金愈茗 陳子軒 陳權(quán) 沙雷皓 沈誠(chéng)
肺癌是目前全球死亡率最高的癌癥[1]。當(dāng)前大部分肺癌患者在診斷時(shí)已經(jīng)處于晚期,晚期肺癌患者5年生存率不足15%,而Ia期肺癌患者的5年生存率可以超過(guò)80%[2,3]。因此,如何盡早發(fā)現(xiàn)并診斷肺癌成為提高患者生存率的關(guān)鍵。
隨著診斷技術(shù)的發(fā)展,早期肺癌篩查在過(guò)去的幾十年內(nèi)有了一定的發(fā)展與進(jìn)步,胸部X射線、計(jì)算機(jī)斷層掃描(computed tomography, CT)、低劑量螺旋CT(low-dose spiral CT, LDCT)、正電子發(fā)射斷層掃描(positron emission tomography, PET)等技術(shù)的發(fā)展使得肺癌患者的生存率逐漸提高,但肺癌確診的金標(biāo)準(zhǔn)仍為明確的病理結(jié)果,有創(chuàng)操作的風(fēng)險(xiǎn)依舊不能避免[4,5]。細(xì)胞學(xué)檢查能夠?yàn)橐陨霞夹g(shù)提供輔助診斷,但由于樣本的獲取及檢測(cè)的局限,痰液細(xì)胞學(xué)的檢測(cè)效力未能達(dá)到理想的效果[6,7]。因此臨床上迫切需要一種安全性更高、準(zhǔn)確性更高的肺癌診斷方法。
隨著對(duì)肺癌的分子機(jī)制研究的深入,基因組學(xué)技術(shù)的發(fā)展,更多生物分子被證實(shí)參與腫瘤進(jìn)程,促進(jìn)其發(fā)生發(fā)展。二代測(cè)序及深度檢測(cè)技術(shù)的出現(xiàn),大幅度提升了基因檢測(cè)的敏感性和特異度[8],而通過(guò)數(shù)據(jù)分析使得準(zhǔn)確測(cè)定組織中腫瘤基因的拷貝數(shù)成為可能[9]。液體活檢中基因相關(guān)樣本檢測(cè)的潛力凸顯。利用患者的血液、胸腔積液、唾液、痰液等樣本中提取的脫氧核糖核酸(deoxyribo nucleic acid, DNA)片段、微小RNA(microRNA, miRNA)、信使RNA(message RNA, mRNA)、蛋白質(zhì)等能夠獲取腫瘤組織的遺傳信息,該方法無(wú)創(chuàng)、易于獲取、可重復(fù)多次提取,具有很強(qiáng)的應(yīng)用前景[10,11]。血液樣本雖然易于提取,但其中相關(guān)基因產(chǎn)物含量低,且容易受機(jī)體其他代謝過(guò)程影響[12];胸腔積液不易受其他過(guò)程影響,產(chǎn)物含量較高,但采集操作是有創(chuàng)性的[13,14]。而痰液中產(chǎn)物含量較適宜,且無(wú)創(chuàng)不易受其他過(guò)程影響,含有多種生物活性物質(zhì),如蛋白質(zhì)、DNA、miRNA、mRNA,是理想的液體活檢樣本。本文回顧了痰液中生物分子標(biāo)記物在肺癌中的相關(guān)機(jī)制和應(yīng)用價(jià)值。
正常細(xì)胞在發(fā)生壞死和凋亡過(guò)程中可能會(huì)將部分DNA釋放到內(nèi)環(huán)境中,而腫瘤細(xì)胞釋放的DNA片段帶有腫瘤特有的遺傳特征,對(duì)腫瘤的診斷具有重要價(jià)值。對(duì)含有腫瘤DNA的痰液進(jìn)行檢測(cè),具有經(jīng)濟(jì)、安全、無(wú)創(chuàng)的特點(diǎn),同時(shí),腫瘤細(xì)胞遺傳物質(zhì)的改變通常發(fā)生于產(chǎn)生臨床癥狀之前,對(duì)遺傳物質(zhì)的檢測(cè)具有一定的前瞻預(yù)防性,而且,可多次反復(fù)取樣還可以連續(xù)動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)腫瘤基因,從而提示腫瘤的發(fā)生與發(fā)展[7,10,15,16]。腫瘤細(xì)胞遺傳物質(zhì)DNA的改變是復(fù)雜且精密的,與癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),當(dāng)前用于肺腫瘤細(xì)胞診斷的DNA遺傳特征改變主要包括DNA的突變(DNA mutation)和異常甲基化(aberrant DNA methylation)。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)是檢測(cè)DNA變異的常用技術(shù),該技術(shù)簡(jiǎn)單易行、經(jīng)濟(jì)快速、敏感性較高[17]。DNA異常甲基化被認(rèn)為是一種腫瘤細(xì)胞調(diào)控的機(jī)制,甲基化特異性PCR(methylationspecific PCR, MSP)是檢測(cè)DNA甲基化的常用方法。
