王麗麗,戰(zhàn)帥帥,謝 磊,王繼慶,哈尼開·馬坎,任 毅,時 佳,耿洪偉
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)生物技術(shù)重點實驗室,烏魯木齊 830052)
【研究意義】小麥是最重要的糧食作物之一[1-3]。品質(zhì)已成為我國小麥主要育種目標,同時影響我國小麥產(chǎn)業(yè)競爭力[4]。面粉和面制品的顏色對小麥磨粉品質(zhì)有重要影響[5]。面粉中蛋白質(zhì)含量、氧化酶類活性以及色素類物質(zhì)的積累對面粉及其制品的顏色有顯著影響[6-8]。過氧化物酶(POD, Peroxidase)是由多基因家族基因編碼的蛋白[2],廣泛存在于所有生物體中,能氧化各種氫供體,如酚類物質(zhì)、胺、抗壞血酸、吲哚和某些無機離子[9]。小麥籽粒中的POD活性對面粉色澤具有褐變和漂白的雙重作用,是影響面包、饅頭、面條白度的重要因素,POD活性高的小麥品種(系)面粉白度更高[10]。小麥籽粒過氧化物酶(POD,Peroxidase)活性對小麥加工品質(zhì)和面粉色澤具有重要影響。研究小麥籽粒POD,對小麥面粉顏色及加工品質(zhì)的改良具有重要意義?!厩叭搜芯窟M展】POD活性受遺傳因子、生態(tài)環(huán)境和栽培措施等影響,但主要受遺傳控制[11,12]。在禾本科作物中,普通小麥POD活性是燕麥、水稻和玉米的3~7倍[13],且顯著高于(P<0.05)硬粒小麥[14-15]。在普通小麥的不同品種(系)間POD活性也可相差3~10倍[16-17]。通過遺傳途徑培育高POD活性品種(系)是可行的[18]。Rebordinos等[19]利用同源線性定位研究表明,普通小麥POD活性基因位于第3和第7同源染色體組上,尤其是第3同源染色體。Brenchley等[20]研究表明,POD基因類型多,分布廣,在A,B,D組中都有分布,Sareini等(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AF525425)克隆了普通小麥籽粒中的Class Ⅲ型POD活性基因(WP1)的全長序列(AF525425)。魏景欣[3]選用豆麥/石 4185 RIL 群體結(jié)合90K的iSelect基因芯片進行POD活性基因定位,發(fā)現(xiàn)QPod.caas-3AL、QPod.caas-4BS和QPod.caas-5AS3個主效位點,基于效應(yīng)值大的QPod.caas-3AL位點進行同源克隆,克隆了3A染色體POD基因TaPod-A1基因組DNA(gDNA)全長編碼序列并且開發(fā)了一對顯性互補功能標記POD-3A1/POD-3A2。時佳等[18]選用黃淮麥區(qū)材料151份與北部冬麥區(qū)82份品種(系)結(jié)合90K iSelect芯片對小麥品種(系)籽粒POD活性基因進行GWAS,發(fā)現(xiàn)2A、2D、5A、6A、7B和7D等多個穩(wěn)定遺傳的位點,基于效應(yīng)值大的7D位點進行同源克隆,克隆了7D染色體TaPod-D1基因gDNA全長編碼序列并且開發(fā)了一對顯性互補功能標記利用POD-7D1/POD-7D6。耿洪偉等[8]利用TaPod-A1位點功能標記POD-3A1/POD-3A2對129份新疆小麥品種(系)標記檢測發(fā)現(xiàn),新疆小麥品種(系)以含有低POD活性相關(guān)的TaPod-A1a(的等位變異類型為主。謝磊等[21]利用TaPod-D1位點的功能標記POD-7D1/POD-7D6對98份新疆冬小麥品種(系)進行分子檢測顯示,新疆冬小麥品種(系)以含有低POD活性相關(guān)的TaPod-A1a的等位變異類型為主?!颈狙芯壳腥朦c】雖然前人已有對新疆小麥POD活性相關(guān)基因等位變異分布情況的報道,但尚未有新疆小麥POD活性及新疆春小麥TaPod-D1基因的等位變異分布情況的報道。研究新疆小麥品種(系)過氧化物酶活性高低并分析相關(guān)基因變異類型和分布。【擬解決的關(guān)鍵問題】對113份新疆小麥品種(系)進行POD活性檢測,結(jié)合POD-3A1/POD-3A2和POD-7D1/POD-7D6分子標記結(jié)果,研究新疆小麥品種(系)TaPod-A1和TaPod-D1基因的等位變異分布頻率及其與POD活性之間的關(guān)系,驗證分子標記POD-3A1/POD-3A2和POD-7D1/POD-7D6的有效性,為利用分子標記選擇高POD活性小麥品種(系)和改良新疆小麥面粉品質(zhì)奠定理論和材料基礎(chǔ)。
