施明雨,郭 亭,,3,,魏荷芬,應(yīng)漢杰,,3,張宿義,陳 勇,,3,唐成倫
(1.江蘇集萃工業(yè)生物技術(shù)研究所有限公司,江蘇 南京 211800;2.南京高新工大生物技術(shù)研究院有限公司,江蘇 南京 211800;3.南京工業(yè)大學(xué) 國家生化工程技術(shù)研究中心,江蘇 南京 211800;4.瀘州老窖股份有限公司,四川 瀘州 646000)
唾液酸(SA),化學(xué)名為N-乙?;窠?jīng)氨酸,是一種天然的碳水化合物[1]。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中,唾液酸在大腦和神經(jīng)系統(tǒng)的產(chǎn)生和發(fā)育中發(fā)揮非常重要的作用[2]。特別是對(duì)于出生體質(zhì)量較輕的嬰兒,充足的唾液酸補(bǔ)給對(duì)嬰兒大腦的正常發(fā)育至關(guān)重要;孕婦分娩后體內(nèi)的唾液酸含量水平逐漸下降,為維持體內(nèi)唾液酸水平,孕婦乃至孕后仍需額外攝取足量的唾液酸。另外,唾液酸的含量還與DHA的含量有著明顯的相關(guān)性,這表明它極有可能與嬰兒的腦結(jié)構(gòu)和腦功能發(fā)育有關(guān),可能兩者都對(duì)早期腦發(fā)育有益[3]。目前,唾液酸作為一種“全能型”新食品資源,可以應(yīng)用于食品、奶粉、醫(yī)藥和化妝品等眾多領(lǐng)域。
據(jù)中國燕窩市場(chǎng)分析報(bào)告顯示,2016—2020年,燕窩的需求與供給均以超過10%的速度增長,但供需矛盾非常突出,如2019年的供需差額約3 000 噸/年;隨著唾液酸的應(yīng)用市場(chǎng)的不斷拓展,唾液酸的潛在市場(chǎng)需求估計(jì)為1 500 噸/年,其市場(chǎng)容量在300~1 000億元/年[6]。唾液酸的生產(chǎn)方法主要有天然提取法、酶合成法、化學(xué)合成法和微生物發(fā)酵法。唾液酸在天然原料中的含量很低,所以唾液酸的天然提取法應(yīng)用有限;唾液酸酶合成法的缺點(diǎn)是原料成本高,這在一定程度上限制了酶合成法的規(guī)?;a(chǎn);唾液酸的化學(xué)合成法所需的反應(yīng)條件苛刻(如氧化過程需要在-78 ℃進(jìn)行),不具備優(yōu)勢(shì);微生物發(fā)酵法生產(chǎn)唾液酸具有原料廉價(jià)、反應(yīng)條件溫和、易于放大的優(yōu)勢(shì),是最具產(chǎn)業(yè)化前景的方法。
聚唾液酸(polysialic acid,PSA)是唾液酸單體通過α-2,8和/或者α-2,9糖苷鍵連接而成的線性多聚糖,以莢膜的形式存在于少數(shù)幾種致病菌細(xì)胞的表面。1959年,Barry和Goebel首先在大腸桿菌(Escherichiacoli) K-235和K-1中發(fā)現(xiàn)該聚合物[4]。在固體發(fā)酵過程中,聚唾液酸通常以夾膜的形式附于細(xì)胞表面;在液體發(fā)酵過程中,由于攪拌等作用,聚唾液酸通常以黏液的形式脫落到發(fā)酵液中。將聚唾液酸進(jìn)行酸水解或酶水解后,離純化可得到唾液酸,這是工業(yè)化發(fā)酵生產(chǎn)唾液酸的基礎(chǔ)[5]。
現(xiàn)階段的聚唾液酸生產(chǎn)菌株主要是大腸桿菌,野生型大腸桿菌聚唾液酸的產(chǎn)量一般都不高且發(fā)酵水平不穩(wěn)定,所以大腸桿菌的工業(yè)化發(fā)酵生產(chǎn)產(chǎn)量普遍較低(5~6 g/L),一定程度上限制了其應(yīng)用。Rode等[7]利用大腸桿菌E.coliK92發(fā)酵生產(chǎn)聚唾液酸,產(chǎn)量為1.6 g/L。Stark等[8]利用E.coli通過溶氧反饋補(bǔ)料發(fā)酵生產(chǎn)聚唾液酸,產(chǎn)量3 g/L。國內(nèi)對(duì)聚唾液酸的研究起步較晚,目前國內(nèi)聚唾液酸的發(fā)酵水平較低,發(fā)酵成本較高。詹曉北等[9]對(duì)聚唾液酸的發(fā)酵動(dòng)力學(xué)以及pH控制補(bǔ)料進(jìn)行了研究。張琦等[10]通過兩階段攪拌策略發(fā)酵生產(chǎn)聚唾液酸,產(chǎn)量為3.966 g/L。劉金龍[11]優(yōu)化聚唾液酸生產(chǎn)工藝,進(jìn)行了500 L規(guī)模的中試放大驗(yàn)證,聚唾液酸產(chǎn)量達(dá)到5.5 g/L。
