趙福振,都 勇,蔣曉霞,李玉全,周傲白雪,李寒雪,諶升友,羅寶正
棘球蚴病又稱包蟲病,是一種由棘球絳蟲中絳期(metacestode)幼蟲寄生于人或動(dòng)物體內(nèi)而引起的一種危害嚴(yán)重的人獸共患寄生蟲病,在世界范圍內(nèi)嚴(yán)重危害人體健康和畜牧業(yè)發(fā)展[1]。棘球絳蟲目前共5種,包括細(xì)粒棘球絳蟲(Echinococcusgranulosus)、多房棘球絳蟲(Echinococcusmultilocularis)、少節(jié)棘球絳蟲(Echinococcusoligarthra)、福氏棘球絳蟲(Echinococcusvogeli)和石渠棘球絳蟲(Echinococcusshiquicus)。在我國主要存在的是細(xì)粒棘球絳蟲、多房棘球絳蟲和石渠棘球絳蟲。棘球蚴病呈全球性分布,我國主要流行于西藏、四川、青海、寧夏等省(自治區(qū)),其中屬四川省甘孜藏族自治州最為嚴(yán)重[2]。目前,我國人獸之間主要流行的囊性棘球蚴病和泡型棘球蚴病分別是由細(xì)粒棘球絳蟲和多房棘球絳蟲感染引起[3],少有其它棘球絳蟲感染人的病例。
棘球絳蟲的終末宿主要是犬、貓、狐、狼等食肉類動(dòng)物,牛、羊等有蹄類動(dòng)物是常見的中間宿主[3],人類通過誤食絳蟲蟲卵被感染后也可成為中間宿主。棘球蚴中的原頭蚴可在終末宿主小腸內(nèi)發(fā)育成成蟲,并產(chǎn)生蟲卵。蟲卵會(huì)隨宿主糞便排出,影響周邊水源等環(huán)境,中間宿主感染后,蟲卵會(huì)在體內(nèi)發(fā)育成棘球蚴,幾乎可以感染任何器官(尤其是肝臟),導(dǎo)致器官發(fā)生功能障礙,嚴(yán)重的可致死亡。棘球蚴和蟲卵是棘球絳蟲的不同生長階段,遺傳物質(zhì)信息保持不變。本文使用實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),根據(jù)5種棘球絳蟲的線粒體基因序列設(shè)計(jì)引物探針,建立一種對(duì)終末宿主和中間宿主快速、高效、靈敏的檢測方法以進(jìn)行早期診斷,發(fā)現(xiàn)問題及時(shí)進(jìn)行驅(qū)蟲消毒治療等工作,在一定程度上可切斷棘球絳蟲的傳染鏈條,對(duì)棘球蚴病防控環(huán)節(jié)可發(fā)揮重要作用,期望為棘球蚴病的預(yù)防和控制環(huán)節(jié)提供技術(shù)支持。
1.1 樣本 犬糞便樣本84份,為中國疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所的測評(píng)樣本,其中陽性樣品為實(shí)驗(yàn)室人工感染的陽性犬糞樣品,陰性樣品為非棘球蚴病流行區(qū)家犬糞便樣品。患病牛、羊解剖的病變組織樣本及其囊液共18份,由天之泰生物技術(shù)研究院(珠海)有限公司提供,已對(duì)病變組織解剖并觀察確診為陽性;犬弓首蛔蟲(Toxocaracanis)、多頭絳蟲(Taeniamulticeps)、豬帶絳蟲(Taeniasolium)、牛帶絳蟲(Taeniasaginata)基因組DNA各1份,為實(shí)驗(yàn)室保存樣本;陽性質(zhì)粒為含有目的基因的重組質(zhì)粒,由上海旭冠生物科技發(fā)展有限公司合成。
1.2 主要試劑 熒光PCR反應(yīng)試劑使用珠海寶銳生物科技有限公司的“Superstart Premix plus(Probe qPCR)”產(chǎn)品,DNA提取試劑盒使用Omega Bio-Tek公司的“Stool DNA Kit”產(chǎn)品和“Tissue DNA Kit”產(chǎn)品,
1.3 主要儀器設(shè)備 ABI QuantStudio 5實(shí)時(shí)熒光PCR儀,ABI QuantStudio 7實(shí)時(shí)熒光PCR儀,eppendorf 5424R高速冷凍離心機(jī)。
1.4 引物探針設(shè)計(jì) 在NCBI GenBank基因庫中,針對(duì)細(xì)粒棘球絳蟲(MN787561.1)、多房棘球絳蟲(AB777918.1)、少節(jié)棘球絳蟲(AB208545.1)、福氏棘球絳蟲(AB208546.1)和石渠棘球絳蟲(AB159139.1)線粒體COX1基因序列,選擇高度同源區(qū)域(圖1),利用生物分析軟件OLIGO 7.0設(shè)計(jì)一組特異性引物、探針(表1)。引物、探針均由賽默飛公司合成。
圖1 5種絳蟲蚴COX1部分序列比對(duì)及特異性引物結(jié)合位點(diǎn)
表1 棘球絳蟲引物和探針序列
1.5 樣本DNA提取 按照Omega Bio-Tek公司的“Stool DNA Kit”產(chǎn)品和“Tissue DNA Kit”產(chǎn)品的使用說明書提取。糞便樣本使用“Stool DNA Kit”產(chǎn)品提取,病變組織樣本使用“Tissue DNA Kit”產(chǎn)品提取。
