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云南省漢族腫瘤患者UGT1A1*6及SLCO1B1基因多態(tài)性分布*

2019-10-12 08:19:38潘欣殷家福高杰孔樹佳
貴州醫(yī)科大學學報 2019年9期
關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

潘欣, 殷家福, 高杰, 孔樹佳

(云南省腫瘤醫(yī)院 藥劑科, 云南 昆明 650118)

伊立替康(Irinotecan,CPT-11)是一種半合成水溶性喜樹堿衍生物,除廣泛用于晚期結(jié)直腸癌和小細胞肺癌的治療外,在婦科腫瘤、胃癌等實體腫瘤的治療中也取得了較好的療效[1]。CPT-11的劑量限制性毒性主要為遲發(fā)性腹瀉和中性粒細胞減少,兩者的發(fā)生率分別可達到46%和30%,嚴重可導致死亡[2]。臨床研究表明,CPT-11的不良反應表現(xiàn)出明顯的個體差異,參與CPT-11代謝和轉(zhuǎn)運過程的酶的活性及基因多態(tài)性與不良反應相關(guān)。目前研究最多的尿苷二磷酸葡萄糖醛酸轉(zhuǎn)移酶1A1(uridine diphosphase glucuronosyl transferase 1A1, UGT1A1)是CPT-11代謝的關(guān)鍵酶,其編碼基因多態(tài)性與CPT-11導致的化療相關(guān)性毒副反應密切相關(guān)[3];而有機陰離子轉(zhuǎn)運蛋白1B1(organic anion transport protein 1B1, OATP1B1)參與了CPT-11的轉(zhuǎn)運過程,其編碼基因是溶質(zhì)載體有機陰離子轉(zhuǎn)運蛋白家族成員1B1基因(solutecarrierorganicaniontransporterfamilymember1B1,SLCO1B1)。近年來SLCO1B1基因多態(tài)性也日漸成為研究的熱點。另有研究顯示,UGT1A1和SLCO1B1基因多態(tài)性的分布在不同種族間存在明顯差異[4-5]。本研究分析UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G) 兩個基因多態(tài)性位點在云南漢族腫瘤患者中的分布頻率,以期為CPT-11的個體化用藥劑量提供一定的理論依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 一般資料

收集2016年8月-2018年8月在云南省腫瘤醫(yī)院應用CPT-11進行治療的云南漢族腫瘤患者122例,其中男69例、女53例,25~89歲。納入標準:云南籍漢族患者,相互間3代無血緣關(guān)系。所有入選患者均簽署《知情同意書》,該項目通過醫(yī)院倫理委員會審批。

1.2 主要儀器與試劑

TL998A型熒光檢測儀(西安天隆科技有限公司),低溫高速離心機(德國Eppendorf)。核酸純化試劑(耀金寶)、基因檢測通用試劑(耀金分)、10×氯化銨溶液均由北京華夏時代基因科技發(fā)展有限公司提供。

1.3 方法

選用乙二胺四乙酸二鈉抗凝采血真空管采集患者用藥前外周靜脈血3 mL,采用1×NH4Cl溶液提取血液白細胞,在白細胞沉淀中加入核酸純化試劑40 μL,混勻后靜置30 min,向相應的測序反應通用試劑中加入白細胞混懸液1.5 μL,置于TL998A熒光檢測儀中,采用數(shù)字熒光分子雜交的方法對其進行基因分型,該方法是在原位分子雜交基礎(chǔ)上,用熒光標記探針,對標本DNA進行原位雜交,若有待測SNP位點堿基,則報告熒光信號。

1.4 統(tǒng)計學處理

采用SPSS 19.0軟件進行統(tǒng)計分析,計數(shù)資料以頻數(shù)、率或比(%)表示,組間比較采用χ2檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

2.1 UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G)等位基因和基因型的分布

UGT1A1*6基因分型位點的基因型分為野生型GG、突變雜合子GA及突變純合子AA。SLCO1B1(388A>G)基因分型位點的基因型分為野生型AA、突變雜合子AG及突變純合子GG。在云南漢族腫瘤患者中,UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G)兩個基因位點的突變頻率較高,UGT1A1*6等位基因的頻率為G(77.87%)和A (22.13%),SLCO1B1(388A>G)等位基因的頻率為A(27.05%)和G(72.95%)。基因型分布見表1。