誘變篩選技術(shù)是獲得高產(chǎn)菌株的有效手段之一,但高產(chǎn)聚唾液酸選育過程繁瑣。國外關(guān)于唾液酸的研究很多,但是主要都是關(guān)于唾液酸及其衍生物生物生理活性的研究。本研究利用常壓室溫等離子體(ARTP)誘變和微生物高通量自動(dòng)挑選儀,誘變選育得到高產(chǎn)聚唾液酸菌株,通過高密度發(fā)酵條件的優(yōu)化,提升聚唾液酸的生產(chǎn)效率,為發(fā)酵法制備唾液酸的產(chǎn)業(yè)化提供良好的生產(chǎn)菌種。
樣品采集自某天然水體。
EscherichiacoliSA-1,由江蘇集萃工業(yè)生物技術(shù)研究所有限公司微生物育種平臺(tái)誘變篩選并保藏。
葡萄糖(食品級(jí)),山東西王藥業(yè)有限公司;山梨醇、瓊脂,NaCl、MgSO4、K2HPO4、KH2PO4,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司;酵母粉、蛋白胨(AR),OXOID公司。
固體培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10、NaCl 10、酵母粉5、瓊脂20;滅菌前pH自然。
種子培養(yǎng)基(g/L):蛋白胨10、NaCl 10、酵母粉5;滅菌前pH自然。
鑒別培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖30、KH2PO41.0、蛋白胨10、MgSO40.6、瓊脂20;滅菌前pH 7.6。
搖瓶培養(yǎng)基(g/L):山梨醇40、(NH4)2SO44.94、K2HPO4·3H2O 5.2、蛋白胨10、MgSO41.2;滅菌前pH 7.6。
上罐培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖20、玉米漿20、K2HPO4·3H2O 2.5、KH2PO45.0,MgSO40.9、NaCl 5;pH 6.4。
ARTP-M型等離子誘變儀,無錫天木清源生物科技有限公司;QPix420型微生物高通量全自動(dòng)挑選儀,美谷分子儀器(上海)有限公司;SW-CJ-1FD型超凈工作臺(tái),蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司;GENESYS 10S型分光光度計(jì),賽默飛世爾科技(中國)有限公司;ZQZY-CT型振蕩培養(yǎng)箱,上海知楚儀器有限公司;T&J-Btype 10 L*2發(fā)酵系統(tǒng),迪必爾生物工程(上海)有限公司;PL600E/02型電子稱,梅特勒-托利多儀器(上海)有限公司;G180DWS型立式自動(dòng)壓力蒸汽滅菌鍋,致微(廈門)儀器有限公司;Centrifuge 5424R型高速離心機(jī),艾本德中國有限公司。
1.3.1 PSA含量測(cè)定
采用間苯二酚-鹽酸法[12],測(cè)定PSA含量。
1.3.2 菌株的分離和純化
將所取水樣逐級(jí)稀釋,分別涂布在鑒別培養(yǎng)基(另加溴甲酚紫10 g/L)上,通過多次稀釋和挑選單菌落劃線進(jìn)行純化,獲得多株菌株,編號(hào)保存于本實(shí)驗(yàn)室。
1.3.3 菌種的生理生化鑒定和進(jìn)化樹分析
