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甲氨蝶呤代謝酶基因多態(tài)性與類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者療效的相關(guān)性研究*

2020-01-01 05:59王丹丹朱懷軍葛泳含劉蘊星葛衛(wèi)紅
藥學(xué)與臨床研究 2020年6期
關(guān)鍵詞:等位基因多態(tài)性基因型

束 慶,曹 智,,王丹丹,朱懷軍,葛泳含,劉蘊星,姚 瑤,孫 雷,葛衛(wèi)紅**

1 南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院 藥學(xué)部,南京 210008;2 徐州醫(yī)科大學(xué)附屬邳州醫(yī)院 藥學(xué)部,徐州 221300;3 南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬鼓樓醫(yī)院 風(fēng)濕免疫科,南京 210008

類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(rheumatoid arthritis,RA)是一類以關(guān)節(jié)炎為主要臨床表現(xiàn)的系統(tǒng)性自身免疫病,全世界發(fā)病率約為0.24%[1],我國大陸地區(qū)患病率為0.2%~0.4%[2]。甲氨蝶呤(methotrexate,MTX)是歐洲抗風(fēng)濕病聯(lián)盟(EULAR)及美國風(fēng)濕病學(xué)會(ACR)推薦治療RA 的一線藥物。關(guān)節(jié)損傷發(fā)生在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎病程的早期[3,4],治療RA 首要目標(biāo)是對疾病的早期控制,防止疾病進展對關(guān)節(jié)結(jié)構(gòu)的破壞和功能的影響。但是,服用MTX 需6 個月才達到血藥濃度穩(wěn)態(tài)[5],方可判定療效。此外,研究顯示,約30%的患者對MTX 的治療無效[6-8]。因此,MTX 在臨床用藥的困難是:能否預(yù)知MTX 對患者的療效,從而能夠早期有效控制疾病的活動。

關(guān)于MTX 在體內(nèi)的代謝及藥理機制的發(fā)揮過程如圖1 所示:MTX 通過還原型葉酸轉(zhuǎn)運載體-1(reduced folate carrier 1,RFC-1)運送到細胞內(nèi),進而谷氨酸基團通過多聚谷氨酰胺合成酶(folylpolyglutamate synthetase,F(xiàn)PGS) 添加到MTX上,轉(zhuǎn)變?yōu)槎嗑酃劝彼峄装钡剩∕TXPGn)[9];而γ-谷氨酰水解酶(γ-glutamyl hydrolase,GGH)則可移除MTXPGn 末端的多聚谷氨酸,使之恢復(fù)成單聚谷氨酸的形式,然后很快地被三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運體(ATP-binding cassette ABC 轉(zhuǎn)運體)的膜蛋白家族轉(zhuǎn)運出細胞。胞內(nèi)的MTXPGn 可通過抑制:①胸苷酸合成酶(thymidylate synthase,TYMS)干擾蛋白質(zhì)的合成。②抑制二氫葉酸還原酶(dihydrofolate reductase,DHFR)使四氫葉酸無法轉(zhuǎn)化為二氫葉酸,進一步導(dǎo)致5,10-亞甲基四氫葉酸無法在亞甲基四氫葉酸還原酶 (5,10 -methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)的催化作用下、形成5-甲基四氫葉酸鹽,最終引起DNA 甲基化的減少。③抑制5-氨基咪唑-4 -氨甲酰核苷酸轉(zhuǎn)甲酰酶 (5 -aminoimidazole -4 -carboxamide ribonucleotide transformylase,ATIC),影響嘌呤的合成。

在甲氨蝶呤通路中,各種代謝酶的基因多態(tài)性可能影響細胞內(nèi)MTXPGn 對葉酸抑制作用的發(fā)揮效果[10]。但是,目前關(guān)于中國人群相關(guān)基因的多態(tài)性的研究較少,因此,本研究通過檢測MTX 代謝酶基因多態(tài)性在中國RA 患者中的分布情況,探討基因多態(tài)性與MTX 療效的相關(guān)性,為臨床對RA 患者的個體化用藥提供參考。

