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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探究溫陽(yáng)強(qiáng)心顆??剐募∪毖俟嘧p傷的作用機(jī)制

2023-01-27 14:40:06朱姝悅王冰梅
吉林中醫(yī)藥 2022年12期
關(guān)鍵詞:強(qiáng)心信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)溫陽(yáng)

原 黛,劉 群,朱姝悅,劉 暢,王冰梅,王 微

(長(zhǎng)春中醫(yī)藥大學(xué),長(zhǎng)春 130117)

急性心肌梗死是一種可導(dǎo)致心肌缺血性壞死的心血管疾病,對(duì)梗死的心肌及時(shí)地進(jìn)行血流灌注是目前最有效的治療手段,但易造成心肌缺血再灌注損傷[1]。心肌缺血再灌注損傷(myocardial ischemia-reperfusion injury,MI/RI)表現(xiàn)為心肌缺血后再灌注血流時(shí),不能恢復(fù)缺血部位的組織器官功能,反而還會(huì)出現(xiàn)超微結(jié)構(gòu)的變化,心肌能量代謝障礙和血管無(wú)復(fù)流等現(xiàn)象,進(jìn)而加重了功能障礙和結(jié)構(gòu)損傷[2]。

溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒具有益氣溫陽(yáng)、利水消腫、活血通絡(luò)的作用。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒中的12味中藥材可通過(guò)不同的作用機(jī)制改善心肌缺血再灌注損傷[3]的癥狀。目前運(yùn)用于治療心肌缺血再灌注損傷的中藥制劑一般是由三七-紅花藥對(duì)、干姜-附子湯、苓桂術(shù)甘湯等由2~5種中藥組成的復(fù)方。相較于這些中藥復(fù)方,溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒復(fù)方中增加了黃芪、川芎等中藥,其中的黃酮類(lèi)成分具有改善血液循環(huán)等作用。溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒復(fù)方成分多,其中的12味中藥都具有抗心肌缺血再灌注損傷的作用,但是,其具體作用機(jī)制還未可知。本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)從系統(tǒng)、整體的水平探討溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒治療心肌缺血再灌注損傷的作用機(jī)制,為溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒對(duì)心肌缺血再灌注損傷的臨床治療提供合理依據(jù)[4]。

1 材料與方法

1.1 溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒中活性成分和作用靶點(diǎn)的篩選 利用中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫(kù)和分析平臺(tái)(TCMSP)搜索中藥名字得到溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒中附子、黨參、當(dāng)歸、川芎、丹參、黃芪、三七、茯苓、白術(shù)、桂枝、甘草、葶藶子這12味藥材的所有化合物成分,將口服生物利用度(OB)的篩選條件調(diào)整為≥30%、將化合物類(lèi)藥性(DL)的篩選條件調(diào)整為≥0.18,篩選出活性成分,并獲取活性化合物的所有作用靶點(diǎn)。利用蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(Uniprot Database)下載已驗(yàn)證的人類(lèi)基因數(shù)據(jù)庫(kù)并進(jìn)行處理,用以方便后續(xù)的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究。

1.2 構(gòu)建靶點(diǎn)蛋白交互作用(protein protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò) 將上述交集靶點(diǎn)輸入蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)(STRING)得到高置信度的靶點(diǎn)蛋白交互作用(PPI)信息,用Cytoscape 3.9.1軟件將PPI信息進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,對(duì)所有數(shù)據(jù)進(jìn)行連接度(Deegre)值分析,以Deegre值對(duì)靶點(diǎn)圖形大小,色彩進(jìn)行調(diào)整進(jìn)而得到PPI網(wǎng)絡(luò),利用Centiscape 2.2軟件進(jìn)行拓?fù)浞治?,分析出所有交集靶點(diǎn)的緊密度(closeness centrality,CC)、Degree和介度(betweenness centrality,BC)3個(gè)參數(shù)值做中位值,再通過(guò)BC、CC和Degree值篩選核心靶點(diǎn)。

1.3 GO 富集分析和KEGG通路富集分析 將藥物疾病交集靶點(diǎn)基因進(jìn)行基因本體(GO)富 集分析,包括分子功能(MF)分析、生物過(guò)程(BP)分析、細(xì)胞組成(CC)分析,然后進(jìn)行京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)富集分析。

