李亞楠,李絲雨,劉國秀,李易軒,季志紅 ,李柯翱 ,于靜 ,王燕平 ,翟華強(qiáng),,王永炎
1.北京中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,北京 102488;2.北京中醫(yī)藥大學(xué)中藥調(diào)劑標(biāo)準(zhǔn)化研究中心,北京 102488;3.新奇康藥業(yè)股份有限公司,新疆 烏魯木齊 830011;4.新疆醫(yī)科大學(xué)維吾爾醫(yī)學(xué)院,新疆 烏魯木齊 830011;5.中國中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)臨床基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所,北京 100700
祖卡木顆粒收載于《中華人民共和國衛(wèi)生部藥品標(biāo)準(zhǔn)·維吾爾藥分冊》,是《國家基本藥物目錄(2018版)》《國家急(搶)救藥品直接掛網(wǎng)采購示范藥品目錄》收錄的維藥重點(diǎn)品種,發(fā)展歷史悠久,臨床療效優(yōu)良,臨床價(jià)值突出[1]。祖卡木顆粒對上呼吸道感染療效良好,且被新疆維吾爾自治區(qū)衛(wèi)生健康委員會列為治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的推薦方藥[2]。在COVID-19發(fā)生過程中,新型冠狀病毒感染會引起機(jī)體肺部免疫細(xì)胞的過度激活,導(dǎo)致急性肺損傷(acute lung injury,ALI)[3]。ALI發(fā)病率和病死率高、預(yù)后差,給全球公共衛(wèi)生事業(yè)帶來巨大挑戰(zhàn)[4]。前期研究表明,祖卡木顆粒對肺損傷具有抗炎和免疫調(diào)節(jié)作用,其作用機(jī)制可能與TLR4/MyD88/NF-κB 信號通路[5]及調(diào)節(jié)Th1/Th2平衡有關(guān)[6]。
目前,系統(tǒng)生物信息學(xué)已成為一種成熟的方法用于在分子水平上系統(tǒng)揭示中藥復(fù)方治療疾病的物質(zhì)基礎(chǔ)和藥效機(jī)制研究。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)構(gòu)建了多組分和多靶點(diǎn)模型,能夠更好地闡明疾病和藥物相關(guān)的基因、蛋白質(zhì)和代謝物之間的復(fù)雜相互作用,十分適合研究中藥的復(fù)雜作用機(jī)制[7]。GEO數(shù)據(jù)庫具有真實(shí)臨床樣本的基因芯片數(shù)據(jù),可通過篩選正常組和疾病組的差異表達(dá)基因(DEGs)反映疾病分子生物學(xué)特征[8]。本研究聯(lián)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和GEO數(shù)據(jù)芯片,預(yù)測祖卡木顆粒治療ALI的主要生物活性化合物、潛在靶點(diǎn)和信號通路,揭示其可能的分子作用機(jī)制,并通過動(dòng)物體內(nèi)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行初步驗(yàn)證,旨在闡釋祖卡木顆粒治療ALI可能的作用機(jī)制。
通過TCMSP (https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)[9]查詢祖卡木顆粒中6味組方藥物薄荷、甘草、罌粟殼、大棗、山柰、大黃的化學(xué)成分,并以口服生物利用度(OB)≥30%且類藥性(DL)≥0.18為條件進(jìn)行成分篩選。對于TCMSP數(shù)據(jù)庫未收錄的4味藥物睡蓮花、破布木果、蜀葵子、洋甘菊,通過中國知網(wǎng)(CNKI)、萬方數(shù)據(jù)知識服務(wù)平臺、PubMed數(shù)據(jù)庫檢索其化學(xué)成分,并以CAS號或標(biāo)準(zhǔn)化學(xué)名稱于TCMSP數(shù)據(jù)庫中檢索,收集并整理其基本化學(xué)信息。通過TCMSP 和SwissTargetPrediction 平臺(http://www.swisstargetprediction.ch/)預(yù)測祖卡木顆粒活性成分的靶點(diǎn)信息,匯總所有靶點(diǎn)信息,使用UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)uqf 靶點(diǎn)蛋白信息轉(zhuǎn)化為標(biāo)準(zhǔn)基因名,設(shè)置靶點(diǎn)種屬來源為“Homo Sapiens”(人類),獲得祖卡木顆粒的作用靶點(diǎn)。
