周舒揚(yáng),張丕奇, 戴肖東,趙曉宇
(黑龍江省科學(xué)院 微生物研究所,黑龍江 哈爾濱 150010)
20世紀(jì)60年代,研究人員在革蘭陰性細(xì)菌的電子顯微圖像中觀察到球形膜泡,當(dāng)時(shí)對(duì)它的內(nèi)容物、組成和用途是未知的,被認(rèn)為是細(xì)胞凋亡所產(chǎn)生的細(xì)胞碎片[1]。1987年,Johnstone等[2]首次發(fā)現(xiàn)羊網(wǎng)狀細(xì)胞分泌的囊泡,并將其命名為外泌體(exosome)。隨著研究領(lǐng)域的不斷擴(kuò)展,研究人員發(fā)現(xiàn)在諸多生物中均產(chǎn)生類似exosome的囊泡,功能與exosome相似,稱為外膜囊泡(outer membrane vesicles,OMV)。因此,OMV也被稱為exosome。2007年,Valadi等[3]首次在OMV中發(fā)現(xiàn)了miRNA和RNA,顯示其可能在細(xì)胞間傳遞遺傳信息。為了揭示這一生物學(xué)現(xiàn)象,揭示分子之間相互作用的原理,近年來(lái)研究細(xì)胞間通訊機(jī)制成為研究熱點(diǎn)。細(xì)胞間通訊是通過(guò)細(xì)胞間隙連接、細(xì)胞膜表面分子接觸和細(xì)胞分泌的化學(xué)物質(zhì)來(lái)進(jìn)行的。除了這些機(jī)制外,最近的研究表明,OMV也參與細(xì)胞間通訊。研究人員也把注意力轉(zhuǎn)移到OMV的研究上,OMV似乎徹底改變了細(xì)胞間通訊的傳統(tǒng)概念。近年來(lái),OMV 在腫瘤、感染性疾病、代謝性疾病、心血管疾病、自身免疫性疾病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的重要生物學(xué)作用逐漸成為研究熱點(diǎn),而細(xì)菌OMV研究還處于開(kāi)始階段。本文綜述近幾年關(guān)于細(xì)菌OMV的研究進(jìn)展,包括OMV及其產(chǎn)生、OMV特定成分以及OMV的功能等,以期為細(xì)菌與宿主多種多樣的互作機(jī)制研究提供參考。
細(xì)菌OMV首次被報(bào)道發(fā)現(xiàn)于大腸埃希菌(Escherichiacoli),之后越來(lái)越多的革蘭陰性細(xì)菌被證明可以產(chǎn)生和分泌OMV,如銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)、鼠傷寒沙門氏菌(Salmonellatyphimurium)、幽門螺桿菌(Helicobacterpylori)等[4-10]。隨著對(duì)炭疽桿菌(Bacillusanthraci)、枯草芽胞桿菌(Bacillussubtilis)和金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的深入研究,發(fā)現(xiàn)革蘭陽(yáng)性菌也可產(chǎn)生OMV[11-13](表1)。
表1 已報(bào)道產(chǎn)生OMV的細(xì)菌
細(xì)菌的OMV是閉合的大小不均的球體粒子,平均直徑10~300 nm。電子顯微鏡(EM)觀察,OMV的產(chǎn)生是由外膜(OM)向外凸起,包裹著周質(zhì)、胞質(zhì)蛋白、DNA和RNA等物質(zhì),以出芽方式形成的囊泡[14](圖1)。對(duì)OMV蛋白質(zhì)組的分析表明,其內(nèi)部含有非母體細(xì)胞所具有的蛋白質(zhì)成分,說(shuō)明OMV不是細(xì)胞死亡的產(chǎn)物,因?yàn)槠浜行潞铣傻牡鞍踪|(zhì)[15]。
圖1 OMV的結(jié)構(gòu)
