楊德奕,趙懿琛,龔偉偉,李昆鵬
1.貴州大學(xué)茶學(xué)院山地植物資源保護(hù)與種質(zhì)創(chuàng)新省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗室貴州省農(nóng)業(yè)生物工程重點(diǎn)實(shí)驗室,貴州 貴陽550025;2.武漢金開瑞生物工程有限公司,湖北 武漢430223
植物防御素1(Nicotiala alatadefensin 1,NaD1)是植物固有免疫系統(tǒng)的重要組成部分,是植物抵御真菌攻擊的第一道防線[1],一般對哺乳動物和植物細(xì)胞無毒,對植物及人類的真菌病原體具有較強(qiáng)抗菌活性[2-3]。NaD1蛋白可在花煙草Nicotiala alata的花芽中提取獲得[4]。研究發(fā)現(xiàn),在花煙草Nicotiala alata中,NaD1蛋白穿過真菌細(xì)胞質(zhì)膜及進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)前,與真菌細(xì)胞壁發(fā)生特異性作用,進(jìn)入細(xì)胞后,迅速引發(fā)產(chǎn)生活性氧(reactive oxygen species,ROS),真菌質(zhì)膜發(fā)生透化,導(dǎo)致真菌細(xì)胞死亡[5-7]。NaD1蛋白對尖孢鐮刀桿菌(Fusarium oxysporum)、灰霉菌(Botrytis cinerea)、念珠菌(Candida albicans)等多種致病性真菌也具有良好的抗菌活性[8]。另有研究表明,NaD1蛋白可與磷酸酰肌醇4,5-二磷酸發(fā)生特異性、高親和力的相互作用,從而發(fā)揮抑制腫瘤細(xì)胞活性的作用[9],但作用機(jī)制尚未明確。
NaD1蛋白的傳統(tǒng)分離純化方法復(fù)雜,成本較高。甲醇畢赤酵母具有表達(dá)量高、糖基化機(jī)制較接近高等真核生物、分泌蛋白便于純化、可高密發(fā)酵、生長繁殖迅速、可耐受較高強(qiáng)度的流體靜壓、易于大規(guī)模生產(chǎn)等優(yōu)點(diǎn)[10-11]。研究表明,已有500多種蛋白在畢赤酵母中實(shí)現(xiàn)了分泌表達(dá),其中大部分為可投入產(chǎn)業(yè)化的藥用蛋白[12]。畢赤酵母對原核生物大量繁殖培養(yǎng)較容易,對真核生物基因產(chǎn)物可進(jìn)行正確折疊及翻譯后修飾加工[13-14]。武如娟[15]將抗菌抗病毒雜合肽Cecropin(1-8)-LL37(17-30)基因克隆至畢赤酵母表達(dá)載體pPICZαA中,表達(dá)純化后每升發(fā)酵液中可提取190.65 mg的重組雜合肽;李旭鋒等[16]將新城疫病毒(Newcastle disease,NDV)HN蛋白的基因克隆至畢赤酵母表達(dá)載體pPICZαA中,表達(dá)純化后可獲得純度高于90%的重組蛋白。本研究將重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-NaD1于畢赤酵母GS115中誘導(dǎo)表達(dá),并進(jìn)行Ni-NTA純化,以期獲得較高純度的重組蛋白NaD1,為后續(xù)NaD1蛋白殺傷真菌及抑制癌細(xì)胞作用機(jī)制的研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 質(zhì)粒及菌株 重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-NaD1由武漢金開瑞生物工程有限公司構(gòu)建(將NaD1基因序列[17]克隆至載體pPIC9K,經(jīng)雙酶切驗證構(gòu)建正確);載體pPIC9K、感受態(tài)E.coliTOP10及感受態(tài)畢赤酵母GS115均由該公司提供。
1.2 主要試劑及儀器 磷酸二氫鉀(KH2PO4)、磷酸氫二鉀(K2HPO4)、甘油(C3H8O3)、葡萄糖(C6H12O6)、甲醇(CH3OH)、乙二胺四乙酸二鈉(EDTA·2Na)、三氯乙酸(trichloroacetic acid,TCA)、酪蛋白及咪唑均購自北京國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;內(nèi)切酶SacⅠ、RDB培養(yǎng)基及Geneticin(G418)均購自美國賽默飛世爾科技有限公司;BMGY液體培養(yǎng)基及YP培養(yǎng)基均由貴州大學(xué)茶學(xué)院山地植物資源保護(hù)與種質(zhì)創(chuàng)新省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗室自制;限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、NotⅠ、小鼠抗NaD1單克隆抗體、HRP標(biāo)記的羊抗小鼠IgG、消泡劑、質(zhì)粒提取試劑盒、Ni-NTA柱、0.22μm過濾器、10 kDa超濾管均由武漢金開瑞生物工程有限公司提供。
