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常壓室溫等離子體(ARTP)誘變介導(dǎo)的赤蘚糖醇生產(chǎn)菌的篩選與優(yōu)化

2022-07-22 08:04趙靜宇馬琳琳孫歡歡祁慶生
生物加工過程 2022年3期
關(guān)鍵詞:赤蘚糖醇甘油

趙靜宇,陳 泉,馬琳琳,孫歡歡,祁慶生,,王 倩

(1.山東大學(xué) 國家糖工程技術(shù)研究中心 微生物技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 青島 266237;2.中國科學(xué)院 青島生物能源與過程研究所 生物材料重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 青島 266101)

赤蘚糖醇(1,2,3,4-丁醇)是一種四碳糖醇,由于其能替代糖、抗氧化且安全,被廣泛用作食品和藥物添加劑[1-5],目前已成為低熱量健康食品原料的新寵,其需求量逐年增加。

赤蘚糖醇可以通過化學(xué)合成法和生物發(fā)酵法來合成。由于低產(chǎn)率和高成本,化學(xué)合成法尚未被工業(yè)化[6]。赤蘚糖醇的生物合成研究主要集中在高產(chǎn)赤蘚糖醇的微生物菌株的選擇和發(fā)酵工藝的優(yōu)化上。目前,一些微生物如Aureobasidiumsp.[7]、Torulasp.[8]、Trichosporonsp.[9]、Candidamagnolia[10-11]和Staphylococci[12]可被用于生物法生產(chǎn)赤蘚糖醇。在酵母或真菌中,如在Torulacorallina[8]、Candidamagnolia[10-11]和Ustilaginomycetes[13]中赤蘚糖醇的合成是通過磷酸戊糖途徑進(jìn)行的[14]。細(xì)菌中的赤蘚糖醇通常是在厭氧條件下情況下通過6-磷酸己糖濃度增加進(jìn)行積累的。

菌種誘變可以增加赤蘚糖醇的產(chǎn)量。高蕾蕾等[15]用紫外線和有機(jī)溶劑誘變獲得性能穩(wěn)定的釀酒酵母ERY237,在最佳發(fā)酵條件下的赤蘚糖醇產(chǎn)量為87.8 g/L。Ishizuka等[16]用紫外光照射酵母Aureobasidiumsp.SN-124A,并用N-甲基-N′-硝基-N-硝基-胍鹽(NTG)處理,突變體在培養(yǎng)過程中不會起泡沫,赤蘚糖醇的最大產(chǎn)量可以達(dá)到164.8 g/L。從蜂蜜中分離出的Moniliellasp.440經(jīng)過NTG處理后,突變體N61188-12能夠吸收肌醇并微弱吸收赤蘚糖醇,最終赤蘚糖醇的產(chǎn)量達(dá)到237.8 g/L[17]。

此外,代謝工程方法[18]也可用于增加赤蘚糖醇的產(chǎn)量。編碼甘油激酶和甘油3-磷酸脫氫酶的基因的過表達(dá)增強(qiáng)了Yarrowialipolytica吸收甘油的能力,而且當(dāng)甘油激酶和甘油3-磷酸脫氫酶共表達(dá)時,赤蘚糖醇的生產(chǎn)率可達(dá)到35%[19]。球頭三型孢菌(Trichosporonoidesoedocephalis)在高產(chǎn)赤蘚糖醇的同時還會產(chǎn)生甘油和核糖醇,對產(chǎn)品的分離帶來一定困難,可通過敲除與高滲透壓甘油途徑相關(guān)的HOG1基因得到TO3,從而減少發(fā)酵過程中副產(chǎn)物甘油的產(chǎn)生[20]。

赤蘚糖醇的生產(chǎn)也受到培養(yǎng)條件的影響。通常,微生物耐受的糖濃度和滲透壓越高,赤蘚糖醇的生產(chǎn)和產(chǎn)能越強(qiáng)。耐高滲酵母在500 g/L葡萄糖溶液中旺盛生長并產(chǎn)生赤蘚糖醇[15]。有研究發(fā)現(xiàn),解脂耶氏酵母(Yarrowialipolytica)可以發(fā)酵甘油生產(chǎn)赤蘚糖醇,產(chǎn)量達(dá)到93.6 g/L,得率為49%[15]。另外,金屬離子也會影響赤蘚糖醇的發(fā)酵產(chǎn)量。如發(fā)酵Torulasp.時添加金屬離子Cu2+可以增加細(xì)胞中赤蘚糖還原酶的活性。Mn2+可以改變細(xì)胞的通透性并降低細(xì)胞中赤蘚糖醇的濃度[21]。Mn2+和Cu2+也可以提高三角酵母的赤蘚糖醇產(chǎn)量[15]。

