趙雅芝,潘 巧,王顯兵,郝文君,劉 桐,王秀梅*,辛九慶*
(1. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,吉林 長春 130118;2. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/動物支原體病創(chuàng)新團(tuán)隊(duì),黑龍江 哈爾濱 150069)
牛支原體(Mycoplasma bovis,M. bovis)是現(xiàn)有的最小的原核微生物,無細(xì)胞壁,可以通過0.22 μm濾器[1],是一種宿主特異性粘膜常在菌,感染能夠引起犢牛的肺炎、關(guān)節(jié)炎及奶牛乳房炎等疾病[2],且常常與其它病原體混合感染導(dǎo)致病情復(fù)雜持久不愈,是危害我國養(yǎng)牛業(yè)健康發(fā)展的重要因素之一。支原體表面有豐富的脂質(zhì)相關(guān)膜蛋白(Lipid-associated mem?brane proteins,LAMPs),其能夠介導(dǎo)支原體黏附感染宿主,調(diào)節(jié)宿主的免疫系統(tǒng)[3],其通過與TLRs 相互作用在炎癥反應(yīng)的起始中起重要作用[4]。本研究從前期獲得的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)中[5],分析了M.bovis LAMPs 刺激前后EBL 細(xì)胞差異表達(dá)的基因,發(fā)現(xiàn)M. bovis LAMPs 刺激后EBL 細(xì)胞上調(diào)表達(dá)TRIM9 基因。TRIM9 基因?qū)儆谌Y(jié)構(gòu)域蛋白(Tripartitemotif,TRIM)家族,該家族蛋白存在于所有多細(xì)胞動物體內(nèi),目前包含70 多個(gè)成員。越來越多的證據(jù)表明,許多TRIM 家族蛋白與抗感染免疫相關(guān)[6]。最近有文獻(xiàn)報(bào)道TRIM9 與NF-κB 信號通路的調(diào)控相關(guān)[7-8]。而以前的文獻(xiàn)報(bào)道表明M.bovis LAMPs 能夠通過NF-κB信號通路誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞釋放IL-1β[9]。為探究TRIM9基因在M.bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞釋放IL-1β中的作用,本研究構(gòu)建TRIM9 基因過表達(dá)和敲低的EBL細(xì)胞模型,采用qPCR,ELISA 和western blot 等試驗(yàn)方法,解析了TRIM9 基因在M.bovis LAMPs 誘導(dǎo)EBL細(xì)胞釋放IL-1β中積極調(diào)控的作用,為宿主基因調(diào)控M.bovis LAMPs 誘導(dǎo)的天然免疫應(yīng)答機(jī)制提供理論依據(jù),同時(shí)也為后期疫苗研發(fā)奠定基礎(chǔ)。
1.1 主要實(shí)驗(yàn)材料M.bovis 牛2c 株、EBL 細(xì)胞、M.bovis LAMPs、NP-40、pEGFP-C1 質(zhì)粒均由本實(shí)驗(yàn)室保存;pCMV-C-HA 質(zhì)粒購自碧云天公司。BCA 蛋白濃度測定試劑盒購自碧云天公司;限制性內(nèi)切酶BamH I 與Sal I 購 自NEB 公 司;Prime STAR Max Pre?mix(2×)購自TaKaRa 公司;DMEM/HIGH GLUCOSE購自HyClone;Plasmid Mini Kit I、Gel Extraction Kit購自O(shè)MEGA 公司;Simply P 總RNA 提取試劑盒購自博日公司;Transcriptor First Strand cDNA Synthesis Kit、FastStart Universal SYBR?Green Master(ROX)購自Roche 公 司;TransIT-X2?System 購 自Mirus 公 司;Bovine Interleukin 1 Beta ELISE Kit 購自MYBioSource公司。
1.2 引物設(shè)計(jì)和合成參考GenBank 中GAPDH(AC_000162),IL-1β(NM_174093)和 牛 源TRIM9(NM_001076537)基因mRNA 序列,采用Primer Pre?mier 5.0 軟件和CE DesignV1.03 軟件設(shè)計(jì)qPCR 及PCR引物,TRIM9 基因序列特異性引物兩端分別加入BamH I 和Sal I 酶切位點(diǎn),引物信息見表1,以上引物均由華大基因科技有限公司合成。委托SIGMA 公司設(shè)計(jì)合成TRIM9 基因干擾引物si-TRIM9。
