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NAS在色譜—質(zhì)譜聯(lián)用儀數(shù)據(jù)管理中的應(yīng)用

2022-09-01 10:11:16王子元王曉虎聞曉東鄭玲童
實(shí)驗(yàn)室研究與探索 2022年5期
關(guān)鍵詞:文件夾數(shù)據(jù)管理硬盤

王子元,王曉虎,聞曉東,,c,鄭玲童

(中國(guó)藥科大學(xué)a.實(shí)驗(yàn)室與設(shè)備管理處校公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái);b.中藥學(xué)院;c.天然藥物活性組分與藥效國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南京 211198)

0 引言

近年來(lái),隨著生命科學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展和國(guó)家對(duì)高校科研投資的重視,公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái)對(duì)科研的支撐作用逐步體現(xiàn),而大型精密儀器作為平臺(tái)提供服務(wù)的基礎(chǔ)設(shè)備,在科學(xué)研究和人才培養(yǎng)中發(fā)揮出重要作用。其中,色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀以其分辨率好,靈敏度高,線性范圍寬等特點(diǎn),廣泛應(yīng)用于制藥、食品、化工和環(huán)境等領(lǐng)域,已在很多高校實(shí)驗(yàn)室中深入普及[1-4]。然而,儀器的高度精密意味著其數(shù)據(jù)量的龐大,這就使得數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和備份壓力倍增。公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái)由于儀器數(shù)量多、測(cè)樣量大、測(cè)樣用戶多,提高數(shù)據(jù)管理能力也有助于提高儀器使用率和開放率,更利于平臺(tái)提供優(yōu)質(zhì)的科研服務(wù)。

目前,大多實(shí)驗(yàn)室依靠傳統(tǒng)光盤、硬盤等介質(zhì)進(jìn)行數(shù)據(jù)存儲(chǔ),在存儲(chǔ)容量、安全性和傳輸速度等受限。因此,引入一種大容量、安全、快速地管理液質(zhì)數(shù)據(jù)的介質(zhì),顯得尤為必要。網(wǎng)絡(luò)附件存儲(chǔ)(Network Attached Storage,NAS)作為一種新型的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)模式,基于IP網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)服務(wù)器與存儲(chǔ)陣列互聯(lián),具有更大的存儲(chǔ)空間,更強(qiáng)的數(shù)據(jù)吞吐量和更快響應(yīng)速度,易于實(shí)現(xiàn)異構(gòu)平臺(tái)間的共享和性能擴(kuò)展,能夠?qū)Υ鎯?chǔ)的數(shù)據(jù)實(shí)施集中管理[5]。

為此,提出一種基于NAS 的色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀數(shù)據(jù)管理解決方案,通過詳細(xì)案例說(shuō)明,探討NAS 數(shù)據(jù)管理的優(yōu)勢(shì)和不足,以供其他儀器管理者參考。

1 NAS數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)介紹

與傳統(tǒng)的直連存儲(chǔ)系統(tǒng)(DAS)相比,NAS 是與網(wǎng)絡(luò)連接的一種數(shù)據(jù)存儲(chǔ)系統(tǒng),它強(qiáng)調(diào)以數(shù)據(jù)為核心,采用瘦服務(wù)器技術(shù),通過網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行數(shù)據(jù)的集中存儲(chǔ)和管理,網(wǎng)絡(luò)上的任何服務(wù)器和客戶端都可以訪問這些數(shù)據(jù)資源[6-8]。NAS的基本原理是通過以太網(wǎng)代替主板中的導(dǎo)線,加載網(wǎng)絡(luò)文件到本地目錄,使用戶在訪問網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)時(shí)像訪問本地?cái)?shù)據(jù)一樣快捷方便[9]。NAS 存儲(chǔ)系統(tǒng)由存儲(chǔ)設(shè)備和服務(wù)器組成,典型的NAS設(shè)備看起來(lái)與磁盤陣列柜相似,但有實(shí)質(zhì)差別,其在磁盤陣列的基礎(chǔ)上增加了獨(dú)立的平臺(tái)文件操作系統(tǒng),方便進(jìn)行文件的傳輸和存儲(chǔ)備份[10]。綜上,NAS 以其訪問快速、存儲(chǔ)環(huán)境靈活、易于管理和硬件成本較低等特點(diǎn),可提高公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái)液質(zhì)數(shù)據(jù)管理效率。

