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基于線性混合效應(yīng)模型的腦結(jié)構(gòu)影像的研究

2020-03-04 02:48:41張豪王昕璨李瑤郭冬喜郭浩
現(xiàn)代電子技術(shù) 2020年2期
關(guān)鍵詞:結(jié)果分析

張豪 王昕璨 李瑤 郭冬喜 郭浩

摘 ?要: 已有研究經(jīng)常忽略現(xiàn)實情況中年齡和性別對于大腦結(jié)構(gòu)影像數(shù)據(jù)的影響,導(dǎo)致特征選取的有效性降低,最終造成分類準確率的降低。為此,提出基于線性混合效應(yīng)模型的方法進行特征選擇,考慮到年齡和性別對影像指標的影響,通過相關(guān)顯著性的大小選取腦影像指標作為特征構(gòu)建分類器,應(yīng)用于不同人格特質(zhì)的組內(nèi)分類及識別中。分類結(jié)果顯示,基于線性混合效應(yīng)模型的方法使得不同人格分類準確率有較明顯的提高。

關(guān)鍵詞: 腦結(jié)構(gòu)影像; 線性混合效應(yīng)模型; 特征選取; 大腦白質(zhì)計算; 人格分類; 結(jié)果分析

中圖分類號: TN911.73?34; TP181 ? ? ? ? ? ? ?文獻標識碼: A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 文章編號: 1004?373X(2020)02?0145?04

Research on brain structure image based on linear mixed effect model

ZHANG Hao1, WANG Xincan2, LI Yao1, GUO Dongxi1, GUO Hao1

Abstract: The previous studies have often overlooked the influence of age and gender on brain structure image data in the real situation, which leads to the reduction in the effectiveness of feature selection and ultimately in the classification accuracy. On this basis, a method based on the linear mixed effect model is proposed for the feature selection. In consideration of the influences of age and gender on image indexes, the brain image indexes are selected based on the size of correlation significance as features to construct the classifier, which is applied to the intra?group classification and recognition for different personality traits. The classification results show that the method based on the linear mixed effect model can obvious improve the accuracy of different personality classification.

Keywords: brain structure image; linear mixed effect model; feature selection; white matter calculation; personality classification; result analysis

0 ?引 ?言

近年來隨著腦科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,人類大腦的結(jié)構(gòu)影像特征越來越受到關(guān)注。個體腦影像特征分析有助于促進對人類神經(jīng)生物學(xué)基礎(chǔ)的認識并具有提供相關(guān)影像學(xué)標記的潛在價值[1]。彌散張量成像技術(shù)(Diffusion Tensor Imaging,DTI),是一種描述大腦結(jié)構(gòu)的新方法,是目前唯一能無創(chuàng)繪制大腦白質(zhì)神經(jīng)纖維通路的方法。多數(shù)學(xué)者認為DTI技術(shù)能非常準確地顯示大腦中主要的白質(zhì)纖維束,并且能夠通過若干特征性參數(shù)反應(yīng)大腦神經(jīng)系統(tǒng)。

已有研究表明年齡和性別是腦結(jié)構(gòu)影像數(shù)據(jù)的重要影響因素,并且已被證明與人格相互作用。而在以往的關(guān)于腦影像學(xué)的研究中,多忽略年齡和性別可能會對實驗結(jié)果所產(chǎn)生的影響,如利用皮爾遜相關(guān)系數(shù)法、斯皮爾曼相關(guān)系數(shù)法[2]等。而為了便于考慮到年齡和性別因素,文獻[3?4]采用了基于一般線性模型的多元回歸分析方法。該方法可以同時將多個對觀察變量產(chǎn)生影響的因素進行分析,但傳統(tǒng)的線性模型對于反應(yīng)變量還有三個假定要求:正態(tài)性、獨立性以及方差齊性。而人類腦影像數(shù)據(jù)由于性別和年齡段的不同可能存在一些群體特性,這就導(dǎo)致獨立性條件的不滿足,最終造成結(jié)果的偏差。為了兼顧年齡和性別這兩個影響因素,同時克服一般線性模型對于觀察變量必須具有的獨立性的要求,本文從個體的腦影像學(xué)特征出發(fā),提出建立線性混合效應(yīng)模型的方法。