本研究中,筆者從蜂巢、土壤、花粉和花蜜中篩選了1株高產(chǎn)菌株并鑒定為Moniliellasp.MU1。通過常壓室溫等離子體(ARTP)生物育種系統(tǒng)對其進(jìn)行誘變,選擇具有高赤蘚糖醇產(chǎn)率的4個菌株,通過不同的碳源、葡萄糖濃度和金屬離子對其進(jìn)行發(fā)酵條件優(yōu)化,以期為后期的生產(chǎn)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 材料和方法

1.1 材料

本研究中使用的土壤、蜂巢、花蜜和花粉是從青島附近的果園和養(yǎng)蜂場收集的。將這些樣品在30 ℃的富集培養(yǎng)基[22](300 g/L葡萄糖,10 g/L酵母粉)上富集3~6 d,然后將樣品轉(zhuǎn)移到補(bǔ)充有20 g/L瓊脂的固體富集培養(yǎng)基中。從富集培養(yǎng)基中選出的單菌落在發(fā)酵培養(yǎng)基(200 g/L葡萄糖,10 g/L酵母粉,1 g/L尿素)[23]中30 ℃、180 r/min培養(yǎng)4 d。

用于發(fā)酵優(yōu)化的培養(yǎng)基中含有10 g/L的酵母粉、1 g/L尿素、200~300 g/L葡萄糖和不同的金屬離子溶液(CuSO4·5H2O 2 g/L,MnSO4·4H2O 50 mg/L,CaCl21 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 2 g/L)。將培養(yǎng)基的pH控制在5.5。所選菌株接種到50 mL發(fā)酵優(yōu)化培養(yǎng)基中,在30 ℃下培養(yǎng)24 h,然后以5%的接種量接種至搖瓶發(fā)酵中。將發(fā)酵搖瓶置于30 ℃或34 ℃的振動器中8 d,每24 h取樣一次以測量葡萄糖剩余量。

限制性內(nèi)切酶、DNA聚合酶、連接酶及凝膠提取試劑盒購自Thermo Fisher Scientific公司;ITS1和ITS4引物(ITS1:cgcaatggttacgatcaccag,ITS4:aggatgcggggtcagtttgcac)由擎科生物科技有限公司合成。

1.2 發(fā)酵產(chǎn)品分析方法

赤蘚糖醇最初是使用薄層色譜法鑒定的[24]。將挑選的菌株接入發(fā)酵培養(yǎng)基,在30 ℃、180 r/min下培養(yǎng)4 d,并將發(fā)酵上清液用于薄層色譜分析。薄層色譜展開劑為正丁醇-乙酸-水,體積比為4∶ 1∶ 1。顯影液A為1 g/L高碘酸鈉溶液;顯影液B為80 mL的體積分?jǐn)?shù)為95%乙醇、70 mL的蒸餾水、30 mL的丙酮、1.5 mL的鹽酸中加入0.8 g聯(lián)苯胺溶劑,靜置12 h,以備后用。通過高效液相色譜(HPLC)檢測赤蘚糖醇生產(chǎn)菌株的發(fā)酵液[25-26],以計(jì)算出每種發(fā)酵液產(chǎn)物的含量。HPLC條件:Waters 510泵,410折射率檢測器,U6K手動進(jìn)樣器,810色譜工作站。4.6 mm×250 mm的Waters NH2色譜柱,柱溫35 ℃,流動相為乙腈與水(體積比 80∶ 20),流速為1.5 mL/min。

1.3 ARTP誘變方法

為了獲得生產(chǎn)赤蘚糖醇的突變菌株,利用ARTP生物育種系統(tǒng)(清華大學(xué)和北京四清源生物技術(shù)有限公司)。該系統(tǒng)由氣體供應(yīng)控制子系統(tǒng)、同軸等離子發(fā)生器、不銹鋼制成的樣品板和射頻電源組成。將要突變的菌株在搖瓶中培養(yǎng)至指數(shù)期。將15 μL培養(yǎng)物浸在無菌不銹鋼板上,射頻功率輸入設(shè)為100 W,等離子炬噴嘴出口與樣品板之間的距離為2 mm,空氣流量為10 mL/min,等離子流溫度為25~35 ℃。為了找到最佳的誘變處理時間,將等離子處理時間設(shè)置為0、15、30、60、120和180 s。洗滌細(xì)菌樣品,然后將其涂在準(zhǔn)備好的鋼板上進(jìn)行誘變。誘變后,將鋼板浸入含有1 mL無菌水的EP管中,并以10-2、10-4和10-6的稀釋倍數(shù)涂布鋼板。

