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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學的“檳榔-草果-厚樸”配伍治療糖尿病腎病作用機制探討

2022-02-14 05:53白曉甜宋超群劉世林
中醫(yī)藥通報 2022年2期
關(guān)鍵詞:草果檳榔靶點

白曉甜 南 征 宋超群 劉世林

糖尿病腎?。―iabetic kidney disease,DKD)是臨床常見的糖尿病并發(fā)癥。2019 年流行病學調(diào)查顯示[1],全球20~70 歲成年人中糖尿病發(fā)病率高達9.3%,而DKD 患病人數(shù)隨糖尿病發(fā)病率升高也成比例增長。DKD 以持續(xù)性蛋白尿和腎功能進行性下降為主要表現(xiàn),并且多伴有高血壓和眼底病變,最后進展為終末期腎病。研究顯示,DKD為發(fā)達國家和地區(qū)終末期腎病的首要原因。對于此病,現(xiàn)代醫(yī)學多從降血糖、降血壓、降血脂、抗炎、抗氧化應激等方面治療[2]。中醫(yī)藥在此病的治療上發(fā)揮了其獨特優(yōu)勢[3]。尚鑫等[4]應用參芪地黃湯治療早期糖尿病腎病,患者SCR、BUN、UAER等指標均較治療前明顯改善。王澤等[5]研究發(fā)現(xiàn)六味地黃丸可降血糖、血壓、血脂,改善腎功能,對于肝腎陰虛型糖尿病腎病療效確切。吳修紅等[6]將當歸補血湯加味用于糖尿病腎病的治療,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其可明顯改善患者腎功能,增強患者免疫機能并且減輕機體炎癥反應。南征教授將“檳榔-草果-厚樸”三藥應用于糖尿病腎病的治療,經(jīng)過多年臨床實踐,收獲良效。

本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學的方法[7],從檳榔、草果、厚樸三味藥的成分及作用靶點出發(fā),分析其治療糖尿病腎病的作用機制,為導師南征教授運用此三味藥治療本病提供相關(guān)佐證,并為糖尿病腎病的治療提供相關(guān)理論參考。

1 資料與方法

1.1 藥物成分篩選及其靶點收集和規(guī)范應用TCMSP 平 臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharamacology Database and Analysis Platform)對檳榔、草果、厚樸三味中藥化學成分進行搜索,并根據(jù)ADME 參數(shù)進行篩選,保留口服生物利用度(OB)≥30%同時類藥性(DL)≥0.18的活性成分。同時通過查閱三味藥物治療糖尿病腎病有關(guān)資料補充相關(guān)活性成分。最后通過TCMSP 平臺收集活性成分作用靶點,并通過UniProt數(shù)據(jù)庫對相關(guān)靶點名稱進行規(guī)范。

1.2 構(gòu)建藥物-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)將藥物、成分、靶點相關(guān)信息導入Cytoscape 3.7.2 軟件,繪制藥物-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖,并根據(jù)degree 值提取相關(guān)性強的活性成分。

1.3 疾病靶點收集和規(guī)范應用GeneCards、DrugBank、OMIM、TTD 四個數(shù)據(jù)庫,以糖尿病腎病為主題詞進行檢索,收集、篩選并匯集糖尿病腎病中相關(guān)基因,同樣用UniProt數(shù)據(jù)庫規(guī)范相關(guān)靶點名稱。

1.4 確定藥物與疾病的交集靶點將收集好的藥物相關(guān)靶點和疾病相關(guān)靶點導入網(wǎng)站(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/),繪 制Venny圖,獲取“檳榔-草果-厚樸”藥對與糖尿病腎病的交集靶點。

1.5 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將所獲取的藥物與疾病的交集靶點導入STRING 11.0 平臺(https://www.string-db.org/),將物種設(shè)定為“Homo sapiens”,設(shè)定最小互相作用值(minimum required interaction score)>0.9,其余設(shè)置為默認值,獲取蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI網(wǎng)絡(luò)),并將網(wǎng)絡(luò)導入Cytoscape 3.7.2軟件進行網(wǎng)絡(luò)處理。

