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延邊半細(xì)毛羊羊毛細(xì)度測(cè)定及其CD200 基因克隆與表達(dá)分析

2020-08-16 23:52劉曉軍關(guān)喜東張立春孫福亮
中國(guó)畜牧雜志 2020年8期
關(guān)鍵詞:細(xì)度延邊毛囊

劉曉軍,關(guān)喜東,于 寧,姜 楠,張立春,孫福亮*

(1.延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院,吉林延吉 133000;2.圖們市農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè)局,吉林圖們 133100;3.吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧分院,吉林公主嶺 136100)

延邊半細(xì)毛羊是延邊地區(qū)特有的品種,是以當(dāng)?shù)仉s種羊?yàn)槟副?,以考力代羊?yàn)楦副?,通過(guò)逐級(jí)雜交選育出的品系[1]。近年來(lái)養(yǎng)殖戶(hù)又引進(jìn)德國(guó)美利奴種羊,與延邊半細(xì)毛羊母羊進(jìn)行雜交,以進(jìn)一步提升延邊半細(xì)毛羊的羊毛品質(zhì)及肉品質(zhì),但未有研究對(duì)新雜交后的延邊半細(xì)毛羊羊毛細(xì)度進(jìn)行過(guò)測(cè)定。因此,本實(shí)驗(yàn)對(duì)新改良后的延邊半細(xì)毛羊的羊毛細(xì)度進(jìn)行檢測(cè),為延邊半細(xì)毛羊的育種提供數(shù)據(jù)參考。

近年來(lái),隨著毛紡產(chǎn)品向輕薄、柔軟、挺括、高檔方向發(fā)展,國(guó)內(nèi)外學(xué)者加強(qiáng)了對(duì)羊毛細(xì)度相關(guān)基因的研究[2-3],如王小佳等[4]研究表明BMPR1B基因的mRNA表達(dá)量與羊毛細(xì)度呈顯著正相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.382;張文建等[5]鑒定出中國(guó)美利奴羊CCNY基因的3個(gè)SNP位點(diǎn)與羊毛細(xì)度顯著相關(guān);Zhang等[6]通過(guò)RNA-seq分析得到CD200在毛纖維直徑差異顯著的小尾寒羊和新吉細(xì)毛羊皮膚中表達(dá)量差異顯著。

CD200基因又稱(chēng)MRC OX2,由McMaster等[7]于1979年發(fā)現(xiàn),是一種細(xì)胞表面的跨膜糖蛋白,與其受體CD200R均屬于免疫球蛋白超家族。CD200在胸腺、神經(jīng)系統(tǒng)、血管內(nèi)皮、滋養(yǎng)層、子宮、免疫系統(tǒng)等組織中廣泛表達(dá)。有研究報(bào)道CD200-CD200R相互作用能減弱炎癥反應(yīng),提高免疫耐受性,降低器官移植的排斥反應(yīng)等[8-11]。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)CD200也與動(dòng)物毛發(fā)的發(fā)育密切相關(guān),如Rosenblum等[12]研究發(fā)現(xiàn)CD200基因在小鼠毛囊外根鞘的角質(zhì)形成細(xì)胞上表達(dá);CD200在人的毛囊中亦有表達(dá),并且與毛囊干細(xì)胞標(biāo)記物有關(guān),進(jìn)而成為鑒定、分選毛囊干細(xì)胞的重要標(biāo)識(shí)[13];CD200也作為羊毛囊干細(xì)胞的標(biāo)記基因而用于篩選毛囊干細(xì)胞[14],但國(guó)內(nèi)外尚未報(bào)道CD200在綿羊羊毛品質(zhì)方面的研究。因此本實(shí)驗(yàn)對(duì)延邊半細(xì)毛羊皮膚毛囊中CD200基因進(jìn)行克隆與定位來(lái)探討其與羊毛細(xì)度的相關(guān)性,為延邊半細(xì)毛羊群體的育種奠定理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與樣品采集 本實(shí)驗(yàn)從龍井市某養(yǎng)殖場(chǎng)選擇在相同條件下飼養(yǎng)的體重相近的10月齡雌性延邊半細(xì)毛羊20只,對(duì)其肩胛部進(jìn)行剪毛,并收集毛樣;將剪過(guò)毛的皮膚用75%的酒精消毒后,剪取1 cm× 1 cm皮膚組織放入4%多聚甲醛溶液中固定,再剪取100 mg左右組織皮膚放入液氮中冷凍保存。

1.2 主要試劑 Trizol試劑盒購(gòu)自Invitrogen公司;DNA Marker、DNA膠回收試劑盒、pMD19-T載體、RNasefreeDNase Ⅰ及大腸桿菌 DH5α均購(gòu)自于寶生物工程(大連)有限公司;DNA質(zhì)粒提取試劑盒與反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)于廣州飛翔生物工程有限公司,免疫組化試劑盒購(gòu)自上海生工生物股份有限公司。

