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沙門菌和志賀菌雙重實(shí)時(shí)熒光定量PCR 的應(yīng)用效果評(píng)價(jià)

2020-07-27 11:15廣東省深圳市西麗人民醫(yī)院檢驗(yàn)科深圳518055
口岸衛(wèi)生控制 2020年2期
關(guān)鍵詞:沙門雙色菌液

熊 輝 廣東省深圳市西麗人民醫(yī)院檢驗(yàn)科(深圳,518055)

沙門菌和志賀菌都是引發(fā)食品中毒的重要致病菌,特別是對(duì)于兒童而言,其危害性非常大,因此這兩種細(xì)菌也成為疾病預(yù)防控制中心對(duì)食品和公共場合工作人員每年定期體檢的必檢項(xiàng)目[1]。 培養(yǎng)法因周期長、操作過程繁瑣、主觀影響因素多、特異性差等原因而無法滿足臨床檢驗(yàn)需求,導(dǎo)致其臨床應(yīng)用存在一定的局限性[2]。 所以,探討一種快速、準(zhǔn)確、有效的檢測方法非常重要也極有必要。 熒光定量PCR 技術(shù)具有操作簡便、靈敏感高、特異性強(qiáng)等優(yōu)勢而得到廣泛運(yùn)用,盡管當(dāng)前針對(duì)沙門菌和志賀菌的熒光PCR 試劑盒有很多,但大規(guī)模臨床樣本的研究尚未見報(bào)道。 基于此,本研究運(yùn)用雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法對(duì)2700 份臨床肛拭子樣本進(jìn)行沙門菌和志賀菌檢測,并分析其結(jié)果,總結(jié)匯報(bào)如下。

1 材料與方法

1.1 材料

收集2017 年8 月到2018 年4 月深圳市西麗人民醫(yī)院職業(yè)健康體檢人員臨床肛拭子樣本2700份,運(yùn)用雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法與培養(yǎng)法同時(shí)進(jìn)行沙門菌與志賀菌的檢測。

1.2 方法

1.2.1 儀器與試劑。 羅氏熒光定量PCR 儀 (美國Roche 公司),主要試劑包括:PCR Marker(武漢默沙克生物科技有限公司)沙門-志賀菌增菌液(批號(hào):SSB-1701014D),木糖賴氨酸脫氧膽鹽平板(批號(hào):XLD-171009D),克氏雙糖鐵(批號(hào):170914),動(dòng)力-吲哚-尿素酶生化管(批號(hào):170914),沙門菌顯色平板(批號(hào):170925-2),沙門菌多價(jià)診斷血清(批號(hào):20170501), 志 賀 菌 多 價(jià) 診 斷 血 清 ( 批 號(hào):20170601),沙門氏菌、志賀氏菌檢測試劑盒(批號(hào):17090801)。

1.2.2 培養(yǎng)法。將肛拭子樣本置于沙門-志賀菌增菌液中,置于35℃溫箱增菌18~24h,3 區(qū)劃線接種至木糖賴氨酸脫氧膽鹽平板, 置于35℃溫箱增菌18~24h,于木糖賴氨酸脫氧膽鹽平板上篩選出疑似沙門菌和志賀菌的菌落,接種克氏雙糖鐵、動(dòng)力-吲哚-尿素酶生化管及血平板, 作初步的生化鑒定和分純培養(yǎng),排除一部分非沙門菌和志賀菌后,將其他菌落進(jìn)行革蘭染色、顯色平板培養(yǎng)、菌種鑒定以及血清學(xué)分型。

1.2.3 雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法。以沙門菌和志賀菌的fimY、ipaH 為目標(biāo)檢測基因, 分別對(duì)其進(jìn)行線上序列比對(duì)。 運(yùn)用Primer Premier 5.0 software 系統(tǒng)設(shè)計(jì)沙門菌、志賀菌的引物與TaqMan 探針。運(yùn)用Primer Express 3. 0 software 系統(tǒng)與DNA star 進(jìn)行排序、分析及評(píng)估,優(yōu)化引物、探針、反應(yīng)條件等因素。 將沙門菌、志賀菌的標(biāo)準(zhǔn)陽性菌株用GN 增菌液培養(yǎng)8h后,稀釋成10-4~10-85 個(gè)濃度梯度,分別取50μl 菌液涂HE 瓊脂平板各3 個(gè),取相同濃度菌液10μl 作為模板,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR 檢測,統(tǒng)計(jì)平板上長出的菌落數(shù), 聯(lián)合相應(yīng)的實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測結(jié)果,計(jì)算其準(zhǔn)確率。 檢測過程嚴(yán)格按照試劑盒說明法操作,為了避免因樣品中含有死細(xì)菌而造成假陽性檢測結(jié)果, 使用疊氮溴化丙錠預(yù)處理樣品基因,使死細(xì)胞的DNA 分子與疊氮溴化丙錠發(fā)生共價(jià)交聯(lián),以抑制DNA 分子的PCR 擴(kuò)增。

1.3 判斷標(biāo)準(zhǔn)