Keohavong等[18,19]的工作證明了KRAS突變及p53突變可能適用于對(duì)肺癌高危人群中的痰液篩檢,但當(dāng)前對(duì)KRAS和p53基因檢出時(shí)間和肺癌進(jìn)展間關(guān)系的研究仍待完善。多項(xiàng)研究[20-22]顯示,p16、PAX5α、GATA5、SULF2等基因的異常甲基化在肺癌早期篩查中的特異性超過(guò)70%。Hulbert等[16]的病例對(duì)照研究同樣發(fā)現(xiàn)了HOXA7、SOX17等基因的異常甲基化檢測(cè)的特異性超過(guò)80%。但這些基因用于篩查的敏感度不高,均低于70%。由于肺癌的發(fā)生涉及到復(fù)雜的遺傳信息調(diào)控過(guò)程,當(dāng)前的研究嘗試將多種基因同時(shí)檢測(cè),以期提高敏感性,研究顯示,同時(shí)對(duì)多個(gè)基因甲基化檢測(cè)可以提高肺癌篩查和早期診斷的敏感性[23,24],可以將敏感性提高到98%,而機(jī)器學(xué)習(xí)的方法也可以通過(guò)多基因組合檢測(cè)診斷出91%的肺癌[16,25,26]。痰液中多基因聯(lián)合檢測(cè)具有高特異性和敏感性,有望成為肺癌篩查和早期診斷的方向,需要更大樣本、更多基因的聯(lián)合研究和深入分析提供進(jìn)一步的支持。
LDCT與痰液中DNA異常甲基化檢測(cè)的結(jié)合也能使肺癌篩查的效率提高,對(duì)在LDCT上發(fā)現(xiàn)可疑結(jié)節(jié)的患者進(jìn)行痰液生物活性物質(zhì)檢測(cè)能夠得到63%-86%的敏感性和75%-92%的特異性[16];Leng等[27]的研究也提示痰液生物活性物質(zhì)檢測(cè)能夠排除1/3 LDCT的假陽(yáng)性。而針對(duì)肺癌的診斷上,根據(jù)大量的病例研究和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)表明,原癌基因KRAS和抑癌基因p53在肺癌的發(fā)生發(fā)展中具有重要的作用[28]。Somers等[29]對(duì)肺腺癌患者的痰液進(jìn)行了研究,結(jié)果提示KRAS基因的點(diǎn)突變可以在肺腺癌患者的痰液中檢測(cè)到,為后續(xù)的檢測(cè)的發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。Destro等[18]在一項(xiàng)對(duì)照實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),肺癌患者中痰液樣本檢測(cè)出KRAS突變(79%)而對(duì)照組無(wú)一陽(yáng)性,雖然當(dāng)前針對(duì)痰液中KRAS和p53對(duì)于肺癌診斷的研究仍未有統(tǒng)一的結(jié)論,但KRAS和p53在肺癌發(fā)展中起著核心作用,結(jié)合痰液檢測(cè)的無(wú)創(chuàng)性特點(diǎn),痰液中KRAS和p53檢測(cè)在今后肺癌的診斷技術(shù)中仍具有潛力。除了單基因檢測(cè),聯(lián)合檢測(cè)DNA甲基化和miRNA被證實(shí)可以顯著提高檢測(cè)的特異性和敏感性。研究[30]顯示,同時(shí)檢測(cè)2種miRNA(miR-31, miR-210)和2種DNA甲基化(RASSF1A和3OST2)能夠獲得87%的敏感度和90%的特異性。痰液中生物活性物質(zhì)在肺癌診斷中具有很大的潛力,為了進(jìn)一步驗(yàn)證檢測(cè)的敏感度和特異性,需要多中心、大樣本臨床研究提供更充分的證據(jù)[18,19]。