1.3 重組表達(dá)質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化 將重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9KNaD1經(jīng)內(nèi)切酶SacⅠ線性化后,進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳,回收酶切產(chǎn)物,電轉(zhuǎn)化至感受態(tài)畢赤酵母GS115中(參數(shù)設(shè)置為:電壓1 500 V,時間5 ms),涂布于RDB+G418平板培養(yǎng)基,于30℃孵育3~4d進(jìn)行篩選。
1.4 陽性克隆的鑒定 根據(jù)GenBank中登錄的NaD1基因序列(AF509566.1)的開放閱讀框,應(yīng)用Oligo 7軟件設(shè)計引物,F(xiàn):5′-GAGAGGCTGAAGCTTACGTAGAATTCATGCACCATCACCATCACCATAGAGAATG-3′,R:5′-TGTCTAAGGCGAATTAATTCGCGGCCGCTTAGTTATCCATTATCTCTTCTTCAAG-3′,擴(kuò)增產(chǎn)物大小為278 bp。引物由武漢金開瑞生物工程有限公司合成。挑取篩選的重組陽性克隆單菌落,進(jìn)行菌落PCR檢測。PCR反應(yīng)體系為:dNTP 1.6μL,10×buffer 2.0μL,上、下游引物各0.2μL,Enzyme 0.2μL,ddH2O補(bǔ)足總體系至20.0μL。PCR反應(yīng)程序為:94℃5 min;94℃30 s,57℃30 s,72℃90 s,共30個循環(huán);72℃7 min。同時設(shè)空白對照(未加模板)。PCR產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。將檢測正確的重組陽性克隆送武漢金開瑞生物工程有限公司測序。
1.5 重組蛋白的小量誘導(dǎo)表達(dá) 挑選菌落PCR鑒定陽性的克隆,加至1.5 mL BMGY液體培養(yǎng)基中,于30℃,200 r/min搖床培養(yǎng)48 h;靜置5~6 h,棄上清,加入1 mL BMMY液體培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24 h;加入200μL含5%甲醇的YP培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24 h;8 929×g離心10 min,取上清,加入150μL TCA,冰浴2 h;重復(fù)離心,棄上清,加入200μL丙酮洗滌沉淀,重復(fù)離心,棄上清,置60℃烘箱烘干15~20 min;加入20μL 1×loading buffer重懸后,進(jìn)行15%SDS-PAGE分析。同時設(shè)陰性對照(轉(zhuǎn)染空載體pPIC9K的菌落)。
1.6 重組蛋白的大量表達(dá)及純化 挑取小量誘導(dǎo)表達(dá)水平較高的單菌落,接種于1 L BMGY液體培養(yǎng)基中,于30℃200 r/min培養(yǎng)24 h;4 722×g離心3 min,棄上清,接種于1 L BMMY培養(yǎng)基中,加入200μL消泡劑,繼續(xù)培養(yǎng)24 h;加入1%的甲醇,繼續(xù)誘導(dǎo)培養(yǎng)24 h;重復(fù)上步操作,4 722×g離心5 min,取上清,經(jīng)不銹鋼圓盤過濾器過濾,透析柱法濃縮至200 mL,即濃縮上清。用1 mol/L Tris(pH 9.0)調(diào)節(jié)濃縮上清pH至8.0;經(jīng)0.22μm過濾器過濾,以1 mL/min的流速上樣Ni-NTA柱,用NTA-0緩沖液(pH 8.0)洗至流出液體不含蛋白,再用250 mmol/L咪唑洗脫,收集洗脫液,經(jīng)10 kDa超濾管超濾濃縮至1~2 mL。
1.7 純化產(chǎn)物的鑒定 采用Western blot法。純化的重組蛋白NaD1經(jīng)15% SDS-PAGE分離后,電轉(zhuǎn)移至PVDF膜,用含1%酪蛋白的封閉液于37℃封閉2 h;PBST洗滌3次,加入小鼠抗NaD1單克隆抗體(1∶1 000稀釋),于37℃孵育60 min;PBST洗滌3次,加入HRP標(biāo)記的羊抗小鼠IgG(1∶3 000稀釋),于37℃孵育60 min;ECL法顯色。另取200μL純化的重組蛋白NaD1,加入2×上樣緩沖液,煮沸10 min,送武漢金開瑞生物工程有限公司進(jìn)行蛋白質(zhì)譜鑒定。
