郭家辰,徐然
(中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院 1.檢驗(yàn)科;2.胸外科,沈陽 110004)
肺癌是最常見的惡性腫瘤之一,在我國其發(fā)病率和致死率均居首位。其中,肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD) 的發(fā)病率呈明顯上升趨勢,在許多國家已超過鱗狀細(xì)胞癌成為最常見的肺癌組織學(xué)類型[1]。手術(shù)切除配合放射化學(xué)治療是目前治療LUAD的主要手段。中華醫(yī)學(xué)會肺癌臨床診療指南對LUAD的一線治療方案之一為培美曲塞和鉑類藥物(如順鉑) 的聯(lián)合治療?;瘜W(xué)治療(簡稱化療) 能明顯改善LUAD患者的預(yù)后,但化療耐藥嚴(yán)重限制了化療的臨床應(yīng)用。因此,研究并發(fā)現(xiàn)提高LUAD化療敏感性的方法非常重要。
近年來,許多非編碼RNA,特別是長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA) 被證明參與了包括LUAD在內(nèi)的幾乎所有類型腫瘤化療耐藥的發(fā)生和維持[2-3]。FAM83H-AS1基因位于8q24.3,由于缺乏蛋白質(zhì)編碼能力,屬于lncRNA。目前,已有多篇文獻(xiàn)[4-5]報道FAM83H-AS1在胃癌、前列腺癌等腫瘤中的存在表達(dá)和功能異常。WANG等[6]報道FAM83HAS1高表達(dá)與LUAD患者預(yù)后不良相關(guān),且能夠促進(jìn)LUAD的惡性進(jìn)展并抑制細(xì)胞凋亡。然而,F(xiàn)AM83HAS1在LUAD化療耐藥中的作用尚不清楚。
本研究發(fā)現(xiàn)FAM83H-AS1與LUAD化療(培美曲塞和順鉑) 耐藥相關(guān),能通過調(diào)控多藥耐藥相關(guān)基因ATP結(jié)合盒亞家族C成員1(ATP binding cassette subfamily C member 1,ABCC1) 促進(jìn)LUAD化療耐藥。
1.1.1 研究對象:104例LUAD及相應(yīng)的正常肺組織(normal lung tissue,NLT) 標(biāo)本均經(jīng)支氣管鏡活檢或經(jīng)皮肺活檢獲得,并由2名病理學(xué)家診斷為LUAD。本研究獲得本院倫理委員會批準(zhǔn),所有患者均簽署書面知情同意書。本研究包括男37例,女67例,年齡35~79歲,中位年齡為62.9歲。納入標(biāo)準(zhǔn):所有患者均確診為LUAD,在確診前未接受治療。排除標(biāo)準(zhǔn):患者病例信息不完整,或患有其他疾病。
確診后,57例LUAD患者選擇新輔助化療或姑息化療(培美曲塞和順鉑)。化療2~3個療程后復(fù)查胸部增強(qiáng)CT及血清腫瘤標(biāo)志物。根據(jù)病灶大小及血清腫瘤標(biāo)志物水平的變化,將患者分為敏感組(39例) 和不敏感組(18例)。
人肺動脈內(nèi)皮細(xì)胞(pulmonary artery endothelial cells,PAEC) 購自武漢云克隆公司,肺腺癌細(xì)胞系(PC9和A549) 購自寧波明舟公司;多藥耐藥細(xì)胞系A(chǔ)549/CR為本課題組前期構(gòu)建[7]。
1.1.2 主要試劑:培美曲塞和順鉑購自美國Sigmaaldrich公司;SYBR RT-PCR試劑盒購自大連寶生物公司;TRIzol和Lipofectamine 3000購自美國賽默飛公司;FAM83H-AS1抑制劑(sh-FAM83H-AS1) 及陰性對照(sh-NC) 購自廣州銳博公司;CCK8試劑盒購自上海碧云天公司;ABCC1和GAPDH抗體購自武漢云克隆公司。
1.2.1 實(shí)時定量PCR:TRIzol法從組織或細(xì)胞標(biāo)本中提取總RNA,檢測RNA的純度和完整性。應(yīng)用一步法SYBR RT-PCR試劑盒擴(kuò)增FAM83H-AS1基因,按照說明書設(shè)定反應(yīng)條件。引物序列見表1。反應(yīng)體系和反應(yīng)條件參照說明書。根據(jù)內(nèi)參基因GAPDH的表達(dá)進(jìn)行歸一化后,應(yīng)用比較Ct值法計(jì)算FAM83H-AS1的相對表達(dá)量,并基于相對表達(dá)量的平均值,將所有LUAD患者分為高表達(dá)組和低表達(dá)組。
表1 引物序列Tab.1 Primer sequences
