宋松泉,劉軍,徐恒恒,劉旭,黃薈
(1中國(guó)科學(xué)院植物研究所,北京100093;2廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物基因研究中心,廣州 510640;3中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,北京100081;4懷化學(xué)院民族藥用植物資源研究與利用湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/生物與食品工程學(xué)院,湖南懷化418008)
植物通過(guò)長(zhǎng)期不斷地進(jìn)化來(lái)調(diào)控種子的休眠與萌發(fā),以確保其在不同的自然環(huán)境條件下萌發(fā)和形成幼苗。休眠(dormancy)是指在合適的條件下種子暫時(shí)不能完成萌發(fā)[1]。在許多植物中,特別是一年生的種子植物,種子休眠對(duì)植物的生存與傳播起關(guān)鍵作用,因?yàn)樗荒苁狗N子在環(huán)境條件合適時(shí)萌發(fā)[2-4]。深休眠阻止種子迅速整齊地萌發(fā),給引種馴化帶來(lái)困難,嚴(yán)重影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育與產(chǎn)量;相反,在許多禾谷類作物中,例如水稻(Oryza sativa)、小麥(Triticum aestivum)和玉米(Zea mays),由于長(zhǎng)期的育種選擇,種子的休眠特性被選擇性地喪失,從而導(dǎo)致收獲前成熟種子在適溫和潮濕的條件下在母體植株上迅速發(fā)芽,造成農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中產(chǎn)量和質(zhì)量的巨大損失[5-6]。GUBLER等[6]提出,目前,種子收獲前發(fā)芽(pre-harvest sprouting)是禾谷類作物種子和糧食生產(chǎn)中的最大危害之一。
NONOGAKI[7]提出,種子休眠與萌發(fā)的激素調(diào)控可能是種子植物中的一種高度保守的機(jī)制。在許多物種中,脫落酸(abscisic acid,ABA)是種子休眠誘導(dǎo)和維持的正調(diào)控因子,種子萌發(fā)的負(fù)調(diào)控因子;赤霉素(gibberellin,GA)和乙烯具有促進(jìn)種子萌發(fā)和拮抗ABA的作用[3,8-9]。高水平的ABA和低水平的GA引起種子深休眠和出苗率降低,而低水平的ABA和高水平的GA則誘導(dǎo)種子提早萌發(fā),也稱為胎萌(vivipary)[4,10-11];然而,這些激素在種子休眠與萌發(fā)中的拮抗作用機(jī)制仍不夠清楚。
ABA是調(diào)控植物許多發(fā)育過(guò)程包括種子休眠、萌發(fā)和幼苗生長(zhǎng),以及控制許多非生物脅迫反應(yīng)的關(guān)鍵因子[12-14]。研究結(jié)果證明,ABA在許多物種的種子休眠中起重要作用:外源ABA可以延遲或抑制種子和胚的萌發(fā);在未成熟種子中,內(nèi)源ABA維持種胚處于發(fā)育而不是萌芽過(guò)程;收獲前的萌發(fā)也與種子中ABA含量較低有關(guān);由ABA生物合成突變、轉(zhuǎn)基因修飾或者化學(xué)抑制所引起的ABA缺乏的種子是非休眠的;ABA生物合成的化學(xué)抑制也引起一些休眠種子的萌發(fā);ABA生物合成基因的過(guò)表達(dá)也會(huì)抑制和延遲種子萌發(fā);在吸脹的最初幾個(gè)小時(shí),非休眠種子中的ABA含量比休眠種子下降更多[15-17]。ABA在種子休眠與萌發(fā)中的作用主要受ABA代謝(包括生物合成和分解代謝)和信號(hào)傳遞途徑的調(diào)控[12-13,17-19],環(huán)境因子對(duì)種子休眠和萌發(fā)的影響也是通過(guò)ABA和GA起作用[20]。然而,許多證據(jù)表明GA主要是在種子休眠被解除后起促進(jìn)萌發(fā)的作用,而不是參與解除種子休眠[17,20-21]。本文主要綜述ABA代謝與信號(hào)傳遞的研究進(jìn)展,ABA在種子發(fā)育、休眠與萌發(fā)中的作用,以及種子休眠基因DOG1(DELAY OF GERMINATION1)和ABA信號(hào)組分的關(guān)系;此外,我們提出了該領(lǐng)域需要進(jìn)一步研究的問(wèn)題,試圖為深入研究ABA調(diào)控種子休眠與萌發(fā)的分子機(jī)理提供新的參考。
1.1.1 ABA生物合成 ABA的生物合成和分解代謝決定細(xì)胞中的ABA水平,從而決定ABA信號(hào)的強(qiáng)度[18,22]。在陸生植物中,C40環(huán)氧類胡蘿卜素(epoxycarotenoid)是ABA生物合成的前體,是由質(zhì)體中甲基赤蘚糖醇磷酸(methylerythritol phosphate,MEP)途徑合成的異戊烯二磷酸(isopentenyl diphosphate,IPP)產(chǎn)生的(圖1)。β-類胡蘿卜素生物合成基因的突變體由于缺乏葉綠素表現(xiàn)為多效性的ABA缺乏表型,包括幼苗致死和光漂白(photobleaching)。玉米黃質(zhì)環(huán)氧化酶(zeaxanthin epoxidase,ZEP)催化全反式玉米黃質(zhì)(all-trans-zeaxanthin)環(huán)氧化成為全反式紫黃質(zhì)(alltrans-violaxanthin)[22]。