2 基于NAS的液質(zhì)數(shù)據(jù)管理應(yīng)用案例

2.1 NAS系統(tǒng)架構(gòu)

為滿足公共實(shí)驗(yàn)平臺(tái)對(duì)液質(zhì)數(shù)據(jù)安全傳輸和存儲(chǔ)的需求,對(duì)比不同方案后,平臺(tái)選擇群暉DS1821 +搭建了NAS系統(tǒng),該系統(tǒng)性能穩(wěn)定,具備成熟的軟件體系,易上手好操作。群暉DS1821 +是一款強(qiáng)大的8 盤位網(wǎng)絡(luò)連接存儲(chǔ)解決方案,搭載AMD RyzenTMV1500B 4 核2.2 GHz處理器,具有高達(dá)1 134 584 K的隨機(jī)讀取IOPS(每秒讀寫次數(shù))和每秒2 312 MB的連續(xù)寫入速度,最多可創(chuàng)建2 048 個(gè)本地用戶帳戶和512 個(gè)共享文件夾。磁盤陣列選擇4 塊4TB 的西部數(shù)據(jù)WD4003VRYZ企業(yè)級(jí)硬盤,它支持7 200 r/min 高轉(zhuǎn)速,采用RAID1 存儲(chǔ)模式,2 塊硬盤用來(lái)存儲(chǔ)數(shù)據(jù),另外兩塊硬盤用來(lái)數(shù)據(jù)備份,數(shù)據(jù)安全性更高,當(dāng)一個(gè)磁盤故障時(shí),系統(tǒng)可自動(dòng)切到鏡像磁盤上,提高存儲(chǔ)效率。剩余盤位,可根據(jù)后續(xù)存儲(chǔ)空間情況,即時(shí)添加硬盤。

此外,為提高儀器使用效率,減小儀器電腦負(fù)荷,我們單獨(dú)配備了1 臺(tái)工作站方便用戶進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,并配備了高性能的千兆網(wǎng)絡(luò)交換機(jī)、千兆六類網(wǎng)線和千兆路由器,將NAS、工作站、多臺(tái)儀器電腦、路由器分別接入交換機(jī),建立起一個(gè)高性能的傳輸存儲(chǔ)局域網(wǎng)絡(luò)。最后預(yù)留出多個(gè)交換機(jī)網(wǎng)絡(luò)接口,方便管理員和用戶自由選擇無(wú)線或有線方式連接進(jìn)局域網(wǎng),進(jìn)行存儲(chǔ)、拷貝及分析等數(shù)據(jù)管理。其中,無(wú)線傳輸速度較慢,但不受設(shè)備限制,手機(jī)等移動(dòng)設(shè)備也可以方便登入,更適用于管理員進(jìn)行賬號(hào)和文件夾的分配設(shè)置和系統(tǒng)管理;有線連接傳輸速度快,適用于用戶將數(shù)據(jù)拷貝至個(gè)人電腦。整體的NAS系統(tǒng)硬件架構(gòu)見圖1。

圖1 NAS系統(tǒng)硬件架構(gòu)

2.2 NAS系統(tǒng)多臺(tái)液質(zhì)設(shè)備應(yīng)用于平臺(tái)的方案

2.2.1 NAS系統(tǒng)訪問方式

為便于管理,平臺(tái)暫不開放廣域網(wǎng)網(wǎng)絡(luò)環(huán)境訪問NAS,用戶僅可通過局域網(wǎng)訪問NAS。連接局域網(wǎng)后,訪問方式主要有2 種(見圖2):①將NAS資料庫(kù)通過Synology Assistant 在“此電腦”中映射為磁盤,像訪問本地?cái)?shù)據(jù)一樣直接訪問。這種方式連接速度更快,但只能進(jìn)行數(shù)據(jù)訪問、上傳和下載,不能進(jìn)行賬號(hào)設(shè)置。②使用瀏覽器,在地址欄輸入預(yù)先設(shè)置好的NAS 服務(wù)器名稱或IP地址,再接著輸入“:5000”,即可登錄訪問。這種網(wǎng)頁(yè)方式不受操作系統(tǒng)的限制,可以進(jìn)行賬號(hào)管理,且界面友好,但因?yàn)椴荒苓M(jìn)行批量文件夾上傳,通常不建議用戶在拷貝數(shù)據(jù)時(shí)使用。

