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軍團(tuán)菌檢測(cè)方法研究進(jìn)展*

2021-03-26 06:43夏蘭蘭宿振國(guó)綜述審校
關(guān)鍵詞:軍團(tuán)菌抗原靈敏度

夏蘭蘭,宿振國(guó) 綜述,王 濤△ 審校

1.濱州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,山東濱州 256600;2.濱州醫(yī)學(xué)院煙臺(tái)附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,山東煙臺(tái) 264000

軍團(tuán)菌是一類革蘭陰性菌,1976年在美國(guó)費(fèi)城召開退伍軍人大會(huì)期間,暴發(fā)了一種不明原因的肺炎,稱軍團(tuán)病,次年分離出該病的病原菌,故而得名軍團(tuán)菌,由該菌引起的疾病稱軍團(tuán)菌病。軍團(tuán)菌專性需氧,廣泛存在于自然界,特別是水中,適宜生長(zhǎng)溫度為25~37 ℃,但也可在高于或低于該溫度范圍的環(huán)境中生存,甚至可在限制生長(zhǎng)的溫度如<20 ℃或>55 ℃條件下存活[1]。該菌為一種機(jī)會(huì)致病菌,可以氣溶膠形式存在于空氣中,當(dāng)人體免疫功能低下時(shí),由呼吸道侵入機(jī)體,到達(dá)肺泡或終末細(xì)支氣管部位生長(zhǎng)及繁殖,從而導(dǎo)致軍團(tuán)菌病。目前,已確認(rèn)的軍團(tuán)菌屬有58種,共70個(gè)血清型,能引起約28種人類疾病,其中對(duì)人致病的主要是嗜肺軍團(tuán)菌[2]。軍團(tuán)菌病在臨床上可分為肺炎型、肺外感染型及流感樣型。肺炎型又稱軍團(tuán)菌肺炎,是軍團(tuán)菌病的主要類型,該病起病急,發(fā)展快,病情重,救治不及時(shí)可導(dǎo)致死亡;肺外感染型是指感染從肺部播散,導(dǎo)致腦、腎、肝等多器官感染;流感樣型又稱龐蒂亞克熱,是一種自限性疾病[3]。因臨床上大多數(shù)軍團(tuán)菌肺炎患者早期臨床癥狀為乏力、肌肉疼痛、頭痛,發(fā)熱伴寒戰(zhàn)、咳嗽,有少量黏痰,與其他病原體引起的非典型性肺炎相似,所以很難與其他病原體引起的肺炎相區(qū)別,從而造成病死率較高,甚至引起暴發(fā)流行[4]。因此,早期、快速、準(zhǔn)確地檢測(cè)出軍團(tuán)菌,對(duì)疾病的診斷、治療及降低病死率有重要意義。軍團(tuán)菌用吉姆薩染色時(shí)菌體呈紅色,活體組織標(biāo)本用鍍銀染色法染色后菌體呈黑褐色,但標(biāo)本直接涂片鏡檢的意義不大,本文不做贅述。軍團(tuán)菌檢測(cè)的方法較多,包括病原菌的分離鑒定、免疫學(xué)檢測(cè)方法、核酸檢測(cè)方法等,本文就這些方法進(jìn)行簡(jiǎn)要敘述。