1.3 羊毛細(xì)度測(cè)定 羊毛經(jīng)過(guò)乙醚洗滌處理后,切取距離毛根2/3處的斷面在羊毛測(cè)定儀檢測(cè)羊毛直徑。將測(cè)得的數(shù)據(jù)用SPSS軟件求平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差,再根據(jù)《綿羊毛》(GB 1523—2013)國(guó)標(biāo)細(xì)度來(lái)判定改良后的延邊半細(xì)毛羊的羊毛細(xì)度。

1.4 免疫組化實(shí)驗(yàn) 取固定好的皮膚組織進(jìn)行脫水、包埋、切片后,將 4 μm厚的切片在烤片機(jī)上65℃烘烤1 h,后續(xù)步驟參照免疫組化試劑盒進(jìn)行操作。

1.5 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)GenBank上的序列(登錄號(hào):XM_012190412)與Oligo7.0軟件設(shè)計(jì)引物,引物序列為F:5'-CGCGGATTCATGTTATGCAGGGCACAAGTG-3',R:5'-CCCAAGCTTCTAGGGCTCTCGATCTTGGT T-3',引物由上海捷瑞生物有限公司合成。

1.6 RNA提取及cDNA合成 用Trizol法提取皮膚總RNA:稱(chēng)重100 mg皮膚組織樣品,放入預(yù)冷的研缽中研磨,研磨成粉末后轉(zhuǎn)入1.5 mL離心管中,后續(xù)步驟按Trizol說(shuō)明書(shū)進(jìn)行,提取出的RNA用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行鑒定。以皮膚中總RNA為模板,通過(guò)RT-PCR反應(yīng)合成cDNA第一鏈,反應(yīng)步驟參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說(shuō)明書(shū)操作。

1.7 PCR擴(kuò)增 以CD200基因的cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,其反應(yīng)體系為20.0 μL:10×Buffer 2.5 μL,dNTP 0.5 μL,0.3 μmol/L的上下游引物各0.5 μL,cDNA 1.0 μL,Taq酶0.3 μL,ddH2O 11.7 μL,MgCl23 μL。反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5 min,94℃變性45 s,69℃退火1 min,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán),72℃再延伸15 min,4℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.0% 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

1.8CD200克隆 用膠回收試劑盒回收目的片段,取純化的PCR回收產(chǎn)物與MD19-T載體混勻后在4℃條件下過(guò)夜,再將質(zhì)粒pMD19-T-CD200轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂于氨芐抗性的固體LB平板,37℃條件下培養(yǎng)12~16 h。經(jīng)藍(lán)白斑篩選后,接種到氨芐抗性的LB液體培養(yǎng)基37℃繼續(xù)培養(yǎng)12 h,用DNA質(zhì)粒提取試劑盒提取菌液中的質(zhì)粒,對(duì)重組質(zhì)粒用PCR鑒定,陽(yáng)性結(jié)果送至上海生工生物股份有限公司測(cè)序。

1.9 生物信息學(xué)分析 用 EditSeq(DNAStar)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,通過(guò)MegAlign(DNAStar)軟件對(duì)延邊半細(xì)毛羊和綿羊(登錄號(hào):XM_004002915)、山羊(登錄號(hào):XM_018065460)、牛(登錄號(hào):XM_024990382)、野豬(登錄號(hào):XM_021070383)、貓(登錄號(hào):XM_023260131)、人(登錄號(hào):NM_005944)、小鼠(登錄號(hào):XM_017316889)進(jìn)行CD200基因序列的同源性分析,并構(gòu)建基因進(jìn)化樹(shù);采用ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)工具對(duì)綿羊CD200基因編碼蛋白基本理化性質(zhì)進(jìn)行分析,用在線GOR4工具與Protean(DNAStar)對(duì)CD200蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)及分析,進(jìn)一步利用SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasyorg/)預(yù)測(cè)三級(jí)結(jié)構(gòu)。

2 結(jié)果

2.1 羊毛細(xì)度分析 羊毛纖維直徑為(19.26±2.69)μm(為66支左右),已達(dá)到細(xì)毛羊的細(xì)度,說(shuō)明用德國(guó)美利奴羊改良后延邊半細(xì)毛羊羊毛品質(zhì)顯著提高。

2.2 免疫組化實(shí)驗(yàn) 經(jīng)免疫組化染色后發(fā)現(xiàn)(圖1),CD200基因在毛囊的外根鞘、毛囊干細(xì)胞及表皮層位置表達(dá)。因此,通過(guò)檢測(cè)CD200在皮膚毛囊中的表達(dá)部位,對(duì)其在皮膚毛囊中的作用研究奠定理論基礎(chǔ)。