通過GeneCards(https://www.genecards.org/)和OMIM(https://omim.org/)數(shù)據(jù)庫檢索“Acute lung injury”,并以相關(guān)性評分(relevance score)取3倍中位數(shù)為篩選條件選取GeneCards數(shù)據(jù)庫獲得的靶點(diǎn),對2個(gè)數(shù)據(jù)庫得到的靶點(diǎn)進(jìn)行合并、去重后得到ALI的疾病靶點(diǎn)。
在GEO 數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)以“Acute lung injury”為關(guān)鍵詞搜索,選擇種屬為“Homo Sapiens”(人類),下載編號為GSE10474[10]、GSE2322[11]、GSE3037[12]的芯片數(shù)據(jù),以獲得ALI和正常樣本的mRNA表達(dá)譜。利用GEO2R在線分析平臺進(jìn)行數(shù)據(jù)集的差異分析,并以|logFC|>1、P<0.05為條件篩選DEGs,對3個(gè)數(shù)據(jù)集的DEGs進(jìn)行合并和去重,獲得ALI 的DEGs。使用Sangerbox3.0(http://vip.sangerbox.com/login.html)的生信繪制工具包繪制DEGs火山圖和熱圖。
運(yùn)用jvenn 在線工具(http://www.bioinformatics.com.cn/static/others/jvenn/example.html)對祖卡木顆粒的潛在作用靶點(diǎn)與ALI相關(guān)靶點(diǎn)和顯著差異基因同時(shí)取交集,三者的交集基因即為祖卡木顆粒治療ALI的關(guān)鍵靶點(diǎn)。
使用STRING(https://cn.string-db.org/)數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行分析,將Organism(種屬)設(shè)為“Homo Sapiens”(人類),置信度設(shè)置為0.4,下載蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)的TSV 文件,并利用Cytoscape3.7.2軟件繪制PPI網(wǎng)絡(luò)圖。通過MCODE插件進(jìn)行模塊分析,高級選項(xiàng)設(shè)置為節(jié)點(diǎn)評分cutoff=0.2、程度cutoff=2、K-core=2,最大深度=100。利用CytoHubba插件選取PPI網(wǎng)絡(luò)中最大團(tuán)中心度(MCC)排序前10位節(jié)點(diǎn)作為核心靶點(diǎn)。
通過DAVID 數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/)對關(guān)鍵靶點(diǎn)進(jìn)行富集分析,設(shè)置篩選條件為P<0.05,分別選取生物過程(BP)、分子功能(MF)、細(xì)胞組成(CC)中P值排名前10 位條目及P值排名前20 位KEGG信號通路,利用微生信網(wǎng)站進(jìn)行可視化分析。
利用Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建中藥-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)和關(guān)鍵靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò),并計(jì)算每個(gè)節(jié)點(diǎn)(成分、靶點(diǎn)、通路)的度值。
1.8.1 動(dòng)物
