張英杰 劉民曉 孫紀(jì)霞 張京偉 郭文姣 呂曉惠 呂英民
關(guān)鍵詞:蝴蝶蘭;PhPIF4;生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑;GA3
中圖分類(lèi)號(hào):S688 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
蝴蝶蘭(Phalaenopsis spp.)是蘭科蝴蝶蘭屬植物的統(tǒng)稱,是我國(guó)銷(xiāo)售量最大的年宵盆花花卉,也是國(guó)際暢銷(xiāo)的盆花種類(lèi)[1-2]。我國(guó)蝴蝶蘭盆花上市時(shí)間主要在春節(jié)前,因此蝴蝶蘭花期精準(zhǔn)調(diào)控尤為重要。目前在擬南芥中,已確定了6 個(gè)調(diào)控開(kāi)花時(shí)間的途徑:光周期、春化、赤霉素、溫度、自主和年齡途徑[3-10]。本課題組在前期蝴蝶蘭成花轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中挖掘了大量的成花途徑關(guān)鍵基因,其中PhPIF4 基因在成花途徑中表達(dá)量顯著增加(未發(fā)表數(shù)據(jù)),成花轉(zhuǎn)變(抽梗)和小花原基分化期(花梗長(zhǎng)10 cm)基因FPKM 值,較低溫處理前增長(zhǎng)了22 倍和38 倍。PIF(phytochromeinteracting factor)蛋白是一類(lèi)能夠與激活狀態(tài)的光敏色素phyB 互作進(jìn)而響應(yīng)光信號(hào)的bHLH(basic helix–loop–helix)類(lèi)型轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長(zhǎng)發(fā)育中起到“樞紐”作用,參與植物體內(nèi)多信號(hào)通路調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育[11]。在植物體內(nèi),PIF 可能通過(guò)整合光和溫度[12] 2 種關(guān)鍵的環(huán)境信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,參與生物鐘對(duì)內(nèi)源激素信號(hào)網(wǎng)絡(luò)的調(diào)控,使植物能夠迅速地適應(yīng)周?chē)沫h(huán)境并精確調(diào)控其發(fā)育進(jìn)程。研究發(fā)現(xiàn),在高溫條件下,PIF4、生長(zhǎng)素和植物伸長(zhǎng)生長(zhǎng)之間存在直接的分子聯(lián)系[13]。正常的生長(zhǎng)素反應(yīng)需要赤霉素(GA)的促進(jìn)作用[14]。PIF4 通過(guò)與DELLA 互作影響赤霉素的合成與功能發(fā)揮[15]。由PIF4 介導(dǎo)的生長(zhǎng)素和GA 的串?dāng)_作用也可能作用于植物成花。因此,PIF4 可能在光、溫度和激素等多途徑成花復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中扮演重要角色。
本研究通過(guò)對(duì)蝴蝶蘭成花轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析挖掘出來(lái)的PhPIF4 基因進(jìn)行克隆和生物信息學(xué)分析,以及對(duì)生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑GA3 的響應(yīng)表達(dá)分析,以期闡明PhPIF4 基因的調(diào)控機(jī)制,對(duì)蝴蝶蘭遺傳改良、生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑的應(yīng)用技術(shù)提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 材料
供試蝴蝶蘭品種大辣椒(Big Chilli)引自廈門(mén)和鳴花卉科技有限公司,在山東省煙臺(tái)市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院內(nèi)栽培2 年。選用健康、無(wú)病蟲(chóng)害、長(zhǎng)勢(shì)基本一致的4 葉1 心的成熟苗進(jìn)行試驗(yàn)。
