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我國生物樣本庫建設現(xiàn)狀與對策

2020-01-08 10:19吳建才周彩虹方育梅
轉(zhuǎn)化醫(yī)學雜志 2020年3期
關鍵詞:樣本生物資源

袁 姣,任 虹,吳建才,雷 樞,陳 實,周彩虹,方育梅,葉 霖

隨著“提高自主創(chuàng)新能力,建設創(chuàng)新型國家”成為我國發(fā)展戰(zhàn)略的核心,我國臨床醫(yī)學科學的發(fā)展也急需進入自主創(chuàng)新階段。生物樣本庫作為臨床治療和醫(yī)學科學研究的基礎設施,是推動臨床醫(yī)學學科創(chuàng)新與診療技術創(chuàng)新的關鍵。大規(guī)模、高質(zhì)量的生物樣本庫的建設對于探索臨床疾病新的診療方式,發(fā)展新技術新業(yè)務,開展精準治療極為重要,對于提升臨床科研質(zhì)量提供極大幫助[1]?,F(xiàn)階段,我國生物樣本庫建設水平低,規(guī)模小,質(zhì)量參差不齊,亟待提高其建設水平和質(zhì)量。本研究通過對我國生物樣本庫建設現(xiàn)狀進行分析,探討生物樣本庫建設中存在的問題及對策,為提高我國生物樣本庫建設水平提供參考。

1 生物樣本庫建設現(xiàn)狀

1.1 國外生物樣本庫建設現(xiàn)狀 生物樣本庫又稱為生物銀行,是一個由實體樣本庫與虛擬數(shù)據(jù)庫組成的一個實體組織,進行標準化采集、處理、儲存和使用組織、體液、DNA、RNA等實體樣本,以及與這些實體樣本有關的病理、臨床診療、倫理審批、知情同意以及隨訪等信息,以及相關樣本的信息管理與數(shù)據(jù)應用,實體樣本的質(zhì)量控制和信息管理系統(tǒng)數(shù)據(jù)的質(zhì)量控制[2-3]。在國際上,生物樣本庫已經(jīng)較為成熟,典型的生物樣本庫平臺有國際生物和環(huán)境樣本庫協(xié)會(International Society for Biological and Environmental Repositories,ISBER)、英國生物樣本庫、美國國立癌癥研究所(National Cancer Institute,NCI)生物樣本庫、丹麥國家生物樣本庫等。英國生物樣本庫成立于1999年,是擁有50萬個40~69歲的英國志愿者,儲存了1 500多萬份生物樣本的大型前瞻性隊列研究的生物樣本庫[4]。美國NCI生物樣本庫成立于1987年,目前收集的樣本超過80萬份[5]。丹麥國家生物樣本庫成立于2012年,儲存了798萬多份生物樣本,該國總?cè)丝跀?shù)為500多萬,在完善的醫(yī)療體制和人口登記制度下,每個丹麥人的生物樣本均被保留且擁有完整的信息[6]。

近年來,國外生物樣本庫不斷向自動化、大型化、信息化發(fā)展,形成了自上而下(英國生物樣本庫)或者自下而上(NCI生物樣本庫)的生物樣本庫共享網(wǎng)絡,各國生物樣本庫制定了統(tǒng)一的標準規(guī)范、共享規(guī)則和流程,建立了高度開放的公共信息平臺,讓所有和生物樣本庫發(fā)生關聯(lián)的人群均能夠通過平臺獲取需要的內(nèi)容[7]。2018年8月,國際上正式發(fā)布ISO 20387:2018標準,在法律法規(guī)、倫理、信息化、質(zhì)量與安全、資源整合與共享提出了統(tǒng)一標準。

1.2 國內(nèi)生物樣本庫建設現(xiàn)狀 我國是一個56個民族的人口大國,臨床疾病種類多,生物樣本資源豐富,這是我國的特有國情,我國在人類遺傳資源方面的樣本數(shù)量和種類是任何一個國家都無法相提并論的,同時,我國生物樣本具有多樣性與地域性的特征,這一特征為我國建設標準化和高質(zhì)量的生物樣本庫提供了基礎。早在1994年中科院就建成了中華民族永生細胞庫,存儲了我國3 000多人的永生細胞株和6 000多份的DNA樣本[1]。我國具有代表性的樣本庫還有國家基因庫、北京重大疾病臨床數(shù)據(jù)與樣本資源庫、上海芯超生物銀行和中華骨髓庫等。各級醫(yī)院也相繼建立了以醫(yī)院??萍膊樘厣膶?粕飿颖編旎蜥t(yī)院全科生物樣本庫。為了推進我國生物樣本庫規(guī)范化建設與高效利用,2009年,中國醫(yī)藥生物技術協(xié)會組織生物樣本庫分會(Biobank Branch,China Medical Biotechnology Association,BBCMBA)成立,整合會員單位的優(yōu)勢資源,建立國家腫瘤組織生物樣本庫及全國網(wǎng)絡系統(tǒng),打破當前組織資源領域條塊分割、相互封閉、重復分散的格局。

