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日本結(jié)縷草ZjTCP20基因生物信息學(xué)及表達(dá)模式分析

2023-03-05 13:38:10楊卓雄韓烈保晁躍輝
草地學(xué)報 2023年2期
關(guān)鍵詞:結(jié)構(gòu)域試劑盒載體

楊卓雄, 董 笛, 韓烈保,晁躍輝

(北京林業(yè)大學(xué), 北京 100083)

TCP轉(zhuǎn)錄因子是高等植物所特有的轉(zhuǎn)錄因子小家族,由三個特征成員玉米的TEOSINTE BRANCHRED 1(TB1)、金魚草(Antirrhinummajus)的CYCLOIDEA(CYC)以及水稻(Oryzasativa)的PROLIFERATING CELL FACTORS(PCFs)命名[1]。TCP結(jié)構(gòu)域包含一個非典型的堿性-螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH)結(jié)構(gòu)域,涉及DNA結(jié)合、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用和蛋白質(zhì)核定位[2]?;诎被嵝蛄械牟町悾貏e是在TCP結(jié)構(gòu)域的基本區(qū)域,TCP轉(zhuǎn)錄因子家族可進(jìn)一步分為Ⅰ類和Ⅱ類兩個亞家族,Class Ⅰ類的TCP也稱作TCP-P類,以水稻中的PCF1與PCF2為代表,Class Ⅱ類的TCP也稱作TCP-C類,以金魚草中的CYC和玉米中的TB1為代表[3]。與Class Ⅰ的成員相比,Ⅱ類成員在TCP結(jié)構(gòu)域多有四個氨基酸殘基,例如谷氨酸-半胱氨酸-谷氨酸(ECE)延伸,一些Ⅱ類蛋白質(zhì)包含一個由極性氨基酸組成的保守R結(jié)構(gòu)域,通過形成親水螺旋介導(dǎo)蛋白質(zhì)相互作用[2,4]。Ⅱ類成員可以根據(jù)TCP結(jié)構(gòu)域中的序列差異進(jìn)一步細(xì)分為CIN和CYC兩個分支,CIN子代以CINCINNATA(CIN)為代表,而CYC子代以CYC/TB1為代表[5-6]。

TCP轉(zhuǎn)錄因子在植物發(fā)育過程中起著至關(guān)重要的作用。研究表明Class Ⅱ類中的CIN和CYC兩個分支主要參與植物發(fā)育,但Class Ⅰ類的基因的作用則與之相反,在調(diào)控葉片發(fā)育過程中最為明顯,Ⅱ類基因抑制細(xì)胞增殖,而Ⅰ類則是正向調(diào)控[7]。此外,在Ⅰ類TCP轉(zhuǎn)錄因子成員中,擬南芥(Arabidopsisthaliana)的TCP14和TCP15分別參與了葉片和花發(fā)育過程中細(xì)胞增殖的激活和抑制[8]。TCP1通過與DWF4啟動子相互作用,調(diào)控DWF4的轉(zhuǎn)錄,進(jìn)一步調(diào)控植物的生長發(fā)育[9]。擬南芥AtTCP23過表達(dá)株系顯示出晚花表型和葉片形態(tài)改變,表明AtTCP23參與了對開花時間和發(fā)育的調(diào)控[10]。在Ⅱ類TCP轉(zhuǎn)錄因子成員中,CIN基因參與了側(cè)向器官的發(fā)育及調(diào)控細(xì)胞分裂素和生長素信號轉(zhuǎn)導(dǎo),CYC/TB1基因與植物開花有關(guān)[11]。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析,將CYC/TB1基因進(jìn)一步分為三類(CYC1,CYC2和CYC3)[12]。CYC1基因在控制腋芽分化和分枝中起著重要作用,CYC2基因在控制花的正向和背面對稱性中起著重要作用,而CYC3在花原基和側(cè)枝中均有表達(dá),但對花分枝的控制不大[4,12-13]。

TCP20是Ⅰ類TCP轉(zhuǎn)錄因子中的成員,屬于古老植物特有的基因家族,可調(diào)控植物芽、花和胚的發(fā)育[14]。在擬南芥中,AtTCP20可以促進(jìn)生長素的合成,對茉莉酸的代謝起負(fù)調(diào)控作用[15-16]。有研究顯示,AtTCP20可介導(dǎo)擬南芥根部的硝酸鹽吸收的系統(tǒng)信號通路,tcp20突變體在根生長方面有缺陷,但在根的硝酸鹽吸收反應(yīng)中沒有缺陷[17]。

