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白樺BpZFP4基因啟動子克隆和逆境響應元件功能分析

2019-11-15 08:17:44秦琳琳
植物研究 2019年6期
關鍵詞:葉盤逆境元件

秦琳琳 張 曦 姜 騁 李 莉

(林木遺傳育種國家重點實驗室,東北林業(yè)大學,哈爾濱 150040)

植物的生長和發(fā)育會受到各種不利環(huán)境的影響,為了抵抗這些逆境,植物在長期的進化過程中形成了許多復雜的防御機制,這種防御機制往往是通過一系列感知和傳導逆境信號的分子來實現(xiàn)的,如轉錄因子、酶和離子通道等[1]。轉錄因子又稱反式作用因子,能夠與基因啟動子區(qū)域中順式作用元件發(fā)生特異性結合來調控基因的轉錄過程,在調控基因表達中起著重要作用[2]。鋅指蛋白是一類具有“手指狀”結構域的轉錄因子,廣泛的分布于人類和動植物中[3~4]。根據(jù)半胱氨酸(Cys)和組氨酸(His)殘基的數(shù)目和位置的不同可將鋅指轉錄因子分為C2H2、C8、C6、C3HC4(RING型)、C2HC、C2HC5(LIM型)、C4、C3H和C4HC3九個亞類,其中大部分鋅指蛋白屬于C2H2型[5]。

C2H2型鋅指蛋白在植物應答生物和非生物脅迫方面發(fā)揮著重要作用[6]。研究發(fā)現(xiàn),水稻C2H2型鋅指蛋白基因ZFP245受高鹽、低溫和干旱的誘導,過表達ZFP245能夠顯著提高煙草的耐鹽性[7]。水稻ZFP182在低溫、干旱、高鹽和ABA脅迫下表達量顯著提高,過表達ZFP182的水稻植株在沒有顯著改變植株株型的同時提高了轉基因植株的耐逆性[8]。Cheuk and Houde[9]等研究了53個小麥C2H2型鋅指蛋白基因在不同脅迫條件下的表達模式,發(fā)現(xiàn)有44個基因對強光、37個基因對干旱脅迫、31個基因對水澇產生應答,其中有16個基因能夠響應所有實驗脅迫條件,表明這些TaZFPs在小麥耐受非生物脅迫中具有重要的作用。對毛果楊109個C2H2型鋅指蛋白轉錄因子的研究發(fā)現(xiàn),大多數(shù)基因的啟動子區(qū)域包含有光響應元件或者非生物脅迫響應元件,RT-PCR分析結果表明這些基因在高鹽、干旱和高溫的脅迫下表達量顯著增加[10]。這些脅迫相關元件的大量存在,預示著這些基因可能受脅迫響應蛋白的調控,進而在諸多逆境脅迫及生理過程中其重要作用。

本課題組應用轉錄組測序分析技術對白樺在鹽、干旱脅迫下的表達譜進行了分析,發(fā)現(xiàn)一個C2H2型鋅指蛋白基因BpZFP4(GenBank Accession number:KU234173.1)在鹽、干旱脅迫處理下表達顯著增強[11],為了進一步研究該基因啟動子的功能,本研究首先通過染色體步移技術克隆獲得BpZFP4基因啟動子片段,通過生物信息學分析發(fā)現(xiàn)其中包含許多與逆境響應和激素響應相關的順式作用元件,推測該啟動子受干旱、鹽等脅迫的誘導表達,為此我們通過5′端一系列缺失突變分析了啟動子序列響應干旱(滲透脅迫)、鹽脅迫以及植物激素ABA的主要調節(jié)區(qū)域及可能的順式作用元件,為進一步探究BpZFP4基因對干旱、高鹽以及ABA脅迫應答的調控機制提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