Biolog細(xì)菌鑒定:采用Biolog微生物自動(dòng)分析系統(tǒng)(MicroStation,Biolog公司),細(xì)菌純培養(yǎng)采用Biolog BUG 的固體培養(yǎng)基,37 ℃恒溫培養(yǎng)12 h,再將菌落用液體培養(yǎng)基(IF - B)稀釋,稀釋的菌液加入到Gen Ⅲ微板中(每個(gè)孔100 μL),37 ℃ 恒溫培養(yǎng)24 h,然后用MicroStation進(jìn)行鑒定。
將測(cè)序結(jié)果提交GenBank進(jìn)行BLAST分析。選取同源性相近的序列,再用MEGA7軟件對(duì)選取的序列進(jìn)行編輯,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。
1.3.4 ARTP誘變
從超低溫冰箱內(nèi)取出甘油管劃線于LB固體平板,挑選單菌落接種至一級(jí)種子液(LB,裝液量20 mL,于100 mL搖瓶中),于37 ℃、200 r/min培養(yǎng)過夜。按4%的接種量將一級(jí)種子液轉(zhuǎn)接至二級(jí)種子液(LB,裝液量20 mL),于37 ℃、200 r/min培養(yǎng)約3 h,OD600達(dá)到0.6~0.8,取菌液1 mL,用無菌生理鹽水梯度稀釋104,制成誘變菌懸液。取10 μL菌懸液均勻涂布于載片上,放置在ARTP操作室中:高度2 mm,通氣量10 L/min(0 ℃,1個(gè)標(biāo)準(zhǔn)大氣壓),功率100 W,分別處理0、10、20、30、35、40、45和50 s。處理完的載片,迅速轉(zhuǎn)移至1 mL生理鹽水中,充分振蕩后涂布于含溴甲酚紫的鑒別培養(yǎng)基中,每個(gè)梯度做3個(gè)平行實(shí)驗(yàn),平板放置于37 ℃生化培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,記錄平板上的活菌數(shù)并計(jì)算致死率。致死率按式(1)計(jì)算。
(1)
式中:A為未誘變處理平板上菌落數(shù);L為誘變處理后平板上菌落數(shù)。
1.3.5 高產(chǎn)菌株篩選
1) 初篩。利用微生物高通量自動(dòng)挑選儀掃描鑒別培養(yǎng)基平板上變色光圈直徑(D)與菌落直徑(d)比值較大的菌落,自動(dòng)挑選至含搖瓶培養(yǎng)基的96孔板(裝液量100 μL),37 ℃、150 r/min培養(yǎng)72 h,測(cè)定各孔菌株的PSA含量。每株單菌落做2個(gè)平行試驗(yàn),復(fù)挑至Copy板培養(yǎng)24 h,作為初篩種子保藏甘油管。
2) 搖瓶復(fù)篩。將初篩得到菌株甘油管從超低溫冰箱取出劃線接種于LB固體平板,挑選單菌落接種至一級(jí)種子液(LB,裝液量20 mL),于37 ℃、200 r/min培養(yǎng)過夜。按2%的接種量將一級(jí)種子液轉(zhuǎn)接至含搖瓶培養(yǎng)基的搖瓶中(LB,裝液量100 mL于500 mL搖瓶中),37 ℃、200 r/min培養(yǎng)72 h。以間苯二酚法檢測(cè)PSA含量,以出發(fā)菌株為對(duì)照,篩選PSA產(chǎn)量較高的菌株。
1.3.6 細(xì)胞生物量測(cè)定
菌體量測(cè)定取一定量發(fā)酵液稀釋一定倍數(shù)后測(cè)定OD600,OD600=1.0相當(dāng)于0.45 g干菌體的質(zhì)量(以1 L發(fā)酵液計(jì))。
1.3.7 遺傳穩(wěn)定性驗(yàn)證
對(duì)獲得的突變菌株進(jìn)行5次傳代,經(jīng)過搖瓶(裝液量100 mL)37 ℃、200 r/min下培養(yǎng)72 h,測(cè)定其各代的SA產(chǎn)量、生物量、發(fā)酵結(jié)束pH,驗(yàn)證菌種的遺傳穩(wěn)定性。
1.3.8 高密度發(fā)酵條件優(yōu)化
