蔣正立 朱 萍 任 宇 戴淑萍 陳 靜
胃癌是一種常見消化系統(tǒng)腫瘤,其發(fā)病率僅次于肺癌、乳腺癌、腸癌和前列腺癌,而死亡率在所有癌癥死因中排第3 位,嚴(yán)重危害人類健康[1]。大量研究發(fā)現(xiàn),傳統(tǒng)中醫(yī)藥在胃癌治療方面效果明顯,從中草藥中尋找抗癌藥物的各類研究一直受到人們的廣泛重視。復(fù)方刺梨合劑是浙江省臺州醫(yī)院院內(nèi)制劑,由刺梨與蒼術(shù)組成,具有健脾燥濕、消食和胃之功效,對食積不化、胃脘脹滿、泄瀉等具有明確療效。復(fù)方刺梨合劑抗胃癌作用尚未見報道,而前期文獻(xiàn)研究發(fā)現(xiàn),刺梨與蒼術(shù)均對胃部腫瘤細(xì)胞有抑制作用[2-6]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究具有整體性和系統(tǒng)性,與中醫(yī)藥的辨證論治原則、整體觀念相合,可用于發(fā)現(xiàn)復(fù)雜中藥中的活性成分,進(jìn)而識別靶標(biāo)和預(yù)測適應(yīng)證[7-9]。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,預(yù)測和分析復(fù)方刺梨合劑抗胃癌藥理作用機(jī)制,并進(jìn)行實(shí)驗(yàn)初步驗(yàn)證,為深入研究其胃癌治療作用提供參考。
1.1儀器 化學(xué)發(fā)光/熒光成像分析儀(Image-Quant,LAS500 北京盛科信德),電泳儀(1658033,美國賽默飛),半干轉(zhuǎn)印槽(1703940,北京龍躍),高速冷凍離心機(jī)(AllegraX-15,美國貝爾曼)。
1.2藥物及試劑 復(fù)方刺梨合劑(浙江省臺州醫(yī)院制劑室,201026),組織細(xì)胞總蛋白抽提試劑盒(杭州達(dá)文生物,P1250-50),預(yù)染蛋白(杭州達(dá)文生物,P1101),麗春紅(杭州達(dá)文生物,P1503),1M Tris-HCl,pH6.8(杭州達(dá)文生物,B1002),pH8.0(杭州達(dá)文生物,B1011),ECL Plus 超敏發(fā)光液(杭州達(dá)文生物,P1052),封閉專用脫脂牛奶(杭州達(dá)文生物,P1622),Tween-20(上海生工生物工程,C500623),SDS(上海生工生物工程,A100227),Glycine(上海生工生物工程,A110167),SAGE 配膠試劑盒(杭州達(dá)文生物,AP014),5X loading buffer(杭州達(dá)文生物,B1034-5),Bcl-2 抗體(杭州達(dá)文生物,C1342),p53抗體(杭州達(dá)文生物,C1831),HRP-抗兔二抗(杭州達(dá)文生物,C2252),磷酸鹽緩沖液(PBS),胃癌細(xì)胞株SGC-7901(中國科學(xué)院)。
1.3方 法1.3.1 活性成分篩選 以“刺梨”與“蒼術(shù)”為主題詞,從中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(TCMSP)(http∶//tcmspw.com/index.php)中尋找與這2 味中藥相關(guān)的所有化學(xué)成分及對應(yīng)靶點(diǎn),以口服生物利用度(OB)≥30%、類藥性(DL)≥0.18 為化合物分子篩選條件,通過條件篩選,即為候選活性成分。
1.3.2活性成分-靶點(diǎn)篩選 基于TCMSP 查找活性成分靶點(diǎn),同時登陸SwissTarget Prediction http∶//www.swisstargetprediction.ch/)服務(wù)器,上傳復(fù)方刺梨合劑活性成分Sdf-mol 格式文件,采用反向藥效團(tuán)匹配方法,設(shè)置可能性Probability>0,得到虛擬活性成分對應(yīng)靶點(diǎn)。