1.3 TRIM9 和IL-1β基因表達(dá)的檢測將生長至對數(shù)期的EBL 細(xì)胞以1×109個(gè)/cm2的密度接種于12 孔細(xì)胞培養(yǎng)板,待細(xì)胞長至80%~90%時(shí),依據(jù)實(shí)驗(yàn)室前期摸索M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞的最佳條件[9],加入終濃度2 μg/mL 的M.bovis LAMPs,設(shè)置空白對照,5%CO237 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)12 h 后收集細(xì)胞,利用Simply P總RNA提取試劑盒提取RNA,經(jīng)Transcrip?tor First Strand cDNA Synthesis Kit 將RNA 反轉(zhuǎn)錄為cD?NA,并以cDNA 為模板采用1L-1β-F/R 和TRIM9-RTF/R引物,利用qPCR方法分別檢測M.bovis LAMPs刺激后EBL 細(xì)胞中TRIM9 和IL-1β的相對表達(dá)量,實(shí)驗(yàn)設(shè)GAPDH(AC_000162)為內(nèi)參基因,qPCR 反應(yīng)條件:95 ℃10 min;95 ℃15 s、60 ℃1 min,40個(gè)循環(huán);95 ℃15 s;60 ℃1 min;95 ℃1 s。
表1 引物序列Table 1 Primers sequence
1.4 TRIM9 亞細(xì)胞定位檢測以1.3 中方法制備EBL 細(xì)胞基因組cDNA 作為為模板,采用TRIM9-GFP-F/R 引物,利用PCR 方法擴(kuò)增TRIM9(擴(kuò)增條件為:95 ℃5 min;95 ℃30 s、61 ℃30 s、72 ℃30 s,40 個(gè)循環(huán);72 ℃10 min),并回收目的片段,連接于BamH I 與Sal I 雙酶切處理純化的pEGFP-C1 載體,構(gòu)建綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9,雙酶切和測序鑒定陽性質(zhì)粒(終濃度2 μg/mL)轉(zhuǎn)染EBL細(xì)胞,對照組轉(zhuǎn)染pEGFP-C1 質(zhì)粒,每組設(shè)置3 個(gè)樣品,重復(fù)3 次實(shí)驗(yàn),24 h 后用1 mL PBS 洗3 次,10 min/次,然后加入1 mL 的4%多聚甲醛,室溫固定15 min,PBS 洗3 次,加入0.5%Triton-X-100 室溫穿 孔15 min,PBS 洗3 次,加入DAPI 染色15 min,利用高分辨率活細(xì)胞共聚焦顯微鏡觀察TRIM9 在EBL 細(xì)胞中的定位。
1.5 過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞的最佳劑量確定按照1.4 中方法采用TRIM9-CHA-F/R引物,構(gòu)建過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9,將不同濃度的過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9(1 μg/mL、2 μg/mL、3 μg/mL、4 μg/mL、6 μg/mL 和8 μg/mL)分別轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,以pCMV-C-HA 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞作為對照,36 h 后利用ELISA 檢測試劑盒檢測培養(yǎng)基中IL-1β的釋放量。同時(shí)收集細(xì)胞,按1.3中方法提取基因組制備cDNA,并以cDNA為模板,以1L-1β-F/R 為引物,GAPDH(AC000162)為內(nèi)參基因,按照1.3 中qPCR 方法檢測EBL 細(xì)胞中IL-1β相對表達(dá)量,重復(fù)3次實(shí)驗(yàn),以引起IL-1β最高表達(dá)量且對EBL細(xì)胞影響輕微的轉(zhuǎn)染劑量作為最佳劑量。
1.6 過表達(dá)及敲低TRIM9 對M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞釋放IL-1β的影響將最佳劑量過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 和si-TRIM9 分別轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,同時(shí)分別轉(zhuǎn)染pCMV-C-HA 和對照siRNA 作為對照組,在5%CO237 ℃培養(yǎng)24 h后加入終濃度2 μg/mL的牛支原體LAMPs 繼續(xù)培養(yǎng)12 h,重復(fù)3 次實(shí)驗(yàn),利用qPCR 檢測IL-1β相對表達(dá)量,同時(shí)利用Bovine Interleukin 1 Beta ELISE Kit 檢測EBL 細(xì)胞IL-1β的釋放量。