選用113份新疆小麥品種(系)為供試材料,其中89份新疆冬小麥品種(系)和24份新疆春小麥品種(系);冬小麥品種(系)包括16份地方品種(系)、34份引進品種(系)和39份自育品種(系),春小麥品種(系)包括4份早期品種(系)(2000年前審定)和20份近期品種(系)(2000年后審定)。所有冬小麥材料均于2016~2017和2017~2018年2個年度播種于新疆農(nóng)科院瑪納斯試驗站,隨機區(qū)組設(shè)計,2 m行長,每行120粒,行距20 cm,每個品種(系)種植3行,2次重復(fù)。田間管理與當(dāng)?shù)卮筇锷a(chǎn)一致,成熟收獲后,人工脫粒。
1.2.1 POD活性檢測
稱取15 g去雜去劣的小麥籽粒采用配備0.8 mm篩子的旋風(fēng)磨(瑞典LaboratoryMill 120)研磨成全麥粉放置于4℃待測。采用魏景欣等[3]方法,測定POD活性,2次重復(fù),若2次檢測的結(jié)果相差超過10%,需重復(fù)檢測。單位POD活性(U)被定義為每克全麥粉每分鐘反應(yīng)產(chǎn)物在470 nm處的吸光度增加0.01。
1.2.2 POD活性分子標記檢測
耿洪偉等[8]已對新疆冬小麥品種(系)進行TaPod-A1和TaPod-D1位點的等位變異檢測,謝磊等[21]也對新疆春小麥品種(系)進行了TaPod-D1位點的等位變異檢測,研究采用耿洪偉等[22]的方法,取3粒有代表性的種子提取基因組DNA,隨后利用時佳等[18]開發(fā)的功能標記POD-7D1/POD-7D6檢測24份新疆春小麥品種(系),根據(jù)每個小麥品種(系)DNA標記結(jié)果判斷其基因型。表1
表1 用于檢測POD活性基因的分子標記及其引物序列
用Excel進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計和相關(guān)性分析,采用IBM SPSS statistics 21對數(shù)據(jù)進行t檢驗及單因素方差分析。
研究表明,新疆小麥品種(系)的POD活性分布范圍很廣(730~4 600 U/(g·min)),最高、最低POD活性相差6倍,其POD平均活性為2 436.5 U/(g·min),不同年份間POD活性相關(guān)系數(shù)為0.6(P<0.01)。新疆春小麥的POD活性(2 507.8 U/(g·min))高于新疆冬小麥的POD平均活性(2 417.2 U/(g·min))。在新疆冬小麥中,POD活性表現(xiàn)為引進品種(系)(活性為2 501.7 U/(g·min))>地方品種(系)(2 473.9 U/(g·min))>自育品種(系)(2 320.3 U/(g·min));在新疆春小麥中,POD活性表現(xiàn)為近期品種(系)(2 524.0 U/(g·min))>早期品種(系)(2 426.9 U/(g·min))。表2
表2 不同類型新疆小麥品種(系)的POD活性
研究表明,在TaPod-A1位點,具有TaPod-A1b等位變異類型品種(系)的POD活性(2 595.3 U/(g·min))極顯著(P<0.01)高于具有TaPod-A1a等位變異類型品種(系)(2 346.0 U/(g·min)),TaPod-A1b為優(yōu)異等位變異,在新疆冬小麥麥引進品種(系)和新疆春小麥早期品種(系)中2個等位變異類型的材料間POD活性均具有極顯著差異(P<0.01);在TaPod-D1位點,具有TaPod-D1b等位變異類型品種(系)的POD活性(2 503.9 U/(g·min))顯著(P<0.05)高于具有TaPod-D1a等位變異類型品種(系)(2 376.9 U/(g·min)),在新疆冬小麥品種(系)中2個等位變異類型的材料間POD活性具有顯著差異(P<0.05)。TaPod-A1位點檢測與魏景欣[3]一致,可用于新疆小麥POD活性的輔助選擇,而TaPod-D1位點的檢測結(jié)果顯示TaPod-D1b為優(yōu)異等位變異。表3
表3 不同類型小麥材料不同等位變異的POD活性
