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環(huán)狀核糖核酸調(diào)節(jié)腎透明細(xì)胞癌生物學(xué)行為的研究進(jìn)展

2021-09-03 09:37:30張慧杰劉利婷崔宏偉于蕾岳根全
腫瘤防治研究 2021年8期
關(guān)鍵詞:核糖核酸上皮調(diào)節(jié)

張慧杰,劉利婷,崔宏偉,于蕾,岳根全

0 引言

腎細(xì)胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是最常見的腎臟腫瘤,起源于腎小管上皮細(xì)胞,占成人腎臟惡性腫瘤的85%~90%。據(jù)估計(jì),2020年美國將有73 750例新發(fā)腎細(xì)胞癌病例[1]。腎透明細(xì)胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)占RCC的70%~75%。非編碼核糖核酸(non coding RNA,ncRNAs)是一種調(diào)節(jié)性核糖核酸。環(huán)狀核糖核酸(cyclic ribonucleic acid,circRNAs)是ncRNAs的亞型,含共價(jià)單鏈閉環(huán)結(jié)構(gòu),缺乏5’端和3’端,進(jìn)而可抵抗核酸外切酶的降解[2]。越來越多的證據(jù)表明,circRNAs在人類疾病發(fā)病機(jī)制中起著至關(guān)重要的作用,特別是在惡性腫瘤中,如三陰性乳腺癌、肺腺癌、結(jié)腸癌、肝細(xì)胞癌、膀胱癌及ccRCC[3-4]。近期研究發(fā)現(xiàn),circRNAs在調(diào)節(jié)ccRCC細(xì)胞增殖、凋亡、遷移和侵襲中起關(guān)鍵作用[5]。因此,闡明circRNAs調(diào)節(jié)ccRCC生物學(xué)行為的有關(guān)機(jī)制及臨床相關(guān)性,為ccRCC的診斷、預(yù)后和選擇性治療提供線索或信息。

1 CircRNAs與腎透明細(xì)胞癌

RCC又稱腎腺癌,是起源于腎實(shí)質(zhì)泌尿小管系統(tǒng)的惡性腫瘤。據(jù)調(diào)查,RCC在我國泌尿生殖系統(tǒng)腫瘤中占第二位,僅次于膀胱癌,約占成人惡性腫瘤的2%~3%,并占成人腎臟惡性腫瘤的80%~90%[6]。Wei等[4]研究發(fā)現(xiàn),circRNAs不僅調(diào)節(jié)基本的生物過程,并在多種疾病中發(fā)揮重要作用,如ccRCC。Ma等[7]通過微陣列研究,發(fā)現(xiàn)542個(gè)circRNAs在ccRCC中異常表達(dá),其中324個(gè)circRNAs下調(diào),而218個(gè)circRNAs顯著上調(diào)。因此認(rèn)為,circRNAs是ccRCC中關(guān)鍵的分子調(diào)節(jié)劑,參與ccRCC發(fā)病的多種過程,包括增殖、凋亡、遷移、侵襲和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化。circRNAs通過CircRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡(luò)相互作用促進(jìn)ccRCC的發(fā)展。

2 CircRNAs

2.1 CircRNAs合成

CircRNAs是一種轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,由外顯子反向剪接及選擇性剪接形成,見圖1A。CircRNAs由基因的內(nèi)含子、外顯子、非翻譯區(qū)或基因間區(qū)編碼產(chǎn)生,包括外顯子環(huán)狀核糖核酸、外顯子-內(nèi)含子環(huán)狀核糖核酸(exon intron cyclic ribonucleic acid,EIciRNAs)和環(huán)狀內(nèi)含子核糖核酸(cyclic intron RNA,ciRNAs)。與線性RNA相比,circRNAs可抵消核酸外切酶活性而維持穩(wěn)定,并通過與ceRNA的競爭來調(diào)節(jié)基因表達(dá)與轉(zhuǎn)錄[3]。

2.2 CircRNAs功能

CircRNAs結(jié)構(gòu)與其特有的合成方式可調(diào)節(jié)各種重要的生物過程與功能,見圖1B~C。

圖1 CircRNAs生物合成與功能Figure 1 CircRNAs biosynthesis and function

2.2.1 CircRNAs調(diào)節(jié)細(xì)胞核內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄水平EIciRNAs可通過U1核小核糖核蛋白顆粒(small nuclear ribonucleoprotein particles,snRNP)相互作用構(gòu)成EIciRNA-U1snRNP復(fù)合體,并與RNA聚合酶Ⅱ結(jié)合,來增強(qiáng)其基因轉(zhuǎn)錄與剪接[8],如CircEIF3J或CircPAIP2。此外,ciRNA也可增強(qiáng)RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄,如ci-ankrd52調(diào)節(jié)細(xì)胞核內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄[9]。