在10 L發(fā)酵罐上對(duì)篩選的高產(chǎn)菌株進(jìn)行高密度發(fā)酵,優(yōu)化最佳產(chǎn)高PSA的高密度培養(yǎng)條件。優(yōu)化后的培養(yǎng)條件:10 L玻璃發(fā)酵罐裝液量為5 L、接種量為4%、發(fā)酵溫度為37 ℃并以15%氨水控制pH在6.4,通過聯(lián)動(dòng)調(diào)節(jié)攪拌和通氣量控制溶解氧在30%以上,采用恒速補(bǔ)料策略(發(fā)酵5 h開始以100 mL/h的速率)進(jìn)行補(bǔ)料至發(fā)酵結(jié)束,補(bǔ)料培養(yǎng)基為500 g/L葡萄糖。
產(chǎn)聚唾液酸大腸桿菌菌株的選育過程通常是酸堿指示劑為初篩條件,然后通過間苯二酚法檢測(cè)聚唾液酸含量來篩選出高產(chǎn)菌株,如高霖等[13]以溴甲酚紫為酸堿指示劑,對(duì)大腸桿菌SA-1進(jìn)行常溫常壓等離子體(ARTP)和硫酸二乙酯(DES)誘變,然后在含酸堿指示劑的平板上人工挑選光圈、菌落較大的菌株,整個(gè)過程工作枯燥,步驟單一,操作人員容易疲勞、出錯(cuò)。高產(chǎn)聚唾液酸的大腸桿菌菌株的獲得一定是基于龐大的突變庫,本研究將酸堿指示劑和高通量自動(dòng)挑選儀結(jié)合進(jìn)行自動(dòng)化高通量篩選,經(jīng)過多輪篩選獲得高產(chǎn)唾液酸大腸桿菌菌株。
從天然水體取得水樣,通過溴甲酚紫的鑒別培養(yǎng)基共分離純化出50株菌,并借助全自動(dòng)菌落挑選儀的顏色識(shí)別功能進(jìn)行高通量自動(dòng)化挑選培養(yǎng)基上各菌株的變色光圈直徑(D)/菌落直徑(d)比值較大的唾液酸突變株,經(jīng)過多輪篩選獲得高產(chǎn)唾液酸大腸桿菌菌株,篩選出6株菌株,見表1。進(jìn)一步檢測(cè)6株菌株聚唾液酸含量(間苯二酚法),其產(chǎn)量為0.01~0.20 g/L,其中5號(hào)菌株產(chǎn)量最高(0.20 g/L),記為SA-1,選作為后續(xù)研究菌株。
表1 產(chǎn)聚唾液酸菌株的初篩結(jié)果Table 1 Preliminary screening results of polysialic acid producing strains
將菌株SA-1接種于LB固體培養(yǎng)基中,菌落邊緣整齊、濕潤、透明、有光澤;對(duì)菌株SA-1進(jìn)行Biolog鑒定(表2),相似度大于0.5;另外,對(duì)菌株SA-1系統(tǒng)進(jìn)化樹同源性分析,結(jié)果見圖1。由圖1可知:菌株SA-1與大腸桿菌144的同源性達(dá)100%。選取序列相近的序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹的分析,測(cè)序序列與大腸桿菌K235的同源性達(dá)100%。綜合2種鑒定結(jié)果判定該菌為大腸桿菌。
表2 菌株SA-1的Biolog鑒定結(jié)果Table 2 Results of strain SA-1 by Biolog identification
圖2 菌體SA-1系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree of strain SA-1
產(chǎn)唾液酸大腸桿菌ARTP誘變存活曲線如圖3所示。
圖3 E.coli SA-1的ARTP誘變存活曲線Fig.3 Survival curve of E.coli SA-1 by ARTP
由圖3可知:在0~30 s時(shí),隨著照射時(shí)間的增加,存活率在逐步降低;照射時(shí)間≥40 s時(shí)存活率接近于0;而當(dāng)照射時(shí)間為35 s時(shí),存活率為19.20%,選取該照射時(shí)間下誘變的菌落進(jìn)行培養(yǎng)。
出發(fā)菌株SA-1通過ARTP誘變后,經(jīng)溴甲酚紫鑒別培養(yǎng)基初篩,再通過搖瓶復(fù)篩,經(jīng)過5輪篩選獲得搖瓶發(fā)酵唾液酸產(chǎn)量最高的突變菌株SA-18,其搖瓶產(chǎn)量為0.95 g/L,是出發(fā)菌株產(chǎn)量(0.20 g/L)的4.75倍。
