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石家莊地區(qū)新生兒Citrin蛋白缺乏癥串聯(lián)質(zhì)譜篩查結(jié)果分析

2021-05-31 02:43:54賈立云封紀(jì)珍王熙馬翠霞封露露
國際生殖健康/計劃生育雜志 2021年3期
關(guān)鍵詞:缺乏癥串聯(lián)基因突變

賈立云,封紀(jì)珍,王熙,馬翠霞,封露露

Citrin蛋白缺乏癥是一類常染色體隱性遺傳病,由SLC25A13基因突變所致,引起肝細(xì)胞線粒體Citrin蛋白功能不足,導(dǎo)致機體代謝紊亂[1]。該病臨床罕見,發(fā)病機制目前尚不完全清楚,臨床上將其分為兩類:一類為新生兒肝內(nèi)膽汁淤積癥(neonatal intrahepatic cholestasis caused by citrin deficiency,NICCD),由Citrin蛋白缺乏所致;另一類為成年發(fā)作Ⅱ型瓜氨酸血癥(citrullinaemia type Ⅱ,CILN2)[2]。Citrin蛋白缺陷所致的NICCD最常見,新生兒期主要表現(xiàn)為膽汁淤積、黃疸延遲消退、凝血功能障礙、肝功能異常以及血氨基酸水平升高。NICCD患兒預(yù)后較好,多數(shù)患兒1歲以內(nèi)可恢復(fù)正常,少數(shù)患兒因延遲就醫(yī)而發(fā)生肝功能衰竭[3-5]。自2013年串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)不斷在新生兒遺傳代謝病篩查中推廣應(yīng)用,使患兒得以早發(fā)現(xiàn)、早診斷和早治療,我國部分地區(qū)已經(jīng)將NICCD列為篩查病種之一,然而此病部分患兒呈現(xiàn)假陰性[6-7]。本研究采用串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)對石家莊地區(qū)2014—2019年出生的160 061例活產(chǎn)新生兒進行氨基酸水平檢測,初步明確了該病在石家莊地區(qū)的患病率,進而對部分患兒進行基因檢測,發(fā)現(xiàn)了1種未報道過的SLC25A13基因突變位點。

1 資料與方法

1.1一般資料采集石家莊地區(qū)2014年1月—2019年12月分娩的160 061例活產(chǎn)新生兒(3~20 d) 的足跟血,制成S&S903濾紙干血斑標(biāo)本,經(jīng)石家莊市新生兒疾病篩查中心串聯(lián)質(zhì)譜篩查并進一步確診的1例Citrin蛋白缺乏癥患兒以及1例假陰性患兒。篩查前家長均簽署知情同意書,本研究經(jīng)石家莊市婦幼保健院倫理委員會批準(zhǔn)實施。

1.2檢測方法

1.2.1 儀器與試劑 串聯(lián)質(zhì)譜儀(TQD,Waters)、自動進樣器(2777C)、高效液相色譜儀泵(1525)、串聯(lián)質(zhì)譜篩查數(shù)據(jù)分析軟件(MassLynxV4.1)均購自美國Waters公司;超聲波清洗機購自中國康士潔有限公司;通風(fēng)柜購自中國杰瑞電氣有限公司;微孔板恒溫孵育震蕩儀購自杭州奧盛儀器有限公司;串聯(lián)質(zhì)譜-非衍生化氨基酸測定試劑盒購自山東英盛公司。

1.2.2 標(biāo)本采集 生后72 h,充分哺乳后于新生兒足跟內(nèi)、外側(cè)緣用75%的乙醇棉簽消毒后,采用觸壓式采血器穿刺,深度不超過2.0 mm,用無菌棉球棄去第一滴血,連續(xù)采集3個血滴于S&S903濾紙,每個血斑的直徑不小于8 mm,以水平位置懸掛血片,室溫下自然干燥2~3 h后,血斑顏色從鮮紅至褐色即可遞送,如不能當(dāng)日進行遞送,應(yīng)將血片標(biāo)本置于密封袋中,置于2~8 ℃冰箱,最遲不超過5個工作日遞送至篩查中心。