2 結(jié)果與討論

2.1 赤蘚糖醇生產(chǎn)菌的篩選

富集培養(yǎng)收集到的樣品,將選出的20株菌落在高濃度葡萄糖發(fā)酵培養(yǎng)基中培養(yǎng)4 d。將發(fā)酵液通過薄層色譜法對赤蘚糖醇進(jìn)行鑒定,發(fā)酵液中有較多的赤蘚糖醇積累。通過HPLC對含量進(jìn)行測定,結(jié)果如圖1所示。由圖1可知:待檢測的4種菌株(C18、C34、C91、C97)中,赤蘚糖醇的質(zhì)量濃度均超過40 g/L;同時還發(fā)現(xiàn),C91與C97菌株的葡萄糖剩余量為0,而C18和C34菌株的殘?zhí)橇亢芨撸?dāng)葡萄糖初始質(zhì)量濃度為300 g/L時,分別剩余106和78 g/L。此外4種菌株中均有副產(chǎn)物甘油的產(chǎn)生,其中C91、C97、C18 以及C34菌株的甘油產(chǎn)量分別為3、3、18和19 g/L,C91與C97菌株的甘油產(chǎn)量明顯低于C18與C34菌株。發(fā)酵液中除了甘油、赤蘚糖醇的積累,并未發(fā)現(xiàn)其他的副產(chǎn)物產(chǎn)生。

圖1 4種篩選菌株的產(chǎn)物濃度和葡萄糖消耗情況Fig.1 Product concentration and glucose consumption of the four screened strains

為了鑒定這些篩選到的菌株,合成了真菌ITS序列的引物ITS1和ITS4。選擇赤蘚糖醇產(chǎn)量較高的菌株C18、C34、C91和C97的基因組作為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測序。最后,僅C91菌株被鑒定出來,將通過PCR擴(kuò)增獲得的產(chǎn)物進(jìn)行序列比對,其基本上與真菌ITS序列的大小匹配,確定其為Moniliellasp.。

2.2 ARTP誘變結(jié)果

將C91菌株在搖瓶中培養(yǎng)至對數(shù)生長期,清洗細(xì)菌并將其涂布在鋼板上。在誘變期間,將離子束照射時間分別設(shè)置為1、2和3 min。誘變完成后,將細(xì)菌溶液稀釋并涂板。從平板菌落中挑選細(xì)菌后,獲得了135個MU1突變體,并根據(jù)誘變時間進(jìn)行了編號和劃線。對上述菌株進(jìn)行發(fā)酵實(shí)驗(yàn),在24孔細(xì)胞培養(yǎng)板中于30 ℃和200 r/min下培養(yǎng)4 d,將發(fā)酵液稀釋100倍并通過HPLC分析。從這135個MU1突變菌株中選出了赤蘚糖醇產(chǎn)量超過15 g/L的22個菌株,赤蘚糖醇、葡萄糖的濃度和糖轉(zhuǎn)化率如圖2所示。由圖2可知:這些突變菌株中赤蘚糖醇的產(chǎn)量大小范圍為20~60 g/L,最高產(chǎn)量可以達(dá)到60 g/L的突變株分別是YE-A12、YE-B18和YE-B29。基于對糖轉(zhuǎn)化率的分析,選擇YE-A3、YE-A27、YE-B10和YE-B22作為后續(xù)的實(shí)驗(yàn)菌株,它們糖轉(zhuǎn)化率大于60%,分別為62.5%、64.3%、64.3%和66.7%。

圖2 ARTP突變菌株的赤蘚糖醇發(fā)酵中赤蘚糖醇的生產(chǎn)情況、糖轉(zhuǎn)化率和葡萄糖的消耗情況Fig.2 Erythritol production,sugar conversion rate and glucose consumption in erythritol fermentation of ARTP mutant strain

