姚佳明,何悅,郝歡歡,黃心如,張敬,徐彬
(南京農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院,江蘇 南京 210095)
光是植物生長發(fā)育最重要的調(diào)控因子之一。植物長期處于黑暗條件下,會(huì)呈現(xiàn)莖細(xì)長柔弱、子葉不展開、葉片細(xì)小、葉片黃化等特征;而在正常光下,植物則呈現(xiàn)出莖粗壯、子葉展開和葉片發(fā)達(dá)等表型,這種受光強(qiáng)、光質(zhì)或光周期調(diào)節(jié)的生長發(fā)育過程稱為植物的光形態(tài)建成[1-2]。光敏色素是一種可溶性色素蛋白,以吸收紅光的非活性形式(red-absorbing phytochrome,Pr)和吸收遠(yuǎn)紅光的活性形式(far red-absorbing phytochrome,Pfr)存在,具有生理活性的Pfr能夠快速地從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核,通過結(jié)合光敏色素互作因子(phytochrome-interacting factors,PIFs),進(jìn)而調(diào)控光響應(yīng)基因的轉(zhuǎn)錄水平[3-4]。PIFs屬于bHLH(basic helix-loop-helix)轉(zhuǎn)錄因子家族的一個(gè)亞家族,是光信號(hào)通路關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子[5],通過直接調(diào)控其下游基因的轉(zhuǎn)錄來抑制種子萌發(fā)、促進(jìn)幼苗光形態(tài)建成和提高植物耐蔭性等[6]。PIFs中的bHLH功能域由約15個(gè)氨基酸組成的堿性區(qū)(basic region)和約60個(gè)氨基酸組成的螺旋-環(huán)-螺旋(helix-loop-helix)區(qū)組成,其中的堿性區(qū)能夠與順式作用元件G-box(CACGTG)特異性地結(jié)合,調(diào)控靶基因表達(dá)[7-15]。
近年來,越來越多的研究證實(shí)PIF家族成員不僅是光信號(hào)調(diào)節(jié)途徑的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,還常作為細(xì)胞信號(hào)樞紐,能夠整合多種信號(hào),成為其他信號(hào)通路的關(guān)鍵組成部分。例如,PIF在光信號(hào)和植物激素信號(hào)傳導(dǎo)之間起到重要的橋梁作用[16]。PIF家族成員之間的功能也存在差異[17],例如,擬南芥(Arabidopsis thaliana)中有8個(gè)PIFs成員[18],包括PIF1(PIL5,At2G20180),PIF3(At1G09530),PIF4(At2G43010),PIF5(PIL6,At3G59060),PIF6(PIL2,At3G62090),PIF7(At5G61270),PIF8(At4G00050)和PIL1(At2G46970)。PIF1在黑暗條件下負(fù)調(diào)控葉綠素的合成和種子萌發(fā),而光誘導(dǎo)PIF1的降解減緩了這一負(fù)調(diào)控作用,進(jìn)而促進(jìn)擬南芥光形態(tài)建成[12];將擬南芥pif4缺失突變體幼苗和野生型擬南芥幼苗從22℃轉(zhuǎn)移到28℃時(shí)發(fā)現(xiàn),pif4突變體幼苗明顯缺乏下胚軸和上胚軸伸長以及葉片下垂的能力。此外,這種溫度變化還會(huì)引起PIF4轉(zhuǎn)錄水平快速升高[19-20];在光照條件下,PIF3能通過誘導(dǎo)光敏色素B的降解來降低植物對(duì)光的響應(yīng)從而調(diào)節(jié)擬南芥下胚軸的伸長[21]。小麥(Triticum aestivum)TaPIF3突變體和過表達(dá)株系的表型分析也表明,TaPIF3在莖的伸長和穗的生長調(diào)控中都發(fā)揮了作用[22]。PIFs不僅調(diào)控植物的光形態(tài)建成,還參與植物對(duì)逆境的響應(yīng)。