用于提取植物基因組DNA的白樺(BetulaplatyphyllaSuk.)無性系組培苗和遺傳轉化受體植物煙草(Nicotianabenthamiana)以及pCAMBIA 1301載體由本課題組保存。無縫克隆ClonExpress Ⅱ One Step Cloning Kit購自Vazyme。Genome Walking Kit、Ex Taq Polymerase、dNTPs Mixture以及DNA Marker均購自TaKaRa。膠回收試劑盒購自康為世紀,質粒小提試劑盒購自Omega。XbaⅠ、BglⅡ、T4DNA聚合酶以及T4-DNA連接酶購自Promega,大腸桿菌(Escherichiacoli)DH5α和根癌農桿菌(Agrobacteriumtumefaciens)GV3101感受態(tài)細胞購自北京莊盟國際生物基因科技有限公司。GUS組織化學染色底物X-Gluc和GUS酶活測定所用4-methylumbelliferyl β-D-glucuronide購自Sigma公司。

1.2 白樺BpZFP4基因啟動子的克隆

按照BioTeke公司“新型快速植物基因組DNA提取試劑盒”的操作流程,以白樺無性系葉片為材料提取基因組DNA。采用染色體步移技術(TaKaRa Genome Walking Kit),根據(jù)白樺BpZFP4基因5′端序列信息,設計三條特異性引物SP1:5′-GGTGTCAAGTTCAAGTCCAAGCACA-3′,SP2:5′-CCACAGATTGAGCACTCATGCATCT-3′,SP3:5′-GTCGGTCGTGTTTAGCACATGAGA-3′,與試劑盒中隨機引物AP1、AP2、AP3和AP4組合進行PCR反應,反應體系參照試劑盒說明書,經三次巢式PCR反應得到一段BpZFP4的CDS5′端側翼序列。根據(jù)已獲取的片段的5′端側翼序列,繼續(xù)設計三條特異引物,分別為SP4:5′-GGAAAGGCAATTGGGAAGTTGGGTA-3′,SP5:5′-CAGAGGTACGGAATATGAACGAGGA-3′,SP6:5′-GGAAGGATCCGATGACGCTCATA-3′進行第二次染色體步移。用BioEdit軟件將通過兩次染色體步移擴增的兩條片段拼接成為BpZFP4基因啟動子片段。

1.3 BpZFP4基因啟動子順式作用元件預測

將克隆獲得的BpZFP4基因的啟動子序列提交到New PLACE[12](http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/)和Plant CARE[13](http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在線網站進行順式作用元件的預測分析。

1.4 BpZFP4基因啟動子5′-缺失片段融合GUS基因的植物表達載體構建

根據(jù)ClonExpress Ⅱ One Step Cloning Kit(Vazyme)使用說明設計PCR引物,其中在正反向引物中分別引入XbaⅠ和BglⅡ酶切位點以及線性化載體兩末端的同源序列(表1)。以攜帶BpZFP4全長啟動子的T載體質粒為模板進行PCR擴增。PCR反應體系如下:10×Ex PCR Buffer 2.0 μL,2.5 mmol·L-1dNTPs 2.0 μL,10 mmol·L-1上下游引物各0.5 μL,100 ng DNA,2 U·μL-1Ex Taq DNA Polymerase 0.1 μL,ddH2O補足20 μL。PCR反應程序:94℃預變性3 min,94℃變性30 s,58℃退火30 s,72℃延伸2 min,35個循環(huán),72℃延伸10 min。將不同片段PCR產物膠回收,酶切驗證并與去除CaMV35S啟動子的pCAMBIA1301載體片段進行重組反應。

表1BpZFP4啟動子5′缺失片段與GUS基因融合所用引物序列

Table 1 A list of primers used to construct different deletions of theBpZFP4 promoter::GUSexpression vector

引物名稱Primer引物序列Sequence(5′—3′)pZF-1360-FGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTGCGAACAGTCGCACTATGpZF-1096-FGGTACCCGGGGATCCTCTAGAAACGCAGGATAGTGCAACTTTTApZF-682-FGGTACCCGGGGATCCTCTAGACATTGTAAGTTTTTAGTAATTTGpZF-396-FGGTACCCGGGGATCCTCTAGAACACAAAGAGAACCTGAATApZF-RTAGAAATTTACCCTCAGATCTCATGGCTACGTTAATGGACG1301-GUS-FTGTTGTGTGGAATTGTGAGC1301-GUS-RGGGTCCTAACCAAGAAAATG

