宋來思,趙海山,吳文富,馮啟榮,譚文
(1.廣東工業(yè)大學(xué)生物醫(yī)藥學(xué)院,廣東 廣州 510006; 2.廣東省人民醫(yī)院醫(yī)學(xué)研究部,廣東 廣州 510080)
血管內(nèi)皮生長因子b(vascular endothelial growth factor b,Vegf-b)是Vegf家族的一員,其氨基酸序列和Vegf-a高度相似[1],因此,有人認(rèn)為Vegf-b也是促血管生長因子[2-3]。但是,有人卻發(fā)現(xiàn)Vegf-b對血管發(fā)育影響甚小[4]。事實上,與廣泛分布的Vegf-a不同,Vegf-b主要分布在心臟、骨骼肌以及棕色脂肪等能量代謝活性高的組織中[5-6]。近年來,國內(nèi)外研究進展表明Vegf-b與心肌細(xì)胞的存活[1]、線粒體功能[7]和能量代謝[8]有著密切的聯(lián)系。Kivela等[9]證明了Vegf-b通過激活ERK及Akt信號通路提高線粒體功能,增加心臟能力。Lal等[1]認(rèn)為Vegf-b一方面通過調(diào)控Vegf-a間接促進血管生成,另一面直接促進脂肪酸的代謝,保護心臟。這表明Vegf-b可能是內(nèi)皮細(xì)胞與心肌細(xì)胞之間通訊的重要因子,將血管新生與心肌細(xì)胞能量代謝聯(lián)系起來。但上述猜想需要進一步的實驗驗證。但是,Vegf-b對于能量代謝的調(diào)控尚有爭議,有人認(rèn)為Vegf-b使脂肪酸代謝轉(zhuǎn)為糖代謝[10],而有人卻認(rèn)為Vegf-b提高了脂肪酸的代謝[11]。
綜上所述,Vegf-b對血管發(fā)育及能量代謝的影響尚有爭議,有待進一步的驗證。此外,Vegf-b是保護心臟的潛在靶點,但是具體的保護機制尚未完全清楚。目前也沒有針對Vegf-b靶點的藥物,因此,有必要對Vegf-b的生理功能及保護心臟的作用機制進行深入研究,從而為針對Vegf-b靶點新的治療策略和新藥開發(fā)提供依據(jù),構(gòu)建Vegf-b敲除動物模型可以為這個方向的研究奠定基礎(chǔ)。
斑馬魚 (zebrafish) 作為脊椎動物整體模型,與常見的爪蟾、小鼠、大鼠等模式動物相比,具有許多明顯的優(yōu)勢[12],如(1)產(chǎn)卵多,健康的成年母魚1周可以產(chǎn)200~300顆胚胎,給各種轉(zhuǎn)基因品種的培育提供足夠的篩選樣本;(2)胚胎透明,各種器官在顯微鏡下直接可見,配合特異表達熒光蛋白的轉(zhuǎn)基因魚系,能夠簡單便捷地在基因水平進行編輯,在活體狀態(tài)下觀察其發(fā)育情況等。轉(zhuǎn)基因斑馬魚系Tg[flk:EGFP]使用flk作為啟動子驅(qū)動EGFP,以使表達flk的細(xì)胞表達綠色熒光,特異性的反映血管內(nèi)皮細(xì)胞的發(fā)育情況,應(yīng)用廣泛。如Fernando等用Tg[flk:EGFP]斑馬魚胚胎模型證明了石杉醇提取物(IO)及其組分Ishophloroglucin A(IPA)對高糖誘導(dǎo)的血管生成具有抗血管生成的作用,表明它們在糖尿病相關(guān)血管生成中有潛在的治療作用[13]。
與早期的ZFN,TALENT技術(shù)相比,CRISPR/Cas9技術(shù)通過單鏈sgRNA,直接識別DNA序列,并實現(xiàn)高效精確的DNA切割,再利用細(xì)胞的非同源末端重組或同源重組對斷裂的DNA進行修復(fù),可實現(xiàn)對靶基因的敲除、敲入。CRISPR/Cas9系統(tǒng)整體操作簡單,編輯效率高,應(yīng)用廣泛,大大降低了基因編輯的難度[14]。該技術(shù)以廣泛分布在基因組中的各種序列基因為靶點,因此可以高效的對絕大多數(shù)基因進行敲除,用于各種基因功能研究[15]。
因此,本研究中,將利用CRISPR/Cas9技術(shù)敲除轉(zhuǎn)基因斑馬魚系Tg[flk:EGFP]的Vegf-b基因,以觀察其對心血管發(fā)育的影響。