1.7 NF-κB 信號通路激活水平檢測NF-κB 由p50 亞基和p65 亞基組成,p65 亞基進(jìn)核和磷酸化是激活NF-κB 信號通路的標(biāo)志。為分析TRIM9 在NF-κB 信號通路中的作用。本試驗(yàn)檢測了TRIM9 過表達(dá)及敲低時(shí)LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞后的p65 磷酸化水平。以1.5 中確定的pCMV-C-HA-TRIM9 最佳濃度和si-TRIM9 分別轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,5% CO237 ℃培養(yǎng)24 h 后加入終濃度2 μg/mL 的牛支原體LAMPs 繼續(xù)培養(yǎng)12 h,同時(shí)設(shè)只加入轉(zhuǎn)染試劑組和LAMPs刺激組為對照組。NP-40 裂解細(xì)胞獲取總蛋白,以抗p-p65(1:1 000)抗體為一抗,以山羊抗兔IgG(1:10 000)熒光抗體為二抗,進(jìn)行western blot 檢測,利用Odys?sey?紅外掃描儀掃描NC 膜,使用Image studio 軟件對結(jié)果進(jìn)行灰度值分析,檢測p65 磷酸化水平,本實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。
2.1 M. bovis LAMPs 刺激對EBL 細(xì)胞中TRIM9 和IL-1β基因轉(zhuǎn)錄水平的影響M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞后,采用qPCR 方法對TRIM9 和IL-1β基因的mRNA 表達(dá)量進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示與對照組相比TRIM9 mRNA 表達(dá)量上調(diào)2.9 倍(圖1A),與本實(shí)驗(yàn)室前期獲得的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)[5]分析相符;IL-1β mRNA表達(dá)量也上調(diào)2.6 倍(圖1B)。表明TRIM9 基因可能與M.bovis LAMPs刺激EBL 細(xì)胞釋放IL-1β相關(guān)。
圖1 qPCR 檢測LAMPS 刺激后EBL 細(xì)胞TRIM9(A)和IL-1β(B)的相對表達(dá)量Fig.1 The relative expression of TRIM9 and IL-1β in EBL cells stimulated by M.bovis LAMPs was detected by qPCR
2.2 TRIM9 蛋白在EBL 細(xì)胞中的定位檢測結(jié)果以EBL 細(xì)胞基因組cDNA 為模板,PCR 擴(kuò)增TRIM9基因,構(gòu)建綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9,酶切鑒定結(jié)果顯示得到約2 100 bp 大小的目的片段,大小與預(yù)期相符(圖2);測序結(jié)果與NCBI 參考序列(NM_001076537)的同源性100%。表明正確構(gòu)建了綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9。
圖2 pEGFP-C1-TRIM9 重組質(zhì)粒雙酶切鑒定Fig.2 Double enzyme digestion of recombinant plasmid pEGFP-C1-TRIM9
將綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL細(xì)胞,利用高分辨率活細(xì)胞共聚焦顯微鏡LSM800-ZEISS 觀察可見,對照組細(xì)胞中無明顯綠色熒光,而轉(zhuǎn)染pEGFP-C1-TRIM9質(zhì)粒的EBL細(xì)胞胞漿中呈現(xiàn)綠色熒光,細(xì)胞核僅藍(lán)色熒光,重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致,表明TRIM9蛋白能夠瞬時(shí)表達(dá)于EBL細(xì)胞的胞漿中。
圖3 高分辨率活細(xì)胞共聚焦顯微鏡TRIM9 亞細(xì)胞定位Fig.3 The subcellular observation of TRIM9 by LSM800
