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基于網(wǎng)絡藥理學研究婦科千金片/膠囊治療盆腔炎性疾病后遺癥的作用機制

2022-02-15 01:07吳夢瑤張鵬凌勇根鄭元青白璐趙毅章澤恒
湖南中醫(yī)藥大學學報 2022年2期
關(guān)鍵詞:網(wǎng)絡藥理學靶點

吳夢瑤 張鵬 凌勇根 鄭元青 白璐 趙毅 章澤恒

〔摘要〕 目的 通過網(wǎng)絡藥理學結(jié)合文獻驗證的方法,探討婦科千金片/膠囊治療盆腔炎性疾病后遺癥(sequelae of pelvic inflammatory disease, SPID)的作用機制。方法 基于TCMSP、TCMID等數(shù)據(jù)庫及文獻收集婦科千金片/膠囊的化學成分,篩選后獲得活性成分及對應靶點;采用GeneGards數(shù)據(jù)庫獲得SPID相關(guān)靶點;采用STRING數(shù)據(jù)庫對兩者交集靶點進行蛋白互作分析;采用DAVID數(shù)據(jù)庫進行基因功能和通路富集分析;采用Cytoscape軟件構(gòu)建“活性成分-靶點-通路”網(wǎng)絡,結(jié)合文獻進行評價。結(jié)果 從婦科千金片/膠囊中篩選得到活性成分88個,對應靶點597個,與SPID交集靶點169個;黃芩素、小檗堿、木犀草素等77個化學成分可能為婦科千金片/膠囊的主要活性成分;雌激素受體1(estrogen receptor 1, ESR1)、前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(prostaglandin endoperoxide synthase 2, PTGS2)、一氧化氮合酶2(nitric oxide synthase 2, NOS2)等80個靶點可能為婦科千金片/膠囊治療SPID的關(guān)鍵靶點;磷脂酰肌醇-3-激酶/絲蘇氨酸蛋白激酶(phosphateidylinositol 3 kinase/serine-threonine kinase, PI3K-Akt)、缺氧誘導因子1(hypoxia inducible factor-1, HIF-1)、腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor, TNF)等9條信號通路可能為婦科千金片/膠囊發(fā)揮治療作用的主要途徑。結(jié)論 婦科千金片/膠囊可通過多成分、多靶點協(xié)同治療SPID,其作用機制可能與調(diào)控PI3K-Akt通路、改善血液循環(huán)及調(diào)節(jié)炎癥、免疫反應和凋亡有關(guān)。

〔關(guān)鍵詞〕 婦科千金片;婦科千金膠囊;盆腔炎性疾病后遺癥;靶點;網(wǎng)絡藥理學

〔中圖分類號〕R285.5? ? ? ?〔文獻標志碼〕A? ? ? ? 〔文章編號〕doi:10.3969/j.issn.1674-070X.2022.02.008

The mechanism of Fuke Qianjin Tablet/Capsule in treating sequelae of pelvic

inflammatory disease based on network pharmacology

WU Mengyao1, ZHANG Peng1, LING Yonggen1, ZHENG Yuanqing1, BAI Lu1, Zhao Yi1, ZHANG Zeheng2*

(1. Zhuzhou Qianjin Pharmaceutical Co., Ltd., Zhuzhou, Hunan 412000, China; 2. Hunan Provincial Center for

Drug Evaluation, Certification and Adverse Reaction Monitoring, Changsha, Hunan 410013, China)

〔Abstract〕 Objective To investigate the effect of Fuke Qianjin Tablet/Capsule on sequelae of pelvic inflammatory disease (SPID) by network pharmacology combined with literature validation. Methods The chemical constituents of Fuke Qianjin Tablet/Capsule were collected based on TCMSP, TCMID and other databases and literatures, and the active constituents and corresponding targets were obtained after screening. GeneGards database was used to obtain SPID related targets. STRING database was used to analyze the protein interactions of the intersection targets. DAVID database was used for gene function and pathway enrichment analysis. Cytoscape software was used to construct an “active component-target-pathway” network, which was evaluated in conjunction with the literature. Results 88 active components were screened from Fuke Qianjin Tablet/Capsule, with 597 corresponding targets and 169 intersection targets with SPID. Wogonin, berberine, luteolin and other 77 chemical components may be the main active components of Fuke Qianjin Tablet/Capsule; the 80 targets such as estrogen receptor 1, prostaglandin endoperoxide synthase 2 and nitric oxide synthase 2 may be the key targets for the treatment of SPID by Fuke Qianjin Tablet/Capsule. Nine signaling pathways, including phosphateidylinositol 3 kinase/serine-threoninekinase, hypoxia inducible factor-1 and tumor necrosis factor may be the main pathways for the therapeutic effect of Fuke Qianjin Tablet/Capsule. Conclusion Fuke Qianjin Tablet/Capsule can treat SPID through multi-component and multi-target synergistic therapy, and its mechanism may be related to regulating PI3K-Akt pathway, improving blood circulation, regulating inflammation, immune response and apoptosis.

