肖池,何彩紅,王安鴿,譚中菊,趙新秀,廖俏云,李金優(yōu),歸崎峰
1 杭州醫(yī)學院基礎醫(yī)學與法醫(yī)學院,杭州310003;2 浙江大學醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院老年醫(yī)學科
舌苔是指覆蓋在舌背面上的一層苔狀物,主要由脫落的角化上皮、唾液、食物碎屑、細菌等組成。舌苔是中醫(yī)舌診的重要內容,也是中醫(yī)臨床辨證不可缺少的客觀依據(jù),能夠反映機體內部的正邪斗爭、氣血盛衰、寒熱虛實[1]?,F(xiàn)階段,舌苔形成的機制是中醫(yī)現(xiàn)代化基礎研究的一個重要方向。舌苔微生態(tài)作為一個相對完整且獨立的微生態(tài)系統(tǒng),因其在舌苔形成過程中具有重要作用而受到眾多學者關注[2-5]。研究證實,多種疾病可導致舌苔微生態(tài)發(fā)生顯著變化,而舌苔菌群變化能夠為中醫(yī)病證診斷提供依據(jù)[1,6]。但目前在健康人群中舌苔與舌苔微生態(tài)關系的研究較少。本研究以健康成年人為研究對象,運用高通量測序技術,觀察了不同舌苔類型舌苔微生態(tài)的結構特點,旨在從微生態(tài)學角度闡釋健康成年人不同舌苔類型的形成機制。
1.1 臨床資料 選擇2019年6月—2020年10月在浙江大學醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院、紹興市越城區(qū)斗門鎮(zhèn)衛(wèi)生院和浙江古纖道綠色纖維有限公司體檢健康的成年志愿者79例。納入標準:①身體狀態(tài)良好,無任何不適癥狀或體征;②年齡18~59歲;③取樣前1周保持正常飲食習慣;④人口學資料完整。排除標準:①合并高血壓、糖尿病、高脂血癥等基礎疾病者;②合并HBV、HCV、HIV等病毒感染者;③有胃腸道手術史者;④合并精神疾病者;⑤取樣前8周內行口腔正畸手術者,或使用益生菌、益生元、合生元及抗生素者;⑥取樣前4周內做過腸道準備者。參照《中醫(yī)診斷學》、《中醫(yī)舌診圖譜》中舌苔分類標準,由浙江大學醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院一位經驗豐富的中醫(yī)師診查舌苔。根據(jù)舌苔質地將研究對象分為膩苔組43例、薄苔組36例。其中,膩苔組男25例、女18例,平均年齡42歲,BMI(23.5±2.7)kg/m2,城鎮(zhèn)人口27例、農村人口16例,有吸煙史12例,有飲酒史6例,黃膩苔22例、白膩苔21例;薄苔組男14例、女22例,平均年齡36歲,BMI(22.7±3.4)kg/m2,城鎮(zhèn)人口28例、農村人口8例,有吸煙史7例,有飲酒史2例,薄白苔28例、薄黃苔8例。兩組性別、年齡、BMI、人口來源比較差異均無統(tǒng)計學意義,而有吸煙史和飲酒史比例比較差異均有統(tǒng)計學意義。本研究由浙江大學醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院設計與實施,符合《赫爾辛基宣言(2013年版)》,并經醫(yī)院臨床研究倫理委員會批準[批件號:(2019)科研快審第(1026)號],所有研究對象知情同意并簽署書面知情同意書。
1.2 舌苔樣本收集與處理 留樣當日,所有研究對象于清晨空腹、不刷牙狀態(tài)下,用兩根無菌棉簽在舌苔表面輕輕擦拭3次,將棉簽頭端折斷后置于2 mL凍存管中,1 h內轉存于-80 ℃冰箱保存。舌苔樣本成批后送至北京諾禾致源科技股份有限公司檢測和分析。