陽性標(biāo)本檢測結(jié)果Ct 值小于33,待檢樣Ct 值為33~36,則重新檢測,若Ct 值仍為36 或無Ct 值,則直接報(bào)告陰性。 如果檢出混合標(biāo)本呈陽性,將對(duì)應(yīng)的10 個(gè)標(biāo)本組合分別劃線接種到木糖賴氨酸脫氧膽鹽平板上培養(yǎng),即再用培養(yǎng)法重做一遍,以確認(rèn)結(jié)果,并以此陽性報(bào)告為依據(jù)。

1.4 數(shù)據(jù)處理

應(yīng)用SPPS 19.0 軟件對(duì)所有數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,計(jì)數(shù)資料以%表示, 組間對(duì)比采用x2檢驗(yàn),P<0.05 表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2700 份樣本中,培養(yǎng)法檢出沙門菌與志賀菌陽性分別為2 株、0 株, 檢出率分別為0.07%、0.00%,雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法檢出沙門菌與志賀菌陽性分別為6 株、3 株,檢測率分別為0.22%、0.11%,雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法檢測法的檢出率高于培養(yǎng)法,對(duì)比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)(見表1)。

表1 培養(yǎng)法與雙色實(shí)時(shí)熒光定量PCR 檢測法的陽性檢出率對(duì)比[n(%)]

3 討論

沙門菌和志賀菌都是誘發(fā)感染性腹瀉的主要病原菌,血清分型異常之多,沙門菌高達(dá)兩千多個(gè)血清型,因此其分布也較廣[3]。腸炎沙門菌是造成食物中毒的主要病原菌,其他沙門菌血清型還包括豬霍亂、湯普遜等,常通過污染的食物與水源傳播[4]。志賀菌是導(dǎo)致細(xì)菌性痢疾的病原之一,其流行具有變遷性特點(diǎn),血清型也會(huì)發(fā)現(xiàn)演變與進(jìn)化[5]。當(dāng)發(fā)生感染或食物中毒后,患者經(jīng)治療痊愈后,會(huì)有少部分人會(huì)成為健康帶菌者,因無自覺癥狀,檢查不易發(fā)現(xiàn),故將其視為慢性或隱性傳染源,此類患者若從事飲食或公共衛(wèi)生場所服務(wù)類工作,則會(huì)對(duì)周邊人群有傳染的可能。

對(duì)于沙門菌和志賀菌的檢測,傳統(tǒng)檢測方法主要為細(xì)菌培養(yǎng)法,這種方法雖然能夠達(dá)到一定的檢測效果,但敏感度不高,而且檢測所需的時(shí)間較長,所需的試劑較多,因此導(dǎo)致其臨床應(yīng)用存在一定的局限性[6]。 國內(nèi)外有運(yùn)用TaqMan 技術(shù)檢測沙門菌和志賀菌的報(bào)道,但常以單一熒光系統(tǒng)檢測單一細(xì)菌,采取同一種方法同時(shí)檢測不同病原菌的報(bào)道則較為罕見。 隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,PCR 技術(shù)在細(xì)菌檢測中獲得了廣泛運(yùn)用,并在很大程度上提高了檢測的速度。雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 檢測方法的原理是實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因的體外擴(kuò)增,并使用熒光標(biāo)記探針及實(shí)時(shí)熒光PCR 儀采集、分析擴(kuò)增過程信號(hào)。 該檢測方法具有較高的特異性及敏感性,能夠通過儀器對(duì)PCR 產(chǎn)物進(jìn)行熒光信號(hào)檢測,所以在一定程度上提高了檢測結(jié)果的準(zhǔn)確度[7-8]。雙色實(shí)時(shí)熒光定量PCR 檢測方法還能夠?qū)崿F(xiàn)多病原體的同步檢測,省時(shí)省力,操作簡便,且檢測成本較低,能夠大大減少后期細(xì)菌分離培養(yǎng)與鑒定的工作量,提高檢驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確率[9]。操作過程中,盡可能地減少對(duì)玻璃器皿的多次使用,減少清洗、滅菌等環(huán)節(jié),可大大降低實(shí)驗(yàn)室輔助環(huán)節(jié)污染的風(fēng)險(xiǎn),繼而提高檢驗(yàn)質(zhì)量。 實(shí)際工作及臨床經(jīng)驗(yàn)表明,雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法在食物中毒的初篩中極少出現(xiàn)漏檢情況[10],因此,可將其作為國際檢測方法的有力補(bǔ)充。

本研究對(duì)比培養(yǎng)法與雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法在沙門菌和志賀菌臨床檢測中的應(yīng)用價(jià)值, 結(jié)果顯示,雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法檢出這兩種細(xì)菌的陽性率(0.22%、0.11%)均高于培養(yǎng)法(0.07%、0.00%),由此說明,雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法在沙門菌和志賀菌檢測中的臨床應(yīng)用價(jià)值高于培養(yǎng)法。 然而,因?yàn)殡p色實(shí)時(shí)熒光PCR 法的檢測費(fèi)用較高,適合大批量的標(biāo)本篩選,因此目前臨床上依然采用培養(yǎng)法。

綜上所述,雙色實(shí)時(shí)熒光PCR 法檢測沙門菌和志賀菌的臨床效果顯著,具有較高的特異性、敏感度及準(zhǔn)確率,值得臨床推廣與應(yīng)用。

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