袁仁智,肖衛(wèi)瓊,唐 鵬,康開彪,潘 文
1 甘肅省中醫(yī)院,甘肅 蘭州 730050;2 甘肅省中醫(yī)藥研究院;3 邵陽學(xué)院
多囊卵巢綜合征(polycystic ovarian syndrome,PCOS)是影響女性最常見的內(nèi)分泌紊亂疾病,在育齡女性中發(fā)病率約5%~20%,且呈不斷上升趨勢[1]。PCOS 主要包括月經(jīng)周期紊亂、高雄激素血癥和肥胖等臨床癥候群[1]。PCOS的發(fā)病機制及其相關(guān)癥狀雖有待解釋,但癥狀和體征的異質(zhì)性提示其發(fā)病因素多樣[2]。有學(xué)者認(rèn)為,PCOS 的發(fā)生不僅受遺傳影響,也與下丘腦-垂體-卵巢軸調(diào)控功能紊亂、高胰島素血癥、肥胖、精神、心理、環(huán)境等因素密切相關(guān)[3]。西醫(yī)主要通過抗雄激素、胰島素增敏劑及促排卵藥物干預(yù),雖有一定療效,但常伴有腫脹、胃痛、盆腔或下腹部痛等不良反應(yīng),嚴(yán)重時引發(fā)卵巢過度刺激綜合征,出現(xiàn)頭暈、惡心、嘔吐、精神抑郁甚至導(dǎo)致卵巢早衰。中醫(yī)藥辨證論治的個性化方案在治療PCOS 方面有獨到之處。通過整理古今中醫(yī)名家治療PCOS 疾病或癥狀的方劑,運用中醫(yī)傳承輔助系統(tǒng)進行數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),中醫(yī)治療PCOS 證候中以腎虛血瘀型和肝郁腎虛型最多,腎、脾、肝臟功能失調(diào)是PCOS 主要病機,補虛和解郁是治療PCOS 的根本方法,而補腎健脾、疏肝解郁、理氣化痰、活血化瘀是治療PCOS的主要思路[4]。
中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)作為目前國內(nèi)較為完善的草藥成分靶點數(shù)據(jù)庫,共收錄了505 味草藥的12 144 個活性成分、關(guān)鍵藥物動力學(xué)性質(zhì)、類藥性、作用靶點、參與的通路及相關(guān)疾病,為中草藥檢索、新藥開發(fā)和中醫(yī)藥基礎(chǔ)理論的現(xiàn)代闡釋提供了新手段和新方法。
本研究提取腎虛血瘀型方劑核心組藥,采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析藥物的化學(xué)成分、靶點和通路之間的關(guān)系,試圖揭示中藥治療PCOS 的作用機制。
借助中國中醫(yī)科學(xué)院研制的中醫(yī)傳承輔助平臺(2.5版本)建立PCOS方劑數(shù)據(jù)庫并進行數(shù)據(jù)挖掘[4],數(shù)據(jù)庫收集了130 位現(xiàn)代醫(yī)家的352 個方劑,對其中的腎虛血瘀型方劑運用熵聚類法進行關(guān)聯(lián)分析。
2.1 巴戟天-續(xù)斷-益母草組藥挖掘及其活性成分篩選和靶點預(yù)測進入自建的中醫(yī)傳承輔助平臺PCOS 數(shù)據(jù)庫,通過數(shù)據(jù)分析組方規(guī)律,獲得腎虛血瘀型方劑25個,涉及藥物96味。運用關(guān)聯(lián)規(guī)則和熵聚類法發(fā)現(xiàn),當(dāng)支持度為6,置信度為0.6時,巴戟天-續(xù)斷-益母草配伍概率較高。因此,選取巴戟天-續(xù)斷-益母草為腎虛血瘀型PCOS 的核心組藥進行網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析。
進入TCMSP 平臺(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),選擇Herb name,依次輸入“Bajitian”“Xuduan”“Yimucao”,分別獲得174 個、31 個和51 個化學(xué)成分,然后根據(jù)口服生物利用度(OB)和藥物相似度(DL)進行篩選,設(shè)為OB≥30%,DL≥0.05,去重后得到巴戟天-續(xù)斷-益母草活性化合物34個(巴戟天18個,續(xù)斷6個,益母草8個,巴戟天和續(xù)斷共有2 個)。同時在TCMSP 中獲得34 個化合物的620 個潛在靶點(其中有6 個化合物無靶點),篩去重復(fù)項,整理得到140個靶點,見表1。
表1 巴戟天-續(xù)斷-益母草組藥活性化合物特征