根據(jù)各種生化和遺傳研究,科學(xué)家們提出了幾種OMV產(chǎn)生的模型。Burdett等[16]對(duì)OMV生物起源的研究表明,肽聚糖(PG)和外膜(OM)之間交聯(lián)的減少觸發(fā)了OMV的形成。由于脂蛋白(Lpp)參與了OM-PG的連鎖反應(yīng),所以推測(cè)可能是由于lpp基因突變引起OMV的形成[17]。脂蛋白(Vfgl)與E.coliAIEC和E.coliK12株中OMV的產(chǎn)生有關(guān),Vfgl是一種參與合成和降解PG的脂蛋白,在OMV產(chǎn)生過(guò)程中,vfgl可能與PG產(chǎn)量的增加有關(guān),或是參與下調(diào)和維持OM膨壓[18]。隨著OMV數(shù)量的增加,OMV以出芽形式從OM釋放,減輕了PG和胞壁酸在細(xì)胞壁合成過(guò)程中所施加給OM的壓力。雖然生化研究顯示OMV和OM具有相似的蛋白結(jié)構(gòu),但胞質(zhì)分子是如何被包裝進(jìn)入OMV的尚不清楚。
Mashburn等[19]提出,通過(guò)磷脂、脂多糖(LPS)和其他特定分子富集在OM上,使得OM的曲率發(fā)生變化從而產(chǎn)生OMV。對(duì)銅綠假單胞菌(Pseudomonasaeruginosa)的研究揭示了群體感應(yīng)(quorum sensing)分子PQS(2-heptyl-3-hydroxy-4-quinolone)插入膜后所帶來(lái)的膜曲率變化,從而產(chǎn)生OMV[20]。通過(guò)添加螯合劑(EDTA)可以觀察到OMV產(chǎn)量的增加,但是向銅綠假單胞菌添加Mg2+會(huì)導(dǎo)致拮抗作用[21]。相反,OM蛋白如OmpA、TolA/B(toll-pal)、YbgF和Lppab,也有助于OMV的生物發(fā)生[22]。此外,高溫脅迫、抗生素等也會(huì)增加OMV的產(chǎn)生。
對(duì)OMV成分的分析表明,囊泡含有多種活性因子,這些活性因子包括蛋白黏附素、毒素、酶以及脂多糖(LPS)等非蛋白抗原。純化的OMV與原核細(xì)胞和真核細(xì)胞相互作用,顯示出毒力因子的傳遞能力。此外,OMV中含有病原體相關(guān)分子模式(MAMPs)和其他外膜成分,這些成分可以影響感染過(guò)程和宿主對(duì)感染的反應(yīng)。通過(guò)密度梯度離心法純化OMV分析其組分,鑒定了OMV的成分信息,包括蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和核酸等。
OMV的研究揭示了大量的OM蛋白(OmpA、OmpC和OmpF)、周質(zhì)蛋白(AcrA、堿性磷酸酶)和一系列毒力因子參與了細(xì)菌對(duì)宿主的黏附和侵染。隨著蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)的發(fā)展,已鑒定3 500多種與OMV相關(guān)的蛋白質(zhì)[23]。當(dāng)細(xì)菌在不同的環(huán)境條件下生長(zhǎng)時(shí),囊泡的產(chǎn)生速率和OMV的蛋白質(zhì)含量會(huì)發(fā)生變化,這暗示特定蛋白質(zhì)有選擇地進(jìn)入OMV[24]。在粘質(zhì)沙雷氏菌(Serratiamarcescens)中,外膜蛋白(OMPs)、孔蛋白(porin)和外膜通道蛋白(TolC)等大量蛋白存在于OM上,而在OMV中未被檢測(cè)到。在粘質(zhì)沙雷氏菌中,OMV檢測(cè)到外膜蛋白MipA,但在OM中卻沒(méi)有檢測(cè)到[25]。痢疾桿菌(Dysenterybacillus)通過(guò)促進(jìn)OMV的產(chǎn)生而促進(jìn)其志賀毒素的分泌[26]。在OMV中導(dǎo)入或排除特定蛋白質(zhì)的機(jī)制尚不明確,目前是研究的熱點(diǎn)[27-29]。為引起疾病而選擇性分泌的蛋白質(zhì),以及為細(xì)菌健康而選擇性去除的蛋白質(zhì)之間的區(qū)別,解決這些問(wèn)題將是解釋各種細(xì)菌OMV蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)的關(guān)鍵挑戰(zhàn)。
