鄭 虹,陸小翠,鄧加聰,2
(1.福建師范大學(xué)福清分校海洋與生化工程學(xué)院,福建福清 350300;2.近海流域環(huán)境測(cè)控治理福建省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建福清 350300;3.現(xiàn)代設(shè)施農(nóng)業(yè)福建省高等學(xué)校工程研究中心,福建福清 350300)
淀粉酶是一類水解淀粉和糖原的酶類總稱,可分為α-淀粉酶、β-淀粉酶、異構(gòu)淀粉酶等[1-2]。淀粉酶作為一類重要的工業(yè)酶,廣泛應(yīng)用于飼料、食品、發(fā)酵、醫(yī)療等領(lǐng)域[3-5]。在制糖、釀酒行業(yè)中,淀粉的糊化、液化、糖化等過(guò)程大多是在高溫下進(jìn)行的[6],因此淀粉加工過(guò)程中需要耐高溫的淀粉酶,否則會(huì)耗費(fèi)大量的冷凝水,提高淀粉加工的成本[7-9]。
自然界中能分泌合成α-淀粉酶的主要微生物有黑曲霉[10]、扣囊復(fù)膜孢酵母[11]、芽孢桿菌[12]、古細(xì)菌[13]等。目前關(guān)于α-淀粉酶的研究主要集中在產(chǎn)α-淀粉酶菌株的分離篩選及選育、產(chǎn)酶發(fā)酵條件的優(yōu)化及酶學(xué)特性研究等[11,13]。ROHBAN R等[14]在高鹽度的湖泊中分離出可產(chǎn)淀粉酶、蛋白酶等多種酶類的極端微生物;謝建華等[15]從酒廠附近的土壤中分離篩選到一株產(chǎn)淀粉酶的解淀粉芽孢桿菌。本實(shí)驗(yàn)從溫泉中分離篩選到一株產(chǎn)高溫淀粉酶的菌株,對(duì)該菌株進(jìn)行了初步鑒定分析,為該菌在釀酒、制曲等生產(chǎn)中的應(yīng)用奠定一定理論基礎(chǔ)。
1.1.1 材料
分離樣品:福建省旗山溫泉的底泥(40 ℃);
生工SK8255柱式細(xì)菌基因組脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)抽提試劑盒、TaqDNA聚合酶、瓊脂糖、DNA Marker、正向引物16S-F(5'-CAGAGTTTGATCCTGGCT-3')、反向引物16S-R(5'-AGGAGGTGATCCAGCCG-CA-3')等(均為分析純):生工生物工程(上海)有限公司;蛋白胨、酵母粉、麥芽糖、可溶性淀粉、乙醇等(均為分析純):國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。
1.1.2 培養(yǎng)基
分離/斜面培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,氯化鈉10 g/L,酵母粉5 g/L,可溶性淀粉2 g/L,瓊脂20.0 g/L,pH 7.2;
富集培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,氯化鈉10 g/L,酵母粉5 g/L,可溶性淀粉2 g/L,pH 7.2;
發(fā)酵培養(yǎng)基:可溶性淀粉10 g/L,NH4Cl·12H2O 8 g/L,豆粕粉30 g/L,CaCO31 g/L,pH 7.0;
LB固體培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L,酵母粉5 g/L,MaCl 5 g/L,pH 7.0。
以上培養(yǎng)基均在121 ℃滅菌20 min。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀:美國(guó)Bio-Rad公司;FA2204B型電子分析天平:上海越平科學(xué)儀器有限公司;SPX-150B-Z生化培養(yǎng)箱:上海博迅實(shí)業(yè)有限公司;722SP分光光度計(jì):上海棱光技術(shù)有限公司;TG16-WS高速臺(tái)式離心機(jī):上海湘儀有限公司;THZ-C臺(tái)式恒溫振蕩器:太倉(cāng)市華美生化儀器廠;SW-CJ-2FD超凈工作臺(tái):福州伍聯(lián)醫(yī)療器械有限公司;CDZX-50KB立式壓力蒸汽滅菌器:上海申安醫(yī)療器械廠。
1.3.1α-淀粉酶產(chǎn)生菌的富集培養(yǎng)
取1 g土樣接種于富集培養(yǎng)基,40 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)24 h。
1.3.2α-淀粉酶產(chǎn)生菌的分離與初篩
將上述富集液稀釋涂布于分離培養(yǎng)基,40 ℃倒置培養(yǎng)24 h。采用點(diǎn)接法,將單菌落用滅過(guò)菌的牙簽點(diǎn)接于分離培養(yǎng)基平板,40 ℃倒置培養(yǎng)24 h后,加入碘液,分別測(cè)量透明圈直徑與菌落直徑,并算出二者比值,將比值大的菌落接種于試管斜面。每個(gè)菌株做3個(gè)重復(fù)。
1.3.3α-淀粉酶產(chǎn)生菌的復(fù)篩