全反式紫黃質(zhì)被轉(zhuǎn)化為9-順式紫黃質(zhì)(9-cis-violaxanthin),或者被轉(zhuǎn)化為全反式新黃質(zhì)(all-trans- neoxanthin)。擬南芥(Arabidopsis thaliana)ABA4催化全反式紫黃質(zhì)轉(zhuǎn)化成為全反式新黃質(zhì)[23]。然而,轉(zhuǎn)化全反式環(huán)氧類胡蘿卜素(all-transepoxycarotenoid)、紫黃質(zhì)和新黃質(zhì)形成其相應(yīng)的9-順式異構(gòu)體的異構(gòu)酶仍然不清楚[13]。盡管環(huán)氧類胡蘿卜素和紫黃質(zhì)的9-順式異構(gòu)體可能是9-順式-環(huán)氧類胡蘿卜素二加氧酶(9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase,NCED)的底物,但9'-順式-新黃質(zhì)(9'-cis-neoxanthin)被認(rèn)為是NCED的主要底物[23]。
NCED將9-順式-環(huán)氧類胡蘿卜素氧化裂解為黃氧素(xanthoxin)是ABA生物合成的關(guān)鍵調(diào)控步驟[22]。因此,內(nèi)源ABA水平的變化與NCED的表達(dá)密切相關(guān)。在陸生植物中,NCED酶由多基因家族編碼,不同的家族成員在植物發(fā)育過(guò)程和脅迫反應(yīng)中起獨(dú)特的作用[24]。AtABA2編碼一個(gè)短鏈脫氫酶/還原酶,該酶催化黃氧素轉(zhuǎn)化為脫落醛(abscisic aldehyde)(圖1)[25-26],脫落醛經(jīng)脫落醛氧化酶(abscisic aldehyde oxidase)轉(zhuǎn)化為ABA[22]。醛氧化酶的活性需要一個(gè)鉬輔因子(molybdenum cofactor,Moco)。因此,Moco生物合成缺陷的突變體也表現(xiàn)出ABA缺乏的表型[27]。
1.1.2 ABA合成代謝抑制劑 ABA是由類胡蘿卜素合成的,類胡蘿卜素生物合成抑制劑能夠降低內(nèi)源ABA水平。氟啶酮(fluridone)和氟草敏(norflurazon)是八氫番茄紅素去飽和酶(phytoene desaturase)的抑制劑,用這些化合物處理也能降低內(nèi)源ABA水平;同時(shí)由于葉綠素的光氧化引起植物發(fā)生漂白(圖1)[28]。去甲二氫愈創(chuàng)木酸(nordihydroguaiaretic acid,NDGA)是一種脂氧合酶的抑制劑,脂氧合酶催化多聚不飽和脂肪酸的脫氧作用(deoxygenation),在受到滲透脅迫的大豆(Glycine max)懸浮細(xì)胞中抑制ABA的積累[29]。研究證明,NDGA抑制脂肪的合成和植物生長(zhǎng)[30],因此,需要研發(fā)更專一的NCED抑制劑。Abamine及其類似物abamineSG是NCED的專一性抑制劑,在擬南芥滲透脅迫處理過(guò)程中可抑制ABA的積累和ABA誘導(dǎo)基因的表達(dá),但這些化合物對(duì)植物生長(zhǎng)沒(méi)有負(fù)面影響[31-32]。類倍半萜類胡蘿卜素裂解雙加氧酶(sesquiterpene-like carotenoid cleavage dioxygenase,SLCCD)抑制劑13(SLCCD13)阻止擬南芥中由滲透脅迫誘導(dǎo)的ABA積累和抑制ABA反應(yīng)基因(圖1)[33]。
圖1 ABA生物合成和分解代謝途徑(根據(jù)DEJONGHE等[13]修改)Fig.1 ABA biosynthetic and catabolic pathways (Modified from DEJONGHE et al.[13])
1.1.3 ABA分解代謝 ABA的分解代謝包括羥基化作用和與葡萄糖結(jié)合(圖1),其中,8'-羥基化作用是ABA分解途徑中的關(guān)鍵步驟。ABA C-8'位置上的羥基化被CYP707A家族催化,產(chǎn)物8'-羥基-ABA是不穩(wěn)定的,能自發(fā)地異構(gòu)化成為紅花菜豆酸(phaseic acid,PA)[34-35]。CYP707A家族屬于Cyt P450單加氧酶(monooxygenase),在高等植物中被多基因家族編碼[36],家族中的每一個(gè)成員在不同的生理或者發(fā)育過(guò)程中起作用[37-38]。PA是一種弱的ABA作用類似物[39-40],被PA還原酶轉(zhuǎn)化成為生物學(xué)活性喪失的二氫紅花菜豆酸(dihydrophaseic acid,DPA)。
ABA的羧基(C-1)和羥基及其氧化分解產(chǎn)物是與葡萄糖結(jié)合的潛在靶點(diǎn)[18]。ABA葡糖酯(ABA glucosyl ester,ABA-GE)是一種最常見(jiàn)的結(jié)合物,被認(rèn)為是ABA的一種儲(chǔ)存或者遠(yuǎn)距離運(yùn)輸形式[18,22]。葡糖基轉(zhuǎn)移酶(glucosyltransferase)催化ABA羧基的葡糖基化。ABA-GE被β-葡糖苷酶水解后釋放ABA,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)局部的ABA濃度[22]。