表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)相關(guān)基因突變被認(rèn)為是肺腺癌發(fā)生的機(jī)制之一,痰液中EGFR突變對(duì)于診斷的影響也在研究之中,研究發(fā)現(xiàn)EGFR突變可能與女性或非吸煙患者的肺腺癌有關(guān),肺癌的不同亞型可能會(huì)成為影響EGFR突變檢出率的原因,同時(shí),當(dāng)前研究較小的樣本量所能具備的代表性也值得進(jìn)一步探究[31-34]。在臨床治療中,針對(duì)EGFR突變的靶向藥被廣泛證實(shí)有顯著的療效,EGFR突變的檢測(cè)對(duì)非小細(xì)胞肺癌(nonsmall cell lung cancer, NSCLC)有著重要的作用[35,36],研究[33]顯示,在已經(jīng)明確診斷為EGFR突變型NSCLC的患者中,30%-50%的患者可以在痰液中檢出這一突變,且所有對(duì)照組中均不能檢出。另一項(xiàng)相似的研究的結(jié)果[37]顯示,痰液中檢測(cè)EGFR突變可以得到46.2%的敏感度和100%的特異性。雖然敏感度不夠理想,但這些研究揭示了痰液EGFR突變檢測(cè)可以在早期獲得肺癌患者EGFR突變狀態(tài)。間變性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase, ALK)也是NSCLC的常見治療靶點(diǎn),針對(duì)此基因突變的許多靶向療法具有顯著的療效[38],但當(dāng)前尚未有針對(duì)痰液中ALK突變的檢測(cè)研究。針對(duì)其他靶點(diǎn)如MET、BRAF的研究同樣缺乏[30]。
miRNA是一種穩(wěn)定的非編碼單鏈小核苷酸序列,它們主要通過(guò)與位于靶mRNA 3’-非翻譯區(qū)(untranslated area,UTR)內(nèi)的種子序列結(jié)合來(lái)調(diào)控致癌和/或抑瘤基因,最終導(dǎo)致靶mRNA失活和降解,從而調(diào)節(jié)基因表達(dá),參與調(diào)控腫瘤進(jìn)程。大量研究[39-41]發(fā)現(xiàn),miRNA基因的異常表達(dá)與肺癌的發(fā)生發(fā)展相關(guān),一類miRNA作為抑癌基因發(fā)揮作用,如let-7家族(let-7a、let-7c)、miR-1[42]可抑制癌細(xì)胞的增殖及耐藥,miRNA-1、miRNA-206[43]可通過(guò)減少腫瘤血管生成而抑制腫瘤的生長(zhǎng)與轉(zhuǎn)移,現(xiàn)發(fā)現(xiàn)miRNA-126、miRNA-494也有一定致癌作用[44-47]。另一類則作為致癌基因發(fā)揮作用,其高表達(dá)可促進(jìn)肺癌的進(jìn)展,如miR-103-a可增加血管生長(zhǎng)因子的表達(dá)[48],miR-31可引起腫瘤支持可溶性因子與侵襲性增加[49],miRNA-17家族(miRNA-17、miRNA-18a、miRNA-19a、miRNA-20a、miRNA-19b-1、miRNA-92a-1)[50]、miRNA-335[51]、miRNA-155[52]、miRNA-183[53]均在肺癌組織中表達(dá)增加。
肺癌亞型傳統(tǒng)上依賴于切除標(biāo)本、支氣管鏡活檢、細(xì)針穿刺的組織病理學(xué)觀察,這些樣本的采取方式對(duì)患者的侵襲性大[54-56],然而研究人員[57,58]發(fā)現(xiàn),內(nèi)源性miRNA以穩(wěn)定的形式存在于痰液中,且對(duì)RNA酶具有抗性,此外在7 d內(nèi)的痰液樣本中也可以被檢測(cè)出來(lái),過(guò)去15年里痰液中miRNA檢測(cè)越來(lái)越多地被用于腫瘤早期篩查與診斷。Zhang等[59]為評(píng)估痰液標(biāo)本中miRNA的異常表達(dá)是否可以作為NSCLC的有用生物標(biāo)志物,納入了14篇文章,包括1,009例NSCLC患者和1,006例健康者對(duì)照,結(jié)果顯示聯(lián)合敏感性、特異性、陽(yáng)性似然比(positive likelihood ratio,PLR)、陰性似然比(negative likelihood ratio, NLR)、診斷優(yōu)勢(shì)比(diagnostic odds ratio, DOR)和曲線下面積(area under the curve, AUC)分別為0.75(95%CI: 0.72-0.78)、0.88(95%CI: 0.86-0.90)、5.70(95%CI: 4.82-6.75)、0.30(95%CI: 0.26-0.34)、22.43(95%CI: 17.48-28.79)、0.89,提示痰液標(biāo)本中的miRNA可能是NSCLC的無(wú)創(chuàng)性診斷生物標(biāo)志物。