1 病原菌的分離鑒定

1.1細(xì)菌培養(yǎng)法 細(xì)菌培養(yǎng)法是診斷軍團(tuán)菌病的金標(biāo)準(zhǔn),其特異度為100%,靈敏度為50%~80%[5]。軍團(tuán)菌檢測(cè)標(biāo)本可通過采集痰液、下呼吸道分泌物、支氣管灌洗液、胸腔積液、血液等來獲取,采集時(shí)注意避免氣溶膠形成。但軍團(tuán)菌生長(zhǎng)對(duì)營(yíng)養(yǎng)要求苛刻,在普通培養(yǎng)基、血瓊脂平板、巧克力瓊脂平板上均不生長(zhǎng),常用活性炭-酵母浸出液瓊脂(BCYE)培養(yǎng)基培養(yǎng),且生長(zhǎng)速度緩慢,一般需3~5 d,長(zhǎng)則需7~14 d,菌落呈圓形、凸起、灰白色,有光澤,某些菌型在紫外線照射下可發(fā)出熒光,在富含L-絡(luò)氨酸-苯丙氨酸瓊脂平板上產(chǎn)生棕色水溶性色素,活的不可培養(yǎng)軍團(tuán)菌的存在及在培養(yǎng)基上過度生長(zhǎng)的其他菌會(huì)影響培養(yǎng)法的檢測(cè)結(jié)果。細(xì)菌培養(yǎng)法對(duì)技術(shù)人員要求較高,且操作繁瑣,培養(yǎng)時(shí)間長(zhǎng),故不能快速得到結(jié)果,不利于軍團(tuán)菌病的診治。隨著現(xiàn)代技術(shù)的創(chuàng)新,研究者已陸續(xù)研制出改良的細(xì)菌培養(yǎng)法,可提高培養(yǎng)成功率,如2011年朱兵清等[6]在 BCYE培養(yǎng)基中添加了可抑制環(huán)境水樣中雜菌的抗菌藥物,提高了嗜肺軍團(tuán)菌的分離率。同時(shí)細(xì)菌培養(yǎng)法也有不可替代的優(yōu)點(diǎn),如發(fā)現(xiàn)新菌種等[7]??傊?,當(dāng)臨床懷疑患者為軍團(tuán)菌病時(shí),細(xì)菌培養(yǎng)法是不可或缺的一種檢測(cè)手段。

1.2質(zhì)譜分析技術(shù) 細(xì)菌的傳統(tǒng)手工鑒定步驟為分離純化獲得待鑒定菌株,涂片及革蘭染色鏡檢,根據(jù)革蘭染色性質(zhì)和菌株形態(tài),輔以氧化酶、觸酶、動(dòng)力、鞭毛染色、氧化發(fā)酵等試驗(yàn),對(duì)鑒定細(xì)菌進(jìn)行初步分群或分科(屬),再繼續(xù)應(yīng)用最小數(shù)量的其他試驗(yàn),逐步縮小鑒定范圍,直至最終獲得鑒定結(jié)果。傳統(tǒng)手工鑒定法步驟繁瑣,周期長(zhǎng),且對(duì)操作人員技術(shù)要求高。近年來,基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜檢測(cè)技術(shù)在臨床微生物檢驗(yàn)中的應(yīng)用越來越廣泛,使用質(zhì)譜儀可以大大縮短細(xì)菌鑒定時(shí)間,并提高準(zhǔn)確性,更有利于臨床抗菌藥物的使用,做到早診斷、早治療,提高患者的生存率。李曲文等[8]應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜對(duì)10株軍團(tuán)菌進(jìn)行菌株蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析比對(duì),鑒定出8株為嗜肺軍團(tuán)菌,1株為米克戴德軍團(tuán)菌,1株為茴香軍團(tuán)菌,此方法簡(jiǎn)便、快速、成本低,不足之處是需要進(jìn)一步規(guī)范標(biāo)本處理、質(zhì)譜圖采集和分析等過程,同時(shí)需要不斷完善數(shù)據(jù)庫(kù)和分析軟件。

