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PCR實驗室的污染及其防范措施

2021-01-11 15:45楊蓮辭常定發(fā)
山東畜牧獸醫(yī) 2021年3期
關(guān)鍵詞:離心機消毒液試劑

陳 永,楊蓮辭,常定發(fā)

(1.云南省瀘西縣動物疫病預(yù)防控制中心,云南 瀘西 652400;2.云南省瀘西縣動物衛(wèi)生監(jiān)督所,云南 瀘西)

隨著動物疫病檢測需求增加,PCR基因擴增實驗室業(yè)務(wù)量有所加大。開展PCR檢測,很可能會出現(xiàn)實驗室污染,影響實驗質(zhì)量和效果,造成假陽性,同時也會給實驗人員健康造成損害。

1 PCR實驗室污染檢測評估

(1)因PCR檢測的樣品及其產(chǎn)物污染無色無味,主觀很難判斷,應(yīng)定期對實驗室操作臺、地板、設(shè)備、器具等采集棉拭子樣進行檢測,評估是否存在污染。樣品要規(guī)范編號記錄,以便追溯。(2)查看實驗室最近疑似污染實驗檢測報告,看陰性對照(水)Ct值(反應(yīng)管內(nèi)營光信號達到設(shè)定的值時所經(jīng)過的循環(huán)數(shù))。陰性對照(水)Ct>38,輕微污染;35<Ct<38,中等污染;Ct<35,嚴(yán)重污染。如只是陰性對照污染,樣品中仍有陰性,則可能是樣品交叉污染或操作不當(dāng),通過規(guī)范仔細的重復(fù)操作以避免污染。如所有的曲線都呈陽性,而且陰性對照和許多標(biāo)本的線性相似,則考慮是系統(tǒng)污染,如檢測試劑污染或氣溶膠污染。(3)試劑對照:在PCR試劑中不加模板DNA或RNA,進行PCR擴增,以監(jiān)測試劑是否污染。

2 污染的來源

2.1 陽性樣本或陽性樣本核酸的污染 此類污染多發(fā)生于樣品處理間,造成樣品間的污染。在采集的樣品中,如存在陽性樣品,在樣品的采集、放置、運輸?shù)倪^程中,由于封裝不嚴(yán)溢出于容器外,導(dǎo)致污染容器、樣品的交叉污染等;實驗過程中,移液器使用不當(dāng),吸液時回槍手速過快導(dǎo)致的移液器槍頭部分被陽性樣本污染;樣品加熱裂解核酸后,立即打開儀器熱蓋,反應(yīng)管突然遇冷導(dǎo)致崩開,濺出核酸;核酸釋放后,未離心,管蓋上有液體,濺出導(dǎo)致的污染;吸取陽性對照的槍頭,處理不當(dāng)造成的污染;由于通風(fēng)不良,病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導(dǎo)致交叉污染。

2.2 陽性對照的污染 在使用陽性對照時,未離心,導(dǎo)致陽性對照泄漏,造成的污染;吸取陽性對照的槍頭,處理不當(dāng)造成的污染。陽性對照的泄露易造成試劑的污染。

2.3 PCR擴增產(chǎn)物污染 擴增過程中或擴增結(jié)束后,PCR管蓋未蓋嚴(yán)或崩開導(dǎo)致擴增產(chǎn)物泄露,造成的污染。因為PCR產(chǎn)物拷貝量大,擴增后的PCR管開蓋等動作容易產(chǎn)生氣溶膠,極微量的PCR產(chǎn)物污染,就可造成假陽性。

3 防范污染的措施

進行PCR檢測操作時,操作人員應(yīng)該嚴(yán)格遵守操作規(guī)程,最大程度地降低可能出現(xiàn)的PCR檢測過程中的污染。

3.1 劃分操作區(qū) 實驗操作在三個不同的區(qū)域內(nèi)進行,試劑配制、樣品處理和擴增要在不同的隔離區(qū)內(nèi)進行:(1)試劑準(zhǔn)備間:配置試劑、加陰性對照,要有單獨的一套移液槍、離心機、耗材,試劑配制應(yīng)在獨立的生物安全柜內(nèi)進行。該區(qū)域不做任何跟樣本相關(guān)的操作,嚴(yán)禁跟樣本相關(guān)的任何物品進入。(2)樣本處理間:樣本處理、核酸提取、加樣本核酸、陽性對照等。要有單獨的一套移液槍、離心機、耗材等。樣本提取應(yīng)在獨立的生物安全柜內(nèi)進行。該區(qū)域主要處理樣品,嚴(yán)禁帶未消毒的設(shè)備進入樣本處理間。(3)PCR擴增區(qū)及分析間:放置PCR儀、電腦及打印機等設(shè)備。任何一間的器材獨立使用,不要拿到其他兩個工作間。