在檢測的113份新疆小麥材料中,TaPod-A1和TaPod-D1基因位點共存在TaPod-A1a/TaPod-D1a、TaPod-A1a/TaPod-D1b、TaPod-A1b/TaPod-D1a和TaPod-A1b/TaPod-D1b四種等位變異組合類型。不同組合類型的總體分布比例表現(xiàn)不同。研究表明,2個高POD活性等位變異組合TaPod-A1b/TaPod-D1b(活性為2 706.2 U/(g·min))顯著高于由2個低POD活性的等位變異組合TaPod-A1a/TaPod-D1a(2 283.6 U/(g·min)),由一個高POD活性和一個低POD活性等位變異組合的TaPod-A1a/TaPod-D1b(2 408.4 U/(g·min))和TaPod-A1b/TaPod-D1a(2 516.8 U/(g·min))POD活性無顯著差異。將2個功能標記組合使用,可以提高優(yōu)異等位基因的選擇效率。表4
表4 2個基因不同等位變異的POD活性
研究表明,在TaPod-A1位點,新疆春小麥品種(系)中具有TaPod-A1b變異類型的材料有17份(占70.8%),為優(yōu)勢等位變異,其中早期品種(系)和近期品種(系)TaPod-A1b分布頻率分別為75.0%和70.0%,在TaPod-D1位點,具有TaPod-D1a在新疆春小麥品種(系)資源中有20份(83.3%),為優(yōu)勢等位變異,其中早期品種(系)和近期品種(系)TaPod-D1a分布頻率分別為100.0%和80.0%,無論是從新疆春小麥品種(系)的總體還是從早期或近期來看,均表現(xiàn)出TaPod-A1b和TaPod-D1a為優(yōu)勢等位變異。在24份新疆春小麥材料中共有TaPod-A1a/TaPod-D1a、TaPod-A1b/TaPod-D1a和TaPod-A1b/TaPod-D1b3種等位變異,TaPod-A1b/TaPod-D1a在24份新疆小麥品種(系)、早期品種(系)或近期品種(系)分布頻率分別為54.2%、75.0%和50.0%,均表現(xiàn)為優(yōu)勢等位變異。表5
表5 不同類型新疆春小麥材料不同等位變異的頻率
研究表明,新疆推廣種植的小麥品種(系)POD活性高,品種(系)間活性變異范圍大,其POD活性總體要高于全國3個主產(chǎn)麥區(qū)(北部冬麥區(qū)、黃淮麥區(qū)和長江流域與西南麥區(qū))推廣的品種(系)[3]。從不同生產(chǎn)麥區(qū)來看,新疆小麥籽粒POD活性最低略高于中國北部冬麥區(qū)小麥品種(系)(729.36 U/(g·min))的活性,最高是長江流域與西南麥區(qū)的小麥品種(系)(653.38 U/(g·min))的7倍。主要是由氣候條件的差異造成的,新疆的干旱半干旱地區(qū),年降雨量平均為117.8 mm,是我國典型的干旱少雨地區(qū),還有諸如鹽漬化和高溫等非生物逆境脅迫,更易引起品種(系)的POD活性增高[23-26]。相比于其他麥區(qū),新疆小麥品種(系)與中國北部冬麥區(qū)的小麥品種(系)籽粒POD活性最為接近,這主要是由于北部冬麥區(qū)與新疆緯度相近,寒、旱等自然條件也更為相近[27-28]。從新疆不同類型小麥的POD活性來看,新疆春小麥POD平均活性(2 507.8 U/(g·min))高于新疆冬小麥的POD平均活性(2 417.2 U/(g·min))。相吉山等[29]和桑偉等[30]通過對新疆小麥品種(系)資源籽粒性狀和磨粉品質(zhì)的研究,發(fā)現(xiàn)新疆春小麥品種(系)的蛋白質(zhì)含量往往比冬小麥高,作為籽粒蛋白質(zhì)組成部分的POD含量也相應(yīng)提高[31],從而導(dǎo)致春小麥POD活性的偏高[32],因此,新疆春小麥品種(系)有助于高POD活性品種(系)的遺傳改良。在新疆冬小麥品種(系)中,引進品種(系)POD活性顯著高于自育品種(系)和地方品種(系),因此,引進品種(系)是新疆小麥面粉品質(zhì)遺傳改良的重要途徑,在新疆小麥育種工作中應(yīng)通過積極引進外地品種(系),來改善新疆小麥的面粉品質(zhì)。在新疆春小麥中,近期品種(系)POD活性高于早期品種(系),除了消費者對小麥品質(zhì)越來越高的關(guān)注和需求之外[33],也源于新疆小麥育種近年來比較注重對面粉色澤的選擇[34-35],使有利于提高小麥面粉白度的高POD活性基因得以在近期品種(系)中被保留。