線性混合效應(yīng)模型[5]的方法對于神經(jīng)影像學(xué)數(shù)據(jù)基于群體的推斷已經(jīng)被證明是有效的,這在分析功能磁共振成像數(shù)據(jù)和結(jié)構(gòu)磁共振成像數(shù)據(jù)的研究中已經(jīng)得到了證明[6]。該方法將年齡和性別作為無興趣的協(xié)變量納入模型,而人格特質(zhì)得分作為興趣變量納入模型,探索各個腦區(qū)腦影像指標與人格特質(zhì)得分間的關(guān)系,研究不同腦區(qū)對正常被試不同人格特質(zhì)的影響,并以此為依據(jù)實現(xiàn)不同人格被試的分類。

本文中主要工作包括:

1) 計算所有正常被試的腦影像指標;

2) 建立混合效應(yīng)模型對不同腦區(qū)影像指標與人格特質(zhì)得分間的相關(guān)性進行研究,根據(jù)相關(guān)顯著性大小進行特征選擇;

3) 以挑選出的腦區(qū)影像指標作為特征構(gòu)建分類器,從而分別實現(xiàn)對外傾性人格特質(zhì)與神經(jīng)質(zhì)人格特質(zhì)的組內(nèi)分類。

1 ?數(shù)據(jù)采集與預(yù)處理

1.1 ?被試者

本研究根據(jù)山西省醫(yī)學(xué)倫理委員會(參考編號:2012.13)的建議,在所有被試者書面知情同意的情況下進行。所有被試者均按照赫爾辛基宣言簽署書面知情同意書,由工作人員統(tǒng)一安排,記錄性別、年齡等人口學(xué)信息并進行編碼,采用艾森克人格問卷(EPQ)調(diào)查被試的人格特質(zhì),所有被試均在安靜舒適的心理評估室完成自評量表的填寫,問卷統(tǒng)一收回進行數(shù)據(jù)錄入。對于被試的分組,根據(jù)EPQ龔耀先教授修訂本的評分細則進行分組,由于艾森克量表的第三維度——精神質(zhì)的定義及神經(jīng)生理機智的不明確性,本文不對這一維度進行分組及研究。被試者基本信息如表1所示。

1.2 ?數(shù)據(jù)采集與預(yù)處理

本文研究使用西門子3T超導(dǎo)MRI掃描儀(Siemens Trio 3?Tesla Scanner,Siemens,Erlangen,Germany)對200名正常右利手被試進行彌散張量磁共振掃描。被試基本信息見表1。在掃描過程中,要求被試放松,閉眼,保持清醒狀態(tài),盡量不做任何思考。掃描參數(shù)設(shè)置如下:45 axial slices,repetition time(TR)=6 000 ms,echo time(ET)=90 ms,thickness/skip=3/0 mm,field of view (FOV)=240 mm[×]240 mm,matrix=128 mm[×]128 mm,flip angle=90°。擴散敏感梯度方向為12,擴散敏感系數(shù)b=1 000 s/mm2。

彌散張量成像數(shù)據(jù)預(yù)處理使用Panda軟件進行。首先對數(shù)據(jù)集進行格式轉(zhuǎn)換(DICOM轉(zhuǎn)換為NifTI),然后提取b0值,進行腦提取去除非腦組織、渦流校正和頭動校正、空間標準化以及高斯平滑等。

2 ?方 ?法

基于線性混合效應(yīng)模型的腦結(jié)構(gòu)影像的分析及分類研究方法包括以下步驟:數(shù)據(jù)預(yù)處理;計算基于白質(zhì)分區(qū)圖譜的大腦白質(zhì)指標;建立線性混合效應(yīng)模型對白質(zhì)指標與人格特質(zhì)得分的相關(guān)性進行分析,根據(jù)相關(guān)性分析的結(jié)果進行特征選擇,最后使用支持向量機的方法進行分類。

2.1 ?大腦白質(zhì)指標的計算

本文采用現(xiàn)有的約翰霍普金斯大學(xué)的ICBM?DTI?81白質(zhì)分區(qū)圖譜[7]進行大腦區(qū)域的劃分,共將大腦分為50個白質(zhì)纖維束區(qū)域。本文共選擇四種DTI圖像特征參數(shù),包括各向異性分數(shù)(Fractional Anisotropy,F(xiàn)A)、平均彌散率(Mean Diffusivity,MD)、徑向彌散系數(shù)(Radial Diffusivity,RD)以及軸向彌散系數(shù)(Axial Diffusivity, AD),用于描述體素特性。