1.2 方法
1.2.1 PhPIF4 基因序列的獲取與分析 PhPIF4基因序列源自本實(shí)驗(yàn)室的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(NCBI ShortRead Achieve 數(shù)據(jù)庫(kù)中登錄號(hào):PRJNA783677,>TRINITY_DN38810_c0_g1_i3_3_2)。利用BLAST網(wǎng)站預(yù)測(cè)PIF4 氨基酸序列中的保守結(jié)構(gòu)域。用DNAMAN(version 7)軟件進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)和保守結(jié)構(gòu)域分析,通過(guò)clustal X 軟件進(jìn)行氨基酸序列同源性比較,通過(guò)GeneDoc 繪制多重序列比對(duì)圖,利用MEGA 5.0 系統(tǒng)進(jìn)化分析軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。通過(guò)ExPASy(http://expasy.org/cgibin/pi_tool)在線軟件分析蛋白質(zhì)的分子量和理論等電點(diǎn),利用SignalP4.0Server 軟件分析蛋白信號(hào)肽,利用SOPMA 分析蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu),利用Phyre2分析蛋白三維結(jié)構(gòu)。
1.2.2 亞細(xì)胞定位 將整個(gè)PhPIF4 編碼區(qū)擴(kuò)增并克隆到pBWA(V)HS-GLosgfp 中,酶切連接后將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)。用酶解液制備擬南芥幼苗葉片細(xì)胞原生質(zhì)體,然后在PEG-4000的作用下將pBWA(V)HS-PhPIF4-GLosgfp 和pBWA(V)HS-GLosgfp 導(dǎo)入原生質(zhì)體。采用激光共聚焦顯微鏡(Nikon C2-ER)觀察PhPIF4 定位。
1.2.3 生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑對(duì)成花的影響 試驗(yàn)組在轉(zhuǎn)入低溫處理2 h 和10、20、30 d 后分別噴施GA3 ( T1:100 mg/L,T2:200 mg/L,T3:300 mg/L)、6-BA(T4:100 mg/L,T5:200 mg/L,T6:300 mg/L),100 mg/L GA3+100 mg/L 6-BA(T7)及300 mg/LGA3+300 mg/L 6-BA(T8)共8 組處理,清水為對(duì)照(CK)。每組處理15 株,每株噴施5 mL,主要噴施第3 和第4 葉基部,設(shè)3 次重復(fù)。統(tǒng)計(jì)第1 朵花的開(kāi)放和凋謝日期、花梗長(zhǎng)度和花量。用Microsoft Excel 2010 軟件處理數(shù)據(jù)及制圖,用SPSS 19.0 軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
1.2.4 PhPIF4 基因時(shí)空表達(dá)及響應(yīng)GA3 表達(dá) 在蝴蝶蘭DBB(潛伏芽期,低溫處理前20 d)、IFB(花序原基分化期,花芽0.5~1 cm)、FBD(小花原基分化期,花梗10 cm)、FB(現(xiàn)蕾期,花梗30 cm)4 個(gè)時(shí)期分別取噴施GA3 300 mg/L 處理組及對(duì)照組的芽點(diǎn)(潛伏芽、花芽和花梗頂端0.5 cm)、葉片和根尖進(jìn)行qRT-PCR。使用RNA提取試劑盒提取各組織的總RNA,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA 第一鏈,并以cDNA 為模板進(jìn)行qRT-PCR。引物PIF4(+) : GTTCCAATACCACCCTTAC ,PIF4(–):GTCAG CGGAAATAATAGTCTGT。每個(gè)RT 反應(yīng)分2 步。第1 步將0.5 μg RNA、2 μL4×gDNA wiper Mi,加入無(wú)核酸酶的H2O 至8 μL。在GeneAmp? PCR System 9700 (Applied Biosystems,USA)中,42 ℃下反應(yīng)2 min。