2.3 綿羊CD200基因PCR擴(kuò)增與鑒定 提取組織中的總RNA,以皮膚中的cDNA為模板,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)結(jié)果顯示,成功擴(kuò)增出了延邊半細(xì)毛羊CD200基因,大小約為729 bp,與目的條帶一致(圖2)。對(duì)重組質(zhì)粒pMD19T-CD200進(jìn)行PCR鑒定,發(fā)現(xiàn)在約729 bp處出現(xiàn)1條特異性條帶,與CD200基因大小相符(圖3),表明獲得了重組表達(dá)質(zhì)粒pMD19T-CD200。

2.4 序列分析及同源性比對(duì) 測(cè)序結(jié)果全長(zhǎng)為729 bp,將測(cè)序結(jié)果用Seqmen軟件進(jìn)行拼接,經(jīng)GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)(登錄號(hào)XM_012190412)Blast N比對(duì)鑒定,克隆的CD200基因片段大小與原始基因一致,顯示該片段CDS區(qū)長(zhǎng)為729 bp,比對(duì)后發(fā)現(xiàn)存在2個(gè)SNP位點(diǎn),同源性為99.7%。對(duì)各物種的同源性分析結(jié)果顯示延邊細(xì)半毛羊的CD200基因與綿羊、山羊、牛、貓、人、野豬、小鼠的同源性分別為99.7%、99.5%、97.6%、88.4%、85.0%、81.9%、79.3%,說(shuō)明各物種間同源性相對(duì)較高,但隨著物種進(jìn)化距離的增加,CD200基因也相應(yīng)表現(xiàn)出同源性降低的現(xiàn)象。

2.5 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建 如圖4所示,延邊半細(xì)毛羊CD200基因與綿羊的親緣關(guān)系最近,與鼠的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),在同一物種間及不同物種間比較分析得出該基因在生物進(jìn)化中比較保守。

2.6 理化性質(zhì)分析 將測(cè)序結(jié)果用Edit Seq分析得出該基因長(zhǎng)度為729 bp,編碼242個(gè)氨基酸,1個(gè)終止密碼子不編碼氨基酸,氨基酸序列見(jiàn)圖5,用Megalign(DNAStar)對(duì)克隆到的延邊半細(xì)毛羊基因和XM_012190412所編碼的氨基酸殘基進(jìn)行比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)第193個(gè)氨基酸殘基不同,由G變?yōu)镽,說(shuō)明該位點(diǎn)基因突變屬于錯(cuò)義突變,第117個(gè)氨基酸殘基沒(méi)有改變,說(shuō)明編碼此處的基因突變屬于沉默突變。延邊半細(xì)毛羊CD200蛋白理化性質(zhì)分析結(jié)果顯示,該蛋白的相對(duì)分子量為26.97 ku,分子式為C1212H1941N323O349S11,理論等電點(diǎn)為8.82,親水性為0.086,不穩(wěn)定系數(shù)為36.73,表明該蛋白為穩(wěn)定的堿性疏水性蛋白。

2.7 蛋白親水性分析 當(dāng)親水性的值大于零時(shí),蛋白為疏水性蛋白,反之則為親水性蛋白。經(jīng)預(yù)測(cè)CD200蛋白存在較多疏水性區(qū)域,與采用ProtParam工具分析所得的結(jié)果一致,為疏水性蛋白。說(shuō)明水相中CD200蛋白內(nèi)部帶有非極性側(cè)鏈的氨基酸形成的疏水區(qū)域較大,從而引起熵的降低及蛋白折疊程度的增大。

2.8 二級(jí)結(jié)構(gòu)及三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 預(yù)測(cè)到CD200蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)包括α螺旋、延伸鏈、無(wú)規(guī)則卷曲構(gòu)成(圖6),其中無(wú)規(guī)則卷曲135個(gè),占二級(jí)結(jié)構(gòu)的55.79%,結(jié)合蛋白的骨架柔性分析,說(shuō)明CD200蛋白易發(fā)生扭曲及折疊。

CD200蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)果表明,CD200蛋白的空間結(jié)構(gòu)復(fù)雜,是由多個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)緊密纏繞形成的球狀結(jié)構(gòu)(圖7)。