脂質(zhì)是細(xì)菌OMV的重要結(jié)構(gòu)成分。Horstman等[30]報(bào)道大腸埃希菌OMV以甘油磷脂、磷脂酰甘油、磷脂酰乙醇胺和心磷脂為主要脂質(zhì),這些脂質(zhì)與OMV的曲度有關(guān)。Chowdhury等[31]在對(duì)紫丁香進(jìn)行質(zhì)譜(MS)分析時(shí)發(fā)現(xiàn)磷脂酰甘油和磷脂酰乙醇胺是OMV中主要的脂質(zhì)成分。同樣,其他研究也發(fā)現(xiàn)磷脂酰甘油是OMV的主要成分,但也發(fā)現(xiàn)磷脂酰乙醇胺是OM的主要成分。此外,OMV中較高比例的飽和脂肪酸使其結(jié)構(gòu)更加穩(wěn)定。LPS在生物膜中起黏附作用,同時(shí)也是OMV的組成部分。與蛋白質(zhì)類似,OMV中只存在少量的親本LPS[32]。
外膜囊泡既攜帶腔內(nèi)DNA,也攜帶表面DNA,二者之間的區(qū)別在于用DNA酶處理之后,腔內(nèi) DNA仍然具有抗性。與此同時(shí),從大腸埃希菌、淋球菌(Neisseriagonorrhoeae)、銅綠假單胞菌和流感嗜血桿菌(Haemophilusinfluenza)中發(fā)現(xiàn)了幾種不同形式的腔內(nèi) DNA。除了DNA,OMV還包含miRNA、mRNA和其他非編碼RNA。自首次在動(dòng)物體內(nèi)OMV中發(fā)現(xiàn)含有RNA以來(lái),人們對(duì)使用OMV中RNA作為診斷生物標(biāo)志物的研究產(chǎn)生了極大的興趣。Skog等[33]發(fā)現(xiàn),膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的血清中OMV含有可用于提供診斷信息的特征性突變mRNA(EGFRvIII mRNA)和miRNA。這些核酸的發(fā)現(xiàn)讓研究人員提出了OMV可以在細(xì)胞間傳遞遺傳信息的假設(shè)。事實(shí)上,Valadi等[33]和Skog等[34]均發(fā)現(xiàn)OMV中含有mRNA,可以在進(jìn)入宿主細(xì)胞后被轉(zhuǎn)移和翻譯。逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子和其他非編碼RNA在OMV中也有報(bào)道[35-36]。這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了OMV作為遺傳信息載體和傳遞者的重要性[37-38],但核酸進(jìn)入OMV的機(jī)制尚不清楚。
外膜囊泡(OMV)具有介導(dǎo)DNA片段、自溶酶、細(xì)胞毒素、毒力因子和多種生物分子轉(zhuǎn)移的特性。OMV的分泌有助于細(xì)菌種間和種內(nèi)的信息交流,也加強(qiáng)了與宿主的相互作用。OMV在多種生理和病理功能中發(fā)揮著重要作用。
OMV的組成使其成為激活宿主先天和獲得性免疫應(yīng)答通路的重要因子。除了強(qiáng)大的免疫調(diào)節(jié)分子LPS外,囊泡還含有OM孔蛋白和其他重要的先天免疫激活配體。總之,OMV 成分協(xié)同作用,調(diào)節(jié)宿主的反應(yīng),既可以促進(jìn)病原體的清除,也可以增強(qiáng)感染的毒性,或是兩者兼有。此外,OMV的免疫原性可導(dǎo)致保護(hù)性黏膜和全身殺菌抗體反應(yīng),已被用于疫苗開(kāi)發(fā)。目前所有實(shí)驗(yàn)證據(jù)表明,對(duì)OMV的先天免疫反應(yīng)是由細(xì)菌相關(guān)分子模式(PAMPs)和對(duì)LPS的識(shí)別共同作用的結(jié)果。囊泡中的脂蛋白和OM蛋白是一種生物活性分子,可以激活免疫細(xì)胞并誘導(dǎo)白細(xì)胞遷移[39]。