1.1.4 ABA分解代謝抑制劑 影響ABA分解代謝的化合物包括唑類抑制劑(azole-type inhibitor)和ABA類似物(ABA analog),它們作用于Cyt P450單加氧酶CYP707A(圖1)。唑類抑制劑烯效唑(uniconazole)和烯效醇(diniconazole)抑制CYP707A的活性,增加內(nèi)源ABA水平[41-42]。烯效唑和烯效醇不但抑制CYP707A,而且抑制其他的Cyt P450單加氧酶,對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育有負(fù)面影響[43]。Abscinazole-E3M選擇性地抑制CYP707A,從而增加內(nèi)源ABA水平,提高水分脅迫耐性,但對(duì)植物的生長(zhǎng)影響較?。▓D1)[44]。與唑類抑制劑相反,ABA類似物能夠作為專一的ABA分解代謝抑制劑起作用。ABA分解代謝的第一步是CYP707A酶對(duì)環(huán)上8'和9'甲基的羥基化[18]。ABA類似物(+)-8'-次甲基-ABA ((+)-8'-methylidyne-ABA)和(+)-9'-乙炔-ABA((+)-9'-acetylene-ABA)不可逆地抑制CYP707A活性(圖1),但這些化合物保留了ABA類似物的活性[45]。ABA 8'-羥化酶抑制劑4(ABA 8'-hydroxylase inhibitor 4,AHI4)不表現(xiàn)出ABA活性(例如停滯生長(zhǎng)和抑制種子萌發(fā)),但強(qiáng)烈地抑制CYP707A活性[46]。
核心ABA信號(hào)傳遞組分主要由PYR/PYL/RCAR(pyrabactin resistance 1/pyrabactin resistance 1-like/regulatory components of ABA receptor)蛋白、A組2C類蛋白磷酸酶(group A type 2C protein phosphatase,PP2C)、亞類Ⅲ蔗糖非發(fā)酵-1-相關(guān)蛋白激酶2(subclassⅢ sucrose nonfermenting-1-related protein kinase2,SnRK2)和ABF(ABA-responsive element (ABRE)-binding factor)/AREB(ABRE-binding protein)轉(zhuǎn)錄因子組成(圖2和圖3)[12-13,19,47-49]。ABA通過(guò)與PYR/PYL/ RCAR蛋白中高度保守的氨基酸進(jìn)行直接的和水介導(dǎo)的接觸,被結(jié)合進(jìn)疏水的配體結(jié)合的ABA受體(結(jié)合)口袋中。結(jié)合口袋(binding pocket)含有類似于一只折疊的手的7個(gè)β折疊,以及1個(gè)大的和2個(gè)較小的α螺旋[50-51]。ABA的結(jié)合促進(jìn)了包含β3和β4之間的一個(gè)門(mén)環(huán)(gate-loop)的構(gòu)象變化,這種構(gòu)象變化關(guān)閉結(jié)合口袋,形成與ABA的接觸。除了PYR/PYL/RCAR12和PYR/PYL/RCAR13分別含有序列-SDLPA-和-SGFPA-外,在所有的PYR/PYL/ RCAR蛋白的門(mén)環(huán)中都含有序列-SGLPA-[13]。β5和β6含有不變的序列-HRL-,它們之間的第二個(gè)“門(mén)閂(latch)”環(huán)也發(fā)生構(gòu)象改變;這種改變使受體-配體復(fù)合物對(duì)接和抑制PP2C。PP2C含有一個(gè)高度保守的、定位于A組專一識(shí)別環(huán)中的色氨酸殘基,該殘基能插入到由門(mén)環(huán)關(guān)閉所產(chǎn)生的小口袋中,并與ABA的酮基產(chǎn)生水介導(dǎo)的接觸。這個(gè)水分子位于ABA、門(mén)的脯氨酸(-SGLPA-)、門(mén)閂的精氨酸(-HRL-)和PP2C的色氨酸鎖之間的H-鍵網(wǎng)絡(luò)中心(圖2)[12,50,52]。
圖2 ABA誘導(dǎo)的受體構(gòu)象變化(引自CUTLER等[12])Fig.2 ABA-induced changes in receptor conformation (From CUTLER et al.[12])
PYR/PYL/RCAR受體能夠間接地控制亞類ⅢSnRK2的活性,SnRK2在對(duì)ABA的反應(yīng)中磷酸化許多脅迫活化的靶點(diǎn)[53-54]。在對(duì)發(fā)育信息或者環(huán)境脅迫的反應(yīng)中,當(dāng)ABA在細(xì)胞中積累時(shí),ABA與PYR/PYL/RCAR受體結(jié)合,以及觸發(fā)受體的構(gòu)象變化,從而使受體-ABA復(fù)合物與PP2C結(jié)合并抑制其活性(圖2和圖3)[12]。因而,亞類Ⅲ SnRK2被釋放,SnRK2磷酸化和控制下游因子的活性以激活生理反應(yīng)。SnRK2的靶點(diǎn)主要有2種類型,包括膜通道蛋白和轉(zhuǎn)錄因子。膜通道蛋白包括慢陰離子通道1(slow anion channel 1,SLAC1)、擬南芥鉀通道1(potassium channel inArabidopsis thaliana1,KAT1)和NADPH氧化酶呼吸爆發(fā)氧化酶同源物F(NADPH oxidase respiratory burst oxidase homolog F,RBOHF),它們是質(zhì)膜蛋白以及能被SnRK2磷酸化[12,22]。轉(zhuǎn)錄因子包括含有堿性亮氨酸拉鏈(basic leucine zipper,bZIP)結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子,例如ABF、AREB和ABI5,它們能夠在ABA誘導(dǎo)的基因啟動(dòng)子中與ABRE結(jié)合(圖3)[12,22]。另外,ABA誘導(dǎo)的基因還可以調(diào)控與相容性溶質(zhì)生物合成、晚期胚胎發(fā)生豐富(late embryogenesis abundant,LEA)蛋白和熱休克蛋白(heat shock protein)有關(guān)基因的表達(dá),從而增加脫水耐性。ABI5與植物專一的VP1/ABI3轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,可以控制種子休眠[55]。