圖2 NAS系統(tǒng)訪問方式

2.2.2 共享文件夾和用戶賬號(hào)的分配和權(quán)限管理

因平臺(tái)儀器對(duì)校內(nèi)課題組及校外單位開放,為了保證用戶數(shù)據(jù)的保密性和安全性,為每個(gè)課題組建立其專用的共享文件夾和用戶賬號(hào),并設(shè)定訪問權(quán)限。其中,每個(gè)共享文件夾具有固定存儲(chǔ)配額,數(shù)據(jù)存滿后需要請(qǐng)管理員清除無(wú)用數(shù)據(jù)或者申請(qǐng)管理員增加存儲(chǔ)配額,這有助于進(jìn)行數(shù)據(jù)的管理和更新,避免大量老舊數(shù)據(jù)占用儲(chǔ)存空間。此外,本課題組賬號(hào)只對(duì)自己課題組的文件夾有讀寫權(quán)限,對(duì)于人數(shù)眾多,測(cè)樣量大的課題組,可以根據(jù)用戶需求增設(shè)多個(gè)子文件夾,每位同學(xué)個(gè)人賬號(hào)只有讀寫自己子文件夾權(quán)限,而課題組負(fù)責(zé)人賬號(hào)可以訪問整個(gè)文件夾??偟膩?lái)說(shuō),用戶權(quán)限有禁止訪問、只讀和可讀寫3 種模式,可根據(jù)實(shí)際需要進(jìn)行個(gè)性化設(shè)置(見圖3)。

圖3 用戶權(quán)限設(shè)置界面

2.2.3 用戶操作及數(shù)據(jù)管理

平臺(tái)所有液質(zhì)聯(lián)用儀均接入NAS,因此用戶在平臺(tái)任何一臺(tái)儀器上的測(cè)試數(shù)據(jù)均可上傳至自身賬戶對(duì)應(yīng)的共享文件夾中。測(cè)樣完成后,用戶可在儀器電腦中按上述方式訪問NAS登錄自身賬號(hào)上傳數(shù)據(jù),再用個(gè)人電腦連接預(yù)留端口進(jìn)行數(shù)據(jù)下載,也可將數(shù)據(jù)下載到平臺(tái)工作站進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,工作站配備基于GC/MS 和LC/MS 系統(tǒng)的MassHunter、LabSolutions等多種色質(zhì)譜定性、定量分析軟件,可完成不同品牌、型號(hào)儀器的數(shù)據(jù)分析工作。以最終實(shí)現(xiàn)“多個(gè)用戶—不同儀器—多類數(shù)據(jù)”的高效傳輸、存儲(chǔ)及分析。

2.3 應(yīng)用成效

啟用NAS系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)管理后,用戶在拷貝數(shù)據(jù)時(shí)無(wú)需攜帶個(gè)人硬盤,測(cè)樣完成后直接將數(shù)據(jù)上傳至NAS,傳輸不限制文件大小,傳輸速度快,減少等待時(shí)間,提高儀器使用效率,同時(shí)也防止個(gè)人硬盤中可能存在的病毒對(duì)儀器電腦帶來(lái)的安全隱患。若在多臺(tái)儀器上同時(shí)測(cè)樣,也可以分別上傳后,統(tǒng)一下載處理,數(shù)據(jù)信息分類明確,一目了然。此外,所有的測(cè)樣數(shù)據(jù)都存放在NAS上,不占用本地儀器電腦內(nèi)存,也方便管理員進(jìn)行數(shù)據(jù)的管理和過期數(shù)據(jù)的刪除。查驗(yàn)數(shù)據(jù)時(shí),管理員不再需要對(duì)每臺(tái)儀器電腦分別核查,登錄NAS即可查看各個(gè)課題組在平臺(tái)所有儀器上的測(cè)樣數(shù)據(jù),極大提高數(shù)據(jù)管理的工作效率。

3 NAS數(shù)據(jù)管理的優(yōu)點(diǎn)

經(jīng)實(shí)際應(yīng)用,我們認(rèn)為相比于傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)方式,基于NAS的數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)具有以下優(yōu)點(diǎn):

(1)便捷性。通過網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸,不損失傳輸速率的前提下,不再需要用戶攜帶硬盤、光盤等移動(dòng)存儲(chǔ)設(shè)備,不受時(shí)間和空間的限制,只要在局域網(wǎng)內(nèi)就能訪問,后續(xù)如果有需要,也可以開放外網(wǎng)訪問,靈活度更高,實(shí)現(xiàn)由多端向單端管理轉(zhuǎn)變,極大提高了管理效率。

(2)安全性。數(shù)據(jù)存放于NAS中,每個(gè)用戶只可訪問自己的空間,并根據(jù)自身需求進(jìn)行數(shù)據(jù)存取和共享。此外,管理員還可設(shè)定連接到特定網(wǎng)絡(luò)端口的白名單和黑名單,對(duì)網(wǎng)絡(luò)中常見的攻擊模式進(jìn)行預(yù)防,若一個(gè)IP 地址非法登錄多次,即進(jìn)入黑名單被禁止登錄,這也保障了NAS中數(shù)據(jù)的安全[11]。