1.6 藥物與疾病靶點功能與通路富集分析將檳榔、草果、厚樸三味藥物治療糖尿病腎病的靶點導入DAVID 數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/),選擇物種為Homo sapiens 進行生物學功能及通路的富集分析,并應用相關(guān)平臺(http://www.bioinformatics.com.cn/)對數(shù)據(jù)進行可視化。

1.7 藥物活性成分-疾病-靶點-通絡(luò)網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建應用Cytoscape 3.7.2軟件構(gòu)建檳榔、草果、厚樸成分-糖尿病腎病-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)。

2 結(jié)果

2.1 藥物活性成分靶點獲取通過TCMSP 平臺,初步獲得檳榔化學成分52 種,篩選之后獲得8 種;初步獲得草果化學成分59 種,篩選后獲得8 種;初步獲得厚樸化學成分139 種,篩選后獲得2 種。因篩選具有相關(guān)局限性,故通過收集相關(guān)文獻補充檳榔成分1種,厚樸成分2 種。經(jīng)過篩選和補充,三藥的主要成分包括槲皮素(quercetin)、和厚樸酚(honokiol)、厚樸酚(Magnolol)、(+)-表兒茶素(ent-Epicatechin)、原花青素B1(Procyanidin B1)等,具體成分見表1。通過對成分的再次檢索,獲得檳榔、草果、厚樸活性成分對應的靶點分別為41 個、174 個和94 個,三藥靶點匯集并去重后共獲得靶點191個。

表1 檳榔-草果-厚樸三藥主要成分表

2.2 藥物成分靶點網(wǎng)絡(luò)圖制作根據(jù)藥物成分及靶點制作相關(guān)network 文件和type 文件,并將文件導入Cytoscape 3.7.2軟件,繪制藥物-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖,見圖1。通過軟件內(nèi)置Network Analyzer,根據(jù)degree 值提取位于前十的活性成分為槲皮素(quercetin)、和厚樸 酚(honokiol)、厚 樸 酚(Magnolol)、桉 葉 油 醇(Eucalyptol)、(+)-表兒茶素(ent-Epicatechin)、(-)-兒茶素[(-)-catechin]、原花青素B1(Procyanidin B1)、鄰苯二甲酸二己酯(WLN:6OVR BVO6)、(4E,6E)-1,7-二(4-羥基苯基)-4,6-庚二烯-3-酮[(4E,6E)-1,7-bis(4-hydroxyphenyl)hepta-4,6-dien-3-one]、新 橙 皮 苷(Neohesperidin)。主要成分degree值見表2。

圖1 藥物-成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖

表2 關(guān)鍵成分degree值表

2.3 疾病相關(guān)靶點獲取從GeneCards 數(shù)據(jù)庫中獲取糖尿病腎病靶點3459個,設(shè)定Score>中位數(shù)后獲取靶點1751 個,通過DrugBank、OMIM、TTD 三個數(shù)據(jù)庫對糖尿病腎病靶點進行補充,經(jīng)過匯總?cè)ブ貜椭岛蠊搏@得糖尿病腎病靶點1784個。

2.4 藥物與疾病的交集靶點獲取將藥物靶點和疾病靶點分別導入相關(guān)網(wǎng)站(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/),繪制藥物疾病靶點交集Venny 圖,見圖2,并獲取藥物與疾病的交集靶點,共115個。