圖3 ABA信號(hào)傳遞途徑和DOG1調(diào)控種子休眠的新模型(根據(jù)NONOGAKI[19]修改)Fig.3 ABA signalling pathway and emerging model of seed dormancy regulated by DOG1 (Modified from NONOGAKI [19])
被子植物的PYR/PYL/RCAR受體分為3個(gè)亞家族(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ)[47,56]。亞家族Ⅰ和Ⅱ存在于除苔蘚植物外的所有陸生植物中(苔蘚植物似乎僅僅含有亞家族Ⅰ);亞家族Ⅲ幾乎僅存在于被子植物中[56-57]。大多數(shù)亞家族Ⅲ受體形成同源二聚體,它們對(duì)ABA的敏感性比亞家族Ⅰ/Ⅱ受體低;而亞家族Ⅰ/Ⅱ?yàn)閱误w,對(duì)ABA具有較高的親和性。在擬南芥原生質(zhì)體中表達(dá)不同PYR/PYL/RCAR受體的試驗(yàn)表明,亞家族Ⅰ和Ⅱ受體介導(dǎo)非脅迫植物中對(duì)低水平的ABA起反應(yīng),而亞家族Ⅲ受體需要較高水平的ABA來(lái)啟動(dòng)信號(hào)傳遞;這些差異與它們具有不同內(nèi)在的ABA親和力相一致[58]。然而,遺傳分析表明擬南芥受體亞家族之間存在廣泛的冗余,模擬ABA缺失突變體的表型需要去除所有3個(gè)亞家族受體[49]。
在擬南芥中,有9個(gè)A組PP2C參與ABA的信號(hào)傳遞。一些擬南芥PP2C突變體表現(xiàn)出ABA過(guò)敏感表型,PP2C的活性被ABA受體選擇性地抑制[58-59]。在A組PP2C中,僅僅ABA過(guò)敏感萌發(fā)1(ABA hypersensitive germination 1,AHG1)缺乏保守的色氨酸鎖殘基,在受體-配體-PP2C復(fù)合物中這個(gè)殘基是與ABA的環(huán)已烯酮上的氧形成水介導(dǎo)的氫鍵必需的[58-59]。盡管AHG1對(duì)ABA受體介導(dǎo)的抑制是抗性的,但在種子萌發(fā)分析中ahg1突變體的種子對(duì)ABA過(guò)敏感,表明AHG1參與了ABA反應(yīng)[59-60]。
擬南芥中有9個(gè)SnRK2,其中3個(gè)亞類Ⅲ SnRK2(SRK2D/SnRK2.2、SRK2E/SnRK2.6/OST1和SRK2I/SnRK2.3)被ABA誘導(dǎo)。SnRK2三重突變體在種子萌發(fā)、植物生長(zhǎng)、氣孔關(guān)閉和ABA反應(yīng)基因表達(dá)中幾乎表現(xiàn)出完全ABA不敏感[53,61-63]。因此,ABA的作用是由亞類Ⅲ SnRK2介導(dǎo)的底物(靶)蛋白的磷酸化所觸發(fā),盡管只有少量SnRK2的直接底物被鑒定。野生型或者用ABA處理的SnRK2三重突變體的磷酸化蛋白質(zhì)組分析鑒定了新的SnRK2候選底物,包括與開(kāi)花、核苷酸結(jié)合、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、信號(hào)傳遞和葉綠體形成有關(guān)的蛋白質(zhì)[64-66]。此外,SnRK2似乎是一個(gè)信號(hào)中樞,能夠被多種途徑調(diào)控;例如,擬南芥OST1(SnRK2.6)以不依賴于ABA的方式被冷脅迫活化,調(diào)節(jié)冷誘導(dǎo)的基因表達(dá)[67]。另外,被調(diào)控的ABA受體和PP2C的蛋白水解、以及受體與不同靶點(diǎn)之間的相互作用已經(jīng)被報(bào)道,表明核心ABA途徑的復(fù)雜調(diào)控作用[68-71]。
ABA在種子發(fā)育過(guò)程中逐漸積累,在種子成熟中后期達(dá)到峰值。擬南芥種子成熟中期積累的ABA主要由母體組織(包括種皮)合成[72];在擬南芥和皺葉煙草(Nicotiana plumbaginifolia)中,這種母體來(lái)源的ABA有助于胚的發(fā)育[73]。擬南芥種子初生休眠的誘導(dǎo)和成熟需要合子組織中合成的ABA,這些ABA在成熟后期積累[74]。擬南芥中有5個(gè)NCED,其中NCED6和NCED9在種子發(fā)育過(guò)程中起促進(jìn)ABA的積累和誘導(dǎo)休眠的作用[75-76];CYP707A1是種子成熟中期ABA失活的主要同源異構(gòu)體,而CYP707A2則是成熟后期ABA失活的主要類型[37]。成熟中期(未成熟)的種子分解代謝活性較高,使母體來(lái)源的ABA失活。在未成熟和成熟種子中,cyp707a1突變體比cyp707a2突變體積累更多的ABA,但cyp707a2突變體由于種子吸脹后ABA的緩慢下降表現(xiàn)出更強(qiáng)的休眠特性[37]。在大麥(Hordeum vulgare)種子發(fā)育過(guò)程中和吸脹后,ABA的代謝和敏感性受環(huán)境條件調(diào)控[16]。
擬南芥哥倫比亞生態(tài)型(Col)干種子中大量?jī)?chǔ)存的mRNA的啟動(dòng)子富含ABRE,同時(shí)也含有豐富的ABI3和ABI4等目標(biāo)順式元件[77],這些結(jié)果表明,在種子成熟后期ABA可能會(huì)影響含有這些目標(biāo)元件的儲(chǔ)存mRNA的組成。
