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基于研究生科研能力培養(yǎng)的《動(dòng)物基因組學(xué)》課堂教學(xué)
——以表觀(guān)基因組學(xué)為例

2021-12-05 15:36:20陶晨雨吳興龍周榮艷
畜禽業(yè) 2021年8期
關(guān)鍵詞:基因組學(xué)表觀(guān)課程內(nèi)容

陶晨雨,陳 輝,吳興龍,嚴(yán) 慧,周榮艷

(河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,河北 保定 071000)

0 引言

隨著人類(lèi)基因組計(jì)劃的完成,分子生物學(xué)的研究對(duì)象已經(jīng)從傳統(tǒng)對(duì)“單個(gè)”基因研究轉(zhuǎn)向組學(xué)的研究,一門(mén)新興學(xué)科基因組學(xué)應(yīng)運(yùn)而生?;蚪M學(xué)是研究生物整個(gè)基因組的結(jié)構(gòu)、調(diào)控、功能、進(jìn)化等方面及與其他組學(xué)如轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、表型組、代謝組等之間的關(guān)系。與人類(lèi)的疾病預(yù)測(cè)診斷、藥物疫苗研發(fā)、生物進(jìn)化起源等等許多重要問(wèn)題息息相關(guān),對(duì)人類(lèi)社會(huì)的許多方面產(chǎn)生重大影響。

《動(dòng)物基因組學(xué)》是河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院博士研究生的一門(mén)選修課程,是對(duì)基因組學(xué)進(jìn)行科學(xué)研究所必須掌握的技術(shù)方法進(jìn)行較為系統(tǒng)全面介紹的一門(mén)科學(xué)。通過(guò)課程的學(xué)習(xí),可以使學(xué)生了解動(dòng)物基因組學(xué)的重要研究領(lǐng)域、熱點(diǎn)問(wèn)題發(fā)展趨勢(shì),以及國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀與進(jìn)展,掌握動(dòng)物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的使用、高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的分析方法、功能基因的篩選與功能研究方法、表觀(guān)基因組學(xué)研究與分析方法以及基因變異位點(diǎn)的檢測(cè)技術(shù)等,培養(yǎng)研究生科研素質(zhì)和創(chuàng)新能力。在課程設(shè)置上,該課程包含了結(jié)構(gòu)基因組、功能基因組、表觀(guān)基因組及應(yīng)用基因組幾大方面,共36學(xué)時(shí)。由于研究生課程要關(guān)注前沿新知識(shí)、技術(shù)、研究成果,因此要求授課教師不僅要關(guān)注最新的科學(xué)研究進(jìn)展,更要開(kāi)展好教學(xué)的組織和管理、課程結(jié)構(gòu)內(nèi)容的優(yōu)化整合等工作。現(xiàn)以動(dòng)物科技學(xué)院博士研究生課程《動(dòng)物基因組學(xué)》中表觀(guān)基因組部分為例,總結(jié)旨在培養(yǎng)科研能力的課堂教學(xué)方法并提出具體改進(jìn)措施。

1 構(gòu)建重點(diǎn)突出的教學(xué)內(nèi)容

由于課時(shí)數(shù)有限、課程內(nèi)容多,因此課堂要求節(jié)奏緊湊,內(nèi)容重點(diǎn)突出。而由于研究生課程沒(méi)有統(tǒng)一教材,課程內(nèi)容多為發(fā)散性質(zhì),主要以重大研究進(jìn)展為主要授課內(nèi)容,因此每年課程內(nèi)容都在隨時(shí)更新。這對(duì)于老師提出了更高的要求,要構(gòu)建經(jīng)典的基因組研究?jī)?nèi)容作為基礎(chǔ),同時(shí)將最新研究前沿進(jìn)展作為重點(diǎn)的授課內(nèi)容。如表觀(guān)遺傳學(xué)包含了許多方面,但上課過(guò)程中只重點(diǎn)關(guān)注學(xué)習(xí)了DNA甲基化、組蛋白共價(jià)修飾、染色質(zhì)重塑、X染色體失活幾部分的內(nèi)容,做到了重點(diǎn)突出。

以“組蛋白共價(jià)修飾”章節(jié)為例,計(jì)劃共占用1.5個(gè)學(xué)時(shí),因此,基礎(chǔ)的內(nèi)容無(wú)法在課堂上進(jìn)行具體的學(xué)習(xí),為保證學(xué)習(xí)的質(zhì)量,在課前給同學(xué)們推薦參考書(shū)籍,課前進(jìn)行相關(guān)內(nèi)容的復(fù)習(xí),并為同學(xué)們推薦了授課教師發(fā)表的相關(guān)進(jìn)展的文獻(xiàn)進(jìn)行閱讀。課堂上,以文獻(xiàn)為基礎(chǔ),以組蛋白H4K12乙?;揎棡槔M(jìn)行深入探討組蛋白翻譯后修飾對(duì)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、基因表達(dá)的影響,力求做到以點(diǎn)帶面,內(nèi)容深刻。

