羅海霞,安 銀,戴 星,王順莎,郭自強
(貴州師范大學生命科學學院,植物生理與發(fā)育調(diào)控重點實驗室,貴州 貴陽 550025)
蛋白質(zhì)折疊是真核細胞的一個基本過程,但它也被認為是一個容易出錯的過程,細胞已經(jīng)進化出一個敏感的蛋白質(zhì)質(zhì)量控制系統(tǒng),以最大限度地減少未折疊或錯誤折疊蛋白質(zhì)的積累。當植物經(jīng)歷不利的環(huán)境脅迫條件或達到不同的發(fā)育階段時,對蛋白質(zhì)折疊的需求發(fā)生變化,并且必須迅速去除錯誤折疊或受損的蛋白質(zhì)以防止聚集和毒害?!暗鞍踪|(zhì)質(zhì)量控制”最初僅指保護內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中分泌蛋白和膜蛋白正確折疊和組裝的過程(Hurtley and Helenius,1989),如本文所述。產(chǎn)生正確折疊的蛋白質(zhì)和消除受損和錯誤折疊的蛋白質(zhì)之間的平衡被稱為蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)或蛋白質(zhì)平衡。蛋白沉積網(wǎng)絡確保蛋白質(zhì)的正確翻譯、構象和亞細胞定位,這些對于細胞分裂、增殖和在不斷變化的生長條件下的生長至關重要。植物細胞包含內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體、葉綠體、線粒體、液泡和過氧化物酶體;每一個細胞器都有一個獨特的蛋白質(zhì)補充物來支持不同的功能,如蛋白質(zhì)合成、代謝、光合作用和能量產(chǎn)生。盡管葉綠體和線粒體都有各自的基因組,分別編碼~85 和~50個額外的蛋白質(zhì),但大多數(shù)細胞器蛋白質(zhì)是在細胞核中編碼的。蛋白質(zhì)體內(nèi)平衡過程中不同細胞器和細胞核之間的協(xié)調(diào)對于維持植物細胞在發(fā)育和環(huán)境反應過程中的動態(tài)蛋白質(zhì)平衡至關重要。在多次不成功的蛋白質(zhì)折疊嘗試后,折疊循環(huán)終止,錯誤折疊的蛋白質(zhì)被選擇通過蛋白酶體介導的蛋白質(zhì)降解途徑降解。錯誤折疊的蛋白質(zhì)的積累以及新合成的和預先存在的蛋白質(zhì)的聚集可能對細胞產(chǎn)生毒性作用。當?shù)鞍踪|(zhì)折疊需求超過蛋白質(zhì)折疊能力時,未折疊或錯誤折疊的蛋白質(zhì)可能積累,并且未折疊的蛋白質(zhì)反應(UPR)被激活以增加伴侶蛋白和折疊催化劑、蛋白酶體介導的蛋白質(zhì)降解的成分和自噬的水平。鑒于每個蛋白質(zhì)質(zhì)量控制步驟的不同方面,用于修復錯誤折疊、未折疊或受損蛋白質(zhì)的蛋白質(zhì)機器應該優(yōu)先用于蛋白質(zhì)降解的蛋白質(zhì)機器,因為修復、再折疊是減少植物細胞器中錯誤折疊、未折疊蛋白質(zhì)數(shù)量的更節(jié)能的方法。本文旨在總結近年來我們對植物細胞器中蛋白質(zhì)質(zhì)量控制以及蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)過程中不同細胞器與細胞核之間通訊的研究進展。
傳統(tǒng)的分泌途徑始于胞質(zhì)溶膠合成的跨膜和分泌蛋白通過Sec61 轉(zhuǎn)位子復合物轉(zhuǎn)運到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),然后由囊泡轉(zhuǎn)運到高爾基體,分泌蛋白被轉(zhuǎn)運到質(zhì)膜或細胞外基質(zhì)。一些液泡蛋白也通過晚期內(nèi)體從高爾基體轉(zhuǎn)移到液泡中。在擬南芥中,大約三分之一的蛋白質(zhì)被預測與分泌途徑中的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或其他細胞器相關。一旦帶有中間信號肽的新生多肽通過易位機制進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔,利用分子伴侶/共分子伴侶、N-糖基化和二硫鍵形成,幾個蛋白質(zhì)折疊過程立即開始。結合蛋白(bip)是熱休克蛋白70 家族的成員,是新生蛋白進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔時與新生蛋白相互作用的主要伴侶。
bip防止蛋白質(zhì)聚集,并幫助非自然展開的蛋白質(zhì)獲得其正確折疊的狀態(tài)。作為一種ATP 酶,bip經(jīng)歷了蛋白質(zhì)結合和ATP水解的循環(huán);其他輔因子如DnaJ蛋白與結合ATP的bip相互作用,催化ATP 水解。bip1bip2bip3 三重擬南芥突變體中三個bip基因的失活導致花粉死亡,而低階突變體在受精過程中顯示花粉管生長減少。
OsERdj7 是水稻中含內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結構域的DnaJ 蛋白之一,在水稻中充當Hsp70的共伴侶。水稻胚乳中OsERdj7的下調(diào)損害內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白折疊,并導致內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔中醇溶蛋白的不正確沉積,形成網(wǎng)狀結構,而不是在野生型種子中觀察到的蛋白體。擬南芥溫敏雄性不育1(TMS1)編碼一種Hsp40 蛋白,它通過DnaJ 結構域與BiPs 相互作用以刺激ATPase 酶活性,TMS1 的突變會損害花粉管的生長。AtERdj3B 還與BiP 相互作用,是生殖發(fā)育所必需的,特別是在高溫下。這些結果表明了參與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)受體蛋白折疊和體內(nèi)平衡的分子伴侶/協(xié)同伴侶對植物發(fā)育至關重要。
