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基于文獻(xiàn)計(jì)量的國外干細(xì)胞研究熱點(diǎn)主題分析*

2021-01-08 13:27:36田芳慧
關(guān)鍵詞:類團(tuán)主題詞充質(zhì)

張 慶 田芳慧

(濟(jì)寧醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)信息工程學(xué)院,日照 276826)

近年來,伴隨著醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的迅速增加,細(xì)胞學(xué)、生理學(xué)、新陳代謝以及干細(xì)胞的應(yīng)用領(lǐng)域出現(xiàn)了較新的概念和技術(shù)[1-2]。干細(xì)胞是相對未分化的細(xì)胞,具有自我更新能力和分化能力,在多個(gè)發(fā)育階段發(fā)揮著重要作用[3]。干細(xì)胞長期以來受到生物學(xué)家和醫(yī)學(xué)科學(xué)家的關(guān)注,為再生醫(yī)學(xué)材料提供了可能。

文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)是基于文獻(xiàn)角度對學(xué)科領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)進(jìn)行定量分析的一種方法?;诖耍疚膹奈墨I(xiàn)計(jì)量視角來揭示干細(xì)胞領(lǐng)域的研究趨勢,探究該學(xué)科領(lǐng)域已發(fā)表文獻(xiàn)的特征、內(nèi)部關(guān)系、主題發(fā)展趨勢以及其知識結(jié)構(gòu)。

1 數(shù)據(jù)來源與方法

1.1 數(shù)據(jù)來源

文章數(shù)據(jù)來源于MEDLINE數(shù)據(jù)庫。檢索近三年發(fā)表的相關(guān)文獻(xiàn),所用的檢索策略為“Stem Cells”[Majr],檢索時(shí)間為2020年2月16日,共得到相關(guān)文獻(xiàn)21601篇。

1.2 方法

1.2.1高頻詞的選定 以XML格式套錄檢索結(jié)果,利用書目共現(xiàn)分析系統(tǒng)BICOMB[4]統(tǒng)計(jì)并抽取文獻(xiàn)記錄中的主要主題詞與副主題詞,按照出現(xiàn)頻次由高到低進(jìn)行排序,選取頻次≥263的45個(gè)主題詞/副主題詞作為高頻詞。其中出現(xiàn)頻次最高的前三位主題詞/副主題詞分別為:間充質(zhì)干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)(mesenchymal stem cells/cytology)、間充質(zhì)干細(xì)胞/代謝(mesenchymal stem cells/metabolism)、干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)(stem cells/cytology)。該45個(gè)高頻詞占所有與干細(xì)胞相關(guān)主題詞的累計(jì)比例為24.69%。

1.2.2聚類分析 根據(jù)高頻詞在每篇文獻(xiàn)記錄中出現(xiàn)的情況,對高頻主題詞進(jìn)行統(tǒng)計(jì),形成高頻詞詞篇矩陣。將詞篇矩陣輸入gCLUTO軟件,采用系統(tǒng)聚類法對所得詞篇矩陣進(jìn)行聚類分析,聚類分析的結(jié)果可以反映出高頻詞之間的親疏關(guān)系,根據(jù)高頻主題詞的聚類結(jié)果以及主題詞之間的語義關(guān)系,總結(jié)出干細(xì)胞領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。將詞篇矩陣導(dǎo)入SPSS軟件生成相似矩陣,并根據(jù)聚類結(jié)果結(jié)合相似矩陣,計(jì)算向心度和密度,繪制戰(zhàn)略坐標(biāo)圖。

2 結(jié)果

2.1 干細(xì)胞領(lǐng)域高頻主題詞共現(xiàn)聚類圖

聚類結(jié)果見圖1,縱軸代表聚類的主題詞/副主題詞,兩詞聚集到一起的距離越短,關(guān)系越密切。

圖1 干細(xì)胞研究領(lǐng)域高頻主題詞共現(xiàn)聚類圖

首先,根據(jù)每一類高頻詞的含義以及這些主題詞之間的語義關(guān)系,總結(jié)出每一類主題詞所代表的研究熱點(diǎn),即干細(xì)胞領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。通過分析這些主題詞的語義關(guān)系就能得出它們所代表的類團(tuán)含義標(biāo)簽,綜合各個(gè)類別的類標(biāo)簽可以得出該主題的研究熱點(diǎn)。其次,利用gCLUTO軟件計(jì)算各類成員對聚類貢獻(xiàn)率的指標(biāo)(描述度Descriptive和區(qū)分度Descriminating),選擇對每一類形成貢獻(xiàn)最大的來源文獻(xiàn)作為表示該類內(nèi)容的類標(biāo)簽文獻(xiàn)。通常選取描述度分值最高者作為該類的類標(biāo)簽文獻(xiàn)(如表1所示),確定類標(biāo)簽文獻(xiàn)后再對文獻(xiàn)內(nèi)容進(jìn)一步分析,進(jìn)而闡釋該類研究方向的具體內(nèi)容。

