現(xiàn)有的大多數(shù)嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2 型（SARS-CoV-2）的診斷檢測(cè)依賴于RNA 提取，然后進(jìn)行定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（RT-qPCR）分析。雖然檢測(cè)中采用自動(dòng)化技術(shù)改進(jìn)了工序效率，應(yīng)用不同的樣品混和策略提高了檢測(cè)能力，但在一次試驗(yàn)中對(duì)多個(gè)變異進(jìn)行定量和測(cè)序的能力依然不足。Chappleboim等描述了一種基于多重二代測(cè)序（NGS）的方法，稱為ApharSeq，將為解決這一問(wèn)題提供新的思路。

在過(guò)去10 年間，二代測(cè)序（NGS）已取代RT-qPCR 和微陣列，成為研究中定量RNA 分子的首選分析方法。NGS 檢測(cè)在提供重要的SARS-CoV-2 變異信息的同時(shí)，還能顯著地增加檢測(cè)量。當(dāng)前基于NGS 的SARS-CoV-2 檢測(cè)和基因分型分析成本高昂，主要原因是經(jīng)過(guò)多個(gè)步驟的平行樣品處理。ApharSeq 檢測(cè)方法，讓樣品在裂解緩沖液中進(jìn)行條形碼標(biāo)記，并在反轉(zhuǎn)錄前混合。研究人員以機(jī)器人工作流程的方式，將ApharSeq應(yīng)用于Hadassah醫(yī)院臨床病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室的500多個(gè)臨床樣本檢測(cè)，驗(yàn)證了該分析方法。該方法在5個(gè)數(shù)量級(jí)上呈現(xiàn)線性，檢測(cè)限為Ct 33（～1000拷貝/mL，95%的靈敏度），特異性＞99.5%。由于將唯一分子標(biāo)識(shí)符納入該方法中，ApharSeq 提供了有針對(duì)性的高置信度基因型信息。由于采用了早期樣品混合，與當(dāng)前的檢測(cè)方法相比，估計(jì)在高通量檢測(cè)環(huán)境下，勞動(dòng)力、自動(dòng)化液體處理量和試劑需求量將減少到1/100 到1/10。該方案可用于同時(shí)檢測(cè)其他宿主或病原體RNA靶點(diǎn)信息。這些結(jié)果表明，對(duì)于當(dāng)前和未來(lái)的大規(guī)模的診斷挑戰(zhàn)，ApharSeq可能是一個(gè)很有前途的方法。