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TRIM9 基因調(diào)控牛支原體脂質(zhì)相關(guān)膜蛋白誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞IL-1β表達(dá)的研究

2020-08-04 10:09:42趙雅芝王顯兵郝文君王秀梅辛九慶
關(guān)鍵詞:磷酸化支原體質(zhì)粒

趙雅芝,潘 巧,王顯兵,郝文君,劉 桐,王秀梅*,辛九慶*

(1. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,吉林 長春 130118;2. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/動物支原體病創(chuàng)新團(tuán)隊(duì),黑龍江 哈爾濱 150069)

牛支原體(Mycoplasma bovis,M. bovis)是現(xiàn)有的最小的原核微生物,無細(xì)胞壁,可以通過0.22 μm濾器[1],是一種宿主特異性粘膜常在菌,感染能夠引起犢牛的肺炎、關(guān)節(jié)炎及奶牛乳房炎等疾病[2],且常常與其它病原體混合感染導(dǎo)致病情復(fù)雜持久不愈,是危害我國養(yǎng)牛業(yè)健康發(fā)展的重要因素之一。支原體表面有豐富的脂質(zhì)相關(guān)膜蛋白(Lipid-associated mem?brane proteins,LAMPs),其能夠介導(dǎo)支原體黏附感染宿主,調(diào)節(jié)宿主的免疫系統(tǒng)[3],其通過與TLRs 相互作用在炎癥反應(yīng)的起始中起重要作用[4]。本研究從前期獲得的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)中[5],分析了M.bovis LAMPs 刺激前后EBL 細(xì)胞差異表達(dá)的基因,發(fā)現(xiàn)M. bovis LAMPs 刺激后EBL 細(xì)胞上調(diào)表達(dá)TRIM9 基因。TRIM9 基因?qū)儆谌Y(jié)構(gòu)域蛋白(Tripartitemotif,TRIM)家族,該家族蛋白存在于所有多細(xì)胞動物體內(nèi),目前包含70 多個(gè)成員。越來越多的證據(jù)表明,許多TRIM 家族蛋白與抗感染免疫相關(guān)[6]。最近有文獻(xiàn)報(bào)道TRIM9 與NF-κB 信號通路的調(diào)控相關(guān)[7-8]。而以前的文獻(xiàn)報(bào)道表明M.bovis LAMPs 能夠通過NF-κB信號通路誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞釋放IL-1β[9]。為探究TRIM9基因在M.bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞釋放IL-1β中的作用,本研究構(gòu)建TRIM9 基因過表達(dá)和敲低的EBL細(xì)胞模型,采用qPCR,ELISA 和western blot 等試驗(yàn)方法,解析了TRIM9 基因在M.bovis LAMPs 誘導(dǎo)EBL細(xì)胞釋放IL-1β中積極調(diào)控的作用,為宿主基因調(diào)控M.bovis LAMPs 誘導(dǎo)的天然免疫應(yīng)答機(jī)制提供理論依據(jù),同時(shí)也為后期疫苗研發(fā)奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 主要實(shí)驗(yàn)材料M.bovis 牛2c 株、EBL 細(xì)胞、M.bovis LAMPs、NP-40、pEGFP-C1 質(zhì)粒均由本實(shí)驗(yàn)室保存;pCMV-C-HA 質(zhì)粒購自碧云天公司。BCA 蛋白濃度測定試劑盒購自碧云天公司;限制性內(nèi)切酶BamH I 與Sal I 購 自NEB 公 司;Prime STAR Max Pre?mix(2×)購自TaKaRa 公司;DMEM/HIGH GLUCOSE購自HyClone;Plasmid Mini Kit I、Gel Extraction Kit購自O(shè)MEGA 公司;Simply P 總RNA 提取試劑盒購自博日公司;Transcriptor First Strand cDNA Synthesis Kit、FastStart Universal SYBR?Green Master(ROX)購自Roche 公 司;TransIT-X2?System 購 自Mirus 公 司;Bovine Interleukin 1 Beta ELISE Kit 購自MYBioSource公司。