SPF級SD雄性大鼠42只,體質(zhì)量180~200 g,購自北京斯貝福實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司,動(dòng)物生產(chǎn)許可證號SYXK(京)2020-0033。飼養(yǎng)于北京中醫(yī)藥大學(xué)動(dòng)物飼養(yǎng)中心恒溫(24~26 ℃)、恒濕(30%~40%)環(huán)境,自由攝食飲水,適應(yīng)性飼養(yǎng)1周后進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)已通過北京中醫(yī)藥大學(xué)動(dòng)物倫理委員會批準(zhǔn)(BUCM-4-2022011901-1098)。
1.8.2 儀器與試藥
WZ-0C6微量注射泵(浙江史密斯醫(yī)學(xué)儀器有限公司),SorvallST8R高速冷凍離心機(jī)(賽默飛世爾科技有限公司),QB-9002 微量快速震蕩儀(Kylin-Bell Lab Instruments),EG1160 生物組織包埋機(jī)(德國Leica),2720型PCR儀(美國ABI),RM2016病理切片機(jī)(德國Leica),system electrophoresis Mupid(Mupid 2plus)電泳槽(日本TaKaRa),vortex mixer(Voltex-Genie2)漩渦混合器(美國SI),Roche LightCycler?480 Ⅱ?qū)崟r(shí)熒光定量PCR 系統(tǒng)(瑞士Roche),倒置光學(xué)顯微鏡(日本Nikon)。
祖卡木顆粒(6 g/袋、無蔗糖,新奇康藥業(yè)股份有限公司,批號201140),醋酸地塞米松片(0.75 mg×100片,天津天藥藥業(yè)股份有限公司,批號CD200410b01),脂多糖(10 mg/瓶,Sigma,批號20220314),注射用青霉素鈉(160萬單位/瓶,江西省科達(dá)動(dòng)物藥業(yè)有限公司,批號20200917),組織細(xì)胞固定液(500 mL/瓶,北京百瑞極生物科技有限公司,批號20211213)。
1.8.3 分組及給藥
將42只大鼠隨機(jī)分為造模后6 h組和72 h組,再分別分成4個(gè)亞組,即假手術(shù)組、模型組、地塞米松組和祖卡木顆粒組,給藥組分別予相應(yīng)藥物進(jìn)行預(yù)防性治療。祖卡木顆粒組予祖卡木顆?;鞈乙海厮渲疲?.25 g/mL)1.62 g/kg灌胃,地塞米松組予醋酸地塞米松混懸液0.5 mg/kg灌胃,假手術(shù)組和模型組均予生理鹽水灌胃(4 mL/kg),1次/d,連續(xù)5 d。
1.8.4 造模
末次給藥1 h后,除假手術(shù)組外,其余各組使用微量注射泵以脂多糖(5 mg/kg)氣管滴入法復(fù)制ALI模型,使藥物均勻分布于肺組織。假手術(shù)組予等量生理鹽水。造模結(jié)束后用醫(yī)用縫合針線縫合好傷口后,使用75%醫(yī)用酒精進(jìn)行消毒并腹腔注射青霉素鈉以防止感染。
1.8.5 取材
分別于造模后6、72 h進(jìn)行取材。使用1%戊巴比妥鈉(30 mg/kg)將大鼠麻醉后通過腹主動(dòng)脈取血的方式處死。摘取大鼠肺臟,用生理鹽水洗凈表層血跡并用濾紙吸干表層液體,于4%多聚甲醛固定液中固定右肺中葉,其余葉片于液氮中急凍后轉(zhuǎn)存于-80 ℃?zhèn)溆谩?/p>
1.8.6 HE染色觀察與評價(jià)
肺組織樣本固定24 h后制作HE染色切片,于顯微鏡下鏡檢并拍照。參照2011年美國胸科學(xué)會病理評分方法[13]對肺組織損傷進(jìn)行評分,評估指標(biāo)包括肺泡壁塌陷、肺泡間隔增厚、肺間質(zhì)水腫、炎性細(xì)胞浸潤和出血,按病變程度輕重分別計(jì)0~4分,計(jì)算總分。
1.8.7 RT-qPCR檢測
取存于-80 ℃肺組織,用Trizol提取樣品RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA,RT-qPCR 分別檢測造模后6 h 肺組織CD14 mRNA表達(dá)和造模后72 h肺組織CD80、CD86 mRNA表達(dá)。引物由北京天一輝遠(yuǎn)生物科技有限公司提供,引物序列見表1。
表1 各基因引物序列
1.8.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
使用GraphPad Prism 7軟件進(jìn)行分析。計(jì)量資料用-±s表示,符合正態(tài)分布樣本組間比較采用方差分析,并進(jìn)行方差齊性檢驗(yàn)。P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