如Yong等[23]研究結(jié)果表明過量表達(dá)ZmPIF3在不影響玉米(Zea mays)產(chǎn)量的同時(shí),能夠提高玉米的耐旱性。過量表達(dá)水稻(Oryza sativa)OsPIL1基因不僅提高了轉(zhuǎn)基因植物的耐旱性,還促進(jìn)了細(xì)胞伸長生長[24]。Zhang等[25]研究發(fā)現(xiàn)擬南芥光敏色素互作因子AtPIF5具有正調(diào)控黑暗誘導(dǎo)葉片衰老和葉綠素降解的功能。另外,擬南芥AtPIF5也能夠調(diào)控乙烯合成和植物激素信號(hào)傳導(dǎo)[26]。基于以上研究結(jié)果,光敏色素互作因子(PIFs)在植物光形態(tài)建成、耐逆調(diào)控和激素信號(hào)傳導(dǎo)中發(fā)揮著重要作用,因此,克隆多年生黑麥草(Lolium perenne)PIFs基因,并分析其轉(zhuǎn)錄調(diào)控模式,可為黑麥草的耐逆(耐蔭、旱和鹽等)生物技術(shù)育種提供重要的候選基因。
多年生黑麥草為禾本科早熟禾亞科黑麥草屬植物,是重要的冷季型牧草和草坪草。常作為草坪建植的先鋒草種,廣泛應(yīng)用于我國的南北過渡帶及以北溫帶地區(qū)。目前,對(duì)于多年生黑麥草PIF基因家族成員的克隆、表達(dá)模式分析及功能的研究尚未見報(bào)道。本研究從多年生黑麥草中克隆得到一個(gè)光敏色素因子(PIFs)編碼基因,命名為LpPIL5,并分析了其基因組結(jié)構(gòu),啟動(dòng)子順式作用元件,亞細(xì)胞定位和不同組織下的表達(dá)特性以及在不同非生物脅迫下的表達(dá)規(guī)律。研究結(jié)果可為多年生黑麥草LpPIFs轉(zhuǎn)錄因子的功能分析奠定基礎(chǔ),也可為黑麥草耐逆育種提供基因資源。
試驗(yàn)于2020年6月-2021年6月在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院草類生理生化與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行。
以多年生黑麥草(品種為Buena Vista,購買于美國Syngenta公司)為試驗(yàn)材料,在人工氣候室中培養(yǎng),基質(zhì)為蛭石、珍珠巖和泥炭土(體積比為1∶3∶9)。氣候室生長條件設(shè)定為:25/20℃(白天/晚上),光照14 h,濕度為70%,光合有效輻射為750 μmol·m-2·s-1。
RNA提取試劑盒、DNA瓊脂糖凝膠回收試劑盒及質(zhì)粒提取試劑盒購于OMEGA BIO-TEK公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒(MonScriptTMRTⅢSuper Mix with dsDNase)及熒光定量試劑盒(MonAmpTMChemoHS qPCR Mix)購于Monad公司;DNA聚合酶(Phanta?Max Super-Fidelity DNA Polymerase)購于諾維贊生物科技股份有限公司。
以擬南芥AtPIF5基因的bHLH功能域序列為誘餌,在多年生黑麥草基因組數(shù)據(jù)庫(SRA號(hào):PRJNA335527)進(jìn)行檢索(basic local alignment search tool,BLAST),篩選出LpPIL5基因,利用BioXM預(yù)測(cè)LpPIL5基因編碼區(qū)序列,用Primer Premier 5設(shè)計(jì)基因全長引物(表1),以多年生黑麥草葉片cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增體系為30 μL,包括:2×Phanta Max buffer 15 μL,dNTP Mix(10 mmol·L-1)0.6 μL,LpPIL5-cDNAF(10 μmol·L-1)1.2 μL,LpPIL5-cDNAR(10 μmol·L-1)1.2 μL,Phanta Max Super-Fidelity DNA Polymerase 0.6 μL,cDNA模版1 μL,ddH2O 10.4 μL。擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性3 min,95℃變性15 s,60℃退火15 s,72℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán)。將PCR產(chǎn)物切膠純化,經(jīng)BamHI和HindⅢ雙酶切后連接至入門載體pEND-Linker,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性單克隆并測(cè)序。