將含有CaMV35S啟動子的pCAMBIA1301載體作為陽性對照;以去除CaMV35S啟動子的pCAMBIA1301載體作為陰性對照,其構建方法是采用XbaⅠ和BglⅡ雙酶切pCAMBIA1301載體質粒以去除CaMV 35S啟動子,用T4DNA聚合酶將線性化載體的5′突出末端補平后,使用T4DNA連接酶將平末端載體相連。

1.5 農桿菌介導的煙草瞬時轉化

農桿菌注射滲透法轉化煙草參照Yang等[14]。方法如下:將連接后的重組質粒轉化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,對陽性克隆進行菌液PCR鑒定,把經測序比對正確的重組質粒通過液氮凍融法導入農桿菌感受態(tài)細胞GV3101中,在含有50 mg·L-1Kan的LB固體培養(yǎng)基上篩選陽性克隆。經菌液PCR驗證的單菌落擴大培養(yǎng)至OD600=0.6~0.8,5 000 r·min-1常溫離心10 min收集菌體,用滲透液MMA[10 mmol·L-1MgCl2,10 mmol·L-1MES,150 mmol·L-1乙酰丁香酮,pH=5.7]重懸,室溫靜置3 h,分別將陽性對照、陰性對照和含有重組載體的農桿菌滲透緩沖液注射到6周齡、長勢接近的煙草植株葉片中,浸染后的植株在16 h/8 h光照/黑暗和25℃條件下繼續(xù)培養(yǎng)48 h時,用直徑為1 cm的葉片打孔器制備煙草葉盤,并立即進行逆境脅迫處理。

1.6 非生物脅迫處理煙草葉盤的GUS組織化學染色分析

分別將葉盤懸浮在含有200 mmol·L-1NaCl、18% PEG6000、100 mmol·L-1ABA的1/2MS液體培養(yǎng)基中處理24 h,每個處理設3個重復,未做脅迫處理組作對照。

按照Jefferson[15]等的方法,對材料進行GUS組織化學染色分析,將材料浸泡于GUS染液中,染液包含0.1 mol·L-1K4Fe(CN)6、0.1 mol·L-1K3Fe(CN)6、50 mmol·L-1磷酸鈉緩沖液(pH7.0)、10 mmol·L-1Na2EDTA、0.001%(V/V) Triton X-100、0.5 mg·mL-1X-Gluc和20%甲醇。37℃保溫過夜,用脫色液(無水乙醇∶冰乙酸=3∶1)脫色,觀察葉盤上深藍色分布情況和顏色深淺,并拍照保存。

1.7 非生物脅迫處理煙草葉盤的GUS活性定量分析

剪取100 mg處理后的煙草葉盤加入3倍體積的GUS提取緩沖液[50 mmol·L-1磷酸鈉緩沖液(pH7.0),10 mmol·L-1EDTA(pH8.0),0.1% Triton X-100,0.1%(w/v)SDS和0.1% β-巰基乙醇],研磨成勻漿,于12 000 r·min-1,4℃離心10 min,收集上清4℃保存?zhèn)溆谩@肨AKARA Bradford protein assay kit測定總蛋白含量,使用Infinie200 PRO多功能酶標儀測定樣品的熒光強度。

1.8 數(shù)據(jù)處理

采用IBM SPSS Statistics 18.0軟件進行數(shù)據(jù)處理,測定結果利用Origin 8.0作圖軟件繪制圖形。所有數(shù)據(jù)均為3次重復。

2 結果與分析

2.1 白樺BpZFP4基因啟動子的克隆

以白樺基因組DNA為模板,采用染色體步移技術經過三輪PCR擴增獲得一條長度約為900 bp的片段(圖1a),將該產物膠回收純化,連接至pMD19-T載體,轉化大腸桿菌。用載體通用引物M13-47和RV-M對菌液進行PCR鑒定,選擇陽性單克隆測序。通過序列比對,發(fā)現(xiàn)該片段3′端的99個堿基與BpZFP4基因的CDS起始序列(1~99 bp)完全一致,說明分離到的片段是BpZFP4基因的啟動子序列。