為檢測(cè)突變菌株E.coliSA-18產(chǎn)PSA的遺傳穩(wěn)定性,連續(xù)培養(yǎng)了8代,測(cè)定各代發(fā)酵參數(shù),實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表3所示。
表3 E.coli SA-18的遺傳穩(wěn)定性測(cè)試Table 3 Genetic stability test of E.coli SA-18
由表3可知:各代菌株發(fā)酵結(jié)束時(shí)的PSA產(chǎn)量在0.95 g/L左右,檢測(cè)指標(biāo)較為穩(wěn)定,說明菌株SA-18具有良好的遺傳穩(wěn)定性。
目前,聚唾液酸發(fā)酵生產(chǎn)過程通常都采用較高濃度磷酸鹽和山梨醇為碳源的培養(yǎng)基,高質(zhì)量濃度磷酸鹽(20 g/L K2HPO4)可以有效提高PSA的產(chǎn)量和菌體濃度[14],但以山梨醇碳源進(jìn)行發(fā)酵時(shí),山梨醇并非速效碳源,導(dǎo)致細(xì)胞生長代謝較慢,發(fā)酵結(jié)束培養(yǎng)基中會(huì)積累大量的磷酸鹽,磷酸鹽在發(fā)酵體系中的另外一個(gè)重要作用就是作為緩沖體系,而SA的分離需要經(jīng)過高濃度的酸來酸解,過高濃度的磷酸鹽勢(shì)必會(huì)大幅增加酸解過程酸的消耗,不利于SA的分離。本研究在10 L發(fā)酵罐中進(jìn)行SA的高密度發(fā)酵,以葡萄糖為碳源,采用恒速補(bǔ)料的方式,發(fā)酵初始培養(yǎng)基不變,通過在補(bǔ)料培養(yǎng)基中分別添加0、2.5、5.0、7.5和10.0 g/L K2HPO4進(jìn)行發(fā)酵,發(fā)酵結(jié)果如圖4和5所示。
圖4 磷酸鹽用量對(duì)誘變菌株SA-18發(fā)酵過程細(xì)胞生長的影響Fig.4 Effects of phosphate concentrations on cell growth in the fermentation process of SA-18 mutated strain
圖5 K2HPO4用量對(duì)菌株SA-18產(chǎn)SA的影響Fig.5 Effects of different phosphate concentrations on SA in SA-18
由圖4和5可知:補(bǔ)料培養(yǎng)基中K2HPO4用量為0、2.5 g/L時(shí),菌體生長速率相對(duì)偏慢,最終唾液酸產(chǎn)量相較低;而當(dāng)K2HPO4為7.5、10.0 g/L時(shí),菌體前期生長迅猛,但發(fā)酵后期菌濃下降,即菌體自溶,后期SA合成速率也下降;當(dāng)K2HPO4為5.0 g/L時(shí),菌體生長穩(wěn)定,最終SA產(chǎn)量也達(dá)到最高值16.10 g/L。
為獲得高產(chǎn)聚唾液酸的菌株,本研究首先從天然水體中獲得樣品,經(jīng)鑒別培養(yǎng)基篩選到產(chǎn)唾液酸出發(fā)菌株SA-1。進(jìn)一步通過優(yōu)化最佳致死率等條件得到最佳誘變條件,出發(fā)菌株經(jīng)ARTP等離子體誘變后獲得大量突變株。借助全自動(dòng)菌落挑選儀的顏色識(shí)別功能進(jìn)行高通量自動(dòng)化挑選高產(chǎn)唾液酸突變株,經(jīng)過多輪篩選獲得高產(chǎn)聚唾液酸大腸桿菌菌株SA-18(搖瓶水平達(dá)0.95 g/L)。在10 L發(fā)酵罐中,對(duì)突變菌株SA-18進(jìn)行高密度發(fā)酵培養(yǎng),優(yōu)化補(bǔ)料培養(yǎng)基中的K2HPO4濃度,當(dāng)K2HPO4用量為5.0 g/L時(shí),此時(shí)SA產(chǎn)量達(dá)到16.10 g/L。