劉 暢,俸婷婷,劉雄偉,周 英
(貴州中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院,貴州 貴陽(yáng) 550025)
中醫(yī)藥是我國(guó)人民經(jīng)過(guò)數(shù)千年的努力積淀起來(lái)的寶貴資源,是優(yōu)秀卓越的文化瑰寶。隨著現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)的迅速發(fā)展,中醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)得到了突飛猛進(jìn)的發(fā)展[1],產(chǎn)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵是中醫(yī)藥行業(yè)研究人才的培養(yǎng)。目前中藥學(xué)的研究也深入到了組學(xué)水平,本草基因組學(xué)是從基因組的水平研究中草藥品質(zhì)形成的分子機(jī)制及中草藥在人體內(nèi)代謝和藥效影響等的前沿學(xué)科,利用基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)等組學(xué)技術(shù)研究中草藥的基原植物遺傳多樣性及其次生代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),闡明中草藥藥效物質(zhì)基礎(chǔ)和作用的分子機(jī)制[2]。本草基因組學(xué)形成于中醫(yī)藥生產(chǎn)實(shí)踐,且對(duì)生產(chǎn)實(shí)踐具有指導(dǎo)作用,并廣泛應(yīng)用于中藥合成生物學(xué)、中藥鑒定學(xué)和藥用植物分子育種等領(lǐng)域,取得了令人矚目的研究成果。
目前,國(guó)內(nèi)高等院校開(kāi)設(shè)本草基因組學(xué)課程的主要為綜合性大學(xué)、中醫(yī)藥院校、研究院所等,如北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、上海中醫(yī)藥大學(xué)、武漢理工大學(xué)等。但大多數(shù)院校將其列為中醫(yī)藥專業(yè)博士生或碩士生課程,僅有武漢理工大學(xué)、浙江中醫(yī)藥大學(xué)、海南醫(yī)學(xué)院等將其列為本科課程[3]。但總的來(lái)說(shuō),開(kāi)設(shè)本草基因組學(xué)課程的學(xué)校還相對(duì)較少,如筆者所在貴州中醫(yī)藥大學(xué)相關(guān)專業(yè)尚未開(kāi)設(shè)此門課程。本草基因組學(xué)能夠加強(qiáng)基于現(xiàn)代科技前沿技術(shù)的中醫(yī)藥基礎(chǔ)的研究,通過(guò)此課程學(xué)習(xí),使學(xué)生了解本草基因組學(xué)研究領(lǐng)域的成果,理解本草基因組學(xué)研究成果對(duì)中醫(yī)藥發(fā)展的促進(jìn)作用,激發(fā)學(xué)生運(yùn)用現(xiàn)代技術(shù)手段探索新知識(shí)、新領(lǐng)域的積極性。
本草基因組學(xué)課程主要承擔(dān)兩方面任務(wù),一是全面完整地闡釋本草基因組學(xué)的產(chǎn)生、發(fā)展和前景,另一方面是為高等院校教師或?qū)W生搭建更完整的理論基礎(chǔ)知識(shí)體系。本課程主要包括兩大部分,一是本草基因組學(xué)理論基礎(chǔ),二是本草基因組學(xué)的應(yīng)用。本草基因組學(xué)課程具有研究范圍廣泛,多學(xué)科交叉;研究手段先進(jìn),理論體系高度綜合;研究?jī)?nèi)容明確,應(yīng)用性強(qiáng)等特點(diǎn)。
中藥學(xué)、中藥資源學(xué)、中藥鑒定學(xué)、中藥栽培學(xué)為本草基因組學(xué)奠定了深厚的歷史基礎(chǔ)、提供了豐富的研究材料,生物化學(xué)、分子生物學(xué)、中藥化學(xué)、中藥藥理學(xué)為本草基因組學(xué)提供了基礎(chǔ)理論和先進(jìn)的技術(shù)方法,生物信息學(xué)為本草基因組學(xué)的研究提供了理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐。與以上各學(xué)科相呼應(yīng),前沿技術(shù)和創(chuàng)新性研究策略為中藥學(xué)注入了新鮮血液,新概念、新思路、新問(wèn)題的提出使中藥的研究煥發(fā)了青春,使基因組學(xué)能夠促進(jìn)中藥學(xué)、生藥學(xué)、中藥資源學(xué)、中藥鑒定學(xué)、中藥栽培學(xué)從經(jīng)典走向現(xiàn)代,從傳統(tǒng)走向前沿,從基因組和分子水平對(duì)中草藥開(kāi)展研究,同時(shí)拓寬了組學(xué)的研究對(duì)象和應(yīng)用領(lǐng)域,為分子生物學(xué)等基礎(chǔ)理論課程走向?qū)嵺`應(yīng)用提供了案例,為中藥藥理學(xué)的深入研究提供了理論和技術(shù)支持。
