張靜靜,祝超瑜,肖元元,蔣伏松,高清歌,方云云,魏 麗
1.上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院生物系,上海 201306;2.上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院內(nèi)分泌代謝科,上海 200233
2型糖尿?。╰ype 2 diabetes mellitus,T2DM)是由遺傳與環(huán)境因素共同作用引起的代謝性疾?。?],異?;虻倪z傳使后代具有糖尿病易感性。胰高血糖素樣肽1(glucagon-like peptide 1,GLP-1)是一種能有效調(diào)節(jié)血糖穩(wěn)態(tài)的腸促胰島素激素,可刺激胰島β 細(xì)胞再生、胰島素分泌,減少胰高血糖素釋放,延緩胃排空,減少肝糖原輸出,促進(jìn)脂肪組織脂解等[2-4],其類似物作為一種新型降糖藥物被廣泛應(yīng)用于臨床。GLP-1主要通過與其受體GLP-1R(glucagon-like peptide-1 receptor,GLP-1R)結(jié)合發(fā)揮生理功能。最近研究發(fā)現(xiàn)GLP-1R基因的遺傳變異會影響其結(jié)構(gòu)組成及生理功能[5],且GLP-1R基因多態(tài)性與糖尿病易感性相關(guān)[6]。美國健康人群中,GLP-1R單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位點rs3765467 GA基因型個體胰島素釋放量遠(yuǎn)大于GG基因型個體[7]。對韓國人群的研究[8]發(fā)現(xiàn),rs37675467(G/A)突變可降低T2DM 的風(fēng)險。目前,GLP-1R基因多態(tài)性與中國T2DM 相關(guān)研究尚不完善。迄今為止,尚無研究發(fā)現(xiàn)rs3765467 多態(tài)性與中國人群T2DM 發(fā)病相關(guān)。本研究采用多重PCR技術(shù),結(jié)合高通量重測序檢測GLP-1R外顯子區(qū)域SNPs 位點多態(tài)性在我國人群中的分布,并進(jìn)一步評估多態(tài)性位點與T2DM及臨床代謝指標(biāo)的相關(guān)性。
本研究共納入463 例研究對象。其中T2DM 組318例,均為2018—2019 年上海交通大學(xué)附屬第六人民醫(yī)院(臨港院區(qū))內(nèi)分泌代謝科收治的住院患者。納入標(biāo)準(zhǔn):①符合1999 年WHO 的糖尿病診斷標(biāo)準(zhǔn)[9]:空腹血糖≥7.0 mmol/L,或糖尿病癥狀+隨機血糖≥11.1 mmol/L,或口服葡萄糖耐量試驗(oral glucose tolerance test,OGTT)2 h 血糖≥11.1 mmol/L。②相互之間無血緣關(guān)系。③年齡>18周歲。④漢族。排除標(biāo)準(zhǔn):①有惡性腫瘤史、急性感染。②有嚴(yán)重的肝腎功能損傷。③患有腦梗死、心肌梗死、冠狀動脈粥樣硬化性心臟病。④有甲狀腺功能亢進(jìn)癥、甲狀腺功能減退癥等其他內(nèi)分泌相關(guān)疾病。正常對照組145 例,為本院體檢中心健康體檢者,空腹血糖<6.0 mmol/L,且餐后2 h 血糖<7.8 mmol/L,糖化血紅蛋白(glycosylated hemoglobin,HbA1c)<6.0%;相互之間無血緣關(guān)系,無糖尿病家族史,無糖尿病史。本研究獲上海市第六人民醫(yī)院(臨港院區(qū))倫理委員會批準(zhǔn)(審批編號:2016-004),所有研究對象均簽署知情同意書。
1.2.1 臨床資料收集 收集所有入組對象的年齡、性別、體質(zhì)量、身高、收縮壓(systolic blood pressure,SBP)、舒張壓(diastolic blood pressure,DBP)、家族史、病程等資料,并計算體質(zhì)量指數(shù)(body mass index,BMI),公式為: BMI (kg/m2) = 體質(zhì)量(kg)/身高的平方(m2)。