1.2 引物設(shè)計(jì)和合成參考GenBank 中GAPDH(AC_000162),IL-1β(NM_174093)和 牛 源TRIM9(NM_001076537)基因mRNA 序列,采用Primer Pre?mier 5.0 軟件和CE DesignV1.03 軟件設(shè)計(jì)qPCR 及PCR引物,TRIM9 基因序列特異性引物兩端分別加入BamH I 和Sal I 酶切位點(diǎn),引物信息見表1,以上引物均由華大基因科技有限公司合成。委托SIGMA 公司設(shè)計(jì)合成TRIM9 基因干擾引物si-TRIM9。

1.3 TRIM9 和IL-1β基因表達(dá)的檢測將生長至對數(shù)期的EBL 細(xì)胞以1×109個(gè)/cm2的密度接種于12 孔細(xì)胞培養(yǎng)板,待細(xì)胞長至80%~90%時(shí),依據(jù)實(shí)驗(yàn)室前期摸索M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞的最佳條件[9],加入終濃度2 μg/mL 的M.bovis LAMPs,設(shè)置空白對照,5%CO237 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)12 h 后收集細(xì)胞,利用Simply P總RNA提取試劑盒提取RNA,經(jīng)Transcrip?tor First Strand cDNA Synthesis Kit 將RNA 反轉(zhuǎn)錄為cD?NA,并以cDNA 為模板采用1L-1β-F/R 和TRIM9-RTF/R引物,利用qPCR方法分別檢測M.bovis LAMPs刺激后EBL 細(xì)胞中TRIM9 和IL-1β的相對表達(dá)量,實(shí)驗(yàn)設(shè)GAPDH(AC_000162)為內(nèi)參基因,qPCR 反應(yīng)條件:95 ℃10 min;95 ℃15 s、60 ℃1 min,40個(gè)循環(huán);95 ℃15 s;60 ℃1 min;95 ℃1 s。

表1 引物序列Table 1 Primers sequence

1.4 TRIM9 亞細(xì)胞定位檢測以1.3 中方法制備EBL 細(xì)胞基因組cDNA 作為為模板,采用TRIM9-GFP-F/R 引物,利用PCR 方法擴(kuò)增TRIM9(擴(kuò)增條件為:95 ℃5 min;95 ℃30 s、61 ℃30 s、72 ℃30 s,40 個(gè)循環(huán);72 ℃10 min),并回收目的片段,連接于BamH I 與Sal I 雙酶切處理純化的pEGFP-C1 載體,構(gòu)建綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9,雙酶切和測序鑒定陽性質(zhì)粒(終濃度2 μg/mL)轉(zhuǎn)染EBL細(xì)胞,對照組轉(zhuǎn)染pEGFP-C1 質(zhì)粒,每組設(shè)置3 個(gè)樣品,重復(fù)3 次實(shí)驗(yàn),24 h 后用1 mL PBS 洗3 次,10 min/次,然后加入1 mL 的4%多聚甲醛,室溫固定15 min,PBS 洗3 次,加入0.5%Triton-X-100 室溫穿 孔15 min,PBS 洗3 次,加入DAPI 染色15 min,利用高分辨率活細(xì)胞共聚焦顯微鏡觀察TRIM9 在EBL 細(xì)胞中的定位。

1.5 過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞的最佳劑量確定按照1.4 中方法采用TRIM9-CHA-F/R引物,構(gòu)建過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9,將不同濃度的過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9(1 μg/mL、2 μg/mL、3 μg/mL、4 μg/mL、6 μg/mL 和8 μg/mL)分別轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,以pCMV-C-HA 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞作為對照,36 h 后利用ELISA 檢測試劑盒檢測培養(yǎng)基中IL-1β的釋放量。同時(shí)收集細(xì)胞,按1.3中方法提取基因組制備cDNA,并以cDNA為模板,以1L-1β-F/R 為引物,GAPDH(AC000162)為內(nèi)參基因,按照1.3 中qPCR 方法檢測EBL 細(xì)胞中IL-1β相對表達(dá)量,重復(fù)3次實(shí)驗(yàn),以引起IL-1β最高表達(dá)量且對EBL細(xì)胞影響輕微的轉(zhuǎn)染劑量作為最佳劑量。

