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一株核桃真菌病害生防菌的鑒定及抑菌特性研究

2020-11-28 07:50馬騰張知曉戶連榮劉凌季梅
中國森林病蟲 2020年6期
關(guān)鍵詞:生防發(fā)酵液芽孢

馬騰,張知曉,戶連榮,劉凌,季梅

(1.青海省林業(yè)調(diào)查規(guī)劃院,青海西寧 810000;2.云南省林業(yè)和草原科學(xué)院,云南昆明 650201)

核桃Juglans regia,學(xué)名胡桃,是多年生落葉喬木,核桃仁是高檔堅果,果實種殼能開發(fā)成工藝品,木材是制作高檔家具的原料,其葉子及果皮可以入藥[1]。因其良好經(jīng)濟社會價值,云南省將胡桃作為發(fā)展八大產(chǎn)業(yè)的重要物種,是打造云南“綠色食品牌”的重要組成部分[2]。截至2017年,云南省核桃種植面積達286.67萬hm2,核桃(干果)總產(chǎn)量為115萬t,產(chǎn)值318億元,居全國第一[3]。近年來,隨著種植面積的快速增加,核桃病蟲害發(fā)生情況也愈加嚴重。在我國,核桃黑斑病等細菌病害,以及炭疽病、枝枯病和腐爛病等真菌病害發(fā)生普遍,對核桃生產(chǎn)造成了嚴重影響[4]。目前,核桃病害防治仍然依賴化學(xué)藥劑,隨著全社會對綠色無公害食品需求的增加以及生態(tài)環(huán)境保護意識的提高,生物防治成為核桃病害防治的發(fā)展方向。

芽孢桿菌具有抗逆能力強、抑菌譜廣等特點,近些年研究較多的如枯草芽孢桿菌Bacillus subtilis、解淀粉芽孢桿菌B.amyloliquefaciens、蠟樣芽孢桿菌B.cereus等,在由絲狀真菌引起的植物病害的生防領(lǐng)域有著廣泛應(yīng)用[5]。芽孢桿菌資源豐富,許多具有生防作用的種類有待發(fā)掘研究。芽孢桿菌抑菌譜廣泛,但不同菌株對病原菌抑制效果不一,且不同芽孢桿菌抑制病原菌的作用機制不同[6],因此在發(fā)掘新的生防菌資源時,有必要對其抑菌特性進行研究。筆者選用前期試驗分離驗證的具有抑菌效果的一株生防細菌5-1,測定其對核桃病害主要病原真菌的抑菌特性,并進行種類鑒定,以期為應(yīng)用該生防菌株防治核桃真菌病害、開發(fā)新的生防微生物資源提供參考。

1 材料與方法

1.1 試驗材料

1.1.1 培養(yǎng)基 LB培養(yǎng)基(胰蛋白胨10 g、酵母粉5 g、氯化鈉5 g、瓊脂 20 g、蒸餾水 1 L),用于細菌培養(yǎng)及形態(tài)鑒定;PDA培養(yǎng)基(馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂20 g、蒸餾水1 L),用于病原真菌培養(yǎng)及對峙培養(yǎng)。

1.1.2 病原真菌 試驗地區(qū)常見核桃真菌病害的病原真菌7種,從云南省核桃病害中分離(表1)。

1.1.3 生防細菌 2019年4月在云南省昆明樹木園(N 25°8′39″,E 102°44′48″)隨機挖取 5 份核桃根際土壤樣品,每份10 g。將5份土樣混合后,稱取10 g土樣用無菌自來水稀釋,取最適濃度的土壤懸浮液均勻涂布于固體LB平板上,28℃條件下培養(yǎng)48 h,挑選單菌落,劃線純化。選擇病原真菌膠孢炭疽菌Colletotrichum gloeosporiodes為指示菌,采用平板對峙法評價分離所得細菌的拮抗能力。選擇拮抗效果最好的菌株5-1進行后續(xù)試驗。

1.1.4 生防菌發(fā)酵液 菌株5-1接種于LB培養(yǎng)液,28℃、140 r/min搖床培養(yǎng)24 h,將菌液濃度稀釋至2×109cfu/mL的活體菌液為活體發(fā)酵液;菌體濃度2×109cfu/mL的活體發(fā)酵液用細菌濾器過濾3次后的濾出液為發(fā)酵濾液;2×109cfu/mL的活體發(fā)酵液經(jīng)121℃滅菌20 min后,用細菌濾器過濾1次的濾出液為滅菌發(fā)酵液。

1.1.5 病原菌孢子懸浮液 廣布擬盤多毛孢菌Pestalotiopsis disseminata在PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng)5 d,用無菌水沖洗分生孢子,離心沉淀并反復(fù)清洗3次后,配制成4×106個/mL的孢子懸浮液。