1.6 反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序 反應(yīng)體系(25 μL):實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)試劑(2×)12.5 μL,上游引物(10 μmol/L)1 μL,下游引物(10 μmol/L)1 μL,探針(10 μmol/L)0.5 μL,DNA模板5 μL,滅菌超純水補(bǔ)至25 μL。
擴(kuò)增程序:95 ℃ 5 min;(95 ℃ 15 s,55 ℃ 30 s)×40個(gè)循環(huán),55 ℃ 30 s處收集熒光,報(bào)告基團(tuán)為FAM。
1.7 方法建立 使用陽性質(zhì)粒,通過預(yù)實(shí)驗(yàn)對(duì)反應(yīng)條件、反應(yīng)程序等參數(shù)進(jìn)行測試,包括引物探針濃度、擴(kuò)增程序參數(shù)。
1.8 靈敏度試驗(yàn) 將陽性質(zhì)粒以10倍梯度進(jìn)行稀釋,對(duì)經(jīng)梯度稀釋的陽性質(zhì)粒分別使用上述1.6反應(yīng)體系和擴(kuò)增程序進(jìn)行熒光PCR檢測,驗(yàn)證所建立方法的靈敏度。
1.9 特異性試驗(yàn) 以1.1中的犬弓首蛔蟲、多頭絳蟲、豬帶絳蟲、牛帶絳蟲基因組DNA為模板,再取1.8中稀釋的陽性質(zhì)粒為陽性對(duì)照,使用上述1.6中的反應(yīng)體系和反應(yīng)程序進(jìn)行熒光PCR檢測,驗(yàn)證所建立方法的特異性。
1.10 樣本檢測 取1.1中樣本提取的DNA作為模板,再取1.8中稀釋的陽性質(zhì)粒為陽性對(duì)照,按照1.6中的反應(yīng)體系和反應(yīng)程序進(jìn)行熒光PCR檢測,并與中國疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所提供的結(jié)果進(jìn)行對(duì)比,以檢驗(yàn)所建立方法對(duì)樣品的檢測情況。
2.1 樣本信息 動(dòng)物病變組織樣本均為天之泰生物技術(shù)研究院(珠海)有限公司解剖并提供發(fā)生明顯病變的樣本,牛肺臟病變組織獲取囊液的過程見圖2。
圖2 從病變牛肺臟中收集囊液
2.2 方法 結(jié)合引物探針Tm值的大小,在退火階段使用梯度功能分別進(jìn)行53 ℃、55 ℃、57 ℃反應(yīng),測試不同退火溫度。確定退火溫度后,對(duì)引物探針分別使用3種用量進(jìn)行比對(duì)測試(引物探針濃度均為10 μmol/L),根據(jù)擴(kuò)增曲線形狀、Ct值大小和熒光值綜合判定,最終確定在55 ℃退火,上游引物1 μL、下游引物1 μL、探針0.5 μL的條件為最優(yōu),見圖3、圖4。
圖3 不同退火溫度結(jié)果對(duì)比
1:Forward primer 1 μL,Reverse primer 1 μL,Probe 1 μL;2:Forward primer 1 μL,Reverse primer 1 μL,Probe 0.5 μL;3:Forward primer 0.5 μL,Reverse primer 0.5 μL,Probe 0.25 μL
2.3 靈敏度試驗(yàn) 取1.1中的重組質(zhì)粒作為模板,以10倍梯度稀釋作為陽性樣品,取107~100共8個(gè)梯度的陽性質(zhì)粒,共出現(xiàn)8個(gè)擴(kuò)增曲線,檢出的最低濃度梯度是101copies/μL。曲線從左到右依次為107~100,見圖5。
圖5 靈敏度試驗(yàn)結(jié)果
2.4 特異性試驗(yàn) 本研究所建立的方法對(duì)犬弓首蛔蟲、多頭絳蟲、豬帶絳蟲、牛帶絳蟲的檢測均未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,特異性效果良好,見圖6。
N:Negative control; P:positive control
2.5 樣本檢測 根據(jù)所建立的檢測方法對(duì)上述84份犬糞樣本和18份病變組織樣本及其囊液樣本進(jìn)行檢測。結(jié)果顯示,84份犬糞中共有41份樣本為陽性,43份樣本為陰性,其中19號(hào)和30號(hào)樣本熒光PCR結(jié)果均為陰性,與中國疾病預(yù)防控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所結(jié)果不一致,符合率為97.6%;病變組織樣本18份均為陽性,結(jié)果與解剖情況完全一致。以上所有陽性結(jié)果均出現(xiàn)顯著的擴(kuò)增曲線,見圖7、圖8。