通過TCMSP獲取薄荷、甘草、罌粟殼、大棗、山柰、大黃6味藥物化學(xué)成分信息,篩選得到各藥物活性成分,分別為薄荷10個(gè)、甘草92個(gè)、罌粟殼11個(gè)、大棗29個(gè)、山柰2個(gè)、大黃15個(gè)。通過檢索已發(fā)表文獻(xiàn)獲取睡蓮花、破布木果、蜀葵子、洋甘菊化學(xué)成分信息,經(jīng)過篩選獲得活性成分,分別為睡蓮花8個(gè)、破布木果9個(gè)、蜀葵子7個(gè)、洋甘菊5個(gè)。匯總10味藥物的所有活性成分,刪除重復(fù)成分,共獲得祖卡木顆粒活性成分174個(gè)。匯總174個(gè)成分的作用靶點(diǎn),刪去重復(fù)靶點(diǎn)后共得到825個(gè)作用靶點(diǎn),見表2。
表2 祖卡木顆粒藥物活性成分和靶點(diǎn)數(shù)
通過OMIM、GeneCards數(shù)據(jù)庫分別獲得ALI靶點(diǎn)354、7 504個(gè),對relevance score取3倍中位數(shù),得到990個(gè)靶點(diǎn),合并、去重后獲得1 253個(gè)ALI相關(guān)基因。
利用GE02R 在線工具對數(shù)據(jù)集進(jìn)行差異分析,GSE10474數(shù)據(jù)集共得到DEGs 231個(gè)(P<0.05),其中上調(diào)基因146個(gè),logFC>1的有4個(gè);下調(diào)基因85個(gè),logFC<-1的有8個(gè)。GSE3037數(shù)據(jù)集共獲取DEGs 438個(gè)(P<0.05),其中上調(diào)基因283個(gè),logFC>1的有58個(gè);下調(diào)基因155個(gè),logFC<-1的有3個(gè)。GSE2322數(shù)據(jù)集共得到差異基因1 370 個(gè)(|logFC|>1、P<0.05),上調(diào)基因485個(gè),去重后得到365個(gè);下調(diào)基因885個(gè),去重后得到682個(gè)。匯總3個(gè)數(shù)據(jù)集的DEGs,去重后獲得1 084個(gè)。見圖1。
圖1 GEO數(shù)據(jù)庫3個(gè)數(shù)據(jù)集差異表達(dá)基因
將祖卡木顆粒藥物靶點(diǎn)與ALI的疾病靶點(diǎn)、DEGs分別取交集,其中祖卡木顆粒藥物靶點(diǎn)與ALI疾病靶點(diǎn)有264個(gè)交集,交集靶點(diǎn)與DEGs取交集得到46個(gè)表達(dá)具有顯著差異的基因,作為祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn),韋恩圖見圖2。關(guān)鍵靶點(diǎn)的表達(dá)信息見表3,顯著上調(diào)和下調(diào)的基因各23個(gè)。
圖2 祖卡木顆粒藥物靶點(diǎn)-ALI靶點(diǎn)差異基因韋恩圖
表3 祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn)差異表達(dá)信息
關(guān)鍵靶點(diǎn)PPI 網(wǎng)絡(luò)(見圖3A)包含46 個(gè)靶點(diǎn)和487條邊。根據(jù)CytoHubba(MCC算法)篩選前10位靶點(diǎn)作為核心靶點(diǎn)(見圖3B),得出該網(wǎng)絡(luò)核心蛋白質(zhì)。根據(jù)MCODE模塊分析得到2個(gè)模塊(見圖4)。模塊1包含26個(gè)靶點(diǎn),得分為13.52分;模塊2包含11個(gè)靶點(diǎn),得分為9分。
圖3 祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn)PPI網(wǎng)絡(luò)與核心靶點(diǎn)
圖4 祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn)MCODE模塊分析
關(guān)鍵靶點(diǎn)GO富集分析得到394個(gè)條目,其中BP條目327個(gè),涉及炎癥反應(yīng)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、基因表達(dá)的正調(diào)控、凋亡、細(xì)胞對脂多糖的反應(yīng)等;CC條目30個(gè),與細(xì)胞質(zhì)、質(zhì)膜、細(xì)胞外隙等有關(guān);MF條目37個(gè),與蛋白質(zhì)結(jié)合、金屬離子結(jié)合相關(guān)。P值前10位條目見圖5。