1.6 過表達(dá)及敲低TRIM9 對M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞釋放IL-1β的影響將最佳劑量過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 和si-TRIM9 分別轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,同時(shí)分別轉(zhuǎn)染pCMV-C-HA 和對照siRNA 作為對照組,在5%CO237 ℃培養(yǎng)24 h后加入終濃度2 μg/mL的牛支原體LAMPs 繼續(xù)培養(yǎng)12 h,重復(fù)3 次實(shí)驗(yàn),利用qPCR 檢測IL-1β相對表達(dá)量,同時(shí)利用Bovine Interleukin 1 Beta ELISE Kit 檢測EBL 細(xì)胞IL-1β的釋放量。

1.7 NF-κB 信號通路激活水平檢測NF-κB 由p50 亞基和p65 亞基組成,p65 亞基進(jìn)核和磷酸化是激活NF-κB 信號通路的標(biāo)志。為分析TRIM9 在NF-κB 信號通路中的作用。本試驗(yàn)檢測了TRIM9 過表達(dá)及敲低時(shí)LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞后的p65 磷酸化水平。以1.5 中確定的pCMV-C-HA-TRIM9 最佳濃度和si-TRIM9 分別轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,5% CO237 ℃培養(yǎng)24 h 后加入終濃度2 μg/mL 的牛支原體LAMPs 繼續(xù)培養(yǎng)12 h,同時(shí)設(shè)只加入轉(zhuǎn)染試劑組和LAMPs刺激組為對照組。NP-40 裂解細(xì)胞獲取總蛋白,以抗p-p65(1:1 000)抗體為一抗,以山羊抗兔IgG(1:10 000)熒光抗體為二抗,進(jìn)行western blot 檢測,利用Odys?sey?紅外掃描儀掃描NC 膜,使用Image studio 軟件對結(jié)果進(jìn)行灰度值分析,檢測p65 磷酸化水平,本實(shí)驗(yàn)重復(fù)3 次。

2 結(jié) 果

2.1 M. bovis LAMPs 刺激對EBL 細(xì)胞中TRIM9 和IL-1β基因轉(zhuǎn)錄水平的影響M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞后,采用qPCR 方法對TRIM9 和IL-1β基因的mRNA 表達(dá)量進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示與對照組相比TRIM9 mRNA 表達(dá)量上調(diào)2.9 倍(圖1A),與本實(shí)驗(yàn)室前期獲得的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)[5]分析相符;IL-1β mRNA表達(dá)量也上調(diào)2.6 倍(圖1B)。表明TRIM9 基因可能與M.bovis LAMPs刺激EBL 細(xì)胞釋放IL-1β相關(guān)。

圖1 qPCR 檢測LAMPS 刺激后EBL 細(xì)胞TRIM9(A)和IL-1β(B)的相對表達(dá)量Fig.1 The relative expression of TRIM9 and IL-1β in EBL cells stimulated by M.bovis LAMPs was detected by qPCR

2.2 TRIM9 蛋白在EBL 細(xì)胞中的定位檢測結(jié)果以EBL 細(xì)胞基因組cDNA 為模板,PCR 擴(kuò)增TRIM9基因,構(gòu)建綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9,酶切鑒定結(jié)果顯示得到約2 100 bp 大小的目的片段,大小與預(yù)期相符(圖2);測序結(jié)果與NCBI 參考序列(NM_001076537)的同源性100%。表明正確構(gòu)建了綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9。

圖2 pEGFP-C1-TRIM9 重組質(zhì)粒雙酶切鑒定Fig.2 Double enzyme digestion of recombinant plasmid pEGFP-C1-TRIM9

將綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL細(xì)胞,利用高分辨率活細(xì)胞共聚焦顯微鏡LSM800-ZEISS 觀察可見,對照組細(xì)胞中無明顯綠色熒光,而轉(zhuǎn)染pEGFP-C1-TRIM9質(zhì)粒的EBL細(xì)胞胞漿中呈現(xiàn)綠色熒光,細(xì)胞核僅藍(lán)色熒光,重復(fù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致,表明TRIM9蛋白能夠瞬時(shí)表達(dá)于EBL細(xì)胞的胞漿中。