表1 類成員對聚類貢獻(xiàn)率指標(biāo)

2.2 主題詞黏合度

類團(tuán)主題的確定需要參考主題詞的黏合度。主題詞黏合度可用來確定類團(tuán)內(nèi)各主題詞對本類團(tuán)的貢獻(xiàn)度,也可用來確定該黏合度所代表的主題在促進(jìn)類團(tuán)聚類的過程中的作用有效與否或者有效程度的大小。其中黏合度值最大的為類團(tuán)中心,是類團(tuán)研究的主要內(nèi)容,對于類團(tuán)的計(jì)算采用鐘偉金[5-6]學(xué)者的方法:

其中,N(Ai)為主題詞Ai的黏合度,n為類團(tuán)內(nèi)主題詞總數(shù),F(xiàn)(Ai→Bj)為主題詞Ai與類團(tuán)內(nèi)其他主題詞的共現(xiàn)頻次。

根據(jù)公式計(jì)算出各類團(tuán)的中心詞依次是:類團(tuán)0,成骨/藥物作用;類團(tuán)1,間充質(zhì)干細(xì)胞/ 細(xì)胞學(xué);類團(tuán)2,干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué);類團(tuán)3,多能干細(xì)胞 /細(xì)胞學(xué);類團(tuán)4,腫瘤干細(xì)胞/代謝。

3 分析

3.1 類團(tuán)研究主題分析

通過對高頻主題詞/副主題詞的聚類分析,將近三年干細(xì)胞領(lǐng)域的研究分為4個(gè)方面,5個(gè)主題方向。

3.1.1干細(xì)胞在成骨分化方面的研究 1)藥物對間充質(zhì)干細(xì)胞成骨的影響。該主題包括的主題詞有:細(xì)胞分化/藥物效應(yīng)、間質(zhì)細(xì)胞/藥物效應(yīng)、間充質(zhì)干細(xì)胞、成骨/藥物效應(yīng)、干細(xì)胞/藥物效應(yīng)、間充質(zhì)干細(xì)胞/免疫學(xué),其中心詞為成骨/藥物作用。

主要研究各種藥物對間充質(zhì)干細(xì)胞成骨的影響。通過研究藥物對間充質(zhì)干細(xì)胞成骨分化的影響,發(fā)現(xiàn)藥物在骨質(zhì)和牙科疾病新的治療手段,為牙周炎、骨質(zhì)疏松癥等疾病的治療開啟新方向。如,研究甘草素、高糖、Exendin-4等藥物對間充質(zhì)干細(xì)胞的成骨分化的影響和作用。甘草素對脂肪組織的間充質(zhì)干細(xì)胞和骨髓的間充質(zhì)干細(xì)胞具有誘導(dǎo)成骨的能力,可以用于開發(fā)干預(yù)骨質(zhì)疏松預(yù)后治療的藥物[7];Exendin-4可以促進(jìn)牙周膜干細(xì)胞成骨分化,而且Exendin-4可以減輕高糖對牙周膜干細(xì)胞成骨分化的抑制作用,為治療糖尿病牙周炎提供新思路[8];高糖可以促進(jìn)根尖乳頭干細(xì)胞成牙/成骨分化[9]。

2)干細(xì)胞在骨損傷修復(fù)方面的研究。該主題包括的主題詞有:間充質(zhì)干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、間充質(zhì)干細(xì)胞/代謝、間充質(zhì)干細(xì)胞移植、間充質(zhì)干細(xì)胞/生理學(xué)、組織支架/化學(xué)、組織工程方法、成骨、間充質(zhì)干細(xì)胞移植/方法、骨髓細(xì)胞/細(xì)胞學(xué),其中心詞為間充質(zhì)干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)。