1.2.3 檢測方法 采用串聯(lián)質(zhì)譜干血濾紙片——非衍生法。①萃取:用打孔器從標(biāo)本上打出直徑3 mm的血斑,置于96孔微孔板中。使用校準(zhǔn)的移液器,將90 μL萃取工作液依次加入到標(biāo)本孔中,貼上封片以減少蒸發(fā),30 ℃,700 r/min,于恒溫震蕩孵育器震蕩45 min。②上機:取出96孔板,移液75 μL至V型底96孔板,鋁箔紙覆上,減少揮發(fā),置于2777C自動進樣器中;MassLynxV4.1中建立樣品列表,沖洗管路后進樣分析。③濃度值計算:通過比較分析物及內(nèi)標(biāo)的信號積分面積,計算待檢物質(zhì)的濃度水平。

1.2.4 質(zhì)量控制 每批實驗均設(shè)置高、低質(zhì)控,質(zhì)控來源為山東英盛氨基酸和肉堿測定試劑盒自帶商品化高、低質(zhì)控。每次檢測過程中將室內(nèi)質(zhì)控品與樣本同時檢測,記錄此標(biāo)本的檢測結(jié)果;計算前20次檢測結(jié)果的平均值作為本批質(zhì)控品的靶值,質(zhì)控結(jié)果控制在靶值±2SD內(nèi);每年參加2次國家衛(wèi)生健康委員會臨床檢驗中心的室間質(zhì)量評價,成績合格。

1.2.5 診斷方法

1.2.5.1 確診 串聯(lián)質(zhì)譜篩查血瓜氨酸水平≥30 μmol/L為篩查陽性,召回復(fù)查陽性患兒進行生化檢測,顯示總蛋白、白蛋白明顯降低;堿性磷酸酶、天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶、膽汁酸、總膽紅素、直接膽紅素升高;甲胎蛋白>1 000 μg/L;尿有機酸水平顯著升高。肝性和膽汁淤積性黃疸,直接膽紅素、血瓜氨酸升高為主要臨床特征。以SLC25A13基因檢測到突變?yōu)榛虼_診。

1.2.5.2 基因檢測 疑似患兒經(jīng)知情同意,采集患兒及父母外周靜脈血各4 mL,采用DNA提取試劑盒(Qiagen)提取核酸,后進行基因組文庫構(gòu)建。用標(biāo)記的探針抓取目的基因,用磁力架吸附,富集目的基因。采用Illumina公司的NextSeq 500進行代謝相關(guān)基因測序[8]。檢測到的變異位點嚴(yán)格按照ACMG指南進行致病性分析。未報道的基因突變,則用生物信息學(xué)蛋白功能預(yù)測軟件預(yù)測致病性,進一步采用Sanger測序進行結(jié)果驗證。此檢測由北京邁基諾醫(yī)學(xué)檢驗所完成。

2 結(jié)果

2.1總體篩查情況160 061例新生兒中篩查陽性20例,確診1例,另1例患兒篩查未能檢出,呈現(xiàn)假陰性,患兒不足1個月因皮膚黃染加重入院,查血串聯(lián)質(zhì)譜,顯示瓜氨酸和甲硫氨酸升高;Citrin蛋白缺乏癥在石家莊地區(qū)新生兒中的患病率為2/160 061。

2.2串聯(lián)質(zhì)譜篩查結(jié)果2例Citrin蛋白缺乏癥患兒中,例1初篩結(jié)果瓜氨酸(CIT)水平稍高于參考值范圍(4~30 μmol/L),為44.00 μmol/L,復(fù)查時CIT為504.00 μmol/L,甲硫氨酸(MET)58.60 μmol/L(參考值8~50 μmol/L);例2初篩結(jié)果CIT在正常參考范圍以內(nèi),為17.17 μmol/L,未做復(fù)查。

