任曉曄
(蘇州市動物衛(wèi)生監(jiān)督所,江蘇蘇州 215000)
1 切膠回收PCR產(chǎn)物
1.1 試劑組成
凝膠溶化劑、結(jié)合液、洗滌液、去鹽液、洗脫液
1.2 注意事項
盡量切去含有DNA片段的凝膠,切膠動作要迅速;凝膠塊必須完全溶化;
在洗脫時,洗脫液加熱至65℃,提高洗脫率。
1.3 操作步驟
(1)取大約150ul的PCR產(chǎn)物。
(2)在紫外燈下切下含有DNA片段的凝膠并切碎,裝入1.5ml的離心管中。
(3)加入3個體積的溶化劑,混合均勻水浴鍋加熱至凝膠完全融化。
(4)加入0.5個熔化劑體積的結(jié)合液,混合均勻。藍耳病片段大小為372bp因此要加入要加入1個凝膠體積的異丙醇。
(5)放入制備管12000r/m,離心1min,棄濾液。
(6)加入500μl 洗滌液,12000r/m,離心30s,棄濾液
(7)加入700μl 去鹽液,12000r/m,離心30s,棄濾液。
(8)將制備管放入新的1.5ml離心管中,加入25μl的洗脫液,室溫靜至1min,12000r/m,離心1min洗脫DNA。
2 插入表達載體pEASY-E1
吸取膠回收到的PCR產(chǎn)物4μl,加入pEASY-E1 1ul,輕輕混勻,為增加陽性克隆的機率室溫30℃反應10min,反應結(jié)束后置于冰上。
3 轉(zhuǎn)化
3.1 實驗準備
(1)LB:酵母膏5g、蛋白胨10g、氯化鈉10g定容至1L 。
(2)LB培養(yǎng)基:酵母膏5g、蛋白胨10g、氯化鈉10g、瓊脂15g定容至 1L 。
(3)濃度100mgml的 氨芐青霉素。
(4)耗材:冰盒、培養(yǎng)皿、接種棒、酒精燈等。
(5)儀器:干式恒溫器、微型振蕩培養(yǎng)箱、水浴鍋。
(6)試劑:Transl-T1感受態(tài)細胞。
3.2 注意事項
(1)LB及LB培養(yǎng)基、超純水、槍頭、脂形管和培養(yǎng)皿高壓滅菌30min。
(2)實驗前雙手消毒,操行臺滅菌。
(3)實驗中使用的耗材要在酒精燈火焰上滅菌。
(4)細菌涂板要均勻,并倒放。
3.3 操作步驟
(1)在培養(yǎng)基凝固前倒入培養(yǎng)皿中。4℃保存?zhèn)溆?,倒放?/p>
(2)加上一步驟中的產(chǎn)物50μl在感受態(tài)細胞中,輕彈混勻,冰浴 20~30min。
(3)42℃準確熱激30s,立即置于冰上。
(4)加入250μl平衡至室溫的LB,置于搖床上200轉(zhuǎn),37℃孵育1h。
(5)在鋪好的培養(yǎng)皿上先涂25μl AMP。
(6)取菌液涂板,鋪2塊,25μl一塊,37℃過夜培養(yǎng)。
(7)用接種棒挑取單個菌落進行擴大培養(yǎng),兩塊板共取16個單個菌落,放入1ml LB中,37℃、200轉(zhuǎn)培養(yǎng)1h。
(8)鑒定菌落是否是陽性,吸取再培養(yǎng)的菌液2μl跑PCR,16個菌落中2、8、9、13號出現(xiàn)條帶,并吸取每個250μl菌液送去測序。PCR法可行,但不一定成功,因為Tm的退火溫度不一定,最終要以測序結(jié)果為準。
(9)取上述陽性菌種再培養(yǎng),涂板,37℃過夜培養(yǎng)。
(10)挑取再培養(yǎng)的菌落,放入10ml的LB中,37℃200轉(zhuǎn)4h培養(yǎng),提質(zhì)粒時使用。
4 提取質(zhì)粒插入表達載體
4.1 試劑組成
溶液P1、P2、P3、平衡液、去蛋白液、漂洗液、洗脫液。
4.2 操作步驟
(1)在吸附柱中加入500μl的平衡液,12000轉(zhuǎn)離心1min。
(2)取5ml菌液,12000轉(zhuǎn)離心1min,棄上清。