PV830型皮升注射泵 (美國World Precision Instruments公司);Stemi 508型體視顯微鏡(德國Carl Zeiss公司);Axio Observer A1型熒光倒置顯微鏡(德國Carl Zeiss公司);LBI-175-N型生化培養(yǎng)箱(上海龍躍儀器設(shè)備有限公司)。
Holt buffer配制如下:用量筒量取2 L ddH2O,置于燒杯中,使用磁力攪拌器進行攪拌,依次加入7.000 g NaCl,0.400 g NaHCO3,0.100 g KCl和0.235 g CaCl2,用一次性真空過濾器(孔徑0.22 μmol/L)過濾后常溫儲存?zhèn)溆谩?/p>
實驗動物為轉(zhuǎn)基因斑馬魚系Tg[flk:EGFP],北京大學(xué)深圳研究生院Lin Lab慷慨贈送,年齡在3~12個月,按照國家斑馬魚資源中心指導(dǎo)建議飼養(yǎng)繁殖。
根據(jù)斑馬魚的Vegf-b基因序列進行sgRNA設(shè)計。本研究設(shè)計了2個sgRNA(表1),顯微注射到斑馬魚胚胎,用堿裂法提基因組DNA,PCR擴增后測序評價其有效性。sgRNA 有效性鑒定及基因敲除斑馬魚篩選所需引物設(shè)計見表2。
表1 Vegf-b sgRNA靶位點核苷酸序列Table 1 Vegf-b sgRNA target nucleotide sequences
表2 Vegf-b sgRNA鑒定和篩選引物序列Table 2 Vegf-b sgRNA identification primer sequences
測序檢測sgRNA有效性使用上下游引物雙向測定,其余篩選只用上游引物正向測序。
在注射前1天下午喂食后1 h,挑選健康的轉(zhuǎn)基因斑馬魚系Tg[flk:EGFP]雌雄各6條,一雄一雌置于配種缸里,中間用隔板隔開。次日上午9:00抽走隔板,讓雄雌魚自由交配0.5 h,產(chǎn)卵后10 min內(nèi)收集胚胎,挑選200枚健康的胚胎并在單細(xì)胞階段進行顯微注射。注射結(jié)束后,置于培養(yǎng)皿中,加入適量Holt buffer在28.5 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
將25 ng/nL sgRNA和250 ng/nL Cas9 RNA混勻,注射2 nL到斑馬魚胚胎。胚胎置于培養(yǎng)皿中,加適量Holt buffer水在28.5 ℃培養(yǎng)箱中飼養(yǎng)。
顯微注射后的胚胎F0代在24 hpf(hours post-fertilization)用堿裂法提基因組DNA,PCR擴增后測序評價sgRNA的有效性。讓F0代與同品系的野生型斑馬魚雜交,胚胎測序篩選出穩(wěn)定遺傳的founder。讓founder與同品系的野生型雜交得到F1代,待F1代成年后用堿裂法測序鑒定篩選出敲除的雜合子斑馬魚Vegf-b+/-,通過基因克隆測序鑒定雜合子F1代的基因型。讓F1代雜合子與同品系的野生型雜交得到F2代,同樣的方法測序鑒定篩選出基因型相同的F2代雜合子,再讓其自交獲得F3代,待F3代成年后用同樣的方法測序鑒定,最終篩選出敲除的純合子斑馬魚Vegf-b-/-(圖1)。
用pEASY?-T1 Simple Cloning Kit(Transgen,CT111)進行克隆,常溫將4 μL目的基因PCR產(chǎn)物和1 μL pEASY?-T1 Simple Cloning Vector混勻,置于冰上5 min,反應(yīng)結(jié)束后進行轉(zhuǎn)化:往連接產(chǎn)物中加入50 μL Trans-T1感受態(tài)細(xì)胞,輕彈混勻,置于冰上30 min。42 ℃水浴熱激30 s,立即置于冰上2 min。加200 μL SOC,放置在搖床上,轉(zhuǎn)速200 r/min,37 ℃培養(yǎng)1 h。同時,取16 μL濃度為500 mmol/L的IPTG和40 μL濃度為20 mg/mL X-gal混勻,均勻涂在Amp+平板上,37 ℃培養(yǎng)箱中放置1 h。待IPTG和X-gal被吸收后,取100 μL菌液均勻涂在平板上,在37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜。次日,挑選8個單克隆PCR后送測序。
