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鐵皮石斛SEP基因克隆與表達的研究

2021-05-19 09:07懂陳文華鄒玉順趙銀河
種子 2021年4期
關(guān)鍵詞:花萼石斛鐵皮

懂陳文華, 鄒玉順, 趙銀河

(云南農(nóng)業(yè)大學(xué)作物農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院, 昆明 650201)

在擬南芥中,SEPALLATA1(SEP1),SEP1、SEP2、SEP3和SEP4被命名為E-class MADS-box基因[2-3,5-6]。研究表明SEP類SEP1、SEP2、SEP3和SEP4基因不僅在擬南芥花發(fā)育早期表達,還參與四輪花器官的發(fā)育,如果這些基因都突變,四輪花器官變成苞片,表明SEP類基因?qū)ㄆ鞴偬卣鞯恼{(diào)控起重要作用[2-3,5-7]。

圖1 SEP-A全長基因的電泳

鐵皮石斛為石斛之極品,野生“鐵皮石斛”, 因其表皮呈鐵綠色而得名。鐵皮石斛具有獨特的藥用價值,研究發(fā)現(xiàn)石斛有增強體質(zhì)、清熱止痛、強筋健骨、降低血糖、抑制腫瘤、明亮眼目、潤養(yǎng)肌膚、延年益壽等功效,被列為“中華九大仙草”之首,民間稱其“救命仙草”。其花器官有特異性,主要產(chǎn)地在云南。本研究以鐵皮石斛花序作為材料,參考張雪梅等[8]的方法進行。

1 材料與方法

1.1 材 料

采用材料為鐵皮石斛(Dendrobiumcandidum)花器官,培養(yǎng)液的配置及所需設(shè)備參照文獻[8]。

1.2 方 法

1.2.1RNA的提取

選用TransZol Plant,試劑盒參考張雪梅等[8]的方法,提取鐵皮石斛花器官的RNA,嚴格按照試劑盒進行。

1.2.2特異性引物設(shè)計

3′-RACE引物參照張雪梅等[8]的方法進行。

總之,高職院校應(yīng)當(dāng)確立體育教育在質(zhì)量立校戰(zhàn)略中的應(yīng)有地位,深刻認識并充分發(fā)揮體育教育在人才培養(yǎng)中的重要作用,使每一位學(xué)生都能具備積極的體育精神、良好的運動能力和健康的運動行為,促進學(xué)生全面發(fā)展。

SEP-A-F 5-AGGGAGAGAAAGAGAAAGAAAT-3;

SEP-A-R 5-ACAAGCCACACAAGTGCATAA-3;

SEP-B-F 5-TGAAAAGTGAGCGAACCAGA-3;

SEP-B-R 5- AACATAATAAGGTAGCAAACAAGAA-3;

1.2.3cDNA的合成

按SMART RACE cDNA Amplication Kit操作流程進行,具體方法參考文獻[8]

1.2.4電泳檢測,割膠回收目的片段

取5 μL的PCR產(chǎn)物進行克隆,克隆方法參照文獻[7]進行,隨機篩選白色菌落,送北京華大基因公司進行測序。

1.2.5SEP1基因的表達

選用TransZol Plant(TransGen Biotech,Beijing,code#ET 121-01)分別提取幼葉、花萼、花瓣、唇瓣以及合蕊柱的RNA,然后進行cDNA合成和RT-PCR,其引物序列如下:

SEP-A-F 5-ATCACTCAAGTTAGCACACAGCAA-3;

SEP-A-R 5-CTTAACTTCCACCTAGAGATGTCGT-3;

SEP-B-F 5-AGTAATCAGACAGCCCATCAGC-3;

SEP-B-R 5-TTGGAGCAGTCGTTGGTG-3;

PCR反應(yīng)條件與克隆該基因一樣,參照文獻[8]的方法進行。

2 結(jié)果與分析

2.1 RACE的結(jié)果

對鐵皮石斛不同發(fā)育時期的花序進行轉(zhuǎn)錄組測序[8],分離出 943 bpSEP-AMADS-box全長cDNA(如圖1),包含有完整的編碼框,編碼243個氨基酸,包含有編碼框5′和3′UTR;同樣分離出1 021 bpSEP-BMADS-box全長cDNA(如圖2),包含有完整的編碼框,編碼227個氨基酸,包含有編碼框5′和3′UTR。

2.2 序列比對

獲得SEPA基因cDNA 全長為 926 bp,包含有編碼框,81 bp 5′UTR和161 bp 3′UTR的非翻譯區(qū),具有完整的開放閱讀框 (ORF)681 bp,編碼227氨基酸,該基因序列起始密碼子為ATG,如圖3。SEPB基因cDNA 全長為954 bp,包含有編碼框,39 bp 5′UTR和127 bp 3′UTR的非翻譯區(qū),具有完整的開放閱讀框 (ORF) 774 bp,編碼243氨基酸,該基因序列起始密碼子為ATG,如圖4。

2.3 SEP1基因在各個花器官的表達

用SEP-A基因靠近3′端的特異引物對鐵皮石斛開花前合蕊柱、唇瓣、花瓣、花萼和幼葉的cDNA模板進行RT-PCR,結(jié)果如圖5,說明SEP-A基因在合蕊柱和唇瓣中表達。

用SEP-B基因靠近3′端的特異引物對鐵皮石斛開花前不同發(fā)育時期的合蕊柱、唇瓣、花瓣、花萼和幼葉的cDNA模板進行RT-PCR,結(jié)果如圖6,說明SEP-B基因在唇瓣、花萼和幼葉中表達。

圖2 SEP-B全長基因的電泳

圖3 SEP-A基因的核苷酸序列和編碼的氨基酸序列

3 討 論

本研究以鐵皮石斛為材料分離出SEP-A和SEP-B基因,確定其全長cDNA序列分別為962 bp和954 bp,編碼227個和243個氨基酸。獲得的序列及其推導(dǎo)的氨基酸序列分析發(fā)現(xiàn)其編碼的蛋白質(zhì)屬于典型的MADS-box,與從其他植物提取出的SEP基因的同源性很高[3],因此,具有MADS-box結(jié)構(gòu)域特性和功能[5]。

SEP類基因?qū)儆贓類基因,在高等真雙子葉植物擬南芥中,E-class MADS-box基因包括SEP1、SEP2、SEP3和SEP4,主要參與四輪花器官的發(fā)育[5-6]。從意大利紅門蘭分離的3個AGL6 MADS-box基因OIcomP8201,OIcomP 1386和OIcomP 4335,OIcomP 8201和OIcomP 1386主要在唇瓣和花萼中表達,OIcomP 4335主要在子房和花萼中表達[9-10]。而在鐵皮石斛中還沒有研究過,從鐵皮石斛中分離的基因通過分析,該基因與其他物種中分離出來的SEP1的基因同源性很高[10]。在表達模式上SEP-A主要在合蕊柱和唇瓣中都表達,SEP-B主要在唇瓣、花萼和幼葉中表達,可能與蘭科比較復(fù)雜的花器官結(jié)構(gòu)有關(guān)系。

SEP作為膠著蛋白可以與 A、B、C、D類MADS-box蛋白質(zhì)互作,蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的“四元體模型”(FQM)的形成[3,5-6,10]。關(guān)于蛋白的作用關(guān)系還有待進一步研究。

圖4 SEP-B基因的核苷酸序列和編碼的氨基酸序列

注:1、2、3、4、5分別為幼葉、花萼、花瓣、唇瓣和合蕊柱。

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