第2 步加入2 μL 的5×HiScript II Q RT SuperMix IIa,反應(yīng)在GeneAmp PCR System 9700(Applied Biosystems,USA)中進(jìn)行,50 ℃下反應(yīng)15 min,85 ℃下反應(yīng)5 s。然后將10 μL 的RTRT reaction mix用nuclease-free water 稀釋10 倍,–20 ℃保存。采用LightCycler? 480 Ⅱ Real-time PCR Instrument(Roche, Swiss)進(jìn)行Real-time PCR,PCR 反應(yīng)混合物為10 μL,其中cDNA1 μL,2×ChamQ SYBRqPCR Master Mix 5 μL,正引物0.2 μL,反引物0.2 μL,nuclease-free water 3.6 μL。在384 孔光學(xué)板(Roche, Swiss)中95 ℃培養(yǎng)30 s,然后進(jìn)行40 個(gè)循環(huán),95 ℃培養(yǎng)10 s,60 ℃培養(yǎng)30 s。每個(gè)樣本重復(fù)3 次。據(jù)擴(kuò)增曲線確定基因的Ct 值,表達(dá)量的計(jì)算采用2-ΔΔCT 法。
2 結(jié)果與分析
2.1 PhPIF4 基因序列分析
蝴蝶蘭大辣椒PhPIF4 基因ORF 全長(zhǎng)為539 bp,編碼176 個(gè)氨基酸。ProtParam 軟件分析表明PhPIF4 分子式為C854H1333N241O250S17,分子量為19 521.46;理論等電點(diǎn)(pI)為7.05,其中包含正電殘基(Asp+Glu)8 個(gè)、負(fù)電殘基(Arg+ Lys)8 個(gè),理論半衰期為體外哺乳動(dòng)物網(wǎng)織紅細(xì)胞30 h、在酵母體內(nèi)>20 h、在大腸桿菌體內(nèi)>10 h,不穩(wěn)定指數(shù)是67.48,脂溶指數(shù)是68.24,屬于不穩(wěn)定蛋白,平均親水性值為-0.38,為兩性蛋白,編碼蛋白不含信號(hào)肽。對(duì)其二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)的分析發(fā)現(xiàn),PhPIF4 蛋白中不規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu)所占比例為78%,α-螺旋比例為35%,β-轉(zhuǎn)角為0%(圖1)。利用NCBI網(wǎng)站進(jìn)行保守結(jié)構(gòu)域分析,發(fā)現(xiàn)PhPIF4 基因編碼的氨基酸具有bHLH_SF super family(cl00081)同源異型盒家族的典型保守結(jié)構(gòu)域(圖2)。將PhPIF4氨基酸序列與小蘭嶼蝴蝶蘭(Phalaenopsis equestris,PhaPIF4, XP_020586384.1) 、建蘭(Cymbidiumensifolium, CyPIF4, QDL88406.1 ) 、墨蘭(Cymbidium sinense, CymPIF4, QDH08906.1)、石斛蘭( Dendrobium catenatum, DePIF13,XP_020694614.2 ) 、鼓槌石斛( Dendrobiumchrysotoxum, DeIEQ34, KAH0453999.1)進(jìn)行比對(duì),并與15 個(gè)物種PIF4 建立系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果表明,大辣椒PhPIF4 與小蘭嶼蝴蝶蘭親緣關(guān)系較近,其次為建蘭、墨蘭和石斛蘭(圖3)。
2.2 PhPIF4 亞細(xì)胞定位分析
在瞬時(shí)轉(zhuǎn)化35S-GFP 空載體的擬南芥原生質(zhì)體中,GFP 基因大量表達(dá),綠色熒光信號(hào)在細(xì)胞質(zhì)、質(zhì)膜和細(xì)胞核中均有分布。而在瞬時(shí)轉(zhuǎn)化35S-PIF4-GFP 的擬南芥原生質(zhì)體中,綠色熒光信號(hào)主要分布于細(xì)胞器上,細(xì)胞質(zhì)、葉綠體和細(xì)胞核中均未檢測(cè)到明顯的熒光信號(hào),表明PhPIF4 蛋白定位于非葉綠體的細(xì)胞器中(圖4)。
2.3 生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑GA3對(duì)成花的影響