2.3 過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞的最佳劑量將鑒定陽性的過表達(dá)質(zhì)粒pC?MV-C-HA-TRIM9(圖略)以不同濃度梯度轉(zhuǎn)染EBL細(xì)胞,利用qPCR 和ELISA 法分別檢測IL-1β的表達(dá)量,結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HATRIM9 后EBL 細(xì)胞中IL-1β表達(dá)量高于對照組,且兩者呈劑量依賴性,當(dāng)轉(zhuǎn)染的pCMV-C-HA-TRIM9質(zhì)粒終濃度為4 μg/mL 時(shí)IL-1β表達(dá)量最高,由此確定重組質(zhì)粒的最佳轉(zhuǎn)染劑量為4 μg/mL(圖4)。
圖4 qPCR(A)和ELISA(B)方法檢測過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞IL-1β的相對表達(dá)量Fig.4 The relative expression of IL-1β in EBL cells after overexpression of TRIM9 gene was detected by qPCR(A)and ELISA(B)
2.4 敲低以及過表達(dá)TRIM9 后EBL 細(xì)胞中IL-1β檢測結(jié)果為確定TRIM9 對IL-1β表達(dá)的影響,分別將si-TRIM9 和過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,經(jīng)M.bovis LAMPs 刺激,利用qPCR 和ELISA 檢測敲低和過表達(dá)TRIM9 時(shí)IL-1β的表達(dá)量,結(jié)果顯示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染si-TRIM9后TRIM9顯著下調(diào)表達(dá)(p<0.001),而轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-CHA-TRIM9 后TRIM9 顯著上調(diào)表達(dá)(p<0.001)(圖5A),表明已將TRIM9 基因在EBL 細(xì)胞中敲低及過表達(dá)。qPCR 檢測結(jié)果顯示,與對照組相比,LAMPs 刺激后正常細(xì)胞中IL-1β上調(diào)2.4 倍,敲低TRIM9 后,細(xì)胞中IL-1β上調(diào)33 倍,而過表達(dá)組中IL-1β上調(diào)2.3 倍(圖5B);ELISA 檢測結(jié)果顯示LAMPs 刺激后正常細(xì)胞中IL-1β上調(diào)2.9 倍,敲低組EBL 細(xì)胞IL-1β釋放量上調(diào)30倍,而過表達(dá)組EBL細(xì)胞IL-1β釋放量上調(diào)2.9倍(圖5C),與qPCR 結(jié)果趨勢一致。以上結(jié)果表明過表達(dá)TRIM9 基因?qū)L-1β表達(dá)無影響,而敲低TRIM9基因可促進(jìn)IL-1β表達(dá)。
圖5 敲低及過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞TRIM9(A)和IL-1β(B,C)的相對表達(dá)量Fig.5 The relative expression of TRIM9 and IL-1β in EBL cells after knockdown and over-expression of TRIM9 gene
2.5 NF-κB 信號通路檢測結(jié)果分別檢測了敲低和過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平。結(jié)果顯示,與對照組相比,敲低TRIM9 后EBL細(xì)胞中p65 磷酸化水平顯著升高(p<0.01),而過表達(dá)TRIM9 蛋白后EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平無明顯變化(圖6)。表明過表達(dá)TRIM9 后牛支原體LAMPs不誘導(dǎo)NF-κB 信號通路激活;而敲低TRIM9 后牛支原體LAMPs 能夠促進(jìn)p65 磷酸化水平提高從而激活NF-κB 信號通路。
圖6 Western blot 檢測敲低及過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化(A)和灰度值分析(B)Fig.6 Detection of p65 phosphorylation(A)and gray value analysis(B)of p65 phosphorylation in EBL cells after knockdown and over expression with TRIM9 gene by western blot
