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長鏈非編碼RNA BRE-AS1在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及其調(diào)控功能

2021-08-07 05:33王嫻張艷秋申嫻尹立紅浦躍樸梁戈玉
關(guān)鍵詞:細(xì)胞周期通路肺癌

王嫻,張艷秋,申嫻,尹立紅,浦躍樸,梁戈玉

1.東南大學(xué) a.公共衛(wèi)生學(xué)院 b.環(huán)境醫(yī)學(xué)工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 南京 210000

2.江蘇省泰州市疾病預(yù)防控制中心環(huán)境職業(yè)衛(wèi)生科,江蘇 泰州 225300

肺癌是中國新發(fā)病例和死亡人數(shù)最多的癌癥[1]。2020年,中國肺癌新發(fā)病例數(shù)為815 563,占新發(fā)癌癥數(shù)的17.9%;因肺癌死亡714 699人,占癌癥總死亡人數(shù)的23.8%[2]。除遺傳因素外,吸煙、汽車尾氣、霧霾等環(huán)境因素是肺癌的主要危險(xiǎn)因素[3]。肺癌最主要的病理學(xué)亞型為非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),占比超過80%[4]。大多數(shù)NSCLC 患者發(fā)現(xiàn)時(shí)已為癌癥末期,難以治愈[5]。此外,許多NSCLC患者會(huì)在手術(shù)后復(fù)發(fā)[6],這些癌癥末期和復(fù)發(fā)患者的生存率很低[5]。因此,世界衛(wèi)生組織呼吁進(jìn)一步探索NSCLC 的發(fā)病機(jī)制,在NSCLC 的診斷和治療中應(yīng)重視分子生物標(biāo)志物,以便早期篩查,監(jiān)測(cè)疾病進(jìn)展,提供治療靶標(biāo),改善患者預(yù)后。

長鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)是一類不編碼蛋白質(zhì)的調(diào)節(jié)性RNA,其異常表達(dá)與多種疾病有關(guān),包括惡性腫瘤[7]。研究發(fā)現(xiàn)lncRNAs參與了NSCLC 的發(fā)生發(fā)展,如BRCA1 相鄰基因2 通過調(diào)控Notch1 信號(hào)通路抑制NSCLC 上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化進(jìn)程[8],過渡前相關(guān)RNA 可促進(jìn)NSCLC 細(xì)胞增殖、遷移和侵襲[9],叉頭蛋白F1 毗連非編碼發(fā)育調(diào)控RNA 通過與miR-761 結(jié)合并調(diào)節(jié)尿金屬蛋白酶2 表達(dá)來抑制NSCLC 的發(fā)展[10]。目前人細(xì)胞中鑒定出的lncRNA 超過50 000 種,大多數(shù)lncRNA 的表達(dá)、作用和機(jī)制尚不明確,迫切需要進(jìn)一步研究。

本課題組前期應(yīng)用芯片篩選NSCLC 相關(guān)lncRNAs,發(fā)現(xiàn)腦和生殖器官表達(dá)蛋白反義RNA 1(brain and reproductive organ-expressed protein antisense RNA 1,BRE-AS1)在NSCLC 中表達(dá)下調(diào)[11]。BRE-AS1是長度為1 659 bp的非編碼RNA,位于2p23.2染色體[12]。腦和生殖器官表達(dá)蛋白(brain and reproductive organ-expressed protein,BRE)是存在各種組織中穩(wěn)定細(xì)胞蛋白,主要功能為DNA 損傷修復(fù)和抗細(xì)胞凋亡[13]。BRE-AS1可調(diào)控多種腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)功能。例如,BRE-AS1可通過與miR-145-5p 相互作用調(diào)節(jié)前列腺癌細(xì)胞的增殖和凋亡[14];過表達(dá)BRE-AS1可以通過抑制信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子3 的磷酸化抑制膀胱癌細(xì)胞增殖[15],但BRE-AS1在NSCLC中的功能尚未明確。因此,本研究從多角度檢測(cè)BRE-AS1在NSCLC中的表達(dá),并探索BRE-AS1的診斷能力、生物學(xué)功能以及調(diào)控機(jī)制,為進(jìn)一步了解NSCLC 發(fā)病機(jī)制提供新的理論依據(jù)。

