黃運福,貢莎莎,孟慶玲*,喬 軍 ,張國武,王熙鳳,才學鵬
(1.石河子大學動物科技學院,新疆 石河子 832003; 2.中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京 100081)
捕食線蟲性真菌(nematode-trapping fungi)是一類通過產(chǎn)生復雜的捕食結(jié)構(gòu)來捕獲和殺死線蟲的絲狀真菌,也是自然界中線蟲重要的天敵和生防資源[1]。少孢節(jié)叢孢菌(Arthrobotrysoligospora)是捕食線蟲性真菌中極具應(yīng)用潛力的代表菌,是研究最多、應(yīng)用最廣的生防真菌之一[2]。目前,對少孢節(jié)叢孢菌的分子背景研究較為清楚,其全基因組的測序成功[3]為在分子水平研究少孢節(jié)叢孢菌以及菌株改造奠定了基礎(chǔ)。
遺傳轉(zhuǎn)化是進行新基因功能研究和菌種改良的重要手段。絲狀真菌轉(zhuǎn)化方法有CaCl2-PEG介導轉(zhuǎn)化法、電擊轉(zhuǎn)化法、限制酶介導整合法、醋酸鋰轉(zhuǎn)化法、基因槍法等,但這些轉(zhuǎn)化方法或涉及原生質(zhì)體的制備和再生,或花費高昂、應(yīng)用范圍窄,或轉(zhuǎn)化效率低、遺傳不穩(wěn)定等,這些不足限制了它們在真菌研究中的應(yīng)用[4]。根癌農(nóng)桿菌介導的轉(zhuǎn)化法(Agrobacteriumtumefaciens-mediated transformation,ATMT)利用農(nóng)桿菌將供體質(zhì)粒中轉(zhuǎn)移的DNA(T-DNA)插入到宿主基因組中,具有操作簡單、受體廣泛、單拷貝插入、轉(zhuǎn)化效率高和遺傳穩(wěn)定等優(yōu)點,因此成為絲狀真菌遺傳轉(zhuǎn)化的有效方法[5]。ATMT技術(shù)已經(jīng)成功應(yīng)用于黃曲霉菌[6]、指狀青霉菌[7]、雙孢蘑菇[8]等多種絲狀真菌的轉(zhuǎn)化。目前,少孢節(jié)叢孢菌成熟的遺傳轉(zhuǎn)化方法為以原生質(zhì)體為受體的CaCl2-PEG介導法[9]和限制酶介導整合法[10-11],但以原生質(zhì)體為受體的轉(zhuǎn)化本身具有的缺點限制了它的應(yīng)用,因此探索并建立一套高效穩(wěn)定的遺傳轉(zhuǎn)化體系對于少孢節(jié)叢孢菌的分子生物學研究具有重要意義。本研究擬利用ATMT技術(shù)轉(zhuǎn)化少孢節(jié)叢孢菌并優(yōu)化其轉(zhuǎn)化體系,為少孢節(jié)叢孢菌功能新基因的研究及菌株改良奠定基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株和質(zhì)粒 少孢節(jié)叢孢菌新疆分離株XJ-A1、EscherichiacoliDH5α菌株、根癌農(nóng)桿菌AGL-1、EHA105和GV3101菌株、pAN7-1質(zhì)粒、pCAMBIA1304質(zhì)粒、pMD19-PtrpC質(zhì)粒,石河子大學動物科技學院預防獸醫(yī)學實驗室(以下簡稱本實驗室)保存;真菌表達載體pCAMBIA1304'-PgpdA,本實驗室構(gòu)建。
1.1.2 主要試劑 限制性內(nèi)切酶、pMD19-T(simple)、DNA標準DL 10 000,寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;Biospin真菌基因組DNA提取試劑盒,杭州博日科技有限公司產(chǎn)品;2×TaqPCR Mix,廣州東盛生物科技有限公司產(chǎn)品; DNA標準DL 600、DNA標準DL 2 000、DNA標準DL 5 000、DNA標準DL 15 000,北京全式金生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品;質(zhì)粒小提試劑盒、瓊脂糖凝膠電泳回收試劑盒,天根生化科技(北京)有限公司產(chǎn)品;GUS染色試劑,北京華越洋生物科技有限公司產(chǎn)品;利福平、頭孢霉素、卡那霉素、乙酰丁香酮,Sigma公司產(chǎn)品;潮霉素,Roche公司產(chǎn)品;其他化學試劑均為國產(chǎn)分析純;LB培養(yǎng)基、PDA培養(yǎng)基、基礎(chǔ)培養(yǎng)基(MM)、誘導培養(yǎng)基(IM)及共培養(yǎng)基(CM)按照常規(guī)方法制備。