2 將前沿科研轉(zhuǎn)化為教學(xué)素材

由于本課程是博士生的必修課程,因此課程內(nèi)容與本科生、碩士生的課程都有著很大的不同,課程內(nèi)容要重點(diǎn)體現(xiàn)出前沿性。因此要求教師在備課時(shí),要將自己的科研課題與關(guān)注的科研前沿進(jìn)展融入到教學(xué)中。如在表觀(guān)遺傳學(xué)部分教學(xué)中,加入了授課教師自己的研究方向哺乳動(dòng)物卵母細(xì)胞及早期胚胎發(fā)育過(guò)程中的核小體測(cè)序研究、組蛋白乙?;揎椉安糠秩S基因組內(nèi)容,并且在教師自己的研究課題的基礎(chǔ)上,又進(jìn)行延伸,內(nèi)容覆蓋了ATAC-seq,Hi-C等前沿領(lǐng)域。

課堂前,老師會(huì)將下次課的內(nèi)容及相關(guān)進(jìn)展文獻(xiàn)發(fā)給同學(xué)們。相關(guān)進(jìn)展文獻(xiàn)做到老師理解深入,選擇恰當(dāng),發(fā)表水平相對(duì)較高。如在講解染色質(zhì)重塑內(nèi)容時(shí),與同學(xué)們分別分享了發(fā)表在《stem cell reports》《nature communication》《developmental cell》等高水平期刊的近3年相關(guān)研究進(jìn)展文章。由于文章水平較高,因此,建議提前1~2周將文獻(xiàn)發(fā)給同學(xué)們進(jìn)行學(xué)習(xí)。同學(xué)們既獲得了相關(guān)研究進(jìn)展的知識(shí),又對(duì)知識(shí)體系有一定深入的理解。

3 多種教學(xué)方法相結(jié)合

傳統(tǒng)課程采用的講授方法并不能讓學(xué)生更多地參與到課堂互動(dòng)中,對(duì)所學(xué)知識(shí)并不會(huì)有深刻的印象。本課程采用課前布置題目,課上進(jìn)行討論交流,課下及時(shí)總結(jié)回顧的方式進(jìn)行。課程前一周老師會(huì)提前發(fā)布下周所講內(nèi)容,同學(xué)們課下進(jìn)行資料、文章搜集,閱讀,總結(jié),并且制成PPT;課堂上,每位同學(xué)進(jìn)行匯報(bào),并提出自己的收獲及運(yùn)用方法;課下將PPT及時(shí)分享到群里,進(jìn)行匯總復(fù)習(xí)。

4 實(shí)現(xiàn)半雙語(yǔ)教學(xué)

英語(yǔ)無(wú)疑是對(duì)博士生非常重要的一門(mén)工具及必備素質(zhì),而一般博士生學(xué)習(xí)英語(yǔ)的途徑主要是通過(guò)查閱英文文獻(xiàn)。因此,掌握更多的專(zhuān)業(yè)詞匯與表達(dá)方式尤為重要。而這種練習(xí)及素質(zhì)的培養(yǎng)可以通過(guò)平時(shí)在課堂中的培養(yǎng)來(lái)實(shí)現(xiàn)。教師在授課時(shí)及同學(xué)們?cè)谟懻撓嚓P(guān)文獻(xiàn)時(shí),PPT的制作以及重點(diǎn)專(zhuān)業(yè)詞匯及概念用英語(yǔ)介紹,這樣既可以加深同學(xué)們對(duì)專(zhuān)業(yè)詞匯的培養(yǎng),又可以加強(qiáng)英語(yǔ)的學(xué)習(xí),起到了事半功倍的效果,成效顯著。

5 靈活多樣的考核方法

研究生的考核多采用平時(shí)成績(jī)加課程論文的形式進(jìn)行。但普遍存在學(xué)生不認(rèn)真對(duì)待,課程論文存在重復(fù)率高甚至直接抄襲的現(xiàn)象。本課程目前采用課堂成績(jī)加期末考試的形式進(jìn)行。課堂上針對(duì)某一問(wèn)題,同學(xué)們課下進(jìn)行資料、文章查詢(xún)、總結(jié),課堂上進(jìn)行交流討論;期末考題主要以解決實(shí)際研究問(wèn)題為主,以要做的某個(gè)實(shí)驗(yàn)方向?yàn)轭}目,讓同學(xué)們利用所學(xué)知識(shí)自行設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),解決問(wèn)題。

6 結(jié)語(yǔ)

《動(dòng)物基因組學(xué)》是動(dòng)物遺傳育種專(zhuān)業(yè)博士研究生的一門(mén)非常重要的專(zhuān)業(yè)選修課,其中涉及到的基因組學(xué)前沿內(nèi)容是作為一名合格博士生應(yīng)必備的知識(shí)與開(kāi)展實(shí)驗(yàn)工作的基礎(chǔ)。因此,如何進(jìn)行高效的課程學(xué)習(xí)是各位授課教師尤為關(guān)注的,在今后的教學(xué)過(guò)程中,應(yīng)當(dāng)進(jìn)一步完善現(xiàn)有的授課內(nèi)容與教學(xué)方法,更加注重學(xué)生的科研能力的培養(yǎng)。

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