本草基因組學(xué)利用高通量測(cè)序的技術(shù),對(duì)藥用生物基因組、全轉(zhuǎn)錄組、miRNA、代謝組、甲基化等進(jìn)行測(cè)序,結(jié)合生物信息學(xué)的方法挖掘藥用生物數(shù)據(jù)信息,是本草基因組學(xué)研究的核心內(nèi)容,對(duì)揭示道地藥材形成的分子機(jī)制,闡明中草藥的藥效物質(zhì)基礎(chǔ),篩選中草藥的質(zhì)量標(biāo)志物,提供中草藥質(zhì)量控制新方法等具有重要作用。
本草基因組學(xué)是一門應(yīng)用性較強(qiáng)的學(xué)科,對(duì)中醫(yī)藥的發(fā)展具有重大的指導(dǎo)意義?;诨蚪M開(kāi)發(fā)了AFLP、ISSR、SNP等分子標(biāo)記,基于轉(zhuǎn)錄組開(kāi)發(fā)SSR分子標(biāo)記,為藥用植物分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)提供了豐富基因資源,給傳統(tǒng)中藥鑒定帶來(lái)革命性影響。組學(xué)技術(shù)聯(lián)合分析可闡明道地藥材形成的分子機(jī)制,從分子水平解析遺傳控制和環(huán)境條件的影響,對(duì)優(yōu)質(zhì)中藥生產(chǎn)和栽培技術(shù)的改進(jìn)提供指導(dǎo)。對(duì)中草藥進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組和代謝組學(xué)的聯(lián)合測(cè)序,篩選和鑒定的次生代謝合成途徑的關(guān)鍵編碼基因,解析次生代謝途徑的合成過(guò)程,實(shí)現(xiàn)目標(biāo)產(chǎn)物的異源生產(chǎn),可為天然藥物研發(fā)提供新的方式。對(duì)中草藥作用于疾病的機(jī)制進(jìn)行多組學(xué)測(cè)序,以闡明中草藥藥效物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制。
《本草基因組學(xué)——中藥組學(xué)的發(fā)展與未來(lái)》專著于2016年出版[4],《本草基因組學(xué)》教材是在其基礎(chǔ)上,按照教材編撰的要求,結(jié)合專家和讀者的建議與意見(jiàn),于2018年8月出版[5]。該教材為普通高等教育“十三五”規(guī)劃教材,對(duì)本草基因組學(xué)的相關(guān)概念和理論進(jìn)行了介紹,對(duì)本草基因組學(xué)最新的研究成果和前沿動(dòng)態(tài)進(jìn)行總結(jié),全面闡釋了本草基因組學(xué)的發(fā)生發(fā)展及應(yīng)用前景。目前,國(guó)內(nèi)高等院校開(kāi)設(shè)本草基因組學(xué)課程的主要為綜合性大學(xué)、中醫(yī)藥院校、研究院所等,但大多數(shù)院校將其列為中醫(yī)藥專業(yè)博士生或碩士生課程,僅有武漢理工大學(xué)、浙江中醫(yī)藥大學(xué)、海南醫(yī)學(xué)院等列為本科課程[3]。由此可見(jiàn),亟待在高等院校尤其是中醫(yī)藥院校本科生中開(kāi)設(shè)本草基因組學(xué)課程,以促進(jìn)中醫(yī)藥相關(guān)專業(yè)學(xué)生了解高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)在藥用生物次生代謝、藥效物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制等領(lǐng)域的應(yīng)用,增加相關(guān)知識(shí)積累。
本草基因組學(xué)在課程教學(xué)的形式上,主要為基礎(chǔ)理論課、實(shí)驗(yàn)課、討論課等。由于本草基因組學(xué)涉及的學(xué)科較多,在實(shí)際教學(xué)過(guò)程中,因缺乏有效的教學(xué)模式以及本科生相關(guān)理論基礎(chǔ)薄弱,在授課過(guò)程中存在諸多問(wèn)題。根據(jù)學(xué)生的專業(yè)背景和對(duì)基礎(chǔ)知識(shí)的掌握程度,不同研究?jī)?nèi)容的難易度和學(xué)生的理解程度,在本課程教學(xué)過(guò)程中,綜合運(yùn)用多種教學(xué)方法并融入思政元素。
