舒春暉 王麗倩 溫小姿 安瑞 沈浩 王賢軍
艱難梭菌(Clostridium difficile)是革蘭陽性、專性厭氧的芽孢桿菌,為人體腸道中的正常菌群,也是導致抗生素相關性腹瀉的主要原因。臨床大量使用抗菌藥物、免疫抑制劑、質子泵抑制劑或化療藥物等導致腸道微生態(tài)失衡,引發(fā)艱難梭菌感染(Clostridium difficile infection,CDI),其主要致病機制與該菌產毒素A(tcdA)和毒素B(tcdB)有關[1],毒素A是一種腸毒素,毒素B為細胞毒素,其分別由tcdA和tcdB基因編碼。據美國2014 年一項研究報道,2010年住院患者CDI的發(fā)病率比2001年幾乎增加了1倍[2]。隨著全球CDI的爆發(fā)和流行,國內感染CDI病例的報道日漸增多,MLST分型逐漸被公認為操作簡便、重復性好的分子技術。該方法通過PCR 擴增多個管家基因內部片段并測定其序列,確定細菌ST型別。2017年美國感染協(xié)會制定了關于成人和兒童艱難梭菌感染最新診療指南[3],針對CDI癥狀的定義,腹瀉患者檢測到產毒型艱難梭菌或偽膜性結腸炎的癥狀,根據患者的白細胞數、血肌酐水平以及臨床癥狀等將CDI嚴重程度分為輕度、中度、重度和極重度的分級體系[3]。但由于我國艱難梭菌研究起步較晚,有關 CDI的系統(tǒng)研究報道較少,更無關于艱難梭菌毒素基因、MLST分型和CDI嚴重程度相關性的研究,作者課題組前期研究發(fā)現[4],艱難梭菌毒素蛋白陽性患者常伴有嚴重的艱難梭菌感染,基于以上基礎,本實驗回顧性分析艱難梭菌分子分型與艱難梭菌感染分級的相關性,現報道如下。
1.1 一般資料 收集2016年3月1日至2017年5月30日杭州市第一人民醫(yī)院腹瀉患者糞便樣本860例,同時收集患者的基本臨床資料,包括患者的姓名、性別、年齡、就診科室和臨床診斷等。患者鈉入標準:腹瀉時間>48h;腹瀉>3次/d。采集不成形糞便標本(≥5ml)送檢,每份樣本分裝2管,-80℃凍存?zhèn)溆糜贑D培養(yǎng)和毒素基因檢測,已通過醫(yī)院倫理委員會的免簽知情同意書。
1.2 儀器與試劑 (1)實驗儀器:MALDI-TOF質譜儀(德國Bruker-Daltonics公司);厭氧培養(yǎng)系統(tǒng)(荷蘭Anoxomat MARK公司);CO2培養(yǎng)箱(美國Thermo Fisher公司);Veriti 96PCR儀(美國Applied Biosystems公司);裂解儀(中國博日科技有限公司);漩渦混勻器(美國Binder公司);高速冷凍離心機(美國Eppendorf公司);生物安全柜(上海力申科學儀器有限公司)等。(2)實驗試劑:PCR緩沖液、DNA聚合酶、dNTPs、Mgcl2(美國Pfizer公司);QIAGE QIAamp DNA Stool Mini Kit(德國QIAGE公司);艱難梭菌選擇性培養(yǎng)基(法國Merieux公司)。
1.3 方法 (1)艱難梭菌厭氧培養(yǎng)及鑒定:對860份腹瀉樣本經室溫解凍,經75%酒精處理后涂布于CCFA培養(yǎng)基,37℃厭氧培養(yǎng)48h,挑取灰黑扁片的可疑菌落采用質譜鑒定。(2)基因組DNA提取及分子檢測:艱難梭菌基因組DNA提取按照QIAGE試劑盒說明書進行。通過PCR技術擴增毒素基因A和B,其引物序列參考 Lemee[5]和 Kato[6]團隊的研究方案,tcdA的PCR反應條件如下:94℃預變性15min,35個循環(huán)94℃變性30s,52℃退火30s,72℃延伸40s,最后延伸72℃5min。tcdB的PCR反應條件如下:94℃預變性15min,35個循環(huán)94℃變性20s,62℃退火120s,74℃延伸40s,最后延伸72℃5min。