1.2.2 生化指標(biāo)檢測 胰島功能及血糖指標(biāo):葡萄糖氧化酶法測定空腹血糖(fasting blood glucose,F(xiàn)BG)及餐后2 h 血糖(2-hour postprandial blood glucose,2 h PG),化學(xué)發(fā)光法測定空腹胰島素(fasting insulin,F(xiàn)INS)、餐后2 h 胰島素(2 hours insulin,2 h INS),高效液相色譜法檢測HbA1c、糖化白蛋白(glycated albumin,GA)。血脂譜:葡萄糖氧化酶法測定血清總膽固醇(total cholesterol,TC),甘油磷酸氧化酶法測定三酰甘油(triacylglycerol,TAG),日立76002020 型生化自動分析儀(計算法) 測定低密度脂蛋白膽固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-Ch)、高密度脂蛋白膽固醇(high density lipoprotein cholesterol, HDL-Ch)。 根據(jù)FBG、FINS 檢測結(jié)果,計算胰島素抵抗指數(shù)(homa insulin- resistance,HOMA-IR)=(FBG×FINS)/22.5 和胰島β 細(xì)胞功能指數(shù)(homa islet beta cell function index,HOMA-β)=20×FINS/(FBG-3.5)。
1.2.3 DNA 提取及SNPs 位點檢測 收集所有研究對象肘靜脈血于5 mL EDTA 抗凝管中,-80 ℃冰箱保存;使用血液基因組DNA 提取試劑盒(上海萊楓生物科技有限公司)提取基因組DNA,SpectraMax i3x酶標(biāo)儀(上海達(dá)邁生物科技有限公司)檢測DNA 樣本質(zhì)量,保證其濃度≥50 ng/μL,吸光度A260/A280 值介于1.8~2.0,提取的DNA于-80 ℃冰箱保存。
據(jù)NCBI上人類GLP-1R基因DNA 參考序列,設(shè)計多重PCR 特異性引物;以提取的全基因組DNA 樣本為模板,進(jìn)行PCR擴增,不同的樣本以相應(yīng)的Barcode引物區(qū)分,而后對擴增子進(jìn)行二代高通量重測序[HiSeq X Ten測序儀(Illumina,美國)]。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法分析,最終獲得每個位點的變異信息。
1.2.4 變異位點檢測 高通量測序過程中會存在一定比例的測序質(zhì)量較低的數(shù)據(jù),需進(jìn)行質(zhì)控以降低SNPs 假陽性。使用測序數(shù)據(jù)評估軟件FastQC 0.10.8 將序列文件中的低質(zhì)量序列過濾掉,保留的數(shù)據(jù)測序質(zhì)量Q>30(Q=30指正確率是99.9%),此時測序錯誤率低于0.1%。序列比對之前,用Cutadapt 2.0 軟件除去加在特異性引物兩側(cè)的接頭序列;運用BWA 0.7.17 軟件將二代測序后的短小片段比對定位到參考基因組(GRCh37/hg19)上;隨后使用Genome Analysis Toolkit 3.x 軟件對測序片段中的SNPs 位點進(jìn)行統(tǒng)計和分析;最后以變異處測序深度大于30、變異在所有樣本出現(xiàn)不少于1 次的標(biāo)準(zhǔn)對突變信息進(jìn)行過濾,獲得變異位點。
采用SPSS 25.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析。應(yīng)用Pearsonχ2檢驗進(jìn)行哈迪-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg Equilibrium,HWE)分析,以確保研究對象的群體代表性。定量資料以表示,采用獨立樣本t檢驗進(jìn)行分析;偏態(tài)分布的定量資料用M(Q1,Q3)表示,采用非參數(shù)檢驗進(jìn)行分析;定性資料以頻數(shù)(百分率)表示,采用χ2檢驗進(jìn)行分析。分別采用基因型、等位基因、顯性和隱性模型進(jìn)行非條件Logistic 回歸分析,修正年齡、性別、BMI、SBP、TAG、HDL-Ch 等混雜因素,計算比值比(odds ratios,OR)和95%置信區(qū)間(95% confidence interval,95%CI)。為減少非參數(shù)檢驗帶來的損失,對偏態(tài)分布HOMA-IR、HOMA-β 數(shù)據(jù)取自然對數(shù),使其轉(zhuǎn)化為正態(tài)分布數(shù)據(jù),再進(jìn)行參數(shù)檢驗。