2 結(jié)果

2.1 溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒的有效成分及作用靶點(diǎn) 從TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出了溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒的277個(gè)化合物,去除重復(fù)項(xiàng)以及無(wú)對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)的化合物后總計(jì)檢索出192個(gè)有效成分。其中:附子3個(gè),黨參11個(gè),川芎2個(gè),丹參54個(gè),黃芪7個(gè),三七1個(gè),茯苓5個(gè),白術(shù)3個(gè),桂枝4個(gè),甘草78個(gè),葶藶子3個(gè),共同有效成分21個(gè)。從TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)匹配到對(duì)應(yīng)的作用靶點(diǎn),將其從UNIPROT數(shù)據(jù)中進(jìn)行匹配,轉(zhuǎn)換成Uniprot ID基因名,得到了溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒藥物有效成分所對(duì)應(yīng)的作用靶點(diǎn)基因共285個(gè)。在GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選到MI/RI相關(guān)作用靶點(diǎn)1 387條,篩選設(shè)置relevance score≥15,最終得到相關(guān)靶點(diǎn)一共173個(gè)。利用微生信網(wǎng)站中的Ⅴenn作圖平臺(tái),將藥物作用靶點(diǎn)和MI/RI相關(guān)靶點(diǎn)取交集后最終得到65個(gè)靶點(diǎn)。

2.2 構(gòu)建靶點(diǎn)蛋白交互作用PPI網(wǎng)絡(luò) 使用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)和Cytoscape 3.9.1軟件得到了一張具有65個(gè)節(jié)點(diǎn)、1082條邊的PPI網(wǎng)絡(luò)圖,如圖1所示。經(jīng)過(guò)Centiscape 2.2軟件拓?fù)浞治龊蟮玫?Degree中位數(shù)為33.81,BC中位數(shù)為30.69,CC中位數(shù)為0.011,滿(mǎn)足以上3個(gè)參數(shù)值的是白細(xì)胞介素6(IL-6)、腫瘤壞死因子(TNF)、白細(xì)胞介素1B(IL-1B)、絲氨酸/蘇氨酸激酶1(AKT1)等21個(gè)可以作為在治療心肌缺血再灌注損傷中發(fā)揮作用的核心靶點(diǎn)[7-8],這些靶點(diǎn)可能在心肌缺血再灌注損傷的治療中發(fā)揮了重要作用[9],詳細(xì)如表1所示。

表1 溫陽(yáng)強(qiáng)心顆??筂I/RI的靶點(diǎn)蛋白交互作用PPI網(wǎng)絡(luò)

圖1 PPI可視化網(wǎng)絡(luò)圖

2.3 GO富集分析 在Matescape平臺(tái)對(duì)得到的65個(gè)交集靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行BP、CC、MF富集分析,以P<0.01為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選,富集到了297條生物過(guò)程條目、64條細(xì)胞組成條目、72條分子功能條目,共計(jì)433條GO條目,各類(lèi)別前10個(gè)條目如圖2所示,其中生物過(guò)程主要包括有:正調(diào)控細(xì)胞遷移、對(duì)脂多糖的反應(yīng)、對(duì)氧化的應(yīng)激反應(yīng)等;細(xì)胞組成主要包括有:膜灶、膜微結(jié)構(gòu)域、細(xì)胞膜內(nèi)陷、囊泡腔、外側(cè)細(xì)胞膜、質(zhì)膜灶、分泌顆粒腔、細(xì)胞質(zhì)囊泡腔、蛋白酶抑制劑復(fù)合物等[10];分子功能包括有:細(xì)胞因子活性、細(xì)胞因子受體結(jié)合、信號(hào)受體激活活動(dòng)、信號(hào)受體調(diào)節(jié)活動(dòng)等[11]。通過(guò)以上數(shù)據(jù)可以發(fā)現(xiàn),溫陽(yáng)強(qiáng)心顆??赡苁峭ㄟ^(guò)多種生物學(xué)過(guò)程發(fā)揮治療MI/RI疾病作用。

圖2 GO生物過(guò)程、細(xì)胞組成、分子功能

2.4 KEGG通路富集分析 在Matescape平臺(tái)對(duì)得到的65個(gè)交集靶點(diǎn)進(jìn)行KEGG信號(hào)通路富集分析,以P<0.01為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選,共富集得到154條信號(hào)通路,主要包括:流體剪切應(yīng)力與動(dòng)脈粥樣硬化、TNF信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、白細(xì)胞介素(IL-17)信號(hào)通路、缺氧誘導(dǎo)因子-1(HIF-1)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(ⅤEGF)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、內(nèi)分泌性信號(hào)通路、Th17細(xì)胞分化信號(hào)通路、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子相互作用信號(hào)通路、細(xì)胞衰老信號(hào)通路、壞死性凋亡信號(hào)通路等信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,且這些信號(hào)通路與膀胱癌(bladder cancer)、胰 腺 癌(pancreatic cancer)、直腸癌(colorectal cancer)、小細(xì)胞肺癌(small cell lung cancer)等癌癥通路有相關(guān)性;也與肺結(jié)核(tuberculosis)、非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease)、酒精性肝病(alcoholic liver disease)、類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(rheumatoidarthritis)等疾病通路有相關(guān)性[12]。分析以上研究結(jié)果可知,溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒的活性成分相關(guān)靶點(diǎn)分布于不同途徑,能夠通過(guò)各個(gè)信號(hào)通路協(xié)調(diào)發(fā)揮對(duì)MI/RI的治療作用[13]。