圖1 基因敲除斑馬魚模型的構(gòu)建過程
Figure 1 Process of construction of gene knockout zebrafish model
為評價敲除Vegf-b對斑馬魚心血管發(fā)育的影響,將同品系的野生型(control組)和敲除Vegf-b(Vegf-b組)的F3代雜合子分別自交,收集胚胎。在24 hpf (受精后小時數(shù))用24孔板進行鋪板,每孔20枚胚胎和1 mL Holt buffer水,每組重復(fù)3孔。在96 hpf(受精后小時數(shù)),觀察胚胎的發(fā)育情況。在凹面載玻片上滴加1滴4%甲基纖維素,用于固定胚胎。將胚胎固定在固定液上,在體視顯微鏡下調(diào)整好胚胎的位置,使兩眼重合,身體保持平直,用熒光倒置顯微鏡EGFP通道觀察血管并拍照,明場通道觀察心臟并拍照。實驗重復(fù)3次。
測序峰圖用Seqscanner進行分析,序列用SerialCloner進行比對,斑馬魚圖片用Photoshop進行裁剪。
測序結(jié)果顯示,sgRNA1(圖2 A)出現(xiàn)明顯的套峰,且重疊峰出現(xiàn)在Vegf-b靶位點(黑色線框所標(biāo)注的序列)酶切位點附近,而sgRNA2為單峰(圖2 B),確定sgRNA1誘導(dǎo)突變有效,因此,本研究使用sgRNA1進行下一步的實驗。
A. sgRNA1; B. sgRNA2。
圖2 sgRNA有效性檢測結(jié)果
Figure 2 sgRNA validity test results
F0代嵌合體成年后與同品系的野生型雜交,胚胎通過堿裂法測序,不能穩(wěn)定遺傳的F0代只有單峰,可以穩(wěn)定遺傳的有明顯套峰,稱之為founder(圖3 A)。讓founder與野生型雜交獲得F1代,待F1代成年后用堿裂法測序,沒有基因突變的野生型只有單峰,有基因突變的斑馬魚雜合子Vegf-b+/-有明顯套峰(圖3 B)。對F1代敲除雜合子進行基因克隆測序,發(fā)現(xiàn)其基因序列缺失TC 2 bp堿基(圖3 C)。讓缺失TC 2 bp 的F1代雜合子和野生型雜交獲得F2代,待F2代成年后用相同方法篩選出基因型相同的F2代敲除雜合子,野生型只有單峰,F(xiàn)2代敲除雜合子有明顯套峰(圖3 D)。讓F2代敲除雜合子Vegf-b+/-自交,相同的方法進行篩選,發(fā)現(xiàn)雜合子Vegf-b+/-有明顯套峰,沒有基因突變的野生型或者有基因突變的純合子Vegf-b-/-(圖3 E)只有單峰,進一步通過序列比對發(fā)現(xiàn),野生型堿基沒有缺失,純合子Vegf-b-/-缺失TC 2 bp堿基(圖3 F)。最終獲得可穩(wěn)定遺傳的Vegf-b敲除的斑馬魚系。
A. F0代野生型和founder; B. F1代野生型和F1代雜合子; C. F1代雜合子序列; D. F2代野生型和F2代雜合子; E. F3代雜合子、F3代野生型和 F3代純合子; F. F3代野生型序列和 F3代純合子序列。
圖3Vegf-b敲除斑馬魚系鑒定結(jié)果
Figure 3 Identification outcome ofVegf-bknockout zebrafish line
control組所有胚胎血管發(fā)育正常,可觀察到發(fā)育完整的血管結(jié)構(gòu)。體節(jié)間血管(intersegmental blood vessels,ISVs)從背部主動脈側(cè)(dorsal aorta,DA)延伸到縱向背側(cè)吻合血管(dorsal longitudinal anastomotic vessels,DLAVS)。心臟呈S型,側(cè)面觀察心臟心室和心房部分重疊,心血管系統(tǒng)無形態(tài)學(xué)改變(圖4 A)。Vegf-b組部分胚胎血管發(fā)育受損,表現(xiàn)為體節(jié)間血管變細(xì),內(nèi)皮細(xì)胞受損(紅色箭頭),嚴(yán)重者體節(jié)間血管發(fā)育不全,表現(xiàn)為體節(jié)間血管未從背部主動脈側(cè)(DA)延伸到縱向背側(cè)(DLAVS)吻合血管(黃色箭頭)。心臟出現(xiàn)明顯的心包膜水腫(紅色箭頭),卵黃囊腫大(藍(lán)色箭頭),心臟畸形且線性化,心室變小,體節(jié)間血管血流緩慢或者無血液循環(huán)等多種形態(tài)改變(圖4 B)。