1.1.3 主要儀器設(shè)備 恒溫搖床(ZHWY-2102C),PCR儀(TC4000),真菌培養(yǎng)箱(MJX280),恒溫培養(yǎng)箱(HIQ-X100),振蕩培養(yǎng)箱(ZHWY-2102C),常規(guī)離心機(Beckmanmicrofuge16),瓊脂糖水平電泳儀(DYCP-31DN),凝膠成像儀(Bio-Rad),全波長酶標儀(Thermo,MuLtiskanGO),生物顯微鏡(CX21BIM)。
1.2.1 少孢節(jié)叢孢菌對潮霉素選擇壓敏感性測定 將少孢節(jié)叢孢菌接種于PDA固體培養(yǎng)基上,于28 ℃培養(yǎng)14 d后收集分生孢子,吸取10 μL孢子懸浮液滴于含有0、50、100、150、200 mg/L潮霉素的PDA固體培養(yǎng)基,于28 ℃培養(yǎng)7 d后觀察真菌生長情況。
1.2.2 真菌表達載體的構(gòu)建 通過融合PCR獲得PtrpC-hph片段。以pMD19-PtrpC質(zhì)粒為模板,克隆363 bp的PtrpC啟動子序列(引物:PtrpCF:5'-CGAGCTCTACGTACAGAAGATGATATTG-3' ; PtrpCR: 5'-CGCGGTGAGTTCAGGCATATGCTTGGGTAGAATAGG-3',上游引物引入SacⅠ酶切位點)。以質(zhì)粒pAN7-1為模板,克隆1 020 bp的潮霉素磷酸轉(zhuǎn)移酶基因hph序列(引物:hphF:5'-CCTATTCTACCCAAGCATATGCCTGAACTCA
CCGCG-3';hphR:5'-CCTCGAGCTATTCCTTTGCCCTCGG-3',下游引物引入XhoⅠ酶切位點)。再以PtrpC和hph片段為模板,用引物PtrpCF和hphR進行PCR擴增得到PtrpC-hph片段,克隆至pMD19-T載體。對測序正確的質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶SacⅠ和XhoⅠ進行雙酶切得到PtrpC-hph片段,與同樣用限制性內(nèi)切酶SacⅠ和XhoⅠ雙酶切質(zhì)粒pCAMBIA1304得到的大片段連接,構(gòu)建出真菌表達載體pCAMBIA1304'。
以質(zhì)粒pAN7-1為模板,克隆2 129 bp的PgpdA啟動子序列(引物:PgpdAF:5'-GCTCTAGAGAATTCCCTTGTATCTCTACAC-3';PgpdAR:5'-CATGCCATGGGAAAAGAAAGAGAAAAG-3',上游引物引入XbaⅠ酶切位點,下游引物引入NcoⅠ酶切位點),克隆至pMD19-T載體。對測序正確的質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶XbaⅠ和NcoⅠ進行雙酶切得到PgpdA啟動子片段,與同樣用限制性內(nèi)切酶XbaⅠ和NcoⅠ雙酶切質(zhì)粒pCAMBIA1304'得到的大片段連接,構(gòu)建出真菌表達載體pCAMBIA1304'-PgpdA,用限制性內(nèi)切酶SacⅠ和XhoⅠ、XbaⅠ和NcoⅠ進行雙酶切鑒定。
表達載體pCAMBIA1304'-PgpdA通過凍融法轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌,對在含有100 mg/L卡那霉素的LB固體培養(yǎng)基上生長的單克隆菌株通過PCR擴增hph基因進行驗證。
1.2.3 根癌農(nóng)桿菌介導的少孢節(jié)叢孢菌遺傳轉(zhuǎn)化 農(nóng)桿菌介導的少孢節(jié)叢孢菌遺傳轉(zhuǎn)化體系為:以農(nóng)桿菌AGL-1、EHA105和GV3101為浸染菌株,轉(zhuǎn)化受體為少孢節(jié)叢孢菌分生孢子,少孢節(jié)叢孢菌孢子懸浮液濃度為1×106個/mL和1×108個/mL,乙酰丁香酮濃度為200 μmol/L,共培養(yǎng)溫度為23 ℃和26 ℃,共培養(yǎng)時間為48 h和60 h。按以下步驟進行轉(zhuǎn)化:將含有表達載體pCAMBIA1304'-PgpdA的農(nóng)桿菌置于10 mL含有50 mg/L利福平和100 mg/L卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,28 ℃、200 r/min過夜培養(yǎng),收集菌體后用3 mL IM培養(yǎng)基重懸至濃度為OD 600 nm為0.15~0.2,繼續(xù)培養(yǎng)至OD 600 nm為0.5~1.0。取100 μL經(jīng)過預培養(yǎng)的農(nóng)桿菌菌液與少孢節(jié)叢孢菌孢子懸浮液等體積混合,涂布于CM培養(yǎng)基表面的微孔濾膜,置于避光環(huán)境進行共培養(yǎng)。