葉綠體和線粒體都有內(nèi)共生起源,它們都有相似的基因表達機制、蛋白質(zhì)折疊過程、成熟因子和蛋白酶,所有這些都來自原核起源。帶有N 端靶向信號的葉綠體和線粒體蛋白是在胞質(zhì)核糖體上合成的,并在胞質(zhì)伴侶Hsp70 和Hsp90 的幫助下被運送到各自的細胞器表面。隨后,葉綠體前體蛋白被表面受體識別,并通過外葉綠體和內(nèi)葉綠體被膜中的轉(zhuǎn)運子復合體運輸?shù)交|(zhì)中。類似地,線粒體前蛋白通過線粒體外膜(TOM)和內(nèi)膜(TIM)中的轉(zhuǎn)位復合體轉(zhuǎn)運到線粒體基質(zhì)中(Ghifari et al.,2018)。由于轉(zhuǎn)位蛋白復合體的孔徑較小,在轉(zhuǎn)位過程中穿過葉綠體或線粒體雙層膜的多肽鏈必須展開。在它們到達葉綠體基質(zhì)或線粒體基質(zhì)后,前蛋白受到蛋白水解處理,在此過程中,它們的前序列被特定的處理肽酶切割掉。得到的N-末端截短的蛋白質(zhì)被進一步折疊或分類,以通過分子伴侶轉(zhuǎn)移到細胞器內(nèi)的靶標,如類囊體膜,生理受損的蛋白質(zhì)會被蛋白酶迅速去除,其中大部分是原核來源的。植物中至少有20 種細胞器蛋白酶。葉綠體和線粒體中蛋白質(zhì)循環(huán)的主要蛋白酶包括無處不在的AAA+家族的ATP 酶、CLP、FtsH、LON 蛋白酶和DEG 蛋白酶。這些蛋白酶不僅能降解進口蛋白質(zhì),還能降解質(zhì)體或線粒體編碼的底物。例如,類囊體膜相關的FtsH 蛋白酶FtsH2 主要作用于降解光損傷的光系統(tǒng)II(PSII)反應中心蛋白,如D1和D2。
在植物發(fā)育和環(huán)境適應過程中,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、葉綠體和線粒體中蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)的維持已經(jīng)取得了顯著進展,許多植物特異性特征被揭示。盡管如此,我們離全面理解植物中的蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)網(wǎng)絡還有很長的路要走。這一領域最重要和最具挑戰(zhàn)性的問題是:在植物細胞器中如何感知蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)過程中指示不平衡的信號。有證據(jù)表明,膜相關轉(zhuǎn)錄因子可以感知、轉(zhuǎn)導與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或線粒體中錯誤折疊的蛋白質(zhì)積累相關的信號,以調(diào)節(jié)參與這些細胞器中蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)的基因的表達,但其他蛋白質(zhì)是否也可以感知這些細胞器中錯誤折疊的蛋白質(zhì)積累目前尚不清楚。
許多植物細胞器是相互連接的。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)是由相互連接的小管和扁平池組成的中心網(wǎng)絡,與其他亞細胞隔室相連,如高爾基體、線粒體、葉綠體、過氧化物酶體、液泡、細胞核和質(zhì)膜。細胞器和細胞核之間建立了實質(zhì)性的交流,從而維持蛋白質(zhì)的穩(wěn)態(tài)。如上所述,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中錯誤折疊的蛋白質(zhì)積累導致細胞核中下游普遍定期審議相關基因的調(diào)節(jié),液泡中蛋白酶活性的增強,胞質(zhì)溶膠中的ERAD,以及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)吞噬作用的啟動,以去除內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中錯誤折疊的蛋白質(zhì)。線粒體產(chǎn)生的ROS 激活內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜相關的轉(zhuǎn)錄因子,然后調(diào)控下游參與清除線粒體ROS的基因。在植物蛋白質(zhì)動態(tài)平衡期間,逆行信號也會觸發(fā)從葉綠體或線粒體到細胞核的信號。質(zhì)網(wǎng)膜相關轉(zhuǎn)錄因子NAC013 和NAC017 能夠整合來自線粒體和葉綠體的活性氧信號,并將信號轉(zhuǎn)導至調(diào)節(jié)基因的線粒體。尚不清楚是否存在更常見的因子來控制這些細胞器中的蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)和細胞的后續(xù)命運。因此,今后進一步了解蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)過程中不同細胞器之間的協(xié)調(diào)是很重要的。
總之,越來越多的證據(jù)表明,多條途徑確保了蛋白質(zhì)的正確折疊,并及時消除了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、葉綠體和線粒體中錯誤折疊的蛋白質(zhì)。在植物發(fā)育和環(huán)境脅迫響應過程中,這些細胞器和細胞核之間的多邊通訊信號是維持細胞器蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)所必需的。了解細胞器蛋白質(zhì)動態(tài)平衡的潛在分子機制對于進一步提高植物的穩(wěn)健性和抗逆性至關重要。