2.2 藥物與疾病共靶點及化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)NCBI是一個關(guān)于分子生物學(xué)、生物化學(xué)和遺傳學(xué)知識的存儲和分析的數(shù)據(jù)庫。進入NCBI 基因數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov),以“polycystic ovarian syndrome”為關(guān)鍵詞檢索,選擇種屬“人類”,得到228個PCOS疾病基因靶點。
將巴戟天-續(xù)斷-益母草組藥與PCOS 疾病靶點分別錄入Excel 建立文檔,通過比對找到兩者的共有靶點19 個,涉及化合物25 個,這些可能是PCOS 的主要作用靶點。將共靶點及其對應(yīng)化合物數(shù)據(jù)導(dǎo)入Cytoscape 3.7.0 構(gòu)建化合物-靶點(CT)網(wǎng)絡(luò),44 個節(jié)點代表化合物和靶點,86 條連線代表化合物和靶點的關(guān)系,每個靶點涉及的化合物均值為4.52,每個化合物涉及的靶點均值為3.44,涉及4 個及以上靶點的化合物有8 個,最多的有17個靶點。涉及5個及以上化合物的靶點有5 個,最多的涉及20 個化合物。這8 個化合物和5個靶點可能與PCOS關(guān)系最為密切,見表2、圖1。
表2 巴戟天-續(xù)斷-益母草組藥與PCOS疾病共靶點
圖1 化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)圖(圓形代表化合物,三角形代表靶點)
2.3 共靶點蛋白互作網(wǎng)絡(luò)藥物作用既可以表現(xiàn)為直接與靶點結(jié)合和單一的信號通路,也可以是直接靶點和間接靶點共同調(diào)控等多靶點、多通路、多層次的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模式。因此通過蛋白之間的相互作用關(guān)系即PPI 網(wǎng)絡(luò)可以進一步深入分析藥物對PCOS的重要影響。進入String數(shù)據(jù)庫,點擊Multiple Proteins,輸入19 個共靶點,種屬“人類”,設(shè)置評分為0.4,網(wǎng)絡(luò)邊緣含義為“分子作用”,得到蛋白互作網(wǎng)絡(luò),節(jié)點數(shù)為19,邊數(shù)為99,平均節(jié)點度為10.4,局部聚類系數(shù)為0.852。PPI 富集P值<1.0e-16,這意味著蛋白質(zhì)之間的相互作用較基因組中隨機的一組相似大小的蛋白質(zhì)所預(yù)期的更多,即蛋白質(zhì)之間的活躍度較高,見圖2。
圖2 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
2.4 靶點通路通過DAVID 數(shù)據(jù)庫得到19 個共靶點的基因功能GO 富集1 048 條,KEGG 信號通路富集21條。其中細(xì)胞組成25個,主要包括細(xì)胞外空間、細(xì)胞外區(qū)域、分泌顆粒、細(xì)胞質(zhì)囊泡、細(xì)胞內(nèi)囊泡等;生物功能28 個,主要包括受體結(jié)合、細(xì)胞因子活性、類固醇激素受體活性、生長因子受體結(jié)合、脂質(zhì)結(jié)合、轉(zhuǎn)錄因子活性、生長因子活性、氧化還原酶活性、受體調(diào)節(jié)劑活性、調(diào)節(jié)區(qū)DNA 結(jié)合、調(diào)節(jié)區(qū)核酸結(jié)合等;生物過程995 個,主要涉及對有機物的反應(yīng)、細(xì)胞增殖、對脂質(zhì)的反應(yīng)、對含氧化合物的反應(yīng)、對外部刺激的反應(yīng)、生物合成過程的正調(diào)節(jié)、細(xì)胞凋亡、程序性細(xì)胞死亡、大分子生物合成、細(xì)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的正調(diào)節(jié)、對類固醇激素刺激的細(xì)胞反應(yīng)、血管發(fā)育、單一生物代謝過程、趨化因子生物合成、細(xì)胞活化、血液循環(huán)、免疫效應(yīng)過程和炎癥反應(yīng)等;信號途徑主要有HIF-1信號通路、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、1 型糖尿病、炎癥性腸病、腫瘤壞死因子(TNF)信號通路、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用、NOD 樣受體信號通路、PI3K-Akt 信號通路、癌癥的途徑、雌激素信號通路、胰島素抵抗、卵母細(xì)胞減數(shù)分裂、Jak-STAT 信號通路、非酒精性脂肪性肝病、癌癥中的轉(zhuǎn)錄失調(diào)、同種異體移植排斥反應(yīng)、膀胱癌等;設(shè)置參數(shù)為FDR<0.05,P<0.05,獲得GO 條目189 個,KEGG條目1條即HIF-1信號通路。