表1 試驗(yàn)所用引物Table 1 Primers used in the study
從TAIR和NCBI數(shù)據(jù)庫中獲取擬南芥、水稻、玉米等物種的PIF基因及其編碼的蛋白質(zhì)序列,利用MEGA 6.0軟件中的ClustalW程序?qū)pPIL5與擬南芥、水稻和玉米等物種的PIF同源蛋白進(jìn)行比對(duì),利用Neighborjoining程序構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。利用Protparam分析LpPIL5蛋白的分子式,利用NetPhos預(yù)測(cè)該蛋白可能的磷酸化位點(diǎn),用SOMPA和SWISS-MODEL分別模擬LpPIL5的二維和三維結(jié)構(gòu),用Plant Care網(wǎng)站預(yù)測(cè)LpPIL5啟動(dòng)子上游1500 bp內(nèi)所包含的順式作用元件。
晝夜節(jié)律設(shè)定為白天和黑暗各12 h,間隔4 h取樣,試驗(yàn)周期為48 h(圖1)。固定時(shí)間點(diǎn)取樣,提取mRNA,采用1%瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)(NanoDrop 2000,Thermo,美國)檢測(cè)mRNA質(zhì)量,將無明顯降解的mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。用羅氏熒光定量系統(tǒng)(Roche Light Cycler?480Ⅱ)并結(jié)合2-ΔΔCT[27]計(jì)算方法檢測(cè)LpPIL5基因的相對(duì)表達(dá)量,LpeLF4A[28]為內(nèi)參基因(GenBank登錄號(hào)為:G0924770)。
圖1 取樣時(shí)間Fig.1 Sampling time
選取長勢(shì)一致的種子苗(萌發(fā)后3周)進(jìn)行水培處理,培養(yǎng)液為Hoagland營養(yǎng)液,1周后進(jìn)行15%聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)6000、100 mmol·L-1NaCl、100 μmol·L-1CdCl2、50 μmol·L-1脫 落 酸(abscisic acid,ABA)、25 μmol·L-16-芐氨基嘌呤[N-(phenylmethyl)-9H-purin-6-amine,6-BA]和高溫(38℃)處理,于0、0.5、2、6、12和24 h后剪取葉片和根,-80℃條件下凍存。相同時(shí)間點(diǎn)剪取未進(jìn)行逆境和激素處理的葉片和根,作為平行對(duì)照。另外,選取多年生黑麥草的伸展葉、成熟葉、老葉、根、莖和根冠部位,用于分析目標(biāo)基因在不同組織、器官中的表達(dá)模式。
將LpPIL5經(jīng)BamHI和HindⅢ雙酶切連接入門載體pEND-linker,然后用PvuⅠ將構(gòu)建好的pEND-LpPIL5線性化,純化后將其與表達(dá)載體(p2GWF7.0)進(jìn)行LR重組反應(yīng),構(gòu)建p2GWF7.0-LpPIL5亞細(xì)胞定位載體。
參照Yu等[29]的方法提取多年生黑麥草原生質(zhì)體,其中酶解液、W5溶液和MMg溶液配方見表2。
表2 提取并轉(zhuǎn)化原生質(zhì)體所用溶液Table 2 The solution used to extract and transform protoplasts