日本結(jié)縷草(Zoysiajaponica)是禾本科(Gramineae)結(jié)縷草屬(Zoysia)多年生草本,主要用于運(yùn)動場地草坪。屬于暖季型草坪草喜溫暖濕潤氣候,喜光,且有一定的耐陰性,抗旱、抗鹽堿、耐瘠薄、耐踐踏[18-19]。TCP基因家族廣泛存在與高等植物中,但關(guān)于TCP20基因的研究鮮有報道,因此本研究通過對日本結(jié)縷草ZjTCP20基因的克隆及生物信息學(xué)分析來為TCP轉(zhuǎn)錄因子提供科學(xué)依據(jù),也有助于后續(xù)研究日本結(jié)縷草的生長發(fā)育奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料及試劑

試驗(yàn)采用的日本結(jié)縷草種由北京林業(yè)大學(xué)草坪分子實(shí)驗(yàn)室提供,放置人工氣候箱內(nèi)培養(yǎng),晝夜相對時長為14/10 h,溫度為26℃,濕度為60%。克隆載體pMD19-T、T4 DNA連接酶、反轉(zhuǎn)錄Prime Script RT試劑盒、限制性核酸酶NcoⅠ和EcoRⅠ、酵母轉(zhuǎn)化試劑盒和熒光定量試劑TB Green Premix Ex Taq Ⅱ購買于TaKaRa公司。RNA提取試劑盒Plant RNA Kit、PCR純化試劑盒Cycle-Pure Kit、細(xì)胞質(zhì)粒提取試劑盒Plasmid mini KitⅠ等購買于OMEGA公司。大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞購買于博雅宏興,酵母菌株Y2HGold、酵母陽性對照質(zhì)粒pGBT9、陰性對照BD空載、農(nóng)桿菌EHA105、植物表達(dá)載體3302-3flag等,均來自北京林業(yè)大學(xué)草坪分子實(shí)驗(yàn)室。脫落酸等植物激素購自SIGMA公司。其它應(yīng)用的試劑均為國內(nèi)分析純。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1引物設(shè)計 引物設(shè)計應(yīng)用軟件Primer Premier 5[19]。基于已知的日本結(jié)縷草參考基因組序列及本實(shí)驗(yàn)室測定的轉(zhuǎn)錄組信息設(shè)計特異性引物ZjTCP20-F和ZjTCP20-R擴(kuò)增ZjTCP20基因以所獲得的ZjTCP20全長序列[20]。并且以BD載體的序列為基礎(chǔ),設(shè)計BD載體連接引物BD-TCP20-F和BD-TCP20-R。設(shè)計引物3302Y-TCP20-F及3302Y-TCP20-R用于35S-ZjTCP20-YFP的載體構(gòu)建。日本結(jié)縷草Actin基因作為內(nèi)參,內(nèi)參引物分別為ZjActin-F以及ZjActin-R,ZjTCP20-qPCR-F和ZjTCP20-qPCR-R以ZjTCP20基因序列為基礎(chǔ),作為熒光定量檢測的特異性引物(表1)。

表1 本試驗(yàn)所用引物序列Table 1 Primer sequences used in the experiment

1.2.2基因克隆 日本結(jié)縷草經(jīng)1個月生長成熟后,剪取葉片將其研磨,按照試劑盒說明提取總RNA并進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄得到cDNA。利用ZjTCP20-F和ZjTCP20-R對cDNA進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)程序?yàn)?5℃/ 10 min;95℃/15 s,58℃/30 s(—0.1℃/cycle),72℃/90 s,30個循環(huán);72℃/5 min,12℃保溫。凝膠電泳檢測后,將其與T載相連,轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α,挑取在Amp抗性LB培養(yǎng)基上大腸桿菌單菌落,進(jìn)行檢測,選擇符合長度要求的菌落送至生物公司測序,選擇測序正確的菌落進(jìn)行保菌和質(zhì)粒提取。

1.2.3生物信息學(xué)分析 使用ExPASy網(wǎng)站(http://expasy.org/)對蛋白質(zhì)長度、等電點(diǎn)、分子量、疏水性等性質(zhì)進(jìn)行分析[21]。利用Phyre 2(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)工具預(yù)測蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)[22]。根據(jù)SignalP 4.1網(wǎng)站(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)預(yù)測信號肽[23]。通過NCBI數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/homologene)查找TCP20同源蛋白[24]。利用MEME網(wǎng)站(http://meme-suite.org/tools/meme)以及TBtools、MEGA 5.0 軟件進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域以及系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹分析[25-26]。