2.3基因突變檢測結(jié)果2例患兒中只有1例患兒進行基因檢測,檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn)為SLC25A13基因復(fù)合雜合突變,見圖1,分別來自父母,其中c.1021+1G>A為剪切位點突變,為未見報道突變,使用GERP++、SIFT、REVEL、PolyPhen_2、MutationTaster等生物信息學(xué)蛋白功能預(yù)測軟件,預(yù)測其致病性,結(jié)合患兒皮膚黃染加重,血串聯(lián)質(zhì)譜顯示瓜氨酸和甲硫氨酸升高,尿有機酸氣相質(zhì)譜顯示4-羥基苯乳酸及4-羥基苯丙酮酸均顯著升高,考慮為致病性變異;c.851_854delTATG為缺失突變,造成移碼突變,編碼2個氨基酸后終止,見表1。

圖1 例1患兒的SLC25A13基因突變檢測結(jié)果

表1 Citrin蛋白缺乏癥患兒基因突變檢測結(jié)果

3 討論

3.1 Citrin蛋白缺乏癥在石家莊地區(qū)新生兒中的患病率Citrin蛋白缺乏致NICCD是尿素循環(huán)障礙旁路代謝異常疾病,在新生兒期主要有黃疸消退減慢、膽汁淤積等臨床表現(xiàn),如未能明確病因,會延誤診治,影響患兒預(yù)后[9]。串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)在新生兒疾病篩查中的不斷推廣應(yīng)用,使早期發(fā)病的Citrin蛋白缺乏癥患兒得以篩查、確診和及時干預(yù)治療[10-11]。據(jù)文獻報道,該病在韓國的患病率為1/50 000,日本為1/19 000,我國的患病率為1/17 000[12]。文獻報道該病在廣州市新生兒中患病率為1/22 664[6]。本研究采用串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)對160 061例新生兒進行篩查,回顧分析發(fā)現(xiàn)Citrin蛋白缺乏癥在石家莊地區(qū)新生兒中的患病率為2/160 061,低于廣州市新生兒患病率,可能與南北地區(qū)人群的SLC25A13基因突變雜合子攜帶率不同相關(guān),具有地域性差異,有待進一步分析。

3.2 部分Citrin蛋白缺乏癥篩查呈假陰性本研究檢出1例患兒,串聯(lián)質(zhì)譜篩查和瓜氨酸增高對明確診斷NICCD有重要意義。此外篩查發(fā)現(xiàn)1例呈假陰性,據(jù)文獻報道廣州市158 651例新生兒中發(fā)現(xiàn)4例患兒呈假陰性[6]。因此,新生兒篩查只能篩查部分Citrin蛋白缺乏癥患兒,因患兒在新生兒早期可出現(xiàn)不同程度的血氨基酸改變[13],可能與采血時間偏早,代謝譜特征尚未呈現(xiàn)有關(guān),有待于進一步研究。

3.3 SLC25A13基因突變分析Citrin蛋白缺乏癥是一類常染色體隱性遺傳病,定位于7q21.3,由SLC25A13基因突變所致[14]。已報道54種突變,其中與臨床表現(xiàn)密切相關(guān)的有10 個,分別為c.851_854delTATG、c.615+5G>A、g.IVS16ins3kb、c.1638_1660dup23、c.955C>T、c.1592G>A、c.1399C>T、IVS11+1G>A、c.1092_1095delT、c.754G>A,尤其是c.851_854delTATG、c.615+5G>A、c.1638-1660dup23和g.IVS16ins3kb,這4個突變位點在中國人群中占所有突變的90%以上[15-19]。本研究發(fā)現(xiàn)的1例患兒為復(fù)合雜合突變,突變位點分別為c.1021+1G>A、c.851_854delTATG,其中c.1021+1G>A為未報到基因突變。

Citrin蛋白缺乏癥作為常見的代謝性疾病,是一種潛在的致死性疾病,早期診斷、早期治療是本病診療的關(guān)鍵。本研究應(yīng)用串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)進行篩查,初步明確了該病在石家莊地區(qū)新生兒中的患病率;進一步結(jié)合基因檢測技術(shù)手段明確致病基因突變類型,為家庭再生育前的遺傳咨詢給予指導(dǎo)。

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