取原生質(zhì)體溶液200 μL(約40000個(gè)原生質(zhì)體),質(zhì)粒p2GWF7.0-LpPIL5(1000 ng·μL-1)20 μL,PEG 4000溶液(見表2)220 μL加入2 mL無菌離心管中混勻。室溫孵育5 min,加入800 μL的W5溶液,混勻后200 r·min-1離心2 min,去除上清液并加入400 μL的W5溶液重懸原生質(zhì)體。室溫下暗孵育12 h后,采用激光共聚焦顯微鏡(Zeiss LSM780 Exciter,德國)觀察目標(biāo)蛋白的亞細(xì)胞定位情況。
采用SPSS 23.0對(duì)基因定量數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和差異顯著性分析(P<0.05),數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤差的形式表示。利用SigmaPlot 12.5、MEGA 6.0和Excel 2013軟件作圖。
經(jīng)PCR反應(yīng),從多年生黑麥草中擴(kuò)增出LpPIL5基因序列(圖2,GenBank登錄號(hào)為MZ188927),其具有5個(gè)外顯子,4個(gè)內(nèi)含子,編碼區(qū)長1410 bp(圖3a)。NCBI數(shù)據(jù)庫檢索得到LpPIL5的直系同源蛋白,分別為大麥(Hordeum vulgare)HvPIL1、二穗短柄草(Brachypodium distachyon)BdPIF1、小米(Setaria italica)SiPIL1、柳枝稷(Panicum virgatum)PvPIL13、高粱(Sorghum bicolor)SbPIF1、玉米ZmPIL5和水稻OsPIL13,這些蛋白都具有保守的bHLH結(jié)構(gòu)域(圖3b)。進(jìn)化結(jié)果表明,LpPIL5與單子葉植物的同源蛋白聚為一類,且與大麥HvPIL1的親緣關(guān)系最近(圖4)。
圖2 部分樣品的mRNA(a)及LpPIL5基因(b)全長克隆的電泳圖Fig.2 Electrophoretogram of some samples’mRNA(a)and full length of LpPIL5 gene(b)
圖3 LpPIL5的基因結(jié)構(gòu)(a)和氨基酸序列(b)分析Fig.3 Gene structure(a)and amino acid sequence(b)analysis of LpPIL5
圖4 LpPIL5及其同源蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析Fig.4 Phylogenetic analysis of LpPIL5 and its homologous proteins
LpPIL5編碼蛋白質(zhì)的分子式為C2150H3368N652O686S28,原子總數(shù)為6884,相對(duì)分子質(zhì)量為50.22 kDa,等電點(diǎn)為6.68;正電荷殘基(精氨酸+賴氨酸)為43個(gè),負(fù)電荷殘基(天冬氨酸+谷氨酸)為46個(gè);不穩(wěn)定系數(shù)為61.84,屬不穩(wěn)定蛋白;平均親水性系數(shù)為-0.657。且其結(jié)構(gòu)中含有49個(gè)磷酸化位點(diǎn)(閾值>0.5),其中28個(gè)絲氨酸、19個(gè)蘇氨酸及2個(gè)酪氨酸。
LpPIL5蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)如圖5a所示。其中α-螺旋由137個(gè)氨基酸殘基組成,占29.15%;延伸鏈由38個(gè)氨基酸殘基組成,占8.09%;β-轉(zhuǎn)角由14個(gè)氨基酸殘基組成,占2.98%;無規(guī)則卷曲由281個(gè)氨基酸殘基組成,占59.79%。LpPIL5蛋白的三維立體結(jié)構(gòu)如圖5b所示,該蛋白具有典型的bHLH轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu),且位于該蛋白兩端的α-螺旋可以形成拉鏈結(jié)構(gòu),嵌入到DNA雙鏈的大溝里,而在這兩個(gè)α-螺旋末端均富含堿性氨基酸,以識(shí)別DNA序列。