1.3.3抗胃癌作用靶點(diǎn)篩選及PPI 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 以“gastric cancer”等關(guān)鍵詞搜索比較毒物遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(CTD)(http∶//ctdbase.org/)和在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫(OMIM)(http∶//www.omim.org/)中已報道的胃癌相關(guān)靶點(diǎn),選擇既是活性成分靶標(biāo)又是胃癌靶標(biāo)的蛋白進(jìn)行分析,篩選靶標(biāo)。通過Cytoscape 3.7.1 軟件構(gòu)建藥物-成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖。將復(fù)方刺梨合劑抗胃癌治療的潛在關(guān)鍵靶點(diǎn)基因?qū)隨tring 數(shù)據(jù)庫平臺(https∶//string-db.org/),選擇物種為人類,獲取蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系,繪制蛋白關(guān)系網(wǎng)絡(luò)。
1.3.4GO 功能和KEGG 通路分析 采用WebGestalt(http∶//www.webgestalt.org/option.php)和DAVID 數(shù)據(jù)庫(https∶//david.ncifcrf.gov/)對預(yù)測治療靶點(diǎn)進(jìn)行GO功能分析和KEGG 通路分析。
1.3.5實(shí)驗(yàn)研究 基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),采用Western blot 法測定p53、Bcl-2 蛋白表達(dá)。取人胃癌細(xì)胞株SGC-7901,接種于10%胎牛血清的RPMI1640 培養(yǎng)基,在37℃、5% CO2條件下培養(yǎng)。根據(jù)前期預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果將細(xì)胞分為對照組及實(shí)驗(yàn)組(濃度分別為80、120、160、240、320μg/mL)。收集對數(shù)生長期細(xì)胞,調(diào)整細(xì)胞密度為1×105個/mL,接種于6 孔板中,每孔2mL。按分組濃度添加含藥培養(yǎng)基,每組設(shè)3 個復(fù)孔,于37℃、5% CO2條件下分別培養(yǎng)48 和72h。用0.25%胰酶消化收集細(xì)胞,并用預(yù)冷PBS 洗滌2 次。用1mL RIPA 裂解液于冰上提取蛋白,以12000r/min 離心15min,取上清液。蛋白質(zhì)濃度測定后,以40μg/孔的上樣量進(jìn)行蛋白質(zhì)電泳,半干轉(zhuǎn)膜法將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移至聚偏二氟乙烯(PVDF)膜,5%脫脂牛奶封閉2h。TBST 溶液洗滌PVDF 膜3 遍后,于4℃條件下孵育p53 及Bcl-2 抗體搖動過夜,洗脫一抗后孵育二抗,于避光條件下采用增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光法(ECL)分析系統(tǒng)顯影,并用ImageJ 軟件計(jì)算分析條帶灰度值。
1.3.6統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 應(yīng)用SPSS 25.0 統(tǒng)計(jì)軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,采用One-way ANOVA 進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1活性成分 以“蒼術(shù)”為關(guān)鍵詞,從TCMSP 數(shù)據(jù)庫中得到蒼術(shù)活性成分49 個化學(xué)成分,根據(jù)OB≥30%,DL≥0.18 進(jìn)行篩選,得到4 個活性成分,分別是NSC63551、谷甾醇-3-O-葡萄糖苷、漢黃芩素、3β-乙酰氧基蒼術(shù)酮。而TCMSP 數(shù)據(jù)庫中并未收錄刺梨,通過文獻(xiàn)檢索相關(guān)成分,包括黃酮、超氧化物歧化酶(SOD)、維生素C、三萜以及多糖等活性成分,進(jìn)一步將其成分通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫,根據(jù)OB≥30%,DL≥0.18 進(jìn)行篩選得到3 個活性成分(槲皮素、山奈酚、木犀草素)。此外,維生素C、蘆丁和刺梨苷雖然不滿足OB≥30%或DL≥0.18,但含量較高,同時文獻(xiàn)研究表明,蘆丁具有抗胃癌SGC-7901 細(xì)胞作用[10-11],維生素C 也具有抗胃癌作用[12],因此納入活性成分,最后通過篩選共得到活性化合物10個,其中蒼術(shù)4 個,刺梨6 個,具體見表1。
