應(yīng)文偉,王建峰,丁振山,陳 星,何宇輝,王愛軍,周曉峰★
(1.北京大學(xué)中日友好臨床醫(yī)學(xué)院,北京 100029;2.中日友好醫(yī)院泌尿外科,北京 100029;3.北京大學(xué)第一醫(yī)院 泌尿外科,北京 100034)
在世界范圍內(nèi),膀胱癌(BCa)在癌癥中死亡率排名第九[1]。盡管手術(shù)等治療的方法已有很大改善,但膀胱癌的復(fù)發(fā)率仍然很高,預(yù)后很差[2]。導(dǎo)致膀胱癌發(fā)展的生物學(xué)機(jī)制尚不清楚,越來越多的證據(jù)表明,某些lncRNA 在膀胱癌的進(jìn)展中起著至關(guān)重要的作用。例如,MALAT1 通過特異性抑制miR-125b 并激活靶基因Bcl-2 和MMP-13 來促進(jìn)膀胱癌[3]。Wang 等研究發(fā)現(xiàn)BCAR4 在膀胱癌中高表達(dá),進(jìn)一步研究表明BCAR4 促進(jìn)膀胱癌的發(fā)展[4]。Xiong 等報(bào)道,NRON 表達(dá)的增加可促進(jìn)膀胱癌的增殖、轉(zhuǎn)移和EMT 過程[5]。
近年來,越來越多的研究人員探究了MIR100HG 與肺癌[6]、乳腺癌[7]、大腸癌[8]和其他腫瘤之間的關(guān)系。但MIR100HG 與膀胱癌發(fā)展之間的關(guān)系尚未確定。在本研究擬探討MIR100HG在膀胱癌中的表達(dá)模式,并在體外細(xì)胞及裸鼠體內(nèi)驗(yàn)證MIR100HG 對膀胱癌發(fā)生發(fā)展的影響。
樣本來自2016年2月~6月中日友好醫(yī)院確診的5 例膀胱癌患者。同時(shí)取10 例的20 個(gè)樣本用做驗(yàn)證。研究得到中日友好醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。所有患者均簽署了知情同意書,并且了解研究的所有細(xì)節(jié)。將所有收集的組織樣品在RNAlater中冷凍并儲(chǔ)存在-80℃。至少2 名病理學(xué)家參與了病理診斷。
TRIzol 試劑盒(購自Invitrogen)用于從組織樣品和膀胱癌細(xì)胞中提取總RNA。根據(jù)制造商的指南,PrimeScript RT 預(yù)混液(購自TaKaRa)用于反轉(zhuǎn)錄。然后,使用一步TB Green PrimeScript RT-PCR 試劑盒(購自TaKaRa)在ABI 7500 實(shí)時(shí)PCR 系統(tǒng)(Thermo 公司)上進(jìn)行了定量實(shí)時(shí)PCR(qRT-PCR)。引物序列設(shè)計(jì)如下:MIR100HG 正向,5'-TGCCAGCAGCCATGAGAA-3',反向,5'-TTGTGAGGTGGAGGAAGGAG-3';GAPDH 正向,5'-GTCTTCACCACCATGGAGAA-3',反向,5'-TAAGCAGTTGGTGGTGCAG-3'。GAPDH 被用作內(nèi)參。MIR100HG 和GAPDH 在不同的孔中擴(kuò)增并一式三份。
RIPA 裂解緩沖液用于從細(xì)胞中提取總蛋白。將提取的蛋白質(zhì)與上樣緩沖液混合,通過SDSPAGE 分離,轉(zhuǎn)移到PVDF 膜上,然后用5%脫脂牛奶溶液封閉1h。將膜與一抗:α- tubulin(購自Proteintech,11224 -1 -AP,1 ∶5000)、HNRNPA2B1抗體(購自Abcam,31645,1∶2000),4℃過夜,在室溫下用辣根與過氧化物酶偶聯(lián)的二抗孵育1h。使用ECL 化學(xué)發(fā)光系統(tǒng)檢測信號(hào)。
人膀胱癌細(xì)胞系EJ 和5637 購自中國科學(xué)院細(xì)胞系(中國上海)。在補(bǔ)充有10%胎牛血清和100U/ml 青霉素和鏈霉素的RPMI-1640(均購自Gibco)完全培養(yǎng)基中培養(yǎng)5637 和EJ 細(xì)胞。將細(xì)胞在37℃下在具有5%CO2的潮濕培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
通過細(xì)胞計(jì)數(shù)試劑盒8(CCK-8)測定法(購自Dojindo Molecular Technologies)分析細(xì)胞的增殖能力。將穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的膀胱癌細(xì)胞系接種到96 孔板中。進(jìn)一步孵育1d、3d 和5d 后,將10μl CCK-8溶液添加到相應(yīng)的孔中2h。最后,通過酶標(biāo)儀在450nm 波長下測量每個(gè)孔的光密度(OD)值。該測定在3 個(gè)獨(dú)立的實(shí)驗(yàn)中一式兩份進(jìn)行。