〔Keywords〕 Fuke Qianjin Tablet; Fuke Qianjin Capsule; sequelae of pelvic inflammatory disease; target; network pharmacology

盆腔炎性疾?。╬elvic inflammatory disease, PID)是指女性上生殖道及周圍組織常見的一種感染性疾病,若未接受規(guī)范、及時有效的治療,可導致一系列后遺癥的發(fā)生,即盆腔炎性疾病后遺癥(sequelae of pelvic inflammatory disease, SPID),主要包括慢性盆腔痛、PID反復發(fā)作、不孕癥和異位妊娠等,曾稱為慢性盆腔炎(chronic pelvic inflammatory disease, CPID)[1]。血瘀濕熱被認為是SPID的主要病機[2],其核心為血瘀[3]。

婦科千金片/膠囊為株洲千金藥業(yè)股份有限公司的獨家品種,由千斤拔、金櫻根、雞血藤、單面針、功勞木、穿心蓮、當歸、黨參8味中藥組成,具有清熱除濕、益氣化瘀的功效,用于治療SPID[4-6]、CPID[7-9]等療效顯著?!吨谐伤幹委熍枨谎仔约膊『筮z癥臨床應用指南(2020年)》[10]推薦婦科千金片/膠囊治療SPID濕熱瘀結(jié)證,可緩解SPID慢性盆腔疼痛,改善陰道分泌物量多、色黃、有異味及神疲乏力等。

為了探討婦科千金片/膠囊治療SPID的作用機制,本研究擬通過網(wǎng)絡藥理學找到婦科千金片/膠囊作用的關(guān)鍵蛋白靶點及相關(guān)信號通路,構(gòu)建其網(wǎng)絡結(jié)構(gòu),篩選可能與靶點有關(guān)的藥效組分,探索婦科千金片/膠囊藥物組成治療SPID的作用機制,為后續(xù)實驗研究的開展提供方向,為其臨床應用提供理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐。

1 材料和方法

1.1? 活性成分獲取

本研究采用中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)和中醫(yī)藥研究綜合數(shù)據(jù)庫(Traditional Chinese Medicines Integrated Database, TCMID, https://www.megabionet.org/tcmid/)檢索婦科千金片/膠囊中8味中藥的化學成分,通過2020年版《中華人民共和國藥典》[11]和文獻對檢索結(jié)果進行補充。將化合物的口服生物利用度(oral bioavailability,OB)篩選閾值均設(shè)為≥30%,類藥性閾值設(shè)為≥0.18,選取同時滿足這兩個條件的化學成分作為候選活性成分。

1.2? 潛在靶點篩選

采用TCMSP、中醫(yī)藥百科全書數(shù)據(jù)庫(The Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine, ETCM,

http://www.tcmip.cn/ETCM/index.php/Home/)和中醫(yī)藥癥候關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫(Symptom Mapping, SymMAP, http://www.symmap.org)獲得活性成分對應的靶點,應用蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(Universal Protein, UniProt, https://www.uniprot.org/)將靶點名稱轉(zhuǎn)換成對應的基因簡稱,物種限定為“Human”。以“Sequelae of Pelvic Inflammatory Disease”為檢索詞,采用人類基因數(shù)據(jù)庫(GeneGards,https://www.genecards.org/)獲得SPID的疾病靶點。將婦科千金片/膠囊活性成分的靶點與SPID相關(guān)靶點取交集,即為婦科千金片/膠囊治療SPID的潛在作用靶點,采用VENNY 2.1.0繪制交集圖。

1.3? 蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)網(wǎng)絡構(gòu)建

將上述潛在作用靶點上傳到STRING數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org),搜索靶點間相互作用關(guān)系,限定物種為“Homo spaiens”,設(shè)置置信度為最高0.9,隱藏游離的點,獲得靶點相互作用關(guān)系,篩選出核心靶點。

1.4? 基因本體(gene oncology,GO)分析

采用DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫(https://david-d.ncifcrf.