1.3 基因組DNA提取、PCR擴增純化和文庫構建 采用CTAB法提取樣本基因組DNA,經瓊脂糖凝膠電泳鑒定,提取的基因組DNA純度和濃度合格。取適量基因組DNA置于離心管中,用無菌水稀釋至1 ng/μL。以稀釋后的基因組DNA為模板,根據(jù)測序區(qū)域的選擇,使用帶barcode的特異引物,擴增區(qū)域為16sv34。引物序列:①341F:5′-CCTAYGGGRBGCASCAG-3′;②806R:5′-GGACTACNNGGGTATCTAAT-3′。按Phusion?High-Fidelity PCR Master Mix with GC Buffer和高效高保真酶說明進行PCR擴增。反應條件:98 ℃ 1 min,98 ℃ 10 s、50 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s共30個循環(huán),最后72 ℃ 5 min。PCR擴增產物經2%瓊脂糖凝膠電泳分離,目的條帶采用GeneJET凝膠回收試劑盒回收。采用TruSeq?DNA PCR-Free Sample Preparation Kit構建文庫,經過Qubit和qPCR定量合格后,NovaSeq 6000測序系統(tǒng)測序。
1.4 生物信息學分析 測序數(shù)據(jù)經Reads拼接得到原始Tags數(shù)據(jù),嚴格過濾處理獲得高質量Clean Tags數(shù)據(jù),然后與物種注釋數(shù)據(jù)庫進行比對,最終得到有效的Tags數(shù)據(jù)。利用Uparse算法對有效的Tags數(shù)據(jù)進行聚類,以97%的一致性將序列聚類成為操作分類單位(OTUs),然后對OTUs序列進行物種注釋,獲得分類學信息并分別在各個分類水平上統(tǒng)計各樣本的菌群組成,通過R軟件(Version 2.15.3)構建Veen圖。采用Qiime軟件(Version 1.9.1)計算Chao1、ACE、Shannon、Simpson、Goods coverage和Observed species指數(shù),然后用R軟件分析α多樣性指數(shù)的組間差異。采用Qiime軟件計算Weighted UniFrac距離,通過R軟件繪制主成分分析(PCA)圖和主坐標分析(PCoA)圖并評估組間的β多樣性。采用線性判別分析效應值(LEfSe)軟件分析LEfSe,設置線性判別分析(LDA)的篩選值為4。
2.1 兩組舌苔微生物α、β多樣性分析 經高通量測序分析,79例健康成年志愿者舌苔標本中共檢出2 099個OTUs。其中,膩苔組和薄苔組共享的OTUs共1 233個,膩苔組和薄苔組獨有的OTUs分別為458、408個,兩組OTUs比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
α多樣性分析發(fā)現(xiàn),膩苔組與薄苔組Chao1指數(shù)分別為345.13±82.15、349.02±88.44,ACE指數(shù)分別為348.96±82.46、352.35±91.45,Shannon指數(shù)分別為4.93±0.36、4.87±0.44,Simpson指數(shù)分別為0.93±0.02、0.92±0.04,Goods coverage指數(shù)分別為1.00±0.00、1.00±0.00,Observed species指數(shù)分別為287.33±60.02、286.58±69.80,兩組上述指數(shù)比較差異均無統(tǒng)計學意義(P均>0.05)。見圖1。
注:TF為薄苔組,GF為膩苔組;a為Chao1指數(shù),b為ACE指數(shù),c為Shannon指數(shù),d為Simpson指數(shù),e為Goods coverage指數(shù),f為Observed species指數(shù)。
β多樣性分析發(fā)現(xiàn),膩苔組與薄苔組菌群均傾向于聚集,提示兩組菌群結構相似度較高。見插頁Ⅰ圖1。
2.2 兩組差異物種分析 LEfSe分布柱狀圖展示了LDA>4的差異物種,其中膩苔組放線菌綱、乳桿菌目、微球菌目和鏈球菌科是差異物種,而薄苔組紫單胞菌科是差異物種。見插頁Ⅰ圖2。
進化分支圖同樣顯示了兩組間的差異物種,并且在由門至屬的分類級別上揭示了差異物種的所屬關系。見插頁Ⅰ圖3。