1.2.2 細(xì)胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染:所有細(xì)胞系均應(yīng)用含10%胎牛血清的DMEM高糖培養(yǎng)基,置于5% CO2,37 ℃的條件下培養(yǎng)。將5×104個A549/CR細(xì)胞接種于6孔板中,培養(yǎng)24 h。按照說明書,應(yīng)用Lipofectamine 3000將FAM83H-AS1抑制劑轉(zhuǎn)染入A549/CR細(xì)胞,培養(yǎng)5~6 h,更換培養(yǎng)基后繼續(xù)常規(guī)培養(yǎng)。
1.2.3 藥物敏感性檢測:分別用培美曲塞(0.5 μg/mL、1 μg/mL、5 μg/mL、10 μg/mL、20 μg/mL和50 μg/mL)和順鉑(5 μg/mL、10 μg/mL、20 μg/mL、50 μg/mL和75 μg/mL) 處理A549/CR細(xì)胞。然后,按照說明書使用CCK8試劑盒檢測細(xì)胞活力。酶標(biāo)儀檢測每個樣本的吸光度(450 nm),并計(jì)算半數(shù)抑制濃度(half maximal inhibitory concentration,IC50)。
1.2.4 Western blotting:提取A549/CR細(xì)胞總蛋白,進(jìn)行蛋白定量分析。取樣進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉(zhuǎn)移到聚偏二氟乙烯膜上,4 ℃過夜封閉,與一抗(ABCC1抗體) 雜交,二抗孵育,化學(xué)發(fā)光,凝膠成像儀獲取圖像。利用Image J軟件對圖像中的條帶進(jìn)行分析。
采用Graphpad prism 5軟件分析數(shù)據(jù)。每組實(shí)驗(yàn)重復(fù)5次,數(shù)據(jù)以±s表示。差異比較采用單因素方差分析、t檢驗(yàn)和χ2檢驗(yàn)。P< 0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
與NLT組織相比,LUAD組織中FAM83H-AS1的相對表達(dá)量顯著上調(diào)(圖1A,P< 0.001)。與PAEC細(xì)胞相比,在PC9和A549細(xì)胞中FAM83H-AS1的相對表達(dá)量明顯增加(圖1B,P< 0.001)。
LUAD組織中FAM83H-AS1的表達(dá)與患者的吸煙史和化療(培美曲塞和順鉑) 不敏感相關(guān)(P< 0.05),與年齡、性別和TNM分期無相關(guān)性(P> 0.05)。見表2?;诎┌Y基因組圖譜(the cancer genome atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫的預(yù)后分析結(jié)果顯示,與FAM83H-AS1低表達(dá)的LUAD患者相比,F(xiàn)AM83H-AS1高表達(dá)的LUAD患者的生存時間更短,預(yù)后更差(圖1C,P< 0.05)。
表2 104例LUAD患者的FAM83H-AS1表達(dá)與臨床病理信息的相關(guān)性Tab.2 Correlation between FAM83H-AS1 expression and clinical pathological characteristics of 104 LUAD patients
圖1 FAM83H-AS1在LUAD中高表達(dá)Fig.1 High expression of FAM83H-AS1 in LUAD
與化療敏感組LUAD組織相比,不敏感組LUAD組織中FAM83H-AS1的表達(dá)顯著增加(圖2A,P<0.05)。如圖2B和2C所示,A549細(xì)胞對培美曲塞和順鉑的IC50分別為(2.17±0.58) μg/mL和(10.86±1.97)μg/mL,而A549/CR細(xì)胞對培美曲塞和順鉑的IC50分別 為(13.48±1.37) μg/mL和(48.72±3.85) μg/mL。A549/CR細(xì)胞對培美曲塞和順鉑的耐藥系數(shù)分別為6.21和4.49,其表現(xiàn)出對培美曲塞和順鉑較強(qiáng)的耐受性。而且,與A549細(xì)胞相比,A549/CR細(xì)胞中FAM83H-AS1的表達(dá)顯著上調(diào)(圖2D,P< 0.05)。
圖2 FAM83H-AS1高表達(dá)與LUAD患者的化療不敏感相關(guān)Fig.2 High-expression of FAM83H-AS1 is related with insensitivity to chemotherapy in LUAD