1 材料和方法

1.1 儀器與設(shè)備

Verity 96well PCR 儀;Gene Genius 凝膠成像儀(Syngene 公司);3730XL 測序儀 (ABI 公司);H6-1 電泳槽 (上海精益有機玻璃制品儀器廠);DYY-8C 電泳儀(北京六一儀器廠);HC-2518R 冷凍離心機 (BBI 公司);TGL-14G 臺式高速離心機(上海醫(yī)療器械有限公司)。

1.2 藥品與試劑

甲氨蝶呤每片2.5 mg,上海上藥信誼藥廠有限公司。Pfu DNA 聚合酶、DNA 提取試劑盒、PCR 產(chǎn)物純化回收試劑盒、PCR 擴增試劑、無乙水醇、異丙醇、丙三醇等均購自生工生物工程(上海)公司。

1.3 研究對象

選取2017 年3~11 月在醫(yī)院門診信息系統(tǒng)記錄且診斷為RA 的患者,共納入109 例。本實驗符合人體試驗委員會制定的倫理學(xué)標(biāo)準(zhǔn),并按照鼓樓醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)的標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行。

1.3.1 入組標(biāo)準(zhǔn)、排除標(biāo)準(zhǔn) 入組標(biāo)準(zhǔn):符合ACR2010年RA 診斷標(biāo)準(zhǔn);能規(guī)律服用MTX(10 mg/周)至少3 個月,且合并用藥為不影響MTX 代謝的免疫抑制劑。排除標(biāo)準(zhǔn):聯(lián)合其他抗風(fēng)濕藥物治療者;有嚴重心、腎等重要臟器損傷和血液系統(tǒng)疾病者(WBC<4.0×109/L,Hb<80 g·L-1,PLT<70×109/L);肝功能ALT、AST 超過正常上限1.5 倍者;血肌酐超過正常上限者。

排除3 個月初判時ESR<20 mm·h-1、但是6 個月未達到有效標(biāo)準(zhǔn)的患者。

1.3.2 療效評價 療效判定標(biāo)準(zhǔn)為以下二種預(yù)定結(jié)果之一:(1)有效患者(穩(wěn)定劑量的MTX 治療至少6 個月,治療6 個月后的血沉(ESR)<20 mm·h-1);(2)無效患者(穩(wěn)定劑量的MTX 治療至少3 個月,ESR 較用藥前改善率低于20%)。

1.4 實驗方法

1.4.1 患者血液采集 入組患者來院檢查時,從檢驗科回收患者行血常規(guī)檢查后剩余的血液樣本,保存于-80 ℃冰箱中。

1.4.2 外周血DNA 的提取 應(yīng)用Wizard?Genomic DNA 提取試劑盒進行提取。冷凍血充分解凍后混勻,取300 μL 加入到900 mL 細胞裂解液內(nèi),顛倒5~6 次混勻,室溫靜置10 min,顛倒2~3 次,14000×g 室溫離心30s,棄去上清液,保留10~20μL,渦旋振蕩器上充分振蕩15~20 s;加入300 μL 核酸裂解液,反復(fù)吹打5~6 次,液體變粘稠;加入100 μL蛋白沉淀液,14000×g 室溫離心3 min;在另一1.5 mL EP 管中加入異丙醇300 μL,將前一步驟中的上清液全部加入其中,輕柔反復(fù)顛倒至白色絮狀沉淀出現(xiàn);14000×g 室溫離心1 min,棄去上清液,加入室溫70%乙醇300 μL,輕柔顛倒EP 管;再于14000×g 室溫離心1 min,棄去上清液,室溫靜置15 min;加入100 μL DNA 再水化液溶解DNA,標(biāo)記后于-80 ℃冰箱保存。

1.4.3 PCR 實驗方法

(1)引物的設(shè)計:見表1。

(2)PCR 反應(yīng)體系:25 μL 體系的配制為1 μL 模板、0.5μL 正向引物、0.5μL 反向引物、0.5μL 的10mM dNTP、2.5 μL Taq 緩沖液、0.2 μL 的5 U·μL-1Taq酶、20 μL 的水。