主要研究修復(fù)骨損傷的方法,多種化學(xué)物質(zhì)對間充質(zhì)干細(xì)胞成骨的引導(dǎo)作用。通過研究化學(xué)物質(zhì)對成骨的影響,發(fā)現(xiàn)骨組織工程的移植材料,構(gòu)建骨組織工程,促進(jìn)骨損傷的修復(fù)。如,發(fā)現(xiàn)有助于骨損傷修復(fù)和骨組織構(gòu)建的化學(xué)物質(zhì)[10];異體脂肪干細(xì)胞聯(lián)合異種脫蛋白骨和三維打印支架具有修復(fù)較大骨損傷的潛力[11];四氧嘧啶對骨髓造血參數(shù)的影響有助于骨組織的構(gòu)建[12]。

3.1.2干細(xì)胞再生方面的研究 該主題包括的主題詞有:干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、干細(xì)胞/代謝、脂肪組織/細(xì)胞學(xué)、細(xì)胞分化/生理學(xué)、干細(xì)胞/生理學(xué)、干細(xì)胞移植、干細(xì)胞、干細(xì)胞移植/方法、再生,其中心詞為干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)。

主要研究干細(xì)胞再生的應(yīng)用。發(fā)現(xiàn)聽覺再生等多種潛在的可以應(yīng)用于臨床的干細(xì)胞的再生應(yīng)用,通過深入研究,將其潛在的再生應(yīng)用,擴(kuò)展到臨床再生領(lǐng)域;同時(shí)加大對脂肪源性干細(xì)胞的研究,使其能夠產(chǎn)生現(xiàn)實(shí)的應(yīng)用價(jià)值。如,發(fā)現(xiàn)存在于嗅黏膜中的嗅源性干細(xì)胞在原發(fā)性或繼發(fā)性聽神經(jīng)變性的聽覺再生的潛在應(yīng)用[13];人肌源性儲備細(xì)胞可以促進(jìn)骨骼肌損傷后的再生[14];脂肪源性干細(xì)胞是再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域非常有前景的細(xì)胞[15]。

3.1.3干細(xì)胞分化方面的研究 該主題包括的主題詞有細(xì)胞分化、誘導(dǎo)多能干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、誘導(dǎo)多能干細(xì)胞/代謝、神經(jīng)干細(xì)胞/代謝、神經(jīng)干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、多能干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、細(xì)胞分化/遺傳學(xué)、細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)/方法、多能干細(xì)胞/代謝、胚胎干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、胚胎干細(xì)胞/代謝,其中心詞為多能干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)。

主要研究多能干細(xì)胞的細(xì)胞分化。發(fā)現(xiàn)多能干細(xì)胞的研究主要在神經(jīng)細(xì)胞、神經(jīng)干細(xì)胞等方面,與神經(jīng)的聯(lián)系密切。如,發(fā)現(xiàn)人類多能干細(xì)胞源性神經(jīng)前體細(xì)胞具有擴(kuò)增和神經(jīng)元分化的作用[16];NF-κB參與神經(jīng)前體細(xì)胞成熟必需的多方面代謝過程[17];mRNA和rRNA協(xié)同控制胚胎干細(xì)胞的多能性和分化[18]。

3.1.4干細(xì)胞在腫瘤領(lǐng)域的研究 該主題包括的主題詞有腫瘤干細(xì)胞/代謝、腫瘤干細(xì)胞/病理學(xué)、造血干細(xì)胞/代謝、腫瘤干細(xì)胞/藥物效應(yīng)、造血干細(xì)胞/細(xì)胞學(xué)、microRNAs/遺傳學(xué)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞增殖、microRNAs/代謝、基因表達(dá)調(diào)控,其中心詞為腫瘤干細(xì)胞/代謝。

主要研究腫瘤中的mRNAs對干細(xì)胞的影響和作用。mRNAs對干細(xì)胞主要起抑制作用,通過對mRNAs的研究,可以更清晰的了解其在腫瘤發(fā)生中的作用,有助于提高對腫瘤和腫瘤干細(xì)胞的認(rèn)識。通過研究可知,miR-34c可以與Notch1形成一個(gè)調(diào)控環(huán),該調(diào)控環(huán)可以抑制肌肉發(fā)育[19];miR-17-92簇在非限制性體細(xì)胞干細(xì)胞中有抑制基因表達(dá)的作用[20];1型干擾素受體IFNAR1鏈的下調(diào)有助于造血干細(xì)胞的維持[21]。