圖3 高分辨率活細(xì)胞共聚焦顯微鏡TRIM9 亞細(xì)胞定位Fig.3 The subcellular observation of TRIM9 by LSM800

2.3 過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞的最佳劑量將鑒定陽性的過表達(dá)質(zhì)粒pC?MV-C-HA-TRIM9(圖略)以不同濃度梯度轉(zhuǎn)染EBL細(xì)胞,利用qPCR 和ELISA 法分別檢測IL-1β的表達(dá)量,結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HATRIM9 后EBL 細(xì)胞中IL-1β表達(dá)量高于對照組,且兩者呈劑量依賴性,當(dāng)轉(zhuǎn)染的pCMV-C-HA-TRIM9質(zhì)粒終濃度為4 μg/mL 時(shí)IL-1β表達(dá)量最高,由此確定重組質(zhì)粒的最佳轉(zhuǎn)染劑量為4 μg/mL(圖4)。

圖4 qPCR(A)和ELISA(B)方法檢測過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞IL-1β的相對表達(dá)量Fig.4 The relative expression of IL-1β in EBL cells after overexpression of TRIM9 gene was detected by qPCR(A)and ELISA(B)

2.4 敲低以及過表達(dá)TRIM9 后EBL 細(xì)胞中IL-1β檢測結(jié)果為確定TRIM9 對IL-1β表達(dá)的影響,分別將si-TRIM9 和過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細(xì)胞,經(jīng)M.bovis LAMPs 刺激,利用qPCR 和ELISA 檢測敲低和過表達(dá)TRIM9 時(shí)IL-1β的表達(dá)量,結(jié)果顯示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染si-TRIM9后TRIM9顯著下調(diào)表達(dá)(p<0.001),而轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒pCMV-CHA-TRIM9 后TRIM9 顯著上調(diào)表達(dá)(p<0.001)(圖5A),表明已將TRIM9 基因在EBL 細(xì)胞中敲低及過表達(dá)。qPCR 檢測結(jié)果顯示,與對照組相比,LAMPs 刺激后正常細(xì)胞中IL-1β上調(diào)2.4 倍,敲低TRIM9 后,細(xì)胞中IL-1β上調(diào)33 倍,而過表達(dá)組中IL-1β上調(diào)2.3 倍(圖5B);ELISA 檢測結(jié)果顯示LAMPs 刺激后正常細(xì)胞中IL-1β上調(diào)2.9 倍,敲低組EBL 細(xì)胞IL-1β釋放量上調(diào)30倍,而過表達(dá)組EBL細(xì)胞IL-1β釋放量上調(diào)2.9倍(圖5C),與qPCR 結(jié)果趨勢一致。以上結(jié)果表明過表達(dá)TRIM9 基因?qū)L-1β表達(dá)無影響,而敲低TRIM9基因可促進(jìn)IL-1β表達(dá)。

圖5 敲低及過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞TRIM9(A)和IL-1β(B,C)的相對表達(dá)量Fig.5 The relative expression of TRIM9 and IL-1β in EBL cells after knockdown and over-expression of TRIM9 gene

2.5 NF-κB 信號通路檢測結(jié)果分別檢測了敲低和過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平。結(jié)果顯示,與對照組相比,敲低TRIM9 后EBL細(xì)胞中p65 磷酸化水平顯著升高(p<0.01),而過表達(dá)TRIM9 蛋白后EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平無明顯變化(圖6)。表明過表達(dá)TRIM9 后牛支原體LAMPs不誘導(dǎo)NF-κB 信號通路激活;而敲低TRIM9 后牛支原體LAMPs 能夠促進(jìn)p65 磷酸化水平提高從而激活NF-κB 信號通路。

圖6 Western blot 檢測敲低及過表達(dá)TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化(A)和灰度值分析(B)Fig.6 Detection of p65 phosphorylation(A)and gray value analysis(B)of p65 phosphorylation in EBL cells after knockdown and over expression with TRIM9 gene by western blot