2.2.2 CircRNAs調(diào)節(jié)細(xì)胞質(zhì)內(nèi)基因轉(zhuǎn)錄水平miRNA結(jié)合位點(diǎn)被稱為miRNA應(yīng)答元件。競爭性內(nèi)源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)機(jī)制即circRNAs充當(dāng)miRNA分子海綿結(jié)構(gòu),抑制miRNA對(duì)其靶基因的沉默作用,間接上調(diào)靶基因及下游信號(hào)分子表達(dá)[3]。CircPVT1作為一種ceRNA,直接結(jié)合miR-145-5p,調(diào)節(jié)TBX15的表達(dá),以評(píng)估ccRCC臨床病理關(guān)聯(lián)性及患者預(yù)后情況[10-11];CircTLK1通過控制miR-136-5p表達(dá),上調(diào)促進(jìn)色原體4,增加血管內(nèi)皮生長因子表達(dá),促進(jìn)ccRCC的增殖或發(fā)展[12]。RNA結(jié)合蛋白(RNA binding protein,RBP)通過調(diào)控RNA的可變剪接、轉(zhuǎn)運(yùn)、翻譯等轉(zhuǎn)錄后過程,參與細(xì)胞增殖、遷移、凋亡及氧化應(yīng)激等多種生物學(xué)行為。研究發(fā)現(xiàn),circRNAs可與RNA聚合酶Ⅱ及真核起始因子4A-Ⅲ等RBP穩(wěn)定結(jié)合,構(gòu)成RNA-蛋白復(fù)合體并與線性RNA相互作用[13]。CircPABPN1可與PABPN1基因的mRNA競爭RBPHuR蛋白,致下游PABPN1翻譯受阻[14]。最新研究表明[15],circRNAs可翻譯多肽或蛋白質(zhì),如N6-甲基腺嘌呤(N6-Methyladenosine,m6A)修飾,有效促進(jìn)circRNAs的翻譯進(jìn)程。此外,circRNAs充當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)誘餌結(jié)合多種RNA結(jié)合蛋白,或作為蛋白質(zhì)支架,促進(jìn)底物酶結(jié)合,調(diào)節(jié)反應(yīng)動(dòng)力學(xué)。

3 CircRNAs調(diào)節(jié)腎透明細(xì)胞癌生物學(xué)行為

CircRNAs充當(dāng)腫瘤啟動(dòng)子,通過miRNA調(diào)節(jié)下游信號(hào)分子,調(diào)節(jié)ccRCC細(xì)胞增殖、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化及凋亡等生物活性,見表1~2及圖2。

表1 CircRNAs調(diào)節(jié)腎透明細(xì)胞癌增殖、遷移及上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化Table 1 CircRNAs regulate proliferation,migration and epithelial mesenchymal transition of ccRCC

表2 CircRNAs調(diào)節(jié)腎透明細(xì)胞癌凋亡Table 2 CircRNAs regulate apoptosis of clear cell renal cell carcinoma

圖2 ccRCC相關(guān)circRNAs的作用和調(diào)節(jié)途徑Figure 2 Role and regulatory pathway of ccRCC-related circRNAs

