楊 鈺 ,楊靖宜,陳志彬,陳燦昆,范志祥,張延潔,張 璐,萬(wàn)瑞雪,龍 莉
(1) 昆明醫(yī)科大學(xué),云南昆明 650031;2) 昆明醫(yī)科大學(xué)細(xì)胞生物學(xué)與醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)系,云南昆明 650500;3) 昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院遺傳科,云南昆明 650101)
CX3CR1為G-蛋白偶聯(lián)受體,須與Fractalkine(Fkn) 相結(jié)合方可發(fā)揮生物學(xué)作用,導(dǎo)致炎癥發(fā)生。CX3CR1 基因共含1065 個(gè)核苷酸,可編碼355 個(gè)氨基酸,位于3p21 -3pter[1]。McDemott 等[2]發(fā)現(xiàn)其跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)共有5 個(gè)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(SNP),而V249I 多態(tài)位點(diǎn)就是其中之一。V249I 多態(tài)性是指位于CX3CR1 基因第二外顯子上的745 位點(diǎn)堿基發(fā)生G→A 突變,使得相應(yīng)的密碼子由纈氨酸(V) 轉(zhuǎn)為異亮氨酸(I)[3]。V249I(G→A) 多態(tài)位點(diǎn)位于CX3CR1 基因編碼區(qū),故其可影響蛋白質(zhì)翻譯,從而影響受體功能[4]。V249I突變影響炎癥進(jìn)程中白細(xì)胞尤其是吞噬細(xì)胞、淋巴細(xì)胞的游走與活化并介導(dǎo)細(xì)胞間黏附聚集等作用,甚至可能影響疾病遺傳易感性[5]?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)V249I 多態(tài)與多種炎癥性疾病和某些傳染性疾病的發(fā)生發(fā)展相關(guān)[6],但其機(jī)制目前為止尚未完全明確。本文著力于研究、描述云南省晉寧縣彝族健康人群CX3CR1 基因V249I 位點(diǎn)多態(tài)分布情況及其與國(guó)內(nèi)外不同種族及不同民族之間的差異,為探索CX3CR1 基因相關(guān)疾病分子機(jī)制提供理論依據(jù)。
昆明市晉寧縣雙河彝族鄉(xiāng)彝族健康村民共245人,其中男性82 例,女性163 例,平均年齡(60.2±12.1) 歲;經(jīng)病史調(diào)查、體檢報(bào)告、實(shí)驗(yàn)室檢查等資料將高血壓、冠心病、心肌病、先天性心臟病和瓣膜性心臟病患者排除在外。本研究已通過(guò)倫理道德審查且所有對(duì)象對(duì)調(diào)查、取樣項(xiàng)目知情同意。
1.2.1 基因組DNA 提取抽取靜脈血2 mL 后采用EDTA 抗凝,使白細(xì)胞分離,低滲溶血,酚-氯仿有機(jī)抽提法提取基因組DNA,TE 緩沖液溶解,4℃冰箱儲(chǔ)存。
1.2.2 目的片段的PCR 擴(kuò)增采用PCR 技術(shù)特異性擴(kuò)增CX3CR1 基因的一段包含V249I 位點(diǎn)的DNA 引物序列。上游引物為:5'-CCGAGGTCCTCCAGGAAATCT-3';下游引物為5'-TCAGCATC AGGTTCAGGAACTC-3';30 μL PCR反應(yīng)體系包含:正反引物各1.3 μL,TaqDNA 聚合酶15 μL(北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司),雙蒸水(ddH2O) 11.4 μL,DNA 樣本1 μL。PCR 反應(yīng)條件如下:94℃預(yù)變性4 min,94℃變性30 s,58℃退火40 s,72 ℃延伸55 s,循環(huán)35 次;于72 ℃延伸10 min。
1.2.3 基因型鑒別采用RFLP 法檢測(cè)基因型。酶切體系共18 μL:PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物6 μL,0.5 μL 限制性內(nèi)切酶Acl I(Bio Basic 公司),雙蒸水(ddH2O)8.8 μL,10×Buffer2.7 μL,37℃孵育過(guò)夜(24~36 h)。反應(yīng)終止后將消化片段于2.5%瓊脂糖凝膠上電泳(添加Goldview-I 型核酸染色劑),凝膠成像系統(tǒng)判斷酶切結(jié)果。
數(shù)據(jù)處理采用SPSS 軟件。χ2檢驗(yàn)分析基因型及等位基因頻率,且檢驗(yàn)Hardy-Weinberg 平衡定律,P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
分析結(jié)果為χ2=3.286,P=0.279,說(shuō)明CX3CR1 基因 V249I 位點(diǎn)多態(tài)性分布符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律,即所選用的人群樣本具有群體代表性,結(jié)果具有說(shuō)服力。
PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小為588 bp。該片段用限制性內(nèi)切酶Acl I 進(jìn)行酶切時(shí),若CX3CR1 基因745 位點(diǎn)沒(méi)發(fā)生突變,編碼的氨基酸為G,則擴(kuò)增產(chǎn)物被Acl I 切開(kāi)會(huì)產(chǎn)生205 bp、383 bp 二個(gè)片段;若745 位點(diǎn)的G 被A 替代,編碼的氨基酸變?yōu)镮,原有的Acl I 酶切位點(diǎn)消失,Acl I 無(wú)法切開(kāi),即長(zhǎng)度不變。酶切后產(chǎn)生2 個(gè)等位基因V、I,形成3種基因型:II:只產(chǎn)生588 bp 一個(gè)片段(無(wú)突變純合子) VV:產(chǎn)生205 bp、383 bp 二個(gè)片段(突變雜合子);VI:產(chǎn)生588 bp、383 bp 和205 bp 三個(gè)片段(突變雜合子),見(jiàn)圖1。
圖1 CX3CR1 基因V249I 多態(tài)性3 種基因型凝膠電泳圖Fig.1 Three genotype of CX3CR1 gene V249I polymorphism were showed by agarose electrophoresis image
昆明市晉寧縣雙河鄉(xiāng)245 例彝族健康人群中,CX3CR1 基因249I 位點(diǎn)有VV、VI、II 三種基因型,其基因型頻率分別為86.53%、12.25%、1.22%;V、I 等位基因頻率分別為92.65%和7.35%。在男性中,基因型頻率為VV(91.46%)、VI(7.32%)、II(1.22%);V、I 等位基因頻率分別為95.12%、4.88%。在女性中,基因型頻率為VV(84.05%)、VI(14.72%)、II(1.23%);V、I等位基因頻率則分別為91.41%、8.59%。經(jīng)過(guò)比較,在不同性別中該位點(diǎn)的多態(tài)性分布無(wú)顯著差異(基因型為χ2=2.791,P=0.248;等位基因?yàn)棣?=2.207,P=0.137),見(jiàn)表1。
現(xiàn)將國(guó)內(nèi)外報(bào)道的不同種族或民族人群CX3CR1 基因位點(diǎn)多態(tài)性分布的研究結(jié)果與本研究進(jìn)行比較,結(jié)果顯示:云南彝族健康人群中V249I多態(tài)性位點(diǎn)以VV 型為主,日本人、傣族人、景頗族人、漢族人、新疆漢族人、湖南漢族人、包頭漢族人群缺少II 基因型。云南彝族與報(bào)道的日本人[7]、法國(guó)人[8]、意大利人[9]、高加索人[10]、希臘人[11]、印度[12]人、塞爾維亞人[13]、維吾爾族人[14]、新疆漢族人[14]、漢族人[15]比較,其CX3CR1 基因型分布與基因頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。與景頗族人[16]、傣族人[16]、湖南漢族人[17]、包頭漢族人[18]相比無(wú)論從基因型分布或是基因頻率均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05)。
云南彝族人群VV 基因型頻率為86.53%,顯著高于已報(bào)道的維吾爾族人(72.45%)、塞爾維亞人(62.60%)、意大利人(52.94%)、希臘人(52.12%)、高加索人(50.60%)、法國(guó)人(50.32%)、印度人(50.00%),P<0.05;但顯著低于新疆漢族人(95.74%)、漢族人(95.24%)、日本人(91.83%),P<0.05;云南彝族人群VI 基因型頻率為12.25%,高于漢族人(4.76%)、新疆漢族人(4.26%),P<0.05;同時(shí)低于法國(guó)人(43.34%)、高加索人(41.77%)、意大利人(41.18%)、印度人(39.33%)、希臘人(35.76%)、塞爾維亞人(32.47%) 和維吾爾族人(23.47%)(P<0.05);云南彝族人群II 基因型頻率為1.22%,顯著低于希臘人(12.12%)、印度人(10.67%)、高加索人(7.63%)、法國(guó)人(6.34%)、意大利(5.88%)、塞爾維亞人(4.30%),P<0.05。
云南彝族人群V 等位基因頻率為92.65%,顯著高于維吾爾族人(84.18%)、塞爾維亞人(78.83%)、意大利人(73.53%)、法國(guó)人(71.96%)、高加索人(71.49%)、希臘人(70.0%)和印度人(69.69%),P<0.01;低于新疆漢族人(97.87%) 和漢族人 (97.60%)、日本人(95.92%),P<0.01。云南彝族人群I 等位基因頻率為7.35%,低于印度人(30.31%)、希臘人(30.00%)、塞爾維亞人(21.17%)、高加索人(28.51%)、法國(guó)人(28.04%)、意大利人(26.47%) 和維吾爾族人(15.82%),P<0.01,但高于日本人(4.08%)、漢族人(2.40%) 和新疆漢族人(2.13%),P<0.01,與其他民族比較差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)表2。
表1 彝族CXC3R1 基因V/I 多態(tài)性的分布[n(%)]Tab.1 Distribution of CX3CR1 gene V249I polymorphism in Yi nationality population [n(%)]