2.3 赤蘚糖醇發(fā)酵條件的優(yōu)化結(jié)果

2.3.1 不同碳源對赤蘚糖醇產(chǎn)量的影響

筆者首先優(yōu)化了在不同碳源下的赤蘚糖醇產(chǎn)量(初始200 g/L葡萄糖或甘油)。在YPD培養(yǎng)基中挑選了4種菌株,分別為YE-A3、YE-A27、YE-B10和YE-B22,添加200 g/L的葡萄糖或甘油,發(fā)酵24 h后檢測赤蘚糖醇的合成情況,結(jié)果如圖3所示。由圖3可知:上述4種菌株利用葡萄糖生產(chǎn)赤蘚糖醇的能力明顯優(yōu)于甘油。當(dāng)利用甘油作為碳源時,4種菌株的赤蘚糖醇平均產(chǎn)量為11 g/L,而當(dāng)利用葡萄糖作為碳源時,4種菌株的赤蘚糖醇平均產(chǎn)量高達(dá)30 g/L。同時,當(dāng)利用葡萄糖作為碳源時,最佳菌株YE-B10可以產(chǎn)生40 g/L的赤蘚糖醇,是利用甘油作為碳源的赤蘚糖醇濃度的2倍(利用甘油作為碳源時,YE-B10只能產(chǎn)生20 g/L的赤蘚糖醇)。此外還發(fā)現(xiàn),不論利用哪種碳源,4種菌株赤蘚糖醇的產(chǎn)量從大到小依次為順序?yàn)閅E-B10、YE-A3、YE-B22、YE-A27。當(dāng)利用甘油作為碳源時,4種菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量從大到小依次為20、10、7.5和5 g/L;當(dāng)利用葡萄糖作為碳源時,4種菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量從大到小依次為40、35、25和20 g/L。

圖3 不同碳源對赤蘚糖醇產(chǎn)量的影響Fig.3 Effects of different carbon sources on erythritol production

2.3.2 不同金屬離子對赤蘚糖醇產(chǎn)量的影響

為了研究赤蘚糖醇產(chǎn)量與添加金屬離子類型之間的關(guān)系[27](金屬離子分別為Ca2+、Mn2+、Fe2+和Cu2+,最終質(zhì)量濃度為1 g/L、50 mg/L、2 g/L和2 g/L),在發(fā)酵開始時,將不同的金屬離子溶液加入搖瓶中持續(xù)發(fā)酵8 d,結(jié)果如圖4所示。由圖4可知:添加Ca2+和Mn2+可以顯著增加這4種菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量,添加Ca2+的效果通常高于Mn2+,添加Ca2+時4種菌株的赤蘚糖醇平均產(chǎn)量約為62 g/L;添加Mn2+時4種菌株的赤蘚糖醇平均產(chǎn)量約為50 g/L。與添加Ca2+和Mn2+的效果相比,Cu2+和Fe2+促進(jìn)赤蘚糖醇生成的能力相對不足。當(dāng)添加Ca2+時,YE-A27菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量最高,為73 g/L ;當(dāng)添加Mn2+時,YE-B10菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量最高,為71 g/L ;當(dāng)添加Cu2+時,YE-B22菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量最高,為28 g/L ;當(dāng)添加Fe2+時,YE-A27菌株的赤蘚糖醇產(chǎn)量最高,為32 g/L 。

圖4 不同離子菌株對赤蘚糖醇產(chǎn)量的影響Fig.4 Effects of different ion on erythritol production

2.3.3 不同菌株葡糖糖代謝及產(chǎn)物積累分析

為了分析葡萄糖初始濃度對赤蘚糖醇積累的影響,選擇YE-A27和YE-B10作為生產(chǎn)菌株,初始葡萄糖質(zhì)量濃度分別為200和300 g/L[8](均在培養(yǎng)基中),并提供25 mmol/L Ca2+,考察發(fā)酵液中赤蘚糖醇及甘油積累曲線,結(jié)果如圖5所示。由圖5可知:YE-A27和YE-B10在200 g/L與300 g/L葡萄糖作為初始碳源的情況下分別生長168、168、192和192 h,赤蘚糖醇產(chǎn)量分別為72.9、97.6、66.3和88.5 g/L。經(jīng)過比較發(fā)現(xiàn),無論是YE-A27還是YE-B10菌株,300 g/L葡萄糖作為初始碳源的最大產(chǎn)量普遍高于200 g/L葡萄糖作為初始碳源的最大產(chǎn)量,且YE-A27在300 g/L葡萄糖作為初始碳源的情況下獲得最高赤蘚糖醇產(chǎn)量97.6 g/L。此外,在YE-A27和YE-B10菌株中還發(fā)現(xiàn)了一個現(xiàn)象,除YE-B10在300 g/L葡萄糖作為初始碳源的情況下不明顯外,其余發(fā)酵情況下的甘油濃度先升高后降低,且無論在何種濃度葡萄糖作為初始碳源,YE-B10菌株生成最大甘油量的時間普遍長于YE-A27菌株。因此推測,在發(fā)酵初期葡萄糖濃度較高時,該菌株可以利用葡萄糖產(chǎn)生赤蘚糖醇,也可以合成甘油;葡萄糖耗盡后,產(chǎn)生的甘油可再次用作碳源,從而導(dǎo)致甘油濃度隨之降低。