表1 引物的設(shè)計

(3)PCR 反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性30 s;58 ℃退火30 s;72 ℃延伸30~60 s;進行35 個循環(huán);72 ℃修復(fù)延伸10 min。

1.4.4 基因型測序 用PCR 產(chǎn)物純化回收試劑盒對產(chǎn)物進行回收,并用測序儀對其序列進行測定(3730XL 美國ABI),得到序列峰圖進行分析。

1.5 統(tǒng)計分析方法

資料收集后經(jīng)STATA14 進行卡方檢驗分析。P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。計算各組基因型頻率及等位基因頻率,擬合優(yōu)度卡方檢驗、確認各組基因型分布是否符合Hardy-Weinberg 平衡。各組間基因型及等位基因頻率比較采用卡方檢驗。

2 結(jié)果

2.1 研究患者的基本特征

入組的患者共109 人,分析中包含的受試者的臨床和人口學(xué)特征,見表2。

表2 納入研究患者的基本特征

2.2 等位基因頻率分析

探討了6 個基因共15 個SNP 位點,其中ATIC(rs2372536)中共有7 位患者未檢測出基因型;ATIC(rs7563206)中共有9 位患者未檢測出基因型。等位基因頻率見表3。

各等位基因頻率與中國漢族人群的等位基因頻率基本相同,無明顯差異。各基因型頻率分布均作Hardy-Weinberg 平衡檢驗,除RFC-1(rs1051266)、ABCB1 (rs1045642)、TYMS (rs2853542)、TYMS(rs34743033)、ATIC(rs7563206)這幾個基因型外,其他基因頻率分布P<0.05,表明樣本來自一個較大的群體,具有群體代表性。

2.3 等位基因與療效的相關(guān)性分析

探討了6 個基因共15 個SNP 位點,各基因型與療效的相關(guān)性檢驗見表4。

其中在ATIC(rs2372536)中共有7 位患者未檢測出基因型,即有效患者中5 位、無效患者中2 位;在ATIC(rs7563206)中共有9 位患者未檢測出基因型,即有效患者中8 位、無效患者中1 位。

2.3.1 RFC-1 基因多態(tài)性與療效的關(guān)系 RFC-1(rs1051266)的基因型分布(AA/AG/GG)在有效組和無效組的比較中未顯示統(tǒng)計學(xué)差異 (χ12=2.44,P1=0.12,χ22=1.16,P2=0.28,χ32=2.89,P3=0.09)。

2.3.2 ABCB1 基因多態(tài)性與療效的關(guān)系 ABCB1(rs1045642)的基因型分布(CC/CT/TT)在有效組和無效組的比較中未顯示統(tǒng)計學(xué)差異 (χ12=0.23,P1=0.63,χ22=0.01,P2=0.93,χ32=0.01,P3=0.93)。

2.3.3 MTHFR 基因多態(tài)性與療效的關(guān)系MTHFR(rs1801131)的基因型分布(AA/AC/CC)在有效組和無效組的比較中未顯示統(tǒng)計學(xué)差異 (χ12=0.001,P1=0.97,χ22=0.27,P2=0.60,χ32=0.27,P3=0.61)。MTHFR(rs1801133)的基因型分布(CC/CT/TT)在有效組和無效組的比較中未顯示統(tǒng)計學(xué)差異 (χ12=0.004,P1=0.95,χ22=0.07,P2=0.80,χ32=0.02,P3=0.89)。

2.3.4 TYMS 基因多態(tài)性與療效的關(guān)系 TYMS(rs2853542)的基因型分布(CC/CG/GG)在有效組和無效組比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=0.07,P1=0.79,χ22=1.56,P2=0.21,χ32=1.03,P3=0.31)。TYMS(rs34743033)的基因型分布(2R2R/2R3R/3R3R)在有效組和無效組比較中僅P1有統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=5.69,P1=0.02),即含有三個重復(fù)序列的患者療效更好。