1.2.435S-ZjTCP20-YFP載體構(gòu)建及亞細(xì)胞定位 利用特異性引物3302Y-TCP20-F和3302Y-TCP20-R擴(kuò)增模板pMD-ZjTCP20,并且使用限制性內(nèi)切酶EcoR Ⅰ酶切35S-YFP載體,利用無縫鏈接酶連接PCR產(chǎn)物和35S-YFP載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌。對構(gòu)建成功的載體,將其質(zhì)粒轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌感受態(tài)EHA105,注射本生煙草葉片,然后將煙草置于黑暗環(huán)境下培養(yǎng)48 h,共聚焦顯微鏡下觀察YFP信號在細(xì)胞中的分布情況[27]。

1.2.5BD-ZjTCP20載體的構(gòu)建及Y2HGold酵母的轉(zhuǎn)化 利用引物BD-TCP20-F和BD-TCP20-R,擴(kuò)增pMD-ZjTCP20模板,并用限制性內(nèi)切酶Nco Ⅰ酶切載體BD,純化后,將切好的載體與PCR產(chǎn)物連接,構(gòu)建BD-TCP20載體,轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)DH5α中。使用BD載體的通用引物3’ BD和T7對單菌落進(jìn)行驗(yàn)證,選擇長度接近的單菌落送至生物公司測序。大量提取測序準(zhǔn)確的載體質(zhì)粒,并將其陽性對照pGBT9質(zhì)粒和陰性對照BD空載按照酵母轉(zhuǎn)化試劑盒要求一起轉(zhuǎn)到大腸桿菌Y2H菌株中。

1.2.6轉(zhuǎn)錄自激活試驗(yàn) 將轉(zhuǎn)化的BD-ZjTCP20的Y2HGold酵母菌株涂于SD/-Trp平板上,比較BD和BD-ZjTCP20在培養(yǎng)基上菌落呈現(xiàn)的狀態(tài)。然后將轉(zhuǎn)化BD-TCP20載體成功的Y2HGold酵母涂于SD/-Trp、SD/-Trp/X-a-Gal、SD/-Trp/X-a-Gal/AbA培養(yǎng)基上,在30℃下孵育。觀察Y2HGold酵母菌株的生長狀態(tài)和菌株顏色進(jìn)行記錄及統(tǒng)計。

1.2.7實(shí)時熒光定量PCR 采集植物幼嫩葉片,成熟葉片和衰老葉片以及成熟的莖和根。對成熟葉片分別噴施10 μmol·L-1濃度的赤霉素及0.5 mmol·L-1濃度的水楊酸,取6個時間點(diǎn)0,1,3,6,12和24 h的葉片樣品。將上述所有樣品立即液氮速凍,并研磨提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄得到cDNA。內(nèi)參引物為ZjActin-F和ZjActin-R,設(shè)計特殊引物ZjTCP20-qPCR-F和ZjTCP20-qPCR-R按照試劑盒要求進(jìn)行實(shí)時熒光定量。

1.2.8數(shù)據(jù)分析 利用SPSS進(jìn)行顯著性分析(P<0.05),利用Microsoft Excel 2010繪圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 日本結(jié)縷草ZjTCP20基因的克隆

利用設(shè)計好的引物ZjTCP20-F和ZjTCP20-R對cDNA進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增出一條長624 bp的單一條帶,編碼208個氨基酸(圖1)。將其與T載相連,轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α,挑取在大腸桿菌單菌落,選擇符合長度要求的質(zhì)粒命名為pMD-ZjTCP20。

圖1 日本結(jié)縷草ZjTCP20基因的克隆Fig.1 Cloning of ZjTCP20 gene from Zoysia japonica注:A,ZjTCP20基因的PCR鑒定;B,ZjTCP20基因的cDNA序列及蛋白質(zhì)序列Note: A, PCR identification of ZjTCP20 gene;B,The cDNA sequence and protein sequence of the ZjTCP20 gene