圖1 BpZFP4啟動子片段的克隆 a~b.第一次和第二次染色體步移擴增產物(M.DNA Marker DL2000;1~3.第1、2及3三輪PCR反應產物Fig.1 Cloning of the BpZFP4 promoter fragment by Genome Walking a-b.1st and 2nd amplification by genome walking(M.DNA Marker DL2000; 1-3.The 1st, 2nd and 3rd Nested PCR amplification products

根據(jù)第一次染色體步移獲取的片段序列信息,設計第二次染色體步移的特異性引物,經三輪PCR擴增獲得長度約為750 bp的側翼序列(圖1b)。將兩次獲得的片段序列拼接,根據(jù)其兩端序列設計引物,進行PCR擴增。PCR產物按照如上所述方法連接、轉化及測序驗證,序列分析表明,該序列長度為1 360 bp。

2.2 BpZFP4基因啟動子順式作用元件預測分析

利用New PLACE和PlantCARE在線分析軟件預測BpZFP4啟動子上順式作用元件,結果顯示該啟動子含有14個TATA box和18個CAAT box啟動子核心元件,除此以外,在啟動子序列多個區(qū)域分布有多種與BpZFP4誘導表達相關的順式調控元件,它們是6種光響應相關元件,包括AT1-motif、Box4、G-Box、IBOXCORE、INRNTPSADB、TCT-motif;14種激素響應相關元件,如脫落酸響應元件ABRE、生長素和水楊酸響應元件As-1、水楊酸響應元件TCA-element和WBOXATNPR1、MeJA響應元件CGTCA-motif和TGACG-motif、乙烯響應元件ERE、光及水楊酸響應元件GT1CONSENSUS、赤霉素及ABA響應元件PYRIMIDINEBOXHVEPB1、赤霉素響應元件GARE2OSREP1、GAREAT、MYBGAHV、PYRIMIDINEBOXOSRAMY1A和WRKY71OS;15種與防御和逆境響應相關元件包括低溫誘導響應LTR、鹽和病原物響應元件GT1GMSCAM4、厭氧誘導必須的順式調控元件ARE、缺氧特殊誘導類似的增強順式作用元件GT-motif、脫水脅迫響應元件ACGTATERD1、MYB1AT、MYBCORE和MYCCONSENSUSAT、抗病響應元件BIHD1OS、損傷響應元件WBOXNTERF3以及參與防御和脅迫反應的順式作用元件CACGTG motif、TC-rich repeats、DOFCOREZM、As-1和SEBFCONSSTPR10A等(表2)。這些元件的存在,表明BpZFP4基因的表達可能被識別這些元件的轉錄因子所調控,從而在植物生長發(fā)育、響應激素信號分子的刺激以及逆境脅迫等過程中發(fā)揮作用。

2.3 BpZFP4啟動子元件缺失突變分析

為了分析非生物脅迫和ABA響應相關元件在BpZFP4啟動子中的作用,尋找存在的關鍵功能區(qū)域,根據(jù)順式作用元件的功能及分布區(qū)域將啟動子分成四段不同長度的缺失片段(圖2a),分別命名為pZF-1360,pZF-1096,pZF-682,pZF-396,其中數(shù)字代表該片段相對于翻譯起始位點的位置(ATG中的A為+1)(表1)。以上述啟動子缺失片段定向替換植物表達載體pCAMBIA1301上GUS基因前的CaMV35S啟動子片段,構建獲得含有啟動子不同缺失長度片段融合GUS報告基因的瞬時表達載體,其構建策略如圖2b所示。

2.4 BpZFP4啟動子5′-缺失片段的表達載體構建

以攜帶BpZFP4全長啟動子的T載體質粒為模板,通過PCR擴增獲得四條不同長度的啟動子缺失目的條帶,與預期大小一致(圖3a),將其純化回收進行XbaⅠ和BglⅡ雙酶切,與pCAMBIA1301載體片段進行重組反應,新的重組質粒利用載體序列引物1301-GUS-F或1301-GUS-R(表1)與缺失片段擴增引物經菌落PCR驗證(圖3b),證明四條啟動子缺失片段已克隆到pCAMBIA1301載體上。采用液氮凍融法,分別將表達載體轉入根癌農桿菌GV3101感受態(tài)細胞中,經菌落PCR鑒定,獲得陽性克隆,完成工程菌制備。