(3)加250μl的P1,混勻。
(4)加 250μl的P2,溫和地上下翻轉(zhuǎn)6~8次。
(5)加350μl的P3,溫和地上下翻轉(zhuǎn)6~8次,充分混勻,出現(xiàn)白色絮狀物,再12000轉(zhuǎn)離心10min,取上清。
(6)將上清放入吸附柱中,12000轉(zhuǎn)離心30s,棄廢液。
(7)加500μl去蛋白液,12000轉(zhuǎn)離心30s,棄廢液。
(8)加600μl漂洗液,12000轉(zhuǎn)離心30s,棄廢液,重復一次。
(9)吸附柱直接12000轉(zhuǎn)離心2min,開蓋靜至5min。
(10)將吸附柱放入新的離心管中,加50μl洗脫液,室溫靜置2min,12000轉(zhuǎn)離心2min。
5 插入BL21感受態(tài)細胞步驟同上。
6 IPTG的誘導表達——通過不同的誘導時間決定最佳的表達條件
6.1 實驗步驟
(1)取一支凍存的陽性菌種加入1ml LB復蘇。
(2)取4支15ml脂形管(編號為1、2、3、4號)分別放入10ml LB(每支加10μl Amp),每支加入復蘇菌液50ml,37℃200轉(zhuǎn)培養(yǎng)直到OD600時的讀數(shù)為0.6~1.0時,從1號中吸取2ml做對照。
(3)將 2、3、4號加入IPTG(濃度為50mg/ml,每8ml中加16μl IPTG),37℃培養(yǎng)。2h后取出2號菌液1ml備用。
(4)1h后取出3號菌液1ml備用,1h再后取出4號菌液。
(5)將上述吸出的菌液12000轉(zhuǎn)離心2min,吸出上清,沉淀用20mM PB溶解,上清和沉淀 -20℃保存。
(6)反復凍融上清和細菌沉淀3次以上。
7 SDS-page電泳
7.1 電泳液
成品SDS-page電泳液直接加入1L超純水。
7.2 制膠
12%的分離膠+5%的濃縮膠(表1)。
7.3 實驗步驟
(1)先配置分離膠,按順序加入溶液,每加完一個搖晃一下。
(2)TEMED在通風櫥中加,加入后混勻30s后再注膠,不要有氣泡,分離膠注好后用水封頂,聚合40min。
(3)加入濃縮膠后插梳子,斜著插入,避免氣泡,聚合40min。
(4)分離膠和濃縮膠界面做好標記,分離膠加8.5ml,濃縮膠加1.5ml。
表1
7.4 上樣
(1)把之前反復凍融的菌液和上清取出,解凍后各取10μl,加入2μl的上樣緩沖液。
(2)將樣品和蛋白Marker100℃水浴5min,冷卻到室溫后上樣緩慢加入。
7.5 跑電泳
(1)電泳槽里面加電泳液加到上樣孔,外面加1/3的電泳液。
(2)電壓80V,等藍色條帶進入分離膠后調(diào)到120V。
(3)待條帶距離分離膠底部1cm處停止電泳。
7.6 切膠
將濃縮膠全部切除,為了分辨正反在將分離膠的右下角切去。
7.7 染色和脫色
(1)將膠體放入染色液中,染色液要充分覆蓋膠體,置于搖床上緩慢搖晃1h。
(2)倒出染色液,倒入脫色液,置于搖床上緩慢搖晃,室溫脫色4~24h,期間更換脫色液2~4次,直到看清條帶。(圖1)
8 討論
(1)1號樣品到4號樣品為上清,5號樣品到8號樣品為細菌 沉淀,5號樣品未加IPTG,6號樣品為加IPTG后2h,7號樣品為加入后3h,8號樣品為加入后4h
(2)根據(jù)條帶可看出,1號樣品至4號樣品上清是沒有條帶的,5號樣品只至8號樣品細菌沉淀出現(xiàn)條帶,7號和8號樣品的目的條帶較明顯,因此暫定加入IPTG后3h為最佳誘導時間,并進行第二次實驗。(圖2)
9 實驗結(jié)果
五個樣本均出現(xiàn)了較為清晰目的條帶,實驗成功,可進行下一步工作,優(yōu)化蛋白表達,純化目的蛋白。
圖1
圖2