gov/)對靶點進行GO分析,將靶點導入到基因列表中,對應的基因標示符選擇“OFFICIAL_GENE_SYMBOL”,將基因物種和背景設(shè)定為人,設(shè)定閾值P≤0.01進行篩選,對靶點進行生物過程(biological process, BP)、細胞組成(cellular component, CC)及分子功能(molecular function, MF)3個方面基因功能的詳細注釋,采用Hiplot平臺(https://hiplot.com.cn/)對靶點的GO分析結(jié)果進行可視化處理。

1.5? 京都基因和基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)分析

采用DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫對靶點進行KEGG代謝通路富集分析。將基因物種和背景限定為人,選擇Pathways下的KEGG_PATHWAY,并設(shè)定P≤0.01,獲得KEGG代謝通路富集結(jié)果。篩選出與SPID相關(guān)的信號通路,并采用Hiplot平臺對篩選后的通路可視化。

1.6? “活性成分-靶點-通路”網(wǎng)絡構(gòu)建

根據(jù)篩選后的信號通路,采用可視化軟件Cytoscape 3.9.0構(gòu)建中藥調(diào)控網(wǎng)絡(“活性成分-靶點-通路”),以探索婦科千金片/膠囊治療SPID的潛在作用機制。

2 結(jié)果

2.1? 婦科千金片/膠囊活性成分獲取

基于TCMSP、TCMID等中藥數(shù)據(jù)庫收集婦科千金片中8味中藥的化學成分,再結(jié)合文獻檢索進行補充,共收集化學成分1071個,其中:千斤拔142個[12-14],金櫻根42個[15-18],穿心蓮105個,功勞木73個,單面針24個[19-27],當歸261個,雞血藤156個,黨參268個。

經(jīng)過篩選后共獲得88個潛在活性成分,其中:千斤拔3個,金櫻根5個,單面針5個,功勞木6個,雞血藤27個,穿心蓮26個,當歸7個,黨參20個。基本信息見表1。

2.2? 潛在作用靶點篩選

采用TCMSP、SymMAP、ETCM和UniProt進行婦科千金片/膠囊活性化合物潛在靶點的篩選,共獲得597個靶蛋白基因;采用GeneGards數(shù)據(jù)庫查詢SPID相關(guān)疾病靶點,共獲得738個靶蛋白基因;將兩者取交集,得到169個潛在作用靶點(見圖1)。

2.3? PPI網(wǎng)絡構(gòu)建

將上述得到的169個潛在作用靶點導入到STRING數(shù)據(jù)庫中,即可得到PPI網(wǎng)絡,結(jié)果見圖2。該網(wǎng)絡中共包含294個節(jié)點,792條邊,平均局部聚類系數(shù)為0.472,平均節(jié)點度為9.37,P值<1.0e-16。從圖中可以看出,該網(wǎng)絡線條相互交錯、多而復雜,即各個靶點間關(guān)聯(lián)性較強,表示婦科千金片/膠囊在治療SPID的過程中各靶點間相互聯(lián)系密切,可能通過作用于多個靶點協(xié)同發(fā)揮藥效。圖3為度值排名前10的靶點,提示這些靶點可能在婦科千金片/膠囊治療SPID中起到關(guān)鍵調(diào)控作用。

2.4? GO功能分析

采用DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫對婦科千金片/膠囊169個潛在作用靶點進行GO分析,根據(jù)P≤0.01共確定了522個GO條目,其中,BP相關(guān)條目405個,占比77.59%,這些靶點主要涉及了藥物反應、RNA聚合酶II啟動子的轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、凋亡過程的負調(diào)控、基因表達的正調(diào)控、對缺氧的反應、一氧化氮生物合成過程的正調(diào)控、ERK1和ERK2級聯(lián)正調(diào)控、DNA模板轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、細胞增殖的正調(diào)控、對乙醇的反應等。

CC相關(guān)條目44個,占比8.43%,這些靶點主要存在于細胞外空間、細胞外區(qū)域、胞質(zhì)、細胞質(zhì)、核漿、細胞核、細胞表面、膜筏、受體復合體、胞漿核周區(qū)、等離子體膜等。

MF相關(guān)條目73個,占比13.98%,這些靶點主要參與了相同蛋白結(jié)合、蛋白結(jié)合、蛋白質(zhì)同源二聚體活動、酶結(jié)合、蛋白質(zhì)異源二聚體活動、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄因子活性,配體激活的序列特異性DNA結(jié)合、類固醇激素受體活性、序列特異性DNA結(jié)合等。見圖4。