新疆小麥品種(系)在TaPod-A1和TaPod-D1 2基因位點,均以含有低POD活性相關(guān)的TaPod-A1a(63.7%)和TaPod-D1a(53.1%)的等位變異類型為主,這2種等位變異類型在均高于新疆小麥品種(系)中的分布頻率高于全國冬小麥品種(系)。而與高POD活性相關(guān)的優(yōu)異等位變異組合TaPod-A1b/TaPod-D1b在新疆冬、春小麥品種(系)中分布頻率均較低,分別只有14.6%和15.0%。趙廣才等[36]研究表明,我國小麥品質(zhì)研究起步較晚,前期更多的關(guān)注于產(chǎn)量性狀,忽視了品質(zhì)的遺傳改良,而品質(zhì)與產(chǎn)量存在一定負相關(guān)[37],在進行高產(chǎn)選擇的同時,不經(jīng)意間使非優(yōu)異等位變異類型在選育過程中得到了積累。優(yōu)異等位變異組合TaPod-A1b/TaPod-D1b在新疆冬小麥材料分布頻率大小為引進品種(系)>自育品種(系)>地方品種(系),而在新疆春小麥材料中的分布頻率為近期品種(系)>早期品種(系)。表明新疆地方品種(系)對新疆小麥的早期育種工作有較大影響,外來種質(zhì)的引入使得小麥優(yōu)異等位變異頻率得到提升;與此同時,近期品種和自育品種多為以地方品種或自育品種(系)和外引品種為親本所育,外來種質(zhì)的引入有力地推進了小麥品質(zhì)的遺傳改良。因此,在今后育種工作中,應(yīng)積極引進國內(nèi)外優(yōu)質(zhì)品質(zhì)(系),采用優(yōu)異等位變異類型品種(系)為親本,對于提高新疆小麥品種(系)優(yōu)異等位變異的頻率,進而加快新疆小麥品質(zhì)的遺傳改良是可行的。
功能標記以其準確、高效、簡單的特點而大規(guī)模應(yīng)用于作物育種[38],功能標記的開發(fā)及應(yīng)用逐漸稱為小麥分子育種的重要研究內(nèi)容[39]。魏景欣等[3]和時佳等[18]研究表明,TaPod-D1b和TaPod-A1a基因型與低POD活性相關(guān),TaPod-D1a和TaPod-A1b基因型與高POD活性相關(guān)。研究用TaPod-A1和TaPod-D1小麥POD活性基因的功能標記對新疆小麥品種(系)進行檢測,發(fā)現(xiàn)TaPod-A1等位變異和TaPod-D1均與POD活性呈極顯著正相關(guān),其中具有TaPod-A1b等位變異材料的POD活性顯著高于具有TaPod-A1a等位變異的材料,具有TaPod-D1b等位變異材料的POD活性顯著高于具有TaPod-D1a等位變異的材料。時佳等[18]利用TaPod-7D1和TaPod-7D6標記對243份中國小麥材料進行了檢測,結(jié)合POD活性表型數(shù)據(jù)分析,卻發(fā)現(xiàn)具TaPod-D1a等位變異的材料具有更高的POD活性,研究結(jié)果與其研究結(jié)果不一致,主要原因是POD的活性受遺傳因子、生態(tài)環(huán)境和栽培措施等影響[15],李鳳梅等[40]研究表明,微效基因以及環(huán)境和其他植物生長調(diào)節(jié)劑影響甜瓜性型;曹雪蓮等[41]發(fā)現(xiàn)基因間的互作及其與環(huán)境的互作對于小麥的抗穗發(fā)芽的影響較大;時佳等[42]通過產(chǎn)量功能標記檢測時,也發(fā)現(xiàn)同一功能標記會因為環(huán)境及材料不同等原因,造成同一功能標記在不同研究中出現(xiàn)沒有顯著差異甚至結(jié)果相反的現(xiàn)象。因此,在今后的工作中可通過擴大樣本量、提高樣本的遺傳多樣性,對TaPod-D1位點不同等位變異與POD活性相關(guān)性進行深入研究,將基于TaPod-D1基因開發(fā)的功能標記應(yīng)用育種實踐。
在新疆小麥品種(系)材料中,以2個低POD活性等位變異類型TaPod-A1a和TaPod-D1a為主,且2個高POD活性等位變異類型TaPod-A1b/TaPod-D1b所占比例較少。TaPod-A1的功能標記POD-3A1和POD-3A2能較好的區(qū)分小麥籽粒POD活性的高低,可用于POD活性的分子標記輔助選擇。TaPod-D1功能標記POD-7D1和POD-7D6標記結(jié)果與POD活性測定結(jié)果相對于前人TaPod-D1a為高POD活性等位變異的結(jié)論不一致,該標記仍需擴大材料做進一步驗證。將2個功能標記組合使用,能更有效地篩選出高POD活性材料。