應(yīng)用GAS Power Calculator(http://csg.sph.umich.edu/abecasis/gas_power_calculator/)在線網(wǎng)站計算統(tǒng)計效能,設(shè)置計算條件:顯性模型,OR=1.8,次等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)=0.247,人群T2DM 患病率為10%,T2DM 組318 例,正常組145 例。本研究統(tǒng)計效能為0.78。
本研究共收集318 例T2DM 患者,其中男性158 例,女性160 例;年齡為22~75 歲,平均年齡為(54.53±10.79) 歲。對照組共145 例,其中男性58 例,女性87 例;年齡為31~66 歲,平均年齡為(53.12±6.56)歲。T2DM 組HDL-Ch、HOMA-β 低于對照組,而BMI、SBP、 FBG、 2 h PG、 FINS、 TC、 TAG、 LDL-Ch、HbA1c、GA、HOMA-IR 均高于對照組(均P<0.05),2組在性別、年齡、DBP、2 h INS水平上差異不具有統(tǒng)計學(xué)意義(表1)。
表1 研究人群的臨床特征Tab 1 Clinical characteristics of the study population
GLP-1R基因外顯子多態(tài)性檢測分析發(fā)現(xiàn)23 個SNPs位點。對位點的基因型和等位基因頻率進(jìn)行病例-對照關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果顯示rs3765467 位點基因型和等位基因頻率在2 組間的分布差異存在統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=9.180,P=0.010;χ2=8.056,P=0.005),說明rs3765467 與T2DM 發(fā)病顯著相關(guān);其余位點基因型及等位基因頻率在2組間的分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。
HWE 檢驗表明rs3765467 等位基因頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡(對照組P=0.893),可代表整體,可進(jìn)行遺傳學(xué)分析。
通過多種模型分析rs3765467 多態(tài)性與T2DM 易感性的關(guān)系,結(jié)果(表2)顯示:rs3765467 G>A 突變顯著降低T2DM 患病風(fēng)險(修正后OR=0.587,95%CI0.395~0.872,P=0.008);與攜帶野生GG基因型個體相比,攜帶GA 基因型(修正后OR=0.507,95%CI0.298~0.864,P=0.012)個體患病風(fēng)險降低;顯性模型中,攜帶rs3765467 GA/AA基因型與攜帶GG基因型的個體相比,T2DM患病風(fēng)險較低(修正后OR=0.502,95%CI0.305~0.829,P=0.007),差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。隱性模型中,2 組間rs3765467等位基因及基因型分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義。
表2 GLP-1R rs3765467位點多態(tài)性與T2DM易感性的關(guān)聯(lián)Tab 2 Association between GLP-1R rs3765467 polymorphism and T2DM susceptibility