表2 BpZFP4啟動子順式作用元件功能預測

注:堿基序列:R=G/A,W=A/T,N=A/T/C/G

Note:Base sequence:R=G/A,W=A/T,N=A/T/C/G

圖2 BpZFP4啟動子5′-缺失突變分析 a.BpZFP4啟動子主要干旱、鹽、ABA響應相關元件分布示意圖;b.BpZFP4基因啟動子缺失片段與GUS基因融合示意圖Fig.2 Deletion analysis of the BpZFP4 gene promoter in transgenic tobacco plants a. Nucleotide sequence and distribution map of cis-acting elements of the main cis-elements in BpZFP4 promoter; b. Schematic representation of BpZFP4 promoter::GUS vector constructs

圖3 BpZFP4啟動子融合GUS重組載體構建 a.BpZFP4不同長度啟動子缺失片段PCR產物(M. DNA Marker DL2000;2~5. pZF-1360,pZF-1098,pZF-682,pZF-396);b.BpZFP4啟動子不同片段的重組質粒交叉PCR驗證(M. DNA Marker DL2000;2~5.四條不同長度缺失片段重組質粒交叉PCR產物)Fig.3 PCR amplification of BpZFP4 full length promoter a. (M.DL2000 DNA Marker; 2-5. pZF-1360,pZF-1098,pZF-682,pZF-396); b.The four different length recombinant vectors were verified by plasmid PCR(M.DL2000 DNA Marker; 2-5.BpZFP4 four different length promoter fragment)

圖4 BpZFP4啟動子不同缺失片段對非生物脅迫和激素脅迫響應分析 A. 18%(w/v) PEG 6000,200 mmol·L-1 NaCl 和100 mmol·L-1 ABA脅迫下轉基因煙草葉盤GUS組織化學染色分析;B. 18%(w/v) PEG 6000,200 mmol·L-1 NaCl和100 mmol·L-1 ABA脅迫下轉基因煙草GUS活性染色分析,所有數(shù)據(jù)為3次重復。Fig.4 Analysis of BpZFP4 promoter deletion constructs in tobacco plants under drought,salt and ABA treatments A. GUS histochemical staining of four deletions constructs in tobacco plants under 18%(w/v) PEG6000,200 mmol·L-1 NaCl and 100 mmol·L-1 ABA treatments; B. GUS activity of different deletion constructs in tobacco plants under 18%(w/v) PEG6000(a),200 mmol·L-1 NaCl(b) and 100 mmol·L-1 ABA(c) treatments(Values represent the means±SD from three repeats)

2.5 BpZFP4啟動子不同缺失片段對非生物脅迫和激素脅迫響應分析

利用注射法分別將含有BpZFP4啟動子5′缺失片段重組質粒的農桿菌浸染煙草葉片,以帶有CaMV35S的pCAMBIA1301載體質粒作為陽性對照;并以去除35S啟動子片段的pCAMBIA1301載體質粒作為陰性對照,對浸染后的葉盤分別進行200 mmol·L-1NaCl、18% PEG6000及100 mmol·L-1ABA脅迫處理,以未脅迫處理的葉片為對照組。

GUS組織化學染色分析結果顯示(圖4A),陰性對照的煙草葉盤未被染上藍色,而陽性對照的葉盤被染成了明顯的深藍色。在經過PEG脅迫處理的啟動子系列缺失表達實驗組中,轉入pZF-1360、pZF-396載體質粒的葉盤在未做脅迫處理下染色較淺,而將浸染后的葉片用PEG處理24h后,染色效果明顯加深,說明pZF-1360和pZF-396片段在干旱脅迫條件下能夠顯著誘導GUS報告基因的表達。觀察受NaCl處理的啟動子缺失片段的GUS染色結果,可以發(fā)現(xiàn)轉入pZF-396缺失結構的葉盤在脅迫前后染色結果沒有明顯的區(qū)別,而轉pZF-1360、pZF-1096和pZF-682質粒的葉盤均被染成藍色,且染色比未做脅迫處理的葉盤更深,表明這三個啟動子缺失片段均響應鹽脅迫,驅動GUS基因在植株中的表達。在ABA處理后,轉入pZF-1096和pZF-396質粒的葉盤染色比對照深,說明GUS的表達受到ABA脅迫的誘導,而轉入pZF-1360和pZF-682片段卻沒有表現(xiàn)出這種誘導效果。