表3 患者MTX 代謝酶等位基因頻率

表4 MTX 代謝酶基因多態(tài)性與療效的相關(guān)性檢驗

2.3.5 ATIC 基因多態(tài)性與療效的關(guān)系 ATIC(rs2372536)的基因型分布(CC/CG/GG)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=0.57,P1=0.45,χ22=2.56,P2=0.11,χ32=2.69,P3=0.10)。ATIC(rs7563206)的基因型分布(CC/CT/TT)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異 (χ12=0.32,P1=0.57)。ATIC(rs12995526)的基因型分布(CC/CT/TT)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=1.41,P1=0.24,χ22=0.28,P2=0.60,χ32=0.33,P3=0.57)。ATIC(rs3821353)的基因型分布(GG/GT/TT)在有效組和無效組中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=0.85,P1=0.36,χ22=1.00,P2=0.32,χ32=1.35,P3=0.24)。ATIC (rs16853834) 的基因型分布(CC/CT/TT) 在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=1.19,P1=0.28,χ22=0.27,P2=0.60,χ32=0.32,P3=0.57)。

2.3.6 DHFR 基因多態(tài)性與療效的關(guān)系 DHFR(rs408626)的基因型分布(AA/AG/GG)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=2.69,P1=0.10,χ22=1.84,P2=0.18,χ32=3.32,P3=0.07)。DHFR(rs12517451)的基因型分布(CC/CT/TT)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異 (χ12=0.26,P1=0.61,χ22=1.29,P2=0.26,χ32=1.23,P3=0.27)。DHFR(rs10072026)的基因型分布(TT/TC/C)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=3.85,P1=0.05)。DHFR(rs1643657)的基因型分布(AA/AG/GG)在有效組和無效組的比較中無統(tǒng)計學(xué)差異(χ12=2.00,P1=0.16)。

3 討論

早期預(yù)測RA 患者使用MTX 后的療效反應(yīng),以及制定MTX 個體化治療方案,以滿足RA 患者需求,這是目前臨床治療上亟須解決的問題。因此,本研究通過入組在本院診治并服用MTX 的109 名RA患者,考察了6 個MTX 代謝途徑的關(guān)鍵酶的15 個基因多態(tài)性位點,發(fā)現(xiàn)TYMS(rs34743033)含有3R重復(fù)序列的患者對治療反應(yīng)效果好,即穩(wěn)定劑量的MTX 治療至少6 個月后ESR<20。

在本研究中發(fā)現(xiàn)TYMS (rs34743033) 與MTX療效的相關(guān)性,既往關(guān)于葡萄牙和塞爾維亞RA 患者的研究顯示,3R3R 基因型與MTX 治療的無反應(yīng)相關(guān)[11,12]。而Stamp LK等[13]在對108 名美國RA 患者與MTX 療效之間的關(guān)系,研究發(fā)現(xiàn),2R2R 基因型患者療效較好。種族人群的基因差異導(dǎo)致的療效差異可能是導(dǎo)致研究結(jié)論不同的原因。

本研究中還涉及了RFC-1(rs1051266)、TYMS(rs34743033)、DHFR(rs408626,rs10072026)等位點基因多態(tài)性與MTX 療效的相關(guān)性;但是都未有顯著意義,有待進一步擴大樣本量來尋找療效差異的基因位點。

在國外研究方面,在對于RFC-1 的研究中,Drozdzik M 等[14]研究分析了174 名波蘭RA 患者與MTX(5~15 mg/周)療效之間的關(guān)系,提示AA 基因型患者臨床療效較好。Ghodke-puranik Y 等[9]研究分析了217 名印度RA 患者與MTX(20 mg/周)療效之間的關(guān)系,顯示含有A 等位基因的RA 患者療效更好。Hayashi H 等[15]研究分析了89 名日本RA 患者與MTX(8~12 mg/周)療效之間的關(guān)系,顯示具有G 等位基因的患者療效更差;Hashiguchi M 等[16]研究分析了99 名日本RA 患者與MTX 療效之間的關(guān)系,顯示含有AA 基因型患者療效更好。在服用MTX(4~10 mg/周)55 名日本RA 患者[17]與服用MTX(10~25 mg/周)327 名印度RA 患者[18]的研究提示,RFC-1 基因與療效無關(guān)。