據(jù)性別將受試者分為2 個亞組,分別比較亞組內(nèi)rs3765467 在T2DM 組和對照組中的基因型及等位基因頻率(表3)。男性人群中,A等位基因攜帶者患病風(fēng)險顯著低于G 等位基因攜帶者(修正后OR=0.460,95%CI0.249~0.852,P=0.013);與攜帶野生GG 基因型個體相比,攜帶GA 基因型(修正后OR=0.439,95%CI0.195~0.990,P=0.047)個體患病風(fēng)險降低;顯性模型中,與GG基因型攜帶者相比,GA+AA 基因型者患病風(fēng)險較低(修正后OR=0.403,95%CI0.186~0.871,P=0.021),差異具有統(tǒng)計學(xué)意義;隱性模型中,rs3765467 等位基因及基因型在2組間的分布無顯著性差異。而女性人群中,各種模型下不同基因型攜帶者患病風(fēng)險差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。
表3 性別亞組中GLP-1R rs3765467位點多態(tài)性與T2DM易感性的關(guān)聯(lián)Tab 3 Association between GLP-1R rs3765467 polymorphism and T2DM susceptibility in male and female
在所有受試者中對GG 和GA+AA 基因型攜帶者的臨床特征進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)GA+AA 基因型攜帶者GA 水平顯著低于GG 基因型攜帶者(P=0.048),而其他指標(biāo)在2 組間差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(表4)。
表4 整體人群不同基因型臨床特征比較Tab 4 Comparison of clinical features of different genotypes
在男性人群中,與GG 基因型攜帶者相比GA+AA 基因型攜帶者FBG水平顯著降低(P=0.016),HbA1c水平顯著降低(P=0.037)(表5)。女性人群中,不同基因型攜帶者的臨床特征無明顯差異。
表5 男性人群不同基因型臨床特征比較Tab 5 Comparison of clinical features of different genotypes in the males
GLP-1R基因定位于6號染色體(6p21.2),包含13個外顯子,全長為42 500 堿基對。GLP-1R 屬于G 蛋白偶聯(lián)受體,具有典型的7次跨膜α-螺旋核心結(jié)構(gòu)域和1個胞外結(jié)構(gòu)域,在激素信號接收及受體激活方面發(fā)揮重要作用[10],是T2DM 的重要治療靶點。近年來,新型降糖藥物GLP-1 受體激動劑以其體重調(diào)控和血糖依賴性降糖等優(yōu)勢廣受歡迎。多項研究發(fā)現(xiàn),GLP-1R基因的多態(tài)性與GLP-1受體激動劑敏感性、FBG[11]、胰島細(xì)胞功能[12-13]、T2DM 發(fā)病機制[14]、肥胖[15]、冠狀動脈疾?。╟oronary artery disease,CAD)[16]相關(guān)。研究者將糖尿病患者分為CAD 組和非CAD 組,檢測GLP-1R基因的11 個SNPs 位點,發(fā)現(xiàn)rs4714210 位點GG 基因型患者比其他基因型患者的CAD 風(fēng)險低(OR=0.442,95%CI=0.258~0.757,P=0.002)[16]。房彬彬等[17]發(fā)現(xiàn)中國人群中GLP-1Rrs1042044 位點AC/CC 基因型和T2DM 發(fā)病相關(guān),其攜帶者患病風(fēng)險增加0.634 倍(P=0.045)。本研究通過多重PCR靶向重測序,共檢測到GLP-1R基因外顯子區(qū)域的23個SNPs位點,通過關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)rs3765467位點與T2DM發(fā)病相關(guān)。已有研究[18]發(fā)現(xiàn)rs3765467 G 等位基因可顯著降低β 細(xì)胞的胰島素分泌和環(huán)磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)濃度,進(jìn)而促進(jìn)細(xì)胞凋亡。一項針對日本T2DM 人群的研究[13]發(fā)現(xiàn),男性中與rs3765467 GA+AA 基因型攜帶者相比,攜帶GG 基因型者胰島素分泌量更低。這些研究提示GLP-1R基因突變在糖尿病發(fā)生發(fā)展中扮演重要角色。