1 對(duì)象與方法

1.1 研究對(duì)象

本次研究收集91 例原發(fā)性NSCLC 患者(無放療或化療史)的腫瘤組織及其配對(duì)癌旁組織樣本,患者來自江蘇省南京市胸科醫(yī)院。采集后立即置于RNA保存液中,4℃過夜后-20℃保存?zhèn)溆茫瑫r(shí)記錄所有患者臨床信息。人支氣管樣上皮細(xì)胞(16HBE)、人肺泡上皮細(xì)胞(HpAEpiC)、NSCLC 細(xì)胞(A549 和NCI-H1395)均來自環(huán)境醫(yī)學(xué)工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,均采用含10%胎牛血清、1%雙抗的DMEM 培養(yǎng)基于37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。本研究已通過東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院倫理委員會(huì)審批(編號(hào):2014ZDSYLL031.0),并獲得患者簽署的知情同意書。

1.2 試劑與儀器

RNA保存液(Tiandz,中國),TRIzol試劑(Invitrogen,加拿大),RIPA裂解液(漢恒,中國),特異引物(捷瑞,中國),胎牛血清(四季青,中國),SYBR Green試劑盒(Promega,美國),雙抗(國藥集團(tuán),中國),培養(yǎng)基(四季青,中國),A214 試劑盒(GenStar,中國),KGA512周期檢測(cè)試劑盒(凱基,中國),CCK8試劑(Beyotime,中國),異丙醇(國藥集團(tuán),中國),KGA107 凋亡檢測(cè)試劑盒(凱基,中國),BRE-AS1過表達(dá)慢病毒及相應(yīng)的陰性對(duì)照慢病毒(漢恒,中國),嘌呤霉素(白鯊易,中國);NanoDrop 2000 光譜儀、酶標(biāo)儀(Thermo Fisher Scientific,美國),StepOnePlus實(shí)時(shí)PCR(Applied Biosystems,加拿大)等。

1.3 方法

本研究首先檢測(cè)了BRE-AS1在NSCLC 組織樣本和不同肺癌細(xì)胞中的表達(dá),同時(shí)分析了BRE-AS1在癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫中的表達(dá),和組織及細(xì)胞的表達(dá)相互印證,并評(píng)估了BRE-AS1的診斷能力及與NSCLC 臨床特征之間的關(guān)系;其次通過慢病毒轉(zhuǎn)染在肺癌A549 細(xì)胞中過表達(dá)BRE-AS1,檢測(cè)BRE-AS1對(duì)細(xì)胞增殖、周期和凋亡的影響;最后通過功能富集分析BRE-AS1的下游通路,并通過Western blotting法檢測(cè)BRE-AS1對(duì)下游磷酸肌醇3-激酶(phosphatidylinositide 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)-哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信號(hào)通路關(guān)鍵蛋白的影響。

1.3.1 NSCLC 組織和細(xì)胞中BRE-AS1 表達(dá)的檢測(cè)及分析應(yīng)用實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)技術(shù)檢測(cè)組織或細(xì)胞中BRE-AS1的表達(dá)。首先用TRIzol 試劑從組織或細(xì)胞中提取總RNA,并用NanoDrop 2000光譜儀測(cè)量純度和濃度。再用A214 試劑盒將RNA 逆轉(zhuǎn)錄成cDNA。通過StepOnePlus 實(shí)時(shí)PCR 系統(tǒng)檢測(cè)目標(biāo)mRNA 表達(dá)。PCR 反應(yīng)組分包括1 μL cDNA、5 μL SYBR Qpcr Mix、0.1 μL 特異引物和3.8 μL 無酶水。反應(yīng)條件為預(yù)變性95℃ 1 min;變性95℃ 15 s,退火60℃30 s,延伸72℃ 30 s,共40個(gè)循環(huán)。特異引物序列見表1。BRE-AS1表達(dá)水平采用2-ΔΔCt法計(jì)算,用差異表達(dá)倍數(shù)(fold change,F(xiàn)C)表示BRE-AS1在各組織中的差異表達(dá)情況,F(xiàn)C=-1/2-ΔΔCt。采用受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線及其曲線下面積評(píng)價(jià)BRE-AS1的診斷能力。應(yīng)用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)分析不同臨床特征(性別、年齡、腫瘤淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移分期、病理類型)的NSCLC 患者的BRE-AS1表達(dá)水平有無差異。

表1 lncRNA BRE-AS1 和內(nèi)參基因GAPDH 的引物序列Table 1 Primer sequences of lncRNA BRE-AS1 and GAPDH