通過以上GUS組織化學染色,我們初步明確了BpZFP4啟動子受干旱、鹽及ABA脅迫誘導,屬于逆境脅迫誘導型啟動子。為了進一步明確該啟動子中與逆境響應相關的區(qū)域,在進行GUS組織化學染色分析的同時,我們對不同長度5′端缺失啟動子片段的轉基因煙草葉片進行了三種脅迫處理和GUS酶活性測定,結果如圖4B所示,在PEG脅迫處理條件下,轉入pZF-1360和pZF-396片段的葉盤中GUS酶活性均有顯著的提高,分別是未脅迫處理葉盤中GUS酶活的11.44和6.05倍,而轉入pZF-1096和pZF-682片段的葉片中在誘導前后的酶活性無明顯變化(圖4B:a),這與上述的染色結果相一致。綜合染色和酶活分析的結果可以看出,啟動子的-1 360~-1 096 bp和-396~-1 bp區(qū)域具有明顯的干旱誘導特性,進一步結合順式作用元件的分布位置分析,發(fā)現(xiàn)在-1 360~-1 096 bp區(qū)域中存在MYB1AT和MYCCONSENSUSAT以及在-396~-1 bp區(qū)域中含有ACGTATERD1,ABRELATERD1和MYCCONSENSUSAT等與干旱誘導相關的順式作用元件。雖然-1 096~-396 bp區(qū)域中也同樣存在MYB1AT,MYBCORE和MYCCONSENSUSAT等干旱響應相關元件,但是GUS活性增加不明顯,說明在該區(qū)域可能存在有負調控元件。用同樣的方法我們對BpZFP4基因啟動子片段在NaCl脅迫下的GUS酶活進行了分析,發(fā)現(xiàn)在未脅迫情況下,轉入四個缺失片段的葉盤中GUS酶活均約為1左右,而在NaCl脅迫之后,轉pZF-1360,pZF-1096和pZF-682的GUS酶活比正常情況下分別上升了8.30,8.09和6.18倍,而轉pZF-396片段的GUS酶活與正常情況下沒有顯著的差異(圖4B:b)。這可能是由于位于-396~-682 bp和-682~-1 096 bp區(qū)域的GT1CONSENSUS和GT1GMSCAM4兩個順式作用元件響應了鹽脅迫,使GUS表達量明顯增加。在-1 096~-1 360 bp區(qū)域內雖然并不包含有鹽響應相關元件,但可能存在并未明確功能的順式作用元件,所以pZF-1360片段也響應了鹽脅迫。在ABA脅迫處理的實驗組中,轉入pZF-1096和pZF-396片段的葉盤中受到ABA誘導后GUS酶活明顯地增強,分別是對照組的7.3和6.19倍,而轉pZF-1360和pZF-682片段與對照組沒有明顯變化(圖4B:c)。序列分析發(fā)現(xiàn)在-396~-1區(qū)域有三個ABRE元件,它們可能參與了ABA脅迫的響應。