實(shí)時定量PCR檢測證實(shí)轉(zhuǎn)染sh-FAM83H-AS1能夠顯著降低A549/CR細(xì)胞中FAM83H-AS1的表達(dá)(圖3A,P< 0.05)。與對照組相比,F(xiàn)AM83H-AS1沉默將A549/CR細(xì)胞對培美曲塞的IC50由(14.13±1.33) μg/mL降為(6.71±0.75) μg/mL(圖3B,P< 0.05),將對順鉑的IC50由(48.21±4.27) μg/mL降為(20.16±2.57) μg/mL(圖3C,P< 0.05)。沉默F(xiàn)AM83H-AS1提高了A549/CR細(xì)胞對培美曲塞和順鉑的敏感性。
圖3 沉默F(xiàn)AM83H-AS1提高A549/CR細(xì)胞對培美曲塞和順鉑的敏感性Fig.3 Silencing of FAM83H-AS1 enhances pemetrexed and cisplatin sensitivity of A549/CR cells
基于TCGA的數(shù)據(jù)庫,應(yīng)用生物信息學(xué)軟件GEPIA2進(jìn)行基因表達(dá)相關(guān)性分析。結(jié)果顯示,F(xiàn)AM83HAS1與ABCC1基因的表達(dá)在LUAD中呈正相關(guān)(圖4A,P< 0.01)。而且,沉默F(xiàn)AM83H-AS1能夠抑制A549/CR細(xì)胞中ABCC1蛋白的表達(dá)(圖4B,P< 0.05)。
圖4 沉默F(xiàn)AM83H-AS1降低A549/CR細(xì)胞中的ABCC1蛋白的表達(dá)水平Fig.4 Silencing of FAM83H-AS1 decreases ABCC1 protein expression level in A549/CR cells
近年來,諸多腫瘤學(xué)研究證實(shí)非編碼RNA參與了包括LUAD在內(nèi)的多種腫瘤化療耐藥的發(fā)生和維持。尤其是lncRNAs,因其數(shù)量眾多、功能和機(jī)制復(fù)雜等特點(diǎn),引起研究者的廣泛關(guān)注。例如,SLCO4A1-AS1通 過miR-4701-5p/NFE2L1途徑激活WNT通路,促進(jìn)LUAD細(xì)胞的生長并誘導(dǎo)其對順鉑的耐藥[8];LINC00485作為分子海綿結(jié)合microRNA-195調(diào)節(jié)其靶基因CHEK1,進(jìn)而降低LUAD細(xì)胞對順鉑的化療敏感性[9]。
本研究結(jié)果顯示,F(xiàn)AM83H-AS1在LUAD中高表達(dá)。FAM83H-AS1的異常高表達(dá)與LUAD患者吸煙史及化療不敏感有關(guān),而且其高表達(dá)與LUAD患者的不良預(yù)后相關(guān)。這些提示FAM83H-AS1參與了LUAD的化療耐藥,可能發(fā)揮癌基因的作用。
本研究還發(fā)現(xiàn)FAM83H-AS1在化療(培美曲塞和順鉑) 不敏感的LUAD組織和細(xì)胞系中高表達(dá),而且FAM83H-AS1的沉默顯著提升了化療耐藥細(xì)胞株A549/CR對培美曲塞和順鉑的敏感性。進(jìn)一步證明了FAM83H-AS1參與了LUAD的化療耐藥。
生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,LUAD中FAM83HAS1與ABCC1基因的表達(dá)正相關(guān)。而且,沉默F(xiàn)AM83H-AS1能夠抑制A549/CR細(xì)胞中ABCC1蛋白的表達(dá)。ABCC1是一個經(jīng)典的多藥耐藥相關(guān)基因,屬于ATP結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白超家族。ABCC1蛋白介導(dǎo)物質(zhì)進(jìn)出細(xì)胞,能在化療藥物起效前將其排出細(xì)胞外。諸多研究[10-11]證實(shí)ABCC1參與了幾乎所有惡性腫瘤的化療耐藥的發(fā)生,包括LUAD。據(jù)此,本研究認(rèn)為FAM83H-AS1能夠通過正性調(diào)節(jié)ABCC1基因,促進(jìn)化療藥物從細(xì)胞中排出,導(dǎo)致LUAD化療耐藥的發(fā)生。
綜上,F(xiàn)AM83H-AS1在LUAD中高表達(dá),且與LUAD患者的化療不敏感相關(guān),F(xiàn)AM83H-AS1能通過正性調(diào)節(jié)ABCC1基因,參與LUAD化療耐藥的形成。本研究有助于明確LUAD化療耐藥發(fā)生的分子機(jī)制,亦能夠?yàn)長UAD的臨床綜合治療提供新靶點(diǎn)。