傅鴻妃
(杭州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,浙江 杭州 310024)
辣椒是我國(guó)重要的蔬菜作物,目前全國(guó)辣椒種植面積超過(guò)200萬(wàn)hm2,占蔬菜種植面積的12%,產(chǎn)量4 000萬(wàn)t,是全球辣椒生產(chǎn)第一國(guó)[1]。辣椒是常異花授粉蔬菜,雜交種子生產(chǎn)絕大部分通過(guò)人工去雄后再授粉得到,因此,在生產(chǎn)過(guò)程中容易產(chǎn)生因去雄不干凈而造成自花授粉,昆蟲(chóng)傳播和機(jī)械混雜也是導(dǎo)致花粉混雜的原因。雜交種子純度鑒定是保證種子質(zhì)量和農(nóng)民效益的有效手段,對(duì)于提高生產(chǎn)效益和利用雜種優(yōu)勢(shì)具有非常重要的意義。
目前,我國(guó)雜交種子純度鑒定以田間栽培形態(tài)鑒定、實(shí)驗(yàn)室同工酶電泳鑒定和分子標(biāo)記鑒定為主。田間種植鑒定周期較長(zhǎng),需要花費(fèi)大量的勞動(dòng)力和土地資源,且易受到環(huán)境因素的影響。同工酶鑒定多態(tài)性信息相對(duì)較少,又具有組織器官特異性,隨著新品種數(shù)量的不斷增加和種質(zhì)遺傳基礎(chǔ)越來(lái)越狹窄,這2種鑒定方法已經(jīng)難以滿(mǎn)足純度鑒定的精確性要求。分子標(biāo)記技術(shù)因快速、精確性高等原因被越來(lái)越多地應(yīng)用在雜交種子純度鑒定上,SSR分子標(biāo)記具有操作方法簡(jiǎn)單、標(biāo)記數(shù)量豐富、多態(tài)性穩(wěn)定性和重復(fù)性好、條帶分布均勻等優(yōu)點(diǎn),本實(shí)驗(yàn)利用該技術(shù)對(duì)杭椒雜交種子進(jìn)行快速鑒定,以期可以有效加快種子鑒定速度,節(jié)約時(shí)間和成本。
本研究所用材料是課題組自留的自交提純辣椒品種H12母本、H12父本和雜交種H12。3份材料在當(dāng)年11月份播種,于次年3月中下旬定植于杭州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院蔬菜基地。
采用改良的CTAB法提取樣品心葉基因組DNA,用分光光度計(jì)NanoDrop2000檢測(cè)DNA質(zhì)量和濃度,-20 ℃下保存?zhèn)溆谩?/p>
PCR擴(kuò)增體系為總體積25 mL,其中10×PCR緩沖液2.5 mL,2.5 mmol·L-1dNTP 2.0 mL,SSR左右引物(10 mmol·L-1)各2.0 mL,Taq酶(5 U·mL-1)0.5 mL,模板DNA(25 ng·mL-1)2.0 mL,ddH2O 14.0 mL。
SSR-PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4 ℃預(yù)變性60 s;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸3 min。擴(kuò)增產(chǎn)物30%聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè),快速銀染法染色。
參照發(fā)表的文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)庫(kù)查找得到辣椒的SSR引物,經(jīng)辣椒SSR遺傳多樣性研究選出多態(tài)性較好引物31對(duì)[2],用于區(qū)分杭椒父母親本和雜交種,引物由上海生物生工公司合成。
將選出的能區(qū)分父母親本和雜交種的引物,用于雜交種的純度鑒定,雜交種純度(%)=同時(shí)具備父母親本特征條帶的植株數(shù)量/檢測(cè)的植株總數(shù)量×100%。
定植后的雜交種植株進(jìn)行常規(guī)田間管理,統(tǒng)計(jì)之前不去雜、不間苗。盛花期統(tǒng)計(jì)總株數(shù)和雜株數(shù),統(tǒng)計(jì)雜交種田間純度,雜交種純度(%)=(總株數(shù)-雜株數(shù))/總株數(shù)×100%。