2.2 日本結(jié)縷草ZjTCP20蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析

ZjTCP20分子式為C909H1397N277O287S7,由208個氨基酸組成,分子量為21.02 kD,理論等電點(diǎn)為5.55。在蛋白二級結(jié)構(gòu)組件中,隨機(jī)線圈占比高達(dá)69%,α螺旋占比為46%,β鏈的含量占比最少,為1%(圖2A)。蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)結(jié)果預(yù)測ZjTCP20蛋白由螺旋和環(huán)構(gòu)成(圖2B)。利用SignalP 4.1 網(wǎng)站預(yù)測ZjTCP20蛋白質(zhì),結(jié)果顯示無信號肽(圖2C)。ZjTCP20蛋白質(zhì)的疏水性圖譜如圖2D所示,數(shù)值大于0表示疏水性,小于0則表示親水性??偲骄H水性為-0.250,則ZjTCP20可能為親水蛋白。

圖2 日本結(jié)縷草ZjTCP20蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測Fig.2 Prediction structure of ZjTCP20 protein from Zoysia japonica注:A,ZjTCP20 蛋白的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測;B,ZjTCP20 蛋白的三級結(jié)構(gòu)預(yù)測;C,ZjTCP20信號肽預(yù)測;D,ZjTCP20蛋白疏水性圖譜Note:A,Prediction secondary structure of ZjTCP20 protein;B,Prediction tertiary structure of ZjTCP20 protein;C,Prediction signal peptide of ZjTCP20 protein;D,Prediction hydrophobicity map of ZjTCP20 protein

2.3 日本結(jié)縷草蛋白進(jìn)化樹及保守結(jié)構(gòu)域分析

MEGA 5.0 及TBtools對TCP20 同源蛋白進(jìn)行比對并繪制系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,結(jié)果顯示日本結(jié)縷草中的TCP20蛋白與玉米中ZmTCP20最相似(圖3)。蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析顯示TCP20蛋白內(nèi)有三段最為保守的結(jié)構(gòu)域,ZjTCP20 蛋白與BrTCP20 蛋白等其他TCP20蛋白相比缺少了一段蛋白結(jié)構(gòu)域(圖4)。

圖3 日本結(jié)縷草ZjTCP20蛋白的遺傳進(jìn)化樹分析Fig.3 Phylogenetic analysis of ZjTCP20 protein from Zoysia japonica注:RcTCP20表示QXP08756.1 月季(Rosa chinensis)TCP20-like,PhTCP20表示QZI95745.1 二球懸鈴木(Platanusx hispanica)TCP20-like,JcTCP20表示XP_012085729.1 麻風(fēng)樹(Jatropha curcas)TCP20-like,CmTCP20表示QBK47072.1 杭白菊(Chrysanthemum x morifolium)TCP20-like,DcTCP20表示PKU81455.1 鐵皮石斛(Dendrobium catenatum)TCP20-like,ZmTCP20表示NP_001142396.1 玉米(Zea mays)TCP20-like,AtTCP20表示OAP02465.1 擬南芥(Arabidopsis thaliana)TCP20-like,BrTCP20表示ATG83546.1 蕪菁(Brassica rapa subsp. Rapa)TCP20-likeNote:RcTCP20 stands for Rosa chinensis TCP20-like,PhTCP20 stands for QZI95745.1 Platanusx hispanica TCP20-like,JcTCP20 stands for XP_012085729.1 Jatropha curcas TCP20-like,CmTCP20 stands for QBK47072.1 Chrysanthemum x morifolium TCP20-like,DcTCP20 stands for PKU81455.1 Dendrobium catenatum TCP20-like,ZmTCP20 stands for NP_001142396.1 Zea mays TCP20-like,AtTCP20 stands for OAP02465.1 Arabidopsis thaliana TCP20-like,BrTCP20 stands for ATG83546.1 Brassica rapa subsp. Rapa TCP20-like

圖4 TCP20蛋白的保守結(jié)構(gòu)域分析Fig.4 The conserved motifs analysis of TCP20 proteins

2.4 日本結(jié)縷草ZjTCP20亞細(xì)胞定位分析

為研究ZjTCP20在細(xì)胞中的定位情況,將構(gòu)建完整的 35S-ZjTCP20-YFP載體轉(zhuǎn)化EHA105農(nóng)桿菌,注射本生煙草葉片,結(jié)果顯示ZjTCP20 蛋白定位在葉綠體、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核上(圖5)。