1.2 生防菌對核桃主要病原真菌拮抗作用 采用平板對峙法測試生防菌株5-1發(fā)酵液對核桃7種病原真菌的抑菌效果。用5 mm打孔器沿菌落邊緣選取新鮮的菌絲制成菌餅,單個菌餅接種在PDA培養(yǎng)基平板中央,用移液器吸取50 μL生防菌活體發(fā)酵液,均勻?qū)ΨQ地接種在距菌餅中央30 mm處的4個點,以接種無菌自來水為對照,于28℃下培養(yǎng),每處理3個重復(fù)。培養(yǎng)7 d后,分別測量對照菌落直徑、處理菌落直徑,計算抑制率。

抑制率(%)=(對照菌落直徑-處理菌落直徑)/(對照菌落直徑-5mm)×100[7]

1.3 生防菌對分生孢子的影響 由于廣布擬盤多毛孢易產(chǎn)孢,且孢子形態(tài)易觀察,因此選擇該病原真菌的分生孢子進行試驗。采用隨機區(qū)組設(shè)計,共設(shè)活體發(fā)酵液、發(fā)酵濾液、滅菌發(fā)酵液和121℃滅菌20 min的滅菌自來水對照4個處理,每個處理3個重復(fù)。將分生孢子懸浮液分別和4個處理液體按1∶1的比例進行混和,置于離心管中,28℃、140 r/min搖床黑暗恒溫培養(yǎng),分別于12 h和24 h后,用無菌移液器吸取病原真菌分生孢子,在光學(xué)顯微鏡下觀察形態(tài),并拍攝照片。

1.4 生防細菌鑒定

1.4.1 形態(tài)學(xué)觀察 將菌株5-1在LB固體培養(yǎng)基上劃線培養(yǎng)[8]。在37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48 h后觀察菌落生長情況,并用革蘭氏染色法制片完成細胞形態(tài)結(jié)構(gòu)的顯微觀察。

1.4.2 生理生化特性測試 完成菌株5-1的溫度(5~60℃)、pH(4.0~13.0)、NaCl(0~14%)耐受試驗,測定水解淀粉和明膠能力,選擇葡萄糖、麥芽糖、淀粉等碳源及酪氨酸、組氨酸等氮源進行唯一碳、氮源的生長試驗[9]。

1.4.3 16S rRNA序列測定 采用細菌DNA提取試劑盒提取菌株5-1的基因組總DNA,用細菌通用引物27F/1495R擴增16S rRNA片段,用1%瓊脂糖凝膠電泳回收擴增產(chǎn)物,送深圳華大基因有限公司進行測序,獲得基因序列與GenBank中已知的核酸序列進行BLAST比對,選取相關(guān)近緣種序列使用MEGA 4.1軟件進行系統(tǒng)發(fā)育分析,采用鄰接距離法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[10]。

2 結(jié)果與分析

2.1 拮抗功能評價 菌株5-1對核桃7種病原真菌均表現(xiàn)出不同程度的抑制作用,其中對間座殼菌Diaporthe nobilis、鐮孢菌Fusariumsp.、膠孢炭疽菌和廣布擬盤多毛孢菌抑制效果十分明顯,抑制率超過40%。對間座殼菌的抑制率最高,達到73.7%,對胡桃楸擬莖點霉Phomopsis juglandina的抑制率最低,僅為24.1%(圖1,表1)。

圖1 生防菌株5-1對核桃7種病原真菌的拮抗效果Fig.1 Confrontation effect of biocontrol strain 5-1 on 7 species of pathogenic fungus infecting walnut

表1 生防菌株5-1對核桃7種病原真菌的抑制率Tab.1 Inhibition rate of biocontrol strain 5-1 on 7 species of pathogenic fungus infecting walnut

2.2 對病原菌分生孢子的影響 生防菌株5-1發(fā)酵液與廣布擬盤多毛孢混合培養(yǎng)12 h和24 h后,廣布擬盤多毛孢孢子萌發(fā)情況見表2。與對照組相比,3組發(fā)酵液均導(dǎo)致分生孢子和菌絲畸變,分生孢子表現(xiàn)為第3色胞明顯膨大,基部無色胞呈囊泡狀,隨之溶解破裂失去萌發(fā)能力;菌絲表現(xiàn)為頂端膨大分叉變形,生長能力減弱(圖2,3)。經(jīng)高溫滅菌后發(fā)酵液依然能導(dǎo)致孢子和菌絲畸變,表明菌株5-1發(fā)酵液的功能成分具有較好的熱穩(wěn)定性?;铙w發(fā)酵液比發(fā)酵濾液造成病原真菌孢子和菌絲的畸變更為明顯,表明活體菌群加大了病原孢子畸形及破裂的程度。

表2 生防菌株5-1的發(fā)酵液對廣布擬盤多毛孢菌絲和孢子形態(tài)的影響Tab.2 Effect of fermentation broth of biocontrol strain 5-1 on mycelia and spore morphology of Pestalotiopsis disseminata

圖2 生防菌3種發(fā)酵液培養(yǎng)12 h后廣布擬盤多毛孢孢子的形態(tài)Fig.2 The spore morphology of Pestalotiopsis disseminata after culturing 3 kinds of fermentation broth for 12 h