PBL教學(xué)模式強(qiáng)調(diào)學(xué)生的自主學(xué)習(xí)和解決問(wèn)題能力培養(yǎng),使學(xué)生的分析、探究、溝通等方面能力得到全方位提升,能夠增加教學(xué)的趣味性,增強(qiáng)知識(shí)的運(yùn)用能力[6]。在PBL教學(xué)過(guò)程中,以學(xué)生為中心,教師設(shè)計(jì)與課程相關(guān)的實(shí)際問(wèn)題引導(dǎo)學(xué)生思考,通過(guò)團(tuán)隊(duì)合作、自主學(xué)習(xí)等方式來(lái)解決問(wèn)題,明確問(wèn)題答案,了解背后相關(guān)的知識(shí),提高解決問(wèn)題能力,培育自主學(xué)習(xí)意識(shí),使學(xué)生真正做到學(xué)以致用。
翻轉(zhuǎn)課堂更加注重個(gè)性化教學(xué),改變傳統(tǒng)的教學(xué)過(guò)程,指導(dǎo)學(xué)生課前利用中國(guó)慕課、學(xué)習(xí)通、中國(guó)知網(wǎng)、NCBI、網(wǎng)絡(luò)資源等學(xué)習(xí)資源自主學(xué)習(xí),課堂上教師引導(dǎo)學(xué)生分小組討論而開(kāi)展教學(xué)的教學(xué)模式[7]。針對(duì)本草基因組學(xué)課程應(yīng)用部分的內(nèi)容,將中草藥組學(xué)測(cè)序研究策略穿插其中。學(xué)生課下收集近期發(fā)表的與藥用植物相關(guān)的文章,可下載小木蟲(chóng)、丁香園、生物通等App,關(guān)注與藥用植物研究相關(guān)的微信公眾號(hào),對(duì)前沿動(dòng)態(tài)進(jìn)行跟進(jìn),對(duì)最新研究進(jìn)展和前沿技術(shù)展開(kāi)討論。
為提高學(xué)生對(duì)本草基因組學(xué)廣度和深度的認(rèn)知,培養(yǎng)學(xué)生的科研創(chuàng)新能力,實(shí)驗(yàn)課可講解二代/三代測(cè)序技術(shù)并上機(jī)演示。實(shí)驗(yàn)課教學(xué)過(guò)程中,授課教師以實(shí)際應(yīng)用問(wèn)題進(jìn)行導(dǎo)課,采用邊授課、邊用電腦演示的方法,本科生可以使用個(gè)人電腦在教師指導(dǎo)下進(jìn)行操作。二代/三代測(cè)序技術(shù)分析流程在網(wǎng)上都有相應(yīng)的軟件,如OmicShare在線平臺(tái)(https://www.omicshare.com/tools/)、百邁客云平臺(tái)(http://www.biocloud.net/)等。云平臺(tái)上的二代/三代測(cè)序示例數(shù)據(jù),如轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)、代謝組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)等,學(xué)生可以利用這些數(shù)據(jù)進(jìn)行實(shí)操訓(xùn)練,更直觀地理解二代/三代測(cè)序數(shù)據(jù)的意義,了解組學(xué)分析的流程。
深入挖掘本草基因組學(xué)課程中的思政元素,將思政元素融入本草基因組學(xué)教學(xué)中,將思政教育貫穿于本草基因組學(xué)教學(xué)全過(guò)程。挖掘中醫(yī)藥發(fā)展史上的優(yōu)秀人物、中醫(yī)藥的文化傳承、相關(guān)的時(shí)事熱點(diǎn)等內(nèi)容,培養(yǎng)學(xué)生的愛(ài)國(guó)主義情感和對(duì)中醫(yī)藥文化的認(rèn)同感。在教授好專業(yè)知識(shí)的基礎(chǔ)上,有目的、有計(jì)劃地將思政元素滲透到教學(xué)過(guò)程中,讓學(xué)生真正了解本草文化,弘揚(yáng)中醫(yī)文化,傳承本草精神。通過(guò)設(shè)計(jì)相關(guān)思政案例將思政內(nèi)容融入本草基因組學(xué)教學(xué)中,是落實(shí)立德樹(shù)人任務(wù)的根本,也是實(shí)現(xiàn)思政教育與專業(yè)課程教育有效融合的載體。
從本草基因組學(xué)課程發(fā)展來(lái)看,該課程教學(xué)體系和教學(xué)大綱已得到進(jìn)一步完善。作為新興課程,雖已在部分院校開(kāi)設(shè)多年,但在很多中醫(yī)藥院校尚未開(kāi)設(shè),其課程設(shè)置和教學(xué)過(guò)程仍處于探索階段,其課程設(shè)置、內(nèi)容涵蓋應(yīng)結(jié)合各中醫(yī)藥相關(guān)專業(yè)的特色進(jìn)行考慮,同時(shí)教法與具體教學(xué)內(nèi)容還應(yīng)在教學(xué)實(shí)踐中不斷探索。