不同濃度GA3 處理均增加了蝴蝶蘭花梗長(zhǎng)度,使花期提前9~11 d,但對(duì)花徑和花量均無(wú)顯著影響?;üW铋L(zhǎng)的處理組是200 mg/L GA3,然而不同濃度GA3 處理的花梗長(zhǎng)度增加的差異不顯著。6-BA 可顯著增加蝴蝶蘭花量,花量最多的處理組為300 mg/L 6-BA,但6-BA 對(duì)花期和花梗長(zhǎng)度無(wú)顯著作用。GA3 和6-BA 混合使用時(shí),對(duì)蝴蝶蘭開(kāi)花時(shí)間和花期的影響介于二者之間(圖5)。
2.4 PhPIF4 基因表達(dá)量分析
在蝴蝶蘭花發(fā)育過(guò)程中,PhPIF4 基因在花芽、葉和根中的表達(dá)量變化不同(圖6)。在花芽中表達(dá)量變化相對(duì)較小,在葉片中表達(dá)量逐漸增加,在根中增加最顯著,F(xiàn)B 期較DBB 期增加了10 倍以上。但不論在哪種器官中,該基因均在FB 期表達(dá)量最大。噴施生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑GA3 后,PhPIF4 基因在花芽、葉和根中的表達(dá)量均有所增加,且在FB 期增加量最大,表明PhPIF4 基因的表達(dá)可能受GA3 影響與調(diào)控。
3 討論
在蝴蝶蘭生產(chǎn)栽培中,低溫、長(zhǎng)日照和植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑是重要的催花技術(shù)手段。夜間18~20 ℃、白天23~26 ℃的相對(duì)低溫處理40~50 d[16]以及增強(qiáng)光照可提前蝴蝶蘭的自然花期以供應(yīng)我國(guó)年宵用花。光照可促進(jìn)蝴蝶蘭成花,光周期對(duì)蝴蝶蘭開(kāi)花的影響不明顯,但增加光強(qiáng)可增加花序數(shù)量,加速抽梗[17]。降低光輻照可以延緩蝴蝶蘭的花梗發(fā)育,從而推遲蝴蝶蘭的開(kāi)花時(shí)間[18]。這可能與蝴蝶蘭屬于景天酸代謝(CAM)植物有關(guān),CAM受晝夜節(jié)律和光質(zhì)[19]影響。擬南芥中許多bHLH轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)具有晝夜節(jié)律性,如bHLH69 和bHLH92[20]。bHLH 轉(zhuǎn)錄因子家族的PIFs 可以通過(guò)與遠(yuǎn)紅光吸收型光敏色素互作來(lái)調(diào)控植物開(kāi)花,其中,PIF4 和PIF5 的表達(dá)具有節(jié)律性,可能通過(guò)與節(jié)律鐘基因的相互作用來(lái)調(diào)控植物的生長(zhǎng)和開(kāi)花[21]。受光照激活的光敏色素既可以通過(guò)光誘導(dǎo)的磷酸化作用與PIFs 蛋白互作,也可與其直接互作,誘導(dǎo)PIFs 蛋白迅速降解[22-24]。同時(shí)光敏色素還可以通過(guò)調(diào)控COP1 ( constitutivelyphotomorphogenic 1)-SPA(suppressor of phytochromeA)復(fù)合體的活性,間接影響PIFs 蛋白的穩(wěn)定性[25-26],降低PIFs 的表達(dá)水平。PIFs 能夠結(jié)合生物鐘的核心組件CCA1/LHY 啟動(dòng)子的G-box 區(qū)域,參與生物鐘的調(diào)節(jié)[27]。本研究發(fā)現(xiàn)PhPIF4 基因編碼的氨基酸具有bHLH_SF superfamily(cl00081)同源異型盒家族的典型保守結(jié)構(gòu)域,bHLH 家族是植物中第二大類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子家族,參與植物不同組織眾多代謝過(guò)程的調(diào)控,在植物光信號(hào)傳導(dǎo)、抗逆脅迫和次生代謝等過(guò)程中發(fā)揮重要作用。本研究發(fā)現(xiàn)PhPIF4 與蝴蝶蘭花發(fā)育過(guò)程緊密相關(guān),隨著花發(fā)育其表達(dá)量逐漸加倍,但其與光敏色素和節(jié)律鐘基因的互作關(guān)系有待進(jìn)一步研究驗(yàn)證。