多位點序列分型(MLST)引物參照Griffth等[7]文獻,反應體系包括PCR總反應體系50μl:滅菌雙蒸水22μl,TAKARA Taq Premix酶 25μl,上下游引物各1μl,模板DNA1μl。選取7個管家基因(adk,atpA,dxr,glyA,recA,sodA和tpi)進行 PCR 擴增并測序,將序列與數據庫比對,分析菌株的ST型別。(3)艱難梭菌感染嚴重分級:參照2017版美國感染病協(xié)會(IDSA)制定的艱難梭菌感染的診療指南[3],將艱難梭菌感染嚴重程度分為3級。輕度(1級):血白細胞升高但<15000/mm3,且血肌酐<1.5mg/dl;中度(2級):血白細胞>15000/mm3,或血肌酐>1.5mg/dl;重度和極重度(3級):出現由艱難梭菌感染引起的低血壓、休克、腸梗阻、巨結腸等嚴重疾病。
1.4 統(tǒng)計學方法 采用SPSS 19.0統(tǒng)計學軟件。計量資料以(±s)表示,采用t檢驗和Fisher確切概率法的數據分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
2.1 臨床資料 根據患者的臨床資料和檢測結果,860例腹瀉糞便中共檢出艱難梭菌98例,產毒型艱難梭菌94株,tcdA-tcdB+菌株52株(55.3%,52/94),tcdA+tcdB+菌株42株(44.7%,42/94)。其中男52例,女42例。社區(qū)CDI構成比占45.7%,院內CDI構成比占54.3%。
2.2 不同艱難梭菌毒素基因表型和CDI患者臨床指標結果分析 統(tǒng)計分析毒素基因tcdA-tcdB+與tcdA+tcdB+在腹瀉次數、血白細胞計數、肌酐水平及白蛋白數值的差異,血白細胞計數和肌酐水平的差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。見表1。
表1 不同艱難梭菌毒素基因表型的CDI患者臨床指標結果分析(±s)
表1 不同艱難梭菌毒素基因表型的CDI患者臨床指標結果分析(±s)
項目 tcdA-tcdB+(n=52) tcdA+tcdB+(n=42) t值 P值腹瀉次數(次/d) 3.9423±1.56448 3.5476±1.25333 -1.049 0.294白細胞計數(×109/L) 11.4327±5.38767 8.5721±3.01014 -2.434 0.015白蛋白(g/L) 35.3923±9.07174 37.2643±8.40267 -0.776 0.438肌酐(μmol/L) 90.6731±92.54818 59.3817±21.13482 -2.211 0.027
2.3 艱難梭菌毒素基因表型與CDI類別的相關性分析 艱難梭菌毒素基因tcdA-tcdB+患者在院內CDI占61.5%,毒素基因tcdA-tcdB+和tcdA+tcdB+在院內和社區(qū)CDI的構成比無明顯差異(P=0.115)。艱難梭菌毒素基因tcdA-tcdB+患者中21.2%為CDI Ⅲ級,毒素基因tcdA-tcdB+和tcdA+tcdB+的CDI各級構成比有差異(P=0.007),表明tcdA-tcdB+相比tcdA+tcdB+更易引起嚴重的艱難梭菌感染。見表2。
表2 艱難梭菌毒素基因表型與CDI類別的相關性分析[n(%)]
2.4 艱難梭菌MLST分型中ST37型與非ST37型患者各臨床檢測結果分析 94株艱難梭菌共分離出15種ST型,其中數量最多的分別為ST37型25株(26.6%,25/94),ST54型20株(21.3%,20/94)和ST81型15株(16.0%,15/94)。分析ST37型與非ST37型在腹瀉次數、血白細胞計數、肌酐水平及白蛋白數值的差異,發(fā)現腹瀉次數和血白細胞計數差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。見表 3。