2 免疫學(xué)檢測(cè)方法

2.1尿抗原檢測(cè) 有研究通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)在感染軍團(tuán)菌24 h后尿中可出現(xiàn)抗原[9]。軍團(tuán)菌的外膜蛋白、脂多糖和多種蛋白酶可造成肺組織損傷,尿抗原檢測(cè)針對(duì)的靶標(biāo)即為細(xì)菌脂多糖。自20世紀(jì)90年代中期引入尿抗原檢測(cè)后,其逐漸成為軍團(tuán)菌病的主要診斷方法,占軍團(tuán)菌診斷試驗(yàn)的70%~80%,包括酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)、放射免疫分析,以及最近發(fā)展的酶免疫分析(EIA)等,但這些方法主要對(duì)嗜肺軍團(tuán)菌血清(Lp)1型敏感[10]。由于軍團(tuán)菌病患者的標(biāo)本可用性較低,因此對(duì)不同類型菌株的尿抗原檢測(cè)評(píng)價(jià)仍然比較困難。2017年有研究通過比較Binax?EIA(軍團(tuán)菌尿EIA)、BinaxNOW?(軍團(tuán)菌抗原檢測(cè))、Sofia?FIA(軍團(tuán)菌熒光免疫分析)3種試劑盒的靈敏度,發(fā)現(xiàn)對(duì)于Lp1型,Sofia?FIA和Binax?EIA檢測(cè)限相似,BinaxNOW?低于其他兩種試劑盒,且與Lp1型相比,這3種試劑盒對(duì)Lp2~Lp15型的檢測(cè)水平均較低。由此可見,這3種試劑盒對(duì)不同嗜肺軍團(tuán)菌血清型的檢測(cè)性能不同[11]。

作為現(xiàn)在軍團(tuán)菌檢測(cè)主要方法之一,尿抗原檢測(cè)具有諸多優(yōu)點(diǎn),如抗原出現(xiàn)時(shí)間早,約88%的軍團(tuán)菌病患者在發(fā)病1~3 d即可在尿中檢測(cè)到抗原,可以為早期診療提供依據(jù);此方法操作簡(jiǎn)單、快速,特異度高,易取得標(biāo)本,且對(duì)患者沒有創(chuàng)傷。缺點(diǎn)是只對(duì)Lp1型敏感,對(duì)其他血清型的嗜肺軍團(tuán)菌檢測(cè)價(jià)值不大[12],且檢測(cè)試劑盒昂貴,不利于在臨床上推廣應(yīng)用。

2.2血清學(xué)診斷 血清學(xué)檢測(cè)對(duì)可疑患者診斷有重要意義,因?yàn)槟承┛梢苫颊邿o肺部感染癥狀,或下呼吸道未產(chǎn)生足量分泌物,標(biāo)本不易獲取。血清學(xué)診斷包括微量凝集試驗(yàn)和ELISA。早在1996年,米亞英等[13]就結(jié)合此兩種方法診斷出國(guó)內(nèi)首例佐丹軍團(tuán)菌病。但是,微量凝集試驗(yàn)主要以整個(gè)菌體作為診斷抗原,這就導(dǎo)致嚴(yán)重的非特異性凝集,導(dǎo)致該試驗(yàn)的特異度較低。ELISA檢測(cè)患者血清中嗜肺軍團(tuán)菌IgG總抗體,其結(jié)果判定更加客觀、準(zhǔn)確。但是,目前市場(chǎng)上用于診斷嗜肺軍團(tuán)菌的試劑盒是用嗜肺軍團(tuán)菌全細(xì)胞蛋白為包衣抗原,往往在不同血清型或種屬間存在交叉反應(yīng)。因此,目前,臨床上對(duì)于軍團(tuán)菌肺炎的血清學(xué)診斷仍缺少一種快速、準(zhǔn)確的方法。2015年有研究曾分離并純化出嗜肺軍團(tuán)菌蛋白FLA、MOMP、MIP、IP和PILE,并將這5種純化蛋白作為包衣抗原檢測(cè)嗜肺軍團(tuán)菌血清抗體,其IgG抗體的靈敏度為90.4%,特異度為97.4%;IgM抗體的靈敏度為91.8%,特異度為95.1%[14]。王濤等[15]也成功誘導(dǎo)表達(dá)及純化出重組MOMP蛋白,將其作為診斷抗原建立了間接ELISA,結(jié)果顯示IgG抗體靈敏度為90.9%,特異度為91.7%,IgM抗體靈敏度為91.4%,特異度為90.6%,IgA抗體靈敏度為92.1%,特異度為88.9%,這為軍團(tuán)菌病血清學(xué)診斷試劑盒的研制奠定了基礎(chǔ)。但是,不同軍團(tuán)菌屬細(xì)菌之間、軍團(tuán)菌與其他細(xì)菌之間有交叉抗原,軍團(tuán)菌多克隆抗體與某些細(xì)菌可產(chǎn)生交叉反應(yīng),故血清學(xué)檢測(cè)只能作為輔助性、回顧性診斷手段。