21條信號通路富集結(jié)果采用OMICSHARE(http://www.omicshare.com)在線工具作出泡泡圖。同時借助Cytoscape 3.7.0構(gòu)建靶點-通路網(wǎng)絡(luò),見表3—4、圖3—5。
表3 預(yù)測靶點基因功能富集
表4 潛在靶點信號通路富集
圖3 潛在靶點生物功能富集圖
圖4 預(yù)測靶點信號通路富集圖
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一門從生物網(wǎng)絡(luò)角度研究疾病發(fā)生和發(fā)展過程,認(rèn)識藥物與機體的相互作用并指導(dǎo)新藥發(fā)現(xiàn)的學(xué)科,在研究工具上,該學(xué)科借助高通量組學(xué)數(shù)據(jù)、分子網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)以及計算機模擬分析,研究藥物的作用機制和促進藥物創(chuàng)新[5]。而中醫(yī)的整體觀念、辨證論治理論與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的系統(tǒng)動態(tài)觀高度一致,因此,運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法研究中醫(yī)復(fù)方的作用機制成為目前藥理學(xué)研究的一個熱點[6]。本研究通過數(shù)據(jù)挖掘找出了治療腎虛血瘀型PCOS 的一組核心組藥巴戟天-續(xù)斷-益母草(B-X-Y),這3 味藥是中醫(yī)臨床專家廣泛使用的補腎活血藥物。研究借助系統(tǒng)藥理學(xué)、藥代動力學(xué)和生物信息學(xué)方法確定組藥的活性化合物及與PCOS相關(guān)的靶點和通路。
圖5 靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖
通過TCMSP 平臺的OB 和DL 篩選,獲得巴戟天-續(xù)斷-益母草的34 個化合物和140 個靶點,發(fā)現(xiàn)其中靶點最多的是槲皮素(87 個靶點)和山奈酚(55 個靶點),其次是β-谷甾醇、異鼠李素、花生四烯酸和蒽醌。可見,槲皮素和山奈酚是治療PCOS 的主要化合物,這與LIU 等[7]研究二仙湯治療PCOS 的結(jié)果一致,也與本項目前期研究菟絲子治療腎虛血瘀型PCOS 的結(jié)果相吻合,不同之處在于LIU等[7]研究主要來自二仙湯當(dāng)中的淫羊藿、知母和黃柏,本研究中槲皮素、山奈酚和異鼠李素(36 個靶點)、花生四烯酸(31 個靶點)均來源于益母草。槲皮素是一種植物多酚,除了在血小板聚集、脂質(zhì)過氧化、毛細(xì)血管通透性、細(xì)胞攝取和自由基中的積極作用外,還具有抗炎、抗癌及抗病毒活性[8]。WANG 等[9]研究結(jié)果表明,槲皮素可抑制Toll樣受體/NF-κB信號通路,改善PCOS大鼠模型中卵巢組織的炎癥微環(huán)境。REZVAN 等[10]研究發(fā)現(xiàn),在隨機安慰劑對照的雙盲試驗中,口服槲皮素補充劑可增強AMPK 水平,改善PCOS 的代謝特征。山奈酚是一種膳食類黃酮,具有抗氧化、抗炎、抗細(xì)胞凋亡、抗癌、雌激素和抗雌激素活性[11]。其通過減弱炎癥和細(xì)胞凋亡來調(diào)節(jié)MAPK 通路以防止IR 損傷[12]。異鼠李素屬于黃酮類,分子式為C16H12O7,其作用廣泛,有擴張冠脈、保護血管內(nèi)皮及抗血栓、抗腫瘤細(xì)胞[13]、抗病毒[14]及減輕氧化應(yīng)激、抗細(xì)胞凋亡[15]和抗炎[16]等作用。花生四烯酸是一種ω-6 多不飽和脂肪酸,為花生油中飽和的花生酸的相對物,具有酯化膽固醇、增加血管彈性、降低血液黏度,調(diào)節(jié)血細(xì)胞功能等一系列生理活性,對預(yù)防心血管疾病、糖尿病和腫瘤等具有重要作用。