前期研究表明M. bovis LAMPs 通過NF-κB 信號通路誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞釋放IL-1β[9-10],引發(fā)EBL 細(xì)胞的炎性反應(yīng),但EBL 細(xì)胞中參與M.bovis LAMPs 引起的炎性反應(yīng)的相關(guān)基因尚不明確。本實(shí)驗(yàn)通過對前期獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)[5]分析,篩選出可能參與調(diào)控NF-κB 信號通路的TRIM9 基因,通過參考GenBank中TRIM9 的序列設(shè)計(jì)引物,采用qPCR 方法驗(yàn)證,結(jié)果表明M.bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞增強(qiáng)IL-1β表達(dá)的同時(shí),TRIM9 基因也上調(diào)表達(dá)。相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道TRIM 家族基因參與多種細(xì)胞功能,包括調(diào)節(jié)先天免疫反應(yīng)[6],TRIM9 最初被認(rèn)為主要存在于胚胎和成人大腦內(nèi),調(diào)控神經(jīng)元的發(fā)育成熟[11-12]。本研究通過亞細(xì)胞定位證明TRIM9基因能夠在EBL細(xì)胞內(nèi)表達(dá)。為了探究TRIM9 基因是否參與及調(diào)控M. bovis LAMPs 誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞IL-1β的釋放,采用qPCR 和ELISA 方法檢測過表達(dá)和敲低TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞引起IL-1β表達(dá)情況,結(jié)果顯示當(dāng)TRIM9 基因過表達(dá)時(shí)EBL 細(xì)胞中IL-1β表達(dá)量無明顯變化,而敲低TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞IL-1β表達(dá)量上調(diào)。表明敲低TRIM9 基因促進(jìn)M. bovis AMPs 誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞釋放IL-1β。為驗(yàn)證此過程是否通過NF-κB 信號通路,采用western blot 方法檢測了同樣實(shí)驗(yàn)條件下NF-κB 信號通路激活水平,發(fā)現(xiàn)過表達(dá)TRIM9 基因后M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平與對照組相比無明顯變化;而敲低TRIM9 后檢測到刺激后的EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平明顯升高,表明敲低TRIM9 基因促進(jìn)M. bovis AMPs 誘導(dǎo)NF-κB 信號通路激活。由此表明,敲低TRIM9,促進(jìn)M. bovis LAMPs 誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞中NF-κB信號通路的激活,從而促進(jìn)其IL-1β的釋放。Liu Y等發(fā)現(xiàn)牡蠣中TRIM9 同源物參與負(fù)調(diào)控NF-κB 活動[7],Shi M 等的研究也顯示TRIM9 磷酸化殘基與β-TrCP的重復(fù)區(qū)WD 40 的相互作用阻止了β-TrCP 與底物結(jié)合,穩(wěn)定IκBα和P100,從而阻斷NF-κB 的激活直接影響NF-κB 誘導(dǎo)的炎性細(xì)胞因子的產(chǎn)生[8],文獻(xiàn)資料說明TRIM9 能夠阻斷NF-κB 的激活,本實(shí)驗(yàn)中敲低TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激細(xì)胞試驗(yàn)結(jié)果,與之前的文獻(xiàn)結(jié)果相一致,但是正向的過表達(dá)TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激細(xì)胞試驗(yàn),并未驗(yàn)證該阻斷效應(yīng)。推測一方面可能與2 μg/mL M.bovis LAMPs 刺激IL-1β的釋放量不高,過表達(dá)TRIM9 基因阻斷效應(yīng)不明顯,另一方面可能可能與TRIM9 基因過表達(dá)模型構(gòu)建不適當(dāng)相關(guān)。今后研究也將繼續(xù)針對該部分實(shí)驗(yàn)進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證和探索。綜上所述,本研究對TRIM9 在調(diào)控M.bovis 誘導(dǎo)宿主細(xì)胞免疫應(yīng)答反應(yīng)中的機(jī)制初步探究,解析宿主基因調(diào)控M.bovis 引起宿主細(xì)胞免疫應(yīng)答反應(yīng)的機(jī)制,為開展進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。