肺癌患者痰液中miRNA-21、miRNA-155、let-7a的含量與良性肺疾病患者與健康者的的痰液中含量差異顯著,miRNA-21與miRNA-155在肺癌患者痰液中含量增高,而let-7a含量則相反[60]。Yu等[58]納入36例肺癌患者和36例健康者對(duì)其痰液進(jìn)行標(biāo)記物優(yōu)化,鑒定出7種表達(dá)顯著改變的miRNA,4種在肺癌患者中高表達(dá),3種低表達(dá),最終選擇4種miRNA(miRNA-21、miRNA-486、miRNA-200b和miRNA-375)組合,其對(duì)診斷肺腺癌的靈敏度和特異度分別為80.6%和91.7%。Roa等[61]檢測(cè)肺癌患者痰液中5種miRNA(miR-21、miR-143、miR-155、miR-210、miR-372)含量增加,隨后進(jìn)行雙盲定量分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)對(duì)診斷肺癌的敏感度和特異度分別為83.3%和100%。Xing等[62]通過(guò)實(shí)時(shí)定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcriptionpolymerase chain reaction, RT-PCR)對(duì)48例I期肺鱗癌患者和48例健康人的痰中miRNA標(biāo)記,鑒定出6種miRNA,其中3種過(guò)度表達(dá),另外3種表達(dá)不足,最終篩選出3種miRNA(miRNA-205、miRNA-210和miRNA-708),其在區(qū)分肺鱗癌患者和正常受試者方面具有73%的敏感性和96%的特異性。Ulivi等[63]和Su等[64]同樣采用多種miRNA聯(lián)合檢測(cè)肺癌的方式,也擁有較好的檢測(cè)能力。
提示痰液miRNA檢測(cè)對(duì)肺癌的早期篩查與診斷有一定價(jià)值和意義,痰中的miRNA表達(dá)水平極為穩(wěn)定,收集后1 d-7 d每天基本不會(huì)改變[65]。但該方法具有一定局限性,從患者身上采集的樣本中細(xì)胞數(shù)量不同可能導(dǎo)致miRNA含量不穩(wěn)定,且許多患者伴有呼吸肌疲勞、無(wú)力等癥狀,這使痰液的采集變得十分困難,部分患者痰液量減少甚至無(wú)痰。并且目前僅有少數(shù)miRNA能提供較好的診斷效果,而miRNA對(duì)癌癥的調(diào)控作用也未能在診斷中有所反映?;谔狄簃iRNA對(duì)于肺癌診斷和篩查無(wú)疑是良好的工具,但對(duì)利用miRNA的定量分析對(duì)肺癌預(yù)后治療、隨訪的評(píng)價(jià)作用未有報(bào)道,或許可成為研究的新方向。
mRNA,是由DNA單鏈作為模板通過(guò)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生、攜帶遺傳信息、能參與蛋白質(zhì)合成的一類單鏈核糖核酸。相較于miRNA,mRNA在痰液中降解快,因此有必要盡快對(duì)采集后的痰液標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)或及時(shí)保存;目前常應(yīng)用RTPCR法對(duì)mRNA序列進(jìn)行檢測(cè),對(duì)肺癌進(jìn)行診斷和篩查。
Dong等[67]應(yīng)用反轉(zhuǎn)錄PCR(reverse transcription-PCR,RT-PCR)法檢測(cè)104例肺癌患者痰液標(biāo)本,并與傳統(tǒng)細(xì)胞學(xué)檢測(cè)結(jié)果比較,肺癌患者痰標(biāo)本Survivin mRNA的陽(yáng)性率為60.6%(63/104),提示痰液mRNA作為肺癌篩查的可能性。Sun等[68]應(yīng)用實(shí)時(shí)定量RT-PCR法檢測(cè)了75例肺癌組織和71例相應(yīng)痰標(biāo)本中APRIL mRNA的表達(dá),并進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果表明肺癌、肺部良性疾病和健康志愿者的APRIL mRNA表達(dá)陽(yáng)性率分別為81.7%(58/71)、3.2%(2/62)和1.5%(1/65);肺癌患者痰液中APRIL mRNA的表達(dá)水平明顯高于良性肺部疾病患者和健康志愿者。印記位點(diǎn)調(diào)節(jié)物兄弟因子(brother of the regulator of imprinted sites, BORIS)作為癌基因也在肺癌患者痰液中被檢測(cè)到,BORIS陽(yáng)性則有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、病理結(jié)果為進(jìn)展期的提示[69],提示了其在預(yù)后、治療方面的作用。