1.3.2 TCGA 數(shù)據(jù)庫中BRE-AS1 表達(dá)分析從TCGA 數(shù)據(jù)庫(更新于2020年10月)下載1 016 例NSCLC 患者腫瘤組織與110 例正常肺組織測(cè)序數(shù)據(jù)。應(yīng)用TCGA RNASeqV2 系統(tǒng)提取NSCLC 組織與正常肺組織中l(wèi)ncRNABRE-AS1表達(dá)數(shù)據(jù)。采用受者工作特征曲線及其曲線下面積評(píng)價(jià)BRE-AS1診斷能力。

1.3.3 構(gòu)建BRE-AS1 過表達(dá)A549 肺癌細(xì)胞模型通過慢病毒轉(zhuǎn)染,過表達(dá)A549 細(xì)胞中的BRE-AS1,并設(shè)置三個(gè)實(shí)驗(yàn)組:LV-BRE-AS1組、陰性組和空白組。將BRE-AS1過表達(dá)慢病毒和陰性對(duì)照慢病毒用感染增強(qiáng)液稀釋至1×108TU·mL-1,感染融合度50%左右的A549細(xì)胞,72 h 后用含2 μg·mL-1嘌呤霉素的培養(yǎng)基持續(xù)培養(yǎng)兩周后得到LV-BRE-AS1組和陰性組,正常培養(yǎng)細(xì)胞為空白組。最后利用RT-qPCR 技術(shù)檢測(cè)慢病毒轉(zhuǎn)染效率。

1.3.4 細(xì)胞增殖能力檢測(cè)使用CCK8 法檢測(cè)過表達(dá)BRE-AS1對(duì)A549 細(xì)胞增殖能力的影響。將LV-BRE-AS1組和陰性組細(xì)胞種于96 孔板(每孔3 000 個(gè)細(xì)胞)中正常培養(yǎng)12、24、36、48 h 后,每孔中加入10 μL CCK8試劑,在37℃下反應(yīng)2 h 后,在酶標(biāo)儀中于450 nm 波長處測(cè)量光密度值。

1.3.5 細(xì)胞周期與凋亡檢測(cè)使用KGA512 周期檢測(cè)試劑盒評(píng)估過表達(dá)BRE-AS1對(duì)A549 細(xì)胞周期的影響。各實(shí)驗(yàn)組收集1×106個(gè)細(xì)胞,逐步加入0.5 mL乙醇,混勻后4℃過夜。在洗凈的細(xì)胞沉淀中加入0.1 mL的RNaseA,置于37℃水浴鍋中30 min,加0.4 mL RNaseA PI 混勻后4℃避光反應(yīng)30 min,使用流式細(xì)胞儀檢測(cè)488 nm處與DNA結(jié)合的PI紅色熒光強(qiáng)度。

使用KGA107凋亡檢測(cè)試劑盒評(píng)估過表達(dá)BRE-AS1對(duì)A549 細(xì)胞凋亡的影響。A549 細(xì)胞轉(zhuǎn)染96 h 后,各實(shí)驗(yàn)組收集1×106個(gè)細(xì)胞,洗凈的細(xì)胞沉淀中加入0.1 mL結(jié)合緩沖液、0.005 mL Annexin V-APC 和0.01 mL 7-ADD 混勻后避光放置15 min,加0.38 mL 結(jié)合緩沖液后,1 h 內(nèi)用流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞凋亡情況。

1.3.6 富集分析和蛋白分析通過差異分析TCGA和課題組前期三對(duì)NSCLC 及癌旁組織芯片測(cè)序的數(shù)據(jù)[11]獲得NSCLC 相關(guān)差異mRNA,并取交集。然后,通過R 語言cluster profiler 包進(jìn)行功能富集分析,包括基因本體論(Gene Ontology,GO)富集和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG),分析尋找受lncRNABRE-AS1影響的信號(hào)通路。

應(yīng)用Western blotting法檢測(cè)PI3K-AKT-mTOR信號(hào)通路中關(guān)鍵蛋白表達(dá)水平的變化。收集細(xì)胞并用RIPA裂解液提取總蛋白后,電泳分離蛋白條帶后轉(zhuǎn)膜,封閉后置于4℃孵育一抗(兔抗人IgG-HRP)過夜。一抗孵育后洗滌,加入二抗(山羊抗兔IgG-HRP)室溫孵育1 h。蛋白表達(dá)由ECL 化學(xué)發(fā)光系統(tǒng)測(cè)量。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

應(yīng)用SPSS 22.0 軟件和Excel 2016 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。結(jié)果以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示。應(yīng)用t檢驗(yàn)、卡方檢驗(yàn)和單因素方差分析各組之間的差異,檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。