3.1 CircRNAs調(diào)節(jié)ccRCC增殖與遷移

叉頭框(forkhead box,FOX)蛋白在調(diào)節(jié)代謝及免疫系統(tǒng)發(fā)展及器官發(fā)育形成過程中發(fā)揮重要作用。FOX基因在不同的癌癥中均差異表達(dá),依據(jù)基因家族類型及細(xì)胞類型不同,既為癌基因,也為抑癌基因。FOXP4編碼蛋白屬于FOX轉(zhuǎn)錄因子家族P亞家族,位于6號(hào)染色體上。最初研究證實(shí)[16-17],F(xiàn)OXP4異常表達(dá)與肺癌、肝癌、食管鱗狀細(xì)胞癌、鼻咽癌等腫瘤密切相關(guān)。Xiong等[18]研究發(fā)現(xiàn),Circ-ZNF609可提高FOXP4的水平,顯著促進(jìn)RCC細(xì)胞的增殖與侵襲,并揭示Circ-ZNF609/miR-138-5p/FOXP4軸在腎細(xì)胞癌中的關(guān)鍵作用。同時(shí),認(rèn)為Circ-ZNF609受m6A修飾的調(diào)節(jié)在細(xì)胞質(zhì)進(jìn)行翻譯,進(jìn)一步調(diào)控ccRCC細(xì)胞惡化。趨化因子配體13(C-X-C motif chemokine ligand 13,CXCL13)是一種穩(wěn)態(tài)趨化因子,與CXCR5協(xié)同促進(jìn)ccRCC細(xì)胞增殖和遷移[19]。Circ HIPK3作為circRNAs的一員,源于HIPK3基因的外顯子2。Han等[20]發(fā)現(xiàn),Circ HIPK3通過調(diào)控miR-508-3p/CXCL13信號(hào)軸變化,募集miR-508-3p,刺激CXCL13,進(jìn)而誘導(dǎo)ccRCC細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移。Liu等[21]通過對(duì)140例RCC標(biāo)本的免疫組織化學(xué)表達(dá),發(fā)現(xiàn)CircPTCH1在ccRCC細(xì)胞G3/G4期的表達(dá)高于G1/G2期。CircPTCH1主要定位于細(xì)胞質(zhì),其作為miR-485-5p分子海綿與競爭性結(jié)合,增強(qiáng)MMP14的表達(dá),降解細(xì)胞外基質(zhì)及幾種生物活性分子成分,異常激活Hh途徑,促進(jìn)ccRCC侵襲與轉(zhuǎn)移。

3.2 CircRNAs調(diào)節(jié)ccRCC上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化

組織金屬蛋白酶抑制因子3(tissue inhibitors of metalloproteinase 3,TIMP3)作為一種抗腫瘤基因,可被miR-181b抑制進(jìn)而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞生長和轉(zhuǎn)移。CircCSNK1G3位于染色體5q23,屬于CK1家族的成員。Li等[22]表明,CSNK1G3通過上調(diào)miR-181b抑制TIMP3表達(dá)并介導(dǎo)ccRCC上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化,促進(jìn)生長與轉(zhuǎn)移。N-鈣黏蛋白(cadherin 2,CDH2)是一種經(jīng)典的鈣黏蛋白和黏附分子,主要參與組織穩(wěn)態(tài)、器官發(fā)生、腎上皮極性與完整性,作為ccRCC侵襲性的主要因素[23]。一項(xiàng)研究[24]顯示,Circ 000926可提高體外細(xì)胞增殖、遷移與侵襲能力,顯著促進(jìn)體內(nèi)ccRCC的生長及間質(zhì)轉(zhuǎn)化,并揭示了與ccRCC轉(zhuǎn)移相關(guān)調(diào)控軸:Circ_000926/miR-411/CDH2。Circ PRRC2A位于6p21.33,其表達(dá)與晚期RCC臨床分期及較差的生存率呈正相關(guān)。轉(zhuǎn)化受體電位陽離子通道M3(transient receptor potential cation channel,subfamily M,member 3,TRPM3)是一種組織特異性癌基因。Li等[25]研究,Circ PRRC2A通過miR-514a-5p或miR-6776-5p的分子海綿作用上調(diào)TRPM3并防止其降解,促進(jìn)RCC患者的上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化及侵襲性。

3.3 CircRNAs調(diào)節(jié)ccRCC凋亡

3.3.1 CircRNAs作為miRNA的分子海綿 CircRNAs在ccRCC中具有腫瘤抑制作用。CircRNAs表達(dá)及其功能研究表明,cRAPGEF5是ccRCC中的一種新的腫瘤抑制因子,其表達(dá)與侵襲性臨床特征有關(guān)。經(jīng)RNA免疫沉淀和體外生化分析表明[26],cRAPGEF5作為miR-27a-3p分子海綿發(fā)揮作用,靶向抑制硫氧還蛋白互作蛋白(thioredoxin interacting protein,TXNIP)基因,介導(dǎo)氧化應(yīng)激,誘導(dǎo)ccRCC細(xì)胞凋亡。FOXK2屬于叉頭盒轉(zhuǎn)錄因子家族,以抑制表皮生長因子受體及ccRCC的惡性表型作為腫瘤抑制因子。研究發(fā)現(xiàn)[27],CircUBAP2在ccRCC中顯著下調(diào),通過靶向miR-148a-3p/FOXK2途徑影響細(xì)胞周期從G1期向S期的進(jìn)展,而抑制ccRCC的增殖及轉(zhuǎn)移,并與ccRCC患者的整體存活率差相關(guān)。