3.2 研究主題戰(zhàn)略坐標(biāo)分析

3.2.1繪制戰(zhàn)略坐標(biāo)圖 戰(zhàn)略坐標(biāo)圖用來分析某個(gè)領(lǐng)域的各方面知識的研究現(xiàn)狀,能夠反映某一領(lǐng)域研究內(nèi)容的內(nèi)部聯(lián)系情況以及相互影響[22]。戰(zhàn)略坐標(biāo)圖是根據(jù)各個(gè)類團(tuán)的密度和向心度兩個(gè)指標(biāo)生成的。密度反映類團(tuán)內(nèi)部聯(lián)系的強(qiáng)度,向心度反映某一類團(tuán)與其他類團(tuán)間聯(lián)系的強(qiáng)度。根據(jù)聚類結(jié)果與相似矩陣計(jì)算出密度和向心度。見表2。

表2 密度值和向心度值

以向心度和密度的均值為原點(diǎn),以向心度為橫坐標(biāo),密度為縱坐標(biāo),得到戰(zhàn)略坐標(biāo)圖。見圖2。

圖2 國外干細(xì)胞研究領(lǐng)域的戰(zhàn)略坐標(biāo)

3.2.2基于戰(zhàn)略坐標(biāo)圖的主題分析 1)核心研究主題。戰(zhàn)略坐標(biāo)圖的第一象限為核心研究主題。由圖2可知,類團(tuán)1(干細(xì)胞在骨損傷修復(fù)方面的研究)位于該象限,向心度和密度都較高,表明該主題與其他主題關(guān)系緊密,在研究中較為活躍,研究較為成熟,是干細(xì)胞研究領(lǐng)域的核心主題。

2)獨(dú)立研究主題。第二象限為獨(dú)立研究主題。由圖2可知,類團(tuán)3(干細(xì)胞分化方面的研究)位于該象限,向心度低但密度較高。表明該主題與其他主題關(guān)系較松散,但與同類團(tuán)的其他主題詞關(guān)系緊密,研究較為成熟,是干細(xì)胞研究領(lǐng)域中的獨(dú)立主題。說明在干細(xì)胞研究領(lǐng)域,對細(xì)胞分化的研究相對成熟,但因?yàn)榕c其他主題聯(lián)系不緊密,生命力不強(qiáng),可能會因?yàn)榫窒扌远А?/p>

3)邊緣研究主題。第三象限為邊緣研究主題。由圖2可知,類團(tuán)0(藥物對間充質(zhì)干細(xì)胞成骨的影響)和類團(tuán)4(干細(xì)胞在腫瘤領(lǐng)域的研究)位于該象限,向心度和密度都比較低。表明主題與其他主題關(guān)系松散,并且類團(tuán)內(nèi)主題詞關(guān)系也較為松散,發(fā)展不夠成熟,是干細(xì)胞研究領(lǐng)域的邊緣主題。

4)潛力研究主題。第四象限為潛力研究主題。由圖2可知,類團(tuán)2(干細(xì)胞再生方面的研究)位于該象限,向心度高但密度較低。表明此主題與其他主題關(guān)系緊密,但主題內(nèi)主題詞關(guān)系較為松散,研究表現(xiàn)活躍,但發(fā)展不夠成熟,是干細(xì)胞領(lǐng)域的潛力主題。表明干細(xì)胞再生領(lǐng)域的研究若引起關(guān)注,加強(qiáng)研究,有潛力發(fā)展為核心主題。

4 討論

通過對干細(xì)胞領(lǐng)域的高頻主題詞進(jìn)行聚類分析,可以將近三年此領(lǐng)域的研究主題分為5類,結(jié)合戰(zhàn)略坐標(biāo)圖可以得出,干細(xì)胞在骨損傷修復(fù)方面的研究是當(dāng)前的核心研究主題,研究較為成熟且活躍,占有重要地位;藥物對間充質(zhì)干細(xì)胞成骨的影響與干細(xì)胞在腫瘤領(lǐng)域的研究為邊緣研究主題,受關(guān)注程度較低,研究不成熟,與其他類團(tuán)主題聯(lián)系不廣泛;干細(xì)胞再生領(lǐng)域的研究為潛力研究主題,研究活躍但不成熟;干細(xì)胞分化方面的研究為獨(dú)立研究主題,與其他主題的聯(lián)系相對較弱。

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