熊紅蓮,王茗祎,謝慧嫻,顏倚媚,鐘會(huì)清
(1.佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院 a.物理與光電工程學(xué)院; b.口腔醫(yī)學(xué)院, 佛山528000;2.華南師范大學(xué)生物光子學(xué)研究院, 國(guó)家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥與光子技術(shù)三級(jí)實(shí)驗(yàn)室, 廣州 510631)
乳腺癌是危害女性生命的主要腫瘤之一,早期診斷和臨床治療可以顯著提高病人的生存率。現(xiàn)有乳腺癌的成像診斷技術(shù)包括鉬靶X射線和超聲影像,但只能檢測(cè)較小的腫塊[1]。傳統(tǒng)的血清腫瘤標(biāo)志物糖類抗原(carbohydrate antigen 153,CA153)、癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)與乳腺癌抗原(breast cancer antigen 225,BCA225)等雖然可以檢測(cè)到早期的乳腺癌,但特異性和敏感性較低,容易造成誤診和漏診[2,3]。最近,液體活檢已成為一種極具潛力的方法,可早期診斷疾病和監(jiān)測(cè)患者的健康。該方法基于使用各種技術(shù)檢測(cè)人流體循環(huán)中的腫瘤標(biāo)志物,例如:循環(huán)腫瘤細(xì)胞(circulating tumor cell,CTC),循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)和外泌體的鑒定和定量。其中,由于外泌體在人體液中的穩(wěn)定存在,分析患者體內(nèi)循環(huán)的外泌體被認(rèn)為是一種創(chuàng)新且有前途的方法,可用于癌癥的早期診斷。外泌體是活細(xì)胞分泌并排泄到胞外的微小囊泡,直徑為40~150 nm[4,5]。外泌體的成分反映了釋放細(xì)胞的組成成分,包括多種蛋白質(zhì)、核酸等成分,以及特異性的 CD9、CD81、CD63、TSG101、HSP70、HSP90和miRNA 等生物分子[6],可作為疾病診斷的新型標(biāo)志物,是釋放細(xì)胞的“指紋”物。已有研究表明外泌體在乳腺癌細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖和轉(zhuǎn)移等過程中發(fā)揮重要作用[7]。有報(bào)道乳腺癌患者體液中外泌體的數(shù)量增多,其所攜帶的分子與正常乳腺上皮細(xì)胞釋放的外泌體顯著不同,尤其是核酸和蛋白質(zhì)含量明顯增加[7]。
目前外泌體的檢測(cè)方法主要包括透射電子顯微鏡(transmission electron microscope,TEM),動(dòng)態(tài)光散射(dynamic light scattering,DLS),納米粒子跟蹤分析(nanoparticle tracking analysis,NTA),流式細(xì)胞儀和蛋白質(zhì)印跡[8,9]。其中,外泌體的TEM檢測(cè)是一項(xiàng)金標(biāo)準(zhǔn),可以看到囊泡的形態(tài)和大小。但是SEM只能確定其存在,不能鑒別正常和腫瘤來源的外泌體。DLS和NTA也只能提供有關(guān)粒徑和分布的信息。流式細(xì)胞術(shù)既可以分析粒徑,還可以通過細(xì)胞熒光標(biāo)記鑒定外泌體的來源和亞群。但是標(biāo)準(zhǔn)流式細(xì)胞術(shù)不能檢測(cè)到小于300 nm的顆粒。而蛋白質(zhì)印跡需要破碎外泌體后,間接測(cè)定其表達(dá)的特征蛋白,如四跨膜蛋白(CD9,CD63和CD81),熱休克蛋白等。因此腫瘤特異性的快速檢測(cè)仍然是一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。