表3 艱難梭菌ST37型和非ST37型中CDI患者臨床指標結果(±s)
表3 艱難梭菌ST37型和非ST37型中CDI患者臨床指標結果(±s)
類別 ST37(n=25) 非ST37(n=69) t值 P值腹瀉次數(次/d) 5.357±1.906 5.025±6.647 -2.862 0.004白細胞計數(×109/L) 12.316±5.309 9.395±4.239 -2.453 0.014白蛋白(g/L) 37.212±8.431 35.827±8.998 -0.702 0.483肌酐(μmol/L) 91.840±97.266 71.588±60.139 -1.023 0.306
2.5 艱難梭菌ST37型和非ST37型與CDI類別的相關性分析 艱難梭菌ST37型與非ST37型在院內和社區(qū)CDI的構成比無明顯差異(P=0.792)。但艱難梭菌ST37型和非ST37型患者CDI各級構成比有顯著差異(P=0.011),其中ST37型患者中28.0%為CDI Ⅲ級,表明艱難梭菌ST37更易引起嚴重的CDI,見表5。
表5 艱難梭菌ST37型和非ST37型與CDI類別的相關性分析
2000年以來,艱難梭菌相關性感染的發(fā)病率不斷上升,尤其是高毒力菌株RT027/NAP1/BI在歐美地區(qū)暴發(fā)流行,病死率也迅速增加,已成為影響全球公共衛(wèi)生的健康問題[8]。我國 CD感染率也正在不斷上升,Chen等[9]研究了浙江省三甲醫(yī)院的1845位腹瀉患者,并分離到艱難梭菌產毒菌株161株,分離率8.73%,本次研究中產毒素株分離率高達10.9%(94/860),足見我省艱難梭菌感染的嚴重性。毒素是艱難梭菌感染主要的致病因素,毒素A是腸毒素,主要引起腸道炎癥,導致腸壁出血壞死;毒素B是細胞毒素,可刺激單核細胞釋放炎性細胞因子,直接損傷腸壁細胞,嚴重的甚至造成偽膜性腸炎[10]。歐美國家流行的艱難梭菌主要以tcdA+tcdB+菌株為主,而亞洲國家tcdA-tcdB+菌株主要以ST37為主[11],本研究顯示,tcdA-tcdB+和tcdA+tcdB+基因表型為主要流行特征,其中tcdA-tcdB+ 基因型的大部分菌株是ST37型,這和Dazhi Jin等[12]關于艱難梭菌在中國東部的分子流行病學研究的報道一致。
本研究發(fā)現tcdA-tcdB+菌株比tcdA+tcdB+菌株更能引起CD感染患者白細胞計數和肌酐水平升高,并且CDI Ⅲ級中全為tcdA-tcdB+基因型,提示tcdA-tcdB+可能更易引起嚴重CDI。有報道顯示,只產毒素B的菌株(tcdA-tcdB+)容易引起暴發(fā)流行和偽膜性結腸炎[13]。也有 Pengcheng Du等[14]提出,tcdA-tcdB+毒素表型的艱難梭菌容易引起醫(yī)院感染爆發(fā),并在全球范圍內被頻繁檢出,tcdA-tcdB+患者常伴有嚴重的臨床癥狀和較高復發(fā)率,但其發(fā)病機制尚待進一步研究。
ST37型是目前中國常見的流行特征[15],本研究發(fā)現CDI Ⅲ級的11例患者中7例為ST37型。由Tian等提出[16],ST37型有更強的致病能力和耐藥性。國內少有文獻關于ST37型與臨床檢驗結果相關性的報道,本研究發(fā)現ST37型比非ST37型腹瀉次數更多、白細胞計數更高,且差異有統(tǒng)計學意義,這可能是因為ST37型的tcdA和tcdB基因與高毒力菌株具有相似性,表現出更強的毒性[17],導致患者臨床癥狀更明顯,病情更嚴重。但ST37型的致病機制仍不清楚。
綜上所述,毒素基因tcdA-tcdB+比tcdA-tcdB+患者白細胞計數和肌酐水平更高,常伴有嚴重的腹瀉等癥狀。ST37型患者腹瀉次數更多、白細胞計數更高,更容易導致艱難梭菌感染。因此,對艱難梭菌感染患者應及時進行菌株毒素基因檢測和MLST分型,可為臨床更精準的診療提供幫助。