3 核酸檢測(cè)方法

3.1聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)及其衍生技術(shù) PCR是一種由 DNA 聚合酶催化的特定序列體外擴(kuò)增技術(shù),突破了核酸的原料限制,可將極微量的生物標(biāo)本中靶核酸在短時(shí)間內(nèi)大量復(fù)制擴(kuò)增至可檢測(cè)范圍,具有高效、操作簡(jiǎn)單的特點(diǎn),已成為生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究,乃至臨床疾病診斷不可或缺的工具。嗜肺軍團(tuán)菌常用的檢測(cè)模板為16S rRNA、5S rRNA、23S-5S rRNA、mip或dotA[16],PCR擴(kuò)增后,不僅可鑒定軍團(tuán)菌,還可以分辨軍團(tuán)菌屬。雖然PCR特異度高,但靈敏度較差,特別是對(duì)于痰液標(biāo)本,由于含菌量較少,易出現(xiàn)假陰性結(jié)果。另外,常規(guī)PCR在產(chǎn)物分析時(shí)需要開蓋操作,容易引起交叉感染,導(dǎo)致假陽(yáng)性。為更快、更好地檢測(cè)軍團(tuán)菌,學(xué)者們已研究出一系列以PCR為基礎(chǔ)的相關(guān)技術(shù)。

3.1.1實(shí)時(shí)熒光定量PCR 實(shí)時(shí)熒光定量PCR是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法[17]。 GINEVRA等[18]利用全基因組測(cè)序數(shù)據(jù),開發(fā)并驗(yàn)證了一種靈敏度、特異度較高的實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法,即通過擴(kuò)增lpp1868基因檢測(cè)ST1克隆復(fù)合物中的Lp1,結(jié)果顯示靈敏度為95%,特異度為100%。這種新的PCR檢測(cè)方法是一種可靠的工具,將有助于改進(jìn)軍團(tuán)菌的檢測(cè)和鑒別,為軍團(tuán)菌病的預(yù)防和控制進(jìn)一步奠定了基礎(chǔ)。

3.1.2巢式PCR 巢式PCR需對(duì)靶DNA進(jìn)行兩次擴(kuò)增,第二次擴(kuò)增所用的模板為第一次擴(kuò)增的產(chǎn)物。巢式PCR通常設(shè)計(jì)兩對(duì)引物,第二對(duì)引物(第二次擴(kuò)增所用引物)在靶序列上的位置應(yīng)設(shè)計(jì)在第一對(duì)引物的內(nèi)側(cè)。由于巢式PCR反應(yīng)有兩次PCR擴(kuò)增,從而降低了擴(kuò)增多個(gè)靶位點(diǎn)的可能性(因?yàn)榕c兩套引物都互補(bǔ)的引物很少),增加了檢測(cè)的靈敏度;有兩對(duì)PCR引物與檢測(cè)模板的配對(duì),增加了檢測(cè)的可靠性。

嗜肺軍團(tuán)菌可生活在水域系統(tǒng)中,WEN-CHIEN等[19]利用巢式PCR結(jié)合變性梯度凝膠電泳來檢測(cè)河水標(biāo)本中的軍團(tuán)菌群落,發(fā)現(xiàn)每種軍團(tuán)菌都有自己的條帶模式,從而發(fā)現(xiàn)軍團(tuán)菌群落的多樣性。同時(shí),這種方法還可能發(fā)現(xiàn)環(huán)境中存在的未知軍團(tuán)菌,甚至其他病原體。