后熟(after-ripening)是指成熟種子離開(kāi)母體植株后,需要經(jīng)過(guò)一系列的生理生化變化才能具備萌發(fā)能力的一個(gè)生理過(guò)程。后熟能夠解除許多物種的種子休眠,完成后熟所需要的時(shí)間與種子的休眠類型和休眠程度密切相關(guān)[78]。許多試驗(yàn)表明,在禾谷類植物中,后熟不改變干燥種子中ABA的含量或者ABA代謝;而當(dāng)休眠種子和后熟種子經(jīng)歷吸脹作用時(shí),ABA含量(或者代謝)發(fā)生顯著的變化。剛收獲的成熟小麥和大麥干燥種子仍然是休眠的,其ABA含量與經(jīng)過(guò)3—4個(gè)月后熟已解除休眠的種子類似;盡管干燥的休眠種胚和后熟種胚中的ABA含量沒(méi)有差異,但后熟種子的萌發(fā)時(shí)間要比休眠種子短很多[79-81]。在吸脹初期的幾個(gè)小時(shí),休眠種子和后熟種子中的ABA含量迅速下降;但在隨后的幾個(gè)小時(shí)后熟種子中的ABA含量較低,而在休眠種子中保持穩(wěn)定,在一些品種中甚至增加[16,79-80]。
在大麥種子中,后熟對(duì)ABA生物合成基因表達(dá)的影響還不明確,但它顯著地增加ABA分解代謝基因HvABA8'OH1的表達(dá)。在吸脹的最初幾個(gè)小時(shí)內(nèi),在后熟種子和休眠種子中HvABA8'OH1的表達(dá)都增加,隨后降低;然而,在后熟種胚中的表達(dá)比休眠種胚中強(qiáng)很多[16,79]。HvABA8'OH2的表達(dá)水平在后熟種子和休眠種子的吸脹過(guò)程中都非常低;因此,與休眠種胚比較,在吸脹的最初幾個(gè)小時(shí),后熟大麥種胚中ABA含量的顯著下降是由于通過(guò)增加HvABA8'OH1的表達(dá),從而促進(jìn)ABA的分解代謝造成的。在吸脹的后熟種子和休眠種子的HvABA8'OH1原位定位顯示,在后熟種胚中,僅僅在胚根鞘(包圍禾谷類種子胚初生根的組織)中檢測(cè)到HvABA8'OH1的表達(dá),而在休眠種胚中沒(méi)有被檢測(cè)到[16]。目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn),胚根鞘在種子休眠的調(diào)控中起重要作用,調(diào)控的機(jī)制可能是基于高水平的ABA阻止胚根鞘的弱化和生長(zhǎng),導(dǎo)致胚根伸長(zhǎng)受阻,而增加的ABA分解代謝則可解除這一限制[16,82]。
種子萌發(fā)表現(xiàn)出3個(gè)階段的水分吸收。第一階段是由于干種子的被動(dòng)吸水,其次是少量的水分吸收(第二階段),進(jìn)一步的水分吸收是與萌發(fā)完成和隨后的幼苗生長(zhǎng)有關(guān)(第三階段)[1]。一系列證據(jù)表明盡管在萌發(fā)早期階段的ABA含量也起一些作用,但萌發(fā)完成前(第二階段后期)種子中的ABA含量是種子萌發(fā)的決定因素[17]。
干種子中存留的ABA會(huì)在種子吸脹后下降,這在休眠(佛得角群島生態(tài)型(Cape Verde Islands ecotype,Cvi))和非休眠(Col)的擬南芥種子中都有發(fā)生,主要取決于CYP707A2的活性[16,37,83-84]。在Col和Cvi種子中,CYP707A2在種子吸脹開(kāi)始后的2—3 h被誘導(dǎo)[84],導(dǎo)致ABA的迅速下降,結(jié)果表明與CYP707A2蛋白的從頭合成(de novosynthesis)有關(guān)[83]。這種早期誘導(dǎo)能被一些因素例如硝酸鹽[85]、一氧化氮(nitric oxide,NO)[83]和后熟[16]調(diào)控。就整個(gè)萌發(fā)過(guò)程而言,雖然休眠的Cvi種子和熱抑制的Col種子在吸脹早期表現(xiàn)出ABA含量下降,但此后會(huì)有所增加[86]。
此外,在一些物種中胚的周?chē)M織(胚乳或者外胚乳和種皮)是胚根伸出的物理障礙[78]。在大麥種子中,這些組織也會(huì)引起缺氧,從而抑制ABA的分解代謝和增加對(duì)ABA的敏感性[87]。一些物種例如萵苣(Lactuca sativa)、番茄(Lycopersicum esculentum)和擬南芥的胚乳都是由活細(xì)胞組成的,它們的弱化對(duì)于萌發(fā)的完成是必需的。盡管在番茄種子萌發(fā)過(guò)程中ABA不抑制珠孔端胚乳(micropylar endosperm)內(nèi)-β-甘露聚糖酶活性的增加[88],但阻止細(xì)胞壁降解酶的合成可能是ABA的一個(gè)重要功能[89]。研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn),ABA調(diào)控細(xì)胞壁松弛酶的表達(dá)或者活性氧(reactive oxygen species,ROS)的積累,ROS可能氧化細(xì)胞壁多糖[78,90]。
種子的休眠與萌發(fā)不僅與核心ABA信號(hào)途徑有關(guān),而且受DOG1-AHG1/AHG3途徑的調(diào)控(圖3)[19,91],這兩條途徑在下游組分PP2C產(chǎn)生重疊[19,48,92]。NONOGAKI[19]認(rèn)為近年來(lái)種子休眠研究的突破是在一定程度上揭示了DOG1的生化功能。下面主要介紹該領(lǐng)域的近期進(jìn)展,包括DOG1對(duì)種子休眠的作用,DOG1表達(dá)和功能的調(diào)控,以及DOG1與ABA信號(hào)途徑的關(guān)系。