(3)高效性。NAS系統(tǒng)是專用存儲(chǔ),不和其他應(yīng)用競(jìng)爭(zhēng)資源,減少系統(tǒng)意外故障的可能[12]。它的安裝過程快,系統(tǒng)簡(jiǎn)潔好操作,易于推廣,存儲(chǔ)容量也可以根據(jù)用戶需求進(jìn)行分配和擴(kuò)增。此外,平臺(tái)配備專業(yè)工作站方便用戶進(jìn)行后期數(shù)據(jù)處理,減小儀器電腦的使用壓力,使在線的數(shù)據(jù)采集和離線的數(shù)據(jù)處理分開進(jìn)行,提高儀器使用效率。

(4)低成本。NAS使用低價(jià)格的以太網(wǎng)環(huán)境,任何連接到網(wǎng)絡(luò)的設(shè)備都可以訪問NAS,與其他數(shù)據(jù)管理解決方案相比,NAS 的整體成本較低。而且其設(shè)備高度集成,主要由服務(wù)器和磁盤陣列組成,對(duì)硬件的要求不高[13]。在應(yīng)用和維護(hù)上,管理員和用戶使用同樣的軟件系統(tǒng),對(duì)操作人員培訓(xùn)成本和系統(tǒng)維護(hù)成本基本為0。

(5)擴(kuò)展性。NAS系統(tǒng)即插即用,調(diào)試或關(guān)機(jī)不影響整個(gè)系統(tǒng)中其他設(shè)備的正常使用,易于實(shí)現(xiàn)擴(kuò)展[14]。①由于多設(shè)備可以同時(shí)訪問同一個(gè)NAS,因此若儀器數(shù)量增加,只需增加交換機(jī)端口數(shù)量即可;②隨著數(shù)據(jù)量的增大,現(xiàn)有內(nèi)存無(wú)法滿足需求時(shí),只需在NAS 上增加硬盤,簡(jiǎn)單設(shè)置后即可獲得更大存儲(chǔ)空間,節(jié)約預(yù)算成本。

4 NAS數(shù)據(jù)管理的不足

NAS系統(tǒng)對(duì)文件系統(tǒng)的管理進(jìn)行了優(yōu)化,提供文件級(jí)訪問,它使用獨(dú)立的平臺(tái)文件系統(tǒng)允許不同設(shè)備訪問同一存儲(chǔ)資源,這也在一定程度上影響其性能[15]。此外,NAS數(shù)據(jù)管理解決方案通常不適用于傳輸大量、離散的塊級(jí)數(shù)據(jù)[16]。在實(shí)際應(yīng)用中,對(duì)于用戶來(lái)說(shuō),從傳統(tǒng)數(shù)據(jù)拷貝方式轉(zhuǎn)換成NAS數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),需要培訓(xùn)并給予其一定的適應(yīng)時(shí)間,每一次使用結(jié)束后需要將自己的賬號(hào)退出登錄,否則下一個(gè)用戶將無(wú)法使用。在文件夾和用戶賬號(hào)的數(shù)量上也有一定的上限限制,需要管理員定期進(jìn)行老舊賬號(hào)的清除管理。

5 結(jié)語(yǔ)

構(gòu)建、發(fā)展及應(yīng)用全新的體系架構(gòu),用于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的獲取、傳輸、存儲(chǔ)和分析,是科研儀器共享時(shí)代,大儀管理的關(guān)鍵科學(xué)問題。如何在新技術(shù)浪潮下更新數(shù)據(jù)管理模式,提高工作效率和服務(wù)質(zhì)量,也成為平臺(tái)發(fā)展所需攻克的難關(guān)之一。根據(jù)平臺(tái)運(yùn)行管理特點(diǎn),提出一種基于NAS的色譜質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)管理解決方案,該方案配置便捷、快速,解決了傳統(tǒng)數(shù)據(jù)管理模式存儲(chǔ)空間不足、安全性差、共享性差、無(wú)法集中管理、管理效率低等問題,在可接受的預(yù)算范圍內(nèi)實(shí)現(xiàn)了多臺(tái)儀器數(shù)據(jù)的數(shù)字化、網(wǎng)絡(luò)化統(tǒng)一管理。但NAS 系統(tǒng)功能強(qiáng)大,本方案只利用了其小部分功能,在今后的實(shí)踐中,我們期望能探索出NAS更大的應(yīng)用價(jià)值,在現(xiàn)有硬件條件下實(shí)現(xiàn)更多功能(如構(gòu)建多用戶協(xié)作環(huán)境、多層次數(shù)據(jù)保護(hù)體系等)。總之,該系統(tǒng)提高了數(shù)據(jù)傳輸和存儲(chǔ)效率,改變了傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)管理模式,對(duì)平臺(tái)管理發(fā)揮積極作用,具有一定的推廣價(jià)值。

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