OMV中最豐富、最有效的免疫刺激成分是脂多糖(LPS)。LPS可激活巨噬細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞等引起炎癥因子的釋放,導(dǎo)致宿主的損傷乃至敗血癥休克。許多研究已經(jīng)表明toll樣受體4(TLR4)復(fù)合物直接將LPS的刺激信號(hào)向細(xì)胞內(nèi)傳遞,從而觸發(fā)宿主炎癥反應(yīng)導(dǎo)致細(xì)菌感染[40]。OMV作為L(zhǎng)PS的載體,可以通過(guò)激活炎癥反應(yīng)而引起宿主組織損傷。許多關(guān)于TLR4介導(dǎo)的LPS的研究都使用化學(xué)方法提純LPS,很可能是由于LPS以O(shè)MV的形式從細(xì)菌中分泌,OMV是一種異質(zhì)的蛋白質(zhì)脂質(zhì)體,其尺寸比由LPS組成的脂質(zhì)體大[41],這些性質(zhì)可能影響先天免疫應(yīng)答的效力。TLR4對(duì)LPS的介導(dǎo)需要從膜中提取LPS,主要是通過(guò)輔助蛋白如CD14、LPS結(jié)合蛋白(LBP)或通透性蛋白(BPI)等來(lái)提取的。雖然這些因子清除細(xì)菌膜上的LPS或?qū)PS傳遞給TLR4的機(jī)制尚不清楚,但研究已確定OMV既是脂多糖激活炎癥的關(guān)鍵因子,又是誘導(dǎo)炎癥的誘餌,結(jié)合這些可溶性因子抑制炎癥。Vesy等[42]發(fā)現(xiàn)沙門氏菌(Salmonellasp.)OMV中的LPS是通過(guò)LBP提取的,而不是通過(guò)CD14等其他因素。缺失LBP抑制了LPS與細(xì)胞表面TLR4-CD14復(fù)合物的結(jié)合。純化的LPS和OMV中的LPS不僅在刺激先天免疫反應(yīng)的能力上不同,而且在宿主組織內(nèi)的分配和清除也可能不同。這對(duì)于將純LPS注入動(dòng)物模型內(nèi)研究尤為重要。OMV作為異質(zhì)的蛋白質(zhì)具有親水性結(jié)構(gòu),使得更多的OMV通過(guò)各組織更快地與宿主膜結(jié)合,相比之下,純脂多糖可能表現(xiàn)出更多的疏水性。這些特性也可能導(dǎo)致OMV更容易被吞噬細(xì)胞識(shí)別和清除。
OMV分泌的一個(gè)特征是能夠協(xié)同地將多個(gè)效應(yīng)分子同時(shí)傳遞到目標(biāo)位點(diǎn)。銅綠假單胞菌釋放帶有毒力因子的OMV,保護(hù)性地將毒力因子移動(dòng)到宿主細(xì)胞膜的目標(biāo)位置,在那里囊泡與宿主細(xì)胞膜融合,將毒力因子運(yùn)送到細(xì)胞質(zhì)[43]中。這一現(xiàn)象在某種程度上類似于某些植物病原菌Ⅲ型分泌系統(tǒng)(T3SS)將效應(yīng)物直接有效地輸送到宿主細(xì)胞質(zhì)中(圖2)[44]。與T3SS系統(tǒng)相比,OMV有可能向宿主細(xì)胞質(zhì)提供更大、更多樣的因子,而不需要直接接近細(xì)菌和宿主細(xì)胞。
雖然OMV與植物細(xì)胞的融合尚未被證實(shí),但OMV在對(duì)植物的細(xì)菌毒性方面發(fā)揮著作用。木質(zhì)部難養(yǎng)菌(Xylellafastidiosa)通過(guò)產(chǎn)生和感知擴(kuò)散信號(hào)因子(DSF)來(lái)進(jìn)行群體感應(yīng)、誘導(dǎo)聚集、表面附著和生物膜的形成。Ionesco等[45]的研究表明,缺乏DSF如ΔrpfF突變體,產(chǎn)生大量游離形式的OMV。研究人員認(rèn)為OMV是一種抗黏附因子,參與調(diào)節(jié)細(xì)菌從生物膜形態(tài)向自由游離形態(tài)轉(zhuǎn)變,在木質(zhì)部分散并促進(jìn)毒性。