利用擬南芥自然變異的數(shù)量性狀位點(diǎn)(quantitative trait locus,QTL)分析已經(jīng)鑒定了種子休眠的特異位點(diǎn),包括DOG1[93-95]。DOG1轉(zhuǎn)錄物在種子成熟階段積累,授粉后14—16 d達(dá)到峰值[95],在剛收獲的種子中減少到約20%,在種子吸脹過(guò)程中消失[96]。DOG1蛋白也在種子成熟階段積累,但在種子接近成熟時(shí)并未降低,故剛收獲的種子含有相對(duì)高水平的DOG1蛋白;即使在后熟13周,種子的休眠狀態(tài)已經(jīng)被解除,蛋白水平仍然保持相對(duì)較高[96]。因此,在后熟種子中,DOG1蛋白的數(shù)量和休眠水平之間缺乏相關(guān)性。研究發(fā)現(xiàn),DOG1保持種子休眠特性最重要的是其化學(xué)性質(zhì)而不是數(shù)量,在后熟過(guò)程中,DOG1蛋白變化成為非功能形式,從而引起種子萌發(fā);事實(shí)上,在種子后熟之前和后熟之后,DOG1蛋白的等電點(diǎn)(pI)發(fā)生了變化[96]。dog1突變體種子缺乏休眠是由于DOG1主要在成熟階段起作用,在成熟種子中含有的DOG1蛋白可能是其殘留物[96]。
DOG1在種子成熟過(guò)程中表達(dá),其表達(dá)受可變剪接(alternative splicing)[95,97]和可變多腺苷酸化(alternative polyadenylation)的調(diào)控[91,98]。DOG1的幾個(gè)剪接變體(splicing variant)[95]可產(chǎn)生5種轉(zhuǎn)錄物變異體(transcript variant,α、β、γ、δ、ε)和3種不同的蛋白(圖4-A)[97];其中DOG1-ε不是一個(gè)真正意義上的剪接變體,但是擬南芥發(fā)育種子中的主要形式[97];可變剪接可以構(gòu)成不同功能的蛋白,包括它們的亞細(xì)胞定位和增加的休眠潛能。這3種蛋白(α、(β、γ、ε)、δ)都能被轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核[97],因此,可以認(rèn)為DOG1是作為一種調(diào)控蛋白以同源二聚體的形式起作用[96-97]。過(guò)表達(dá)分析結(jié)果表明,這3種同源異構(gòu)體可以誘導(dǎo)種子休眠,且共表達(dá)時(shí)更為穩(wěn)定。因此,異源二聚體的形成不能解釋DOG1蛋白具有更好的穩(wěn)定性。對(duì)于DOG1的穩(wěn)定性,同源異構(gòu)體共表達(dá)的正作用機(jī)制尚不夠清楚[91]。當(dāng)酵母剪接體組分19號(hào)復(fù)合物相關(guān)蛋白1(nineteen complexrelated protein 1)的擬南芥直系同源物(AtNTR1)被突變時(shí),它引起DOG1中內(nèi)含子保留和外顯子跳躍(intron retention and exon skipping)的主要缺陷。這種DOG1剪接的錯(cuò)誤能調(diào)控種子減少休眠,但這種表型不會(huì)由可變剪接本身引起,而可能是這種突變體中DOG1表達(dá)水平降低的結(jié)果[99]。研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄延伸的效率(transcription elongation efficiency)對(duì)于DOG1的表達(dá)和種子休眠是一種重要的因子[7,100-102],認(rèn)為AtNTR1是在剪接位點(diǎn)控制著RNA聚合酶Ⅱ(PolⅡ)的作用,并可作為轉(zhuǎn)錄延伸的校正點(diǎn)(checkpoint)[99]。
產(chǎn)生轉(zhuǎn)錄變異體的另一種機(jī)制是可變多腺苷酸化,在3'端產(chǎn)生不同的轉(zhuǎn)錄物[98,103]?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)可變多腺苷酸化能產(chǎn)生2種形式的DOG1轉(zhuǎn)錄物——短DOG1(shDOG1)和長(zhǎng)DOG1(lgDOG1)[98]。shDOG1終止于近端轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)(proximal transcription termination site,pTTS),而lgDOG1可延伸至遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)錄終止位點(diǎn)(distal transcription termination site,dTTS)。shDOG1和lgDOG1(第2個(gè)內(nèi)含子/第3個(gè)外顯子)的DOG1基因組區(qū)域含有一個(gè)反義方向的啟動(dòng)子,它可驅(qū)動(dòng)反義DOG1RNA(antisenseDOG1RNA,asDOG1)的表達(dá)[104]。試驗(yàn)已經(jīng)證明,從終止子區(qū)域(terminator region)的反義RNA表達(dá)可能是一種常見(jiàn)的現(xiàn)象[105-106],DOG1中asDOG1的表達(dá)可能通過(guò)轉(zhuǎn)錄控制負(fù)調(diào)控正義DOG1的表達(dá)[91]和減少種子休眠[104]。shDOG1與DOG1-ε相同,而lgDOG1包括DOG1-α、DOG1-β、DOG1-γ和DOG1-δ(圖4-A)。在許多物種中,DOG1蛋白的C末端是缺失的或者是不保守的,因此,C末端對(duì)于DOG1的功能不是必需的。事實(shí)上,shDOG1對(duì)于補(bǔ)償dog1突變和恢復(fù)種子休眠是足夠的[98]。盡管在已發(fā)表的研究結(jié)果中關(guān)于lgDOG1轉(zhuǎn)錄本的重要性存在一些分歧,但一致認(rèn)為由2個(gè)外顯子組成的shDOG1是有功能的,是種子休眠所必需的主要蛋白[97-98,104]。