圖5 祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn)GO富集分析
關(guān)鍵靶點(diǎn)KEGG通路富集分析得到137條信號通路(P<0.05),包括晚期糖基化產(chǎn)物-晚期糖基化終末產(chǎn)物受體(AGE-RAGE)、腫瘤壞死因子(TNF)、白細(xì)胞介素(IL)-17、Toll樣受體、NOD樣受體等信號通路,P值前20位信號通路見圖6。祖卡木顆粒治療ALI的機(jī)制可能與上述信號通路密切相關(guān)。
圖6 祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn)KEGG通路富集分析
祖卡木顆粒治療ALI的活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)見圖7,根據(jù)度值大小對活性成分進(jìn)行排序,前3位活性成分為槲皮素、蘆丁、山柰酚,前10位活性成分信息見表4。關(guān)鍵靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)見圖8。
圖7 祖卡木顆粒治療ALI中藥-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)
圖8 祖卡木顆粒治療ALI關(guān)鍵靶點(diǎn)-通路網(wǎng)絡(luò)
表4 祖卡木顆粒治療ALI中藥-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)度值前10位活性成分
2.8.1 祖卡木顆粒對模型大鼠肺組織形態(tài)的影響
假手術(shù)組大鼠肺組織形態(tài)正常,肺泡結(jié)構(gòu)完整、大小均一,肺泡腔內(nèi)無炎性細(xì)胞浸潤。模型組大鼠肺泡結(jié)構(gòu)明顯塌陷,肺泡腔變小并伴有炎性細(xì)胞浸潤和肺間質(zhì)變厚;祖卡木顆粒組和地塞米松組大鼠肺組織形態(tài)與肺泡結(jié)構(gòu)變化較模型組有所減輕,表現(xiàn)為肺間質(zhì)充血減輕,炎性細(xì)胞浸潤減少。見圖9、圖10。造模后6 h和造模后72 h,模型組肺組織損傷評分均明顯高于假手術(shù)組(P<0.01),祖卡木顆粒組和地塞米松組均明顯低于模型組(P<0.05,P<0.01),祖卡木顆粒組與地塞米松組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見表5。
圖9 造模后6 h各組大鼠肺組織形態(tài)(HE染色,×200)
圖10 造模后72 h各組大鼠肺組織形態(tài)(HE染色,×200)
表5 各組大鼠不同時(shí)點(diǎn)肺組織損傷評分比較(±s,分)
表5 各組大鼠不同時(shí)點(diǎn)肺組織損傷評分比較(±s,分)
注:與模型組比較,*P<0.05,**P<0.01
造模后72 h 1.667±2.081**6.250±0.000 3.500±2.380**3.200±1.862**組別假手術(shù)組模型組祖卡木顆粒組地塞米松組只數(shù)4566造模后6 h 1.333±1.527**5.750±1.643 4.000±2.236*3.000±2.449*
2.8.2 祖卡木顆粒對模型大鼠肺組織CD14 mRNA表達(dá)的影響
造模后6 h,各組大鼠肺組織CD14 mRNA表達(dá)見表6。模型組大鼠肺組織CD14 mRNA表達(dá)明顯高于假手術(shù)組(P<0.01),祖卡木顆粒組和地塞米松組明顯低于模型組(P<0.05),祖卡木顆粒組與地塞米組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
表6 各組大鼠造模后6 h肺組織CD14 mRNA表達(dá)比較(±s)
表6 各組大鼠造模后6 h肺組織CD14 mRNA表達(dá)比較(±s)
注:與模型組比較,*P<0.05,**P<0.01;與地塞米松組比較,#P<0.05
CD14 0.096 7±0.028 9**0.938 0±0.060 6 0.792 0±0.289 6*#0.655 0±0.267 9*組別假手術(shù)組模型組祖卡木顆粒組地塞米松組只數(shù)4566