2.1 重組表達(dá)質(zhì)粒的鑒定 重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9KNaD1的單切酶(SacⅠ)產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳分析,可見9 572 bp的目的基因片段,大小與預(yù)期一致,見圖1。
圖1 重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-NaD1的單酶切產(chǎn)物(SacⅠ)電泳圖Fig.1 Electrophoretic profle of recombinant plasmid pPIC9KNaD1 digested with SacⅠ
2.2 陽性克隆的鑒定 經(jīng)電轉(zhuǎn)化獲得的重組陽性克隆經(jīng)菌落PCR檢測,可見278 bp的目的條帶,大小與預(yù)期一致,見圖2。測序結(jié)果表明,目的基因序列與GenBank中登錄的NaD1基因序列(AF509566.1)開放閱讀框一致。
圖2 陽性克隆的菌落PCR鑒定Fig.2 Identification of positive clones by PCR
2.3 小量誘導(dǎo)表達(dá)產(chǎn)物的鑒定 所有陽性克隆重組蛋白的表達(dá)均不明顯,因此需進(jìn)一步進(jìn)行大量誘導(dǎo)表達(dá)。其中5號陽性克隆誘導(dǎo)表達(dá)的重組蛋白水平相對較高,于相對分子質(zhì)量約20 000處略可見目的蛋白條帶,見圖3。因此,選擇5號陽性克隆進(jìn)行大量誘導(dǎo)表達(dá)重組蛋白。
圖3 陽性克隆表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig.3 SDS-PAGE profile of expressed product in positive clones
2.4 純化產(chǎn)物的鑒定 純化產(chǎn)物相對分子質(zhì)量約20 000,大小與預(yù)期一致,見圖4;純化產(chǎn)物可與小鼠抗NaD1單克隆抗體發(fā)生特異性結(jié)合,且于相對分子質(zhì)量約20 000處可見特異性結(jié)合條帶,見圖5。純化重組蛋白NaD1純度可達(dá)85%,蛋白得率為0.25mg/L。在可信度conf≥95%,Unique peptides≥1時,重組蛋白NaD1鑒定到的蛋白質(zhì)總數(shù)為8,覆蓋度(Coverage)最高比對蛋白為6 His-NaD1,覆蓋度達(dá)12%,相對分子質(zhì)量為9 700,大小與理論值相符,見表1。上述結(jié)果表明,于酵母表達(dá)系統(tǒng)中成功純化獲得了重組蛋白NaD1。
圖4 純化產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig.4 SDS-PAGE profile of purified product
表1 純化產(chǎn)物的蛋白質(zhì)譜鑒定結(jié)果Tab.1 Protein mass spectrometry of purified product
本研究將重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-NaD1電轉(zhuǎn)化至畢赤酵母感受態(tài)GS115中進(jìn)行NaD1重組蛋白分泌表達(dá)。轉(zhuǎn)化重組表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K-NaD1的GS115通過G418篩選,獲得了陽性克隆菌株,經(jīng)甲醇誘導(dǎo)后,表達(dá)水平較低,可能是由于小量表達(dá)誘導(dǎo)不足所致。因此,選擇了表達(dá)量相對較高的單菌落進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),大量表達(dá)的重組蛋白經(jīng)Ni-NTA純化后,純化產(chǎn)物可與小鼠抗NaD1單克隆抗體發(fā)生特異性結(jié)合,于相對分子質(zhì)量約20 000處可見特異性結(jié)合條帶,條帶大小與重組蛋白NaD1理論值11 000不符,是由于含有His標(biāo)簽所導(dǎo)致的;蛋白條帶呈彌散狀態(tài),推測是由于酵母系統(tǒng)表達(dá)中發(fā)生了糖基化修飾[18]及NaD1蛋白形成了多聚體[19]。本研究獲得純化產(chǎn)物的純度為85%,得率為0.25 mg/L,今后將進(jìn)一步優(yōu)化其表達(dá)體系,以期得到更高表達(dá)及純化效率的NaD1蛋白。
綜上所述,本研究于畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)中成功表達(dá)了重組蛋白NaD1,并進(jìn)行了純化,獲得了純度較高的重組蛋白NaD1,為后續(xù)NaD1蛋白殺傷真菌和抑制癌細(xì)胞作用機(jī)制的研究奠定了基礎(chǔ)。