隨著精準醫(yī)學的發(fā)展,我國政府出臺了一系列政策,推動了生物樣本庫的發(fā)展?!督】抵袊?030規(guī)劃綱要》提出要大力加強國家臨床醫(yī)學研究中心和協(xié)同創(chuàng)新網(wǎng)絡建設,進一步強化實驗室、工程中心等科研基地能力建設。2016年,國務院出臺《國務院關于印發(fā)“十三五”國家科技創(chuàng)新規(guī)劃的通知》(國發(fā)〔2016〕43號),指出聚焦戰(zhàn)略生物資源的整合、挖掘與利用,推進人類遺傳資源的系統(tǒng)整合與深度利用研究,構(gòu)建國家戰(zhàn)略生物資源庫和信息服務平臺,擴大資源儲備,加強開發(fā)共享,掌握利用和開發(fā)的主動權,為生物產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展提供資源保障。2017年,科技部等部委關于印發(fā)《國家科技創(chuàng)新基地優(yōu)化整合方案》(國科發(fā)基〔2017〕250號)的通知[8],提出依托相關醫(yī)療機構(gòu)建設一批國家臨床醫(yī)學研究中心,大規(guī)模整合臨床醫(yī)學資源,構(gòu)建大數(shù)據(jù)、樣本庫等專業(yè)化的臨床醫(yī)學公共服務平臺。2017年,科技部出臺的《“十三五”衛(wèi)生和健康科技創(chuàng)新專項規(guī)劃》明確要求不斷完善創(chuàng)新基地平臺,在明確定位、分類整合的基礎上,優(yōu)化布局衛(wèi)生與健康領域研發(fā)基地和平臺建設,大力推進國家臨床醫(yī)學研究中心建設,統(tǒng)籌布局國家醫(yī)學大數(shù)據(jù)及樣本資源庫等平臺基地,建成覆蓋100萬健康人群和10個重點疾病的大型人群隊列[9]?,F(xiàn)階段,各個地區(qū)政府、高校和醫(yī)院高度重視生物樣本庫的建設,推動了生物樣本庫規(guī)范化和標準化建設,促進醫(yī)學研究資源的整合,為疾病診療新技術和新方法研究,新藥研發(fā)與評價提供支撐,同時也推動了轉(zhuǎn)化醫(yī)學的發(fā)展。

2 存在問題

目前,生物樣本庫行業(yè)處于加速發(fā)展階段,很多綜合型醫(yī)院的生物樣本庫建設彎道超車,然而,我國的生物樣本庫的發(fā)展還處于起步階段。隨著生物樣本庫行業(yè)的發(fā)展,也產(chǎn)生了一系列的問題,諸如缺乏統(tǒng)一的標準化流程,法律法規(guī)不健全,生物樣本學科尚未建成,缺乏專業(yè)的人才隊伍,各個樣本庫之間相互獨立缺乏資源共享機制,樣本庫的成本效益低,缺乏自身造血功能,樣本使用率低等。

2.1 缺乏統(tǒng)一的標準的生物樣本庫建設流程 精準醫(yī)學的發(fā)展需要標準化高質(zhì)量的生物樣本,但我國各個生物樣本庫建設程度不一,樣本收集和儲存標準不一致,以及對生物樣本的質(zhì)量控制標準也不一致,使得我國綜合型醫(yī)院生物樣本庫的建設規(guī)模和樣本質(zhì)量參差不齊[10]。雖然我國很多綜合型醫(yī)院建立了生物樣本庫,但還沒有一個全國統(tǒng)一的生物樣本庫建設標準。目前,我國各個生物樣本庫都采用各自的建庫標準,在生物樣本庫領域還沒有形成全國統(tǒng)一標準的采樣流程和管理模式,信息系統(tǒng)也沒有統(tǒng)一的指標體系和樣本質(zhì)量控制體系,各個機構(gòu)都是根據(jù)自身科研需求建設樣本庫[3]。有研究表明我國各地區(qū)生物樣本庫發(fā)展不均衡,各醫(yī)院在資金投入、場地環(huán)境配置、組織人員安排等都存在較大差異[11]。