圖5 日本結(jié)縷草ZjTCP20 亞細(xì)胞定位情況Fig.5 Subcellular localization of ZjTCP20 from Zoysia japonica注:A,融合場;B,葉綠體自發(fā)熒光;C,激發(fā)光Note:A,Merged;B,Chloroplast autofluorescence;C,Ultraviolet field

2.5 酵母自激活檢測

轉(zhuǎn)入BD-TCP20載體、陽性對照pGBT9載體和陰性對照BD空載的Y2HGold酵母在SD/-Trp的培養(yǎng)基內(nèi)生長正常,且BD-TCP20和陽性對照在SD/-Trp/X-a-Gal培養(yǎng)基和SD/-Trp/X-a-Gal/AbA培養(yǎng)基內(nèi)可以正常生長,形成藍(lán)色菌斑(圖6A,6B),BD空載不能形成藍(lán)色菌斑(圖6C),證實(shí)ZjTCP20具備自激活活性。

2.6 日本結(jié)縷草ZjTCP20基因表達(dá)模式分析

通過RT-PCR試驗(yàn)研究日本結(jié)縷草ZjTCP20基因在不同組織器官、葉片不同發(fā)育時期及不同激素處理的表達(dá)模式。結(jié)果表明,該基因在葉片中大量表達(dá),且與根和莖的表達(dá)量有顯著差異(圖7A)。在葉片不同發(fā)育時期下,ZjTCP20基因在幼嫩葉片中大量表達(dá),隨植物生長基因表達(dá)量不斷下降(圖7B)。經(jīng)脫落酸(ABA)處理后,ZjTCP20基因的表達(dá)沒有顯著差異(圖7C),這表明ZjTCP20基因很可能不受ABA激素的誘導(dǎo)。經(jīng)水楊酸(SA)處理后,ZjTCP20表達(dá)量在噴施6 h后顯著下降,但總體沒有顯著差異(圖7D)。經(jīng)茉莉酸甲酯(MeJA)處理后,ZjTCP20表達(dá)量在3 h沒有顯著差異,但在6 h迅速升高,總體沒有顯著差異(圖7E)。

圖7 日本結(jié)縷草中的ZjTCP20的表達(dá)模式Fig.7 Expression patterns of ZjTCP20 in Zoysia japonica

3 討論

轉(zhuǎn)錄因子參與特定生理或生化過程的調(diào)控,在調(diào)控植物非生物逆境脅迫方面發(fā)揮重要作用[28]。TCP是植物所特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在諸多植物中被鑒定出來,參與調(diào)控植物的生長發(fā)育、衰老及逆境應(yīng)答等多個生物學(xué)過程[29-30]。根據(jù)氨基酸序列的差異,TCP轉(zhuǎn)錄因子可被分為Class Ⅰ和Class Ⅱ兩個亞家族,TCP20屬于Ⅰ類TCP轉(zhuǎn)錄因子中的成員[31]。本研究對日本結(jié)縷草ZjTCP20基因進(jìn)行克隆、生物信息學(xué)分析、自激活檢測及表達(dá)分析來探究ZjTCP20基因的特性。從日本結(jié)縷草中克隆得到ZjTCP20完整編碼區(qū)有624 bp,編碼208個氨基酸。蛋白分子量為21.02 kD,具有疏水性,但不具信號肽。構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹有利于研究生物的進(jìn)化關(guān)系,對TCP20同源蛋白進(jìn)行比對,繪制系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹顯示日本結(jié)縷草中的TCP20蛋白與玉米中ZmTCP20親緣關(guān)系最近[32]。亞細(xì)胞定位顯示ZjTCP20定位在葉綠體、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)。酵母雙雜交系統(tǒng)主要應(yīng)用于快速驗(yàn)證蛋白之間的相互作用,將構(gòu)建好的載體BD-TCP20 轉(zhuǎn)入酵母菌Y2HGold,其在SD/-Trp培養(yǎng)基上可以正常生長,且在SD/-Trp/X-a-Gal和SD/-Trp/X-a-Gal/AbA培養(yǎng)基上正常生長并形成藍(lán)色菌斑,其陽性對照pGBT9也可以形成藍(lán)色菌斑,而陰性對照BD空載不能形成藍(lán)色菌斑,證明ZjTCP20 可自激活,說明ZjTCP20不能用于酵母雙雜交系統(tǒng)。TCP轉(zhuǎn)錄因子的N末端擁有非典型螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH)結(jié)構(gòu)域,但TCP轉(zhuǎn)錄因子與bHLH轉(zhuǎn)錄因子沒有同源性,并結(jié)合不同于bHLH轉(zhuǎn)錄因子識別的DNA結(jié)構(gòu)域[14]。根據(jù)蛋白質(zhì)二、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測,ZjTCP20屬于非典型的bHLH蛋白。