ABC 轉(zhuǎn)運蛋白主要參與MTX 的外排,廣泛表達于腸道細胞、肝臟細胞、腎小管上皮細胞,排泌功能影響胞內(nèi)MTX 水平。ABC 亞型ABCB1 的C3435T(rs1045642)多態(tài)性的研究,有的結(jié)果提示,與MTX 治療RA 的療效無關(guān)[19],有的研究認為,TT基因型的患者病情緩解率較高[20]。

MTHFR 兩個突變位點C677T (rs1801133)和A1298C(rs1801131)是影響酶活性重要因素。既往,較多研究關(guān)注這兩個基因多態(tài)性與MTX 的療效的相關(guān)性,但是研究結(jié)果仍不一致。其中,關(guān)于C677T(rs1801133),分析了233 名服用MTX(2.5~25mg/周)的葡萄牙RA 患者[11],200 名服用MTX(約15 mg/周)新西蘭RA 患者[13],67 名巴基斯坦RA 患者[19]及309名英國RA 患者[21],結(jié)果研究均表明,該位點與療效無關(guān)。而研究表明,120 名服用MTX (11.7±2.9 mg/周)的捷克RA 患者與MTX 療效之間的關(guān)系,CC 型和TT 型等位基因療效更好[22]。Dervieux T 等[23]研究分析了48 名美國RA 患者與MTX 療效之間的關(guān)系,研究發(fā)現(xiàn),TT 基因型患者療效較差。關(guān)于A1298C (rs1801131),217 名服用MTX 20 mg/周的印度RA 患者的研究顯示,含有A 等位基因的RA患者療效更好[9]。Kato T 等[17]分析了55 名日本服用MTX 4~10 mg/周的RA 患者與MTX 療效之間的關(guān)系,研究發(fā)現(xiàn),AA 基因更容易使疾病緩解。但是關(guān)于120 名服用MTX(11.7±2.9 mg/周)的捷克RA 患者的結(jié)果表明,CC 型等位基因療效更好[22]。

ATIC 是腺苷途徑的重要代謝酶,該基因突變會影響細胞外腺苷的釋放。309 名服用MTX(≥15 mg/周) 的英國患者的研究提示,ATIC 的三個單核苷酸(rs3821353,rs7563206 和rs16853834)與MTX 的療效相關(guān)[24]。關(guān)于ATIC(rs2372536)這個位點:108 名美國RA 患者與MTX 療效之間的關(guān)系,研究發(fā)現(xiàn),GG 基因型與患者的療效相關(guān)[13]。

關(guān)于DHFR 的研究,服用MTX (10.2±2.8 mg/周) 的125 名西班牙RA 患者的用藥顯示,AA 型患者療效較差[25]。

需要特別指出的是,目前有關(guān)代謝酶基因多態(tài)性與療效的研究結(jié)論并不一致,分析導(dǎo)致的原因可能主要為以下幾點:①目前相關(guān)的研究基本屬于回顧性或橫斷面研究。因此結(jié)果的分析僅為治療期間的一個時間點,并不能全面反映患者在整個治療期的情況,從而不能全面有效地反映出基因多態(tài)性這類潛在的遺傳標(biāo)記物對MTX 療效的影響[26]。②MTX的療程、劑量和給藥途徑在各個研究之間有差異,也是造成各項研究結(jié)論差異的影響因素。一般亞洲人群的劑量為10 mg/周,而歐美人群高達15~20 mg/周。③各研究對疾病活動的評價標(biāo)準(zhǔn)有很大差異。不同研究對于入組患者疾病程度的標(biāo)準(zhǔn)和臨床觀察終點的標(biāo)準(zhǔn)并不完全一致。④不同種族人群存在基因背景的差異,也可能影響研究結(jié)果的判定。

基于以上影響因素以及本研究是單中心小樣本的研究,因此,后期一方面需要擴大樣本量和聯(lián)合多中心研究來探討中國人群基因多態(tài)性對MTX療效的影響;另一方面結(jié)合多位點的單倍型分析和MTX 活性產(chǎn)物的血藥濃度測定來更好地評價藥效,從而實現(xiàn)對RA 患者的個體化精準(zhǔn)用藥,為患者合理、安全、經(jīng)濟用藥提供保障。

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