表1 云南漢族腫瘤患者UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G)基因多態(tài)性分布Tab.1 Polymorphism distribution of UGT1A1*6 and SLCO1B1 (388A>G) in cancer patients of Yunnan Han people

2.2 UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G)位點基因型分布的哈迪-溫伯格平衡分析

UGT1A1*6位點的基因型分布符合哈迪-溫伯格平衡(P=0.117),雜合度和期望雜合度分別為0.295和0.345;SLCO1B1(388A>G)位點的基因型分布也符合哈迪-溫伯格平衡(P=0.647),雜合度和期望雜合度分別為0.377和0.395。

2.3 不同臨床特征腫瘤患者UGT1A1*6基因型分布

不同性別和年齡的腫瘤患者UGT1A1*6基因型分布比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),且不同腫瘤發(fā)生部位的患者UGT1A1*6基因型分布差異也無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表2。

表2 云南漢族不同臨床特征腫瘤患者UGT1A1*6基因型分布Tab.2 Genotypic distribution of UGT1A1*6 in cancer patients with different clinical characters

2.4 不同臨床特征腫瘤患者SLCO1B1(388A>G)基因型分布

SLCO1B1(388A>G)的基因型頻率在不同性別、年齡、腫瘤發(fā)生部位等分組中的分布比較結(jié)果顯示,不同性別及年齡腫瘤患者SLCO1B1(388A>G)基因型比較,差異無統(tǒng)計意義(P>0.05),且不同部位腫瘤患者SLCO1B1(388A>G)基因型分布比較,差異也無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表3。

表3 云南漢族不同臨床特征腫瘤患者SLCO1B1(388A>G)基因型分布Tab.3 Genotypic distribution of SLCO1B1 (388A>G)in cancer patients with different clinical characters

2.5 不同腫瘤人群UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G)等位基因頻率分布

UGT1A1*6在云南漢族中的等位基因頻率分別與中國河南腫瘤患者[6]、日本腫瘤患者[7]的等位基因頻率進行比較后結(jié)果顯示,中國云南漢族、中國河南和日本腫瘤患者人群中UGT1A1*6等位基因頻率比較相似,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表4;將中國云南漢族SLCO1B1(388A>G)的等位基因頻率分別與中國上海腫瘤患者[8]、日本腫瘤患者[7]的等位基因頻率進行比較后結(jié)果顯示,云南漢族腫瘤患者SLCO1B1(388A>G)等位基因頻率與中國上海、日本腫瘤患者的頻率均相似,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),見表4。