2.5? KEGG分析

采用DAVID 6.8數(shù)據(jù)庫對篩選出的169個潛在作用靶點進行KEGG信號通路富集分析,根據(jù)P≤0.01,共獲得114條富集通路,篩選出基因數(shù)≥20的9條可能與SPID相關(guān)的信號通路,包括磷脂酰肌醇-3-激酶/絲蘇氨酸蛋白激酶(phosphateidylinositol 3 kinase/serine-threoninekinase, PI3K-Akt)、缺氧誘導因子1(hypoxia inducible factor-1, HIF-1)、腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor, TNF)、黏著斑(focal adhesion, FA)、甲狀腺激素(thyroid hormone, TH)、絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)、趨化因子(chemokine)、toll樣受體(toll-like receptor, TLR)、雌激素(estrogen)等信號通路。采用Hiplot對以上信號通路進行可視化處理,見圖5。

2.6? “活性成分-靶點-通路”網(wǎng)絡構(gòu)建

采用Cytoscape 3.9.0構(gòu)建“活性成分-靶點-信號通路”網(wǎng)絡,見圖6。該網(wǎng)絡共包含166個節(jié)點(77個活性成分,80個靶點,9條信號通路)和766條邊。由網(wǎng)絡可知,婦科千金片/膠囊88個潛在活性成分中,有77個參與網(wǎng)絡構(gòu)建,M38黃芩素(wogonin)度值最大,與43個靶點相連;M8小檗堿(berberine)與36個靶點相連;M31木犀草素(luteolin)與31個靶點相連。80個靶點中,雌激素受體1(estrogen receptor 1,ESR1)度值最大,與71個化合物相連;其次是前列腺素內(nèi)過氧化物合酶2(prostaglandin endoperoxide synthase 2, PTGS2),與56個化合物相連;然后是一氧化氮合酶2(nitric oxide synthase 2, NOS2),與44個化合物相連。提示這些度值比較高的活性成分和靶點可能在婦科千金片/膠囊治療SPID中發(fā)揮著相對重要的作用。

3 討論

SPID多由急性盆腔炎轉(zhuǎn)變而來,具有病程長、復發(fā)率高的特點,且西藥治療療效不確切。婦科千金片/膠囊中千斤拔可祛風除濕、活血解毒,金櫻根可清熱利濕、活血化瘀,單面針可活血散瘀、理氣止痛,功勞木可清熱燥濕,雞血藤可行血補血、舒筋活絡,穿心蓮可清熱解毒、消炎止痛,當歸可補血調(diào)經(jīng)、活血止痛,黨參可生津止渴、補中益氣,諸藥合用可達到清熱除濕、益氣化瘀、抗炎增免的功效。

本研究通過網(wǎng)絡藥理學的方法分析了婦科千金片/膠囊治療SPID的主要活性成分,預測了其作用靶點,構(gòu)建了“活性成分-靶點-通路”網(wǎng)絡。從網(wǎng)絡中可以推測,婦科千金片/膠囊中黃芩素、小檗堿、木犀草素等77個主要活性成分可能通過調(diào)控ESR1、PTGS2、NOS2等80個靶點,介導PI3K-Akt、HIF-1、TNF等信號通路,從而發(fā)揮治療SPID的作用。

3.1? 活性成分

網(wǎng)絡分析結(jié)果顯示,黃芩素、小檗堿、木犀草素度值較高,與較多靶點相連。黃芩素已被證明具有廣泛的抗炎和抗腫瘤活性[28],其可通過激活人骨關(guān)節(jié)炎軟骨細胞中的ROS/ERK/Nrf2信號通路發(fā)揮強大的抗炎和軟骨保護作用,完全抑制IL-6、COX-2、PGE2、iNOS和NO等炎癥介質(zhì)的表達和產(chǎn)生[29];可調(diào)節(jié)PI3K-Akt、p53、NF-κB、MAPK等多種細胞信號通路[30]。小檗堿是一種異喹啉類生物堿,具有抗炎、抗過敏、抗血管生成和抗腫瘤等藥理特性。有研究表明小檗堿能顯著抑制脂多糖誘導的異位子宮內(nèi)膜基質(zhì)細胞增殖,抑制子宮內(nèi)膜基質(zhì)細胞中IL-6、IL-8、TGF-β、EGF、VEGF和MMP2的表達[31];還有臨床證據(jù)表明小檗堿能減少內(nèi)皮細胞炎癥[32]。現(xiàn)代藥理學研究表明,木犀草素是一種天然的類黃酮化合物,具有強大的抗炎活性[33],包括抑制促炎介質(zhì)(如IL-1β、IL-6、IL-8、IL-17、IL-22、TNF-α、COX-2),調(diào)節(jié)多種信號通路(如NF-κB、JAK-STAT、TLR信號通路)[34-35]。以上研究提示黃芩素、小檗堿和木犀草素可能是婦科千金片/膠囊的主要活性成分。