圖5 不同葡萄糖質(zhì)量濃度下YE-A27和YE-B10的赤蘚糖醇和甘油合成曲線Fig.5 Erythritol and glycerol synthesis curves for YE-A27 and YE-B10 at different glucose concentration

綜上所述,碳源濃度影響會赤蘚糖醇的產(chǎn)生,初始碳源濃度越高越有利于赤蘚糖醇的產(chǎn)生。在300 g/L葡萄糖和25 mmol/L Ca2+培養(yǎng)條件下,菌株YE-A27的赤蘚糖醇產(chǎn)量最高,為97.6 g/L。

2.4 討論

由于市場對赤蘚糖醇的需求不斷增加,赤蘚糖醇的生物合成和產(chǎn)率的優(yōu)化變得越來越重要。盡管在含有葡萄糖或果糖的合成培養(yǎng)基上發(fā)酵赤蘚糖醇的研究較多,但是很少有關(guān)于討論使用不同碳源生產(chǎn)這種多元醇的報道。前期研究時,筆者分別使用葡萄糖和甘油作為碳源來研究赤蘚糖醇的生產(chǎn),發(fā)現(xiàn)甘油作為碳源不適合于工程菌株生產(chǎn)赤蘚糖醇。此外,金屬離子與赤蘚糖醇的產(chǎn)生密切相關(guān),而Cu2+和Mn2+已被證明對Torulasp.產(chǎn)生赤蘚糖醇非常有益[21]。據(jù)推測,Ca2+的添加可能影響工程菌株中與赤蘚糖醇合成有關(guān)的酶的活性,或通過改變細(xì)胞的滲透性來促進(jìn)赤蘚糖醇的產(chǎn)生。

赤蘚糖醇生產(chǎn)的優(yōu)化可以通過控制葡萄糖濃度來實(shí)現(xiàn)。通常,如果微生物能耐受的糖濃度和滲透壓越高時,碳源葡萄糖的初始濃度越高,對赤蘚糖醇的產(chǎn)率和產(chǎn)量越有益。筆者總結(jié)了不同菌株在以葡萄糖或者甘油為底物時赤蘚糖醇的產(chǎn)量(表1),以葡萄糖為底物時比以甘油為底物時的產(chǎn)量普遍偏高。2009年,Jeya等[28]使用葡萄糖作為碳源,在分批飼料培養(yǎng)中對P.tsukubaensisKN75進(jìn)行有氧培養(yǎng),赤蘚糖醇的產(chǎn)量達(dá)到241.0 g/L。Moniliellasp.是一種滲透性酵母,對葡萄糖濃度的合理控制有助于提高赤蘚糖醇的產(chǎn)量。在本研究中,與在含有200 g/L葡萄糖的高滲培養(yǎng)基中相比,Moniliellasp.在含有300 g/L葡萄糖的高滲培養(yǎng)基中能更好地產(chǎn)生赤蘚糖醇。

表1 不同菌株中赤蘚糖醇的產(chǎn)量及產(chǎn)率分析Table 1 Analysis of yield of erythritol in different strains

3 結(jié)論

筆者篩選了在蜂巢中產(chǎn)生赤蘚糖醇的菌株。通過突變育種和發(fā)酵條件的優(yōu)化,赤蘚糖醇的產(chǎn)量提高到了97.6 g/L,且金屬離子的類型對赤蘚糖醇的生產(chǎn)有較大的影響,尤其Ca2+的添加可以提高赤蘚糖醇的產(chǎn)量。同時還發(fā)現(xiàn),碳源也對赤蘚糖醇的生產(chǎn)有影響。當(dāng)使用葡萄糖作為碳源時,高濃度的碳源有利于赤蘚糖醇的生產(chǎn)。添加輔助碳源可能會增加赤蘚糖醇的產(chǎn)量,這將在以后的研究中進(jìn)一步研究。

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