2 結(jié)果

2.1 BRE-AS1 在NSCLC中表達(dá)

RT-qPCR 結(jié)果顯示,與癌旁組織相比,BRE-AS1在NSCLC 組織中表達(dá)下調(diào)(FC=-13.15,P<0.05,圖1A)。TCGA 數(shù)據(jù)庫分析結(jié)果顯示,與正常組織相比,BRE-AS1在NSCLC 組織中表達(dá)也下調(diào)(FC=-4.85,P<0.05,圖1B)。此外,細(xì)胞檢測(cè)結(jié)果表明,與16HBE 和HpAEpiC 細(xì)胞相比,A549 細(xì)胞中BRE-AS1表達(dá)下調(diào)(FC=-4.87,P<0.05,圖1C),而NCI-H1395 中BRE-AS1表達(dá)無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P>0.05,圖1C)。

圖1 BRE-AS1 在NSCLC組織(A、B)及細(xì)胞(C)中的表達(dá)水平Figure 1 Expression levels of BRE-AS1 in NSCLC tissues (A and B)and cells (C)

2.2 BRE-AS1 對(duì)NSCLC的診斷能力

結(jié)果如圖2所示,肺癌患者組織BRE-AS1診斷的ROC 曲線下面積為0.916,95%CI為0.872~0.960,靈敏度為85.6%,特異度為85.7%(圖2A);TCGA 數(shù)據(jù)庫中BRE-AS1診斷的ROC 曲線下面積為0.853,95%CI為0.809~0.897,靈敏度為84.5%,特異度為66.1%(圖2B),提示BRE-AS1對(duì)NSCLC 具有較高的診斷能力。

圖2 BRE-AS1 診斷NSCLC的ROC曲線Figure 2 ROC curve of BRE-AS1 in predicating NSCLC

2.3 不同臨床特征的NSCLC患者的BRE-AS1 表達(dá)差異

不同性別和病理類型的NSCLC 患者的BRE-AS1表達(dá)水平存在差異(P<0.05),男性患者低于女性,肺鱗狀細(xì)胞癌患者低于肺腺癌患者(表2)。不同年齡和腫瘤淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移分期的NSCLC 病人的BRE-AS1表達(dá)水平無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P≥0.05)。

表2 不同臨床特征的NSCLC 患者的BRE-AS1 表達(dá)差異分析Table 2 Expressions of BRE-AS1 in NSCLC patients with different clinical characteristics

2.4 過表達(dá)BRE-AS1 抑制A549細(xì)胞增殖

以A549 細(xì)胞作為研究對(duì)象,并利用慢病毒構(gòu)建BRE-AS1過表達(dá)穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株(圖3A-C)。圖3D 結(jié)果表明,與陰性組相比,LV-BRE-AS1組的光密度值在24、36、48 h 降低(P<0.01),提示過表達(dá)BRE-AS1可抑制A549細(xì)胞的增殖。

圖3 BRE-AS1 過表達(dá)穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株的構(gòu)建(A、B、C)及BRE-AS1 對(duì)A549細(xì)胞增殖的影響(D)Figure 3 Building stable BRE-AS1 over-expressed cells (A,B,and C)and effect of BRE-AS1 over-expression on A549 cell viability (D)

2.5 過表達(dá)BRE-AS1 影響A549細(xì)胞周期與凋亡

細(xì)胞周期檢測(cè)結(jié)果顯示,與陰性組相比,LVBRE-AS1組中S 期比例降低,G2/M 期中比例升高(P<0.01),提示過表達(dá)BRE-AS1可阻滯A549 細(xì)胞周期于G2/M 期(圖4A)。細(xì)胞凋亡檢測(cè)結(jié)果表明,與陰性組相比,LV-BRE-AS1組的晚期凋亡和總凋亡比例增加(P<0.05),提示BRE-AS1過表達(dá)可誘導(dǎo)A549 細(xì)胞凋亡(圖4B)。

圖4 BRE-AS1 過表達(dá)對(duì)A549細(xì)胞周期(A)和細(xì)胞凋亡(B)的影響Figure 4 Effect of BRE-AS1 over-expression on cell cycle (A) and cell apoptosis (B) in A549 cells