圖5 LpPIL5蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和空間三維結(jié)構(gòu)Fig.5 Secondary structure and three-dimensional structure of LpPIL5
將p2GW7.0-LpPIL5-GFP融合表達(dá)載體瞬時(shí)轉(zhuǎn)化多年生黑麥草原生質(zhì)體,用激光共聚焦顯微鏡觀察綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)信號(hào)的定位。結(jié)果表明GFP信號(hào)與4′,6-二脒基-2-苯基吲哚(4′,6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)信號(hào)重疊(圖6),說明LpPIL5定位于細(xì)胞核。
圖6 LpPIL5蛋白在多年生黑麥草原生質(zhì)體中的亞細(xì)胞定位Fig.6 The subcellular localization of LpPIL5 protein in protoplasts of perennial ryegrass
LpPIL5啟動(dòng)子區(qū)含有響應(yīng)逆境、植物激素和光響應(yīng)相關(guān)的順式作用元件,如與脫落酸有關(guān)的順式調(diào)控元件ABRE、干旱誘導(dǎo)相關(guān)的MYB結(jié)合位點(diǎn)MBS、啟動(dòng)子和增強(qiáng)子區(qū)域的共同順式作用元件CAAT-box、調(diào)控啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的基本元件TATA-box等。另外,啟動(dòng)子區(qū)域也含有如G-box、I-box、BoxⅡ、TCCC-motif等多個(gè)光響應(yīng)元件(表3),說明LpPIL5可能參與植物的激素信號(hào)傳導(dǎo)、耐逆響應(yīng)和晝夜節(jié)律調(diào)控。
表3 LpPIL5啟動(dòng)子順式作用元件分析Table 3 The analysis of cis-acting regulatory elements in the LpPIL5 promoter
LpPIL5在多年生黑麥草伸展葉、成熟葉、老葉、根、莖、葉鞘和根冠中均表達(dá)(圖7a)。葉片中LpPIL5的表達(dá)量顯著高于根、莖、葉鞘和根冠,其中,在成熟葉中的表達(dá)量最高。另外,LpPIL5的表達(dá)受光周期調(diào)控,如在光下的相對(duì)表達(dá)量要明顯高于黑暗。在光照開始0~4 h,其表達(dá)量上升最為明顯,隨后會(huì)有不同程度的下降。而在黑暗條件下,該基因的表達(dá)量顯著低于光照條件,且處于較低水平(圖7b)。
圖7 LpPIL5在不同組織(a)和光照條件(b)下的相對(duì)表達(dá)量Fig.7 Relative expression of LpPIL5 gene in different tissues(a)and light or dark conditions(b)
PEG、NaCl、CdCl2和高溫脅迫處理?xiàng)l件下葉片中LpPIL5基因的相對(duì)表達(dá)量均低于對(duì)照,說明4種非生物脅迫的逆境處理均抑制了葉片中LpPIL5基因的表達(dá)(圖8)。在根中PEG、NaCl、CdCl2和高溫脅迫處理6 h內(nèi),LpPIL5基因的相對(duì)表達(dá)量也低于對(duì)照,然而在處理24 h后,LpPIL5基因在根中的表達(dá)量均高于對(duì)照。
圖8 4種非生物脅迫處理下多年生黑麥草葉片和根中LpPIL5的相對(duì)表達(dá)量Fig.8 The relative expression of LpPIL5 in leaves and roots in response to four different abiotic stresses