圖2 檳榔-草果-厚樸與糖尿病腎病交集靶點Venny圖

2.5 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將所獲取的藥物與疾病的交集靶點導入STRING 11.0 平臺,經(jīng)過最小互相作用值>0.9 篩選后獲得靶點104 個,并構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI 網(wǎng)絡(luò)),并將網(wǎng)絡(luò)導入Cytoscape 軟件,利用軟件的NetworkAnalyzer功能對網(wǎng)絡(luò)進行分析,使PPI網(wǎng)絡(luò)圖中的節(jié)點根據(jù)degree值呈現(xiàn)大小與顏色深淺的變化(節(jié)點越大、顏色越深表示degree 值高),見圖3。再根據(jù)degree值排序獲得藥物作用于疾病的關(guān)鍵靶點為AKT1、MAPK1、TP53、IL6、VEGFA等。

圖3 “檳榔-草果-厚樸”糖尿病腎病靶點PPI網(wǎng)絡(luò)圖

2.6 生物學功能與通路富集分析將檳榔-草果-厚樸與糖尿病腎病交集靶點導入DAVID 數(shù)據(jù)庫進行生物學功能及通路的富集分析,并對結(jié)果進行可視化,如圖4~圖7。

圖4~圖7 藥物治療疾病靶點功能與通路的富集分析圖

2.7 藥物成分-疾病-靶點-通絡(luò)網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建制作成分、疾病、靶點、通路相關(guān)network 文件和type 文件,導入Cytoscape軟件構(gòu)建藥物成分-疾病-靶點-通絡(luò)網(wǎng)絡(luò)圖,同樣使用Network Analyzer 功能對網(wǎng)絡(luò)進行分析,使PPI 網(wǎng)絡(luò)圖中的節(jié)點根據(jù)degree 值呈現(xiàn)大小與顏色深淺的變化(節(jié)點越大、顏色越深表示degree值越高),見圖8??芍?,關(guān)鍵靶點為AKT1、MAPK1、TP53、IL6、VEGFA;關(guān)鍵 通 路為PI3K-Akt、HIF-1、MAPK、FoxO等信號通路。

圖8 成分-疾病-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖

3 討論

3.1 “檳榔-草果-厚樸”的作用檳榔為達原飲之君藥,草果、厚樸為達原飲之臣藥,三藥共同構(gòu)成了達原飲開達膜原、辟穢化濁的基礎(chǔ)。檳榔是棕櫚科植物檳榔的干燥成熟種子[8],功能殺蟲、行氣、利水、消積、截瘧。草果為姜科植物草果的干燥成熟果實,有燥濕溫中、截瘧除痰之功效。厚樸為木蘭科植物厚樸的干燥干皮、根皮、枝皮,可行氣燥濕消痰、下氣除滿平喘。三藥皆為辛溫之藥,相輔相成,功效顯著。檳榔雖歸經(jīng)于陽明[9],其疏利之性卻能透腸胃、搜膜原;草果雖歸于脾經(jīng),其烈性卻可透脾臟達膜原;厚樸行氣散結(jié)之力強,可在兩藥引導之下直擊伏于膜原之邪并導之以出。歷代醫(yī)家多應用達原飲治療瘧疾、疫戾之病。現(xiàn)代醫(yī)家在此基礎(chǔ)上,將達原飲應用于更廣泛的領(lǐng)域。楊進教授[10]將達原飲的治療思路運用到多種疾病的治療上,將檳榔、草果、厚樸三藥應用于濕濁郁閉三焦之口腔潰瘍、干燥綜合征等。吳耀南[11]運用達原飲治療慢性肝病,認為此病為邪氣伏于膜原,故從膜原論治。陳蓓華[12]以檳榔、草果、厚樸為主藥治療小兒病毒性腦炎,總有效率達90.5%。林霜霜[13]還將達原飲加減應用于小兒腸系膜淋巴結(jié)炎。在新型冠狀病毒肺炎的治療上,余漢先[14]認為,達原飲能祛胸中膜原之邪,若理化檢查符合肺外帶、肺下葉毛玻璃影等指征時可以達原飲為底方進行治療,對患者病情有顯著的改善作用。田和炳[15]將檳榔、草果、厚樸作為新型冠狀病毒肺炎瘥后防復的宣透方,以達膜原清透余邪,改善瘥后不適癥狀。