本研究發(fā)現(xiàn),T2DM 組rs3765467 位點GA+AA 基因型頻率顯著低于對照組;與G 等位基因攜帶者相比,rs3765467位點A等位基因攜帶者患T2DM風(fēng)險顯著降低;提示rs3765467(G/A)變異與T2DM 的發(fā)病相關(guān),A 等位基因可能是T2DM 的保護(hù)因素。韓國人群GLP-1R變異與T2DM 相關(guān)性研究[8]發(fā)現(xiàn)rs3765467(G/A)突變可降低T2DM 風(fēng)險(OR=0.84,P=3.55×10-8),這與我們的研究結(jié)果相似。但也有研究與我們的結(jié)果不同。李蕊等[19]分析中國山東137例T2DM患者及100例健康人rs3765467位點多態(tài)性的分布特征,發(fā)現(xiàn)T2DM 人群GG 基因型攜帶者TAG 水平高于GG+GA 基因型攜帶者(P=0.03),但并未發(fā)現(xiàn)rs3765467 與T2DM 相關(guān)。這可能是由于2 項研究之間存在樣本量的差異,也可能是因生活環(huán)境、遺傳背景的差異,導(dǎo)致rs3765467 位點對2 型糖尿病的影響存在地區(qū)異質(zhì)性。
為闡明rs3765467 位點多態(tài)性對T2DM 的影響,本研究對不同基因型下臨床特征進(jìn)行比較。整體人群中,與GG 基因型攜帶者相比,GA+AA 基因型攜帶者GA 水平顯著降低,HbA1c 水平有下降趨勢,這提示GLP-1Rrs3765467 多態(tài)性參與血糖水平的調(diào)控。二肽基肽酶-4(dipeptidyl peptidase-4,DPP-4)抑制劑是一種常用降糖藥,可有效防止GLP-1 的降解。一項關(guān)于韓國T2DM 患者對DPP-4 抑制劑的響應(yīng)的研究[20]發(fā)現(xiàn),與GG 基因型攜帶者相比,攜帶GA+AA 基因型的T2DM 患者對DPP-4 抑制劑的應(yīng)答反應(yīng)更高,HbA1c 降低幅度更大。這與我們的研究結(jié)果相似,表明rs3765467 位點多態(tài)性與血糖水平相關(guān),GA+AA 基因型更利于保持血糖穩(wěn)態(tài)。
按性別分組,男性人群中T2DM 組rs3765467 A 等位基因頻率顯著低于對照組,A等位基因攜帶者患病風(fēng)險顯著降低。臨床特征分析顯示,與GG 基因型攜帶者相比,GA+AA 基因型攜帶者HbA1c、FBG 水平顯著降低,這與整體人群的情況一致。而女性人群中,T2DM組與對照組間的等位基因、基因型頻率分布均不存在差異,不同基因型間臨床生化指標(biāo)也不具有顯著性差異。我們推測,rs3765467 A 等位基因可能是防止男性T2DM 發(fā)生的特異性保護(hù)因素,A等位基因有助于維持血糖穩(wěn)態(tài),但未來仍需要更大的樣本量來驗證不同性別人群中rs3765467 多態(tài)性與血糖的相關(guān)性。
GLP-1R基因rs3765467 變異與T2DM 相關(guān)的機制尚未闡明。已知GLP-1R 在與其配體互作過程中,其胞外域先與配體C 端結(jié)合,從而確保配體的N 端能夠結(jié)合到受體核心區(qū)域,進(jìn)而激活受體;GLP-1R 胞外域中的氨基酸殘基在其自身折疊及結(jié)構(gòu)穩(wěn)定中發(fā)揮關(guān)鍵作用[21]。蛋白序列分析顯示,rs3765467 位點G/A 突變導(dǎo)致GLP-1R 胞外結(jié)構(gòu)域的131 位精氨酸(CGG)被谷氨酰胺(CAG)替代。我們推測,rs3765467 位點G/A 突變導(dǎo)致氨基酸殘基替換可能會影響GLP-1R 與其配體的結(jié)合效率,影響后期細(xì)胞信號傳導(dǎo)。
綜上,本研究通過病例-對照研究,首次發(fā)現(xiàn)GLP-1Rrs3765467與上海漢族人群T2DM 發(fā)病風(fēng)險相關(guān);次要等位基因A 可能有助于維持血糖穩(wěn)態(tài),是T2DM 的保護(hù)因素,這種保護(hù)性尤其在男性中顯著。未來有待采用分子生物學(xué)的方法驗證位點的功能,從而為探討T2DM 發(fā)病機制及基因靶向治療提供一定的理論依據(jù)。
上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版)2021年9期