拉曼光譜技術(shù)通過分子振動(dòng)和轉(zhuǎn)動(dòng)產(chǎn)生的光譜信號(hào)就可獲得分子的結(jié)構(gòu)和物質(zhì)的成分信息,樣品無(wú)需標(biāo)記。因懸浮在PBS中的外泌體含量極小,拉曼散射效應(yīng)十分微弱,難以獲得清晰的拉曼光譜。增加激光功率并延長(zhǎng)曝光時(shí)間可以增強(qiáng)微弱的拉曼信號(hào),但激光功率超過10 mW,易燒傷生物學(xué)標(biāo)本[10]。表面增強(qiáng)拉曼散射(surface-enhanced Raman spectroscopy,SERS)技術(shù)將大量的樣品吸附在粗糙的金屬表面,當(dāng)激光束穿過懸浮膠體時(shí),不僅可使拉曼信號(hào)增強(qiáng)1013~1014倍,還能夠抑制生物樣品熒光背景[11]。SERS技術(shù)具有靈敏度高、準(zhǔn)確性好、操作簡(jiǎn)單等優(yōu)越性能,為外泌體檢測(cè)提供了新的希望。從理論上講,來自各種不同來源的外泌體具有特定功能的生物大分子。這意味著來自各種來源的外泌體具有特定的分子表型,從而反映不同的SERS譜型。因此SERS技術(shù)與外泌體檢測(cè)結(jié)合可區(qū)分不同細(xì)胞來源的外泌體。Park等[12]已經(jīng)報(bào)道了應(yīng)用SERS鑒別肺癌細(xì)胞來源的外泌體和正常細(xì)胞來源的外泌體的可行性。
本研究利用SERS技術(shù)檢測(cè)了從乳腺癌細(xì)胞MCF-7和人正常乳腺上皮細(xì)胞MCF-10A培養(yǎng)基上清中分離出來的外泌體,探索了SERS技術(shù)在乳腺癌中診斷的應(yīng)用價(jià)值,比對(duì)了MCF-7和MCF-10A細(xì)胞來源的外泌體SERS光譜,同時(shí)篩選出兩種不同細(xì)胞來源外泌體的特征光譜,最后分析特征性光譜的形成原因。
人乳腺上皮細(xì)胞MCF-10A和人乳腺癌細(xì)胞系MCF-7均購(gòu)于上海中國(guó)科學(xué)院細(xì)胞庫(kù)。表面增強(qiáng)的拉曼材料是納米銀增強(qiáng)基底,購(gòu)于云洋光電(深圳)有限公司。圖1是納米基底的掃描電鏡圖,粗糙的表面可以增加納米材料的表面增強(qiáng)能力。
圖1 納米銀基底的掃描電鏡圖Fig.1 Scan electron microscope image of the silver film substrate
正常人乳腺上皮細(xì)胞MCF-10A采用DMEM/F12培養(yǎng)基(含10%HS、1%青霉素/鏈霉素、0.1%HCl、0.02%EGF、0.1%胰島素、0.01%霍亂毒素),在37 ℃和5% CO2的條件下進(jìn)行培養(yǎng),當(dāng)細(xì)胞密度達(dá)到大約70%時(shí),用PBS對(duì)細(xì)胞洗滌3次,加入無(wú)血清DMEM/F12培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24 h,收集細(xì)胞培養(yǎng)上清液。
人乳腺癌細(xì)胞MCF-7在DMEM完全培養(yǎng)基中(含10%胎牛血清、青霉素100 μg/mL、鏈霉素100 μg/mL),培養(yǎng)于37 ℃,5% CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱內(nèi)。當(dāng)細(xì)胞密度達(dá)到大約70%時(shí),用PBS對(duì)細(xì)胞洗滌3次,加入含10%無(wú)外泌體的胎牛血清(Gibco)DMEM培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24 h,然后收集細(xì)胞培養(yǎng)上清液。
本試驗(yàn)采用差速超速離心法從細(xì)胞培養(yǎng)上清液中分離外泌體。收集細(xì)胞培養(yǎng)基上清液轉(zhuǎn)移至離心管中,于4 ℃下轉(zhuǎn)速為1 000 r/min離心10 min,棄沉淀,上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,于4 ℃下轉(zhuǎn)速為2 000 r/min離心20 min,棄沉淀,上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管中,在4 ℃下轉(zhuǎn)速為5 000 r/min離心30 min,棄沉淀,用0.22 μm微濾器過濾,留上清液,之后4 ℃下32 000 r/min超速離心90 min,低速離心獲得的細(xì)胞培養(yǎng)上清液不足時(shí),用PBS緩沖液補(bǔ)充配平。去上清液,將離心獲得的沉淀用無(wú)菌PBS重懸。再次在4 ℃下32 000 r/min超速離心90 min,去上清液,用100 μL PBS重懸沉淀,保存于-80 ℃冰箱備用。