為了進一步推動我國生物樣本庫標準化建設,提高生物樣本的質(zhì)量,BBCMBA于2017年10月組織開展了生物樣本庫室間比對與第三方質(zhì)控服務項目。2018年6月,BBCMBA和ISBER以及盧森堡綜合生物樣本庫簽訂了聯(lián)合開展中國生物樣本庫室間質(zhì)評的項目合約,同年,BBCMBA綜合考慮我國國情以及國內(nèi)生物樣本庫領域的發(fā)展需求,開展了2018年的生物樣本庫室間質(zhì)評與第三方質(zhì)控服務。以上措施在推動生物樣本庫的標準化和規(guī)范化建設方面起到了積極作用,但是BBCMBA為非政府組織,還需要國家相關部門建設國家級官方的組織管理體系,建成全國標準統(tǒng)一高質(zhì)量的生物樣本庫,強制要求各個生物樣本庫按照統(tǒng)一標準建設,落實健康中國2030規(guī)劃,切實推動健康中國的發(fā)展。

2.2 生物樣本學科尚未建成,缺乏專業(yè)的人才隊伍 生物樣本庫在我國成立雖然已經(jīng)有20多年的歷史,但是目前仍未形成一門正式學科。隨著科學技術水平、轉(zhuǎn)化醫(yī)學和精準醫(yī)學的發(fā)展,我國綜合型醫(yī)院生物樣本庫建設進入了黃金時期,但是生物樣本學科尚未建成,缺乏專業(yè)的人才隊伍。其他學科人員在全日制高等教育階段就已經(jīng)形成了基本完整的理論體系,而醫(yī)院樣本庫工作人員沒有經(jīng)過系統(tǒng)的專業(yè)理論知識的學習與實踐技能培訓,僅通過生物樣本庫崗前培訓,參加醫(yī)院科室內(nèi)外部業(yè)務學習來上崗任職。同時,醫(yī)院也缺乏生物樣本庫人員的考核標準、職稱評審體系等,大部分研究型醫(yī)院都是掛靠大學及醫(yī)院的實驗員、研究員或者醫(yī)院的檢驗科人員、病理科或者參照行政人員的標準進行考核和職稱評審。

2.3 缺乏資源共享機制 生物樣本庫為臨床醫(yī)學研究提供了資源,但是有限的樣本資源滿足不了病因?qū)W研究所需要的病例數(shù)量,因而無法明確疾病發(fā)生發(fā)展的機制。單個項目通常會因為樣本數(shù)量不足而影響統(tǒng)計結(jié)果,而大項目所需要的樣本量極大,通常在人力、物力和時間上難以實現(xiàn),所以生物樣本庫建設最主要的目的是整合和共享生物資源[12]。生物樣本庫資源共享的前提是信息資源共享,需要信息資源高度的同質(zhì)性?,F(xiàn)階段,各個生物樣本庫建設標準不一,收集樣本的方式和內(nèi)容各異,信息系統(tǒng)各異,不同單位的樣本庫信息管理系統(tǒng)對接成本高,難度大,再加上很多樣本庫無目的的收集樣本,無法進行整合,使得生物樣本資源共享難度加大,樣本利用率低,以至于很多樣本庫只存不取,成為“垃圾庫”或“死庫”。

2.4 樣本庫缺乏自身造血機制 醫(yī)院生物樣本庫作為樣本的儲存場所,不僅儲存組織、血液、尿液等實體樣本,還擁有這些樣本相對應的信息系統(tǒng),主要服務于醫(yī)學科學研究。樣本庫作為一個實體資源與海量數(shù)據(jù)資源的信息系統(tǒng)的綜合體,能夠為科學研究提供極其重要的資源支持。我國生物樣本庫建設起步時間相對國外生物樣本庫較晚,自身造血能力相對較弱,以提供樣本資源和儲存服務為主,提供技術支持能力相對較弱。同時,醫(yī)院生物樣本庫的建設中經(jīng)濟意識缺乏,資源有償服務制度和可持續(xù)發(fā)展機制缺失,使得樣本庫成為高投入、低產(chǎn)出科室,這在一定程度上制約了生物樣本庫的可持續(xù)發(fā)展。

3 對策

3.1 加強生物樣本庫標準化建設 高標準、高水平的生物樣本庫是實現(xiàn)精準醫(yī)學與轉(zhuǎn)化醫(yī)學的樣本來源基礎。一個全流程的生物樣本庫標準化的建設,需要從生物樣本的采集前的申請、倫理委員會的審查、知情同意,到樣本的采集、處理、存儲、包裝、使用、運輸?shù)戒N毀的全流程的標準的制定與落實[13]。我國生物樣本庫在后期建設中,要嚴格按照ISO 20387:2018標準進行生物樣本庫的建設,充分借鑒國際上建設樣本庫的成功經(jīng)驗及標準,如《ISBER最佳實踐》、加拿大組織庫協(xié)作網(wǎng)絡的《樣本庫標準操作流程》等。同時也需要根據(jù)我國特有國情和地區(qū)特色,形成一套完整的生物樣本庫標準化建設流程,并建立獎懲機制,加強政府對高質(zhì)量生物樣本庫的投入,對于不符合標準的生物樣本庫應加強監(jiān)督,限期整改,整改不到位的進行約談,相應減少當年對該樣本庫的投入,促使其符合標準,進一步提高我國生物樣本庫建設質(zhì)量。