內(nèi)毒素是造成ALI的主要原因之一。CD14作為細(xì)胞表面的一種模式識別受體能夠識別、結(jié)合脂多糖復(fù)合物[14]。脂多糖與細(xì)胞表面的模式識別受體CD14受體結(jié)合后,活化細(xì)胞內(nèi)信號,釋放大量炎性細(xì)胞因子,引起炎癥反應(yīng)[15]。祖卡木顆粒能有效抑制ALI大鼠肺組織CD14 mRNA表達(dá),從而減輕ALI炎癥反應(yīng)。
2.8.3 祖卡木顆粒對模型大鼠肺組織CD80、CD86 mRNA表達(dá)的影響
造模后72 h,各組大鼠肺組織CD80、CD86 mRNA 表達(dá)水平見表7。與假手術(shù)組比較,模型組CD80、CD86 mRNA表達(dá)均顯著升高(P<0.01)。與模型組比較,祖卡木顆粒組和地塞米松組CD80和CD86 mRNA表達(dá)均下降(P<0.01,P<0.05),祖卡木顆粒組與地塞米松組差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
表7 各組大鼠造模后72 h肺組織CD80、CD86 mRNA表達(dá)比較(±s)
表7 各組大鼠造模后72 h肺組織CD80、CD86 mRNA表達(dá)比較(±s)
注:與模型組比較,*P<0.05,**P<0.01
組別假手術(shù)組模型組祖卡木顆粒組地塞米松組CD86 0.606 7±0.089 6**1.472 5±0.606 7 0.828 0±0.115 2*0.820 0±0.131 8*只數(shù)4566 CD80 0.620 0±0.087 2**3.020 0±1.436 0 1.148 3±0.493 4**1.181 7±0.595 1**
CD80和CD86是T淋巴細(xì)胞最重要的共刺激分子,主要表達(dá)在抗原提呈細(xì)胞如巨噬細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞表面,與相應(yīng)配體(CD28)結(jié)合后促進(jìn)T淋巴細(xì)胞活化,啟動(dòng)適應(yīng)性免疫應(yīng)答,調(diào)節(jié)Th細(xì)胞分化,從而調(diào)節(jié)Th1、Th2和Th17反應(yīng)[16]。CD80和CD86誘導(dǎo)核因子-κB和炎性細(xì)胞因子產(chǎn)生,在肺部炎癥和氣道反應(yīng)中起重要作用[17]。二者表達(dá)失衡會引起機(jī)體異常免疫應(yīng)答反應(yīng)[18]。祖卡木顆粒能有效抑制ALI大鼠肺組織CD80和CD86 mRNA表達(dá)升高,從而減輕肺部炎癥。
ALI是由肺炎和吸入引起的直接損傷和全身感染、敗血癥、創(chuàng)傷引起的間接損傷引起的一種呼吸系統(tǒng)急危重癥[19]。ALI病因復(fù)雜,包括肺免疫穩(wěn)態(tài)失調(diào)、全身炎癥、器官炎癥和功能細(xì)胞凋亡障礙等,最終導(dǎo)致器官衰竭危及生命[20]。目前臨床采用生命維持和抗感染治療,主要分為機(jī)械通氣療法和藥物療法[21]。藥物包括皮質(zhì)醇類、他汀類藥物和β-激動(dòng)劑等,但常出現(xiàn)耐藥性、代謝紊亂、胃腸道紊亂等不良反應(yīng)[22]。因此,在分子水平上了解ALI發(fā)病機(jī)制,發(fā)現(xiàn)具有診斷和預(yù)后作用的生物標(biāo)志物,對于開發(fā)新的治療藥物十分關(guān)鍵[23]。中藥對免疫系統(tǒng)具有雙向調(diào)節(jié)作用,在膿毒癥并發(fā)ALI治療中具有獨(dú)特優(yōu)勢[24]。ALI可歸屬中醫(yī)學(xué)“喘證”“暴喘”“喘脫”范疇,其病機(jī)可概括為熱、毒、痰、瘀,治以清熱解毒、祛痰化瘀,常用藥物包括大黃、甘草等[25]。
為闡明祖卡木顆粒對ALI的保護(hù)作用及機(jī)制,本研究利用系統(tǒng)生物信息學(xué)篩選祖卡木顆粒的有效入血成分,獲得174個(gè)藥物活性成分和46個(gè)差異基因,并構(gòu)建中藥-活性成分-關(guān)鍵靶點(diǎn)-疾病網(wǎng)絡(luò)。槲皮素、木犀草素、山柰酚、柚皮素、番瀉葉苷等是祖卡木顆??怪嗵钦T導(dǎo)ALI的有效成分,說明祖卡木顆粒具有防治ALI的藥理成分基礎(chǔ)。槲皮素可通過抗炎、調(diào)節(jié)氧化應(yīng)激、抗纖維化來保護(hù)內(nèi)毒素造成的ALI,其相關(guān)機(jī)制涉及JAK2/STAT3信號通路[26]、TLR4/NF-κB信號通路[27]、Nrf-2/ARE 信號通路[28]等。