3 討 論

前期研究表明M. bovis LAMPs 通過NF-κB 信號通路誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞釋放IL-1β[9-10],引發(fā)EBL 細(xì)胞的炎性反應(yīng),但EBL 細(xì)胞中參與M.bovis LAMPs 引起的炎性反應(yīng)的相關(guān)基因尚不明確。本實(shí)驗(yàn)通過對前期獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)[5]分析,篩選出可能參與調(diào)控NF-κB 信號通路的TRIM9 基因,通過參考GenBank中TRIM9 的序列設(shè)計(jì)引物,采用qPCR 方法驗(yàn)證,結(jié)果表明M.bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞增強(qiáng)IL-1β表達(dá)的同時(shí),TRIM9 基因也上調(diào)表達(dá)。相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道TRIM 家族基因參與多種細(xì)胞功能,包括調(diào)節(jié)先天免疫反應(yīng)[6],TRIM9 最初被認(rèn)為主要存在于胚胎和成人大腦內(nèi),調(diào)控神經(jīng)元的發(fā)育成熟[11-12]。本研究通過亞細(xì)胞定位證明TRIM9基因能夠在EBL細(xì)胞內(nèi)表達(dá)。為了探究TRIM9 基因是否參與及調(diào)控M. bovis LAMPs 誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞IL-1β的釋放,采用qPCR 和ELISA 方法檢測過表達(dá)和敲低TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞引起IL-1β表達(dá)情況,結(jié)果顯示當(dāng)TRIM9 基因過表達(dá)時(shí)EBL 細(xì)胞中IL-1β表達(dá)量無明顯變化,而敲低TRIM9 基因后EBL 細(xì)胞IL-1β表達(dá)量上調(diào)。表明敲低TRIM9 基因促進(jìn)M. bovis AMPs 誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞釋放IL-1β。為驗(yàn)證此過程是否通過NF-κB 信號通路,采用western blot 方法檢測了同樣實(shí)驗(yàn)條件下NF-κB 信號通路激活水平,發(fā)現(xiàn)過表達(dá)TRIM9 基因后M. bovis LAMPs 刺激EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平與對照組相比無明顯變化;而敲低TRIM9 后檢測到刺激后的EBL 細(xì)胞中p65 磷酸化水平明顯升高,表明敲低TRIM9 基因促進(jìn)M. bovis AMPs 誘導(dǎo)NF-κB 信號通路激活。由此表明,敲低TRIM9,促進(jìn)M. bovis LAMPs 誘導(dǎo)EBL 細(xì)胞中NF-κB信號通路的激活,從而促進(jìn)其IL-1β的釋放。Liu Y等發(fā)現(xiàn)牡蠣中TRIM9 同源物參與負(fù)調(diào)控NF-κB 活動[7],Shi M 等的研究也顯示TRIM9 磷酸化殘基與β-TrCP的重復(fù)區(qū)WD 40 的相互作用阻止了β-TrCP 與底物結(jié)合,穩(wěn)定IκBα和P100,從而阻斷NF-κB 的激活直接影響NF-κB 誘導(dǎo)的炎性細(xì)胞因子的產(chǎn)生[8],文獻(xiàn)資料說明TRIM9 能夠阻斷NF-κB 的激活,本實(shí)驗(yàn)中敲低TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激細(xì)胞試驗(yàn)結(jié)果,與之前的文獻(xiàn)結(jié)果相一致,但是正向的過表達(dá)TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激細(xì)胞試驗(yàn),并未驗(yàn)證該阻斷效應(yīng)。推測一方面可能與2 μg/mL M.bovis LAMPs 刺激IL-1β的釋放量不高,過表達(dá)TRIM9 基因阻斷效應(yīng)不明顯,另一方面可能可能與TRIM9 基因過表達(dá)模型構(gòu)建不適當(dāng)相關(guān)。今后研究也將繼續(xù)針對該部分實(shí)驗(yàn)進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證和探索。綜上所述,本研究對TRIM9 在調(diào)控M.bovis 誘導(dǎo)宿主細(xì)胞免疫應(yīng)答反應(yīng)中的機(jī)制初步探究,解析宿主基因調(diào)控M.bovis 引起宿主細(xì)胞免疫應(yīng)答反應(yīng)的機(jī)制,為開展進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。

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