相關(guān)文獻[17-18]報道糖異生的增加是2 型糖尿病基礎(chǔ)狀態(tài)下高血糖的一個重要因素,而吳勉云等[19]實驗表明,花生四烯酸能顯著降低糖異生兩個關(guān)鍵酶磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶和葡萄糖-6-磷酸酶的轉(zhuǎn)錄水平以及磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶的酶活性。來源于巴戟天的兩種蒽醌:2-羥基-1,5-二甲氧基-6-(甲氧基甲基)-9,10-蒽醌和1,6-二羥基-5-甲氧基-2-(甲氧基甲基)-9,10-蒽醌,分別有31個靶點和29個靶點,兩者的口服生物利用度較高,分別為95 和104。蒽醌類化合物是各種天然醌類化合物中數(shù)量最多的一類化合物,具有抗菌消炎[20]、抗病毒[21-23]、抗腫瘤[24-25]、利尿、活血[26]、降血脂[27]和增強免疫功能[28]等作用。β-谷甾醇的51 個靶點來源于巴戟天和續(xù)斷。β-谷甾醇是植物甾醇類成分之一,屬于四環(huán)三帖類化合物,有降膽固醇、止咳、祛痰及抑制腫瘤和修復(fù)組織作用。用于Ⅱ型高脂血癥、動脈粥樣硬化癥和慢性氣管炎,亦用于早期子宮頸癌及皮膚潰瘍等[29]。由于巴戟天-續(xù)斷-益母草組藥中已知的化合物成分多達(dá)256 種,它們中可能有多種成分通過多種機制作用于多個靶標(biāo)。
藥靶網(wǎng)絡(luò)和PCOS網(wǎng)絡(luò)有19個重疊基因,富集于21 條通路。其中有5 個靶點富集的通路有HIF-1 信號通路、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、1 型糖尿病、炎癥性腸病、TNF 信號通路,涉及基因12 個,根據(jù)其所涉通路依次排序為:IL-6(15 條)、IL1β(11 條)、IFNG(11 條)、INS(6 條)、CCL2(6 條)、IL-2(5 條)、VEGFA(5 條)、NOS3(4 條)、PPARG(3 條)、MMP2(3條)、AR(1 條)、HMOX1(1 條),結(jié)合蛋白互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系(表2 和圖3),得分前10 位的基因是IL-6、INS、VEGFA、NOS3、PPARG、MMP2、CCL2、IL1β、IL2和ESR2,因此IL-6、IL-1B、IFNG、INS、CCL2、IL2、VEGFA 等,可能是PCOS治療中涉及的關(guān)鍵基因。如TNF主要由巨噬細(xì)胞分泌,并可誘導(dǎo)某些腫瘤細(xì)胞系的細(xì)胞死亡。CHEN 等[15]發(fā)現(xiàn)PCOS 患者血清TNF-α和AMH高表達(dá),血清TNF-α和AMH水平與PCOS高度相關(guān),可以作為預(yù)測PCOS 風(fēng)險的診斷指標(biāo)。FASSHAUER 等[30]發(fā)現(xiàn)TNF-α和胰島素能上調(diào)脂肪細(xì)胞上IL-6表達(dá),胡靜等[31]研究發(fā)現(xiàn)IL-6主要與IR 有關(guān),TNF-α 和IL-6 協(xié)同作用能加重PCOS病情的發(fā)生發(fā)展。TNF 信號通路和胰島素抵抗與PCOS發(fā)生及發(fā)展密切相關(guān)已成為共知。最近的研究發(fā)現(xiàn),NOD 樣受體信號通路也對PCOS 產(chǎn)生影響。賀晶等[32]探討促性腺釋放激素激動劑輔助腹腔鏡下卵巢巧克力囊腫剝離術(shù)對TNF-α和IL-6 水平的影響研究表明,該術(shù)不僅能提高妊娠率,還能降低NOD1、NOD2 的表達(dá),下調(diào)血清NF-α和IL-6 水平,抑制患者體內(nèi)炎癥狀態(tài)。
總之,巴戟天-續(xù)斷-益母草組藥治療PCOS 是分子間協(xié)同作用的結(jié)果,通過干預(yù)分子網(wǎng)絡(luò)、生物過程和通路來恢復(fù)機體平衡,具有多成分、多靶點的特點,其對PCOS 的治療主要是通過補腎活血化瘀達(dá)到抗炎、抗腫瘤、調(diào)節(jié)血脂、促進微循環(huán)及改善胰島素抵抗的目的,與現(xiàn)代醫(yī)藥治療多囊卵巢綜合征的作用機制相符合。