OMV分泌途徑也被發(fā)現(xiàn)可作為Ⅱ型分泌(T2SS)系統(tǒng)[46]分泌胞外酶的替代途徑。OMV[47]蛋白組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),如脂肪酶、蛋白酶和細(xì)胞壁修飾蛋白酶等可作為損傷相關(guān)分子模式(DAMPs)的來(lái)源,被模式識(shí)別受體(PRRs)識(shí)別。事實(shí)上,通過(guò)T2SS系統(tǒng)分泌的酶和OMV內(nèi)含的酶似乎有重疊。木聚糖酶是一種植物細(xì)胞壁降解酶,其由T2SS系統(tǒng)和OMV分泌到細(xì)胞外對(duì)木質(zhì)部難養(yǎng)菌的毒力有重要作用。其他毒性因子也采取同樣的途徑。例如,在木質(zhì)部難養(yǎng)菌中T2SS系統(tǒng)分泌的一種脂肪酶LesA被包裝進(jìn)OMV,從而促進(jìn)了疾病的傳播[48]。與T2SS相比,將LesA和木聚糖酶包裝進(jìn)入OMV可以保護(hù)蛋白質(zhì)免受細(xì)胞外環(huán)境的影響,從而擴(kuò)大有效的活性范圍,并允許同時(shí)靶向和協(xié)同傳遞[49]。對(duì)T3SS分泌的效應(yīng)蛋白及植物病原菌OMV中轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)蛋白的研究表明,OMV也可能是T3SS系統(tǒng)的替代途徑,或與之協(xié)同作用。
因此,OMV可促進(jìn)細(xì)菌近端和遠(yuǎn)端毒力因子的傳遞。了解OMV的傳遞機(jī)制以及OMV的產(chǎn)生與其他細(xì)菌分泌系統(tǒng)的相互作用,將有助于闡明細(xì)菌是如何影響細(xì)胞外環(huán)境的。
綜上所述,不同于細(xì)菌I-IX分泌系統(tǒng),OMV介導(dǎo)毒力因子、黏附分子、毒素和其他免疫調(diào)節(jié)化合物的轉(zhuǎn)移,構(gòu)成了一個(gè)獨(dú)立的分泌系統(tǒng),促進(jìn)細(xì)菌對(duì)不同宿主的黏附和定殖。此外,OMV在營(yíng)養(yǎng)獲取、細(xì)胞間通訊、防御和宿主的免疫調(diào)節(jié)等過(guò)程中的貢獻(xiàn)引起了科學(xué)界的極大興趣。
OMV作為抗原復(fù)合物與天然佐劑已經(jīng)成功應(yīng)用到疫苗中。通過(guò)設(shè)計(jì)高效的脂質(zhì)體納米載體(siRNA、microRNA和蛋白質(zhì)),意在實(shí)現(xiàn)藥物靶向性傳遞,在特定條件下促進(jìn)藥物的釋放,以實(shí)現(xiàn)藥物更好的靶向性,增加藥物的吸收[50]。除了動(dòng)物病原細(xì)菌外,其他微生物如植物病原細(xì)菌、真菌以及共生菌,如根瘤菌等互利微生物也可能分泌OMV[51]。細(xì)菌OMV是否能進(jìn)入植物細(xì)胞或是否有植物胞質(zhì)受體檢測(cè)到OMV尚不清楚。植物細(xì)胞壁的存在是否阻止了OMV與植物細(xì)胞質(zhì)膜的融合,OMV誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)與直接由細(xì)菌引起的免疫反應(yīng)有何不同,OMV在發(fā)病機(jī)制和共生中的作用是什么,這些挑戰(zhàn)植物微生物相互作用領(lǐng)域的問(wèn)題都有待研究人員一一解開(kāi)。并且隨著科研的不斷深入,預(yù)計(jì)在不遠(yuǎn)的將來(lái),外泌體的研究將在疾病治療藥物、疫苗生產(chǎn)研發(fā)、動(dòng)植物營(yíng)養(yǎng)調(diào)節(jié)劑開(kāi)發(fā)等領(lǐng)域展現(xiàn)巨大潛力。