各向異性分數(shù)(Fractional Anisotropy,F(xiàn)A)是分析各向異性最常用的參數(shù),指彌散的各向異性部分占彌散張量總值的比例。計算公式如下:

[FA=32·(λ1-λ)2+(λ2-λ)2+(λ3-λ)2λ21+λ22+λ23] ?(1)

式中,[λ1,λ2,λ3]是彌散張量矩陣的三個特征值,分別表示沿三個正交方向上的彌散率;[λ=λ1+λ2+λ33]。

平均擴散率(Mean Diffusivity,MD)反映水分子整體的彌散水平,只表示水分子彌散的大小和程度,而與彌散方向無關(guān)。計算公式如下:

[MD=λ1+λ2+λ33] ? ? ? ? ? ?(2)

徑向彌散系數(shù)(Radial Diffusivity,RD)反映與軸突長軸成對角平面的水分子彌散水平。計算公式如下:

[RD=λ2+λ32] ? ? ? ? ? ? (3)

軸向彌散系數(shù)(Axial Diffusivity,AD)反映與軸突方向平行的水分子的彌散水平。計算公式如下:

[AD=λ1] ? ? ? ? ? ? ?(4)

2.2 ?線性混合效應(yīng)模型

線性混合效應(yīng)模型的一般形式結(jié)構(gòu)為:

[y=Xβ+Uγ+ε] ? ? ? ? ?(5)

式中:[y]表示反應(yīng)變量的測量值向量;[X]為固定效應(yīng)自變量的設(shè)計矩陣;[β]是與[X]對應(yīng)的固定效應(yīng)參數(shù)向量;[U]為隨機效應(yīng)變量構(gòu)造的設(shè)計矩陣,其構(gòu)成方式與[X]相同,[γ]為隨機效應(yīng)參數(shù)向量;[ε]為隨機誤差向量[8]。

本文中通過計算大腦白質(zhì)指標FA,MD,RD及AD等來描述體素特性。在建立模型之前,首先針對各指標特征,對其進行相應(yīng)的對數(shù)轉(zhuǎn)化,使其呈近似正態(tài)分布,滿足模型建立的條件。然后建立混合效應(yīng)模型,分別將所有被試者的不同腦白質(zhì)指標作為反應(yīng)變量的觀察值向量,以被試者的不同人格特質(zhì)得分構(gòu)造固定效應(yīng)的設(shè)計矩陣,又將各個被試的年齡、性別作為隨機效應(yīng)構(gòu)造隨機效應(yīng)的設(shè)計矩陣。

模型公式如下:

[y=β0+β1E+β2N+γ0+γ1AGE+γ2SEX] ?(6)

式中:y對應(yīng)于所有被試的同一白質(zhì)纖維束的同一白質(zhì)指標值構(gòu)成的向量;E和N分別是各個被試的外傾性人格特質(zhì)得分和神經(jīng)質(zhì)人格特質(zhì)得分;AGE和SEX分別是各個被試者的年齡和性別。

分析線性混合效應(yīng)模型最終結(jié)果,以相關(guān)顯著性p<0.05為依據(jù)挑選與人格特質(zhì)相關(guān)的白質(zhì)纖維束。

2.3 ?分 ?類

本文在線性混合效應(yīng)模型最終結(jié)果的基礎(chǔ)上,分別得到與外傾性和神經(jīng)質(zhì)人格特質(zhì)相關(guān)的大腦白質(zhì)纖維束,將相關(guān)的大腦白質(zhì)纖維束指標作為分類特征。為了消除所選特征中可能存在的冗余情況,又對各特征間進行了兩兩冗余分析,得到最終與人格特質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵特征集合。

為了自動鑒別不同人格特質(zhì)數(shù)據(jù),本文使用機器學(xué)習(xí)的方法來構(gòu)建分類器。被廣泛使用的分類器有多種,其中包括決策樹、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、線性判別分析等。

每種分類算法都有其適用的場合和其特有的優(yōu)缺點,而支持向量機(Support Vector Machine,SVM)分類算法比較適合對小樣本數(shù)據(jù)的處理。結(jié)合磁共振影像數(shù)據(jù)的特點,本文選取支持向量機分類算法進行分類。它是基于Matlab的LIBSVM工具包[9]進行分類,并采用10折交叉驗證(10?fold cross?validation)的方法來評估分類器的泛化性能。具體的過程是將所有的被試隨機分成10等分,逐一將其中的1等分作為測試集,剩余的9等分是訓(xùn)練集,取10次結(jié)果的均值作為對分類器性能的評估。同時,為了得到更精確的結(jié)果,本實驗進行100次10折交叉驗證,最后對100次的結(jié)果求均值得到最終的結(jié)果。以最常用的分類器性能的量化指標正確率(Accuracy),敏感度(Sensitivity),特異度(Specificity)和AUC值作為評價標準。