3.1.3多重PCR 常用的PCR僅應(yīng)用一對(duì)引物,通過擴(kuò)增后產(chǎn)生一個(gè)核酸片段,主要用于單一致病因子檢測(cè)。多重PCR又稱多重引物PCR或復(fù)合PCR,它是在同一PCR反應(yīng)體系里加入多對(duì)引物,同時(shí)擴(kuò)增一份DNA樣品中同一靶DNA或不同靶DNA的多個(gè)不同序列片段。臨床上常用于病原體分型或鑒定。2014年吳冬雪等[20]建立了一種多重PCR技術(shù)結(jié)合基因芯片的檢測(cè)方法,成功研制了嗜肺軍團(tuán)菌O血清型分型基因芯片,實(shí)現(xiàn)了嗜肺軍團(tuán)菌15種血清型的快速、準(zhǔn)確檢測(cè),使軍團(tuán)菌的診斷又邁出了一大步,并提供了新的思路與方向。

3.2環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP) LAMP是NOTOMI等[21]于2000年開發(fā)的一種在等溫條件下對(duì)DNA進(jìn)行高特異度、高效率、快速擴(kuò)增的檢測(cè)方法,即利用1種DNA聚合酶和4種特殊設(shè)計(jì)的引物在等溫條件(63 ℃左右)下保溫30~60 min,完成核酸擴(kuò)增反應(yīng)。LAMP作為一種全新的核酸擴(kuò)增方法,與常規(guī)PCR相比,具有簡(jiǎn)單、快速、特異度高的特點(diǎn)。目前,許多病原體都可通過LAMP進(jìn)行快速檢測(cè),如沙眼衣原體[22]。

LAMP的創(chuàng)新又為檢測(cè)軍團(tuán)菌提供了新思路,如MOOSAVIAN等[23]就曾采用培養(yǎng)法、PCR和LAMP對(duì)2016年6月至2017年3月在伊朗阿瓦茲教學(xué)醫(yī)院住院的肺炎患者的痰液和支氣管肺泡灌洗液標(biāo)本進(jìn)行軍團(tuán)菌檢測(cè),結(jié)果表明,培養(yǎng)法陽(yáng)性率為1%,PCR和LAMP檢測(cè)軍團(tuán)菌陽(yáng)性率分別為3%和7%,由此可以得出,LAMP檢測(cè)軍團(tuán)菌優(yōu)于培養(yǎng)法和PCR。

4 其 他

軍團(tuán)菌主要污染供水系統(tǒng)、空調(diào)冷卻水、呼吸機(jī)等,也可形成帶菌氣溶膠,通過空氣傳播,一旦暴發(fā)流行將嚴(yán)重危害人們的健康。2016年范曉?shī)櫟萚24]將軍團(tuán)菌的16S rRNA基因作為基因芯片,創(chuàng)立基因芯片檢測(cè)技術(shù),對(duì)空調(diào)冷卻系統(tǒng)等公共衛(wèi)生環(huán)境中的軍團(tuán)菌進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)控,取得一定成果。但是,此方法成本過高,不利于推廣。因?yàn)榕R床上軍團(tuán)菌肺炎與其他肺炎癥狀相似,不易區(qū)分,MIYASHITA等[25]根據(jù)“男性、無咳嗽、呼吸困難、C反應(yīng)蛋白和乳酸脫氫酶升高及低鈉”等條件,制訂出了一種新的軍團(tuán)菌評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)來區(qū)分軍團(tuán)菌肺炎和非軍團(tuán)菌肺炎,如果得分≥3分,則診斷為軍團(tuán)菌肺炎,此方法的靈敏度為93%,特異度為75%,也可作為軍團(tuán)菌的一種評(píng)估方法。

目前,軍團(tuán)菌病在國(guó)內(nèi)外時(shí)有暴發(fā)流行,在美國(guó)和歐洲國(guó)家的發(fā)病率也一直在增加[26],且感染存在地區(qū)及季節(jié)差異,是影響公眾健康的一大隱患。因此,準(zhǔn)確高效地檢測(cè)軍團(tuán)菌,對(duì)軍團(tuán)菌病的防控具有重要意義。隨著科技和知識(shí)的發(fā)展,用于檢測(cè)軍團(tuán)菌的方法越來越多,筆者相信會(huì)有更簡(jiǎn)便、快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)方法出現(xiàn),為軍團(tuán)菌的檢測(cè)提供更有力的保障,為人們的健康增添一重防護(hù)。

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