將初篩得到的菌株接種于試管斜面,40 ℃活化培養(yǎng)24 h;挑取活化后的菌株1環(huán),接種于液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,150 r/min振蕩培養(yǎng)24 h;將活化后的種子液按3%(V/V)的接種量接種于液體發(fā)酵培養(yǎng)基,40 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)48 h,發(fā)酵液8 000 r/min離心10 min,測(cè)定發(fā)酵上清液中α-淀粉酶的活性。每株重復(fù)3個(gè)平行。
1.3.4α-淀粉酶產(chǎn)生菌的形態(tài)特征及生理生化實(shí)驗(yàn)
將試管保存的菌株劃線接種于LB固體培養(yǎng)基,40 ℃倒置培養(yǎng)24 h。
參考文獻(xiàn)[16-17]對(duì)α-淀粉酶的產(chǎn)生菌進(jìn)行形態(tài)觀察及生理生化研究。
1.3.5 菌株16S rDNA基因序列的測(cè)定與分析
菌株基因組DNA按照試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行提取。采用細(xì)菌通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增條件為:純化的PCR產(chǎn)物(10 ng/μL)1 μL、2.5 mmol/L三磷酸脫氧核糖核苷酸(deoxyribonucleotide triphosphate,dNTP)8 μL、Taq酶0.2 μL,引物(3.2 pmol/μL)1 μL,加滅菌的去離子水10 μL。PCR擴(kuò)增條件為96 ℃預(yù)變性1 min;96 ℃變性10 s,50 ℃退火5 s,60 ℃延伸4 min,循環(huán)25次;60 ℃再延伸10 min,4 ℃保溫。
16S rDNA基因序列測(cè)序委托上海生工生物工程股份有限公司完成。測(cè)序序列與美國(guó)國(guó)家生物信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)網(wǎng)站的已知序列進(jìn)行blast。采用MAGE4.0軟件中的鄰接法(neighbor joining,NJ)算法(BootStrap的設(shè)定值為1 000)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)[18-19],進(jìn)行菌株系統(tǒng)發(fā)育分析。
1.3.6 溫度對(duì)菌株生長(zhǎng)的影響
將菌株接種于試管斜面活化24 h;挑取活化后的菌株1環(huán),接種于液體發(fā)酵培養(yǎng)基中,40 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng)24 h;將活化后的種子液按3%(V/V)接種量接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,在不同溫度(30 ℃、35 ℃、40 ℃、45 ℃、50 ℃、55 ℃)條件下,150 r/min振蕩培養(yǎng)24 h,測(cè)定發(fā)酵液OD600nm值。
1.3.7 酶活力測(cè)定方法
發(fā)酵液8 000 r/min、4 ℃離心10 min,其上清液即為粗酶液。淀粉酶活力的測(cè)定采用3,5二硝基水楊酸(3,5-dinitrosalicylic acid)法[20-22]。
α-淀粉酶酶活單位定義:pH 5.5,溫度為60 ℃的條件下,1 mL酶液1 min水解淀粉產(chǎn)生1 μg葡萄糖的酶用量為1個(gè)酶活單位(U/mL)。
式中:C為從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查的的葡萄糖含量,mg;VT為淀粉酶原液總體積,mL;VS為反應(yīng)所用的α-淀粉酶原液體積,mL;W為樣品的質(zhì)量,g;t為反應(yīng)時(shí)間,min。其中VT=25 mL,VS=1 mL,T=5 min,W=0.001 g。
2.1.1 高產(chǎn)耐高溫α-淀粉酶菌株的分離
通過(guò)富集培養(yǎng)、稀釋涂布及平板分離等方法,從土壤中分離篩選到10株透明圈直徑(D)與菌落直徑(d)比值比較大的菌株。結(jié)果見(jiàn)表1。
表1 α-淀粉酶產(chǎn)生菌的初篩結(jié)果Table 1 Preliminary screening results of α-amylase-producing strain
由表1可知,不同菌株產(chǎn)α-淀粉酶活性有一定的差異,根據(jù)菌株的D/d值,可以看出所篩選得到的菌株產(chǎn)α-淀粉酶活性的強(qiáng)弱如下:FA4>FA8>FA3>FA5>FA10>FA1>FA2>FA9>FA7>FA6。