根據(jù)編碼的多肽序列,DOG1基因組DNA的第3外顯子區(qū)域幾乎沒(méi)有保守性。相反,這一區(qū)域在DNA水平上是高度保守的,它延伸到內(nèi)含子2[104]。在DNA水平,DOG1序列的保守性與相同區(qū)域蛋白序列的低進(jìn)化壓力是矛盾的,暗示DOG1基因組區(qū)域可能是一個(gè)調(diào)控長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的產(chǎn)生位點(diǎn)。事實(shí)已證明lncRNA從這個(gè)區(qū)域(和附近)反義方向表達(dá)(asDOG1)(圖4-A)[104];試驗(yàn)也證實(shí)其表達(dá)不是假的轉(zhuǎn)錄噪音,而是被一個(gè)轉(zhuǎn)錄活性啟動(dòng)子反義方向調(diào)控[104]。AsDOG1的表達(dá)負(fù)影響shDOG1的表達(dá),表明asDOG1是DOG1表達(dá)和種子休眠的負(fù)調(diào)控因子。(正義鏈)DOG1啟動(dòng)子(dog1-3(T-DNA))、外顯子1(dog1-4(T-DNA))和外顯子2(dog1-1(1 bp刪去))的突變導(dǎo)致減少或者幾乎沒(méi)有種子休眠[95,98,104]。相反,外顯子3(asDOG1啟動(dòng)子)區(qū)域(dog1-5(T-DNA))的突變反而增加種子休眠(圖4-A)[98,104],這為asDOG1作為種子休眠負(fù)調(diào)控因子起作用提供了令人信服的證據(jù)。
反義DOG1是一種相對(duì)穩(wěn)定的RNA(半衰期約為46 min)[104],也是典型的調(diào)節(jié)RNA,因此,asDOG1可能在轉(zhuǎn)錄后水平依賴于RNA分子。然而,asDOG1表達(dá)分析顯示,asDOG1不能反式、但能順式起作用[104];即asDOG1轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物(RNA分子本身)可能不重要,但轉(zhuǎn)錄本身的“行為”[107-108]可能是DOG1抑制的原因[104]。研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn),反義表達(dá)的共轉(zhuǎn)錄作用而不是反義RNA分子的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控引起轉(zhuǎn)錄干擾[108]。轉(zhuǎn)錄干擾可能被不同的機(jī)制介導(dǎo),包括RNA聚合酶不直接結(jié)合到啟動(dòng)子序列上和啟動(dòng)子競(jìng)爭(zhēng)(圖4-B)[108-110]。在酵母中,反義介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄干擾阻斷IME4的轉(zhuǎn)錄延伸[108,111]。因此,asDOG1的表達(dá)可能影響DOG1的轉(zhuǎn)錄延伸,這是種子休眠的一個(gè)關(guān)鍵因子(圖4-B)[7,100-102]。由于在種子吸脹過(guò)程中DOG1和asDOG1的表達(dá)量降低,因此,asDOG1的作用可能被局限在種子成熟階段[104],DOG1蛋白功能的修飾而不是它的轉(zhuǎn)錄控制對(duì)于后熟誘導(dǎo)種子萌發(fā)可能是關(guān)鍵的[96,112]。asDOG1在種子成熟階段的表達(dá)水平可能決定成熟種子的休眠深度,但為了理解asDOG1在種子休眠生物學(xué)中的確切作用還有待于進(jìn)一步研究。
目前,已經(jīng)報(bào)道DOG1能與AHG1/AHG3和PP2C相互作用[48,92],而AHG1[60]和AHG3[113]是ABA信號(hào)傳遞和種子休眠的負(fù)調(diào)控因子。AHG1(ahg1-5)或AHG3(ahg3-2)的功能缺失突變將增強(qiáng)種子休眠,雙突變體ahg1-5ahg3-2的種子休眠特性增強(qiáng)[92],在ahg1-1ahg3-1雙突變體種子中也觀察到類似現(xiàn)象[48]。這些結(jié)果表明,這2個(gè)AHG在種子休眠中起冗余的作用。當(dāng)非休眠突變dog1-2與單一ahg突變的任何一個(gè)組合時(shí),雙突變體種子(dog1-2 ahg1-5和dog1-2 ahg3-2)是完全非休眠的[92],這表明DOG1對(duì)AHG1和AHG3的拮抗作用。相反,三重突變體dog1-2 ahg1-5 ahg3-2種子像雙突變體ahg1-5 ahg3-2種子一樣仍然是深休眠的[92],表明AHG1和AHG3對(duì)DOG1是上位性的(epistatic)。這些遺傳分析表明AHG1和AHG3在DOG1的下游起促進(jìn)萌發(fā)的作用,DOG1通過(guò)束縛它們維持種子休眠[19,48]。
圖4 DOG1表達(dá)和功能的調(diào)節(jié)(引自NONOGAKI[91])Fig.4 Regulation of DOG1 expression and function (From NONOGAKI[91])
AHG1和AHG3的PP2C功能缺失增加種子對(duì)ABA的敏感性[48,92]。DOG1被認(rèn)為通過(guò)結(jié)合和抑制AHG1和AHG3增加對(duì)ABA的敏感性。這種機(jī)制類似于ABA感受和信號(hào)途徑中通過(guò)ABA受體PYR/PYL/RCAR對(duì)ABI1亞家族PP2C的抑制(圖3)[12,47,49]。PP2C活性的抑制(ABA受體的主要作用)也在DOG1蛋白中觀察到[48],盡管在不同的實(shí)驗(yàn)室也觀察到一些相互矛盾的結(jié)果,這可能是由于在體外試驗(yàn)中缺失一些因素所致[92]。對(duì)于種子休眠,PP2C的失活可能是DOG1功能的一個(gè)重要部分。