3 討論

心肌缺血是心肌異常代謝導(dǎo)致能量不足以支持心臟正常工作的病理狀態(tài),是由于心臟的血液灌注量降低導(dǎo)致心臟供氧降低而形成的疾病[14],血運(yùn)重建治療法是現(xiàn)在臨床上治療心肌缺血的主要方法[15]。但是恢復(fù)缺血部位心肌組織的血流供應(yīng)后,心肌可能會(huì)更大程度受損進(jìn)而導(dǎo)致心肌組織的二次損傷。大量研究結(jié)果顯示缺血再灌注損傷心肌可占全部梗死心肌面積的50%[16]。

本研究共獲得了以下核心靶點(diǎn):IL-6、TNF、IL-1B、AKT1、ⅤEGFA、CCL2、NOS3、MMP9和IL-10等。在溫陽(yáng)強(qiáng)心顆??剐募∪毖俟嘧p傷的GO富集分析中主要涉及297條生物學(xué)過(guò)程,包括正調(diào)控細(xì)胞遷移、對(duì)脂多糖的反應(yīng)、對(duì)氧化應(yīng)激的反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、對(duì)無(wú)機(jī)物質(zhì)的反應(yīng)和細(xì)胞對(duì)化學(xué)的應(yīng)激反應(yīng)等大部分生物過(guò)程都和心肌缺血再灌注損傷相關(guān)[17]。在溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒抗心肌缺血再灌注損傷的KEGG通路富集分析中,主要涉及AGE-RAGE信號(hào)通路、TNF信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、IL-17信號(hào)通路、HIF-1信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和ⅤEGF信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路等通路[18]。在心肌缺血再灌注損傷這一疾病的發(fā)展過(guò)程中,炎癥因子TNF-α水平的增加與心肌組織的功能降低有關(guān)系,通過(guò)直接影響心肌的收縮力從而抑制心肌細(xì)胞的凋亡,這是TNF-α導(dǎo)致心肌缺血后心肌功能降低的主要機(jī)制[19],相關(guān)研究表明,IL-23、IL-17等其他炎性因子在心肌缺血再灌注損傷中的表達(dá)明顯提高,與心肌細(xì)胞凋亡、提高炎性反應(yīng)和氧化應(yīng)激等有相關(guān)性[20]。研究證明,激活HIF-1α可以通過(guò)調(diào)控Bax/Bcl-2表達(dá)以及與Caspase-3和Caspase-9活性相關(guān)的心肌細(xì)胞凋亡,從而有效減輕糖尿病心臟I/R后的心肌損傷程度[21],增強(qiáng)ⅤEDF的表達(dá),抑制心肌缺血時(shí)脂質(zhì)的過(guò)氧化,從而促進(jìn)清除氧自由基,促進(jìn)缺血部位新生血管的生成,對(duì)大鼠實(shí)驗(yàn)性心肌缺血再灌注損傷也具有保護(hù)作用[6],NF-kB信號(hào)通路是I/R損傷的介質(zhì)。NF-kB激活會(huì)造成炎癥因子(如TNF-α,IL-1,IL-6和IL-8),趨化因子(例如MCP-1和MIP-1a)以及產(chǎn)生繼發(fā)性炎癥介質(zhì)(例如COX-2和iNOS)的誘導(dǎo)酶的表達(dá)增強(qiáng)[20]。這是一個(gè)惡性循環(huán),會(huì)擴(kuò)大初始炎癥反應(yīng),這是I/R損傷的重要機(jī)制[21]。有關(guān)研究報(bào)道,AGE與其細(xì)胞表面受體RAGE的結(jié)合導(dǎo)致NF-kB介導(dǎo)的炎癥因子釋放[22],有絲分裂原激活的蛋白激酶(MAPK)信號(hào)通路參與I/R損傷過(guò)程,通過(guò)P38MAPK、P44/42MAPK和SAPK/JNK 3條途徑調(diào)節(jié)細(xì)胞免疫、炎癥和凋亡[23]。根據(jù)這些研究推測(cè)溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒可能是通過(guò)作用于這些通路來(lái)發(fā)揮治療心肌缺血再灌注損傷的作用。

本研究應(yīng)用了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù)研究了溫陽(yáng)強(qiáng)心顆粒中所含中藥的所有化學(xué)成分及其作用靶點(diǎn),多角度分析總結(jié)得到其抗心肌缺血再灌注損傷具有多成分、多靶點(diǎn)、多生物過(guò)程、多信號(hào)通路的作用機(jī)制,但其具體的作用機(jī)制還有待進(jìn)一步探討。

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