2.6 過表達(dá)BRE-AS1 對(duì)PI3K-AKT-mTOR 信號(hào)通路的影響

功能富集分析發(fā)現(xiàn),NSCLC 相關(guān)差異mRNA 主要富集于133 種基因功能條目以及22 種信號(hào)通路(圖5A、5B,P<0.05),其中PI3K-AKT信號(hào)通路基因富集數(shù)量最多,因此,推測(cè)BRE-AS1可能通過PI3K-AKT 信號(hào)通路介導(dǎo)NSCLC 生物功能。Western blotting 分析結(jié)果表明,與陰性組相比,LV-BRE-AS1組中AKT3、p-AKT3、mTOR、p-mTOR 表達(dá)降低,PTEN 表達(dá)增高(圖5C、5D),且p-AKT3/AKT3 及p-mTOR/mTOR 也降低(圖5E、5F,P<0.05),提示過表達(dá)BRE-AS1可抑制PI3K-AKTmTOR 信號(hào)傳導(dǎo)途徑。

圖5 非小細(xì)胞肺癌中BRE-AS1 相關(guān)的GO(A)和KEGG(B)富集分析及蛋白印跡分析結(jié)果(C-F)Figure 5 BRE-AS1 related GO (A) and KEGG (B) enrichment analysis results in NSCLC and Western blotting results (C-F)

3 討論

近年來,NSCLC 新發(fā)和死亡病例逐年增多,疾病負(fù)擔(dān)嚴(yán)重。由于缺乏有效篩查手段,早期NSCLC 難以及時(shí)發(fā)現(xiàn),晚期及復(fù)發(fā)NSCLC 難以治愈[16],因此NSCLC 生存率很低[17],迫切需要進(jìn)一步探索NSCLC 的發(fā)病機(jī)制,為尋找更加有效、實(shí)用、經(jīng)濟(jì)的生物標(biāo)志物提供理論依據(jù)[18]。

隨著分子生物學(xué)技術(shù)的不斷成熟[19],越來越多的lncRNA被發(fā)現(xiàn)。lncRNA是轉(zhuǎn)錄長度超過200 nt 但缺乏蛋白質(zhì)編碼能力的RNA 分子,研究表明其具有調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展的能力[20]。例如被轉(zhuǎn)化生長因子β 激活的長鏈非編碼RNA 在肝癌、結(jié)直腸癌、胃癌和肺癌等多種腫瘤中異常表達(dá),并且可以通過結(jié)合miRNA 誘導(dǎo)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化來促進(jìn)腫瘤發(fā)生和進(jìn)展[21];lncRNA 肺癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄物1 在肺癌、肝癌、乳腺癌等腫瘤中高表達(dá),可通過多種機(jī)制調(diào)節(jié)腫瘤的增殖、侵襲和遷移[22]。這些研究提示lncRNA 也可能在NSCLC 發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用。

課題組前期對(duì)原發(fā)性NSCLC 組織lncRNA 芯片檢測(cè)中發(fā)現(xiàn),BRE-AS1在癌組織中表達(dá)下調(diào)[11]。為進(jìn)一步探討B(tài)RE-AS1在NSCLC中的作用,本研究首先檢測(cè)了NSCLC患者組織、TCGA數(shù)據(jù)庫、NSCLC細(xì)胞中BRE-AS1表達(dá),發(fā)現(xiàn)BRE-AS1在NSCLC 組織及細(xì)胞中表達(dá)下調(diào),進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),BRE-AS1對(duì)NSCLC具有較高的診斷價(jià)值,且男性患者BRE-AS1的表達(dá)水平明顯低于女性,肺鱗狀細(xì)胞癌患者明顯低于肺腺癌患者,提示BRE-AS1和男性肺鱗狀細(xì)胞癌患者的發(fā)病關(guān)系更加密切。既往研究發(fā)現(xiàn)了一些與NSCLC 相關(guān)的重要lncRNA,如被轉(zhuǎn)化因子β 激活的長鏈非編碼RNA、lncRNA 肺癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄物1 和煙酰胺核苷酸轉(zhuǎn)氫酶反義RNA1 等在NSCLC中表達(dá)上調(diào)[21-23],轉(zhuǎn)錄超保守區(qū)454 等在NSCLC 中表達(dá)下調(diào)[24]。關(guān)于BRE-AS1的報(bào)道較少,Zhang 等[12]通過GEO 數(shù)據(jù)庫分析同樣發(fā)現(xiàn)BRE-AS1在NSCLC 中表達(dá)下調(diào),與本研究結(jié)果相互印證。