透射電子顯微鏡(transmission electron microscope, TEM,日本電子株式會(huì)社JEM-1200EX)可視化測(cè)量外泌體大??;納米跟蹤儀(nanoparticle tracking analysis, NTA,Malvern,Nanosight LM 10)跟蹤外泌體,分析其大小和濃度。吸取樣本各10 μL滴加于銅網(wǎng)上,沉淀3 min,濾紙從邊緣處吸去浮液,PBS漂洗后磷鎢酸負(fù)染,常溫干燥5 min,電鏡成像。NTA儀器利用激光光源照射外泌體懸浮液,可觀察到帶有散射光的顆粒的布朗運(yùn)動(dòng),并進(jìn)行粒徑計(jì)算,同時(shí)得到整個(gè)體系的粒徑分布信息。用注射器吸取1 mL左右的樣品,然后向樣品池緩慢注入,設(shè)置參數(shù),獲取粒徑分布結(jié)果。
本試驗(yàn)使用雷尼紹公司的顯微共聚焦拉曼光譜儀(Renishaw,inVia,UK)采集SERS數(shù)據(jù)。石英載玻片上置于激光共焦顯微拉曼光譜儀的顯微鏡載物臺(tái)上,納米銀基底置于石英載玻片上,然后將10 μL外泌體溶液滴于干燥的納米銀基底上,液滴消失后,基底表面為濕潤(rùn)狀態(tài),立即收集表面增強(qiáng)拉曼散射信號(hào)。拉曼信號(hào)采集的光譜范圍為800~1 800 cm-1,激發(fā)波長(zhǎng)為785 nm,采集次數(shù)2次,曝光時(shí)間4 s,激發(fā)光功率約為0.5 mW,以防止功率過大燒傷樣品。所裝備的顯微鏡為萊卡DM2500,物鏡放大倍數(shù)50×。每個(gè)樣品在不同的位置獲得約30個(gè)SERS光譜。每次掃描前,均用硅片的520 cm-1峰進(jìn)行校準(zhǔn)。試驗(yàn)重復(fù)3遍。為了減少不同光譜強(qiáng)度的差異和更好地對(duì)光譜形狀進(jìn)行對(duì)比分析,所有的拉曼信號(hào)采集均在同一條件下進(jìn)行。數(shù)據(jù)定量分析前,采用Vancouver拉曼譜處理軟件對(duì)所有譜線進(jìn)行基線校正及熒光背景扣除。為了便于比較不同外泌體樣品光譜形狀和譜峰的相對(duì)強(qiáng)度,用強(qiáng)度法對(duì)光譜進(jìn)行了歸一化處理。
采用透射電鏡TEM觀察外泌體的大小和形態(tài);納米跟蹤儀(nanoparticle tracking analysis,NTA)檢測(cè)外泌體的粒徑和濃度。圖2a與圖2b分別為MCF-10A和MCF-7來源外泌體的TEM圖。在鏡下觀察,外泌體分布不均勻,體形態(tài)多變,測(cè)量大小在30~200 nm,脂質(zhì)包膜膜結(jié)構(gòu)完整,大多數(shù)都呈現(xiàn)出典型的杯狀結(jié)構(gòu),數(shù)個(gè)MCF-7來源外泌體有聚集的現(xiàn)象(圖2b),這可能與TEM樣品制樣的沉淀過程有關(guān)。然后進(jìn)一步利用NTA分析外泌體的大小和濃度,圖2c為MCF-10A外泌體粒徑圖,可以發(fā)現(xiàn)外泌體主要分布在50~150 nm之間,中位值在130 nm左右,外泌體濃度約為4.8×108particles/mL。MCF-7外泌體粒徑圖可以發(fā)現(xiàn)極少量外泌體分布在40~50 nm之間(圖2d),主要分布在80~150 nm之間,中位值分布也在130 nm左右,外泌體濃度4.9×108particles/mL。但可以看到有少量的囊泡分布在200~400 nm之間,可能與外泌體的聚集有關(guān)。
圖2 外泌體的表征Fig.2 The characterization of exosomes(a)MCF-10A來源外泌體的透射電鏡圖(TEM);(b)MCF-7來源外泌體的TEM圖;(c)MCF-10A來源外泌體的納米跟蹤儀(NTA)檢測(cè)結(jié)果圖;(d)MCF-7來源外泌體的NTA檢測(cè)結(jié)果圖(a)TEM image of MCF-10A-derived exosomes;(b)TEM image of MCF-7-derived exosomes; (c)NTA results of MCF-10A-derived exosomes;(d)NTA results of MCF-7-derived exosomes