3.2 實驗人員操作規(guī)范 (1)操作前佩戴好個人防護用品,用核酸祛除劑噴灑移液器、吸頭盒等,并放入生物安全柜中。(2)實驗人員操作時要穿戴各區(qū)間的專用工作服、手套、口罩等,完成一項操作或發(fā)現(xiàn)污染及時更換手套。實驗完成離開實驗室,更換工作服,脫掉手套、口罩等,嚴(yán)禁將工作服穿出實驗室外。(3)對一些活毒樣品在提取前,應(yīng)將樣品用60 ℃ 水浴滅活處理不少于30 min,防止活病毒造成污染和擴散。(4)吸頭盒不用時保持關(guān)閉狀態(tài),避免吸完樣品,特別是陽性對照的吸頭經(jīng)過時造成污染。(5)取樣、加液前,應(yīng)做瞬時離心,將管蓋、管壁上液體完全沉于管底。開蓋時動作要輕緩,防止液體濺出。使用移液器時要注意快壓慢放或使用帶濾芯的吸頭,防止液體污染移液器管頭。(6)實驗過程中最先加陰性對照,蓋好蓋子后再加待檢核酸,最后加陽性對照。用后的廢吸頭、其它廢棄物品、污染物等集中放入裝有10 % 84消毒液的廢液缸內(nèi),消毒液要能完全浸泡廢棄物品。(7)PCR擴增完成后,如無必要,盡量不要打開或少打開反應(yīng)體系,如必須打開,應(yīng)在獨立專用區(qū)域內(nèi)進行。

4 污染的處理

4.1 輕度污染的處理 PCR板、八聯(lián)管板、離心機轉(zhuǎn)子用50 % 84消毒液浸泡30 min,反復(fù)幾次。操作臺面先酒精擦拭,再用30 % 84消毒液反復(fù)擦拭幾次,每次實驗前后都要用酒精對所有的操作臺面、移液槍、離心機進行擦拭。地面用30 % 84消毒水進行擦拭,1~2次/d。實驗環(huán)境通風(fēng)、紫外線燈照射。經(jīng)過以上方法處理,污染基本可以1周左右消除。

4.2 中度和重度污染的處理 (1)評估污染源頭:評估是環(huán)境污染、器材污染(尤其是移液槍和離心機)還是試劑盒污染。①準(zhǔn)備一套新的移液槍、離心機、耗材、試劑盒。②用新的移液槍和原來試劑在新的環(huán)境配2個陰性對照上機擴增,如果沒有污染,說明試劑盒沒有問題;如果有污染,說明試劑盒有污染。用新的移液槍和新的試劑盒在原來環(huán)境配2個陰性對照上機擴增,如果沒有污染,說明環(huán)境沒有問題;如果有污染,說明環(huán)境有污染。用原來移液槍和新的試劑盒在新的環(huán)境配2個陰性對照上機擴增,如果沒有污染,說明移液槍沒有問題;如果有污染,說明移液槍有污染。(2)不同污染的處理:①器材污染:移液器污染移液槍不帶槍頭吸酒精,并把槍柄部分浸泡在酒精中,目的是使有機物溶解。再用移液槍不帶槍頭吸清水,反復(fù)幾次,目的是把酒精及有機物清洗掉,之后用移液槍不帶槍頭吸50 % 84消毒水,反復(fù)幾次,并停留30 min,最后用移液槍不帶槍頭吸清水,反復(fù)幾次,目的是把84消毒水清洗掉。以上操作重復(fù)幾次,再用三把移液器不帶槍頭吸清水,把清水當(dāng)作樣品進行檢測,評估污染是否消除。離心板架或者八聯(lián)管板架污染,使用酒精浸泡后,再用清水清洗干凈,之后再用30 % 84消毒水浸泡30 min以上,最后再用清水清洗干凈,多重復(fù)幾次。離心機污染,使用酒精擦拭后,用清水反復(fù)擦拭,轉(zhuǎn)子用50 % 的84消毒液浸泡,再用清水洗干凈,晾曬干,再用棉簽取離心機拭子檢測,評估污染是否解除。②試劑盒污染,封存,用新的試劑盒實驗。③環(huán)境污染,30 % 84消毒液擦拭操作臺面2~3次,次數(shù)可根據(jù)實際情況增減。設(shè)備門把手、門窗把手和外部區(qū)域10 % 84消毒液擦拭2~3次。所有垃圾能用消毒水浸泡的浸泡,不能浸泡的無害化處理。地面采用拖把沾50 % 84消毒液進行反復(fù)拖地,1~2次/d。有紫外線的設(shè)備開啟紫外線燈照射30 min,房間內(nèi)進行紫外線長時間照射消毒,每天進行 。環(huán)境保持通風(fēng),降低氣溶膠的蓄積,如果通風(fēng)不暢的可采取風(fēng)扇機械通風(fēng)。處理后采集環(huán)境樣品進行檢測,評估污染是否消除。

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