2.1.2 高產(chǎn)耐高溫α-淀粉酶產(chǎn)生菌的復(fù)篩
將初篩得到的10株D/d值較大的菌株進(jìn)行搖瓶復(fù)篩,發(fā)酵培養(yǎng)24 h,測(cè)定該菌株產(chǎn)α-淀粉酶的酶活力,結(jié)果見(jiàn)圖1。
圖1 淀粉酶產(chǎn)生菌的復(fù)篩結(jié)果Fig.1 Secondary screening results of amylase-producing strain
由圖1可知,菌株產(chǎn)淀粉酶活性強(qiáng)弱如下:FA4>FA8>FA1>FA7>FA10>FA6>FA5>FA9>FA2>FA3,與菌株D/d值有一定的差異,其中菌株FA4的淀粉酶活性最強(qiáng),其酶活可達(dá)71.56 U/mL。所以選擇菌株FA4進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
2.2.1 菌株FA4的形態(tài)特征及生理生化實(shí)驗(yàn)
圖2 菌株FA4的形態(tài)觀察結(jié)果Fig.2 Morphological observation results of strain FA4
由圖2可知,菌株FA4在LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)24 h后,菌落呈乳白色,表面較濕潤(rùn),不透明,隆起,邊緣光滑。顯微鏡下觀察該菌體呈桿狀,革蘭染色為陽(yáng)性。參照《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》對(duì)菌株進(jìn)行生理生化實(shí)驗(yàn),結(jié)果見(jiàn)表2。
表2 菌株FA4與芽孢桿菌的生理特征比較Table 1 Physiological and morphological characteristics of strain FA4 and Bacillus sp.
由表2可知,菌株FA4能利用檸檬酸鹽、亞硝酸鹽、硝酸鹽及丙二酸,能分解過(guò)氧化氫,能水解淀粉和酪氨酸,甲基紅試驗(yàn)呈陽(yáng)性,V-P試驗(yàn)呈陽(yáng)性,吲哚試驗(yàn)和苯丙氨酸脫氨酶試驗(yàn)陰性。
2.2.2 菌株FA4的16S rDNA序列分析鑒定
將提取到的菌株基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增產(chǎn)物大小約為1 375 bp的16S rDNA基因。將所得到的16S rDNA基因序列進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序后,與NBCI網(wǎng)站上的數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行序列同源性比對(duì),結(jié)果顯示該菌株序列與Bacillus thuringiensis的多菌株具有99%以上的同源性。抽取若干條同源性較高的序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建,結(jié)果見(jiàn)圖3。
圖3 菌株FA4的序列分析Fig.3 Sequence analysis of the strain FA4
由圖3可知,菌株FA4的基因序列與登錄號(hào)NR043403.1、MN643161.1的16S rDNA序列的同源性達(dá)到99%,表明菌株FA4與Bacillus thuringiensis親緣性最近。再結(jié)合菌株的形態(tài)及生理生化特征,將該菌命名為蘇云金芽孢桿菌FA4(Bacillus thuringiensis)。
不同的培養(yǎng)溫度對(duì)菌株FA4生長(zhǎng)的影響結(jié)果見(jiàn)圖4。由圖4可知,菌株的OD600nm值隨著培養(yǎng)溫度的升高,逐漸升高,當(dāng)培養(yǎng)溫度達(dá)到40 ℃時(shí),OD600nm值達(dá)到最大值,表明40 ℃是該菌株的最適生長(zhǎng)溫度;之后,隨著培養(yǎng)溫度的升高,生物量反而逐漸減少,當(dāng)培養(yǎng)溫度為55 ℃時(shí),菌體仍有一定的生長(zhǎng),表明該菌株具有較強(qiáng)的耐熱性。
圖4 培養(yǎng)溫度對(duì)菌株FA4生長(zhǎng)的影響Fig.4 Effect of temperature on the growth of strain FA4
本研究從溫泉底泥中分離篩選到一株耐高溫的淀粉酶菌株,從菌株形態(tài)、生理生化特性及16S rRNA遺傳分析,初步鑒定為芽孢桿菌屬,將其命名為蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis),該菌株具有具有較強(qiáng)的穩(wěn)定性,在55 ℃條件下仍能生長(zhǎng)。