舌苔作為口腔微生物的主要定植部位,其口腔微生物的數(shù)量和種類遠高于口腔其他部位。因此,舌苔微生態(tài)成為口腔微生態(tài)研究的主要對象。此外,舌苔微生態(tài)還與中醫(yī)辨證施治密切相關[1]。根據(jù)張伯禮院士對6 708例健康人群舌苔類型的研究發(fā)現(xiàn),健康人群舌苔類型以黃膩苔、白膩苔、薄白苔、薄黃苔最為常見,占95%以上[7]。本研究健康成年志愿者舌苔類型均為上述四種類型,與張伯禮等[7]研究結果吻合。本研究根據(jù)舌苔質地將研究對象分為膩苔組和薄苔組,然后提取舌苔樣本基因組DNA,經PCR擴增純化和文庫構建后進行生物信息學分析,結果發(fā)現(xiàn)兩組共享的OTUs共1 233個,膩苔組和薄苔組獨有的OTUs分別為458、408個,兩組OTUs比較差異無統(tǒng)計學意義;α多樣性分析發(fā)現(xiàn),兩組Chao1、ACE、Shannon、Simpson、Goods coverage、Observed species指數(shù)比較差異均無統(tǒng)計學意義;β多樣性分析亦顯示,兩組菌群均傾向于聚集,提示兩組菌群結構相似度較高。結果表明健康人群的舌苔微生態(tài)相對穩(wěn)定,究其原因可能與舌具有一定的自潔作用有關[8]。但本研究通過LEfSe分析發(fā)現(xiàn),兩組存在差異物種,其中膩苔組放線菌綱、乳桿菌目、微球菌目和鏈球菌科是差異物種,而薄苔組紫單胞菌科是差異物種,與既往文獻[9]報道基本一致。結果表明,不同舌苔類型的菌群結構存在差異,而這些差異菌群可能在相應的舌苔類型形成過程中起重要作用。
放線菌屬是人類口腔內的優(yōu)勢菌群之一[10]。與非吸煙者比較,吸煙者口腔放線菌門富集,相對豐度較高[11]。本研究結果發(fā)現(xiàn),膩苔組放線菌綱富集明顯高于薄苔組,與國內馬廣強等[9]研究結果一致,其原因可能與膩苔組有吸煙史比例高于薄苔組有關。國內李華等[5]研究發(fā)現(xiàn),放線菌屬豐度和舌苔的苔量、苔厚、苔膩呈明顯正相關關系。由此推測,放線菌有可能是形成膩苔的主要微生物因素之一,并且從舌苔微生態(tài)角度上也能更好地解釋吸煙可使舌苔變厚這一現(xiàn)象[12]。放線菌可能和人類某些疾病有一定聯(lián)系。有研究報道,糖尿病患者口腔放線菌檢出率明顯升高,放線菌有可能增加受檢者罹患糖尿病的風險[13]。此外,放線菌還可通過口腔或牙齦傷口侵入組織內部,在人體免疫力下降時易誘發(fā)慢性膿腫[14]。因此,健康人群出現(xiàn)膩苔可在一定程度上預示體內潛在疾病的發(fā)生風險增加。
本研究結果發(fā)現(xiàn),膩苔組乳桿菌目和鏈球菌科豐度明顯高于薄苔組。乳桿菌雖然是一種有益菌,但它也有對機體不利的一面。乳桿菌能夠與口腔中的鏈球菌一起使糖類發(fā)酵產生乳酸或其他酸類物質,溶解牙釉質,導致齲齒、牙周炎等口腔疾病[15]。王菁等[16]對口臭患者與健康志愿者舌背微生態(tài)的菌群結構研究發(fā)現(xiàn),口臭患者舌苔微生態(tài)發(fā)生了顯著改變,其特有的細菌高達17種,其中鏈球菌檢出率最高。有研究報道,口臭、牙周炎等口腔疾病與舌苔厚度呈明顯正相關關系[17-18]。提示乳桿菌和鏈球菌可能通過口腔疾病導致膩苔形成。
本研究結果發(fā)現(xiàn),薄苔組紫單胞菌科豐度明顯高于膩苔組,與既往文獻[9]報道基本一致。紫單胞菌科屬于擬桿菌目,包括卟啉單胞菌屬、巴氏菌屬等,是人和動物口腔、胃腸道的正常菌群,在維持口腔微生態(tài)平衡中具有重要作用。其中,卟啉單胞菌是一種小型厭氧革蘭陰性非運動球菌,作為正常菌群的一部分存在于人類口腔內,對維持口腔健康具有重要作用[9]。正常人的舌苔由于口腔微生態(tài)穩(wěn)定,舌上皮細胞正常生長、分化且不存在明顯炎癥,這為薄白苔舌象形成奠定了基礎[19]。
綜上所述,健康成年人不同舌苔表象具有不同的舌苔微生態(tài)特征,其中放線菌綱、乳桿菌目、微球菌目和鏈球菌科是膩苔的差異物種,紫單胞菌科是薄苔的差異物種,這些菌群差異可能是不同舌苔類型形成的微生態(tài)基礎。但本研究還存在一定局限性,如僅比較了薄苔和膩苔的微生態(tài)差異,對更加細化的舌苔類型未進一步探討,中醫(yī)辨證和舌苔微生態(tài)的關系亦未闡明;只評估了舌苔的微生態(tài)特征,而對兩者相互作用的機制未進一步闡明;未進行吸煙、飲酒、運動、飲食等因素對舌苔及其微生態(tài)的共發(fā)生網絡進行分析。