生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑可影響蝴蝶蘭成花轉(zhuǎn)變。赤霉素被認(rèn)為是促進(jìn)蝴蝶蘭花芽分化與花期提前最重要的生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑[28-29]。鄭錦凱等[30]研究發(fā)現(xiàn)250、500、1000 mg/mL 赤霉素處理后蝴蝶蘭花期分別提前了5、9、17 d。此外,GA 可有效提高蝴蝶蘭雙梗率、花芽分化率和分枝率[31],可代替環(huán)境信號(hào)來(lái)縮短植物的開(kāi)花時(shí)間。BLANCHARD 等[32]研究發(fā)現(xiàn)單獨(dú)噴施200 mg/L 或400 mg/L BA(0.2 L/m2)的植株比未處理的植株早3~9 d 出現(xiàn)明顯的花序,平均每株多0.7~3.5 個(gè)花序、多3~8朵花,但BA 不能完全替代低溫誘導(dǎo)。BA+GA 處理對(duì)不同速率下的花序數(shù)和總花數(shù)均無(wú)顯著影響。劉曉榮[31]研究發(fā)現(xiàn)蝴蝶蘭大花品種2048 對(duì)植物生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑較小花品種如滿天紅更敏感,10 mg/L 6-BA 顯著增加了花芽分化速度, 而25 mg/L 與對(duì)照差異不顯著。涂抹花芽處理試驗(yàn)中,25 mg/L 和50 mg/L 6-BA、50 mg/L GA 均提高了雙梗率。因此不同激素聯(lián)合處理蝴蝶蘭的成花作用效果在品種間存在差異。本研究?jī)H針對(duì)大辣椒品種展開(kāi)試驗(yàn),發(fā)現(xiàn)GA3 處理增加了花梗長(zhǎng)度,并使花期提前。6-BA 可顯著增加蝴蝶蘭花量,但對(duì)花期和花梗長(zhǎng)度無(wú)顯著作用。2 種激素聯(lián)合使用效果介于二者之間。
植物成花過(guò)程赤霉素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路主要包括GID1、DELLA蛋白以及介導(dǎo)DELLA蛋白降解的其他調(diào)控因子。當(dāng)GA 在細(xì)胞外的濃度較高時(shí),GA 上的C 端結(jié)構(gòu)域會(huì)與GID1 結(jié)合,從而引發(fā)一系列相關(guān)應(yīng)答反應(yīng);當(dāng)細(xì)胞外GA 濃度低時(shí),GA則不與GID1 結(jié)合,這時(shí)GA 應(yīng)答基因與DELLA蛋白結(jié)合,并被其抑制活性[33]。擬南芥PIF1 能夠與2 個(gè)DELLA 蛋白基因RGA1 和GAI 的啟動(dòng)子結(jié)合抑制黑暗中種子萌發(fā)[34]。擬南芥DELLA蛋白通過(guò)抑制PIF4 的活性,調(diào)節(jié)植物開(kāi)花時(shí)間,在缺乏DELLA 蛋白時(shí)植物會(huì)表現(xiàn)出提前開(kāi)花的表型[35]。GA 降解DELLA 蛋白,在GA 缺乏的植株中,DELLA 蛋白積累,PIF4 的活性被抑制,抑制FT 相關(guān)基因的表達(dá),導(dǎo)致開(kāi)花延遲[36]。本研究中,噴施生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑GA3 后,PhPIF4 基因在花芽、葉和根中的表達(dá)量均有所增加,且在FB 期表達(dá)量最大,表明PhPIF4 基因的表達(dá)可能受GA3影響與調(diào)控。但赤霉素是直接調(diào)控PhPIF4,還是通過(guò)赤霉素調(diào)節(jié)DELLA 蛋白含量,使DELLA 蛋白與PIF4 蛋白互作,進(jìn)而間接調(diào)節(jié)PhPIF4 的表達(dá)量,仍有待進(jìn)一步研究。
PIF 基因在植物生長(zhǎng)發(fā)育中起到“樞紐”作用[37],本文研究了GA3 等生長(zhǎng)調(diào)節(jié)劑對(duì)蝴蝶蘭生殖生長(zhǎng)的影響,探究了PhPIF4 基因響應(yīng)赤霉素的表達(dá)情況,為揭示其在蝴蝶蘭生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中的作用奠定基礎(chǔ),進(jìn)一步完善PhPIF4 在赤霉素調(diào)控生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為其遺傳育種應(yīng)用做準(zhǔn)備。