3 討論

CPT-11是一種無活性前體藥,在體內(nèi)主要由羧酸酯酶Ⅱ代謝為活性化合物7-乙基-10-羥基喜樹堿(7-ethyl-10-hydroxycamptothecin, SN-38),SN-38是DNA拓撲異構(gòu)酶Ⅰ(Topo Ⅰ)抑制劑,通過與細胞DNA形成裂解復合物導致DNA鏈斷裂,最終導致腫瘤細胞死亡而發(fā)揮抗腫瘤活性[9]。SN-38在發(fā)揮抗腫瘤活性的同時,也可引起遲發(fā)性腹瀉和粒細胞減少等不良反應;隨后SN-38在SLCO1B1基因編碼的OATP1B1協(xié)助下轉(zhuǎn)運到肝臟細胞,經(jīng)UGT1A1醛酸化為無活性的SN-38葡糖苷酸(SN-38G)而排出體外,CPT-11的體內(nèi)分布和不良反應有明顯的個體差異。目前研究認為,UGT1A1基因突變可引起UGT1A1酶活性降低或缺失,細胞毒性產(chǎn)物SN-38蓄積,導致不良反應的發(fā)生。UGT1A1基因位于人類2號染色體2q37,已知該基因的突變位點多達50多種,目前研究較多的是位于該基因啟動子區(qū)的UGT1A1*28和UGT1A1*6兩個基因多態(tài)性位點。UGT1A1基因啟動子區(qū)存在大量TA堿基重復序列,最常見的為6個TA重復序列,即TA6/TA6或*1/*1;UGT1A1*28為7個TA重復序列,包括純合突變型(TA7/TA7或*28/*28)和雜合突變型(TA6/TA7或*1/*28)。UGT1A1*6的多態(tài)性表現(xiàn)為211G>A,形成G/G、A/G和A/A這3種基因型[7]。研究顯示,UGT1A1基因多態(tài)性在高加索人、非洲人和亞洲人群之間存在明顯的人種差異,UGT1A1*28純合突變在高加索人群和非洲人群中分布較高,分別占人群的10%~15%和12%~27%,在亞洲人群中突變率僅為1.2%~4.7%[10];UGT1A1*6在亞洲人群中的突變頻率可達13%~23%,且目前只在亞洲人群中發(fā)現(xiàn)[11]。本研究中UGT1A1*6位點A等位基因發(fā)生頻率為22.13%,突變頻率與中國河南、日本腫瘤患者人群中UGT1A1*6等位基因頻率比較相似,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。來向陽等[12]研究認為,不同性別、年齡的腫瘤患者UGT1A1*6位點基因型分布無差異,但不同腫瘤部位的基因型分布有差異。在本研究中,未發(fā)現(xiàn)UGT1A1*6位點在性別、年齡及不同腫瘤部位的基因型分布差異。

表4 UGT1A1*6位點和SLCO1B1(388A>G)位點等位基因在各群體中的分布Tab.4 Allelic distribution of UGT1A1*6 and SLCO1B1(388A>G) sites in different populations

注:(1)與云南漢族比較。

SLCO1B1基因長約109 kb,位于12號染色體短臂上,由14個外顯子和1個非編碼外顯子組成,主要負責編碼特異性分布于肝細胞基底膜外側(cè)的有機陰離子轉(zhuǎn)運蛋白OATP1A1。近年來多個研究提出,OATP1A1參與了CPT-11活性代謝產(chǎn)物SN-38的運輸,其編碼基因SLCO1B1的基因多態(tài)性可顯著影響OATP1B1的轉(zhuǎn)運活性[12],藥物代謝能力下降,CPT-11蓄積而導致不良反應的發(fā)生。目前已發(fā)現(xiàn)40余個SLCO1B1的單核苷酸多態(tài)性[13],其中SLCO1B1 388A>G和521T>C研究最多,在亞洲人種也最為常見。這兩個位點在不同種族人群中的分布存在很大差異。已有研究報道,SLCO1B1(388A>G)在高加索人、非洲人和亞洲人中的突變頻率分別為30%~45%、70%~80%、60%~90%[14-15]。本研究中,云南漢族患者SLCO1B1(388A>G)位點的G等位基因發(fā)生頻率為72.95%,突變頻率與中國河南、日本腫瘤患者人群中SLCO1B1(388A>G)等位基因頻率比較相似,未發(fā)現(xiàn)分布差異。另外,本研究未發(fā)現(xiàn)SLCO1B1(388A>G)位點在性別、年齡以及不同腫瘤部位的基因型分布差異。

綜上所述,本研究通過對122例云南漢族腫瘤患者的CPT-11代謝相關(guān)基因UGT1A1和SLCO1B1的研究發(fā)現(xiàn),云南漢族腫瘤患者UGT1A1*6基因分布情況與我國河南、日本腫瘤患者的分布頻率一致。SLCO1B1(388A>G)基因分布情況與我國上海、日本腫瘤患者的分布頻率一致。另外,在本研究中,未發(fā)現(xiàn)UGT1A1*6和SLCO1B1(388A>G)位點在不同性別、年齡以及腫瘤部位的基因分布差異。本研究樣本量較小,尚需要大量樣本的臨床資料進一步補充,且有必要進一步在云南健康人群中進行基因檢測,為我省日后更大樣本量UGT1A1和SLCO1B1相關(guān)位點突變頻率的研究以及建立基因數(shù)據(jù)庫提供有意義的數(shù)據(jù)積累。

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