“膜原”一詞最早見于《黃帝內(nèi)經(jīng)》,其廣泛分布在人體,內(nèi)與臟腑相連,外與體表相通,并與三焦有關(guān)。明代吳又可在《溫疫論》提出疫戾邪氣從口鼻侵犯人體,病位不在臟腑和經(jīng)絡(luò),而為半表半里之膜原,并運用達原飲開達膜原、辟穢化濁以治療瘟疫之氣伏于膜原[16]。南征教授在繼承膜原理論的基礎(chǔ)上,結(jié)合多年臨床經(jīng)驗認為,膜原非獨疫病可侵入,頑固、穢濁之邪同樣可入膜原[17]。消渴腎病是由于消渴日久,臟腑功能失常,毒邪伏于膜原,損傷腎絡(luò)所致,關(guān)鍵病機為毒損腎絡(luò)。本病之毒邪深藏膜原,故藥難及,邪難出。所以在治療時運用“達膜原”的方法,用達原飲中三味主藥檳榔、草果、厚樸,其中檳榔辛散化濁,厚樸行氣散結(jié),草果芳香辟穢。三藥合用可直達膜原,使深伏之毒邪潰敗,祛毒邪外出,在本病的治療上發(fā)揮了重要作用。

3.2 “檳榔-草果-厚樸”的藥理學分析現(xiàn)代藥理研究顯示,檳榔的成分有生物堿、酚類、氨基酸、維生素等[18]。具體成分包括原花青素A1、原花青素B1等,這類物質(zhì)具有良好的抗氧化作用,可以應用于氧化應激損傷造成的多種慢性疾病。袁列江等[19]在研究檳榔提取物時發(fā)現(xiàn),不同提取方式提取的檳榔活性成分均能在抗氧化方面發(fā)揮相應作用。姚起鑫等[20]研究發(fā)現(xiàn)檳榔堿能夠調(diào)節(jié)糖代謝及脂代謝,其降糖原理是減少肝臟糖異生。草果中含有多種活性成分[21],如酚類、黃酮、揮發(fā)油、花青素以及微量元素等,揮發(fā)油為其主要成分,草果揮發(fā)油[22]的兩種成分可協(xié)同促進細胞凋亡和抗腫瘤。草果甲醇提取物具有抗氧化活性作用,還可降低甘油三酯和血糖。厚樸的化學成分[23]主要為酚性化合物及揮發(fā)油等。厚樸酚、和厚樸酚為主要酚類活性物質(zhì),可明顯改善機體糖脂代謝,同時抗炎、抗氧化,和厚樸酚還有治療腹瀉、抗抑郁、降血糖的作用。厚樸揮發(fā)油(主要為桉葉油醇)及黃酮等成分也有良好的抗炎、抗氧化作用。

以往對檳榔、草果、厚樸單獨的藥理研究很多,但對于三藥共同作用的研究相對缺乏,其對糖尿病腎病治療方面的藥理研究也相對匱乏。本研究通過對檳榔、草果、厚樸三藥的活性成分如槲皮素、和厚樸酚、厚樸酚、(+)-表兒茶素、原花青素B1等的分析,找到其治療糖尿病腎病的相關(guān)靶點共115個,主要有AKT1、MAPK1、TP53、IL6、VEGFA 等,經(jīng)過通路與生物進程分析找到三藥發(fā)揮作用的生物學通路主要是PI3KAkt、HIF-1、MAPK、FoxO等信號通路。相關(guān)具體分析如下。