SSR標(biāo)記的質(zhì)量與DNA的質(zhì)量息息相關(guān),DNA純度用D260/D280值估算,D260/D280值為1.8的DNA質(zhì)量很好,是純品。分光光度計(jì)NanoDrop2000測(cè)量得到H12母本辣椒、H12父本辣椒和雜交種H12辣椒的DNAD260/D280值分別為1.99、1.87和1.75,滿(mǎn)足SSR分子標(biāo)記的需要。
利用H12母本辣椒、H12父本辣椒和雜交種H12辣椒,以31對(duì)引物進(jìn)行多態(tài)性挑選,31對(duì)引物均擴(kuò)增出了清晰條帶,但大部分不能區(qū)分父母本辣椒和F1代雜交種,不適合用于父母親本與F1代雜交種的純度鑒定,只有Cams885和GP20036兩對(duì)引物在父母親本和雜交種之間擴(kuò)增出典型的父母本互補(bǔ)條帶,可用于鑒定父母親本和F1代雜交種。圖1、圖2是在引物Cams885和GP20036下擴(kuò)增出的區(qū)分H12和父母親本的圖譜。
a—母本;b—父本;c—H12。圖2同。圖1 引物Cams885區(qū)分H12和父母親本的圖譜
圖2 引物GP20036區(qū)分H12和父母親本的圖譜
分別取96株H12植株的心葉,利用引物Cams885和GP20036進(jìn)行純度鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn)96個(gè)H12植株中引物Cams885擴(kuò)增出92個(gè)植株條帶清晰一致,引物GP20036擴(kuò)增出86個(gè)植株條帶清晰一致,利用這2個(gè)引物檢測(cè)雜交種H12種子的純度分別是95.8%和89.6%。圖3、圖4分別是雜交種H12在引物Cams885和GP20036下擴(kuò)增出的部分圖譜。
辣椒盛花期時(shí)對(duì)定植的雜交種H12進(jìn)行田間純度鑒定,對(duì)種植的每個(gè)單株進(jìn)行植株、葉、花、果等性狀的逐一辨別和分析,記錄數(shù)據(jù)并統(tǒng)計(jì)結(jié)果。結(jié)果表明,田間種植的150株H12中,4株定植后死亡,剩余146株中有138株是雜交種H12,田間鑒定的純度是94.5%。
本研究選出的引物Cams885能區(qū)分H12母本辣椒、H12父本辣椒和雜交種H12辣椒,這與張曼[3]的結(jié)果一致。選出的引物GP20036能夠區(qū)分H12母本辣椒、H12父本辣椒和雜交種H12辣椒國(guó)內(nèi)還沒(méi)有人用于辣椒純度鑒定,這是國(guó)內(nèi)首次利用該引物區(qū)分辣椒父母親本和其雜交種子。
圖3 引物Cams885檢測(cè)H12擴(kuò)增部分的圖譜
利用引物Cams885和GP20036對(duì)雜交種H12的種子進(jìn)行純度鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn),96個(gè)H12植株中引物Cams885擴(kuò)增出92個(gè)植株條帶清晰一致,引物GP20036擴(kuò)增出86個(gè)植株條帶清晰一致,純度分別是95.8%和89.6%。利用田間表型性狀檢測(cè)雜交種H12種子的純度,146株中有138株是雜交種H12,純度為94.5%。利用SSR分子標(biāo)記檢測(cè)和田間表型性狀觀察雜交種H12種子的純度結(jié)果相近,說(shuō)明實(shí)驗(yàn)室利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)檢測(cè)雜交種子和利用田間性狀觀察杭椒雜交種子純度結(jié)果一致,實(shí)驗(yàn)室SSR分子標(biāo)記技術(shù)檢測(cè)杭椒雜交種子可以大大縮短純度鑒定的周期,節(jié)約時(shí)間和精力。
利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)存在個(gè)別植株條帶缺失或條帶不一樣的情況,田間表型性狀觀察發(fā)現(xiàn)存在不一樣的表型性狀的植株,主要是非本雜交品種種子所致,存在雜株的主要原因是其他辣椒種子不經(jīng)意的混雜,或者是母本沒(méi)有授粉結(jié)果所致,亦或是隔離不嚴(yán)密存在個(gè)別植株或果實(shí)被非父本雜交所致。解決這些問(wèn)題的方法是嚴(yán)格隔離,不讓其他花粉混雜進(jìn)來(lái);仔細(xì)授粉,不漏下不授粉的母本;采收和烘曬種子盡量不讓別的種子混雜進(jìn)來(lái)。