表1 復(fù)方刺梨合劑篩選后得到10 個活性成分
2.2活性成分-靶點(diǎn) 篩選相關(guān)作用靶點(diǎn),通過Uniprot 數(shù)據(jù)庫(https∶//www.uniprot.org/)的Uniprot ID對應(yīng)至基因,共得到人源靶點(diǎn)基因236 個。
2.3復(fù)方刺梨合劑治療胃癌作用靶點(diǎn)篩選及PPI 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 以“gastric cancer”等關(guān)鍵詞搜索CTD 和OMIM 數(shù)據(jù)庫中已報道的與胃癌相關(guān)的靶點(diǎn),共得到440 個胃癌相關(guān)靶點(diǎn),選擇既是成分靶標(biāo)又是胃癌靶標(biāo)的蛋白進(jìn)行分析,共篩選到38 個靶標(biāo)。通過Cytoscape3.7.1 軟件構(gòu)建藥物-成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖(見圖1),該網(wǎng)絡(luò)包含2 種藥物、1 種疾病、8 個活性成分、38 個靶點(diǎn),連接度為前3 的潛在活性分子為quercetin、luteolin、kaempferol,關(guān)鍵靶點(diǎn)包括p53、Bcl-2、PIK3CA、Caspase8、CDK4 等。以上成分及靶點(diǎn)是復(fù)方刺梨合劑抗胃癌治療的重要成分及重要靶點(diǎn),對復(fù)方刺梨合劑治療胃癌有重要意義。將38 個潛在的關(guān)鍵靶點(diǎn)基因?qū)隨tring 數(shù)據(jù)庫平臺,繪制蛋白關(guān)系網(wǎng)絡(luò)(見圖2),該網(wǎng)絡(luò)圖共包括38 個節(jié)點(diǎn),397 條邊。其中綜合數(shù)值評分>0.995 的相互作用蛋白有CDK4-CCND1、CDKN1A-CDK4、BCL2L1-TP53、CDKN2A-CDK4、CDKN1A-CCND1、CDKN1A-TP53、MAPK8 -JUN、CASP8 -BCL2L1、PLAU -SERPINE1、CHEK2-TP53 等,這些蛋白之間的相互作用在網(wǎng)絡(luò)中具有重要地位,靶點(diǎn)基因在復(fù)方刺梨合劑抗胃癌治療中具有重要意義,可作為復(fù)方刺梨合劑有效成分作用的靶點(diǎn)基因。
圖1 復(fù)方刺梨合劑藥物、活性成分與胃癌關(guān)鍵靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
圖2 蛋白質(zhì)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖
2.4GO 功能和KEGG 通路分析 采用WebGestalt和DAVID 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO 功能和KEGG 通路分析。如圖3 所示,GO 功能分析顯示顯著功能有:對刺激反應(yīng)(38/38)、生物調(diào)節(jié)(38/38)、細(xì)胞傳遞(36/38)、核(28/38)、胞質(zhì)溶膠(25/38)、膜封閉腔(25/38)等。KEGG 通路富集結(jié)果顯示,38 個靶點(diǎn)參與63 條顯著KEGG 通路(根據(jù)Benjamini 校正法、PValue<0.01),包括關(guān)鍵基因靶點(diǎn)主要富集的通路為HIF-1 信號通路、p53 信號通路、TNF 信號通路、PI3K-Akt 信號通路等。且與胰腺癌、膀胱癌、大腸癌、子宮內(nèi)膜癌、小細(xì)胞肺癌等腫瘤密切相關(guān),表明復(fù)方刺梨合劑的活性成分靶點(diǎn)分布于不同的通路,可通過各通路協(xié)調(diào)發(fā)揮抗癌作用。同時復(fù)方刺梨合劑的關(guān)鍵靶點(diǎn)基因富集于多種癌癥通路上,提示此類型的癌癥可作為未來研究復(fù)方刺梨合劑對抗癌療效的重要方向。
圖3 GO 功能分析結(jié)果