3.2? 關(guān)鍵靶點

網(wǎng)絡分析結(jié)果顯示,ESR1、PTGS2、NOS2等靶點與婦科千金片/膠囊中較多化合物相連。ERS1是一種雌激素受體,可能與ESR2形成二聚體,并影響靶組織中的細胞增殖和分化,對性發(fā)育和生殖功能至關(guān)重要,同時也負責骨骼的生長和維持心血管和神經(jīng)系統(tǒng)的正常,也參與包括乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌和骨質(zhì)疏松癥在內(nèi)的病理過程。PTGS2又叫環(huán)氧合酶2(cyclooxygenase-2, COX-2),是一種參與前列腺素生成的酶在各種細胞中可被促炎細胞因子、腫瘤促進劑、有絲分裂原和生長因子等高度誘導,從而參與炎癥反應、細胞增殖、細胞凋亡等多種病理過程[36];有研究表明,雌激素在子宮中可反向調(diào)節(jié)COX-2的表達[37];子宮內(nèi)膜異位患者慢性、非月經(jīng)相關(guān)的盆腔疼痛與COX-2的表達增加具有相關(guān)性[38],使用COX-2特異性抑制劑可有效治療子宮內(nèi)膜異位引起的盆腔疼痛[39]。NOS2是一種同工酶,在細胞受到刺激被激活后發(fā)揮作用,所生成的NO數(shù)量較多[40]。以上均提示PTGS2、NOS2、ESR1等靶點可能是婦科千金片/膠囊發(fā)揮藥效的關(guān)鍵作用靶點。

前期研究表明,婦科千金膠囊可抑制NF-κB激活和通路的活化,下調(diào)下游因子轉(zhuǎn)錄來抑制iNOS表達和NO產(chǎn)生,阻斷COX-2/PEG2與TNF-α、IL-6、IL-8等炎癥因子間的分子信號傳遞,改善炎性細胞浸潤及子宮組織水腫程度,阻止炎癥反應的級聯(lián)擴大及對生殖系統(tǒng)的損傷[41]。本課題組基于婦科千金膠囊對COX-2的抑制活性建立了抗炎生物效價測定方法,以確保其臨床療效穩(wěn)定可控[42]。

3.3? 信號通路

網(wǎng)絡分析結(jié)果顯示,PI3K-Akt、HIF-1、TNF、甲狀腺激素、MAPK、toll樣受體等可能為婦科千金片/膠囊治療SPID的主要信號通路。PI3K-Akt信號通路是一種細胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導途徑,響應細胞外信號,促進代謝、增殖、細胞存活、生長和血管生成,在炎癥反應的調(diào)節(jié)以及慢性疼痛中也發(fā)揮著重要作用[43];在細胞中,HIF-1主要調(diào)控對氧氣的感知和反應,還可誘導控制葡萄糖代謝、細胞增殖和血管形成的蛋白質(zhì)表達[44];甲狀腺激素是重要的生長發(fā)育和代謝調(diào)節(jié)劑[45],甲狀腺激素轉(zhuǎn)運體和受體在卵巢、早期胚胎、子宮內(nèi)膜、子宮和胎盤中表達[46],甲狀腺功能減退或亢進都與卵巢功能改變、月經(jīng)不規(guī)律等有關(guān)[47]。TNF可參與全身炎癥反應,是組成急性期反應的細胞因子之一,可觸發(fā)許多途徑的激活,包括NF-κB和MAPK途徑。前期研究表明,婦科千金片可通過降低TLR4-PI3K/Akt信號表達從而抑制盆腔炎大鼠的炎癥反應[48],婦科千金膠囊可通過調(diào)節(jié)TGF-β1-PI3K/Akt信號通路發(fā)揮抗子宮內(nèi)膜纖維化功效,達到治療宮腔粘連大鼠的作用[49]。

綜上,本研究從生物信息學的角度初步分析了婦科千金片/膠囊活性成分可通過多靶點、多途徑協(xié)同治療SPID,其作用機制可能與調(diào)控PI3K-Akt通路、改善血液循環(huán)及調(diào)節(jié)炎癥、免疫反應和凋亡有關(guān),本研究為后續(xù)更精準地研究其藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機制提供了理論基礎(chǔ)和研究方向。

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