N:Negative control;P:Positive control
N:Negative control;P:Positive control
我國棘球蚴病主要流行的地區(qū)基本為牧區(qū)或半牧區(qū),這些地區(qū)環(huán)境復(fù)雜,常有野生動(dòng)物出沒,有開放的溪水等水源,故傳染源分布廣泛。調(diào)查研究表明,犬是人類和畜牧動(dòng)物感染棘球蚴病的重要傳染源,且犬等終末宿主的糞便會(huì)對(duì)環(huán)境造成污染,包括土壤和水源等,使人和畜牧動(dòng)物被感染;家庭屠宰、隨意丟棄患病的動(dòng)物內(nèi)臟又易讓犬、野生動(dòng)物等終末宿主進(jìn)食后感染棘球絳蟲,進(jìn)而使人和畜牧動(dòng)物增加患病風(fēng)險(xiǎn)。因此,對(duì)糞便、動(dòng)物內(nèi)臟、土壤[4]、水源甚至種植的蔬菜水果[5]等進(jìn)行檢測意義重大,可以在消滅傳染源、切斷傳播途徑兩個(gè)方面預(yù)防和控制棘球蚴病。
目前棘球蚴病的檢測手段主要包括影像學(xué)診斷[6]、免疫學(xué)檢測[7]和核酸檢測[8-9]。影像學(xué)在人群篩查方面是主要的臨床診斷方法,有著準(zhǔn)確、直觀等優(yōu)勢,便攜式超聲設(shè)備的成熟也使得影像學(xué)在對(duì)動(dòng)物現(xiàn)場診斷方面實(shí)現(xiàn)了突破。免疫學(xué)以ELISA最為常見,在流行病學(xué)調(diào)查方面,可通過對(duì)血清抗體和糞樣中的抗原進(jìn)行檢測,了解流行情況和推測未來趨勢。核酸檢測技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)不同來源樣本檢測的需求,使用合適的DNA提取試劑盒即可進(jìn)行后續(xù)檢測,相比其它兩類方法還有著高特異性和高靈敏度的特點(diǎn),檢測通量大,在早期診斷中優(yōu)勢明顯。綜上所述,核酸檢測方法更適用于棘球絳蟲的終末宿主感染檢測、中間宿主病變組織檢測和環(huán)境污染監(jiān)測。核酸檢測常見有普通PCR、熒光PCR、LAMP和RPA/RAA等方法,其中以熒光PCR在操作性、檢測時(shí)間、結(jié)果靈敏度、特異性和穩(wěn)定性等方面均有出色的表現(xiàn),在此次的新冠病例的診斷和篩查中被廣泛應(yīng)用。目前國內(nèi)熒光PCR的試劑和儀器產(chǎn)業(yè)鏈完善,檢測成本相比以往大大降低,現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于病毒[10]和寄生蟲病[11]等領(lǐng)域的檢測。
本研究成功建立了一種基于實(shí)時(shí)熒光PCR檢測棘球絳蟲的檢測方法,理論上適用于任何含有棘球絳蟲、蟲卵或幼蟲的樣本。該方法靈敏度高,可以檢測到濃度為10 copies/μL,可適用于檢測犬糞等目的基因含量不高的樣本,在提取時(shí)建議使用專用提取試劑盒,這類試劑盒在提取過程中可以有效去除糞便中的各種污染物和影響PCR的抑制因子,并高效回收DNA,達(dá)到下游實(shí)驗(yàn)的要求,而一般的提取試劑盒無法達(dá)到要求,會(huì)影響后續(xù)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。試驗(yàn)中的犬糞樣本為天之泰生物技術(shù)研究院(珠海)有限公司通過ELISA方法檢測后的剩余樣本,ELISA方法對(duì)犬糞樣本進(jìn)行前處理時(shí),通過在糞樣中加樣品稀釋液后震蕩混懸,最后離心取上清的方式進(jìn)行試驗(yàn),針對(duì)部分離心后不能吸取上清的糞樣,則重復(fù)以上步驟直至獲取上清。本研究方法檢測樣本時(shí),部分樣本出現(xiàn)了Ct值偏高,其中19號(hào)和30號(hào)樣本出現(xiàn)了未檢出的情況,可能與ELISA試驗(yàn)中,部分樣本因復(fù)檢而重復(fù)前處理步驟,導(dǎo)致剩余樣本中蟲卵含量過少,影響目的基因提取有關(guān)。本研究作為通用型的棘球絳蟲檢測方法,無法鑒別蟲種,在今后的研究可繼續(xù)完善,例如可通過多重?zé)晒釶CR或普通PCR測序?qū)崿F(xiàn)。
利益沖突:無
引用本文格式:趙福振,都勇,蔣曉霞,等.實(shí)時(shí)熒光PCR檢測棘球絳蟲方法的建立及應(yīng)用[J].中國人獸共患病學(xué)報(bào),2022,38(1):29-34.DOI:10.3969/j.issn.1002-2694.2021.00.179