3 討論

啟動子是一段能與RNA聚合酶及轉錄因子發(fā)生特異性結合、決定基因轉錄起始的DNA序列,位于基因的上游[16]。啟動子中包含的順式作用元件可以與反式作用因子相互作用,使生物能根據(jù)需要或環(huán)境的改變,在特定的時間與位置表達目的基因。根據(jù)啟動子的作用方式和功能的不同,可將其分為3種類型:組成型啟動子、誘導型啟動子和組織特異型啟動子[17~18]。組成型啟動子可使目的基因在轉基因植物中非組織特異性和非誘導性高水平表達,具穩(wěn)定性和持續(xù)性。如花椰菜花葉病毒CaMV35S啟動子[19],而誘導型啟動子可以根據(jù)需要在植物體特定發(fā)育階段和組織器官中通過外界信號誘導目的基因表達[20],如泛素核糖體蛋白融合基因ubi3啟動子在受到損傷后才能啟動下游基因表達[21];組織特異性啟動子可以調控基因只在某些特定的器官或組織部位表達,并表現(xiàn)出發(fā)育上的時空特異性。如白樺4CL基因啟動子調控GUS基因在莖中表達;小黑楊ICE1基因啟動子調控GUS基因在花和根中表達;而花生AhNCED1基因啟動子調控GUS基因在葉片中表達[22~24]。近年來,隨著對植物轉基因研究的深入,對轉基因植物生物安全性要求的提高,使用誘導型啟動子和組織特異型啟動子培育抗逆作物新品種在很多情況下成為最佳選擇。

本研究利用染色體步移技術,成功克隆獲得白樺BpZFP4基因啟動子片段,進一步以生物信息學預測分析和GUS報告基因在煙草中瞬時表達的手段對BpZFP4基因啟動子響應逆境脅迫的順式作用元件及其所在區(qū)域和功能進行了分析。揭示了-1 360~-1 096 bp和-396~-1 bp區(qū)域為干旱誘導響應的正調控區(qū),在該區(qū)域中發(fā)現(xiàn)有MYB1AT、MYCCONSENSUSAT等與干旱誘導相關的順式作用元件。這與Abe等關于擬南芥干旱響應基因rd22啟動子中MYB1AT和MYCCONSENSUSAT元件能夠被MYB或MYC識別,增強了靶基因在干旱和ABA脅迫下表達的結果一致[25~26]。MYCCONSENSUSAT還是低溫脅迫基因的識別位點,擬南芥CBF/DREB1和玉米ZmCBF3基因的轉錄是通過ICE1識別該位點起始的[27~28],預示了BpZFP4對脅迫響應的多樣性。此外,在高鹽響應的正調控區(qū)-1 360~-396 bp中,存在有6個GT1GMSCAM4元件。前人在對大豆SCaM-4[29]、豌豆PsSEOF1[30]、甜瓜CmLOX08[31]等基因啟動子逆境響應元件及其功能分析中報道,GT1GMSCAM4元件在鹽脅迫條件下能夠顯著誘導GUS報告基因的表達。因此GT1GMSCAM4可能對BpZFP4基因在鹽脅迫下的轉錄起到調控作用。

ABA是一種重要的逆境植物激素,在許多逆境下能夠增加積累,并通過整合多種脅迫信號,調控下游應激相關基因的表達[32]。植物對脅迫信號應答的途徑分為依賴于ABA和不依賴于ABA受體兩種類型[33],轉錄因子通過不同的ABREs、DRE/CRTs或者MYB和MYC識別motifs激活應激反應[26,34]。BpZFP4基因啟動子的pZF-1096和pZF-396片段響應ABA脅迫,GUS基因的表達獲得顯著增強,分析發(fā)現(xiàn),在-396~-1區(qū)域分布有三個ABRE元件。根據(jù)這些分析結果,我們可以推測BpZFP4啟動子中的ABREs元件可能在響應外源ABA處理中發(fā)揮作用,但是BpZFP4基因是否通過依賴ABA途徑對非生物脅迫作出響應還需要進一步的研究。

本研究發(fā)現(xiàn)BpZFP4啟動子序列中含有多個干旱、高鹽及ABA響應相關的順式作用元件,其中一些元件對啟動子受逆境脅迫和激素的誘導起著重要的作用,這對進一步深入地了解逆境脅迫下白樺BpZFP4基因的表達調控和指導林木轉基因育種提供了新的依據(jù)。

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完形填空Ⅳ
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Cu4簇合物“元件組裝”合成及其結構與電催化作用
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振動與沖擊(2011年9期)2011-02-13 11:54:56
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