1.2.4 重組少孢節(jié)叢孢菌的篩選 將共培養(yǎng)基表面的微孔濾膜倒貼到含有400 mg/L頭孢霉素和150 mg/L潮霉素的PDA固體培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)24 h后用無菌鑷子輕輕揭掉微孔濾膜,繼續(xù)培養(yǎng)7 d~9 d。將長勢良好的少孢節(jié)叢孢菌轉(zhuǎn)接到新的含有400 mg/L頭孢霉素和150 mg/L潮霉素的PDA固體培養(yǎng)基上進行復篩。
1.2.5 重組少孢節(jié)叢孢菌的鑒定及遺傳穩(wěn)定性分析 按照杭州博日科技有限公司Biospin真菌基因組DNA提取試劑盒說明提取在含潮霉素抗性的PDA固體培養(yǎng)基上生長良好的少孢節(jié)叢孢菌的基因組DNA,擴增hph和gus基因進行驗證。將PCR檢測的陽性轉(zhuǎn)化子分別接種于PDA固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)7 d,從邊緣挑取菌絲接種于PDA固體培養(yǎng)基上進行5次傳代培養(yǎng),再次將少孢節(jié)叢孢菌轉(zhuǎn)化子轉(zhuǎn)入含150 mg/L潮霉素的PDA固體培養(yǎng)基上培養(yǎng),提取正常生長的轉(zhuǎn)化子基因組DNA,PCR擴增hph和gus基因進行驗證。
1.2.6 重組少孢節(jié)叢孢菌GUS活性分析 將轉(zhuǎn)化子及出發(fā)菌株分別接至PDA固體培養(yǎng)基上,培養(yǎng)4 d后切取菌塊進行GUS染色,將菌塊置于Ep管中,加入一定量的GUS染液將菌塊完全浸泡,于37 ℃閉光24 h,在顯微鏡下觀察染色結(jié)果。
對不同濃度潮霉素抗性PDA固體培養(yǎng)基上生長7 d的少孢節(jié)叢孢菌生長情況觀察,少孢節(jié)叢孢菌在潮霉素濃度為150 mg/L時完全停止生長,因此選擇150 mg/L作為篩選濃度(圖1)。
通過融合PCR擴增得到PtrpC-hph片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析,PtrpC啟動子序列約為363 bp(圖2A),PtrpC-hph片段約為1 383 bp(圖2B),hph基因約為1 020 bp(圖2C),PgpdA啟動子序列約為2 129 bp(圖2D)。將PtrpC-hph片段和PgpdA啟動子片段先后插入pCAMBIA1304質(zhì)粒得到真菌表達載體pCAMBIA1304'-PgpdA,表達載體經(jīng)限制性內(nèi)切酶SacⅠ和XhoⅠ、XbaⅠ和NcoⅠ雙酶切鑒定可得到大小約1 383 bp(圖3A)和2 129 bp(圖3B)的條帶,證實成功構(gòu)建了真菌表達載體。
將構(gòu)建的表達載體 pCAMBIA1304'-PgpdA通過凍融法轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌AGL-1、EHA105和GV3101后,各挑取2顆單菌落通過PCR擴增hph基因,證實質(zhì)粒成功轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中(圖4)。
A~E.0、50、100、150、200 mg/L
A.PtrpC;B.PtrpC-hph;C.hph;D.PgpdA;M1.DNA標準DL 600;M2.DNA標準DL 2 000;M3.DNA標準DL 5 000;1~3.PCR擴增產(chǎn)物;4.陰性對照
M1.DNA標準DL 15 000;M2.DNA標準DL 10 000;1.雙酶切對照;2.重組質(zhì)粒雙酶切(SacⅠ和Xho Ⅰ);3.雙酶切對照;4.重組質(zhì)粒雙酶切(XbaⅠ和Nco Ⅰ)
M.DNA 標準DL 2 000;1~2.GV3101;3~4.EHA105;5~6.AGL-1;7.陰性對照