根據(jù)PP2C抑制激酶的典型作用,與種子休眠有關(guān)的PP2C的一個(gè)顯著特征是AHG1(但不是AHG3)對(duì)ABA受體的抑制作用是抗性的[59]。在體外試驗(yàn)中當(dāng)激酶與PP2C一起孵育時(shí),激酶的自體磷酸化作用被PP2C抑制;而ABA受體和ABA一起加入到同一反應(yīng)體系時(shí)則抑制PP2C的活性和恢復(fù)激酶的自體磷酸化。相反,在ABA和激酶存在下ABA受體和AHG1的共孵育不表現(xiàn)出自體磷酸化,表明AHG1仍然能夠抑制激酶活性,即PP2C對(duì)ABA受體的抑制作用是抗性的[59]。AHG1的另一特征表明即使在高水平的ABA存在下,這些種子表達(dá)的和與休眠相關(guān)的PP2C仍然能夠負(fù)調(diào)控ABA信號(hào)傳遞。這些研究結(jié)果表明只要通過(guò)這個(gè)開(kāi)放的AHG1窗口,種子萌發(fā)程序仍然能夠在含有高水平ABA的發(fā)育種子中運(yùn)行[19]。因此,為了完全暫停萌發(fā)程序,必須關(guān)閉拮抗ABA抑制的AHG1途徑。DOG1的主要生物學(xué)作用可能是阻止AHG1/AHG3途徑以確保種子休眠[19]。DOG1似乎是作為ABA作用的“看門(mén)狗(watchdog)”,直到它在種子后熟過(guò)程中被化學(xué)修飾和失活[19],從而允許種子恢復(fù)萌發(fā)程序。
另一個(gè)種子特異性的ABA信號(hào)是DOG1被認(rèn)為是一種血紅素結(jié)合蛋白(heme-binding protein)。血紅素不是DOG1與AHG1相互作用所必需的,AHG1通過(guò)DOG1 N端區(qū)域中的6個(gè)殘基DSYLEW(位置13—18)介導(dǎo)。然而,在DOG1蛋白的His 245和His 249結(jié)合的血紅素對(duì)于DOG1在種子休眠中的功能是必需的[48]。由于血紅素結(jié)合蛋白是作為O2和NO傳感器起作用[114],但至今血紅素怎樣與ABA信號(hào)體系相聯(lián)系仍不夠清楚。研究發(fā)現(xiàn),種子的氧化還原狀態(tài)變化顯著地影響種子的休眠與萌發(fā)[112]。NO觸發(fā)ABI5的S-亞硝?;⊿-nitrosylation),從而引起萌發(fā)抑制因子ABI5的穩(wěn)定性降低[91,115]。血紅蛋白是一種NO的清除劑以及負(fù)影響ABI5的S-亞硝酰化作用,從而穩(wěn)定ABI5[91];DOG1可能參與了這個(gè)過(guò)程[19]。
ABA是調(diào)控種子發(fā)育、休眠與萌發(fā)以及脫水耐性的重要激素,也顯著地影響種子的產(chǎn)量與質(zhì)量和幼苗形成[1-2];因此,自1960年以來(lái)ABA的代謝、生理作用和信號(hào)傳遞就得到了廣泛的研究[12,48,116-117]。盡管近年來(lái)這些領(lǐng)域已取得了重要的突破,但仍然有一些重要的科學(xué)問(wèn)題尚不清楚。例如,ABA代謝中ABA被CYP707A家族催化成為8'-羥基-ABA,然后自發(fā)地異構(gòu)化成為PA;ABA葡糖基轉(zhuǎn)移酶能將ABA轉(zhuǎn)化成為ABA-GE,作為ABA的儲(chǔ)存池;ABA-GE又能被β-葡糖苷酶水解成為ABA和葡萄糖(圖1)。那么,這些酶及其基因怎樣響應(yīng)發(fā)育和環(huán)境變化以維持正常的ABA濃度是不清楚的。
圖3總結(jié)了種子中ABA信號(hào)途徑的新模型。PYR/PYL/RCAR蛋白與ABA結(jié)合,并抑制A組PP2C的活性;PP2C使SnRK2去磷酸化和阻止活性SnRK2的積累;SnRK2又參與bZIP轉(zhuǎn)錄因子的直接磷酸化;從而負(fù)調(diào)控ABA介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄反應(yīng)[12,19,48]。盡管這個(gè)模型能夠解釋核心ABA信號(hào)傳遞途徑,但不能解釋ABA生理的許多重要調(diào)控因子的作用,包括第二信息[12]。因此,研究已知因子例如Ca2+或者ROS與PYR/PYL/RCAR信號(hào)機(jī)制的相互關(guān)系將是今后的任務(wù)之一。此外,DOG1和AHG1/AHG3結(jié)合,調(diào)控下游組分包括SnRK2和ABI5,組成與核心ABA信號(hào)途徑并行的種子休眠與萌發(fā)調(diào)控系統(tǒng);這兩條途徑在組分PP2C重疊[19,48,92]。值得注意的是,在整合生理?xiàng)l件或者環(huán)境信號(hào)時(shí)PP2C優(yōu)先響應(yīng)哪一條途徑,這兩條途徑怎樣協(xié)調(diào),以及PP2C還有哪些新的靶組分都還不夠清楚。
組學(xué)(-omics)技術(shù)已經(jīng)應(yīng)用于種子休眠與萌發(fā)的研究[118-120],結(jié)合種子ABA生物合成和信號(hào)組分突變體,利用相應(yīng)的專一性抑制劑,構(gòu)建新的種子休眠與萌發(fā)的組學(xué)研究體系,包括轉(zhuǎn)錄組、翻譯組、蛋白質(zhì)組、代謝組和環(huán)境組可能產(chǎn)生一些新的知識(shí)和有助于更全面地理解種子休眠的機(jī)制。