3 ?結(jié) ?果

3.1 ?特征選擇

在本文中,將相關(guān)顯著性閾值p設(shè)為0.05,發(fā)現(xiàn)與艾森克人格的外傾性維度E相關(guān)的纖維束主要出現(xiàn)在內(nèi)側(cè)丘系,小腦上腳以及鉤束;而與艾森克人格的神經(jīng)質(zhì)維度相關(guān)的纖維束主要出現(xiàn)在矢狀層(包括下縱束以及額枕下束)、小腦中腳、內(nèi)側(cè)丘系、膜狀層以及后丘腦輻射(包括視神經(jīng)輻射),具體如表2所示。

本研究中得到的纖維束所涉及到的腦區(qū)可能對外傾性和神經(jīng)質(zhì)人格特質(zhì)有一定的影響,與已有研究中得到的結(jié)論也大體一致。

例如,Wright 等人報道了大腦中內(nèi)側(cè)前額葉區(qū)域與內(nèi)外向存在關(guān)聯(lián)性;Wei 等人報道了與內(nèi)外向相關(guān)的腦區(qū)發(fā)生在內(nèi)側(cè)前額葉部分、小腦、扣帶回及腦島等部位,而與神經(jīng)質(zhì)相關(guān)的腦區(qū)位于左側(cè)額中回[10];Hahn 等人通過研究發(fā)現(xiàn)紋狀體及眶額葉部位與人格特質(zhì)存在關(guān)聯(lián)性[11];Fischer等人報道了內(nèi)外向與殼核,尾狀核等皮層下的結(jié)構(gòu)相關(guān)聯(lián);O′Gorman等人報道了內(nèi)外向得分與丘腦及額下回等腦區(qū)相關(guān)聯(lián);文獻[12]通過研究找到內(nèi)外向與紋狀體、楔前葉及額上回等腦區(qū)相關(guān),而神經(jīng)質(zhì)與額中回及楔前葉相關(guān)。

3.2 ?分類結(jié)果

本文將通過線性混合效應(yīng)模型分析挑選出的大腦白質(zhì)纖維束指標作為分類特征,分別進行外傾性和神經(jīng)質(zhì)人格特質(zhì)的組內(nèi)分類。同時,本文利用同樣的通過相關(guān)性分析方法進行特征選擇的思想,進行了皮爾遜相關(guān)系數(shù)和多元線性回歸的統(tǒng)計分析方法選取特征并進行分類的實驗。

分類結(jié)果如表3 所示。

由兩種人格特質(zhì)組內(nèi)分類結(jié)果可知,本文所提出的利用線性混合效應(yīng)模型做相關(guān)的分析方法,不僅能夠綜合考慮年齡和性別影響因素,而且彌補了已有方法中的缺陷,從而提高了分類的準確率。

4 ?結(jié) ?語

本文基于線性混合效應(yīng)模型的腦結(jié)構(gòu)影像的分析及分類研究在真實的人格數(shù)據(jù)集上得到了有效的驗證,所得相關(guān)性研究成果與現(xiàn)有研究結(jié)果大致相吻合,表明此方法可以用于對腦結(jié)構(gòu)影像與人格特質(zhì)的有關(guān)中,并且能夠?qū)崿F(xiàn)對不同人格進行分類。本文所提方法能夠兼顧年齡和性別因素對于腦影像數(shù)據(jù)所產(chǎn)生的影響,并克服了傳統(tǒng)的一般線性模型的三個假定要求所帶來的問題。分類的結(jié)果顯示,基于線性混合效應(yīng)模型的腦結(jié)構(gòu)影像的分析及分類方法對不同人格特質(zhì)的分類準確率均有所提高。

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作者簡介:張 ?豪(1994—),女,山西運城人,碩士研究生,主要研究方向為人工智能、智能信息處理、腦信息學(xué)。

郭 ?浩(1981—),男,山西太原人,博士,副教授,CCF會員,研究領(lǐng)域為人工智能、智能信息處理與腦影像學(xué)。

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