3 討論

近年來(lái)世界羊毛品質(zhì)出現(xiàn)了劃時(shí)代的變革,主要表現(xiàn)在羊毛細(xì)度方面。如澳大利亞是世界羊毛產(chǎn)量最多的國(guó)家,最近幾年其羊毛總產(chǎn)量雖有減少,但平均直徑小于19 μm的細(xì)羊毛產(chǎn)量大幅增加,我國(guó)也正用基因調(diào)控、引進(jìn)超細(xì)型種羊進(jìn)行雜交等方式提升羊毛細(xì)度,說(shuō)明細(xì)毛羊養(yǎng)殖正在變革羊毛品質(zhì)的發(fā)展[15-16]?!毒d羊毛》(GB 1523—2013)國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)中將羊毛細(xì)度在66支(直徑小于25.0 μm)以上的羊品種定位為細(xì)毛羊類(lèi),經(jīng)檢測(cè)延邊半細(xì)毛羊的羊毛平均直徑為(19.26±2.69)μm,對(duì)比澳洲羊毛和國(guó)標(biāo)說(shuō)明延邊半細(xì)毛羊品系具有良好的羊毛細(xì)度,且在纖維細(xì)度方面有穩(wěn)定的遺傳。

羊毛的細(xì)度、長(zhǎng)度、彎曲度等性狀早在毛囊時(shí)期就已經(jīng)決定,因此要調(diào)控羊毛的性狀應(yīng)對(duì)毛囊的形成及機(jī)理進(jìn)行調(diào)控分析,但羊毛的組成成分復(fù)雜,羊毛形成不僅受角蛋白中間絲(Keratin Intermediate Filament,KRTIF)和角蛋白輔助蛋白(Keratin-associated proteins,KAPs)這兩個(gè)家族中的多個(gè)基因聯(lián)合表達(dá)的影響,也受Sox9、Lhx2、Tcf3/4、Nfatc1、Gab1、CD200等多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的周期性調(diào)控[17]。乃門(mén)塔娜[18]研究證明干擾Sox9表達(dá)后的毛囊干細(xì)胞無(wú)法完成從S期到G2/M期的過(guò)渡;?zlem等[19]研究發(fā)現(xiàn)Gab1和Mapk信號(hào)在頭發(fā)周期和毛囊干細(xì)胞靜止過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用;Zhang等[6]通過(guò)RNAseq分析出CD200為小尾寒羊和新吉細(xì)毛羊的差異基因,其在毛纖維較粗的小尾寒羊皮膚中表達(dá)極低,在新吉細(xì)毛羊皮膚中表達(dá)高;本研究中延邊半細(xì)毛羊的羊毛細(xì)度較細(xì),接近新吉細(xì)毛羊的細(xì)度,而且也成功地從其皮膚中克隆出了CD200基因,且定位在皮膚毛囊部位表達(dá),與李東江等[20]報(bào)道的毛細(xì)度較粗的云南半細(xì)毛羊皮膚中未檢測(cè)到CD200基因的結(jié)論一致,進(jìn)而說(shuō)明CD200基因在細(xì)毛羊中表達(dá)較高,而在半細(xì)毛羊或粗毛羊中表達(dá)低或不表達(dá)。因此,推測(cè)CD200基因是引起羊毛細(xì)度的差異基因,可能對(duì)羊毛細(xì)度起調(diào)控作用。

本實(shí)驗(yàn)采用酶標(biāo)抗體法檢測(cè)到CD200在毛囊的外根鞘、毛囊干細(xì)胞及表皮層表達(dá),與Rosenblum[11]檢測(cè)的CD200基因在小鼠皮膚的表皮層、外根鞘及毛囊干細(xì)胞中表達(dá)一致。Sanja等[21]研究發(fā)現(xiàn)CD200能維持和更新角膜緣表皮細(xì)胞,因此可推測(cè)綿羊表皮高表達(dá)的CD200基因也可能參與到皮膚表皮細(xì)胞的維持和更新,CD200在毛囊干細(xì)胞與外根鞘表達(dá)推測(cè)該基因可能參與毛囊周期性的發(fā)育及毛發(fā)性狀的調(diào)控,但有待進(jìn)一步證實(shí)。本實(shí)驗(yàn)中,對(duì)延邊半細(xì)毛羊CD200基因與其他物種比對(duì),發(fā)現(xiàn)該基因在物種進(jìn)化過(guò)程中比較保守,且能穩(wěn)定遺傳;通過(guò)對(duì)CD200蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)及三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè),為深入研究綿羊的CD200蛋白提供基本的數(shù)據(jù)資料,也為CD200調(diào)控羊毛細(xì)度表達(dá)作用機(jī)理的研究奠定理論基礎(chǔ)。

4 結(jié)論

本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,延邊半細(xì)羊毛的羊毛細(xì)度符合國(guó)家細(xì)毛羊標(biāo)準(zhǔn)。通過(guò)免疫組化得知CD200基因在延邊半細(xì)毛羊皮膚的表皮層、外根鞘及毛囊干細(xì)胞表達(dá);通過(guò)克隆分析表明CD200可能參與調(diào)控羊毛細(xì)度的表達(dá)。

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