A. control組; B.Vegf-b組。
圖4 敲除Vegf-b對心血管發(fā)育的影響
Figure 4 Effect of knockoutVegf-bon embryonic vascular development
Vegf-b是Vegf家族的一員,但不同于Vegf-a是公認(rèn)的促血管生長因子,它對血管內(nèi)皮細(xì)胞的影響尚未明晰。有人認(rèn)為Vegf-b促進血管新生[16],尤其是冠狀動脈血管的發(fā)育。Kupatt等發(fā)現(xiàn)過表達Vegf-b使心肌缺血或心梗的小鼠心臟毛細(xì)血管的密度增加[17]。有人卻認(rèn)為,Vegf-b對血管發(fā)育的影響甚小或者抑制血管,Mould等發(fā)現(xiàn)敲除Vegf-b的小鼠,炎癥相關(guān)滑膜血管生成減少[18]。
轉(zhuǎn)基因斑馬魚系Tg[flk:EGFP]內(nèi)皮細(xì)胞特異性的表達綠色熒光,反映血管內(nèi)皮細(xì)胞的發(fā)育情況,能夠在活體狀態(tài)下直接觀察Vegf-b對血管發(fā)育的影響。CRISPR/Cas9系統(tǒng)是在原核生物CRISPR/Cas9技術(shù)基礎(chǔ)上進行改造,從而應(yīng)用于真核生物的一種基因編輯技術(shù)。與傳統(tǒng)的TALEN和ZFN技術(shù)對比,CRISPR/Cas9具有許多優(yōu)勢。TALEN和ZFN都是蛋白質(zhì)引導(dǎo)的DNA切割,但蛋白質(zhì)合成、選擇和驗證過程復(fù)雜且耗時。CRISPR/Cas9是由sgRNA引導(dǎo),短且方便設(shè)計,成本低且易于生產(chǎn)[19]。CRISPR/Cas9可在多個獨立位點進行基因修飾[20]。目前只有morpholinos敲降Vegf-b的斑馬魚模型,認(rèn)為Vegf-b對斑馬魚的視網(wǎng)膜血管發(fā)育有影響,但未發(fā)現(xiàn)其對體節(jié)間血管的發(fā)育有損傷[21]。
本研究針對Vegf-b3號外顯子設(shè)計了2個sgRNA,證明了sgRNA1效率高,通過三代篩選得到缺失TC 2bp穩(wěn)定遺傳系,成功建立Vegf-b移碼突變的敲除斑馬魚系。進一步研究發(fā)現(xiàn),敲除Vegf-b會導(dǎo)致胚胎血管發(fā)育受損,表現(xiàn)為體節(jié)間血管變細(xì),嚴(yán)重者發(fā)育不全,證明了Vegf-b對血管發(fā)育有重要作用。同時,這也說明了基因敲除技術(shù)和morpholinos敲降技術(shù)有不同表型,前者可以構(gòu)建出穩(wěn)定遺傳的基因編輯斑馬魚品系,是后續(xù)研究Vegf-b功能的重要模型。
此外,本研究還意外發(fā)現(xiàn)敲除Vegf-b會導(dǎo)致心臟出現(xiàn)心包膜水腫,這表明Vegf-b可能對心臟的發(fā)育及功能有重要影響。有研究也發(fā)現(xiàn)缺失Vegf-b的小鼠心臟小于正常小鼠心臟,其心臟功能的恢復(fù)能力也弱于正常鼠[22]。這提示Vegf-b的功能不僅僅局限于血管方面,同時與心臟發(fā)育及功能有重要的關(guān)系。Mehlem等認(rèn)為Vegf-b可能通過PGC-1α/ERR-α通路調(diào)控脂肪酸,影響線粒體能量代謝,從而保護心臟[23]。穩(wěn)定遺傳的Vegf-b敲除斑馬魚系將成為研究Vegf-b功能和分子機制的重要工具。
綜上所述,本研究使用CRISPR/Cas9技術(shù)敲除轉(zhuǎn)基因斑馬魚系Tg[flk:EGFP]的Vegf-b基因,成功構(gòu)建Vegf-b敲除的Tg[flk:EGFP]斑馬魚系,本研究發(fā)現(xiàn)敲除Vegf-b導(dǎo)致胚胎血管發(fā)育受損以及心臟心包膜水腫,表明Vegf-b對心血管發(fā)育具有重要作用,為未來深入研究Vegf-b功能提供穩(wěn)定可靠的動物模型。