遷移實(shí)驗(yàn)在具有8μm 孔徑聚碳酸酯膜的24孔Transwell 小室中進(jìn)行(購自BD 公司),侵襲實(shí)驗(yàn)在Matrigel 涂層的Transwell 小室中進(jìn)行(購自BD 公司)。簡而言之,將轉(zhuǎn)染的膀胱癌細(xì)胞(5×104個(gè)/孔)用無血清培養(yǎng)基接種到上腔室中,并將含15%FBS 的培養(yǎng)基添加到下腔室中。溫育24h 后固定、染色、計(jì)數(shù)。
用膜聯(lián)蛋白V-異硫氰酸熒光素和碘化丙啶(購自Invitrogen 公司)處理5637 細(xì)胞。室溫下黑暗中染色15min 后,將0.3ml 結(jié)合緩沖液添加到每個(gè)制備管中。用FACSCalibur 流式細(xì)胞儀(BD公司)測量細(xì)胞凋亡率。
該研究得到中日友好醫(yī)院動(dòng)物保護(hù)與福利委員會(huì)的批準(zhǔn)。皮下注射腫瘤細(xì)胞到每組6 只小鼠的側(cè)面皮下,注射后4 周處死小鼠。游標(biāo)卡尺測量腫瘤的長度(L)和寬度(W),腫瘤體積(V)=(L×W 2)×0.5。
取3 次獨(dú)立重復(fù)實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。應(yīng)用SPSS17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,組間比較采用t 檢驗(yàn)。
首先,對5 例患者的臨床樣本進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)(其中男3例、女2 例,年齡68±12.24 歲),根據(jù)|log2Ratio|≥1 和q<0.05 篩選差異表達(dá)基因。分析結(jié)果顯示,篩選出1752 個(gè)差異表達(dá)基因,其中1243 個(gè)上調(diào)而509 個(gè)下調(diào)(圖1A,彩插二)。隨后,我們對10 例患者的20 個(gè)樣品進(jìn)行了qRT-PCR 驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)MIR100HG 的表達(dá)顯著下調(diào)(FC=0.4,P<0.01,圖1B、C,彩插二)。通過探索基于從TCGA 數(shù)據(jù)庫中提取的數(shù)據(jù)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(starBase,http://starbase.sysu.edu.cn/),分析膀胱癌中MIR100HG 的水平。與正常樣本相比,MIR100HG在膀胱癌組織中呈下降趨勢(FC=0.16,P<0.01;圖1D,彩插二),與我們先前的研究結(jié)果一致。我們進(jìn)一步對患者臨床特征進(jìn)行分析,MIR100HG 的表達(dá)與患者的性別、年齡、腫瘤大小、腫瘤浸潤深度或TNM 分期無關(guān)(均P>0.05)。
圖1 MIR100HG在膀胱癌中的表達(dá)情況
通過qRT-PCR 檢測MIR100HG 在人膀胱上皮細(xì)胞系(SV-HUC-1)和5 種人膀胱癌細(xì)胞系(5637、EJ、BIU-87、SW780 和UM-UC-3)中的表達(dá)情況。我們觀察到,與人膀胱上皮細(xì)胞系相比,MIR100HG 在人膀胱癌細(xì)胞系5637、EJ 和BIU-87 中的表達(dá)水平顯著降低,而在SW780 和UMUC-3 細(xì)胞中,MIR100HG 的表達(dá)顯著增加(P<0.01,圖2A)。為了研究MIR100HG在膀胱癌細(xì)胞中的功能,我們建立了穩(wěn)定表達(dá)MIR100HG 的5637 和EJ 細(xì)胞。結(jié)果表明,MIR100HG 的表達(dá)水平顯著高于對照5637 細(xì)胞或空載體5637 細(xì)胞(命名為pLOV 細(xì)胞,P<0.01;圖2B)。
圖2 MIR100HG在膀胱癌細(xì)胞中的表達(dá)情況
為探究MIR100HG 對體外膀胱癌細(xì)胞增殖和凋亡能力的影響,我們分別進(jìn)行了CCK-8 和流式細(xì)胞實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,過表達(dá)MIR100HG 顯著抑制了5637 和EJ 膀胱癌細(xì)胞的增殖(P<0.01,圖3A、B),但對膀胱癌細(xì)胞的凋亡沒有影響(P>0.05,圖3C-F)。
圖3 過表達(dá)MIR100HG 對膀胱癌細(xì)胞增殖和凋亡的影響