木犀草素能抑制TLR4/NF-κB和PI3K/Akt介導(dǎo)的MAPK信號通路保護(hù)ALI[29]。TNF、VEGFA、IL6、IL-1β、AKT1是祖卡木顆??笰LI的關(guān)鍵靶點(diǎn)。IL-6、IL-1β、TNF-α等炎癥因子在ALI發(fā)病中起著關(guān)鍵作用。VEGFA可誘導(dǎo)生理或病理性的新血管生成,進(jìn)而促進(jìn)肺血管通透性,加重肺水腫癥狀[30]。GO富集分析顯示,炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞對脂多糖的反應(yīng)等在祖卡木顆粒抗ALI的生物過程中發(fā)揮重要作用。KEGG通路富集分析顯示,AGE-RAGE、IL-17、TNF、Toll樣受體、NOD樣受體等信號通路[31]在祖卡木顆粒治療ALI中發(fā)揮關(guān)鍵作用。晚期糖基化終末產(chǎn)物的可溶性受體(sRAGE)是肺上皮損傷的標(biāo)志。sRAGE 與表面活性蛋白(SP-D)聯(lián)合,可作為膿毒癥的生物標(biāo)志物[32]。IL-17可誘導(dǎo)肺部和氣道炎性介質(zhì)的釋放。Th17/Treg平衡是早期ARDS/ALI的重要風(fēng)險(xiǎn)指標(biāo)[33]。Th17細(xì)胞在急性呼吸窘迫綜合征患者外周血中顯著增加[34]。血清IL-17水平可反映ALI患者病情嚴(yán)重程度[35]。羅艷等[36]研究認(rèn)為,羅格列酮能顯著減輕脂多糖誘導(dǎo)的新生鼠ALI炎癥,其機(jī)制與降低IL-17A有關(guān)。Toll樣受體4(TLR4)參與先天免疫并通過識別脂多糖或細(xì)菌內(nèi)毒素介導(dǎo)炎癥反應(yīng),TLR4過度激活會觸發(fā)多種炎癥因子產(chǎn)生[37]。
ALI可以通過一系列免疫信號通路導(dǎo)致機(jī)體炎癥反應(yīng)失控。機(jī)體受到感染時(shí),通過模式識別受體識別病原體的固有免疫系統(tǒng)作為第一道防線,啟動(dòng)炎癥反應(yīng),同時(shí)誘導(dǎo)共刺激分子表達(dá)和抗原提呈細(xì)胞成熟,活化T細(xì)胞從而引起機(jī)體的適應(yīng)性免疫應(yīng)答[38]。CD14是模式識別受體中的一種,能單獨(dú)或與TLR4共同識別脂多糖,啟動(dòng)炎癥反應(yīng)[39]。金肇權(quán)等[40]研究表明,CD14-TLR4-NF-κB通路參與脂多糖誘導(dǎo)的ALI炎癥反應(yīng)。在膿毒癥患者體內(nèi)CD86明顯升高,可用于預(yù)測早期膿毒癥的發(fā)生[41]。脂多糖誘導(dǎo)的ALI小鼠的肺和脾樹突狀細(xì)胞上CD80和CD86表達(dá)升高,用白藜蘆醇預(yù)處理能降低共刺激分子的表達(dá),減輕ALI[42]。因此,本研究通過氣管滴注脂多糖建立ALI大鼠模型對祖卡木顆粒進(jìn)行藥效學(xué)評價(jià),結(jié)果表明,祖卡木顆粒能有效緩解脂多糖引起的ALI,并顯著抑制肺組織中CD14和共刺激分子CD80、CD86 mRNA表達(dá),減輕機(jī)體免疫細(xì)胞的過度應(yīng)激反應(yīng),避免細(xì)胞因子風(fēng)暴的發(fā)生。
綜上所述,本研究采用生物信息學(xué)方法預(yù)測祖卡木顆粒抗ALI的活性成分、有效靶點(diǎn)和信號通路,并通過ALI大鼠模型進(jìn)行初步驗(yàn)證。結(jié)果表明,槲皮素、木犀草素、山柰酚和番瀉葉苷可能是祖卡木顆??笰LI的主要活性成分,祖卡木顆粒能夠有效抑制ALI大鼠肺組織CD14、CD80、CD86 mRNA表達(dá),其機(jī)制可能與IL-17、Toll樣受體、NOD樣受體等免疫信號通路有關(guān)。本研究可為祖卡木顆粒的基礎(chǔ)研究及臨床應(yīng)用提供思路和依據(jù),但仍存在一定的局限性。復(fù)方藥味眾多,成分復(fù)雜,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法并不能準(zhǔn)確反映復(fù)方君臣佐使的作用;數(shù)據(jù)庫篩選的成分未必與實(shí)際發(fā)揮作用者一致;脂多糖誘導(dǎo)的ALI大鼠模型在病理機(jī)制方面與臨床ALI患者不完全相同。藥效學(xué)實(shí)驗(yàn)未對更多信號通路進(jìn)行驗(yàn)證,后續(xù)將開展更深入的研究。