兩種激素處理?xiàng)l件下,LpPIL5在根和葉片中的表達(dá)模式也具有差異(圖9)。LpPIL5在葉片中的表達(dá)均受ABA和6-BA的抑制,但抑制程度不同。如:6-BA處理0.5~2 h時(shí),LpPIL5表達(dá)量呈上升的趨勢(shì),但ABA處理0.5~2 h,LpPIL5表達(dá)量呈下降的趨勢(shì)。在根中,LpPIL5在6-BA和ABA處理下的表達(dá)模式是相似的,均表現(xiàn)為前12 h內(nèi),該基因的表達(dá)受到抑制,但在24 h時(shí),該基因的相對(duì)表達(dá)量高于對(duì)照。
圖9 ABA和6-BA處理下多年生黑麥草葉片和根中LpPIL5的相對(duì)表達(dá)量Fig.9 The relative expression of LpPIL5 in leaves and roots in response to ABA and 6-BA
光在植物生長發(fā)育中起著至關(guān)重要的作用,不僅參與植物的光合作用,還作為信號(hào)調(diào)節(jié)多種生理反應(yīng),如光形態(tài)建成等。光敏色素主要在細(xì)胞質(zhì)中合成,在紅光照射下會(huì)快速移動(dòng)到細(xì)胞核中,然后與PIFs蛋白發(fā)生相互作用,促進(jìn)它們的快速降解來調(diào)節(jié)植物的生長發(fā)育過程[30]。光敏色素互作因子作為bHLH轉(zhuǎn)錄因子的亞家族,是參與光信號(hào)通路的關(guān)鍵調(diào)控因子,在植物生長發(fā)育中發(fā)揮著重要作用[6]。隨著生物技術(shù)的不斷發(fā)展,目前,越來越多的PIF轉(zhuǎn)錄因子家族在植物中被發(fā)現(xiàn)并研究。如PIF轉(zhuǎn)錄因子已經(jīng)在水稻[31]、番茄(Solanum lycopersicum)[32]、擬南芥[18,33]、小立碗蘚(Physcomitrella patens)[34]和玉米[35-36]等多種植物中被發(fā)現(xiàn)并分離。但是,多年生黑麥草的PIF轉(zhuǎn)錄因子家族成員尚未被克隆。
本研究從多年生黑麥草中克隆得到一個(gè)PIF基因LpPIL5,其編碼蛋白具有堿性螺旋-環(huán)-螺旋(basic helix-loop-helix)蛋白保守的bHLH結(jié)構(gòu)域和APB功能域。前人研究結(jié)果表明,光敏色素A和B可以與PIFs的APA和APB功能域互作,促進(jìn)PIF降解進(jìn)而發(fā)揮生物學(xué)功能[37-38]。然而,本研究發(fā)現(xiàn)LpPIL5不含有APA功能域,說明其可能不與光敏色素A直接互作。對(duì)LpPIL5蛋白進(jìn)行空間三維立體結(jié)構(gòu)模擬,發(fā)現(xiàn)其具有典型的bHLH結(jié)構(gòu)域特征,位于該蛋白兩端的α-螺旋形成拉鏈結(jié)構(gòu),能夠嵌入DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的大溝,而在這兩個(gè)α-螺旋末端均富含堿性氨基酸,以識(shí)別DNA序列。前人研究發(fā)現(xiàn),PIFs可以通過其bHLH結(jié)構(gòu)域的基本區(qū)域與下游基因的順式作用元件結(jié)合[39]?;谝陨辖Y(jié)果,并結(jié)合LpPIL5定位于細(xì)胞核,推測(cè)LpPIL5是一個(gè)轉(zhuǎn)錄激活子,通過bHLH功能域與其下游基因啟動(dòng)子結(jié)合并促進(jìn)下游基因的表達(dá),進(jìn)而發(fā)揮生物學(xué)功能。