行Transwell 實(shí)驗(yàn)以檢測MIR100HG 對膀胱癌細(xì)胞的侵襲和遷移能力的影響。結(jié)果表明,過表達(dá)MIR100HG 顯著抑制了膀胱癌細(xì)胞的侵襲(P<0.01;圖4A,彩插二),但對膀胱癌細(xì)胞的遷移能力沒有影響(P>0.05;圖4B,彩插二)。
圖4 過表達(dá)MIR100HG抑制膀胱癌侵襲
用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫Starbase 分析可能與MIR100HG 相互作用的RNA 結(jié)合蛋白(RNA binding protein,RBP)。隨后,我們對MIR100HG的潛在目標(biāo)進(jìn)行了初步篩選,共發(fā)現(xiàn)51 個(gè)目標(biāo)(表1 示前5 個(gè))。利用在線數(shù)據(jù)庫GEPIA(gepia.cancer-pku.cn/)和UniProt(https://www.uniprot.org/)逐一比較這51 個(gè)目標(biāo),發(fā)現(xiàn)HNRNPA2B1 可能與膀胱癌的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)的結(jié)果表明,在過表達(dá)MIR100HG 的細(xì)胞中,HNRNPA2B1 的蛋白質(zhì)水平被下調(diào)(圖5A,彩插二)。這表明HNRNPA2B1 的表達(dá)可能與MIR100HG有一定相關(guān)性。
表1 RBP-MIR100HG 相互作用的前5 個(gè)目標(biāo)
圖5 MIR100HG與HNRNPA2B1相關(guān)性和裸鼠的體外腫瘤形成情況
我們使用皮下異種移植小鼠模型,評(píng)估MIR100HG 對裸鼠體內(nèi)腫瘤生長的影響。分別注射5637 細(xì)胞和過表達(dá)MIR100HG 的5637 細(xì)胞到BALB/c Nu 小鼠的腋側(cè)。注射后4 周,與對照組相比,MIR100HG 過表達(dá)組的腫瘤體積和重量顯著降低(圖5B、C,彩插二)。表明MIR100HG 在體內(nèi)抑制膀胱癌腫瘤的生長。
膀胱癌預(yù)后不良和復(fù)發(fā)的問題,仍然是臨床上的主要挑戰(zhàn)。膀胱癌的病因涉及多種致癌基因和抑癌基因的變化。我們的研究證明了MIR100HG在膀胱癌中的作用。
越來越多的證據(jù)表明,MIR100HG 在各種人類腫瘤類型中均具有基因拷貝數(shù)變異。Yu 等進(jìn)行了2 個(gè)非小細(xì)胞肺癌微陣列數(shù)據(jù)集的微陣列基因表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)與正常肺組織相比,MIR100HG在腫瘤組織中的表達(dá)水平降低了[6]。相反,Lu 等報(bào)道了在結(jié)腸直腸癌中MIR100HG 高表達(dá),并與西妥昔單抗耐藥有關(guān)[8]。Su 等人在骨肉瘤中,還發(fā)現(xiàn)MIR100HG 高水平表達(dá),它通過LATS1 和LATS2的表觀遺傳沉默和Hippo 通路失活促進(jìn)骨肉瘤的進(jìn)展[9]。在急性巨核細(xì)胞白血病原始細(xì)胞中,MIR100HG 也呈現(xiàn)高水平表達(dá)。另外,Emmrich 等人的研究首次發(fā)現(xiàn)MIR100HG 在骨髓性白血病的發(fā)展中充當(dāng)造血和致癌的調(diào)節(jié)劑[10]。所有這些結(jié)果充分證明了MIR100HG 與腫瘤細(xì)胞存活密切相關(guān)。
根據(jù)上述文獻(xiàn),我們想確定MIR100HG在膀胱癌中是否也有差異表達(dá)。我們對膀胱癌臨床樣品中MIR100HG 的表達(dá)進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序。結(jié)果表明,MIR100HG 在腫瘤組織中的表達(dá)水平明顯低于癌旁正常組織,并且在公共數(shù)據(jù)庫獲得了一致的結(jié)果。
我們構(gòu)建了體外穩(wěn)定過表達(dá)MIR100HG 的膀胱癌細(xì)胞,進(jìn)行了增殖、凋亡、遷移和侵襲等功能測定,發(fā)現(xiàn)MIR100HG 過表達(dá)顯著抑制了膀胱癌細(xì)胞的增殖和侵襲。在裸鼠體內(nèi)研究中,我們也發(fā)現(xiàn)MIR100HG 的高表達(dá)抑制腫瘤發(fā)生。
有文獻(xiàn)表明,GATA6 蛋白與MIR100HG 之間的雙重負(fù)調(diào)控環(huán)是西妥昔單抗耐藥的基礎(chǔ)[8]。為在公共數(shù)據(jù)庫確定與MIR100HG 相互作用的潛在RBP,我們發(fā)現(xiàn)HNRNPA2B1 的表達(dá)可能與MIR100HG 有關(guān)。