研究顯示I類和II類TCP的分子機(jī)制可能在拮抗關(guān)系中發(fā)揮作用[7]。TCP20可能與它相互作用的蛋白TCP4,充當(dāng)靶基因轉(zhuǎn)錄的激活子或抑制子。TCP20等的I類TCP抑制茉莉酸生物合成基因LOX2(脂氧合酶2,LIPOXYGENASE2),II類TCP4則可以激活其表達(dá)。隨著TCP4豐度的增加,LOX2的表達(dá)量以及茉莉酸產(chǎn)量在葉片發(fā)育后期增加。在葉片發(fā)育的早期,茉莉酸通過抑制細(xì)胞增殖影響細(xì)胞增殖向細(xì)胞膨脹轉(zhuǎn)變,而在葉片發(fā)育的晚期,茉莉酸誘導(dǎo)葉片衰老(圖8)[16]。表達(dá)模式結(jié)果顯示,該基因在葉片中大量表達(dá),與根系和莖的表達(dá)量存在顯著差異,且相對于成熟和衰老葉片,ZjTCP20基因在幼嫩葉片中大量表達(dá),并與成熟和衰老葉片的基因表達(dá)量存在顯著差異。激素處理后,該基因不受脫落酸(ABA)誘導(dǎo),在水楊酸(SA)和茉莉酸甲酯(MeJA)的誘導(dǎo)下ZjTCP20基因表達(dá)總體沒有顯著差異。ZjTCP20響應(yīng)茉莉酸調(diào)控的相關(guān)研究有待后續(xù)試驗(yàn)進(jìn)行探究。后續(xù)研究中可通過研究表達(dá)模式及激素含量測定,探究ZjTCP20基因應(yīng)答茉莉酸的機(jī)制,為ZjTCP20基因的功能提供更多參考依據(jù)。

圖8 I類及II類TCP轉(zhuǎn)錄因子拮抗調(diào)控葉片發(fā)育模型Fig.8 Leaf development model for antagonistic regulation by Class I and Class II of TCP transcription factors注:I類TCP,TCP20,TCP9;II類TCP,TCP4Note:Class I TCP,TCP20,TCP9;Class II TCP,TCP4

4 結(jié)論

本試驗(yàn)將ZjTCP20基因從日本結(jié)縷草中成功克隆出,共624 bp,編碼208個氨基酸殘基。ZjTCP20蛋白預(yù)測結(jié)果表明該蛋白不具有信號肽,具有疏水性,通過蛋白質(zhì)二級、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測,發(fā)現(xiàn)其屬于非典型的bHLH蛋白。系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹顯示ZjTCP20蛋白與玉米ZmTCP20親緣關(guān)系最近。亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示其定位在葉綠體、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)。酵母雙雜交試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),載體BD-TCP20 在SD/-Trp培養(yǎng)基上可正常生長,在SD/-Trp/X-a-Gal和SD/-Trp/X-a-Gal/AbA培養(yǎng)基上生長且形成藍(lán)色菌斑,ZjTCP20可自激活。ZjTCP20表達(dá)模式分析顯示,該基因在葉片中大量表達(dá),且在幼嫩葉片中大量表達(dá),隨植物葉片發(fā)育該基因的表達(dá)量逐漸減少,但三種激素ABA,SA和MeJA不能誘導(dǎo)該基因顯著性表達(dá)。

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華人時刊(2020年15期)2020-12-14 08:10:36
蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域劃分方法及在線服務(wù)綜述
重組綠豆BBI(6-33)結(jié)構(gòu)域的抗腫瘤作用分析
組蛋白甲基化酶Set2片段調(diào)控SET結(jié)構(gòu)域催化活性的探討
GoldeneyeTM DNA身份鑒定系統(tǒng)25A試劑盒的法醫(yī)學(xué)驗(yàn)證
GlobalFiler~? PCR擴(kuò)增試劑盒驗(yàn)證及其STR遺傳多態(tài)性
TiO_2包覆Al_2O_3載體的制備及表征
泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域與泛素化信號的識別
牛結(jié)核病PCR診斷試劑盒質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)的研究
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