表2 不同人群CXC3R1 基因V249I 多態(tài)性基因型頻率和等位基因頻率[n(%)]Tab.2 Genotype frequency and gene frequency of CX3CR1 gene V249I polymorphism comparison between Yi nationality and other populations [n(%)]
Fkn 是CX3C 趨化因子家族中獨(dú)特的促炎因子,以可溶性和膜結(jié)合形式存在,主要由大腦、心臟及外周血管內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)。其特異性受體CX3CR1 存在于單核細(xì)胞、NK 細(xì)胞、T 細(xì)胞膜上,兩者之間相互作用可導(dǎo)致炎癥發(fā)生[19]?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)CX3CR1 基因V249I 多態(tài)性與某些傳染性疾病以及多種炎性疾病的發(fā)生發(fā)展相關(guān)。朱阿楠[20]等發(fā)現(xiàn)V249I 突變對(duì)Fkn 趨化活性、結(jié)合率均下降,并減緩糖尿病腎?。―N) 進(jìn)程。例如Combadiere 等[21]發(fā)現(xiàn)CX3CR1 基因V249I 多態(tài)性與年齡相關(guān)性黃斑變性(AMD) 相關(guān)。Moatti 等[22]發(fā)現(xiàn)CX3CRl 上只有I 等位基因可用于預(yù)測(cè)評(píng)估急性冠狀動(dòng)脈綜合征的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),說(shuō)明Fkn 分子與血管性疾病有相關(guān)性;正如李文龍等[23]的研究顯示:冠狀動(dòng)脈硬化性疾?。–AD) 患者的V249I 頻率較低,即推測(cè)V249I 多態(tài)是CAD 的保護(hù)性因素。近年有研究發(fā)現(xiàn)V249I 多態(tài)可能為缺血性腦血管病(ICVD) 的遺傳易感因素[24],且體外試驗(yàn)證實(shí)V249I 多態(tài)性還在腎小球腎炎發(fā)病中起作用[25]。但CX3CR1 基因V249I 多態(tài)與疾病的關(guān)系,在不同的民族或種族中,可能會(huì)得出不同的結(jié)論。如劉明旭等[14]檢測(cè)到V249I 多態(tài)性可能與新疆維吾爾人群中HIV-1 易感性有關(guān);而鄧小玲等[26]卻推測(cè)四川彝族人群HIV-1 感染者與正常人中V249I 多態(tài)分布無(wú)顯著差異。這可能是由于不同民族遺傳背景不同導(dǎo)致對(duì)疾病易感性存在差異。除了上述慢性病外,最近的研究提示V249I 多態(tài)性還與腫瘤的發(fā)生過(guò)程相關(guān)[27];瘤內(nèi)CX3CL1-CX3CR1 信號(hào)被證明直接影響膠質(zhì)瘤的侵襲和粘連行為,V249I 多態(tài)性提高膠質(zhì)瘤患者術(shù)后的總存活率,減少TAM 浸潤(rùn)。
云南彝族與其他民族和種族具有不同的遺傳背景,如龍莉等[28-33]發(fā)現(xiàn)M235T、T280M 等多種基因的多個(gè)多態(tài)位點(diǎn)在云南彝族與其他民族或種族中的分布均有顯著差異。但目前國(guó)內(nèi)外對(duì)于云南彝族CX3CR1 基因V249I 位點(diǎn)多態(tài)性的研究較少,對(duì)云南彝族進(jìn)行基因?qū)用娴难芯靠蔀槟壳疤岢珳?zhǔn)醫(yī)療,個(gè)體化醫(yī)療方案提供一定證據(jù)。本研究對(duì)部分已報(bào)道種族、民族CX3CR1 基因V249I 多態(tài)性分布進(jìn)行收集、描述統(tǒng)計(jì),結(jié)果顯示:云南彝族與報(bào)道的日本人、法國(guó)人、意大利人、高加索人、希臘人、印度人、塞爾維亞人、維吾爾族、漢族、新疆漢族比較,V249I 基因型分布與基因頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。這說(shuō)明在不同地域、不同種族的健康人群中,V249I 基因型及其等位基因頻率分布存在差異,其中以不同種族之間的差異更為顯著。
以上國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展與結(jié)果都提示趨化因子受體CX3CR1 在炎性疾病、AMD 與AIDS 等疾病進(jìn)程中發(fā)揮重要作用,而V249I 多態(tài)性很大程度上影響著CX3CR1 的表達(dá)。各種族與民族遺傳背景的不同使得其疾病發(fā)生與發(fā)展可能存在差異,通過(guò)研究人類基因多態(tài)性,可掌握基因在不同人群中的分布狀況,從基因水平對(duì)疾病在不同民族、種族中表現(xiàn)的易感性、發(fā)病率差異的潛在機(jī)制進(jìn)行初步探索。此外,開(kāi)展多地區(qū)、大樣本的研究并對(duì)CX3CR1 的其他多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行篩查,有助于明確CX3CR1 基因多態(tài)性在疾病發(fā)生發(fā)展中的作用,為疾病排查、治療提供新的靶點(diǎn)。
昆明醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2020年10期