圖3 生防菌3種發(fā)酵液培養(yǎng)24 h后廣布擬盤多毛孢菌絲和孢子形態(tài)Fig.3 The mycelia and spore morphology of Pestalotiopsis disseminata after culturing 3 kinds of fermentation broth for 24 h

2.3 生防菌的鑒定

2.3.1 菌株形態(tài) 菌株5-1在固體LB培養(yǎng)基培養(yǎng)3 d后,其菌落為淡黃色,邊緣不整齊,表面光滑,中央凸起,不分泌黏液。顯微鏡下觀察到菌體直桿狀,單個,兩端鈍圓,革蘭氏染色呈陽性(圖4)。

圖4 菌株5-1在LB培養(yǎng)基培養(yǎng)3 d的菌落和菌體形態(tài)Fig.4 Bacterial colony and morphology of strain 5-1 cultured in LB medium for 3 days

2.3.2 生理生化特性 該菌株能利用葡萄糖、淀粉、蔗糖、D-甘露醇、D-木糖、L-阿拉伯糖等多種碳水化合物作為唯一碳源進行生長,卻不能利用麥芽糖和殼聚糖;能利用酪氨酸、組氨酸作為唯一氮源進行生長,生長溫度在5~50℃,生長pH范圍在5.0~9.0,能耐受14%的NaCl;具有水解淀粉和明膠的能力,V-P試驗陽性,不能利用檸檬酸鹽及丙酸鹽,不能還原硝酸鹽。

2.3.3 16S rRNA基因序列測定及系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析 利用16S rRNA通用引物,以菌株5-1 DNA為模板進行PCR擴增,測序得到長度為1 373 bp的16S rRNA基因片段(登錄號:MT378304)。將測序獲得的序列在NCBI上進行核苷酸同源性比對,結(jié)果顯示,其與暹羅芽孢桿菌B.siamensis的16S rRNA核苷酸序列同源性最高,達到99.7%。選取該種相關(guān)近緣種,采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,菌株5-1與暹羅芽孢桿菌同聚一支,親緣關(guān)系最近(圖5)。因此,初步鑒定菌株5-1為芽孢桿菌屬。

圖5 菌株5-1的16S rRNA系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.5 16S rRNA phylogenetic tree of strain 5-1

3 結(jié)論與討論

形態(tài)觀察表明該細菌是革蘭氏陽性菌,LB培養(yǎng)基上菌落呈淡黃色,不分泌黏液;生理生化試驗結(jié)果表明該菌株能夠在5~50℃溫度范圍內(nèi)生長,能耐受14%的NaCl,這是區(qū)分暹羅芽孢桿菌與其他芽孢桿菌的重要特征[11]。此外,菌株5-1能夠利用D-木糖,不能利用檸檬酸鹽,這與Sumpavapol等人[12]的研究中對暹羅芽孢桿菌的描述一致;從系統(tǒng)發(fā)育樹看,菌株5-1與B.siamensis、B.amylolique-faciens和死亡谷芽孢桿菌B.vallismortis的親緣關(guān)系很近,而文獻報道后面兩者無法利用D-木糖,但可以利用檸檬酸鹽[11]。通過形態(tài)觀察、生理生化指標測定和分子生物學(xué)等技術(shù)手段,最終確定菌株5-1為暹羅芽孢桿菌。

目前核桃病害防治仍以化學(xué)防治為主,搭配育種及修枝、清落葉等營林措施[13],其中化學(xué)農(nóng)藥難免對生態(tài)環(huán)境造成破壞,育種及營造健康林分需要漫長周期,生物災(zāi)害突發(fā)時難以應(yīng)對。生物防治技術(shù)因其見效快,對生態(tài)環(huán)境友好,滿足食品安全需求等優(yōu)點,近幾年發(fā)展迅速。關(guān)于暹羅芽孢桿菌,前人已經(jīng)報道過其拮抗真菌的特性,如對細極鏈格孢菌Alternaria tenuissima[14]、禾谷鐮刀菌Fusarium graminearum[15]、尖孢鐮刀菌Fusarium oxysporum[16]、粉紅單端孢Trichothecium roseum和擬盤多毛孢Pestalotiopsis paeoniicola、半裸鐮刀菌Fusarium semitectum、毀滅柱孢Cylindrocarpon destructans[17]等多種病原真菌均有一定的抑制活性。本研究中,菌株5-1能對7種核桃病原真菌產(chǎn)生抑菌作用,結(jié)合前人的相關(guān)研究表明,暹羅芽孢桿菌是一種潛力生防菌,抑菌能力強,抑菌譜廣;菌株5-1經(jīng)液體發(fā)酵后能夠使病原真菌廣布擬盤多毛孢的分生孢子及菌絲畸形,進而抑制其生長,菌群黏附性強,且抑菌能力穩(wěn)定。這些特征表明其在核桃真菌病害生防領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用開發(fā)前景。然而關(guān)于該菌株的研究才剛剛起步,要將其應(yīng)用于核桃病害的生物防治還需對其代謝途徑、功能機理等進行深入研究,同時還要開展大量的田間防效試驗。

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