Chen等[70]建立了一種新的PCR方法:Template-Ready PCR(TRPCR),提高了PCR的靈敏度;應(yīng)用這種方法檢測(cè)858例肺癌患者和480例非惡性肺部疾病志愿者的痰液標(biāo)本中的人端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(human telomerase reverse transcriptase, HTERT)mRNA,其陽(yáng)性率分別為84.15%(722/858)和3.96%(19/480),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。由于mRNA易降解的特性,其痰液檢測(cè)受到限制,未有研究報(bào)道其生物學(xué)特性在肺癌復(fù)發(fā)、隨訪等方面的作用,但mRNA具有的基因特性仍具有較大潛力。
21世紀(jì)以來(lái),蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)不斷得到發(fā)展與補(bǔ)充,利用該技術(shù)檢測(cè)對(duì)應(yīng)的生物標(biāo)志物在疾病的篩查、診斷和預(yù)后中發(fā)揮著不可或缺的重要作用。肺癌患者的痰液中可以檢測(cè)出敏感性好、特異性高的生物標(biāo)志物,將會(huì)大大提高肺癌早期檢測(cè)成功率,從而更好地進(jìn)行肺癌的治療和預(yù)后[71]。
Rangel等[73]利用透明質(zhì)酸(hyaluronan, HA)區(qū)分腫瘤患者和無(wú)腫瘤患者的敏感性為80%,特異性為66%,擁有較好的敏感度,在肺癌篩查方面具有較大潛力。Yu等[72]研究了I期肺癌患者的診斷方式,在痰上清液中利用蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)EN01蛋白水平增高,敏感性為58%,特異性為80%。Pio等[74]證實(shí)了肺癌患者痰中存在補(bǔ)體因子H的水平升高,補(bǔ)體因子H檢驗(yàn)的敏感性和特異性分別為80%和88%;他們認(rèn)為分子生物標(biāo)記物的測(cè)量,如補(bǔ)體因子H,未來(lái)可能作為細(xì)胞學(xué)檢測(cè)的輔助手段用于惡性肺部疾病的診斷。Li等[75]利用蛋白芯片和ELISA技術(shù)開發(fā)了三種腫瘤抗原相關(guān)自身抗體(tumor antigen-associated autoantibody,TAAb)DDX6、ENO1和14-3-3ζ作為診斷肺癌的生物標(biāo)志物,其敏感性和特異性分別為81%和83%。
對(duì)痰液中蛋白質(zhì)的檢測(cè)擁有較高的特異性和敏感度,具有良好的診斷性作用,而通過(guò)蛋白質(zhì)定量檢測(cè)來(lái)判斷肺癌進(jìn)展程度的報(bào)道較少。
痰液中生物標(biāo)志物具有良好的肺癌診斷能力,但痰液標(biāo)本收集則會(huì)干擾診斷的能力,故對(duì)痰液標(biāo)本的收集是值得研究的方向。痰液中生物標(biāo)志物大多為RNA,其穩(wěn)定性不高,易分解,采樣后及時(shí)檢測(cè)也是提高檢測(cè)能力的方法之一。血液中存在可評(píng)估腫瘤進(jìn)展和治療效果的生物標(biāo)志物,而痰液中也可能存在類似的物質(zhì),除用于肺癌診斷也可用于對(duì)肺癌狀態(tài)的實(shí)時(shí)檢測(cè)。痰液中存在多種可用于檢測(cè)的物質(zhì),聯(lián)合診斷往往可以提高診斷的能力,目前較多研究為同類物質(zhì)的聯(lián)合檢測(cè),而不同物質(zhì)如miRNA聯(lián)合蛋白或miRNA聯(lián)合DNA的檢測(cè)方式還未有報(bào)道。同樣生物活性物質(zhì)的檢測(cè)也可與LDCT聯(lián)合診斷肺癌并提高二者的準(zhǔn)確性[16]。
由于血清和血漿相比于痰和全血,具有更大的特異性和敏感性[66],近年來(lái)對(duì)痰液生物活性物質(zhì)的研究熱度有所降低,較少研究利用定量檢測(cè)對(duì)肺癌進(jìn)程進(jìn)行分析,而痰液中含有大量可檢測(cè)的生物標(biāo)志物,隨著檢測(cè)方式的不斷改進(jìn),其在肺癌的診斷甚至治療預(yù)后中的作用將會(huì)越來(lái)越大。