揭掉微孔濾膜培養(yǎng)4 d后,發(fā)現(xiàn)含頭孢霉素和潮霉素抗性的PDA固體培養(yǎng)基上長出許多密集成片的真菌,繼續(xù)培養(yǎng)數(shù)天,結(jié)果農(nóng)桿菌AGL-1介導的轉(zhuǎn)化在1×106個/mL孢子懸浮液,共培養(yǎng)階段為23 ℃培養(yǎng)60 h的條件下有1株轉(zhuǎn)化子能正常生長,將其轉(zhuǎn)接至含150 mg/L潮霉素的PDA固體培養(yǎng)基培養(yǎng),其長勢良好(圖5A)。提取該菌株基因組DNA進行hph和gus基因的PCR檢測,結(jié)果能擴增出hph和gus基因片段(圖5B)。
少孢節(jié)叢孢菌轉(zhuǎn)化子在無潮霉素選擇壓力的PDA固體培養(yǎng)基上連續(xù)傳代培養(yǎng)5代次后,再次轉(zhuǎn)入含有150 mg/L潮霉素的培養(yǎng)基中進行培養(yǎng)。對轉(zhuǎn)化子提取基因組DNA進行hph和gus基因的PCR檢測,結(jié)果從轉(zhuǎn)化子可以擴增出hph和gus基因的目的條帶,表明hph和gus基因在重組少孢節(jié)叢孢菌中可以穩(wěn)定遺傳(圖6)。
A.菌落;B.PCR;a.出發(fā)菌株;b-c.假陽性菌株;d.陽性轉(zhuǎn)化子;M.DNA標準DL 2 000;1.hph基因;2.gus基因;3.陰性對照
M.DNA 標準DL 2 000;1.hph基因;2.gus基因;3.陰性對照
分別將轉(zhuǎn)化子和對照菌株接種到PDA固體培養(yǎng)基上,培養(yǎng)4 d后進行GUS染色。如圖7所示,出發(fā)菌株并未染色(圖7A),轉(zhuǎn)化子有明顯藍色(圖7B),表明gus基因被整合到少孢節(jié)叢孢菌基因組中并在PgpdA啟動子調(diào)控下正常表達。
Gus基因在許多真菌、細菌等微生物中很少或完全檢測不到活性,因此也應(yīng)用于如棉花黃萎病菌[12]、萊氏野村菌[13]和金針菇[14]等多種真菌的轉(zhuǎn)化試驗。Tunlid A等[10]通過限制酶介導整合法將攜帶gus基因的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化少孢節(jié)叢孢菌,在16株轉(zhuǎn)化子中有10株檢測到GUS活性,說明gus基因能做為少孢節(jié)叢孢菌轉(zhuǎn)化試驗的報告基因。
A.出發(fā)菌株;B.轉(zhuǎn)化子
ATMT是一種高效轉(zhuǎn)化絲狀真菌的有力工具,其介導的真菌遺傳轉(zhuǎn)化過程基本相同,但轉(zhuǎn)化效率取決于真菌受體、農(nóng)桿菌菌株類型、乙酰丁香酮的濃度、農(nóng)桿菌和真菌受體的比例以及共培養(yǎng)溫度和時間[15];此外,還受到孢子濃度、誘導培養(yǎng)基、培養(yǎng)方式、pH等因素的影響。通過優(yōu)化這些影響條件,很多真菌實現(xiàn)了更高的轉(zhuǎn)化率[16]。ATMT介導的少孢節(jié)叢孢菌轉(zhuǎn)化甚少報道,劉瑞[17]利用 ATMT技術(shù)在以孢子懸浮液、菌塊懸浮液、菌絲溶液和原生質(zhì)體溶液為受體,農(nóng)桿菌AGL-1為浸染菌株,孢子濃度為1×105個/mL,共培養(yǎng)條件為22 ℃培養(yǎng)48 h的轉(zhuǎn)化體系對少孢節(jié)叢孢菌云南株YMF1.1883進行轉(zhuǎn)化,結(jié)果獲得了3株轉(zhuǎn)化子。在本研究中,經(jīng)過多次重復試驗,農(nóng)桿菌AGL-1介導的轉(zhuǎn)化在1×106個/mL孢子懸浮液,共培養(yǎng)階段為23 ℃培養(yǎng)60 h的條件下獲得了1株轉(zhuǎn)化子。盡管優(yōu)化的轉(zhuǎn)化體系不盡相同,但轉(zhuǎn)化率基本相同,與利用限制酶介導整合法轉(zhuǎn)化少孢節(jié)叢孢菌獲得35個/μg DNA[11]的最大轉(zhuǎn)化率相比,ATMT介導的少孢節(jié)叢孢菌遺傳轉(zhuǎn)化可能更難以實現(xiàn),這可能是由影響ATMT轉(zhuǎn)化效率的多種因素造成的,也可能是少孢節(jié)叢孢菌不適合采用ATMT進行轉(zhuǎn)化,這有待于進一步研究。
本研究利用ATMT對少孢節(jié)叢孢菌進行了轉(zhuǎn)化,證實ATMT可以應(yīng)用于少孢節(jié)叢孢菌的轉(zhuǎn)化,為少孢節(jié)叢孢菌的生防機制、遺傳轉(zhuǎn)化及菌株改良等研究奠定了基礎(chǔ)。