SERS技術(shù)檢測(cè)得到為正常乳腺細(xì)胞MCF-10A來源外泌體和乳腺癌細(xì)胞MCF-7來源外泌體SERS光譜(圖3),主要差異反映在其核酸,蛋白質(zhì),脂類等譜峰的波數(shù)和相對(duì)強(qiáng)度的明顯變化,兩者的拉曼特征峰差異性顯著。MCF-10A外泌體和MCF-7外泌體SERS特征譜分別如圖3a和圖3b所示。由于外泌體包含相同的整體結(jié)構(gòu)和大分子(脂質(zhì),蛋白質(zhì),核酸等),因此在800~1 800 cm-1區(qū)域有共同的拉曼譜峰,858、938、999、1 032、1 318、1 602和1 655 cm-1,其分別歸屬于酪氨酸,脯氨酸和纈氨酸,苯丙氨酸,膠原或者脂類,核酸,酪氨酸和苯丙氨酸,蛋白的酰胺I帶[13]。MCF-10A來源外泌體和MCF-7來源外泌體的特征峰歸屬見表1。
表1 外泌體拉曼光譜譜峰歸屬Tab.1 Band position and assignment of exosomes from 800~1 800 cm-1
2.2.1 核酸分子的譜線的變化
1 031 cm-1譜帶源于核酸分子C- C鍵的拉伸振動(dòng),1 336 cm-1譜線歸屬于多核苷酸鏈。同時(shí)出現(xiàn)在MCF-7外泌體中的1 031 cm-1,1 336 cm-1處的拉曼峰,再一次證明MCF-7外泌體中的核酸顯著高于MCF-10外泌體。
2.2.2 蛋白質(zhì)分子類譜線的變化
MCF-10A來源的外泌體中蛋白質(zhì)的酰胺I帶特征譜帶位于1 655 cm-1處,而MCF-7來源的外泌體的譜峰頻移到1 642 cm-1處。該峰反映了蛋白質(zhì)構(gòu)象的α-螺旋和β-折疊結(jié),無(wú)規(guī)則卷曲等特征。MCF-7來源外泌體在1 642 cm-1處的峰強(qiáng)雖無(wú)明顯變化,但位于938 cm-1的肽鏈骨架 C-C鍵振動(dòng)峰卻明顯變?nèi)?。酰胺I帶和肽鏈骨架的特征拉曼峰與蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)有關(guān),是研究蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的靈敏探針。肽鏈骨架峰強(qiáng)相對(duì)于酰胺I帶的減弱會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的無(wú)序性[25]。
在MCF-7外泌體的SERS光譜中還可以清楚地看到酪氨酸譜線由正常乳腺癌上皮細(xì)胞MCF-10A的853 cm-1處頻移到 857 cm-1,歸屬于色氨酸譜帶1 336 cm-1處的強(qiáng)度也有明顯的升高。這些譜線強(qiáng)度的增加表明癌變組織中氨基酸殘基含量增加,成為蛋白質(zhì)拉曼光譜的主要貢獻(xiàn)者。值得注意的是,1 372 cm-1出現(xiàn)在MCF-10A來源外泌體峰譜中,該譜帶的存在說明色氨酸殘基的吲哚環(huán)呈埋藏式。而在MCF-7來源的外泌體中此特征峰消失,這說明氨基酸殘基所處的腫瘤微環(huán)境發(fā)生變化使色氨酸殘基的埋藏式吲哚環(huán)變?yōu)楸┞妒絒26]。
2.2.3 脂類分子譜線的變化
正常乳腺上皮細(xì)胞外泌體中歸屬于脂類的特征譜線位于1 754、1 446和1 318 cm-1,而癌變組織中只觀察到1 318 cm-1處的峰藍(lán)移到1 315 cm-1,且峰發(fā)生了分裂。這些脂類分子可能主要來源于組織中的脂肪,這些譜線消失表明癌變組織中脂肪成分所占比例減少。另外,我們還觀察到在正常MCF-10A來源的外泌體中可見較強(qiáng)的1 372 cm-1(碳水化合物),但是在MCF-7外泌體譜線卻觀察不到此峰。這可能是癌細(xì)胞的代謝比正常細(xì)胞活躍。