3.2 建立生物樣本學科,培養(yǎng)高素質(zhì)專業(yè)人才 學科發(fā)展與人才培養(yǎng)如影隨形,一門新型學科的快速發(fā)展離不開高級專業(yè)人才,同樣高級專業(yè)人才的培養(yǎng)需要學科的發(fā)展。生物樣本庫在我國已有20多年的歷史,但是至今都沒有形成一門專業(yè)學科,使得樣本庫人員的發(fā)展也受到了很大的限制。亟需要BBCMBA及行業(yè)專家學者達成一致意見,爭取在教育部創(chuàng)建一門新型學科,推動生物樣本學的發(fā)展,培養(yǎng)高素質(zhì)樣本庫專職人員,推動轉(zhuǎn)化醫(yī)學和精準醫(yī)學的發(fā)展,促進全人類健康發(fā)展。各個生物樣本庫也應該加強對其工作人員的內(nèi)外部培訓,鼓勵到國內(nèi)外優(yōu)秀生物樣本庫進修學習,提升專業(yè)技術水平。

3.3 整合共享樣本資源,提高樣本利用率 生物樣本信息共享是當前生物樣本庫發(fā)展的主流方向。早在2008年歐盟就實施了歐洲生物樣本庫與生物分子資源研究計劃,解決了生物樣本整合所需要的法律法規(guī)、資金來源、管理模式以及技術協(xié)調(diào)問題,實現(xiàn)了樣本信息共享共用。英國生物樣本庫于2017年開始正式向全球研究者開放全部數(shù)據(jù),是目前全球最大規(guī)模的醫(yī)學生物樣本數(shù)據(jù)庫。2015年,我國啟動精準醫(yī)療計劃,預計在2030年投入600億人民幣來發(fā)展精準醫(yī)療市場,為生物樣本庫的發(fā)展提供利好政策環(huán)境[14]。抓住國家大力發(fā)展大數(shù)據(jù)平臺和精準醫(yī)療的機遇,利用樣本庫前處理工作站,自動化存儲系統(tǒng)和自動化核酸提取設備,建設智能化生物樣本庫,使得生物樣本質(zhì)量得到保證,存儲集約高效,操作靈活便捷,降低人力成本和運行及維護成本,提高樣本利用率。我國作為人類遺傳資源大國,在生物樣本共享領域也應該積極推進,整合各個生物樣本庫資源,建立樣本信息化管理系統(tǒng),避免“垃圾庫”、“死庫”的產(chǎn)生,進而建立健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)共享平臺、建立科研成果轉(zhuǎn)化基地和建立國家精準醫(yī)療研究中心,實現(xiàn)數(shù)據(jù)互聯(lián)互通,共享使用,提高樣本資源的使用率,促進醫(yī)學科學研究的發(fā)展。

3.4 促進生物樣本庫可持續(xù)發(fā)展 生物樣本庫作為一個資源庫,應該充分發(fā)揮自身優(yōu)勢,在標準化建設下,積極發(fā)揮自身造血功能,為科研人員提供有償服務。生物樣本庫的建設和運行需要投入大量的人力、物力、財力,制定合理的生物樣本有償使用和服務價值體系,合理收取樣本資源的使用費用、檢測費用、存儲費用及耗材費用等,用于樣本庫的運行與維護,以實現(xiàn)樣本和服務的價值屬性,促進生物樣本庫的可持續(xù)發(fā)展,形成良性的以資源養(yǎng)資源的動態(tài)發(fā)展[3]。我國生物樣本庫建設還可以采用政府和社會資本合作模式,利用社會資本資金雄厚、資本運作方式靈活、市場意識強的優(yōu)勢[15],不僅可以緩解生物樣本庫資金壓力,將學術創(chuàng)新進行轉(zhuǎn)化應用到臨床實踐,進一步推動生物樣本庫可持續(xù)發(fā)展。

綜上,如何實現(xiàn)生物樣本庫的標準化建設、充分發(fā)揮資源共享能力、加快學科建設和高素質(zhì)樣本庫人才培養(yǎng)及發(fā)揮樣本庫自身的造血功能成為我國生物樣本建設中亟待解決的關鍵問題。

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