通過細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步揭示BRE-AS1在NSCLC 中的功能,結(jié)果顯示過表達(dá)BRE-AS1可抑制NSCLC 細(xì)胞增殖,阻滯細(xì)胞周期,促進(jìn)細(xì)胞凋亡。既往研究顯示不同lncRNAs 對(duì)NSCLC 細(xì)胞功能的影響不同,如過表達(dá)過渡前相關(guān)RNA 可促進(jìn)A549 細(xì)胞增殖、遷移和侵襲[9],敲低lncRNA X 染色體失活特異性轉(zhuǎn)錄物可抑制細(xì)胞增殖并促進(jìn)細(xì)胞凋亡[25],而過表達(dá)轉(zhuǎn)錄超保守區(qū)454 則會(huì)抑制A549 細(xì)胞遷移和侵襲[24]。既往報(bào)道與本研究均顯示BRE-AS1對(duì)腫瘤(膀胱癌、前列腺癌、肺癌)細(xì)胞功能的影響主要體現(xiàn)在抑制細(xì)胞增殖和促進(jìn)細(xì)胞凋亡方面[12,14-15],提示BRE-AS1在NSCLC中具有抑癌作用。

lncRNA在腫瘤中存在多種調(diào)控機(jī)制,如轉(zhuǎn)錄、翻譯、細(xì)胞內(nèi)信號(hào)通路、蛋白質(zhì)修飾以及RNA-蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)復(fù)合物形成等,其中通過信號(hào)通路來調(diào)控腫瘤的發(fā)生發(fā)展是最普遍的方式之一[26]。Peng等[20]報(bào)道lncRNAs可通過影響Notch、PI3K-AKT-mTOR、核因子κB等多種信號(hào)通路來調(diào)控腫瘤發(fā)生發(fā)展。為探討B(tài)RE-AS1調(diào)控NSCLC 細(xì)胞功能的潛在分子機(jī)制,本研究首先通過富集分析發(fā)現(xiàn)PI3K-AKT 可能是BRE-AS1的重要下游通路。目前已知PI3K-AKT通路的激活可以促進(jìn)多種癌癥包括肺癌的發(fā)生[27],其中關(guān)鍵分子AKT活化后可進(jìn)一步磷酸化mTOR 來介導(dǎo)細(xì)胞增殖、周期和糖代謝[28],故常常將PI3K-AKT信號(hào)通路與mTOR 信號(hào)通路放一起研究。mTOR 主要調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、能量代謝及細(xì)胞骨架重建[29],另一關(guān)鍵蛋白PTEN 活化后主要抑制細(xì)胞生長并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[30]。本研究通過Western blotting實(shí)驗(yàn)對(duì)上述關(guān)鍵蛋白及其磷酸化水平進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)BRE-AS1可能通過抑制PI3K-AKTmTOR信號(hào)傳導(dǎo)通路來發(fā)揮抑癌作用。

目前關(guān)于BRE-AS1在NSCLC 中作用的報(bào)道較少。本研究利用RT-qPCR 技術(shù)以及TCGA 數(shù)據(jù)庫分析,從多方面檢測(cè)BRE-AS1的表達(dá)并相互驗(yàn)證,結(jié)果準(zhǔn)確可信。本研究仍然存在一定的局限性,僅采用過表達(dá)BRE-AS1進(jìn)行細(xì)胞實(shí)驗(yàn),缺乏體內(nèi)實(shí)驗(yàn)的驗(yàn)證。因此,未來將結(jié)合體內(nèi)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步闡明BRE-AS1在NSCLC 發(fā)生發(fā)展中的作用。

綜上所述,本研究首先檢測(cè)分析了BRE-AS1在NSCLC 組織樣本、TCGA 數(shù)據(jù)庫和不同肺癌細(xì)胞中的表達(dá),并評(píng)估了BRE-AS1的診斷能力,發(fā)現(xiàn)BRE-AS1在NSCLC 中低表達(dá)且具有較高的診斷能力;其次通過慢病毒轉(zhuǎn)染在A549 中過表達(dá)BRE-AS1,檢測(cè)BRE-AS1對(duì)細(xì)胞增殖、周期和凋亡的影響;最后通過功能富集和Western blotting 檢測(cè)分析BRE-AS1對(duì)下游PI3K-AKT-mTOR信號(hào)通路關(guān)鍵蛋白的影響,發(fā)現(xiàn)BRE-AS1可能通過抑制PI3K-AKT-mTOR 信號(hào)通路來抑制NSCLC細(xì)胞生長、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡并阻滯細(xì)胞周期,研究為進(jìn)一步了解NSCLC 發(fā)病機(jī)制及篩選新的候選生物標(biāo)志提供依據(jù)。

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