圖3 外泌體的表面增強(qiáng)拉曼散射(SERS)特征光譜Fig.3 The characteristic SERS spectrum of exosomes(a)MCF-10A來源外泌體SERS光譜;(b)MCF-7來源外泌體SERS光譜(a)SERS spectrum of MCF-10A-derived exosomes;(b)SERS spectrum of MCF-7-derived exosomes
SERS技術(shù)是一種靈敏度度高、無(wú)標(biāo)記、無(wú)損傷、簡(jiǎn)單快速檢測(cè)物質(zhì)成分的方法,能夠獲得清晰的良惡性細(xì)胞來源外泌體的拉曼特征光譜,從而協(xié)助診斷良惡性細(xì)胞腫瘤。普通的拉曼光譜技術(shù)也有極高的靈敏度,但血清和培養(yǎng)基上清中純化外泌體數(shù)量極少,獲得外泌體的特征譜不夠清晰,難以對(duì)疾病進(jìn)行正確的評(píng)估。我們用SERS技術(shù)檢測(cè)了MCF-10A和MCF-7來源的外泌體,并繪制了800~1 800 cm-1頻移區(qū)段SERS光譜圖。通過分析比對(duì)方式尋找出了腫瘤細(xì)胞MCF-7來源外泌體的特征性拉曼光譜,然后對(duì)特征性光譜的可行性及其物質(zhì)歸屬進(jìn)行匹配。拉曼光譜是物質(zhì)成分的表觀顯示,物質(zhì)成分的變化使拉曼光譜波形數(shù)量和強(qiáng)度的改變以及波峰的頻移[27,28]。核酸、蛋白和脂類是構(gòu)成外泌體表面的主要分子。這些物質(zhì)成分在含量、結(jié)構(gòu)、成分、表觀遺傳學(xué)發(fā)生任何變化,都可能會(huì)引起拉曼光譜的變化,導(dǎo)致SERS特征明顯不同。此前,Joseph等[29]已用SERS技術(shù)檢測(cè)了細(xì)胞與健康人血清和早期胰腺癌病人血清來源的外泌體,獲得了清晰的拉曼特征譜,成功的區(qū)分了不同來源的外泌體。在本研究中,也能觀察到SERS特征光譜明顯的改變。例如,歸屬為雙螺旋DNA骨架磷酸二酯的對(duì)稱伸縮振動(dòng)的拉曼峰,在正常乳腺上皮細(xì)胞MCF-10A來源外泌體拉曼光譜的1 067 cm-1處,而乳腺腫瘤細(xì)胞MCF-7來源外泌體特征譜中紅移到1 072 cm-1處,且拉曼峰明顯變寬變高。核酸是關(guān)鍵的遺傳物質(zhì),核酸任何成分的增加或減少或結(jié)構(gòu)構(gòu)象的改變代表細(xì)胞新陳代謝和基因完整性發(fā)生變化。MCF-7中核酸的明顯增加表明了腫瘤細(xì)胞大量分裂繁殖。另外,相比MCF-10A外泌體,MCF-7中歸屬蛋白質(zhì)肽鏈骨架938 cm-1處的拉曼峰變?nèi)?,表明了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的無(wú)序性。癌細(xì)胞旺盛的代謝消耗了大量的脂類,其分泌的外泌體的脂類拉曼峰也顯著變?nèi)?。良惡性?xì)胞外泌體富含的蛋白質(zhì)、核酸(DNA或RNA)及脂類的變化都會(huì)引起拉曼光譜的變化能夠協(xié)助鑒別良惡性腫瘤[30]。
本研究建立了一種基于外泌體和SERS技術(shù)的快速無(wú)損檢測(cè)方法,外泌體中的成分反映了釋放細(xì)胞的組成成分,通過分析比對(duì)SERS拉曼光譜,可用于區(qū)分正常和腫瘤來源的外泌體,進(jìn)而協(xié)助診斷早期腫瘤。這項(xiàng)研究表明SERS技術(shù)可為癌癥的早期檢測(cè)和診斷提供了一種快速、無(wú)標(biāo)記和無(wú)損的方法。
但該試驗(yàn)和結(jié)果也有一定的局限性。首先我們僅僅選取乳腺上皮細(xì)胞和乳腺癌細(xì)胞來源的外泌體做比較,想要得更客觀的結(jié)果,需要選擇多種乳腺癌細(xì)胞系與乳腺上皮細(xì)胞的外泌體拉曼光譜做對(duì)比,甚至選擇其他種類良惡性細(xì)胞外泌體拉曼光譜做對(duì)比,這樣篩選出的特征光譜更為可靠。其次,我們用的是細(xì)胞培養(yǎng)基分離出來的外泌體,但患者血清提純的外泌體更具有臨床實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。因此,下一步的試驗(yàn)計(jì)劃是收集健康人和腫瘤患者的血液樣本,分離外泌體,然后用SERS技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)和鑒別。