分析LpPIL5基因的表達(dá)模式有助于揭示其調(diào)控多年生黑麥草耐逆反應(yīng)、激素響應(yīng)和光形態(tài)建成的機(jī)制。Wang等[40]的研究表明兩對(duì)AhPIF3基因(AhPIF3A1/B1,AhPIF3A4/B4)在黑暗下的轉(zhuǎn)錄水平要高于在光下的轉(zhuǎn)錄水平。與上述結(jié)果相似的是葡萄(Vitis vinifera)VvPIFs在光下的轉(zhuǎn)錄水平也會(huì)被抑制,并且暗處理可誘導(dǎo)其表達(dá)[41]。除此之外,AtPIF3在黑暗條件下的擬南芥幼苗中表達(dá)量高,但在紅光和遠(yuǎn)紅光條件下都會(huì)被降解[42]。本研究結(jié)果表明LpPIL5的表達(dá)受光調(diào)控,表現(xiàn)為白天的表達(dá)量顯著高于夜晚,并且在其啟動(dòng)子區(qū)發(fā)現(xiàn)了許多與光響應(yīng)相關(guān)的順式作用元件,如G-box、I-box、BoxⅡ、TCCC-motif等。因此,推測(cè)LpPIL5基因功能發(fā)揮與光信號(hào)密切相關(guān),是植物光信號(hào)通路的核心調(diào)控因子,且LpPIL5啟動(dòng)子為光誘導(dǎo)型啟動(dòng)子,光照能夠驅(qū)動(dòng)或誘導(dǎo)LpPIL5基因的表達(dá),進(jìn)一步調(diào)節(jié)植物的光形態(tài)建成[43]。因此,LpPIL5是調(diào)控多年生黑麥草光形態(tài)建成及耐蔭響應(yīng)的重要候選基因。前人研究顯示,AdPIF3A4/AiPIF3B4基因在雌蕊發(fā)育早期的表達(dá)量高于其他組織[44],本研究發(fā)現(xiàn)LpPIL5基因在植物葉片中的表達(dá)量顯著高于其他部分,并且在葉片不同時(shí)期內(nèi)的表達(dá)量也有所不同,其中在成熟葉片中表達(dá)量最高,說明該基因在多年生黑麥草發(fā)育過程中可能具有不同的生物學(xué)功能。
不同非生物脅迫和兩種外源激素處理的定量數(shù)據(jù)結(jié)果表明,LpPIL5基因在葉片中受NaCl、CdCl2、高溫、干旱、ABA和6-BA處理后均表現(xiàn)為先上升后下降的表達(dá)趨勢(shì)。而在聚乙二醇(PEG)處理后的0.5 h內(nèi)其基因表達(dá)量出現(xiàn)了先下降,隨后上升再下降的趨勢(shì)。但與對(duì)照組相比,不管在哪種非生物脅迫處理下,其葉片中該基因的相對(duì)表達(dá)量都下降,但下降的程度不相同,表明該基因在多年生黑麥草葉片中對(duì)逆境脅迫的響應(yīng)具有重要作用,且不同逆境下其響應(yīng)程度不同。在根中,不同處理下也出現(xiàn)了相似的表達(dá)模式,但與葉片中不同的是,在處理24 h后,該基因的相對(duì)表達(dá)量均超過了對(duì)照組。尤其是在NaCl處理下,該基因在6 h后表達(dá)量快速上升,說明LpPIL5在根部受NaCl的影響要高于其他處理組。根和葉的相對(duì)表達(dá)量數(shù)據(jù)分析也表明,LpPIL5基因在根和葉中均有不同的表達(dá)模式。LpPIL5基因表達(dá)對(duì)上述逆境及植物激素處理的響應(yīng)可能與其啟動(dòng)子中含有的ABRE,MBS,CGTCA-motif和TGACG-motif等順式作用元件相關(guān),但與其啟動(dòng)子互作的逆境和激素響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子仍需進(jìn)一步挖掘。綜上所述,LpPIL5不僅具有參與光信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的能力,而且在響應(yīng)鹽、鎘、高溫、干旱等非生物脅迫方面也發(fā)揮著重要作用。
本研究克隆了多年生黑麥草LpPIL5基因,發(fā)現(xiàn)LpPIL5與大麥HvPIL1遺傳距離較近,且具有bHLH蛋白保守的結(jié)構(gòu)域和APB功能域;LpPIL5定位于細(xì)胞核;與其他組織相比,LpPIL5在多年生黑麥草葉片中表達(dá)量較高;并且其在葉片和根中表達(dá)量均受NaCl、CdCl2、PEG、高溫、ABA和6-BA等調(diào)控。另外,LpPIL5基因的表達(dá)受晝夜節(jié)律調(diào)控,如LpPIL5在白天的表達(dá)量顯著高于夜晚。本研究初步明確了LpPIL5不僅在光信號(hào)通路中起著至關(guān)重要的作用,而且還參與多年生黑麥草耐逆調(diào)控,研究結(jié)果為后續(xù)揭示LpPIL5基因調(diào)控多年生黑麥草光形態(tài)建成和耐逆(如耐蔭)機(jī)制提供了理論基礎(chǔ)。