3.3.2 CircRNAs作為miRNA的“儲(chǔ)庫”CircRNAs也可作為miRNA的“儲(chǔ)庫”來調(diào)節(jié)ccRCC的進(jìn)展。雄激素受體(androgen receptor,AR)在調(diào)節(jié)癌癥的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移中起關(guān)鍵作用,如ccRCC。Wang等[28]研究發(fā)現(xiàn),Circ HIAT1充當(dāng)miRNA“庫”來增加miR-195-5p/29a-3p/29c-3p的活性,調(diào)節(jié)細(xì)胞骨架重組、細(xì)胞周期進(jìn)程、極性與轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而抑制ccRCC細(xì)胞的獨(dú)立遷移與侵襲。

3.3.3 CircRNAs調(diào)節(jié)相關(guān)的信號(hào)通路 CircRNAs通過癌癥相關(guān)的信號(hào)通路調(diào)節(jié)ccRCC發(fā)展,如hsacirc-0072309[29]通過miR-100分子海綿作用,阻斷ccRCC細(xì)胞系中的PI3K/AKT與mTOR的級(jí)聯(lián)活性,促進(jìn)ccRCC細(xì)胞凋亡。

4 CircRNAs作為腎透明細(xì)胞癌診斷、預(yù)后生物標(biāo)志物及潛在治療靶點(diǎn)

早期診斷與篩查便于臨床治療并降低ccRCC患者死亡率。經(jīng)臨床ccRCC有關(guān)研究表明,circRNAs異常表達(dá)與臨床疾病特異性相關(guān)。Hsa_circ 0001451[30]與ccRCC臨床病理特征和總生存率(overall survival,OS)相關(guān),其AUC-ROC曲線下的面積為0.704,且ccRCC與健康者的敏感度和特異性分別為0.755和0.608。因此表明,Hsa_circ 0001451可作為診斷ccRCC的理想候選物。Lin等[31]發(fā)現(xiàn)聯(lián)合Circ EGLN3與 Lin EGLN3檢測其AUC-ROC值達(dá)到0.99(95%的敏感度和99%的特異性),表明circRNAs的組合診斷價(jià)值高于單個(gè)circRNAs。

一些circRNAs也可用于預(yù)后評(píng)估。Huang等[32]在體外研究中發(fā)現(xiàn),Circ ABCB10在ccRCC組織中顯著升高,與腫瘤大小、病理分級(jí)、晚期腫瘤淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移分期和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移顯著相關(guān),利于臨床預(yù)后評(píng)估。Li等[25]多變量分析表明,CircPRRC2A表達(dá)是ccRCC患者OS的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。

根據(jù)CircRNA在ccRCC中的生物功能,進(jìn)一步探索ccRCC治療的潛在新途徑,提出相關(guān)治療策略,CircHIAT1和CircATP2B1可作為轉(zhuǎn)移抑制劑,靶向控制AR-CircHIAT1-miR-195-5p/29a-3p/29c-3p/CDC42及CircATP2B1介導(dǎo)的miR-2043p/FN1信號(hào)級(jí)聯(lián)[28,33]。吉西他濱是一種新型抗癌藥物,可選擇性靶向調(diào)節(jié)酪氨酸激酶,進(jìn)而改善ccRCC患者生活質(zhì)量。Yan等[34]認(rèn)為,hsa-circ_0035483通過miR-335/CCNB1信號(hào)通路以增強(qiáng)吉西他濱的耐藥性,并認(rèn)為其可能是吉西他濱耐藥性的潛在靶位。

5 總結(jié)

CircRNAs是一種新描述的非編碼核糖核酸,豐富臨床對(duì)ncRNAs表達(dá)及其作用的理解。CircRNAs參與某些腫瘤的發(fā)病機(jī)制,如結(jié)腸癌、肝細(xì)胞癌及ccRCC等。CircRNAs調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞程序性死亡、增殖、遷移與轉(zhuǎn)移,并認(rèn)為其可作為潛在的腫瘤標(biāo)志物便于臨床診斷或應(yīng)用。CircRNAs在ccRCC中研究較少,且其生物學(xué)功能與分子機(jī)制不明確。因此,未來需進(jìn)一步研究circRNAs在ccRCC中的環(huán)化、降解與細(xì)胞定位的確切機(jī)制,并明確其臨床相關(guān)敏感度與特異性,為ccRCC早期診斷、預(yù)后及治療提供依據(jù)。

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