3.2.1 藥物活性成分分析 槲皮素為黃酮類化合物,生物活性及藥用價值都很高,具有抗炎、抗氧化的作用,對糖尿病腎病有很好的療效。靳麗英等[24]通過研究發(fā)現(xiàn)槲皮素可通過增強podocin4(足突蛋白)及nephrin(腎病蛋白)的表達,減少糖尿病腎病足細胞損傷,從而降低蛋白尿。宋其蔓等[25]研究發(fā)現(xiàn)槲皮素可激活PI3K-Akt 信號通路,從而在糖尿病腎病患者的治療上起到抗氧化應激、抑制細胞凋亡以及增強細胞活力的作用。和厚樸酚為厚樸中含有的小分子多酚[26],吳芳等[27]研究發(fā)現(xiàn)和厚樸酚具有抗炎、抗菌、抗氧化的作用,對于糖尿病腎病的氧化應激損傷具有切實的治療作用。厚樸酚對GK大鼠糖尿病腎病模型有一定的保護作用[28],可降低血糖并降低血漿胰島素,降低尿蛋白,同時降低內(nèi)生肌酐清除率。(+)-表兒茶素[29]是一種兒茶素和多酚,具有抗氧化活性。原花青素B1[30]是8種原花青素中活性最強的,可清除有毒自由基,并且有抗炎、降血脂等功用,可抑制炎癥反應,減輕細胞損傷,可預防和治療長期炎癥導致的慢性疾病,如糖尿病及其并發(fā)癥如糖尿病腎病。

3.2.2 關(guān)鍵靶點分析 AKT1 是AKT 激酶的一種。AKT 可介導葡萄糖的攝取和調(diào)節(jié)[31]。AKT1 調(diào)節(jié)許多過程,包括細胞存活、增殖、代謝、生長等[32]。MAPK1是MAP 激酶信號轉(zhuǎn)導途徑的重要組成部分,可介導多種生物學功能,如細胞生長、黏附、存活和分化[33]。TP53誘導的TRGAR[34](凋亡調(diào)節(jié)因子)可維持細胞氧化還原穩(wěn)態(tài)、調(diào)節(jié)細胞內(nèi)葡萄糖代謝。IL6參與免疫、組織再生和新陳代謝,可在組織損傷期間進行宿主防御,并可通過GLP-1 介導提高胰島素敏感性,以適應胰島素需求的變化[35]。陳麗萍等[36]研究發(fā)現(xiàn),IL6與糖尿病腎病炎性因子相關(guān)。IL6 可協(xié)調(diào)胰島素需求,但過量會損傷胰島細胞,且會刺激腎小球膜細胞增生。VEGFA 可誘導血管通透性增加并抑制細胞凋亡[37]。VEGF 升高可促使血管內(nèi)皮功能損傷,并損傷腎臟基質(zhì)及其上皮細胞[38]。

3.2.3 主要通路及功能分析 在糖尿病腎病中,PI3K-Akt 信號通路是一條重要的免疫炎癥機制通路[39],可防止細胞凋亡、加快細胞增殖,在疾病進展過程中起重要作用。研究發(fā)現(xiàn),PI3K-Akt信號通路過度激活與本病的發(fā)生密切相關(guān)[40]。HIF-1信號通路可改善缺氧[41],但也可對本病起到促進作用。在糖尿病腎病早期,HIF-1 信號通路主要起保護作用,但在糖尿病腎病不斷進展的過程中,其誘導的細胞凋亡作用會引起腎臟受損。MAPK 信號通路能對細胞的代謝凋亡產(chǎn)生調(diào)控作用,可影響組織細胞糖代謝,從而影響本病進展[42]。FoxO 信號通路對葡萄糖產(chǎn)物的基因轉(zhuǎn)錄起到促進作用,但是FoxO 依賴的轉(zhuǎn)錄如果增強也會起反向作用,如引發(fā)高血糖。

綜上所述,本研究應用網(wǎng)絡(luò)藥理學方法,對“檳榔-草果-厚樸”藥對治療糖尿病腎病的相關(guān)藥理機制進行了初步探究,研究結(jié)果初步預測了三味藥成分對應的靶點作用于本病的相關(guān)機制,為進一步將膜原理論應用于DKD 的治療提供了先導信息和基礎(chǔ),也為網(wǎng)絡(luò)藥理學研究其它方藥的作用機制提供相應借鑒。

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