2.5實(shí)驗(yàn)研究 與對照組(0.28±0.02)比較,80μg/mL復(fù)方刺梨合劑處理48h 后,人胃癌細(xì)胞SGC-7901中p53 蛋白相對β-actin 表達(dá)量為(0.38±0.03,P=0.060),160μg/mL 和320μg/mL 復(fù)方刺梨合劑處理48h 后,p53 蛋白相對β-actin 表達(dá)量分別為(0.60±0.05,P=0.011)和(0.47±0.01,P=0.005)。與對照組(0.09±0.01)比較,80μg/mL 復(fù)方刺梨合劑處理48h后Bcl-2 相對β-actin 表達(dá)為(0.13±0.00,P=0.005),160μg/mL 和320μg/mL 復(fù)方刺梨合劑處理組的Bcl-2 相對β-actin 表達(dá)量分別為(0.10±0.01,P=0.771)和(0.11±0.01,P=0.127)。Western blot 實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示(見圖4),復(fù)方刺梨合劑使用后,p53 和Bcl-2 蛋白表達(dá)增加,且p53 相對β-actin 表達(dá)隨著復(fù)方刺梨合劑濃度的增加而增加。
圖4 p53 和Bcl-2 蛋白表達(dá)
復(fù)方刺梨合劑作為醫(yī)院制劑,由刺梨與蒼術(shù)組成,該配伍利用刺梨味甘性涼,結(jié)合蒼術(shù)味辛性溫之性味,發(fā)揮其燥濕健脾、祛風(fēng)散寒之功效。目前對其研究也局限于制劑質(zhì)量控制方面[13-14],而關(guān)于其藥理作用研究報道較少。
本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫及文獻(xiàn)篩選了10 個復(fù)方刺梨合劑的活性化學(xué)成分,得到236 個化合物靶點(diǎn),蒼術(shù)活性化學(xué)成分中漢黃芩素活性最高,作用于45 個靶點(diǎn),刺梨活性化學(xué)成分中以槲皮素最高,作用于154 個靶點(diǎn)。通過CTD和OMIM 數(shù)據(jù)庫中已報道的與胃癌相關(guān)的靶點(diǎn),共得到440 個胃癌相關(guān)靶點(diǎn),對蛋白進(jìn)行分析,共得到38 個靶標(biāo),關(guān)鍵靶點(diǎn)包括p53、Bcl-2、PIK3CA、Caspase8、CDK4 等。在本研究中,采用WebGestalt 和DAVID 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO 功能和KEGG 通路分析,篩選出HIF-1、p53、TNF、PI3K-Akt 等信號通路,表明復(fù)方刺梨合劑可通過調(diào)控各通路發(fā)揮抗癌作用。基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究結(jié)果,p53 和Bcl-2 為復(fù)方刺梨合劑抗胃癌的關(guān)鍵靶點(diǎn)。p53 基因是目前研究最深入、最廣泛的腫瘤抑制基因之一,由11 個外顯子和10個內(nèi)含子組成,是一種負(fù)調(diào)節(jié)因子,其失活對腫瘤形成起重要作用,在臨床中具有重要意義[15]。Bcl-2 基因?yàn)榈蛲鲆种苹?,可通過阻礙細(xì)胞凋亡、促進(jìn)細(xì)胞增殖、延長細(xì)胞壽命來增加腫瘤的發(fā)生,并促進(jìn)腫瘤的發(fā)展[16]。不少學(xué)者研究表明,p53 在胃癌組織中高表達(dá),與胃癌腫瘤直徑、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、浸潤深度、胃癌TNM 分期等密切相關(guān),其異常表達(dá)表明p53 與胃癌的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移等有關(guān)[17-18]。多項(xiàng)研究顯示,胃癌中Bcl-2 蛋白高表達(dá)參與胃癌的發(fā)生、發(fā)展[19-20]。因此,本研究采用Western blot 方法對網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究結(jié)果進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,結(jié)果表明,復(fù)方刺梨合劑可上調(diào)人胃癌細(xì)胞SGC-7901 中p53 和Bcl-2 蛋白表達(dá)。
綜上所述,本文基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法及實(shí)驗(yàn)研究,揭示了復(fù)方刺梨合劑抗胃癌作用是多成分、多靶點(diǎn)、多通路的結(jié)果,可能通過調(diào)控p53 和Bcl-2 蛋白的表達(dá)發(fā)揮作用,為下一步深入研究其作用機(jī)制提供了思路。